单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 10619 篇文献，本页显示第 9801 - 9820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9801 | 2025-10-07 |
Metabolic pathway activation and immune microenvironment features in non-small cell lung cancer: insights from single-cell transcriptomics
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1546764
PMID:40092988
|
研究论文 | 通过单细胞转录组数据研究非小细胞肺癌肿瘤微环境特征和代谢通路激活 | 首次在单细胞水平系统分析NSCLC中代谢通路激活与免疫微环境特征的关系，并构建具有强预测能力的风险特征 | 需要进一步探索这些代谢通路的具体机制及其在临床应用中的潜力 | 深入了解非小细胞肺癌肿瘤微环境及其代谢特征 | 非小细胞肺癌组织和细胞 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,机器学习算法 | PCA,UMAP,WGCNA | 单细胞转录组数据 | 29,053个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9802 | 2025-10-07 |
Unveiling the immunological landscape of disseminated tuberculosis: a single-cell transcriptome perspective
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1527592
PMID:40092995
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示播散性结核病的免疫学特征 | 首次结合单细胞RNA转录组和T细胞受体测序分析DTB患者，发现独特的TCR特征和MAIT细胞缺失现象 | 样本量较小（仅7例DTB患者），需更大规模研究验证 | 阐明播散性结核病的免疫发病机制 | 播散性结核病患者、潜伏结核感染者、活动性结核患者和健康对照 | 单细胞转录组学 | 结核病 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据, TCR序列数据 | 7例DTB患者+2例潜伏感染+3例活动性结核+2例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9803 | 2025-10-07 |
Integration of scRNA-seq and bulk RNA-seq to reveal the association and potential molecular mechanisms of metabolic reprogramming regulated by lactylation and chemotherapy resistance in ovarian cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1513806
PMID:40093000
|
研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA-seq数据，揭示乳酸化修饰调控代谢重编程与卵巢癌化疗耐药性的关联及分子机制 | 首次发现ALDH1A1和S100A4两个乳酸化相关基因与卵巢癌化疗耐药性相关，并证实乳酸积累与耐药性的关联 | 研究样本量有限，需要进一步实验验证分子机制 | 阐明卵巢癌化疗耐药性中乳酸化修饰的作用机制 | 卵巢癌组织和细胞 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 差异表达分析, 生存分析, 富集分析 | NA | 基因表达数据 | 铂耐药队列和敏感队列的卵巢癌组织及细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 9804 | 2025-10-07 |
Identification of glycolysis-related gene signatures for prognosis and therapeutic targeting in idiopathic pulmonary fibrosis
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1486357
PMID:40093327
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，识别了特发性肺纤维化中与糖酵解相关的基因标志物及其预后价值 | 首次系统识别特发性肺纤维化中糖酵解相关基因标志物，构建预后模型并验证其临床价值，同时发现潜在治疗靶点 | 研究基于公共数据库数据，需要更多独立队列验证；动物模型与人类疾病存在差异 | 探索特发性肺纤维化中糖酵解相关基因的预后价值和治疗靶点 | 特发性肺纤维化患者基因表达数据和博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型 | 生物信息学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 生物信息学分析 | LASSO回归, SVM-RFE, 预后模型 | 基因表达数据 | 三个GEO数据集和博来霉素诱导的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 9805 | 2025-10-07 |
Dehydrodiisoeugenol targets the PLK1-p53 axis to inhibit breast cancer cell cycle
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1545498
PMID:40093330
|
研究论文 | 本研究筛选出益智仁中主要抗乳腺癌活性成分脱氢二异丁香酚，并揭示其通过调控PLK1-p53信号轴诱导细胞周期阻滞的机制 | 首次系统鉴定益智仁中抗乳腺癌主要活性成分DHIE，并阐明其通过PLK1-p53信号轴诱导细胞周期阻滞的新机制 | DHIE在不同乳腺癌亚型中调控p53的具体机制及与其他化疗药物相比的组合优势仍需进一步探索 | 探究益智仁抗乳腺癌的主要活性成分及其作用机制 | 乳腺癌细胞系和荷瘤小鼠模型 | 癌症研究 | 乳腺癌 | LC-MS, WGCNA, 网络药理学, 分子对接, 转录组测序, 免疫浸润分析, 单细胞测序, CCK-8, 流式细胞术, Western blot | NA | 基因组数据, 转录组数据, 单细胞数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 9806 | 2025-10-07 |
Current status and future perspectives of the diagnostic of plant bacterial pathogens
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1547974
PMID:40093602
|
综述 | 本文综述植物细菌病原体诊断技术的发展现状与未来展望 | 系统分析从传统培养方法到光谱技术和单细胞测序的诊断技术演进路径 | 光谱方法需要先验数据库且无法检测未知病原体 | 探讨植物细菌病原体诊断技术的演进与未来发展 | 植物细菌病原体 | NA | NA | 微拉曼光谱，单细胞测序，合成生物学 | NA | 光谱数据，基因组数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 9807 | 2025-10-07 |
From Gene to Intervention: NLRC4 and WIPI1 Regulate Septic Acute Lung Injury Through Autophagy
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S510691
PMID:40093959
|
研究论文 | 本研究通过多组学数据分析发现NLRC4和WIPI1通过调控自噬通路影响脓毒症急性肺损伤的发病机制 | 首次揭示NLRC4和WIPI1作为关键差异表达自噬相关基因在脓毒症急性肺损伤中的调控作用，并发现WIPI1与非经典自噬通路的特殊关联 | 研究主要基于数据库分析和实验验证，临床转化应用仍需进一步探索 | 探究自噬相关基因在脓毒症急性肺损伤中的分子机制 | 人类样本数据集和实验模型 | 生物信息学 | 脓毒症急性肺损伤 | 微阵列分析,单细胞测序,流式细胞术,免疫荧光,qPCR,Western Blotting,siRNA | NA | 基因表达数据,单细胞数据 | 两个微阵列数据集(GSE33118和GSE131761)和三个单细胞测序数据集(SCP43,SCP548,SCP2156) | NA | 单细胞测序,微阵列 | NA | NA |
| 9808 | 2025-10-07 |
The aggrephagy-related gene TUBA1B influences clinical outcomes in glioma patients by regulating the cell cycle
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1531465
PMID:40094001
|
研究论文 | 本研究通过识别胶质瘤中的聚集性自噬亚型并发现TUBA1B基因作为独立预后标志物，揭示了其在调控细胞周期和免疫微环境中的关键作用 | 首次将聚集性自噬相关基因TUBA1B与胶质瘤预后联系起来，并通过多组学分析和实验验证阐明了其通过细胞周期调控影响肿瘤进展的机制 | 研究主要基于公共数据库数据，需要更多独立队列验证；动物模型数量有限 | 探索胶质瘤的预后生物标志物和治疗靶点 | 胶质瘤患者组织样本和细胞系 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 单细胞测序，qRT-PCR，体外功能实验，小鼠异种移植模型 | 机器学习，多变量Cox回归，列线图模型 | 基因表达数据，临床数据，单细胞测序数据 | TCGA和CGGA数据库中的GBM和LGG样本，GEO数据库GSE167960单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 9809 | 2025-10-07 |
Multi-omics analysis of the dynamic role of STAR+ cells in regulating platinum-based chemotherapy responses and tumor microenvironment in serous ovarian carcinoma
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1545762
PMID:40098624
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析发现STAR+细胞是浆液性卵巢癌中一种新型癌症相关成纤维细胞亚型，能够增强铂类化疗敏感性 | 首次鉴定出STAR+细胞作为新型CAF亚型，发现其通过调节代谢通路和抑制WNT信号通路增强化疗敏感性 | STAR+细胞与肿瘤细胞相互作用的具体机制尚未完全阐明 | 探索CAF亚型与化疗敏感性之间的关系 | 浆液性卵巢癌患者组织样本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 空间转录组学, 免疫组织化学, 免疫荧光 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据, 蛋白质表达数据 | 化疗敏感和化疗耐药的SOC患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 9810 | 2025-10-07 |
Integrating machine learning and single-cell sequencing to identify shared biomarkers in type 1 diabetes mellitus and clear cell renal cell carcinoma
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1543806
PMID:40098701
|
研究论文 | 通过整合机器学习和单细胞测序技术识别1型糖尿病和肾透明细胞癌的共同生物标志物 | 首次结合WGCNA、LASSO和SVM算法从多组学数据中鉴定T1DM和ccRCC的共享枢纽基因，并利用单细胞测序解析其细胞特异性表达 | 基于公共数据集的分析需要进一步实验验证，临床样本规模有限 | 识别T1DM和ccRCC的共同生物标志物以促进高危人群的预防和早期检测 | 1型糖尿病和肾透明细胞癌的基因表达数据及临床样本 | 机器学习 | 糖尿病, 肾癌 | 单细胞RNA测序, 基因表达分析 | WGCNA, LASSO, SVM | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 多个公共数据集及临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9811 | 2025-10-07 |
STsisal: a reference-free deconvolution pipeline for spatial transcriptomics data
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1512435
PMID:40098978
|
研究论文 | 开发了一种无需参考数据的空间转录组学反卷积方法STsisal | 提出了一种整合标记基因选择、混合比例分解和细胞类型特征矩阵分析的新型参考自由反卷积方法 | NA | 解决空间转录组学数据中缺乏单细胞分辨率的问题 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | SISAL算法 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 9812 | 2025-10-07 |
Integration of single-nuclei and spatial transcriptomics to decipher tumor phenotype predictive of relapse-free survival in Wilms tumor
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1539897
PMID:40098972
|
研究论文 | 通过整合单核RNA测序和空间转录组学数据，鉴定与肾母细胞瘤复发相关的肿瘤亚型并构建预后预测模型 | 首次在肾母细胞瘤中识别出与不良无复发生存期相关的Scissor+肿瘤细胞亚型，并发现其对EGFR抑制剂的敏感性 | 基于公共数据库的回顾性研究，需要前瞻性临床验证 | 识别驱动肾母细胞瘤复发的分子特征并发现新的治疗靶点 | 肾母细胞瘤患者样本 | 数字病理学 | 肾母细胞瘤 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 免疫组织化学 | 集成机器学习模型, Cox回归, LASSO回归 | 基因表达数据, 突变数据, 拷贝数变异数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 9813 | 2025-10-07 |
The Role of PLIN3 in Prognosis and Tumor-Associated Macrophage Infiltration: A Pan-Cancer Analysis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S509245
PMID:40098998
|
研究论文 | 通过泛癌分析探讨PLIN3在预后和肿瘤相关巨噬细胞浸润中的作用 | 首次系统评估PLIN3对肿瘤免疫微环境的影响及其作为免疫治疗反应预后指标的潜力 | 研究主要基于数据库分析，实验验证主要在肺腺癌细胞中进行 | 评估PLIN3作为癌症诊断和预后生物标志物的潜力及其对免疫细胞浸润的影响 | 多种正常和癌组织、肺腺癌细胞 | 生物信息学 | 多种癌症 | 单细胞转录组学、空间转录组学、多重荧光染色、分子对接 | 计算算法 | mRNA表达数据、蛋白质表达数据、转录组数据 | 多个数据库中的多样化组织样本 | NA | 单细胞转录组学,空间转录组学,批量转录组学 | NA | NA |
| 9814 | 2025-10-07 |
Key genes linking gut microbiota, immune cells, and osteoporosis: A multi-omics approach
2025-May, Microbial pathogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.micpath.2025.107412
PMID:39993547
|
研究论文 | 通过整合孟德尔随机化、单细胞RNA测序和生物信息学分析，探索肠道微生物群、免疫细胞调控与骨质疏松症之间的因果关系 | 首次采用多组学方法系统揭示肠道微生物群通过免疫细胞介导影响骨质疏松的分子机制，并识别出关键基因USP6NL、SELENOT和TAF1A | 研究主要基于欧洲人群数据（UK Biobank和芬兰队列），结果在其他人群中的普适性需要进一步验证 | 阐明肠道微生物群通过免疫调控影响骨质疏松的分子机制 | 骨质疏松症患者与对照样本 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | 两样本孟德尔随机化 | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | UK Biobank和芬兰队列数据，包含412种肠道微生物物种和731种免疫细胞类型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9815 | 2025-10-07 |
Multi-Targeting CAR-T Cell Strategies to Overcome Immune Evasion in Lymphoid and Myeloid Malignancies
2025-Mar-14, Oncology research and treatment
IF:2.0Q3
DOI:10.1159/000543806
PMID:40090318
|
综述 | 探讨多靶向CAR-T细胞策略在克服淋巴和髓系恶性肿瘤免疫逃逸中的应用 | 提出逻辑门控CAR、适配器CAR等多靶向策略应对抗原逃逸问题 | NA | 改善CAR-T细胞疗法在血液恶性肿瘤中的治疗效果和持久性 | 淋巴和髓系恶性肿瘤患者 | NA | 淋巴瘤、多发性骨髓瘤 | 下一代测序(NGS)、直接随机光学重建显微镜(dSTORM)、多参数流式细胞术、CRISPR筛选、单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9816 | 2025-10-07 |
Recurrent ERBB2 alterations are associated with esophageal adenocarcinoma brain metastases
2025-Feb-26, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.02.19.25322558
PMID:40061311
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示食管腺癌脑转移中ERBB2基因的复发性改变及其临床意义 | 首次在食管腺癌脑转移中发现ERBB2基因的复发性扩增，并证明其与单克隆播散相关 | 样本量较小（10例），需要更大规模研究验证 | 探究食管腺癌脑转移的分子特征和临床治疗策略 | 食管腺癌脑转移患者及其匹配的原发肿瘤 | 数字病理学 | 食管癌 | 全基因组测序, 单细胞空间转录组学 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 10例食管腺癌脑转移患者 | NA | 全基因组测序, 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 9817 | 2025-10-07 |
MolGene-E: Inverse Molecular Design to Modulate Single Cell Transcriptomics
2025-Feb-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.19.638723
PMID:40060426
|
研究论文 | 开发了一种名为MolGene-E的深度生成框架，用于基于单细胞转录组数据设计新药物分子 | 首个能够利用单细胞组学数据设计新药物分子的机器学习方法，结合了跨模态数据协调和对比学习生成模型 | 单细胞组学数据存在噪声、异质性、稀缺性和高维度等挑战 | 开发能够调节单细胞转录组学的逆向分子设计方法 | 疾病细胞与健康细胞的转录组状态 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学 | 深度生成框架,跨模态模型,对比学习生成模型 | 单细胞转录组数据,化学扰动的大量转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9818 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomics combined with single-nucleus RNA sequencing reveals glial cell heterogeneity in the human spinal cord
2025-Nov-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-23-01876
PMID:38934400
|
研究论文 | 本研究结合空间转录组学和单核RNA测序技术，揭示了人类脊髓中胶质细胞的异质性 | 首次在人类脊髓中系统绘制胶质细胞的转录组异质性图谱，并进行跨物种比较分析 | 样本数量有限，未涵盖所有可能的病理状态 | 探索人类脊髓胶质细胞的分子异质性及其在物种间的差异 | 人类和小鼠脊髓中的星形胶质细胞、小胶质细胞和少突胶质细胞 | 空间转录组学 | 神经系统疾病 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间位置数据 | NA | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 9819 | 2025-10-07 |
Exosomes originating from neural stem cells undergoing necroptosis participate in cellular communication by inducing TSC2 upregulation of recipient cells following spinal cord injury
2025-Nov-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00068
PMID:38993124
|
研究论文 | 本研究探讨了脊髓损伤后经历坏死性凋亡的神经干细胞来源的外泌体在细胞通讯中的作用及其对受体细胞TSC2表达的影响 | 首次揭示了神经干细胞坏死性凋亡来源的外泌体通过诱导TSC2上调参与脊髓损伤后细胞通讯的新机制 | 研究主要基于体外实验模型，体内验证仍需进一步深入 | 探究脊髓损伤后神经干细胞坏死性凋亡来源的外泌体在细胞通讯中的功能 | 胚胎小鼠神经干细胞、外泌体、脊髓损伤模型 | 单细胞组学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序、转录组测序 | NA | RNA测序数据 | 16-17天胚胎小鼠神经干细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9820 | 2025-10-07 |
Oligodendroglial heterogeneity in health, disease, and recovery: deeper insights into myelin dynamics
2025-Nov-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00694
PMID:39665821
|
综述 | 通过单细胞RNA测序技术重新定义少突胶质细胞谱系的五种细胞状态，并探讨其在健康和疾病状态下的功能意义 | 提出基于单细胞RNA测序发现的少突胶质细胞谱系新分类系统，将传统两种细胞类型扩展为五种连续细胞状态 | NA | 建立统一的少突胶质细胞术语体系以促进跨研究数据整合，深化对髓鞘病理机制的理解 | 少突胶质细胞谱系细胞 | 单细胞生物学 | 多发性硬化症,阿尔茨海默病,肌萎缩侧索硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |