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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9841 | 2025-10-07 |
Mapping Gene Expression in Whole Larval Brains of Bicyclus anynana Butterflies
2025-Mar-13, Methods and protocols
IF:2.3Q3
DOI:10.3390/mps8020031
PMID:40126249
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研究论文 | 本研究优化了HCR v3.0方案,实现了非洲蝴蝶幼虫全脑组织中十个基因表达域的单细胞分辨率空间定位 | 首次在蝴蝶幼虫全脑组织中应用HCR v3.0技术,实现了多基因表达的空间可视化 | 仅针对固定脑组织进行基因表达定位,未涉及动态行为过程中的实时变化 | 探索蝴蝶幼虫大脑在分子水平上的基因表达空间分布模式 | 非洲蝴蝶(Bicyclus anynana)幼虫的完整脑组织 | 空间转录组学 | NA | 杂交链式反应3.0(HCR v3.0) | NA | RNA分子空间表达图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 优化了聚丙烯酰胺凝胶包埋、固定和样品透化步骤的HCR v3.0方案 |
| 9842 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomic Approaches for Decoding Non-Coding RNA Mechanisms in Colorectal Cancer
2025-Mar-10, Non-coding RNA
IF:3.6Q2
DOI:10.3390/ncrna11020024
PMID:40126348
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学方法在结直肠癌非编码RNA研究中的应用与进展 | 聚焦单细胞水平揭示非编码RNA异质性,整合生物信息学方法与实验验证 | 作为综述文章,不包含原始实验数据验证 | 探讨单细胞生物信息学方法在结直肠癌非编码RNA研究中的应用 | 结直肠癌中的非编码RNA | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | scRNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9843 | 2025-10-07 |
Identifying gene expression and cellular pathways involved in glomerular AL-amyloidosis and correlation with experimental data: seeking novel therapeutic interventions
2025-Mar-04, Ultrastructural pathology
IF:1.1Q4
DOI:10.1080/01913123.2025.2468708
PMID:39985165
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析肾小球淀粉样变性中系膜细胞的基因表达和细胞通路变化 | 首次在人类肾小球中揭示淀粉样轻链与系膜细胞相互作用过程中的基因表达谱和激活的细胞通路 | 样本量较小(仅5例肾活检样本),需要更大规模研究验证 | 寻找肾小球AL-淀粉样变性的新型治疗干预靶点 | 肾小球淀粉样变性患者的肾活检组织中的系膜细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 5例不同阶段肾小球淀粉样变性活检样本与正常对照 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 9844 | 2025-10-07 |
Esr1-Dependent Signaling and Transcriptional Maturation in the Medial Preoptic Area of the Hypothalamus Shapes the Development of Mating Behavior during Adolescence
2025-Feb-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.26.640339
PMID:40060480
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探索了下丘脑内侧视前区在青春期发育过程中对交配行为形成的分子机制 | 首次揭示Esr1在MPOA区GABA能神经元转录成熟过程中的关键作用,并发现其调控性别特异性基因调控网络 | 研究仅限于小鼠模型,未涉及其他物种验证 | 探究青春期神经系统发育过程中激素信号调控交配行为形成的分子机制 | 青春期发育过程中的雄性和雌性小鼠 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序,原位杂交 | NA | 基因表达数据,行为数据 | 青春期发育不同阶段的雄性和雌性小鼠 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 9845 | 2025-10-07 |
CD271 regulates osteogenic differentiation of ectomesenchymal stem cells via the RhoA/ROCK signaling pathway
2025-Feb-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114068
PMID:39826451
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研究论文 | 本研究探讨了CD271通过RhoA/ROCK信号通路调控外间充质干细胞成骨分化的机制 | 首次揭示CD271通过调控RhoA/ROCK信号通路影响外间充质干细胞的成骨分化过程 | NA | 研究CD271对外间充质干细胞成骨分化的影响及其分子机制 | 外间充质干细胞(EMSCs)和CD271缺陷小鼠 | 干细胞生物学 | 颌骨发育异常 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | CD271缺陷小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9846 | 2024-11-07 |
Metabolic reprogramming landscape of pan-cancer by single-cell transcriptome data integration
2025-Mar-30, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2024.10.026
PMID:39500689
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9847 | 2025-10-07 |
Checkpoint kinase 1 in colorectal cancer: Upregulation of expression and promotion of cell proliferation
2025-Mar-24, World journal of clinical oncology
IF:2.6Q3
DOI:10.5306/wjco.v16.i3.101725
PMID:40130044
|
研究论文 | 本研究探讨了检查点激酶1在结直肠癌中的表达上调及其促进癌细胞增殖的作用 | 首次通过单细胞RNA测序结合组织芯片数据系统分析CHEK1在结直肠癌中的表达和功能,并发现硝基氯化物可作为其靶向药物 | 数据集多样性有限,需要进一步研究其具体作用机制 | 研究CHEK1在结直肠癌中的表达和功能 | 结直肠癌细胞和组织样本 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,分子对接,CRISPR基因敲除 | NA | 单细胞RNA测序数据,组织芯片数据,mRNA表达数据 | GSE144735数据集及多个公共数据库的结直肠癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9848 | 2025-10-07 |
Dissecting endothelial cell heterogeneity with new tools
2025-Mar-23, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-025-00223-3
PMID:40121354
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综述 | 本文综述了内皮细胞异质性的研究进展,重点关注单细胞RNA测序和血管类器官等新技术在揭示内皮细胞多样性中的应用 | 整合单细胞RNA测序与血管类器官等新兴技术,从表观遗传学和空间分辨率角度深入探索内皮细胞异质性 | NA | 解析内皮细胞异质性及其在器官发育和人类血管疾病中的意义 | 血管内皮细胞 | 生物医学 | 血管疾病 | 单细胞RNA测序, 高通量测序技术, 三维培养系统 | NA | 转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9849 | 2025-10-07 |
Integrating single-cell and bulk RNA sequencing data to characterize the heterogeneity of glycan-lipid metabolism polarization in hepatocellular carcinoma
2025-Mar-22, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06347-z
PMID:40121455
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据,揭示了肝细胞癌中糖代谢和脂代谢异质性亚型的特征及其临床意义 | 首次基于代谢相关通路识别出肝细胞癌的糖代谢-HCC和脂代谢-HCC两种异质性亚型,并开发了多种临床适用的分型方法 | 研究依赖于现有队列数据,需要进一步实验验证代谢亚型的生物学机制 | 表征肝细胞癌中糖代谢-脂代谢极化的异质性特征并开发临床转化策略 | 肝细胞癌患者样本 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 放射组学, 对比增强超声 | NA | RNA测序数据, 临床病理信息, 影像数据, 血清生物标志物 | 内部队列和公共HCC队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 9850 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals a new mechanism of endothelial cell heterogeneity and healing in diabetic foot ulcers
2025-Mar-22, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-025-00628-9
PMID:40121493
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示糖尿病足溃疡中内皮细胞异质性和愈合的新机制 | 发现SH3BGRL3基因在高葡萄糖条件下对内皮细胞增殖、迁移和血管生成能力的促进作用,为DFU治疗提供了新的潜在靶点 | NA | 识别与糖尿病足溃疡愈合和进展相关的关键细胞群和基因 | 糖尿病足溃疡患者的足部皮肤细胞和内皮细胞 | 数字病理学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9851 | 2025-10-07 |
Roles of TLR4 in macrophage immunity and macrophage-pulmonary vascular/lymphatic endothelial cell interactions in sepsis
2025-Mar-21, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07921-3
PMID:40119011
|
研究论文 | 本研究探讨TLR4在脓毒症中调控巨噬细胞免疫代谢及其与肺血管/淋巴管内皮细胞相互作用的机制 | 首次通过单细胞RNA测序结合实验验证,揭示TLR4通过调控巨噬细胞胆固醇外流和糖酵解影响M2极化,并阐明其在免疫介导和直接内皮反应中的双重作用机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证;TLR4在多细胞群体中的具体靶向策略尚未明确 | 深入探索TLR4在脓毒症中调控巨噬细胞免疫代谢及其与肺内皮细胞相互作用的机制 | TLR4基因敲除小鼠的巨噬细胞、肺血管内皮细胞和淋巴管内皮细胞 | 免疫学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序,基因敲除技术 | NA | 基因表达数据 | TLR4基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9852 | 2025-10-07 |
B cells and energy metabolism in HER2-positive DCIS: insights into breast cancer progression from spatial-omics analyses
2025-Mar-21, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-025-01990-2
PMID:40119362
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研究论文 | 通过空间转录组学分析研究HER2阳性DCIS中B细胞与能量代谢在乳腺癌进展中的作用 | 首次发现HER2阳性DCIS中B细胞丰度与癌细胞能量代谢基因表达呈正相关,揭示B细胞可能通过代谢途径抑制癌症进展 | 样本量有限,主要关注HER2阳性亚型,机制研究仍需进一步验证 | 探究HER2阳性乳腺导管原位癌向浸润性乳腺癌转变的机制 | HER2阳性DCIS和伴随DCIS的浸润性乳腺肿瘤 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 9853 | 2025-10-07 |
TM4SF1 overexpression in tumor-associated endothelial cells promotes microvascular invasion in hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1526177
PMID:40123905
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现肿瘤相关内皮细胞中TM4SF1过表达通过影响上皮-间质转化促进肝细胞癌微血管侵袭 | 首次在单细胞水平揭示TM4SF1在肿瘤相关内皮细胞中的表达与肝细胞癌微血管侵袭的关联机制 | 样本量较小(初始3例MVI和2例非MVI患者),需要更大规模验证 | 探究肿瘤相关内皮细胞在肝细胞癌微血管侵袭中的作用机制 | 肝细胞癌患者的肿瘤相关内皮细胞 | 单细胞生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 生物信息学分析 | Seurat, monocle2 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 病理标本 | 初始5例患者(3例MVI+2例非MVI),另加5个空间转录组数据集和4例术后病理标本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 9854 | 2025-10-07 |
Genetic factors associated with erectile dysfunction- mendelian randomisation analysis
2025, American journal of clinical and experimental urology
IF:1.5Q3
DOI:10.62347/BVHS3637
PMID:40124574
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研究论文 | 通过孟德尔随机化分析识别与勃起功能障碍相关的遗传保护基因 | 首次利用孟德尔随机化方法系统识别ED相关遗传保护基因,发现TRIP10基因的显著保护作用 | 研究样本主要来自芬兰人群,可能存在人群特异性限制 | 探索勃起功能障碍的遗传保护机制 | 勃起功能障碍患者和对照人群 | 遗传学 | 勃起功能障碍 | GWAS, eQTL分析, 孟德尔随机化, 单细胞测序 | 孟德尔随机化模型 | 基因组数据, 表达量数据 | 1,154例病例和94,024例对照,共95,178人 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9855 | 2025-10-07 |
Distinct Immunological Features Compared to Lichen Planus and Oral Lichen Planus
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S506313
PMID:40125076
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析比较了口腔扁平苔藓和扁平苔藓的免疫特征差异 | 首次鉴定出PTGDS作为OLP诊断标志物及新型CXCR4高-TSC22D3高CD4细胞毒性T细胞亚群 | 样本量有限(16例患者和5例对照),需要进一步验证 | 阐明口腔扁平苔藓与扁平苔藓的免疫病理机制差异 | 口腔扁平苔藓患者和扁平苔藓患者的免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 口腔扁平苔藓 | 单细胞转录组测序,ELISA | NA | 单细胞转录组数据 | 16例OLP患者和5例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9856 | 2025-10-07 |
Elucidating Molecule-Crosstalk of Neutrophil Extracellular Traps Between Cardiovascular Disease and Psoriasis: Insights Into Mendelian Randomization, Single-Cell RNA Analysis, Shared Targets and the Role of Resveratrol
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S493416
PMID:40125083
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研究论文 | 通过整合多种组学方法揭示中性粒细胞胞外诱捕网在左心室肥厚和银屑病之间的分子互作机制 | 首次整合孟德尔随机化、单细胞RNA分析和分子对接方法系统研究NETs在心血管疾病与银屑病间的分子串扰 | 研究机制尚未完全阐明,需要进一步验证 | 探索左心室肥厚与银屑病之间的分子互作机制,特别关注NETs相关通路 | 左心室肥厚和银屑病患者 | 生物信息学 | 心血管疾病,银屑病 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,孟德尔随机化,分子对接 | 预测模型 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 9857 | 2025-10-07 |
Causal Correlations Between Plasma Metabolites, Inflammatory Proteins, and Chronic Obstructive Pulmonary Disease: A Mendelian Randomization and Bioinformatics-Based Investigation
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S513526
PMID:40125086
|
研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化和生物信息学方法探讨血浆代谢物、炎症蛋白与慢性阻塞性肺疾病之间的因果关系 | 首次系统性地通过MR方法验证代谢物与COPD的因果关系,并识别出三种关键中介蛋白和NRXN3的保护作用机制 | MR方法依赖于遗传工具变量的假设,且样本来源和人群特征可能限制结果的普适性 | 探究代谢、炎症与COPD之间的因果关系及中介机制 | 血浆代谢物、炎症蛋白和慢性阻塞性肺疾病患者 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 孟德尔随机化, 蛋白互作网络分析, GO/KEGG富集分析, 单细胞测序, 转录组分析 | MR, PPI网络, 富集分析 | 基因组数据, 转录组数据, 单细胞测序数据, 蛋白质组数据 | 未明确具体样本数量,但涉及多组学数据集和人肺组织验证 | NA | 单细胞测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 9858 | 2025-10-07 |
Exploring the Association Between Immune Cell Phenotypes and Osteoporosis Mediated by Inflammatory Cytokines: Insights from GWAS and Single-Cell Transcriptomics
2025, ImmunoTargets and therapy
IF:6.2Q1
DOI:10.2147/ITT.S510102
PMID:40125424
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研究论文 | 通过孟德尔随机化和单细胞转录组学探索免疫细胞表型通过炎症细胞因子介导骨质疏松症的机制 | 首次结合GWAS、孟德尔随机化和单细胞转录组学系统分析免疫细胞与骨质疏松的因果关系,发现IgD⁺CD24⁺ B细胞通过IL-17C介导骨质疏松的新机制 | 研究样本来源和数量未明确说明,部分炎症因子存在重叠可能影响分析准确性 | 阐明免疫细胞表型通过炎症细胞因子介导骨质疏松症的因果机制 | 731种免疫细胞类型、91种炎症因子、5种骨质疏松类型、骨质疏松患者和地塞米松诱导的骨质疏松模型 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | 两样本孟德尔随机化、中介分析、共定位分析、单细胞转录组测序、微CT、流式细胞术、ELISA、Western blotting、免疫组化 | 贝叶斯共定位模型、单细胞聚类分析 | 基因组数据、转录组数据、影像数据、蛋白表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9859 | 2025-10-07 |
Integrated bioinformatics analysis identifies neutrophils and villous cytotrophoblasts infiltration characterized by BLC6 upregulation as associated with the co-occurrence of gestational diabetes mellitus and pre-eclampsia
2025-Dec, Hypertension in pregnancy
IF:1.5Q4
DOI:10.1080/10641955.2025.2475814
PMID:40122115
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研究论文 | 通过生物信息学分析鉴定与妊娠期糖尿病和子痫前期共病相关的中性粒细胞和绒毛细胞滋养细胞浸润特征 | 首次发现BCL6在GDM和PE共病患者的中性粒细胞和绒毛细胞滋养细胞中高表达,并鉴定出三个共同枢纽基因 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要实验验证 | 鉴定与妊娠期糖尿病和子痫前期共病相关的枢纽基因和通路 | 妊娠期糖尿病和子痫前期患者 | 生物信息学 | 妊娠期糖尿病和子痫前期 | 生物信息学分析,单细胞测序 | 回归模型,ROC分析 | 基因表达矩阵数据 | 来自GEO数据库的多个数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9860 | 2025-10-07 |
Xin-Fu-Kang oral liquid mitigates chronic heart failure through NR4A1-Dependent regulation of endoplasmic reticulum-mitochondrial crosstalk in Cardiomyocytes
2025-May, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.156467
PMID:40036990
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研究论文 | 本研究探讨了心复康口服液通过NR4A1依赖的机制调节心肌细胞内质网-线粒体相互作用缓解慢性心力衰竭的作用 | 首次揭示心复康口服液通过NR4A1调控内质网-线粒体交互作用改善慢性心力衰竭的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验,需要进一步临床验证 | 阐明心复康口服液治疗慢性心力衰竭的分子机制 | 小鼠模型、大鼠血清、H9C2心肌细胞系 | 心血管疾病研究 | 慢性心力衰竭 | 单细胞RNA测序,UPLC-QE质谱分析,分子对接 | 动物疾病模型,细胞模型 | 基因表达数据,代谢组学数据,功能检测数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序,质谱分析 | NA | NA |