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当前共找到 10430 篇文献，本页显示第 9701 - 9720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9701 | 2025-10-07 |
Single-cell analyses reveal metastasis mechanism and microenvironment remodeling of lymph node in intrahepatic cholangiocarcinoma
2025-Mar, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2024.101275
PMID:40041119
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研究论文 | 通过单细胞和多组学分析揭示肝内胆管癌淋巴结转移的机制和微环境重塑 | 首次系统揭示iCCA淋巴结转移微环境的异质性，鉴定CD36+巨噬细胞和SAA1+肿瘤细胞在转移过程中的关键作用 | 样本量相对较小（4例单细胞测序患者），需要更大规模研究验证 | 系统探索肝内胆管癌淋巴结转移相关微环境的异质性 | 肝内胆管癌患者的原发肿瘤、癌旁肝组织和肿瘤引流淋巴结 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫组织化学, 差异基因表达分析, 功能富集分析, 单细胞拷贝数变异评估, 拟时序分析 | NA | 单细胞转录组数据, 组织切片图像 | 4例患者（单细胞测序）, 81例肿瘤和匹配淋巴结组织切片 | NA | 单细胞RNA测序, 多重免疫组织化学 | NA | NA |
| 9702 | 2025-10-07 |
ELLIPSIS: robust quantification of splicing in scRNA-seq
2025-Feb-04, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf028
PMID:39936571
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研究论文 | 开发了一种名为ELLIPSIS的工具，用于在单细胞RNA测序中稳健地量化剪接事件 | 利用局部观察到的读取覆盖度、流动保守性和细胞类型内相似性特性，能够量化新型剪接事件 | NA | 开发在单细胞RNA测序中稳健量化剪接的工具 | 单细胞RNA测序数据中的剪接事件 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9703 | 2025-10-07 |
Jellyfish stings-induced cardiac failure was ameliorated through AAG-mediated glycogen-driven ATP production
2025-Feb, Exploration (Beijing, China)
DOI:10.1002/EXP.20230089
PMID:40040825
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研究论文 | 本研究揭示了水母蜇伤导致的心力衰竭通过AAG介导的糖原驱动ATP产生得到改善的机制 | 首次发现AAG通过促进糖原代谢和糖酵解/线粒体代谢转换来改善水母蜇伤引起的心力衰竭 | 具体分子机制仍需进一步阐明，临床转化潜力有待验证 | 探究AAG在改善水母蜇伤引起的心力衰竭中的作用机制 | 水母蜇伤引起的心力衰竭患者和相关的分子通路 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,空间转录组技术 | 基因敲除模型 | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 9704 | 2025-10-07 |
Overexpression of ornithine decarboxylase 1 mediates the immune-deserted microenvironment and poor prognosis in diffuse large B-cell lymphoma
2025-Feb, Journal of the National Cancer Center
IF:7.6Q1
DOI:10.1016/j.jncc.2024.10.001
PMID:40040873
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研究论文 | 本研究通过机器学习识别弥漫性大B细胞淋巴瘤中具有干细胞特征的高风险亚群，并揭示ODC1过表达与免疫荒漠微环境共同导致不良预后的机制 | 首次将ODC1过表达与DLBCL免疫荒漠微环境联系起来，建立了精准风险分层模型，并证明靶向ODC1可调节免疫治疗反应 | 研究基于回顾性数据，需要前瞻性临床试验验证治疗策略 | 改善弥漫性大B细胞淋巴瘤的风险分层和治疗策略 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者和细胞系 | 机器学习 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 基因组分析, 体外实验 | 机器学习算法 | 转录组数据, 基因组数据, 单细胞RNA测序数据 | 2133例DLBCL样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9705 | 2025-10-07 |
Accurate tiling of spatial single-cell data with Tessera
2025-Jan-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.17.633630
PMID:39896464
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研究论文 | 介绍了一种名为Tessera的空间单细胞数据分割算法，能够准确识别组织边界 | 采用边缘保持平滑、拓扑数据分析和形态学感知的聚合空间聚类方法，通过将组织划分为小型多细胞瓦片来精确追踪自然组织边界 | NA | 开发能够准确识别组织边界和功能多细胞单元的空间单细胞数据分析方法 | 健康小鼠大脑、人类淋巴结、人类大脑和肺癌组织 | 空间转录组学 | 肺癌 | 空间转录组学，空间蛋白质组学 | Tessera算法 | 空间单细胞数据 | NA | NA | 空间转录组学，空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 9706 | 2025-10-07 |
A regularized Bayesian Dirichlet-multinomial regression model for integrating single-cell-level omics and patient-level clinical study data
2025-Jan-07, Biometrics
IF:1.4Q2
DOI:10.1093/biomtc/ujaf005
PMID:39887052
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研究论文 | 提出一种正则化贝叶斯狄利克雷-多项回归框架，用于整合单细胞水平组学数据与患者水平临床数据 | 采用新型层次树结构在不同细胞类型水平识别关联关系，首次将正则化贝叶斯方法应用于单细胞与临床数据整合 | 未明确说明模型验证方法和性能评估指标 | 研究单细胞RNA测序数据与患者临床数据之间的关联关系 | 肺纤维化、COVID-19和非小细胞肺癌患者 | 生物信息学 | 肺纤维化, COVID-19, 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯狄利克雷-多项回归模型 | 单细胞组学数据, 临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9707 | 2025-10-07 |
Multiomics analysis provides insights into musk secretion in muskrat and musk deer
2025-Jan-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf006
PMID:40036429
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了麝鼠和麝香鹿麝香分泌的分子机制 | 首次生成麝鼠和麝香鹿染色体级别基因组组装，并开发了首个麝香分泌哺乳动物多组学数据库平台MuskDB | 对麝香分泌特异性遗传变异的深入研究仍显不足 | 探究麝香分泌的分子机制和进化驱动因素 | 麝鼠(Ondatra zibethicus Linnaeus)和中国林麝(Moschus berezovskii Flerov) | 多组学分析 | NA | 基因组测序,转录组测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据,转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 2个物种的基因组组装和168个麝鼠组织转录组 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 基因组测序 | NA | NA |
| 9708 | 2025-10-07 |
Deciphering ovarian cancer heterogeneity through spatial transcriptomics, single-cell profiling, and copy number variations
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0317115
PMID:40036264
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研究论文 | 通过空间转录组学、单细胞分析和拷贝数变异解析高级别浆液性卵巢癌的异质性 | 整合单细胞转录组、空间转录组和拷贝数变异数据，首次系统揭示HGSOC肿瘤异质性的多层次特征，发现MDK-NCL配体-受体对在肿瘤增殖中的关键作用 | 样本量有限（8名患者），需要在更大队列中验证发现 | 阐明高级别浆液性卵巢癌肿瘤异质性的分子机制 | 高级别浆液性卵巢癌患者组织样本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 拷贝数变异分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 基因组变异数据 | 8名HGSOC患者（5个单细胞转录组，8个空间转录组） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 9709 | 2025-10-07 |
Weighted Gene Coexpression Network Analysis Identifies Neutrophil-Related Molecular Subtypes and Their Clinical Significance in Gastric Cancer
2025, Cancer management and research
IF:2.5Q3
DOI:10.2147/CMAR.S500215
PMID:40040634
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和加权基因共表达网络分析鉴定胃癌中与中性粒细胞相关的分子亚型及其临床意义 | 首次利用单细胞RNA测序结合高维加权基因共表达网络分析鉴定出两种与中性粒细胞相关的胃癌分子亚型，并发现三个新的预后关键基因 | NA | 建立更准确的胃癌分子分型系统以改善患者预后 | 胃癌患者样本 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 随机生存森林分析 | 随机森林 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9710 | 2025-10-07 |
New hopes and challenges in targeted therapy and immunotherapy for primary central nervous system lymphoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1438001
PMID:40040699
|
综述 | 本文综述原发性中枢神经系统淋巴瘤靶向治疗和免疫治疗的最新进展与挑战 | 整合基因测序、单细胞测序等新技术揭示PCNSL发病机制，系统评估新兴靶向药物和免疫疗法的临床应用前景 | NA | 总结PCNSL靶向治疗和免疫治疗的最新研究成果并展望未来发展方向 | 原发性中枢神经系统淋巴瘤(PCNSL) | NA | 淋巴瘤 | 基因测序, 转录组测序, 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 9711 | 2025-10-07 |
Integrative Analysis of scRNA-Seq and Bulk RNA-Seq Identifies Plasma Cell Related Genes and Constructs a Prognostic Model for Hepatocellular Carcinoma
2025, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S509749
PMID:40040881
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研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA测序数据识别浆细胞相关基因并构建肝细胞癌预后模型 | 首次发现浆细胞是肝细胞癌发展的关键细胞簇，并基于浆细胞相关基因构建了八基因预后模型 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅限于SSR3基因的体外功能验证 | 识别与肝细胞癌发展最相关的肿瘤免疫微环境细胞类型及其作用机制 | 肝细胞癌患者的正常组织和肿瘤组织 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 体外功能验证 | 预后模型, 列线图 | 基因表达数据 | 内部和外部数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 9712 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the impaired epidermal differentiation and pathological microenvironment in diabetic foot ulcer
2025, Burns & trauma
IF:6.3Q1
DOI:10.1093/burnst/tkae065
PMID:40040959
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示糖尿病足溃疡中表皮分化受损和病理微环境的机制 | 首次在单细胞水平系统描绘糖尿病足溃疡的表皮分化表型和动态变化，鉴定出两种关键角质形成细胞亚型BC-2和DAK | 样本来源和数量未明确说明，需要进一步功能验证实验 | 探究糖尿病足溃疡再上皮化受损的潜在机制 | 人正常皮肤、急性伤口和糖尿病足溃疡组织 | 单细胞组学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序, 激光捕获显微切割测序, 多重免疫组织化学 | 伪时间分析, 谱系推断分析, 细胞间相互作用分析 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组 | NA | NA |
| 9713 | 2025-10-07 |
Identification of cancer-associated fibroblast signature genes for prognostic prediction in colorectal cancer
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1476092
PMID:40041860
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序数据识别结直肠癌中癌症相关成纤维细胞特征基因，并建立预后预测模型 | 首次结合单细胞RNA测序和WGCNA方法系统识别CAFs特征基因，并建立具有预后预测价值的风险模型 | 研究依赖公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 识别结直肠癌中癌症相关成纤维细胞相关基因并建立预后预测模型 | 结直肠癌患者和细胞系（HCT116、HT29、NCM460） | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序，qRT-PCR，WGCNA，LASSO算法 | LASSO回归模型 | 基因表达数据 | TCGA数据库结直肠癌样本和GEO数据库单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 9714 | 2025-10-07 |
EPAS1 induction drives myocardial degeneration in desmoplakin-cardiomyopathy
2025-Mar-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.111895
PMID:40034852
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析发现EPAS1是致心律失常性心肌病中心肌退化的关键调控因子 | 首次在人类扩张型心肌病心脏中发现EPAS1通过调控线粒体稳态参与心肌退化过程 | 研究样本量有限，主要基于单个患者的心脏样本 | 探索桥粒斑蛋白基因突变导致心肌病的分子机制 | 携带致病性DSP基因突变的心肌细胞 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 1例患者心脏样本及多个遗传性心肌病心脏样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 9715 | 2025-10-07 |
Saltiness Enhancement of Soy Peptides by Modulating Amiloride-Insensitive Salt-Responsive Cells and Interacting with Cell Membranes
2025-Mar-05, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c12256
PMID:39993222
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研究论文 | 本研究探讨大豆肽E、DG和9AA通过调节阿米洛利不敏感盐响应细胞及与细胞膜相互作用的机制增强咸味感知 | 首次结合感官评价、钙成像、单细胞RNA测序和分子动力学模拟系统揭示大豆肽的咸味增强机制 | 仅研究三种大豆肽，未涵盖其他可能具有咸味增强潜力的肽类 | 探究大豆肽的咸味增强机制及其结构-功能关系 | 大豆肽E(EDEGEQPRPF)、DG(DEGEQPRPFP)和9AA(DEGEQPRPF) | 食品科学 | NA | 感官评价、钙成像、单细胞RNA测序、分子动力学模拟 | NA | 感官数据、成像数据、基因表达数据、分子模拟数据 | 三种大豆肽 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9716 | 2025-10-07 |
Single-cell Atlas of Developing Mouse Palates Reveals Cellular and Molecular Transitions in Periderm Cell Fate
2025-Mar-04, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf013
PMID:40037804
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了小鼠腭部发育过程中周皮细胞的细胞和分子转变机制 | 首次系统描绘了腭部发育过程中周皮细胞的四个亚群和两种不同的细胞命运轨迹，发现了claudin家族基因、Arhgap29和Pitx2在周皮细胞功能中的新作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究腭部发育过程中周皮细胞的分子机制和发育轨迹 | 发育中的小鼠腭部组织（胚胎期E10.5至E16.5） | 单细胞转录组学 | 腭裂 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠胚胎腭部组织（E10.5-E16.5多个时间点） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9717 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Tumor Heterogeneity and Immunosuppressive Microenvironment in Urothelial Carcinoma
2025-Mar, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16436
PMID:39726326
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示尿路上皮癌的肿瘤异质性和免疫抑制微环境特征 | 首次在单细胞分辨率下系统比较了不同解剖来源尿路上皮癌的细胞组成差异，发现了具有EMT和癌症干细胞特征的EP9稀有上皮亚型及其预后价值 | 样本量较小（仅13例患者），缺乏功能验证实验 | 解析尿路上皮癌的细胞异质性和免疫微环境特征 | 膀胱尿路上皮癌、输尿管尿路上皮癌和肾盂尿路上皮癌患者组织样本 | 单细胞组学 | 尿路上皮癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 13例患者（4例膀胱UC，5例输尿管UC，4例肾盂UC） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9718 | 2025-10-07 |
Unveiling tumor-infiltrating immune cell-driven immune-mediated drug resistance in clear cell renal cell carcinoma: prognostic insights and therapeutic strategies
2025-Mar-01, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01890-z
PMID:40025304
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研究论文 | 本研究通过整合转录组和单细胞RNA测序数据，探索肿瘤浸润免疫细胞在透明细胞肾细胞癌中介导免疫耐药性的机制 | 构建了基于肿瘤浸润免疫细胞相关RNA的预后模型，在预测性能上优于53个已发表模型，并揭示了免疫代谢重编程与基因组改变的关联 | 研究依赖于回顾性队列数据，需要前瞻性临床验证 | 探索ccRCC中肿瘤浸润免疫细胞介导的耐药机制及其预后和治疗意义 | 透明细胞肾细胞癌患者及其肿瘤微环境 | 生物信息学 | 肾细胞癌 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 机器学习 | 机器学习算法 | 基因表达数据, 单细胞数据 | 多个队列数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 9719 | 2025-10-07 |
Association between cancer-associated fibroblasts and prognosis of neoadjuvant chemoradiotherapy in esophageal squamous cell carcinoma: a bioinformatics analysis based on single-cell RNA sequencing
2025-Mar-01, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03709-x
PMID:40025479
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析食管鳞癌新辅助放化疗后肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞与预后的关联 | 首次在单细胞水平系统表征NCRT后ESCC微环境中CAF亚型，并建立基于myCAFs标记基因的预后模型 | 需要进一步研究验证发现结果并探索其临床意义 | 研究新辅助放化疗对食管鳞癌微环境的影响 | 食管鳞状细胞癌(ESCC)患者样本 | 生物信息学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | 预后特征模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9720 | 2025-10-07 |
Identification and multi-omics analysis of essential coding and long non-coding genes in colorectal cancer
2025-Mar, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.101938
PMID:40034256
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研究论文 | 通过整合CRISPR筛选和单细胞测序数据，识别结直肠癌中的必需编码基因和长非编码基因，并进行多组学分析 | 首次在单细胞水平系统识别结直肠癌必需基因，结合多组学数据揭示其在肿瘤微环境中的调控网络 | 研究主要基于细胞系数据，在体验证仍需进一步完善 | 识别结直肠癌中的必需基因并探索其作为治疗靶点的潜力 | 结直肠癌细胞系和组织样本 | 生物信息学 | 结直肠癌 | CRISPR/Cas9筛选, 单细胞RNA测序, 多组学分析 | 超几何检验, 个性化PageRank算法 | 基因组数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | 8个全基因组CRISPR数据集和结直肠癌组织单细胞数据 | NA | 单细胞RNA测序, CRISPR筛选 | NA | NA |