单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 10430 篇文献，本页显示第 9761 - 9780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9761 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics of X-ray irradiated Drosophila wing discs reveals heterogeneity related to cell-cycle status and cell location
2025-Feb-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.10.627868
PMID:39990483
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组技术分析X射线辐射对果蝇翅盘细胞的影响，揭示了与细胞周期状态和细胞位置相关的异质性 | 首次将用于研究市场集中度的赫芬达尔-赫希曼指数应用于基因表达异质性分析，并发现辐射诱导基因表达在区域间和区域内均存在显著异质性 | 研究仅限于果蝇翅盘这一相对简单的组织模型，结果可能不适用于更复杂的哺乳动物组织 | 探究X射线辐射对组织细胞异质性的影响机制 | 果蝇翅盘细胞 | 单细胞转录组学 | 辐射损伤 | 单细胞RNA测序 | 聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9762 | 2025-10-07 |
Molecularly-guided spatial proteomics captures single-cell identity and heterogeneity of the nervous system
2025-Feb-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.10.637505
PMID:39990460
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研究论文 | 本研究利用空间单细胞蛋白质组学技术探索神经系统细胞身份和异质性 | 首次将免疫染色引导的激光捕获显微切割与LC-MS结合，应用于异质性中枢神经系统的空间单细胞蛋白质组学研究 | 研究主要聚焦于特定脑区域和损伤模型，尚未扩展到更广泛的神经系统疾病 | 开发和应用空间单细胞蛋白质组学方法以理解神经系统生物学和神经疾病分子机制 | 大脑皮层和黑质神经元群体、刺伤损伤相关的神经免疫变化、肠肌层神经节细胞与神经束 | 空间蛋白质组学 | 神经系统疾病 | 免疫染色引导激光捕获显微切割、液相色谱-质谱联用 | NA | 蛋白质组数据 | 多个脑区域和神经组织样本 | NA | 空间单细胞蛋白质组学、激光捕获显微切割 | LCM、LC-MS | 免疫染色引导激光捕获显微切割与液相色谱-质谱联用技术 |
| 9763 | 2025-10-07 |
A Benchmarking Study of Random Projections and Principal Components for Dimensionality Reduction Strategies in Single Cell Analysis
2025-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.04.636499
PMID:39974925
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研究论文 | 系统评估主成分分析和随机投影在单细胞RNA测序数据降维中的性能比较 | 首次对PCA和RP方法在单细胞分析中进行全面基准测试，包括计算效率和下游分析效果的多维度评估 | 仅评估了线性降维方法，未包含非线性降维技术的比较 | 比较不同降维策略在单细胞数据分析中的性能 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | PCA, SVD, 随机SVD, 稀疏随机投影, 高斯随机投影 | 基因表达数据 | 多个公开可用的标记和未标记单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9764 | 2025-10-07 |
Seq-Scope-eXpanded: Spatial Omics Beyond Optical Resolution
2025-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.04.636355
PMID:39975076
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研究论文 | 提出Seq-Scope-X技术，通过组织膨胀实现亚微米级空间转录组和蛋白质组分析 | 结合组织膨胀技术与Seq-Scope方法，突破光学分辨率限制，实现亚微米级空间多组学分析 | NA | 开发超高分辨率空间多组学分析技术 | 肝脏组织、脑组织、结肠组织、小鼠脾脏、人类扁桃体 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学、组织膨胀技术 | NA | 空间转录组数据、空间蛋白质组数据 | NA | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学 | Seq-Scope-X | 结合组织膨胀的Seq-Scope改进技术，支持亚微米级分辨率的转录组和蛋白质组分析 |
| 9765 | 2025-10-07 |
The profiles of immunosuppressive microenvironment in the Lauren intestinal-type gastric adenocarcinoma
2025-Feb-01, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03938-5
PMID:39891785
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术揭示了Lauren肠型胃腺癌免疫抑制微环境的细胞组成和相互作用机制 | 首次系统鉴定IGAC中HAVCR2+VCAM1+耗竭T细胞和LAYN+TNFRSF4+调节性T细胞等关键免疫抑制细胞亚群，并证实其与疾病进展的相关性 | 样本量相对有限（15例患者），且仅针对中国人群进行研究 | 探究Lauren肠型胃腺癌免疫抑制机制，为改善免疫治疗效果寻找潜在靶点 | 15例中国Lauren肠型胃腺癌患者的肿瘤组织和癌旁正常黏膜 | 数字病理 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫荧光, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据, 流式数据 | 15例IGAC患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 9766 | 2025-10-07 |
CFTR High Expresser BEST4+ cells are pH-sensing neuropod cells: new implications for intestinal physiology and Cystic Fibrosis disease
2025-Jan-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.24.634747
PMID:39974899
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现肠道BEST4+细胞是pH感应神经足细胞，并揭示了其在囊性纤维化疾病中的新作用机制 | 首次将BEST4+细胞鉴定为CFTR高表达细胞，发现其具有pH感应功能并参与囊性纤维化疾病发病机制 | 研究主要基于大鼠模型，人类样本验证尚不充分 | 探究肠道BEST4+细胞的分子特征及其在囊性纤维化疾病中的作用 | 人类和大鼠肠道上皮细胞，特别是BEST4+细胞亚群 | 单细胞生物学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序，免疫定位 | NA | 单细胞转录组数据，蛋白质表达数据 | 野生型和ΔF508囊性纤维化大鼠空肠组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9767 | 2025-10-07 |
Single circulating tumor cell sequencing based on improved high-porosity membranes and nanoporous microchambers
2025-May-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.117263
PMID:39978235
|
研究论文 | 本研究开发了基于高孔隙率超薄滤膜和纳米孔微腔的新型纳米器件，用于分离单个循环肿瘤细胞并建立自动化单细胞测序工作流程 | 开发了高孔隙率超薄滤膜和纳米孔微腔芯片两种新型纳米器件，建立了基于滤膜系统的自动化单CTC测序工作流程 | NA | 开发高效的循环肿瘤细胞单细胞测序方法，探索肿瘤异质性和进展机制 | 循环肿瘤细胞(CTCs) | 单细胞测序技术 | 肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因组测序数据 | NCI-H358细胞系和患者来源的CTCs | NA | 单细胞测序 | NA | 基于滤膜系统的单细胞测序工作流程 |
| 9768 | 2025-10-07 |
Identification and validation of immune-related biomarkers and polarization types of macrophages in keloid based on bulk RNA-seq and single-cell RNA-seq analysis
2025-Apr, Burns : journal of the International Society for Burn Injuries
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.burns.2025.107413
PMID:39923303
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研究论文 | 基于bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq分析鉴定瘢痕疙瘩中免疫相关生物标志物和巨噬细胞极化类型 | 首次结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据，通过多种机器学习方法鉴定瘢痕疙瘩的免疫相关生物标志物，并揭示巨噬细胞极化状态异常 | 研究依赖于公共数据库的回顾性数据，样本量有限，需要进一步实验验证 | 鉴定瘢痕疙瘩的免疫相关生物标志物和巨噬细胞极化类型，为治疗提供新靶点 | 瘢痕疙瘩组织和正常皮肤组织 | 生物信息学 | 瘢痕疙瘩 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 蛋白质印迹, 免疫荧光 | LASSO, SVM-RFE, 随机森林 | 基因表达数据, 单细胞数据 | 四个GEO数据集(GSE83286, GSE212954, GSE92566, GSE90051) | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9769 | 2025-10-07 |
Upregulation of LSP1 in AML cells enhances AML resistance to sorafenib and promotes apoptosis in CD8+ T cells
2025-Mar-26, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114255
PMID:39952006
|
研究论文 | 本研究通过RNA-seq和单细胞RNA-seq分析发现LSP1是AML的重要免疫相关标志物，影响索拉非尼耐药性和CD8+T细胞功能 | 首次揭示LSP1在AML免疫抑制微环境中的关键作用，及其对索拉非尼耐药性和CD8+T细胞凋亡的影响 | 未明确说明样本数量和研究人群的具体特征 | 探索AML免疫抑制肿瘤微环境的机制并寻找免疫治疗新靶点 | 急性髓系白血病(AML)细胞和CD8+T细胞 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | RNA-seq, scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 9770 | 2025-10-07 |
Applications of Single-Cell Omics Technologies for Induced Pluripotent Stem Cell-Based Cardiovascular Research
2025-Feb-28, International journal of stem cells
IF:2.5Q3
DOI:10.15283/ijsc23183
PMID:39129179
|
综述 | 探讨单细胞组学技术与诱导多能干细胞在心血管研究中的整合应用 | 整合单细胞组学与iPSC技术，探索空间组学等新兴范式在揭示心脏组织空间结构方面的潜力 | NA | 阐明心脏健康与疾病的分子复杂性，推动心血管研究发展 | 心脏细胞、诱导多能干细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间组学 | NA | 基因组, 转录组, 蛋白质组 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 9771 | 2025-10-07 |
A novel telomere-associated genes signature for the prediction of prognosis and treatment responsiveness of hepatocellular carcinoma
2025-Feb-27, Biological procedures online
IF:3.7Q1
DOI:10.1186/s12575-025-00271-8
PMID:40016654
|
研究论文 | 本研究开发了一个包含18个端粒相关基因的肝细胞癌预后预测模型 | 首次建立了基于端粒相关基因的肝细胞癌预后模型，并通过孟德尔随机化分析确认了ASF1A基因与酒精性肝细胞癌的因果关系 | 研究主要基于TCGA数据库，需要更多独立队列验证模型的普适性 | 开发肝细胞癌预后预测模型并探索端粒相关基因在肝细胞癌中的作用 | 肝细胞癌患者组织和细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序,空间转录组测序,Western blotting,Transwell迁移实验,伤口愈合实验,集落形成实验 | Cox回归模型,LASSO回归模型 | 基因表达数据,临床数据 | 374例肝细胞癌样本和50例正常肝组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 9772 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Extensive Heterogeneity and Unique Gene Trajectories in Non-Transformed and Transformed Human Lung Epithelial Cells: Insights into the Role of LncRNAs in Tumor Heterogeneity
2025-Feb-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26041690
PMID:40004153
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示人肺上皮细胞在非转化和转化状态下的转录组异质性及lncRNA在肿瘤异质性中的作用 | 首次在单细胞水平系统比较非转化与转化肺上皮细胞的lncRNA表达轨迹，揭示lncRNA亚型对细胞异质性的贡献机制 | 研究仅使用两种细胞系（BEAS2B和H460），未涉及原代肿瘤样本或体内模型验证 | 探究肺上皮细胞在癌变过程中的转录组异质性特征及lncRNA的作用机制 | 永生化非转化肺上皮细胞系BEAS2B和转化肺上皮细胞系H460 | 单细胞转录组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 两种肺上皮细胞系（BEAS2B和H460） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9773 | 2025-10-07 |
Revealing the core suppression effects of various Di (2-ethylhexyl) phthalate exposure on early meiosis progression in postnatal male mice via single-cell RNA sequencing
2025-Feb, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.117866
PMID:39923572
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示DEHP暴露对雄性小鼠早期减数分裂进程的核心抑制作用 | 首次通过单细胞RNA测序全面证明DEHP通过Trp53介导的p38-MAPK通路抑制雄性生殖细胞早期减数分裂进程 | 研究仅限于啮齿类动物模型，未涉及人类样本验证 | 探究DEHP暴露对雄性生殖系统早期减数分裂影响的分子机制 | 出生后雄性小鼠睾丸细胞 | 单细胞转录组学 | 男性生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 42,000个细胞，3,172,754,990条reads | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 9774 | 2025-10-07 |
Analysis of toxicity and mechanisms of busulfan in non-obstructive azoospermia: A genomic and toxicological approach integrating molecular docking, single-cell sequencing, and experimentation in vivo
2025-Feb, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.117878
PMID:39933234
|
研究论文 | 本研究通过整合分子对接、单细胞测序和体内实验，揭示了白消安导致非梗阻性无精子症的关键分子机制 | 首次发现POLE和LRAT蛋白是白消安诱导睾丸毒性的关键靶点，并揭示了免疫细胞浸润在疾病进程中的作用 | 研究主要聚焦于白消安的毒性机制，对其他化疗药物的适用性需要进一步验证 | 阐明白消安导致非梗阻性无精子症的分子机制和关键信号通路 | 白消安处理的睾丸组织及精原干细胞 | 生殖医学 | 男性不育症 | 分子对接, 单细胞RNA测序, 体内实验 | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据, 实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9775 | 2025-10-07 |
Atlas of expression of acyl CoA binding protein/diazepam binding inhibitor (ACBP/DBI) in human and mouse
2025-Feb-26, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07447-w
PMID:40011442
|
研究论文 | 本研究绘制了酰基辅酶A结合蛋白/地西泮结合抑制剂(ACBP/DBI)在人类和小鼠组织中的表达图谱 | 首次系统揭示ACBP/DBI在哺乳动物特定细胞类型中的保守表达机制及其共调控网络 | 研究主要基于数据库挖掘，缺乏实验验证 | 探究ACBP/DBI在人类和小鼠不同器官中的表达模式及调控机制 | 人类和小鼠的正常组织、恶性肿瘤组织 | 生物信息学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序,转录组学,蛋白质组学,系统数据挖掘 | NA | 转录组数据,蛋白质组数据,单细胞RNA测序数据 | 人类和小鼠多种组织器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9776 | 2025-10-07 |
KRT7 promotes pancreatic cancer metastasis by remodeling the extracellular matrix niche through FGF2-fibroblast crosstalk
2025-Feb-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-84129-1
PMID:40011455
|
研究论文 | 本研究揭示了KRT7通过FGF2-成纤维细胞相互作用重塑细胞外基质微环境促进胰腺癌肝转移的机制 | 首次发现KRT7通过调控FGF2分泌影响癌症相关成纤维细胞功能，重塑转移前微环境 | 样本量有限，机制研究主要基于动物模型 | 探究KRT7在胰腺癌转移中的作用机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者样本和肿瘤细胞 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | RNA测序,蛋白质组学,单细胞RNA测序 | 原位肿瘤模型小鼠 | 基因表达数据,蛋白质数据 | 24个PDAC样本的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9777 | 2025-10-07 |
Immunological profile of lactate metabolism-related genes in Psoriasis a comprehensive analysis based on bulk and single-cell RNA sequencing data
2025-Feb-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-91237-z
PMID:40011693
|
研究论文 | 通过整合分析批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，研究银屑病中乳酸代谢相关基因的免疫学特征 | 首次结合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据系统分析银屑病中乳酸代谢相关基因的免疫学作用 | 研究基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 阐明乳酸代谢在银屑病发病机制中的作用 | 银屑病患者皮肤组织 | 生物信息学 | 银屑病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个数据集(GSE13355, GSE109248)的合并样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 9778 | 2025-10-07 |
Immune dysregulation in COVID-19 induced ARDS in kidney transplant recipients revealed by single-cell RNA sequencing
2025-Feb-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-91439-5
PMID:40011702
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示肾移植受者与非移植受者在COVID-19诱发ARDS中的免疫失调差异 | 首次构建肾移植受者COVID-19相关ARDS的单细胞图谱，发现S100A9+巨核细胞亚群和XAF1+效应T细胞亚群的特异性变化 | 样本来源仅限于外周血，未涉及肺部局部免疫反应；样本量相对有限 | 探索肾移植受者与非移植受者在COVID-19诱发ARDS中的免疫应答差异，寻找潜在治疗靶点 | 肾移植受者、非移植受者的COVID-19相关ARDS患者及健康对照 | 单细胞组学 | COVID-19相关急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序 | 细胞聚类分析、富集分析 | 单细胞转录组数据 | 108,320个外周血细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9779 | 2025-10-07 |
Combining single-cell ATAC and RNA sequencing for supervised cell annotation
2025-Feb-26, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06084-6
PMID:40011801
|
研究论文 | 本研究探索了结合单细胞ATAC和RNA测序数据在监督式细胞注释中的效果 | 首次系统评估了结合单细胞ATAC和RNA测序数据在监督式细胞注释中的性能提升，而非仅关注无监督方法 | 在神经元细胞注释中未观察到性能提升，结果可能受细胞类型和数据集特性影响 | 评估多组学数据整合对监督式细胞类型注释性能的改善 | 人类外周血单个核细胞(PBMC)和阿尔茨海默病神经元细胞 | 单细胞多组学分析 | 阿尔茨海默病 | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | 随机森林, 支持向量机, 逻辑回归, scVI | 单细胞多组学数据 | 两个独立数据集：PBMC和神经元细胞 | 10x Genomics | 单细胞多组学 | 10x Chromium | 10x Genomics多组学平台 |
| 9780 | 2025-10-07 |
Pathological and molecular insights into intravenous leiomyomatosis: an integrative multi-omics study
2025-Feb-26, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05919-9
PMID:40011937
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研究论文 | 通过整合多组学方法研究静脉内平滑肌瘤病的病理和分子特征 | 首次对静脉内平滑肌瘤病进行综合多组学分析，揭示了染色体10q缺失与血管形态作为预测侵袭性行为的重要标志物 | 样本量有限，疾病罕见性限制了研究的规模 | 探索静脉内平滑肌瘤病的发生发展机制，为诊断和治疗提供新见解 | 静脉内平滑肌瘤组织、子宫肌瘤组织和正常子宫肌层组织 | 数字病理学 | 平滑肌瘤病 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学分析, H&E染色 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据, 病理图像 | 8对配对的IVL和正常子宫肌层新鲜冷冻组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |