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当前共找到 10619 篇文献,本页显示第 961 - 980 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
961 2026-01-17
Identification of Disulfidptosis-Associated Hub Genes in Psoriasis via Integrated Transcriptomic and Experimental Validation Approaches
2025-Nov, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 本研究通过整合转录组学和单细胞RNA测序数据,结合机器学习方法,识别了与银屑病相关的二硫化物死亡相关枢纽基因,并探讨了其在疾病发病机制中的作用 首次将新发现的细胞死亡途径——二硫化物死亡与银屑病联系起来,并利用整合的转录组学和单细胞RNA测序数据结合机器学习方法识别了相关的枢纽基因 研究主要基于生物信息学分析和小鼠模型验证,需要在人类临床样本中进行进一步的功能验证 探究二硫化物死亡相关基因在银屑病发病机制中的作用,并识别潜在的生物标志物和治疗靶点 银屑病皮损和非皮损皮肤组织,以及咪喹莫特诱导的银屑病样小鼠模型 生物信息学 银屑病 转录组学分析,单细胞RNA测序,Western blotting LASSO回归,随机森林 转录组数据,单细胞RNA测序数据 多个数据集(GSE106992,GSE11239,GSE162183)和小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
962 2026-01-17
Foxn3 is required to suppress aberrant ciliogenesis in nonphotoreceptor retinal neurons
2025-Jul-22, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究探讨了转录因子Foxn3在抑制视网膜非感光神经元中异常纤毛发生中的作用 首次揭示了Foxn3作为关键转录抑制因子,通过直接结合并抑制纤毛基因及其反式激活因子的启动子,来防止非感光神经元形成类似感光细胞的纤毛结构 研究主要基于小鼠模型,其在人类视网膜中的具体作用机制尚需进一步验证 探究视网膜细胞类型间纤毛结构差异的建立与维持机制 视网膜特异性条件性敲除(Foxn3CKO)小鼠的视网膜神经元,特别是双极细胞和无长突细胞 发育生物学 纤毛病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、染色质分析、转录测定 条件性基因敲除小鼠模型 基因表达数据、电生理数据、染色质结合数据 Foxn3CKO小鼠及其对照 NA 单细胞RNA测序 NA NA
963 2026-01-17
Genomic and Single-Cell Analyses Characterize Patient-Derived Tumor Organoids to Enable Personalized Therapy for Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2025-Jul-15, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究通过建立头颈部鳞状细胞癌患者来源的肿瘤类器官,结合基因组和单细胞分析,揭示了肿瘤异质性、顺铂耐药机制,并识别了潜在治疗靶点 利用患者来源的肿瘤类器官模型,结合bulk和单细胞RNA测序,首次在类器官中表征了分子亚型和瘤内转录异质性,并发现了一种与顺铂耐药和不良预后相关的混合上皮-间质转化样程序,识别了amphiregulin作为关键调节因子 研究样本量相对较小(31例患者),且主要基于体外类器官模型,其体内生理环境模拟和长期临床验证仍需进一步研究 改善头颈部鳞状细胞癌的生物学理解并开发个性化疗法 头颈部鳞状细胞癌患者及其来源的肿瘤类器官 数字病理学 头颈部鳞状细胞癌 bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 患者来源的肿瘤类器官模型 基因组数据, 转录组数据, 组织病理学数据 31例头颈部鳞状细胞癌患者 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
964 2026-01-17
LSD1 inhibition corrects dysregulated MHC-I and dendritic cells activation through IFNγ-CXCL9-CXCR3 axis to promote antitumor immunity in HNSCC
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究阐明了LSD1抑制通过IFNγ-CXCL9-CXCR3轴调控MHC-I和树突状细胞激活,从而增强头颈鳞状细胞癌抗肿瘤免疫的机制 首次揭示了LSD1抑制通过激活H3K4me2并直接与MHC-I相互作用来诱导抗肿瘤免疫的新机制 研究主要基于小鼠模型和体外共培养实验,在人体内的直接验证尚不充分 阐明LSD1在头颈鳞状细胞癌抗肿瘤免疫中的作用机制 头颈鳞状细胞癌小鼠模型、人类头颈鳞状细胞癌细胞、外周血单个核细胞 肿瘤免疫学 头颈鳞状细胞癌 流式细胞术、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、蛋白质表达数据 小鼠模型、人类细胞系、TCGA数据库数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
965 2026-01-17
Smooth muscle cell-specific CD47 deletion suppresses atherosclerosis
2025-Jan-15, Life sciences IF:5.2Q1
研究论文 本研究探讨了平滑肌细胞特异性CD47缺失对动脉粥样硬化的抑制作用 首次揭示了TSP1-CD47信号在调节VSMC表型中的作用,并证明SMC特异性Cd47缺失能抑制动脉粥样硬化病变形成 未详细探讨CD47缺失对其他细胞类型或全身代谢的长期影响,且主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 研究血管平滑肌细胞TSP1-CD47信号在调节VSMC表型和动脉粥样硬化发展中的作用 人类和小鼠的血管平滑肌细胞、动脉粥样硬化组织、SMC特异性Cd47敲除小鼠 心血管疾病研究 动脉粥样硬化 单细胞RNA测序、免疫组织化学、分子生物学技术、细胞特异性敲除小鼠模型 NA 基因表达数据、组织图像、细胞实验数据 人类动脉粥样硬化血管组织、小鼠模型(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
966 2026-01-17
Efficient and accurate detection of viral sequences at single-cell resolution reveals putative novel viruses perturbing host gene expression
2025-Jan-02, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种基于高度保守氨基酸域的方法,用于在批量及单细胞转录组学数据中高效、准确地检测病毒序列,并应用于识别恒河猴PBMC数据中的潜在新病毒 该方法不依赖参考基因组,能保留单细胞分辨率,通过细胞条形码追踪,覆盖超过10万种RNA病毒物种,实现病毒存在与宿主基因表达的并行分析 未明确提及具体样本量或实验验证细节,可能受限于数据质量和病毒保守域的覆盖范围 开发一种高效准确的病毒检测方法,以理解病毒感染对人类健康的影响并预测潜在流行病 病毒序列(特别是RNA病毒)及宿主基因表达,应用于恒河猴外周血单个核细胞数据 生物信息学 病毒感染 高通量测序,单细胞转录组学 基于保守氨基酸域的检测方法 转录组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
967 2026-01-16
Type 2 diabetes Reprograms Bone Marrow Hematopoiesis and Dysregulates Immune Signaling in Response to Stroke
2025-Dec-30, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了2型糖尿病如何通过重编程骨髓造血功能和失调免疫信号通路来恶化中风后的免疫反应和预后 首次在单细胞水平上揭示了2型糖尿病背景下中风后骨髓造血功能的重编程、细胞间通讯网络的重组以及代谢与免疫信号通路的失调 研究基于小鼠模型,其结论在人类中的普适性有待验证;研究主要关注骨髓,未全面评估外周免疫器官的影响 阐明2型糖尿病恶化中风预后的潜在免疫机制 对照(db/+)和糖尿病(db/db)小鼠的骨髓细胞 单细胞组学与免疫学 2型糖尿病与缺血性中风 单细胞RNA测序,GeoMx数字空间谱分析,nCounter分析,流式细胞术 伪时间轨迹分析,CellChat细胞通讯分析,AUCell富集分析 单细胞转录组数据,空间转录组数据,基因表达数据,流式细胞数据 对照和糖尿病小鼠模型(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学,数字分子谱分析 GeoMx DSP,nCounter GeoMx数字空间谱分析用于空间基因表达分析,nCounter用于靶向基因表达分析
968 2026-01-16
A stem cell knockout village reveals lineage rewiring and a non-canonical islet cell fate in monogenic diabetes
2025-Dec-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文通过建立敲除村框架,利用纵向单细胞RNA测序分析79个人类多能干细胞突变系,揭示了单基因糖尿病中细胞命运重连和非经典胰岛细胞命运的形成机制 首次引入敲除村框架进行大规模纵向单细胞RNA测序分析,揭示了单基因糖尿病基因突变导致β细胞向肠嗜铬样细胞命运转变的新机制,并预测验证了ISL1作为关键下游效应因子 研究主要基于体外干细胞分化模型,可能无法完全模拟体内复杂环境;突变系数量虽多,但仅覆盖30个发育调节因子 探究单基因糖尿病中基因突变如何改变发育轨迹并产生病理细胞状态 79个人类多能干细胞突变系,靶向30个发育调节因子(包括15个糖尿病基因),分化为胰岛细胞 单细胞组学 单基因糖尿病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 79个干细胞突变系,覆盖五个胰岛分化阶段 NA 单细胞RNA-seq NA NA
969 2026-01-16
Site-specific ERα phosphorylation determines sex-dependent metabolic, reproductive, and body-compositional phenotypes in mice
2025-Dec-19, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过构建ERα特定丝氨酸位点磷酸化缺陷的基因敲入小鼠,揭示了位点特异性ERα磷酸化对小鼠代谢、生殖和身体组成的性别依赖性调控作用 首次在体内系统研究了ERα两个保守磷酸化位点(S171和S216)的生理功能,并发现这些位点对代谢、生殖和骨骼表型具有性别特异性的调控作用 研究仅限于小鼠模型,人类中的相关性尚需验证;机制研究主要基于转录组分析,具体的信号通路和分子机制有待深入 探究雌激素受体α(ERα)特定磷酸化位点在调节代谢、生殖和身体组成中的生理功能 ERα S171A和S216A磷酸化缺陷基因敲入小鼠 分子生物学 代谢性疾病 基因敲入、单细胞空间转录组学、代谢谱分析 NA 转录组数据、代谢数据、骨骼密度数据 基因敲入小鼠模型 NA 单细胞空间转录组学 NA NA
970 2026-01-16
CellMentor: cell-type aware dimensionality reduction for single-cell RNA-sequencing data
2025-Dec-11, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文介绍了一种名为CellMentor的全监督降维方法,用于单细胞RNA测序数据分析 CellMentor是一种基于非负矩阵分解的全监督降维方法,首次将细胞类型标签直接整合到优化目标中,以最小化已知群体内的变异并最大化类型间的区分 NA 开发一种改进的单细胞RNA测序数据降维方法,以优化细胞类型识别 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 非负矩阵分解 基因表达谱 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
971 2026-01-16
Aire-dependent interferon signalling shapes thymocyte maturation and central tolerance in mice
2025-Dec-09, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了Aire蛋白通过调控胸腺干扰素信号通路,影响胸腺细胞成熟和中枢免疫耐受的机制 首次在单细胞分辨率下系统揭示了Aire缺陷如何通过干扰素信号通路影响胸腺微环境中多种免疫细胞的转录组特征 研究仅限于小鼠模型,未在人类样本中验证;机制研究主要基于转录组分析,缺乏功能实验的直接验证 阐明Aire缺陷如何通过干扰素信号通路影响免疫细胞发育和中枢耐受 Aire缺陷型和野生型小鼠的胸腺、骨髓和淋巴结免疫细胞 单细胞组学 自身免疫性疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 Aire缺陷型和野生型小鼠的胸腺、骨髓和淋巴结组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
972 2026-01-16
Single-cell sequencing reveals MCAM+ MyCAFs as key pro-angiogenic cells interacting with endothelial cells in solid-type adenoid cystic carcinoma
2025-Dec-08, Cancer cell international IF:5.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了在实体型腺样囊性癌中,MCAM+肌成纤维细胞样癌症相关成纤维细胞是关键的促血管生成细胞,它们通过转录因子MEF2C上调促血管生成因子的表达,从而促进血管生成和肿瘤生长 首次在实体型腺样囊性癌中鉴定出MCAM+肌成纤维细胞样癌症相关成纤维细胞作为关键的促血管生成细胞亚群,并揭示了其通过MEF2C转录因子调控促血管生成因子转录的上游机制 研究主要基于体外和体内实验模型,临床样本的直接验证可能有限,且未详细探讨MCAM+ myCAFs与其他肿瘤微环境成分的相互作用 探究实体型腺样囊性癌中癌症相关成纤维细胞与血管生成之间的关系及其分子机制 实体型与非实体型腺样囊性癌中的癌症相关成纤维细胞、内皮细胞以及SACC83细胞系 数字病理学 腺样囊性癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 未明确指定样本数量,但涉及原代CAFs分离、细胞系实验及体内模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
973 2026-01-16
Intratumoral Collinsella aerofaciens exhibits antitumor activity in endometrial carcinoma through activation of the p53 signaling pathway
2025-Dec-08, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究揭示了子宫内膜癌肿瘤内微生物群的组成,并鉴定出Collinsella aerofaciens通过激活p53信号通路发挥抗肿瘤作用 首次在子宫内膜癌中鉴定出Collinsella aerofaciens作为新型抑菌菌,并通过多组学技术揭示了其通过激活p53通路抑制肿瘤的机制 微生物功能机制仍需进一步体内验证,样本量可能有限 表征子宫内膜癌肿瘤内微生物组,阐明微生物空间定位并鉴定具有肿瘤抑制特性的细菌 子宫内膜癌患者的肿瘤组织、癌旁正常组织、EC细胞系及小鼠模型 微生物组学与肿瘤学 子宫内膜癌 5R 16S rRNA测序, 荧光原位杂交, 空间转录组学, 单细胞RNA测序, RNA测序, 粪便微生物移植 NA 微生物组数据, 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, RNA测序数据 子宫内膜癌患者的肿瘤和癌旁组织样本(具体数量未明确) NA 16S rRNA测序, 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA NA
974 2026-01-16
Neutrophil extracellular traps released by CD177+ neutrophils aggravated inflammation and neuronal impairment post-SCI
2025-Dec-07, Cell communication and signaling : CCS IF:8.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序在脊髓损伤小鼠模型中鉴定出三个不同的中性粒细胞亚群,并发现CD177+中性粒细胞通过释放中性粒细胞胞外陷阱加剧炎症和神经元损伤 首次在脊髓损伤后鉴定出中性粒细胞亚群,并揭示CD177+中性粒细胞通过PAD4和ROS依赖的NETs形成促进炎症和神经元凋亡的新机制 研究主要基于小鼠模型和有限的患者数据,人类样本的验证仍需扩大 探究脊髓损伤后中性粒细胞的功能异质性及其在炎症和神经元损伤中的作用 脊髓损伤小鼠模型和患者样本中的中性粒细胞 单细胞组学 脊髓损伤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠模型和SCI患者样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
975 2026-01-16
Harnessing plasma transcriptomics for non-invasive cancer biomarker identification: a comprehensive review
2025-Dec-07, Discover oncology IF:2.8Q2
综述 本文全面综述了利用血浆转录组学进行非侵入性癌症生物标志物识别的技术、分析流程、挑战与未来方向 系统性地评估了多种转录组学技术(包括RNA-seq、scRNA-seq和空间转录组学)在血浆样本中的应用潜力,并强调了整合分析(如元分析和AI辅助的多组学整合)这一新兴趋势对生物标志物发现的增强作用 血浆转录组学存在技术局限性,如RNA降解、产量低以及缺乏标准化流程,这限制了其临床转化 旨在为癌症研究人员和临床医生提供关于血浆转录组学的基础知识和实用见解,推动其在精准肿瘤学和非侵入性癌症诊断中的应用 血浆样本中的转录组 自然语言处理 癌症 高通量测序(RNA-seq)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
976 2026-01-16
A DSSM network for inferring and prioritizing cell-type-specific regulons using single-cell RNA-seq data
2025-Dec-07, BMC bioinformatics IF:2.9Q1
研究论文 本研究提出了一种基于深度结构化语义模型(DSSMReg)的方法,用于从单细胞RNA-seq数据中推断和优先排序细胞类型特异性调控模块 利用深度结构化语义模型将转录因子和靶基因映射到低维语义空间,通过余弦相似度评估调控强度,并结合AUCell算法对调控模块进行重要性排序 未明确提及模型在处理大规模数据或复杂组织样本时的计算效率或泛化能力限制 开发一种从单细胞转录组数据中识别细胞类型特异性调控模块的计算方法 转录因子及其靶基因形成的调控模块(regulons) 机器学习 三阴性乳腺癌 单细胞RNA-seq DSSM(深度结构化语义模型) 单细胞转录组数据、转录因子基序数据 五个细胞系的scRNA-seq数据,以及三阴性乳腺癌和人类骨髓造血干细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
977 2026-01-16
Organoid-derived photoreceptor precursors enriched by CD9⁻CD81mid sorting restore visual function in RCS rats
2025-Dec-07, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1
研究论文 本研究通过分析人视网膜类器官的单细胞RNA测序数据,鉴定出CD9⁻CD81mid表面标记物组合,用于富集光感受器前体细胞,并将其移植至RCS大鼠视网膜下腔,成功改善了视觉功能 首次提出基于CD9⁻CD81mid表面标记物的非遗传性富集策略,避免了基因标记的临床转化限制,为视网膜退行性疾病的细胞治疗提供了更安全的替代方案 研究仅在RCS大鼠模型中进行,尚未在更大型动物或人体中进行验证;长期安全性和免疫排斥反应需进一步评估 开发一种临床可转化的非遗传性策略,用于富集人光感受器前体细胞,以治疗视网膜退行性疾病 人视网膜类器官来源的光感受器前体细胞及RCS大鼠模型 数字病理学 视网膜退行性疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫荧光、流式细胞术、荧光激活细胞分选(FACS) NA 单细胞RNA测序数据、图像数据、电生理数据 未明确说明具体样本数量,涉及人视网膜类器官及RCS大鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
978 2026-01-16
Using single-cell and transcriptome data to identify prognostic genes associated with SUMO-ylation and their molecular regulatory mechanisms in breast cancer
2025-Dec-06, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 本研究基于单细胞RNA测序和转录组数据,识别了与SUMO化相关的乳腺癌预后基因,并开发了一个风险模型 结合单细胞RNA测序和转录组数据,首次系统性地识别了与SUMO化相关的乳腺癌预后基因,并构建了具有良好预测性能的风险模型 研究主要基于生物信息学分析,虽然进行了RT-qPCR验证,但缺乏更深入的体内外功能实验验证 探索SUMO化相关基因在乳腺癌中的预后价值及其分子调控机制 乳腺癌患者组织样本 生物信息学 乳腺癌 单细胞RNA测序, 转录组测序, RT-qPCR 风险模型, 列线图模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
979 2026-01-16
A mitochondria-related gene-based signature predicts pancreatic ductal adenocarcinoma clinical outcome and revealed CAMK2A/THEM4 regulates progression phenotypes and mitophagy in vivo and in vitro
2025-Dec-06, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究开发了一个基于线粒体相关基因的预后特征,用于预测胰腺导管腺癌的临床结果,并揭示了CAMK2A/THEM4在体内外调节进展表型和线粒体自噬的作用 首次开发了基于线粒体相关基因的胰腺癌预后特征,并深入研究了CAMK2A和THEM4的协同作用机制,提出了CAMK2A-THEM4-AKT轴作为新的治疗靶点 NA 开发稳健的分子特征以改善胰腺导管腺癌的风险分层并识别潜在治疗靶点 胰腺导管腺癌患者 机器学习 胰腺癌 机器学习,单细胞测序,免疫组化微阵列,体内异种移植模型 NA 基因表达数据,单细胞测序数据,免疫组化数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
980 2025-12-08
From bulk RNA sequencing to spatial transcriptomics: a comparative review of differential gene expression analysis methods
2025-Dec-06, Human genomics IF:3.8Q2
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
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