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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
9881 2025-10-07
The aggrephagy-related gene TUBA1B influences clinical outcomes in glioma patients by regulating the cell cycle
2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过识别胶质瘤中的聚集性自噬亚型并发现TUBA1B基因作为独立预后标志物,揭示了其在调控细胞周期和免疫微环境中的关键作用 首次将聚集性自噬相关基因TUBA1B与胶质瘤预后联系起来,并通过多组学分析和实验验证阐明了其通过细胞周期调控影响肿瘤进展的机制 研究主要基于公共数据库数据,需要更多独立队列验证;动物模型数量有限 探索胶质瘤的预后生物标志物和治疗靶点 胶质瘤患者组织样本和细胞系 生物信息学 胶质瘤 单细胞测序,qRT-PCR,体外功能实验,小鼠异种移植模型 机器学习,多变量Cox回归,列线图模型 基因表达数据,临床数据,单细胞测序数据 TCGA和CGGA数据库中的GBM和LGG样本,GEO数据库GSE167960单细胞测序数据 NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
9882 2025-10-07
Multi-omics analysis of the dynamic role of STAR+ cells in regulating platinum-based chemotherapy responses and tumor microenvironment in serous ovarian carcinoma
2025, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
研究论文 本研究通过多组学分析发现STAR+细胞是浆液性卵巢癌中一种新型癌症相关成纤维细胞亚型,能够增强铂类化疗敏感性 首次鉴定出STAR+细胞作为新型CAF亚型,发现其通过调节代谢通路和抑制WNT信号通路增强化疗敏感性 STAR+细胞与肿瘤细胞相互作用的具体机制尚未完全阐明 探索CAF亚型与化疗敏感性之间的关系 浆液性卵巢癌患者组织样本 数字病理学 卵巢癌 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 空间转录组学, 免疫组织化学, 免疫荧光 NA 基因表达数据, 空间定位数据, 蛋白质表达数据 化疗敏感和化疗耐药的SOC患者样本 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 空间转录组学 NA NA
9883 2025-10-07
Integrating machine learning and single-cell sequencing to identify shared biomarkers in type 1 diabetes mellitus and clear cell renal cell carcinoma
2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 通过整合机器学习和单细胞测序技术识别1型糖尿病和肾透明细胞癌的共同生物标志物 首次结合WGCNA、LASSO和SVM算法从多组学数据中鉴定T1DM和ccRCC的共享枢纽基因,并利用单细胞测序解析其细胞特异性表达 基于公共数据集的分析需要进一步实验验证,临床样本规模有限 识别T1DM和ccRCC的共同生物标志物以促进高危人群的预防和早期检测 1型糖尿病和肾透明细胞癌的基因表达数据及临床样本 机器学习 糖尿病, 肾癌 单细胞RNA测序, 基因表达分析 WGCNA, LASSO, SVM 基因表达数据, 单细胞测序数据 多个公共数据集及临床样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
9884 2025-10-07
STsisal: a reference-free deconvolution pipeline for spatial transcriptomics data
2025, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 开发了一种无需参考数据的空间转录组学反卷积方法STsisal 提出了一种整合标记基因选择、混合比例分解和细胞类型特征矩阵分析的新型参考自由反卷积方法 NA 解决空间转录组学数据中缺乏单细胞分辨率的问题 空间转录组学数据 空间转录组学 NA 空间转录组学 SISAL算法 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
9885 2025-10-07
Integration of single-nuclei and spatial transcriptomics to decipher tumor phenotype predictive of relapse-free survival in Wilms tumor
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过整合单核RNA测序和空间转录组学数据,鉴定与肾母细胞瘤复发相关的肿瘤亚型并构建预后预测模型 首次在肾母细胞瘤中识别出与不良无复发生存期相关的Scissor+肿瘤细胞亚型,并发现其对EGFR抑制剂的敏感性 基于公共数据库的回顾性研究,需要前瞻性临床验证 识别驱动肾母细胞瘤复发的分子特征并发现新的治疗靶点 肾母细胞瘤患者样本 数字病理学 肾母细胞瘤 单核RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 免疫组织化学 集成机器学习模型, Cox回归, LASSO回归 基因表达数据, 突变数据, 拷贝数变异数据, 空间定位数据 NA NA 单核RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 NA NA
9886 2025-10-07
The Role of PLIN3 in Prognosis and Tumor-Associated Macrophage Infiltration: A Pan-Cancer Analysis
2025, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 通过泛癌分析探讨PLIN3在预后和肿瘤相关巨噬细胞浸润中的作用 首次系统评估PLIN3对肿瘤免疫微环境的影响及其作为免疫治疗反应预后指标的潜力 研究主要基于数据库分析,实验验证主要在肺腺癌细胞中进行 评估PLIN3作为癌症诊断和预后生物标志物的潜力及其对免疫细胞浸润的影响 多种正常和癌组织、肺腺癌细胞 生物信息学 多种癌症 单细胞转录组学、空间转录组学、多重荧光染色、分子对接 计算算法 mRNA表达数据、蛋白质表达数据、转录组数据 多个数据库中的多样化组织样本 NA 单细胞转录组学,空间转录组学,批量转录组学 NA NA
9887 2025-10-07
Key genes linking gut microbiota, immune cells, and osteoporosis: A multi-omics approach
2025-May, Microbial pathogenesis IF:3.3Q2
研究论文 通过整合孟德尔随机化、单细胞RNA测序和生物信息学分析,探索肠道微生物群、免疫细胞调控与骨质疏松症之间的因果关系 首次采用多组学方法系统揭示肠道微生物群通过免疫细胞介导影响骨质疏松的分子机制,并识别出关键基因USP6NL、SELENOT和TAF1A 研究主要基于欧洲人群数据(UK Biobank和芬兰队列),结果在其他人群中的普适性需要进一步验证 阐明肠道微生物群通过免疫调控影响骨质疏松的分子机制 骨质疏松症患者与对照样本 生物信息学 骨质疏松症 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 两样本孟德尔随机化 基因组数据, 单细胞转录组数据 UK Biobank和芬兰队列数据,包含412种肠道微生物物种和731种免疫细胞类型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
9888 2025-10-07
Multi-Targeting CAR-T Cell Strategies to Overcome Immune Evasion in Lymphoid and Myeloid Malignancies
2025-Mar-14, Oncology research and treatment IF:2.0Q3
综述 探讨多靶向CAR-T细胞策略在克服淋巴和髓系恶性肿瘤免疫逃逸中的应用 提出逻辑门控CAR、适配器CAR等多靶向策略应对抗原逃逸问题 NA 改善CAR-T细胞疗法在血液恶性肿瘤中的治疗效果和持久性 淋巴和髓系恶性肿瘤患者 NA 淋巴瘤、多发性骨髓瘤 下一代测序(NGS)、直接随机光学重建显微镜(dSTORM)、多参数流式细胞术、CRISPR筛选、单细胞RNA测序 NA NA NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
9889 2025-10-07
Recurrent ERBB2 alterations are associated with esophageal adenocarcinoma brain metastases
2025-Feb-26, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 通过多组学分析揭示食管腺癌脑转移中ERBB2基因的复发性改变及其临床意义 首次在食管腺癌脑转移中发现ERBB2基因的复发性扩增,并证明其与单克隆播散相关 样本量较小(10例),需要更大规模研究验证 探究食管腺癌脑转移的分子特征和临床治疗策略 食管腺癌脑转移患者及其匹配的原发肿瘤 数字病理学 食管癌 全基因组测序, 单细胞空间转录组学 NA 基因组数据, 转录组数据 10例食管腺癌脑转移患者 NA 全基因组测序, 单细胞空间转录组学 NA NA
9890 2025-10-07
MolGene-E: Inverse Molecular Design to Modulate Single Cell Transcriptomics
2025-Feb-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 开发了一种名为MolGene-E的深度生成框架,用于基于单细胞转录组数据设计新药物分子 首个能够利用单细胞组学数据设计新药物分子的机器学习方法,结合了跨模态数据协调和对比学习生成模型 单细胞组学数据存在噪声、异质性、稀缺性和高维度等挑战 开发能够调节单细胞转录组学的逆向分子设计方法 疾病细胞与健康细胞的转录组状态 机器学习 NA 单细胞转录组学 深度生成框架,跨模态模型,对比学习生成模型 单细胞转录组数据,化学扰动的大量转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
9891 2025-10-07
Spatial transcriptomics combined with single-nucleus RNA sequencing reveals glial cell heterogeneity in the human spinal cord
2025-Nov-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1
研究论文 本研究结合空间转录组学和单核RNA测序技术,揭示了人类脊髓中胶质细胞的异质性 首次在人类脊髓中系统绘制胶质细胞的转录组异质性图谱,并进行跨物种比较分析 样本数量有限,未涵盖所有可能的病理状态 探索人类脊髓胶质细胞的分子异质性及其在物种间的差异 人类和小鼠脊髓中的星形胶质细胞、小胶质细胞和少突胶质细胞 空间转录组学 神经系统疾病 单核RNA测序, 空间转录组学 NA 转录组数据, 空间位置数据 NA NA 单核RNA测序, 空间转录组学 NA NA
9892 2025-10-07
Exosomes originating from neural stem cells undergoing necroptosis participate in cellular communication by inducing TSC2 upregulation of recipient cells following spinal cord injury
2025-Nov-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1
研究论文 本研究探讨了脊髓损伤后经历坏死性凋亡的神经干细胞来源的外泌体在细胞通讯中的作用及其对受体细胞TSC2表达的影响 首次揭示了神经干细胞坏死性凋亡来源的外泌体通过诱导TSC2上调参与脊髓损伤后细胞通讯的新机制 研究主要基于体外实验模型,体内验证仍需进一步深入 探究脊髓损伤后神经干细胞坏死性凋亡来源的外泌体在细胞通讯中的功能 胚胎小鼠神经干细胞、外泌体、脊髓损伤模型 单细胞组学 脊髓损伤 单细胞RNA测序、转录组测序 NA RNA测序数据 16-17天胚胎小鼠神经干细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
9893 2025-10-07
Oligodendroglial heterogeneity in health, disease, and recovery: deeper insights into myelin dynamics
2025-Nov-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1
综述 通过单细胞RNA测序技术重新定义少突胶质细胞谱系的五种细胞状态,并探讨其在健康和疾病状态下的功能意义 提出基于单细胞RNA测序发现的少突胶质细胞谱系新分类系统,将传统两种细胞类型扩展为五种连续细胞状态 NA 建立统一的少突胶质细胞术语体系以促进跨研究数据整合,深化对髓鞘病理机制的理解 少突胶质细胞谱系细胞 单细胞生物学 多发性硬化症,阿尔茨海默病,肌萎缩侧索硬化 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
9894 2025-10-07
Lactate drives senescence-resistant lineages in hepatocellular carcinoma via histone H2B lactylation of NDRG1
2025-Apr-28, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序轨迹分析重建肝细胞癌克隆演化,发现乳酸通过LDHA-NDRG1轴介导的组蛋白H2B乳酰化驱动衰老抵抗谱系 首次揭示乳酸通过LDHA-NDRG1轴介导的组蛋白H2B K58位点乳酰化表观遗传机制,连接代谢重编程与衰老逃逸 研究主要基于小鼠模型和公共数据集,需要进一步临床验证 探索肝细胞癌异质性机制和衰老抵抗的分子基础 肝细胞癌细胞谱系和克隆演化 癌症生物学 肝细胞癌 单细胞RNA测序,轨迹分析,加权基因共表达网络分析 预后模型 单细胞RNA测序数据,公共HCC数据集 902个特征基因跨越7种细胞状态,14基因预后模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
9895 2025-10-07
Network-based analysis of Alzheimer's Disease genes using multi-omics network integration with graph diffusion
2025-Apr, Journal of biomedical informatics IF:4.0Q2
研究论文 通过多组学网络整合与图扩散方法分析阿尔茨海默病基因的网络特征 挑战了AD基因主要是网络枢纽节点的传统观点,发现AD基因分布在不同的度中心性分位数中,且外围基因也发挥重要作用 NA 研究已知AD基因在网络中的特性 阿尔茨海默病相关基因 生物信息学 阿尔茨海默病 多组学网络整合, 图扩散, 网络分析 图扩散模型 基因表达数据, 蛋白质相互作用数据, 基因本体数据 NA NA 微阵列, 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 NA NA
9896 2025-10-07
Mapping glioma progression: single-cell RNA sequencing illuminates cell-cell interactions and immune response variability
2025-Mar-12, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示胶质瘤微环境中细胞间相互作用和免疫反应异质性 识别了14种胶质瘤细胞亚群和4种巨噬细胞/单核细胞亚型,揭示了通过MIF和SPP1通路的关键配体-受体相互作用 基于公共数据库的回顾性分析,需要实验验证细胞间相互作用的机制 探索胶质瘤恶性细胞与巨噬细胞/单核细胞的相互作用及其对肿瘤进展和治疗反应的影响 胶质瘤组织和其中的细胞亚群 生物信息学 胶质瘤 单细胞RNA测序,功能富集分析,发育轨迹分析,细胞通讯分析,基因调控网络分析 预后风险评分模型 RNA测序数据 来自TCGA和CGGA数据库的胶质瘤样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
9897 2025-10-07
Transcription factor networks and novel immune biomarkers reveal key prognostic and therapeutic insights in ovarian cancer
2025-Mar-12, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究基于肿瘤微环境中的转录因子调控网络,开发了一个9基因风险模型用于卵巢癌预后预测 首次在卵巢癌肿瘤微环境中识别出6个免疫恶性细胞亚群,并基于转录因子调控网络构建了9基因风险预后模型 研究样本量有限,需要更大规模的数据验证模型的普适性 探索卵巢癌肿瘤微环境中的转录因子调控网络,开发预后预测模型和识别新的免疫生物标志物 卵巢癌患者样本和细胞系 生物信息学 卵巢癌 单细胞RNA测序, qPCR, 免疫组化, 细胞功能实验 Lasso回归, ConsensusClusterPlus, SCENIC 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据, 临床数据 未明确具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
9898 2025-10-07
Integrative whole slide image and spatial transcriptomics analysis with QuST and QuPath
2025-Mar-12, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 介绍QuST这一QuPath扩展工具,用于整合全切片图像和空间转录组学数据 开发了能够在单细胞水平上桥接全切片图像和空间转录组学分析的工具QuST 面临训练模式准备和分辨率差异等挑战 通过整合数字病理学和空间转录组学技术来增强疾病理解 全切片图像和空间转录组学数据 数字病理学 NA 空间转录组学,全切片图像分析 NA 图像,空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 QuPath, QuST QuPath扩展工具QuST
9899 2025-10-07
Fatty acid metabolism shapes immune responses in chronic lymphocytic leukemia
2025-Mar-12, Biomarker research IF:9.5Q1
研究论文 本研究构建了基于脂肪酸代谢基因的慢性淋巴细胞白血病预后评分系统,并揭示了脂肪酸氧化在CLL免疫微环境中的调控作用 首次构建基于脂肪酸代谢基因的CLL预后评分系统,通过单细胞分析揭示关键FAM基因在免疫细胞亚群中的表达模式,发现脂肪酸氧化抑制可协同增强PI3K抑制剂疗效 研究基于RNA测序数据分析,需要进一步实验验证具体分子机制 阐明脂肪酸代谢在慢性淋巴细胞白血病中的特征及其在疾病发展中的调控作用 慢性淋巴细胞白血病患者和健康对照 生物信息学 慢性淋巴细胞白血病 RNA测序,单细胞RNA测序,细胞活力检测,药物敏感性检测,氧消耗测定 Cox-LASSO回归 RNA测序数据 CLL患者和健康对照的RNA测序数据 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
9900 2025-10-07
Single-cell transcriptomics of clinical grade adipose-derived regenerative cells reveals consistency between donors independent of gender and BMI
2025-Mar-05, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1
研究论文 通过单细胞转录组分析临床级脂肪来源再生细胞,发现供体间一致性不受性别和BMI影响 首次在临床级ADRCs中系统评估供体特征对细胞组成的影响,发现供体间异质性极小 仅基于两项细胞试验干预研究,样本量有限 评估供体特征(性别、BMI)对脂肪来源再生细胞组成和质量的影响 临床级脂肪来源再生细胞(ADRCs) 单细胞组学 再生医学 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 两项细胞试验干预研究中的多个供体 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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