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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 961 | 2026-08-18 |
Umbilical cord blood-derived cytotoxic T lymphocytes target melanoma via HLA-A2-restricted tumour antigens
2025-10, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70444
PMID:41088891
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研究论文 | 本研究评估了脐带血与外周血来源的HLA-A2限制性抗原特异性CD8+ T细胞对黑色素瘤的细胞毒性,并利用单细胞RNA测序和TCR测序分析细胞组成和TCR克隆型,以探索脐带血作为内源性细胞治疗细胞资源库的可行性。 | 首次证实脐带血可作为内源性T细胞治疗的细胞资源库,并揭示了脐带血与外周血中抗原特异性T细胞亚群组成的差异,同时通过TCR测序扩展了靶向黑色素瘤的TCR数据库。 | 研究主要依赖体外和体内实验,可能未完全反映体内复杂的免疫微环境;TCR克隆型的多样性和功能验证仍需进一步临床研究支持。 | 评估脐带血来源的抗原特异性CD8+ T细胞对黑色素瘤的细胞毒性,并与外周血来源的细胞进行比较,探索脐带血作为内源性T细胞治疗的替代细胞来源,并扩展TCR库。 | 脐带血和外周血来源的HLA-A2限制性抗原特异性CD8+ T细胞,以及黑色素瘤细胞系。 | 细胞治疗、免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序、TCR V(D)J测序、分子对接模拟、细胞毒性实验(体内外) | NA | 单细胞转录组数据、TCR序列数据、分子对接数据 | 未明确,涉及脐带血和外周血样本及黑色素瘤细胞系 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、单细胞V(D)J测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 和 V(D)J 测序 |
| 962 | 2026-08-18 |
Granulocyte colony-stimulating factor induced T-cell hyporesponsiveness via modulation of CD177+S100Ahi neutrophils in unexplained recurrent pregnancy loss
2025-10, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70508
PMID:41103061
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序等技术,揭示了G-CSF通过扩增具有PMN-MDSC特性的CD177+S100Ahi中性粒细胞改善不明原因复发性流产患者妊娠结局的机制 | 首次表征了G-CSF动员的CD177+S100Ahi中性粒细胞具有PMN-MDSC特性,并揭示了其通过ARG1/L-Arg代谢轴和免疫检查点分子协同作用诱导T细胞低反应性的机制 | 摘要未提及局限性 | 探讨G-CSF在不明原因复发性流产中通过调节中性粒细胞改善母胎免疫的机制 | 不明原因复发性流产患者及健康孕妇的外周血和蜕膜组织,以及流产倾向小鼠模型 | 单细胞组学,免疫学 | 不明原因复发性流产 | 单细胞RNA测序,单细胞T细胞受体测序,空间转录组学,流式细胞术,免疫组化 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,流式细胞术数据,免疫组化图像 | 具体样本量未在摘要中说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,单细胞T细胞受体测序,空间转录组学 | 10x Chromium,10x Visium | 10x Chromium单细胞3'文库,10x Visium空间转录组 |
| 963 | 2026-08-18 |
Dissecting cross-lineage tumourigenesis under p53 inactivation through single-cell multi-omics and spatial transcriptomics
2025-09, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70461
PMID:40887856
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学和空间转录组学技术,深入解析了p53失活后不同细胞谱系的肿瘤发生机制。 | 利用单细胞多组学和空间转录组学构建了Trp53功能细胞图谱,并结合深度学习基因网络模型重建了p53调控网络,揭示了p53缺失下跨谱系肿瘤发生的共享和谱系特异性特征。 | 研究基于小鼠模型,可能不完全等同于人类情况;且空间转录组学分辨率有限,可能无法完全捕捉细胞间相互作用。 | 阐明p53失活后不同细胞谱系的细胞稳态破坏和肿瘤发生机制。 | Trp53敲除小鼠模型的免疫、基质和上皮细胞。 | 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞转录组、单细胞ATAC测序、空间转录组、全基因组测序、CUT&Tag | 深度学习基因网络模型 | 单细胞多组学数据、空间转录组数据、全基因组测序数据 | 小鼠模型,具体样本量未在摘要中提供。 | NA | 单细胞转录组、单细胞ATAC测序、空间转录组 | NA | NA |
| 964 | 2026-08-18 |
Stereo-cell: Advancing spatial single-cell biology towards clinical translation
2025-09, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70480
PMID:40984816
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评论 | 本文介绍Stereo-cell空间单细胞测序平台,该平台整合形态学、转录组学和蛋白质组学,实现高分辨率空间单细胞分析,并探讨其在临床转化中的潜力与挑战 | Stereo-cell平台通过整合形态学、转录组学和蛋白质组学,在保留空间背景的同时实现多模态分析,能检测稀有细胞并支持临床可解释的诊断,填补了高级组学与传统病理学之间的空白 | 重要挑战包括数据整合、监管合规和数字建模等方面,这些是实现临床实施的关键障碍 | 展示Stereo-cell平台在空间单细胞生物学向临床转化中的应用前景,并讨论其技术优势及面临的挑战 | Stereo-cell平台及其在空间单细胞测序中的应用 | 空间转录组学 | 不适用 | 空间单细胞测序 | 不适用 | 空间转录组、蛋白质组和形态学数据 | 不适用 | 不适用 | 空间单细胞测序 | Stereo-cell | Stereo-cell平台,整合形态学、转录组学和蛋白质组学 |
| 965 | 2026-08-18 |
CD103+CD8+ tissue-resident memory T lymphocytes of melanoma boost anti-tumour immunity and predict immunotherapy outcomes
2025-09, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70464
PMID:40985995
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研究论文 | 本研究探讨了黑色素瘤中CD103+CD8+组织驻留记忆T淋巴细胞(TRM)的抗肿瘤免疫功能及其对免疫治疗预后的预测价值 | 首次揭示CD103通过激活整合素依赖的PI3K/AKT信号通路促进CD8+ TRM的增殖和抗肿瘤效应,并发现其在三级淋巴结构中富集且可促进其形成,作为免疫治疗反应的可靠预测因子 | 未明确提及,但可能包括样本来源的局限性及机制研究的深入程度需进一步验证 | 阐明CD103+CD8+ TRM在黑色素瘤抗肿瘤免疫中的作用机制及其作为免疫治疗疗效预测标志物的潜力 | 黑色素瘤患者组织样本及小鼠模型中的CD8+组织驻留记忆T淋巴细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多重免疫组化、磁珠分选 | NA | 图像、基因表达数据 | 包括ZS黑色素瘤队列及多个独立患者队列,具体样本数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | 具体配置未提供 |
| 966 | 2026-08-18 |
Developing risk stratification strategies and biomarkers for recurrent hepatocellular carcinoma
2025-08, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70410
PMID:40741894
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综述 | 本文综述了肝细胞癌术后复发风险分层策略及生物标志物的最新进展,包括基因组、转录组、蛋白质组和代谢组生物标志物,以及液体活检和人工智能驱动的组织学和影像组学分析。 | 整合了多组学、液体活检、AI及单细胞和空间转录组学技术,提出个性化监测方案以改善HCC患者预后。 | 未详细讨论各技术的具体临床应用限制和实施障碍。 | 探讨肝细胞癌复发风险分层和生物标志物开发的前沿进展。 | 肝细胞癌复发患者及相关生物标志物。 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞和空间转录组学技术 |
| 967 | 2026-08-18 |
Multi-omics profiling identifies TNFRSF18 as a novel marker of exhausted CD8⁺ T cells and reveals tumour-immune dynamics in colorectal cancer
2025-08, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70425
PMID:40770837
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研究论文 | 通过多组学分析,识别出TNFRSF18作为CD8⁺ T细胞耗竭的新标志物,并揭示结直肠癌中肿瘤-免疫动态变化 | 首次整合单细胞转录组、单细胞VDJ测序和空间转录组学,系统描绘了不同TNM分期下CD8⁺ T细胞耗竭的动态演变,并发现TNFRSF18和核糖体干性相关基因作为新生物标志物 | 样本量较小(仅6例患者),且主要依赖公共数据集验证,可能限制结果的普适性 | 探究结直肠癌中CD8⁺ T细胞耗竭的跨TNM分期动态演变及其对预后和免疫逃逸的影响 | 结直肠癌患者的肿瘤及邻近组织样本中的CD8⁺ T细胞、肿瘤细胞及免疫细胞 | 多组学、数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单细胞TCR/BCR测序(scVDJ-seq)、空间转录组学、免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据、单细胞VDJ数据、空间转录组数据、免疫荧光图像 | 来自6例结直肠癌患者的20个肿瘤及邻近组织样本 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞VDJ测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 968 | 2026-08-18 |
Integrative single-cell transcriptomic analysis deciphers heterogeneous characteristics of gastrointestinal tract cancer
2025-08, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70415
PMID:40785647
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组数据,系统性解析了胃肠道癌症的异质性特征 | 构建了胃肠道癌症的综合单细胞图谱,识别了24个共识上皮细胞元程序和42个非上皮细胞亚型,发现食管癌和胃癌的化生特征与结直肠癌的相似性 | 未提供明确的局限性信息 | 解析胃肠道癌症在单细胞水平上的共同和异质性分子特征 | 胃肠道癌症,包括食管癌、胃癌和结直肠癌 | 单细胞转录组学 | 胃肠道癌症 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解 | 单细胞转录组数据 | 577个样本,包括121个食管癌、182个胃癌和254个结直肠癌 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 969 | 2026-08-18 |
Reconstitution of T cell-mediated immunity by umbilical cord-derived mesenchymal stem cells in ulcerative colitis
2025-08, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70452
PMID:40842289
|
研究论文 | 本文通过单臂临床试验和单细胞RNA测序,研究了脐带间充质干细胞对溃疡性结肠炎的治疗效果及其通过调节T细胞介导免疫的机制 | 首次结合单细胞RNA测序和动物模型,揭示脐带间充质干细胞通过抑制T细胞促炎特征和DUOX2介导的氧化应激,实现肠道黏膜免疫重建的机制 | 单臂临床试验缺乏对照组,样本量较小且随访时间短,机制验证主要依赖小鼠模型 | 评估脐带间充质干细胞治疗溃疡性结肠炎的临床疗效,并阐明其免疫调节机制 | 中度至重度左侧溃疡性结肠炎患者及DSS诱导的结肠炎小鼠模型 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 26名患者和若干小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 970 | 2026-08-18 |
Spatial transcriptomic analysis across histological subtypes reveals molecular heterogeneity and prognostic markers in early-stage lung adenocarcinoma
2025-08, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70439
PMID:40847563
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研究论文 | 利用空间转录组分析揭示早期肺腺癌不同组织学亚型间的分子异质性和预后标志物 | 首次在早期肺腺癌中结合空间转录组和多重免疫荧光,解析不同组织学亚型(高、中、低分化)的肿瘤上皮和巨噬细胞富集区域的分子特征,并整合关键通路构建预后相关复合分子签名 | 研究样本量有限(未具体说明数量),且仅基于FFPE样本,可能影响结果的普适性;未进行功能验证实验 | 探究早期肺腺癌分子特征与组织学亚型之间的关联,并识别预测疾病进展和预后的潜在生物标志物 | 早期肺腺癌患者的FFPE组织样本,涵盖高分化、中分化和低分化三种组织学亚型 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组、多重免疫荧光 | NA | 图像和转录组数据 | 未具体说明样本数量 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | GeoMx Digital Spatial Profiler平台用于空间转录组分析,多重免疫荧光用于验证 |
| 971 | 2026-08-18 |
T-cell differentiation stage block bias confers hypermethylation and mediastinal preference in T-cell lymphoblastic lymphoma
2025-07, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70380
PMID:40579780
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研究论文 | 本研究通过多组学数据对比T细胞淋巴母细胞淋巴瘤(T-LBL)与T细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL),揭示T-LBL恶性T细胞主要在DN和DP阶段阻滞,导致免疫抑制微环境及纵隔偏好,并通过E2F2上调UHRF1引起肿瘤抑制基因高甲基化,去甲基化治疗可有效抑制肿瘤增殖 | 首次从分化阻滞阶段偏倚的角度阐明T-LBL与T-ALL的差异,发现DN/DP阶段阻滞与纵隔偏好及免疫抑制微环境的关联,并揭示E2F2-UHRF1轴驱动的高甲基化机制及去甲基化治疗潜力 | 尚未提及具体局限性 | 探讨T-LBL与T-ALL在分化阻滞阶段上的差异及其对临床表现、微环境和治疗反应的影响 | T-LBL和T-ALL患者样本,包括来自NCH-TALL-LBL队列的流式细胞术数据和体细胞突变数据,以及T-LBL样本的单细胞RNA测序和T细胞受体测序数据 | 数字病理学 | T细胞淋巴母细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序、单细胞T细胞受体测序、表达阵列、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、突变数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、单细胞T细胞受体测序 | NA | NA |
| 972 | 2026-08-18 |
IGF2BP2 binding to CPSF6 facilitates m6A-mediated alternative polyadenylation of PUM2 and promotes malignant progression in ovarian cancer
2025-07, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70388
PMID:40629911
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研究论文 | 本研究揭示了卵巢癌中m6A修饰通过IGF2BP2与CPSF6的相互作用调控PUM2的替代性多聚腺苷酸化,从而促进肿瘤恶性进展的机制 | 首次阐明m6A通过IGF2BP2与CPSF6的交叉对话调控前体mRNA的APA加工,并鉴定PUM2为关键靶基因,其短3'UTR转录本更稳定并促进卵巢癌恶性进展 | 未提及 | 探究卵巢癌中m6A依赖的APA调控机制及其在肿瘤进展中的作用 | 卵巢癌细胞及临床样本 | 基因组学 | 卵巢癌 | RNA甲基化测序、单细胞测序、RNA pull-down、免疫沉淀、质谱、Western blot、蛋白质纯化、GST pull-down、PAS-seq、eCLIP-seq、RIP-seq、meRIP-seq、RT-qPCR、3'RACE、RNA稳定性分析、双荧光素酶报告基因 | NA | 测序数据、蛋白质互作数据、基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 973 | 2026-08-18 |
Cancer stem cells: Bridging microenvironmental interactions and clinical therapy
2025-07, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70406
PMID:40665579
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综述 | 本文综述了癌症干细胞(CSCs)的生物学特性、分子调控机制及其与肿瘤微环境的复杂相互作用,并聚焦于靶向CSCs的治疗策略和临床转化挑战 | 系统整合CSC生物学机制与临床转化研究,提出多组学引导的精准医学和微环境重塑的未来方向 | 未具体讨论临床试验中的疗效数据或挑战的量化细节 | 提供理解肿瘤生物学和开发精准治疗策略的综合框架 | 癌症干细胞及其与肿瘤微环境的相互作用 | 机器学习 | 肿瘤 | 多组学分析、谱系追踪、单细胞测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 974 | 2026-08-18 |
Itaconate suppresses neonatal intestinal inflammation via metabolic reprogramming of M1 macrophage
2025-07, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70419
PMID:40673634
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和动物模型,发现衣康酸通过代谢重编程抑制M1巨噬细胞极化,从而减轻新生儿坏死性小肠结肠炎的肠道炎症损伤 | 首次揭示衣康酸作为代谢检查点调控NEC中巨噬细胞分化,并通过4OI恢复线粒体功能和氧化磷酸化来抑制M1极化 | 摘要未提及具体局限性信息 | 探究衣康酸在新生儿坏死性小肠结肠炎中的保护作用及其通过巨噬细胞代谢重编程的机制 | 新生儿坏死性小肠结肠炎中的巨噬细胞、ACOD1基因敲除小鼠模型及临床NEC样本 | 数字病理学 | 新生儿坏死性小肠结肠炎 | 单细胞测序、液相色谱-质谱、免疫荧光染色 | NA | 图像、序列数据 | 临床NEC样本及ACOD1-/-和ACOD1fl/flLysMcre小鼠模型(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 975 | 2026-08-18 |
DDR2-mediated autophagy inhibition contributes to angiotensin II-induced adventitial remodeling
2025-06, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70361
PMID:40468620
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研究论文 | 本研究探讨DDR2介导的自噬抑制在血管紧张素II诱导的外膜重塑中的作用及其机制 | 首次揭示DDR2通过PI3K/Akt/mTOR通路抑制自噬,促进成纤维细胞向肌成纤维细胞转化,从而加剧外膜重塑 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验,临床相关性需进一步验证 | 探究DDR2是否通过mTOR信号通路抑制自噬,促进外膜成纤维细胞转化和外膜重塑 | 血管紧张素II处理的小鼠和原代外膜成纤维细胞 | 分子生物学 | 高血压 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型及细胞实验 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 976 | 2026-08-18 |
Calbindin 2 as a Novel Biomarker and Therapeutic Target for Abdominal Aortic Aneurysm: Integrative Analysis of Human Proteomes and Genetics
2025-05-06, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.124.039195
PMID:40314374
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研究论文 | 整合人类蛋白质组和遗传学证据,识别出CALB2作为腹主动脉瘤的新型生物标志物和治疗靶点,并通过实验验证其作用及潜在药物 | 首次通过蛋白质组范围的孟德尔随机化、遗传相关性和共定位分析综合识别CALB2为AAA的因果蛋白,结合多组学数据(包括批量RNA测序、单细胞/单核RNA测序和空间转录组学)和实验验证,以及药物可及性分析发现来那度胺和染料木黄酮作为治疗候选药物 | 未提及 | 识别腹主动脉瘤的潜在因果血浆蛋白质生物标志物和治疗靶点,探索其作用机制及潜在药物 | 腹主动脉瘤患者及小鼠模型(载脂蛋白E缺乏并输注血管紧张素II诱导AAA模型) | 基因组学与多组学 | 腹主动脉瘤 | 蛋白质组范围的孟德尔随机化、遗传相关性分析、共定位分析、表型组关联研究、中介分析、批量RNA测序、单细胞/单核RNA测序、空间转录组学、药物可及性分析 | NA | 遗传数据、转录组数据、蛋白质组数据、空间转录组数据 | 未明确(涉及人类蛋白质组和遗传数据,以及小鼠模型实验) | NA | RNA测序、单细胞RNA测序、单核RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 977 | 2026-08-18 |
The deubiquitinase OTUD3 plays a neuroprotective role by reducing ferroptosis induced by cerebral ischaemia reperfusion via stabilizing PLK1 via deubiquitination
2025-05, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70347
PMID:40462502
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研究论文 | 本研究揭示了去泛素化酶OTUD3通过去泛素化稳定PLK1,激活PI3K/AKT信号通路,减少脑缺血再灌注损伤中的铁死亡,从而发挥神经保护作用 | 首次阐明OTUD3通过去泛素化PLK1(靶向K48连接泛素化)调控PI3K/AKT通路并抑制铁死亡,发挥脑缺血再灌注损伤中的神经保护作用;首次证明OTUD3与PLK1的氨基酸残基35-305结合 | 未提及具体局限性 | 探究OTUD3在脑缺血再灌注损伤中通过调控PLK1和铁死亡发挥神经保护作用的机制 | 小鼠脑缺血再灌注模型中的神经元、原代皮层神经元及OTUD3相关分子机制 | 神经科学 | 缺血性脑卒中 | 单细胞测序、免疫共沉淀-质谱分析、泛素化实验 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | 小鼠脑组织及原代皮层神经元样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 978 | 2026-08-18 |
mcDETECT: Decoding 3D Spatial Synaptic Transcriptomes with Subcellular-Resolution Spatial Transcriptomics
2025-Apr-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.27.645744
PMID:40236251
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研究论文 | 提出mcDETECT框架,利用亚细胞分辨率空间转录组学数据解码三维突触空间转录组,并揭示阿尔茨海默病进展中的突触亚型失调。 | 首次将空间转录组学分析提升至亚细胞突触水平,通过三维空间中的信使RNA聚集识别单个突触并构建其空间转录组图谱。 | 摘要未提及。 | 开发能够利用空间转录组学数据解析单突触空间转录组的方法,并探究其在神经退行性疾病特别是阿尔茨海默病中的应用价值。 | 突触,特别是大脑神经回路中的单个突触及其亚型。 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学,机器学习 | NA | 空间转录组数据(包括图像和空间基因表达谱) | 未明确,涉及多个平台的iST数据。 | 10x Genomics, Vizgen, NanoString | 空间转录组学 | Xenium, MERSCOPE, CosMx | 包括Xenium、Xenium 5K、MERSCOPE和CosMx,采用靶向基因panel。 |
| 979 | 2026-08-17 |
Myeloid cells mediate interferon-driven resistance to immunotherapy in advanced renal cell carcinoma
2025-Nov-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.10.013
PMID:41175876
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据表征肾细胞癌肿瘤微环境中干扰素信号效应,并揭示髓系细胞介导的干扰素驱动的免疫治疗耐药机制 | 通过混合效应模型推断细胞类型内干扰素刺激基因的可诱导性,并发现髓系细胞而非肿瘤细胞的干扰素γ信号特征可预测免疫治疗原发耐药 | 研究主要基于公开数据集和体外实验,缺乏体内功能验证 | 探究干扰素信号在肾细胞癌肿瘤微环境中的细胞特异性效应及其对免疫检查点阻断疗效的影响 | 肾细胞癌肿瘤微环境中的免疫细胞和肿瘤细胞 | 机器学习和数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 混合效应模型 | 单细胞转录组数据 | 多个临床队列样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 980 | 2026-08-17 |
Efficient count-based models improve power and robustness for large-scale single-cell eQTL mapping
2025-Mar-05, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.01.18.25320755
PMID:40093202
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research paper | 提出了一种基于计数模型的高效sc-eQTL映射框架jaxQTL,在大型单细胞数据中显著提高了识别eQTL的统计功效和稳健性 | 利用负二项模型处理稀疏计数数据,显著提高低表达基因的eQTL检测能力,并在大规模数据中保持高效计算 | 未讨论jaxQTL在非人类数据或极端异质性样本中的表现,且未与其他近期方法进行全面比较 | 开发一种高效、稳健的sc-eQTL映射方法,以改进大规模单细胞转录组数据中遗传变异对基因调控影响的识别 | 单细胞RNA测序数据中的表达数量性状位点(eQTL) | 单细胞基因组学 | 自身免疫性疾病(如类风湿关节炎) | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 负二项模型 | 单细胞基因表达计数数据、基因型数据 | 982个样本,14种细胞类型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |