单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202501-202512] [清除筛选条件]
当前共找到 10619 篇文献,本页显示第 9761 - 9780 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
9761 2025-10-07
Role of cancer stem cell heterogeneity in intrahepatic cholangiocarcinoma
2025-Feb-28, Translational cancer research IF:1.5Q4
研究论文 通过单细胞RNA测序分析肝内胆管癌中癌症干细胞异质性及其对预后的影响 首次在单细胞水平系统揭示肝内胆管癌中不同癌症干细胞亚群的异质性特征及其与预后的关联 样本量有限,主要依赖公共数据库数据,需要更大规模临床验证 研究癌症干细胞异质性对肝内胆管癌预后的影响 肝内胆管癌患者样本和公共数据库中的单细胞RNA测序数据 单细胞组学 肝内胆管癌 单细胞RNA测序,免疫组织化学,生物信息学分析 AUCell, CellChat, SCENIC, CIBERSORT 单细胞RNA测序数据,批量RNA测序数据,临床数据 GSE142784数据集和TCGA数据库中的肝内胆管癌样本 NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
9762 2025-10-07
Fast, flexible analysis of differences in cellular composition with crumblr
2025-Feb-27, Research square
研究论文 开发了一种名为crumblr的可扩展统计方法,用于分析单细胞技术产生的细胞组成差异数据 采用精度加权线性混合模型处理计数比率数据,并能在细胞谱系层次结构的多个水平上进行统计检验,通过多元方法提高检测效力 NA 开发统计分析方法以识别细胞类型频率的变化 单细胞RNA测序数据集(涉及衰老、结核感染T细胞、前列腺癌骨转移和SARS-CoV-2感染) 生物信息学 前列腺癌, 结核病, COVID-19 单细胞RNA测序 线性混合模型 单细胞计数数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
9763 2025-10-07
Cluster replicability in single-cell and single-nucleus atlases of the mouse brain
2025-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 评估小鼠大脑单细胞和单核RNA测序图谱中细胞簇的可重复性 使用全转录组邻域投票方法识别了2009对相互匹配的细胞簇对,并发现这些簇在多个物种数据集中具有一致的空间定位和协调的基因表达 下丘脑的高度异质性限制了细胞簇的可重复性,区分相近细胞簇比区分大多数其他簇更具挑战性 评估单细胞和单核RNA测序研究中细胞簇的生物学稳健性和可重复性 小鼠大脑细胞 单细胞基因组学 NA 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 邻域投票算法 基因表达数据 超过400万个细胞 NA 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 NA NA
9764 2025-10-07
Cell Type-Agnostic Transcriptomic Signatures Enable Uniform Comparisons of Neurodevelopment
2025-Feb-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过单细胞转录组元分析开发细胞类型无关的转录组特征,实现神经发育的跨数据集统一比较 开发了细胞类型无关的发育年龄预测模型,在人类和小鼠大脑中均表现出良好泛化能力 NA 建立统一的神经发育比较框架,预测细胞发育状态 人类和小鼠大脑发育细胞、人类神经类器官 生物信息学 神经发育疾病 单细胞转录组测序 正则化回归模型 单细胞转录组数据 超过280万个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
9765 2025-10-07
Integrative analysis of semaphorins family genes in colorectal cancer: implications for prognosis and immunotherapy
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过整合多组学分析和机器学习方法,构建了结直肠癌中信号素家族基因相关的预后评分系统 开发了包含10种机器学习算法及其101种组合的新型计算框架来构建SRS评分,并首次在结直肠癌中系统评估信号素家族基因的预后价值 研究样本量未明确说明,需要进一步验证SRS评分在独立队列中的临床应用价值 评估信号素家族基因在结直肠癌中的预后价值和免疫治疗意义 结直肠癌患者和癌细胞系 机器学习 结直肠癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 细胞实验 10种机器学习算法组合 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
9766 2025-10-07
Single-cell RNA sequencing of shoot apex reveals the mechanism of cyclin regulating cell division via auxin signaling pathway in Populus alba
2025, Frontiers in plant science IF:4.1Q1
研究论文 通过白杨茎尖单细胞RNA测序揭示了细胞周期蛋白通过生长素信号通路调控细胞分裂的机制 首次在单细胞水平解析白杨茎尖发育过程中细胞周期蛋白和生长素信号通路的协同调控网络 研究仅基于两个生物学重复,样本量相对有限 探究细胞周期蛋白通过生长素信号通路调控白杨叶片发育的分子机制 白杨(Populus alba)茎尖组织 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序, 扫描电子显微镜 NA 单细胞转录组数据, 图像数据 29,011个细胞(来自两个生物学重复) NA 单细胞RNA-seq NA NA
9767 2025-10-07
Multi-omics approach reveals the impact of prognosis model-related genes on the tumor microenvironment in medulloblastoma
2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过多组学方法开发了髓母细胞瘤肿瘤微环境风险评分模型,用于预测患者预后并阐明生物学机制 首次构建了基于8个关键基因的TMErisk评分模型,并通过单细胞多组学和空间转录组学验证了模型基因在肿瘤微环境中的表达动态和空间分布 研究样本量有限,需要更多独立队列验证模型的普适性 开发髓母细胞瘤肿瘤微环境相关风险评分模型并探索其生物学机制 髓母细胞瘤患者样本 生物信息学 髓母细胞瘤 RNA测序,单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序,空间转录组分析 WGCNA,LASSO-COX,COX回归模型 基因表达数据,表观遗传数据,空间分布数据 322例天坛医院样本和763例GSE85217数据集样本 NA 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序,空间转录组学,bulk RNA测序 NA NA
9768 2025-03-20
Targeting the histone reader ZMYND8 inhibits antiandrogen-induced neuroendocrine tumor transdifferentiation of prostate cancer
2025-Mar-18, Nature cancer IF:23.5Q1
研究论文 本文通过CRISPR‒Cas9筛选与单细胞RNA测序追踪肿瘤转变,揭示了抗雄激素治疗诱导的ZMYND8依赖的表观遗传编程在前列腺癌神经内分泌肿瘤转分化中的关键作用 揭示了ZMYND8依赖的表观遗传编程在前列腺癌神经内分泌肿瘤转分化中的关键作用,并开发了iZMYND8-34小分子抑制剂以阻断这一过程 NA 研究抗雄激素治疗诱导的前列腺癌神经内分泌肿瘤转分化的分子机制 前列腺癌神经内分泌肿瘤 表观遗传学 前列腺癌 CRISPR‒Cas9筛选, 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA NA NA NA
9769 2025-10-07
Insight into perfluorooctanoic acid-induced impairment of mouse embryo implantation via single-cell RNA-seq
2025-May-05, Journal of hazardous materials IF:12.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了全氟辛酸对小鼠胚胎着床能力的影响机制 首次利用单细胞RNA测序技术在全氟辛酸暴露模型中系统分析子宫内膜容受性受损的分子机制,并发现ANGPTL信号通路异常的关键作用 研究仅使用小鼠模型,结果向人类外推需谨慎;仅关注低剂量暴露效应 探究全氟辛酸对子宫内膜容受性和胚胎着床的影响及其分子机制 小鼠子宫内膜组织 单细胞组学 生殖系统疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
9770 2025-10-07
SPP1 + macrophages in colorectal cancer: Markers of malignancy and promising therapeutic targets
2025-May, Genes & diseases IF:6.9Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞和空间转录组学分析,揭示了SPP1+巨噬细胞在结直肠癌中的关键作用及其作为治疗靶点的潜力 首次系统性地阐明了SPP1+巨噬细胞在结直肠癌中的功能机制,并提出了SPP1+巨噬细胞模型 NA 探究SPP1+巨噬细胞在结直肠癌肿瘤微环境中的角色和作用机制 结直肠癌肿瘤微环境中的巨噬细胞 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量测序 NA 转录组数据,空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 NA NA
9771 2025-10-07
Comprehensive analysis of immune subtype characterization on identification of potential cells and drugs to predict response to immune checkpoint inhibitors for hepatocellular carcinoma
2025-May, Genes & diseases IF:6.9Q1
研究论文 通过免疫亚型分析预测肝细胞癌患者对免疫检查点抑制剂的治疗反应 整合细胞异质性和免疫分型来预测肝细胞癌对免疫检查点抑制剂的反应 NA 预测肝细胞癌患者对免疫检查点抑制剂的治疗反应 肝细胞癌患者 生物信息学 肝细胞癌 单细胞测序技术 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
9772 2025-10-07
The scRNA-sequencing landscape of pancreatic ductal adenocarcinoma revealed distinct cell populations associated with tumor initiation and progression
2025-May, Genes & diseases IF:6.9Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示胰腺导管腺癌中与肿瘤起始和淋巴结转移相关的独特细胞群体 首次在PDAC中鉴定出维持导管身份的关键基因和促进淋巴结转移的肿瘤亚群 样本量较小(仅8例患者),胰腺样本解离困难可能影响单细胞测序质量 解析胰腺导管腺癌的转录组景观并探索治疗靶点 胰腺导管腺癌患者组织样本和胰腺癌细胞系 单细胞组学 胰腺癌 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 NA 单细胞转录组数据, bulk RNA测序数据 8例不同淋巴结转移状态的PDAC患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
9773 2025-10-07
Radiation from frequent whole-body CT scans induces systemic immunosuppression and immune activation of tumor tissue
2025-Apr, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 本研究探讨重复全身CT扫描对系统性免疫和肿瘤免疫微环境的影响 首次揭示重复CT扫描辐射同时引起系统性免疫抑制和肿瘤组织免疫激活的双向效应 研究基于小鼠Lewis肺癌模型,结果需在人类临床研究中进一步验证 阐明重复全身CT扫描对系统性免疫、肿瘤免疫微环境和肿瘤控制的影响 Lewis肺癌小鼠模型 肿瘤免疫学 肺癌 ELISA, 流式细胞术, 免疫组织化学, RNA测序, 单细胞测序 NA 生物分子数据, 细胞计数数据, 基因表达数据 两组Lewis肺癌小鼠模型(对照组和多次CT扫描辐射组) NA 单细胞测序, RNA测序 NA NA
9774 2025-10-07
IQGAP2 regulates blood-brain barrier immune dynamics
2025-Mar-21, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究揭示了IQGAP2蛋白在调控血脑屏障免疫特权和免疫细胞进入中枢神经系统中的关键作用 首次发现IQGAP2作为支架蛋白在维持血脑屏障免疫稳态中的核心调控功能,并证实其在阿尔茨海默病患者海马体中表达降低 研究主要基于动物模型,人类组织分析样本量有限,具体分子机制仍需进一步阐明 探究IQGAP2如何调控免疫细胞跨越血脑屏障的浸润过程 小鼠、斑马鱼模型以及人类脑组织 神经科学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序,免疫组织化学 NA 基因表达数据,组织图像数据 多种动物模型和人类组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
9775 2025-03-19
A graph neural network that combines scRNA-seq and protein-protein interaction data
2025-Mar-18, Nature methods IF:36.1Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
9776 2025-10-07
Pan-cancer analysis and experimental verification of cytochrome B561 as a prognostic and therapeutic biomarker in breast cancer
2025-Mar-17, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 通过泛癌分析和实验验证研究细胞色素B561在乳腺癌中的预后和治疗生物标志物作用 首次系统分析CYB561在泛癌中的表达模式及其与免疫浸润的关系,并通过实验验证其在乳腺癌中的功能作用 研究主要基于TCGA数据库,需要更多独立队列验证;实验验证仅限于细胞水平 探讨CYB561在泛癌中的表达特征及其在乳腺癌中的预后和治疗价值 癌症患者组织样本和乳腺癌细胞系 生物信息学 乳腺癌 单细胞RNA测序,基因敲除,生物信息学分析 逻辑回归,Cox回归,Kaplan-Meier,Nomogram 基因表达数据,临床病理数据 TCGA数据库中的泛癌样本和乳腺癌患者样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
9777 2025-10-07
A Gremlin 1-expressing splenic niche cell population restrains chronic myeloid leukemia by antagonizing the BMP pathway
2025-Mar-17, Nature cancer IF:23.5Q1
研究论文 本研究揭示脾脏中表达Gremlin 1的基质细胞群通过拮抗BMP通路抑制慢性髓系白血病进展的新机制 首次发现脾脏中特定Gremlin 1+基质细胞群构成防御性微环境,通过拮抗BMP通路诱导白血病干细胞凋亡 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证仍需进一步深入 探究脾脏微环境在慢性髓系白血病进展中的调控机制 小鼠慢性髓系白血病模型及人类脾脏样本 单细胞生物学 慢性髓系白血病 单细胞RNA测序,基因敲除,酪氨酸激酶抑制剂治疗 小鼠疾病模型 单细胞转录组数据,实验验证数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
9778 2025-10-07
Single-cell RNA sequencing revealed cell landscape of tongue dorsal mucosa in rats with gastric intestinal metaplasia
2025-Mar-16, Cell death discovery IF:6.1Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示胃肠化生大鼠舌背黏膜的细胞景观变化 首次在胃肠化生大鼠模型中应用单细胞RNA测序技术系统分析舌背黏膜的细胞组成和基因表达变化 研究仅使用大鼠模型,未在人类样本中验证;样本量未明确说明 探究胃肠化生与舌背黏膜细胞景观变化的关系 胃肠化生大鼠模型的舌背黏膜细胞 单细胞测序 胃肠化生 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
9779 2025-10-07
Genetic insights into idiopathic pulmonary fibrosis: a multi-omics approach to identify potential therapeutic targets
2025-Mar-16, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 通过多组学方法识别特发性肺纤维化的潜在治疗靶点 整合基因组和转录组数据,结合TWAS、孟德尔随机化和分子对接等多种分析方法 未明确说明样本量的具体数值和研究人群的详细特征 识别特发性肺纤维化的潜在治疗靶点并评估其安全性 特发性肺纤维化相关基因和药物靶点 生物信息学 特发性肺纤维化 转录组范围关联研究(TWAS), 孟德尔随机化(MR), RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 分子对接 OTTERS框架, 基于汇总数据的MR(SMR) 基因组数据, 转录组数据, GWAS汇总统计数据 使用Global Biobank和Finngen数据库的GWAS数据,UK Biobank中679种疾病的GWAS数据 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
9780 2025-10-07
Single-cell transcriptomic analysis reveals dynamic changes in the liver microenvironment during colorectal cancer metastatic progression
2025-Mar-16, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 通过单细胞转录组分析揭示结直肠癌肝转移过程中肝脏微环境的动态变化 首次在转移前和转移期肝脏中鉴定出高表达Prok2的中性粒细胞亚群,并揭示其通过抑制巨噬细胞吞噬和促进T细胞耗竭驱动免疫抑制的新机制 研究基于小鼠原位模型,需要在人类样本中进一步验证 探究结直肠癌肝转移过程中肝脏微环境的动态变化 小鼠原位结直肠癌模型的转移前和转移期肝脏组织 数字病理学 结直肠癌 单细胞测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠原位模型肝脏组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
回到顶部