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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9741 | 2025-10-07 |
Downregulated STAT3 and STAT5B are prognostic biomarkers for colorectal cancer and are associated with immune infiltration
2025-Mar-18, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02085-2
PMID:40100436
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析发现STAT3和STAT5B在结直肠癌中表达下调,并验证其作为预后生物标志物和免疫治疗靶点的潜力 | 首次系统评估STAT家族在结直肠癌中的表达、预后价值及免疫功能,并利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术深入分析 | 样本量有限,临床样本仅30例,且主要依赖公共数据库数据 | 探究STAT家族在结直肠癌中的表达特征、预后价值及与免疫浸润的关系 | 结直肠癌患者样本(包括TCGA数据库644例、GTEx数据库308例和临床样本30例) | 生物信息学 | 结直肠癌 | 多组学分析,单细胞RNA测序,空间转录组学,DNA甲基化分析 | 列线图预测模型 | 基因表达数据,临床数据,单细胞测序数据,空间转录组数据 | 总计982个样本(TCGA 644例,GTEx 308例,临床样本30例) | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 9742 | 2025-10-07 |
[Nafamostat Mesylate Alleviates Renal Ischemia-Reperfusion Injury in a Rat Model Through HMGB1 Modulation: An Omics Analysis -Based Study of the Protective Effect and the Mechanisms Involved]
2025-Jan-20, Sichuan da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Sichuan University. Medical science edition
DOI:10.12182/20250160506
PMID:40109453
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研究论文 | 本研究通过组学分析探讨甲磺酸萘莫司他在大鼠肾脏缺血再灌注损伤模型中的保护作用及其机制 | 首次结合单细胞RNA测序和HMGB1调控机制研究甲磺酸萘莫司他对肾脏缺血再灌注损伤的保护作用 | 样本量较小(每组7只大鼠),仅观察24小时时间点,机制研究仍需进一步验证 | 研究甲磺酸萘莫司他对肾脏缺血再灌注损伤的保护作用及分子机制 | 健康雄性Sprague-Dawley大鼠 | NA | 肾脏缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, Western blotting, HE染色, TUNEL染色 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据, 组织病理学图像 | 21只SD大鼠(每组7只) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单核RNA测序 |
| 9743 | 2025-10-07 |
Identification of a Subpopulation of Astrocyte Progenitor Cells in the Neonatal Subventricular Zone: Evidence that Migration is Regulated by Glutamate Signaling
2025-Jan-09, Neurochemical research
IF:3.7Q2
DOI:10.1007/s11064-024-04326-2
PMID:39789409
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研究论文 | 本研究通过荧光标记技术识别了新生小鼠脑室下区的星形胶质细胞前体细胞亚群,并证明谷氨酸信号调控其迁移过程 | 首次发现tdTomato标记的胶质前体细胞亚群,并证明谷氨酸信号通过离子型谷氨酸受体和谷氨酸转运体调控其向皮层的迁移 | 研究主要基于转基因小鼠模型,人类相关性需进一步验证;体外器官型切片培养可能无法完全模拟体内环境 | 探究星形胶质细胞前体细胞的发育起源和迁移调控机制 | 新生小鼠脑室下区的胶质前体细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序,免疫荧光,器官型切片培养 | NA | 基因表达数据,图像数据 | 新生小鼠(PND1-PND7)脑组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9744 | 2025-10-07 |
LKB1 inactivation promotes epigenetic remodeling-induced lineage plasticity and antiandrogen resistance in prostate cancer
2025-Jan, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-024-01025-z
PMID:39743630
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了LKB1失活在前列腺癌中促进表观遗传重塑诱导的谱系可塑性和抗雄激素耐药性的机制 | 首次发现LKB1失活通过引起全基因组DNA低甲基化驱动AR非依赖性谱系可塑性,并提出靶向DNA低甲基化的治疗策略 | 研究主要基于基因工程小鼠模型,在人类患者中的临床验证仍需进一步研究 | 探索雄激素受体非依赖性谱系可塑性的分子机制并开发潜在治疗策略 | 人类和小鼠前列腺癌样本 | 癌症生物学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,全基因组亚硫酸氢盐测序 | 基因工程小鼠模型 | 转录组数据,表观遗传数据 | 未明确指定具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序,全基因组测序 | NA | NA |
| 9745 | 2025-10-07 |
Identification and Evaluation of Lipocalin-2 in Sepsis-Associated Encephalopathy via Machine Learning Approaches
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S504390
PMID:40109658
|
研究论文 | 通过机器学习方法识别和评估脂质运载蛋白-2在脓毒症相关脑病中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序和多种机器学习算法系统性地识别LCN2作为中性粒细胞诱导SAE的关键基因 | 研究主要基于动物模型,需要在人类患者中进行进一步验证 | 识别脓毒症相关脑病的关键基因并探索潜在靶向治疗 | 脓毒症患者和脓毒症小鼠模型 | 机器学习 | 脓毒症相关脑病 | 单细胞RNA测序, Western blotting, 行为测试 | 四种二分类机器学习算法, AddModuleScore算法, CellCall算法 | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质印迹数据, 行为学数据 | 脓毒症患者和脓毒症小鼠模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9746 | 2025-10-07 |
Integrated single-cell analysis reveals the regulatory network of disulfidptosis-related lncRNAs in bladder cancer: constructing a prognostic model and predicting treatment response
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1527036
PMID:40110199
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞分析构建了膀胱癌中双硫死亡相关lncRNAs的调控网络和预后模型 | 首次将双硫死亡与lncRNAs结合构建膀胱癌预后模型,并揭示其与免疫状态和治疗反应的关系 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证模型的临床适用性 | 探索双硫死亡相关lncRNAs作为膀胱癌预后生物标志物的潜力 | 膀胱癌患者 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞测序, RNA测序, RT-qPCR, LASSO回归, Cox回归 | 预后模型, nomogram | 单细胞测序数据, RNA测序数据, 临床信息 | 来自GEO和TCGA数据库的膀胱癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 9747 | 2025-10-07 |
Aspartate beta-hydroxylase is a prognostic factor in gallbladder cancer with the function of promoting tumorigenesis and chemoresistance
2025, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2025.1452345
PMID:40110547
|
研究论文 | 本研究探讨天冬氨酸β-羟化酶(ASPH)在胆囊癌中的促癌作用及化疗耐药机制 | 首次通过孟德尔随机化方法确认ASPH是胆囊癌的致病基因,并发现其通过调控免疫检查点和上皮间质转化促进肿瘤进展 | 研究样本量有限(215例),且主要基于回顾性分析 | 探索胆囊癌的新型生物标志物及其在肿瘤发生和化疗耐药中的作用机制 | 胆囊癌患者组织样本和单细胞测序数据 | 癌症生物学 | 胆囊癌 | RNA测序, 单细胞测序, 免疫组织化学, 孟德尔随机化, 网络药理学, 分子对接 | NA | 基因表达数据, 临床病理数据, 单细胞测序数据 | 215例胆囊癌患者 | NA | 单细胞测序, RNA测序 | NA | NA |
| 9748 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing-guided engineering of mitochondrial therapies for intervertebral disc degeneration by regulating mtDNA/SPARC-STING signaling
2025-Jun, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.02.036
PMID:40104024
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序指导工程化线粒体疗法治疗椎间盘退变 | 首次利用单细胞RNA测序指导开发针对椎间盘退变的线粒体移植疗法,并工程化具有抗氧化和抗炎活性的多生物活性生物疗法 | 研究主要基于动物模型验证,尚未进行人体临床试验 | 开发针对椎间盘退变的新型线粒体疗法 | 人类髓核组织、髓核细胞和大鼠椎间盘退变模型 | 单细胞测序 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序 | 动物模型 | 单细胞RNA测序数据 | 人类髓核组织和大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9749 | 2025-10-07 |
SPRY1 regulates macrophage M1 polarization in skin aging and melanoma prognosis
2025-Apr, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102331
PMID:40023001
|
研究论文 | 本研究探讨SPRY1在皮肤衰老中的作用,特别是其对巨噬细胞M1极化的调控及其在黑色素瘤预后中的潜在价值 | 首次揭示SPRY1通过调控巨噬细胞M1极化促进皮肤衰老的机制,并发现其在黑色素瘤预后中的临床意义 | 缺乏体内实验验证,需要进一步研究其调控网络 | 研究SPRY1在皮肤衰老中的功能及其作为治疗靶点的潜力 | RAW264.7小鼠单核/巨噬细胞白血病细胞和NIH/3T3小鼠皮肤成纤维细胞 | 生物信息学 | 皮肤衰老和黑色素瘤 | 单细胞测序,WGCNA,qRT-PCR,CCK-8检测,ROS和SOD活性测量 | NA | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 来自GTEx和GEO数据库的数据集,以及细胞系实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9750 | 2025-03-21 |
Marrying mechanics with spatial transcriptomics
2025-Mar-19, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02491-4
PMID:40108447
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9751 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomics in the adult Drosophila brain and body
2025-Mar-18, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.92618
PMID:40100257
|
研究论文 | 本研究应用空间转录组学技术定位成年果蝇大脑和身体中150种mRNA的空间位置 | 首次将空间转录组学应用于成年果蝇大脑和身体,开发了整合空间转录组学和单细胞数据集的计算工具 | 概念验证研究,仅使用选定基因面板(150种mRNA物种) | 解决单核测序中细胞空间位置信息丢失的问题,定位果蝇细胞图谱中未知细胞簇的空间位置 | 成年果蝇大脑和身体组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据,单细胞数据 | 整个果蝇头部和身体,包括所有主要器官 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9752 | 2025-10-07 |
Targeting HIF-2α in glioblastoma reshapes the immune infiltrate and enhances response to immune checkpoint blockade
2025-Mar-17, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-025-05642-8
PMID:40095115
|
研究论文 | 本研究探索靶向HIF-2α在胶质母细胞瘤中重塑免疫浸润并增强免疫检查点阻断疗效的作用机制 | 首次揭示HIF-2α在胶质母细胞瘤免疫抑制中的关键作用,并证明HIF-2α抑制剂PT2385与免疫检查点阻断疗法的协同效应 | 研究基于小鼠GL261胶质母细胞瘤模型,临床转化效果需进一步验证 | 探究靶向HIF-2α对胶质母细胞瘤免疫微环境的调控作用及其与免疫治疗的协同机制 | GL261小鼠胶质母细胞瘤模型、肿瘤相关小胶质细胞/巨噬细胞、调节性T细胞 | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、体外细胞培养 | 动物疾病模型 | 基因表达数据、细胞表型数据 | GL261小鼠模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9753 | 2025-10-07 |
Transcriptional heterogeneity shapes stress-adaptive responses in yeast
2025-Mar-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57911-6
PMID:40097446
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探索酵母在渗透胁迫适应过程中的转录异质性及其对细胞适应性决策的影响 | 首次系统性地揭示了酵母渗透胁迫响应程序的转录异质性模式,并建立了转录异质性与细胞适应性之间的直接联系 | 研究仅针对酵母模型,结果在其他生物系统中的普适性需要进一步验证 | 阐明转录异质性在酵母应激适应性响应中的分子机制和功能意义 | 酵母细胞及其300多个RNA条形码缺失突变体 | 单细胞生物学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 300多个RNA条形码缺失突变体 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 9754 | 2025-10-07 |
Unraveling shared diagnostic genes and cellular microenvironmental changes in endometriosis and recurrent implantation failure through multi-omics analysis
2025-Mar-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-93146-7
PMID:40097519
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研究论文 | 通过多组学分析揭示子宫内膜异位症和复发性种植失败的共享诊断基因及细胞微环境变化 | 首次整合转录组和单细胞测序数据系统分析EMs和RIF的共享分子机制,并利用机器学习筛选出PDIA4和PGBD5作为新型共享诊断生物标志物 | 研究结果仍需在更大规模队列中验证,治疗潜力有待进一步探索 | 探索子宫内膜异位症和复发性种植失败的共同病理机制和诊断标志物 | 子宫内膜异位症和复发性种植失败患者 | 生物信息学 | 子宫内膜异位症,复发性种植失败 | 转录组测序,单细胞测序,机器学习,基因集富集分析,ceRNA网络分析 | 随机森林,XGBoost | 基因表达数据,单细胞数据 | GEO数据库中的转录组和单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq,转录组测序 | NA | NA |
| 9755 | 2025-10-07 |
Exploring mitochondrial and ferroptotic mechanisms for systemic lupus erythematosus biomarker identification and therapy
2025-Mar-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-93872-y
PMID:40097571
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析探索系统性红斑狼疮中线粒体和铁死亡相关机制,建立诊断预测模型并筛选潜在治疗药物 | 首次结合线粒体相关基因和铁死亡相关基因评分,通过单细胞多组学分析揭示SLE细胞异质性,并开发高精度诊断预测模型 | 研究基于公共数据库数据,缺乏实验验证;样本来源和数量未明确说明 | 探索系统性红斑狼疮的分子机制并开发诊断生物标志物和治疗方法 | 系统性红斑狼疮患者基因表达数据 | 生物信息学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, 微阵列分析, 分子对接 | 机器学习算法, 高维加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 微阵列 | NA | NA |
| 9756 | 2025-10-07 |
Neutrophil extracellular trap-derived double-stranded RNA aggravates PANoptosis in renal ischemia reperfusion injury
2025-Mar-17, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02145-8
PMID:40098148
|
研究论文 | 本研究揭示了中性粒细胞胞外诱捕网来源的双链RNA通过TLR3信号通路加剧肾缺血再灌注损伤中近端肾小管上皮细胞的PANoptosis | 首次发现NETs来源的dsRNA通过TLR3信号通路促进肾IRI中的PANoptosis,并鉴定RIPK1-PANoptosomes在此过程中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究中性粒细胞胞外诱捕网在肾缺血再灌注损伤中促进PANoptosis的具体机制 | 小鼠肾缺血再灌注损伤模型中的近端肾小管上皮细胞 | 分子生物学 | 肾缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序,基因敲除,化学抑制剂 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9757 | 2025-10-07 |
Independent signaling pathways provide a fail-safe mechanism to prevent tumorigenesis
2025-Mar-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.28.640798
PMID:40093137
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析揭示EGFR-Ras和Hh信号通路在防止肿瘤发生中的独立作用机制 | 发现非相互作用的信号通路在转录水平上汇聚以防止恶性细胞行为的新机制 | 研究局限于果蝇滤泡细胞谱系,未在哺乳动物系统中验证 | 探究促增殖信号对上皮稳态的影响及其在肿瘤发生中的作用 | 果蝇滤泡细胞谱系 | 单细胞转录组学 | 肿瘤发生 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9758 | 2025-10-07 |
The trabecular and compact myocardium of adult vertebrate ventricles are transcriptionally similar despite morphological differences
2025-Mar, Annals of the New York Academy of Sciences
IF:4.1Q1
DOI:10.1111/nyas.15296
PMID:39934982
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研究论文 | 本研究通过转录组学分析揭示了成年脊椎动物心室中致密心肌和小梁心肌在转录水平上的相似性 | 首次系统比较了多种脊椎动物胚胎期和成年期心肌的转录组差异,挑战了传统认为致密心肌与小梁心肌存在本质功能差异的观点 | 研究主要基于转录组数据分析,缺乏功能验证实验;物种覆盖范围有限 | 探究脊椎动物心脏进化过程中致密心肌与小梁心肌的转录组差异及其发育动态 | 小鼠、人类、斑胸草雀、斑马鱼和金枪鱼的心肌组织 | 转录组学 | 心血管疾病 | 空间转录组学,单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 多种脊椎动物物种的心肌样本 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9759 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing of peripheral blood mononuclear cells from bronchopulmonary dysplasia
2025-Mar, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70276
PMID:40097329
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析支气管肺发育不良患者外周血单个核细胞的免疫特征 | 首次整合单细胞RNA测序与T/B细胞受体分析揭示BPD免疫机制,发现BTLA-TNFRSF14信号轴的关键作用 | 样本量有限,主要发现需在动物模型中验证 | 阐明支气管肺发育不良的免疫学机制 | 早产儿外周血单个核细胞及小鼠BPD模型 | 单细胞组学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序,T/B细胞受体分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 早产儿BPD患者和健康对照的外周血单个核细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9760 | 2025-10-07 |
Intratumoral Heterogeneity and Immune Microenvironment in Hepatoblastoma Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2025-Mar, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70482
PMID:40099956
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示肝母细胞瘤的瘤内异质性和免疫微环境特征 | 首次提供肝母细胞瘤的全面单细胞图谱,发现不同肿瘤区域具有不同的细胞组成和恶性程度,识别HMGB2作为潜在预后标志物 | 仅基于单个患者的样本,样本量有限,需要更大规模研究验证 | 探索肝母细胞瘤的瘤内异质性和肿瘤免疫微环境特征 | 肝母细胞瘤患者三个肿瘤区域和邻近正常组织的细胞 | 数字病理学 | 肝母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 43,592个细胞来自一个患者的三个肿瘤区域和邻近正常组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |