单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 10570 篇文献，本页显示第 9681 - 9700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9681 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing uncovers a high ESM1-expression endothelial cell subpopulation associated with bladder cancer progression and the immunosuppressive microenvironment
2025-Mar-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-95731-2
PMID:40159545
|
研究论文 | 通过单细胞测序发现膀胱癌中高表达ESM1的内皮细胞亚群与疾病进展和免疫抑制微环境相关 | 首次在膀胱癌中鉴定出高表达ESM1的内皮细胞亚群，揭示其与肿瘤进展和免疫抑制微环境的关联 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证 | 探究膀胱癌中肿瘤内皮细胞的异质性及其在疾病进展中的作用 | 膀胱癌组织中的CD45阴性单细胞 | 单细胞测序分析 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | 层次聚类分析，pySCENIC算法 | 单细胞转录组数据 | 7,519个CD45阴性单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9682 | 2025-10-07 |
SERPINA3 predicts long-term neurological outcomes and mortality in patients with intracerebral hemorrhage
2025-Mar-29, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07551-x
PMID:40157917
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析发现SERPINA3可作为脑出血患者长期神经功能预后和死亡率的预测生物标志物 | 首次在脑出血研究中结合空间转录组学、病理验证和临床队列分析，系统揭示SERPINA3的预后预测价值 | 需要更大规模的前瞻性队列验证，样本量相对有限 | 探索脑出血患者长期神经功能预后的可靠生物标志物 | 脑出血患者和健康对照人群 | 空间转录组学 | 脑出血 | 空间转录组学, 病理学研究, 血浆分析 | NA | 转录组数据, 病理图像, 临床数据 | 500人（250例脑出血患者和250例健康对照） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 9683 | 2025-10-07 |
Revealing a coherent cell state landscape across single cell datasets with CONCORD
2025-Mar-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.13.643146
PMID:40161827
|
研究论文 | 提出CONCORD自监督对比学习框架，用于单细胞RNA测序数据的稳健降维和整合 | 采用概率性、数据集和邻域感知的采样策略，同时提高细胞状态分辨率和减少批次效应 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中细胞状态景观解析的挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 对比学习框架 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9684 | 2025-10-07 |
Single‑cell RNA‑Seq reveals PBMC profile alterations in a patient following a radiation accident
2025-May, Experimental and therapeutic medicine
IF:2.4Q3
DOI:10.3892/etm.2025.12846
PMID:40165803
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示辐射事故患者外周血单核细胞谱的动态变化 | 首次在单细胞水平上系统描述辐射暴露后人类外周血免疫细胞的动态变化轨迹 | 样本量较小（仅1名患者和10名健康对照），缺乏多时间点跟踪 | 研究电离辐射对人体外周血免疫细胞的影响机制 | 辐射事故患者和健康对照者的外周血单核细胞 | 单细胞组学 | 辐射损伤 | 单细胞RNA测序 | 轨迹分析、基因调控网络推断 | 单细胞转录组数据 | 1名患者在辐射后第113天和631天，10名健康对照者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9685 | 2025-10-07 |
Dynamic Alterations in DNA Methylation of CD4+ T Cells and Macrophages in a Murine Model of Tuberculous Pleural Infection Induced by BCG Vaccination
2025-Apr, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70166
PMID:40170749
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研究论文 | 本研究通过分析BCG诱导的小鼠结核性胸膜炎模型中CD4+ T细胞和巨噬细胞的DNA甲基化动态变化 | 首次揭示了结核性胸膜炎进展过程中免疫细胞DNA甲基化的动态变化特征及其对T细胞分化的调控作用 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类样本中验证 | 探究结核性胸膜炎中免疫细胞的表观遗传调控机制 | BCG诱导的结核性胸膜炎小鼠模型中的CD4+ T细胞和巨噬细胞 | 表观遗传学 | 结核病 | DNA甲基化测序,转录组测序,单细胞RNA测序 | NA | 表观遗传数据,转录组数据 | BCG诱导的小鼠胸膜炎模型在0、1、7、14天时间点的胸膜灌洗液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9686 | 2025-10-07 |
Deciphering shared molecular dysregulation across Parkinson's disease variants using a multi-modal network-based data integration and analysis
2025-Mar-31, NPJ Parkinson's disease
DOI:10.1038/s41531-025-00914-3
PMID:40164620
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研究论文 | 通过构建知识图谱整合多组学数据，探索不同帕金森病变异型之间的共同分子失调机制 | 首次将患者特异性中脑类器官的多模态数据与公共生物数据整合构建知识图谱，并在单细胞水平分析特发性帕金森病与单基因型帕金森病的共同转录组失调 | 研究样本量有限，仅包含特定基因突变类型，需要进一步验证 | 探索不同帕金森病变异型之间共享的分子失调机制 | 帕金森病患者特异性中脑类器官（含LRRK2-G2019S、SNCA三倍体、GBA-N370S、MIRO1-R272Q突变）及特发性帕金森病患者 | 系统生物医学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序，高通量成像，知识图谱构建 | 知识图谱，网络分析 | 图像数据，RNA测序数据，单细胞RNA测序数据 | 包含多种基因突变的帕金森病患者特异性中脑类器官及特发性帕金森病患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq，RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 9687 | 2025-10-07 |
Myeloid-derived suppressor cell inhibits T-cell-based defense against Klebsiella pneumoniae infection via IDO1 production
2025-Mar, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1012979
PMID:40096073
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了高毒力肺炎克雷伯菌感染中髓源性抑制细胞通过IDO1酶抑制T细胞免疫应答的机制 | 首次发现hvKp感染通过诱导色氨酸代谢增强MDSCs的免疫抑制活性，并证实IDO1在抑制T细胞抗细菌免疫中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证；IDO1抑制剂在临床应用中的效果需进一步评估 | 探究高毒力肺炎克雷伯菌逃避宿主免疫防御的机制，为开发新的免疫治疗策略提供理论依据 | 高毒力肺炎克雷伯菌感染的小鼠模型及相关的免疫细胞 | 免疫学 | 细菌感染 | 单细胞RNA测序，基因敲除，体外抑制实验 | NA | 基因表达数据 | 小鼠感染模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9688 | 2025-10-07 |
Inhibition of ERK1/2 mediated activation of Drp1 alleviates intervertebral disc degeneration via suppressing pyroptosis and apoptosis in nucleus pulposus cells
2025-Mar, Journal of orthopaedic translation
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.jot.2025.01.013
PMID:40160807
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研究论文 | 本研究探讨了Drp1在椎间盘退变中的作用机制，并验证了Drp1抑制剂Mdivi-1通过抑制细胞焦亡和凋亡缓解退变的治疗效果 | 首次揭示ERK1/2通过调控Drp1磷酸化介导的线粒体分裂在椎间盘退变中的作用机制，并证实Mdivi-1的治疗潜力 | 研究主要基于大鼠模型和体外细胞实验，尚未进行临床验证 | 阐明Drp1在椎间盘退变中的分子机制并评估其抑制剂Mdivi-1的治疗效果 | 大鼠椎间盘退变模型和髓核细胞 | 分子生物学 | 椎间盘退变 | 单细胞测序分析、Western blot、流式细胞术、免疫荧光染色、X射线、MRI | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、影像数据 | 8周龄大鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9689 | 2025-10-07 |
A novel lactylation-related gene signature to predict prognosis and treatment response in lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1549724
PMID:40161374
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于乳酸化相关基因的特征模型，用于预测肺腺癌患者的预后和治疗反应 | 首次在肺腺癌中系统研究乳酸化相关基因特征，构建了风险预后模型并验证其与免疫浸润和化疗敏感性的关联 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，需要更多前瞻性临床研究验证 | 探索乳酸化相关基因在肺腺癌预后预测和治疗反应评估中的价值 | 肺腺癌患者和肺腺癌细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | RNA测序，单细胞测序，LASSO回归分析 | 风险预后模型，列线图 | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的肺腺癌患者样本 | NA | RNA-seq，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9690 | 2025-10-07 |
Early Detection of Malignant Cells in Gastric Lavage via Hexokinase 2 and Single-Cell Sequencing for Gastric Cancer Diagnosis
2025, Risk management and healthcare policy
IF:2.7Q2
DOI:10.2147/RMHP.S510123
PMID:40161902
|
研究论文 | 本研究开发了一种通过胃灌洗液中HK2标记和单细胞测序检测脱落肿瘤细胞的新方法，用于胃癌早期诊断 | 首次将代谢标记物HK2与单细胞测序技术结合应用于胃灌洗液检测，实现胃癌早期诊断 | 样本量相对有限（60例），对重度不典型增生的敏感性仅为57% | 开发一种非侵入性的胃癌早期诊断方法 | 胃灌洗液中的脱落肿瘤细胞 | 数字病理 | 胃癌 | 单细胞测序，基因组拷贝数变异分析 | NA | 单细胞基因组数据 | 60例（10例胃癌，26例癌前病变，15例良性胃病，9例健康对照） | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 9691 | 2025-10-07 |
Analysis and Validation of Mitophagy-Related Genes in Diabetic Foot Ulcers
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S504001
PMID:40162084
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，鉴定并验证了与糖尿病足溃疡相关的线粒体自噬关键基因 | 首次在糖尿病足溃疡中系统分析线粒体自噬相关基因，结合机器学习算法、免疫细胞浸润分析和单细胞RNA测序验证 | 样本量有限，需要更大队列研究；对炎症机制的机制性联系探索不够深入 | 鉴定糖尿病足溃疡发病机制中与线粒体自噬相关的关键基因 | 糖尿病足溃疡患者皮肤组织 | 生物信息学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序, RT-PCR, Western blot, 机器学习算法 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 使用GEO数据库中的多个数据集(GSE80178, GSE68183, GSE165816) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 9692 | 2025-10-07 |
scCCTR: An iterative selection-based semi-supervised clustering model for single-cell RNA-seq data
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.03.018
PMID:40165824
|
研究论文 | 提出一种基于迭代选择的半监督聚类模型scCCTR，用于单细胞RNA测序数据分析 | 通过迭代选择高置信度细胞和标签来指导深度学习模型，结合Transformer神经网络的多头注意力机制提升聚类精度 | NA | 开发更准确有效的单细胞RNA测序数据聚类算法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | Transformer, 深度学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9693 | 2025-10-07 |
Inflammation and cancer: molecular mechanisms and clinical consequences
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1564572
PMID:40165901
|
综述 | 本文综述了炎症与癌症之间的分子机制及临床关联，重点关注癌症相关炎症对肿瘤进展和治疗反应的影响 | 整合单细胞RNA测序和空间分子成像分析等先进技术，系统阐明慢性炎症与癌症的联系机制 | NA | 探讨炎症在癌症发生发展中的分子机制和临床后果 | 癌症相关炎症、肿瘤微环境、胃肠道癌症 | NA | 癌症、胃肠道癌症 | 单细胞RNA测序、空间分子成像分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9694 | 2025-10-07 |
Identification of immune characteristic biomarkers and therapeutic targets in cuproptosis for rheumatoid arthritis by integrated bioinformatics analysis and single-cell RNA sequencing analysis
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1520400
PMID:40166070
|
研究论文 | 通过整合生物信息学分析和单细胞RNA测序分析，鉴定铜死亡在类风湿关节炎中的免疫特征生物标志物和治疗靶点 | 首次系统研究铜死亡相关基因在类风湿关节炎中的表达特征和生物学功能，并探索其与免疫浸润和治疗药物的关联 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证 | 阐明铜死亡相关基因与类风湿关节炎的潜在关联，寻找新的生物标志物和治疗靶点 | 类风湿关节炎患者和对照组的铜死亡相关基因 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 蛋白质相互作用网络分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9695 | 2025-10-07 |
A dynamic peripheral immune landscape during human pregnancy
2025-Jan, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2022.06.011
PMID:40166108
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示人类妊娠期间外周免疫系统的动态转录变化 | 首次从免疫角度提出妊娠具有促衰老效应，并发现该效应在产后可能恢复 | 仅关注外周血单核细胞，未涉及局部组织免疫变化 | 阐明妊娠期间母体免疫系统的动态变化机制 | 妊娠期女性的外周血单核细胞 | 单细胞组学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 不同妊娠阶段的孕妇外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9696 | 2025-10-07 |
A Noninvasive Menstrual Blood-Based Diagnostic Platform for Endometriosis Using Digital Droplet Enzyme-Linked Immunosorbent Assay and Single-Cell RNA Sequencing
2025, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0652
PMID:40171018
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研究论文 | 开发基于月经血的非侵入性子宫内膜异位症诊断平台，结合数字微滴酶联免疫吸附测定和单细胞RNA测序技术 | 首次将月经血作为诊断样本，开发了具有飞摩尔级灵敏度的ddELISA技术，并验证了月经血与子宫内膜异位症病变的关键生物学特性相似性 | 未提及样本规模和研究人群特征，需要进一步临床验证 | 开发子宫内膜异位症的非侵入性体外诊断方法 | 子宫内膜异位症患者，重点关注月经血中的遗传和炎症标志物 | 数字病理 | 子宫内膜异位症 | 数字微滴酶联免疫吸附测定，单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质检测数据，单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9697 | 2025-10-07 |
Spatial genomics reveals cholesterol metabolism as a key factor in colorectal cancer immunotherapy resistance
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1549237
PMID:40171265
|
研究论文 | 通过空间转录组学技术揭示结直肠癌中胆固醇代谢与免疫检查点抑制剂耐药性的关联 | 开发了增强型转录组捕获方案获得高质量空间数据，首次发现肿瘤细胞胆固醇代谢是免疫治疗耐药的关键因素 | 研究基于MC38同系肿瘤模型，需要在更多临床样本中验证 | 探索免疫检查点抑制剂治疗反应的早期特征 | 结直肠癌肿瘤模型 | 空间转录组学 | 结直肠癌 | 空间转录组学，bulk RNA测序 | MC38同系肿瘤模型 | 空间转录组数据，组织学图像，RNA测序数据 | 16个肿瘤，48,636个转录组位点 | NA | 空间转录组学，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 9698 | 2025-10-07 |
Uncovering the heterogeneity of NK cells on the prognosis of HCC by integrating bulk and single-cell RNA-seq data
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1570647
PMID:40171266
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA-seq数据，揭示了NK细胞异质性在肝细胞癌预后中的作用 | 首次通过整合bulk和单细胞RNA测序数据系统分析HCC中NK细胞的异质性及其预后价值 | 研究基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 探究NK细胞在肝细胞癌肿瘤微环境中的作用及预后价值 | 肝细胞癌患者样本数据 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 加权基因共表达网络分析, Cox回归分析 | 预后风险评分模型 | 基因表达数据 | GSE149614数据集和TCGA数据集的样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 9699 | 2025-10-07 |
Integrated multi-omics analyses provide new insights into genomic variation landscape and regulatory network candidate genes associated with walnut endocarp
2025-Apr, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70113
PMID:40162720
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析揭示了核桃内果皮发育的基因组变异格局和调控网络候选基因 | 构建了首个核桃图形结构泛基因组，通过多组学整合分析鉴定了与木质素积累相关的关键候选基因 | 研究主要基于核桃品种，可能无法完全代表所有核桃种质的遗传多样性 | 系统解析核桃内果皮发育的基因组基础和调控网络 | 波斯核桃(Juglans regia)及其8个近缘种，共285个种质材料 | 植物基因组学 | NA | 基因组测序, GWAS, 转录组学, 代谢组学, DNA甲基化, 空间转录组学 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 代谢组数据, 表观遗传数据 | 285个核桃种质材料，涵盖11个发育阶段 | NA | 全基因组重测序, 多组学整合分析 | NA | NA |
| 9700 | 2025-10-07 |
Cell Function Graphics: TOGGLE delineates fate and function within individual cell types via single-cell transcriptomics
2025-Mar-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.01.631041
PMID:40060433
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研究论文 | 开发了TOGGLE方法和图扩散功能图谱，用于在单细胞水平识别同一细胞类型内的功能异质性和细胞命运轨迹 | 利用高分辨率分析方法揭示细胞水平的功能多样性，开发创新的图扩散功能图谱能显著降低噪音并捕捉高维数据中更细微的功能差异 | NA | 克服同一细胞类型内因基因表达相似性而难以区分功能状态和细胞命运轨迹的挑战 | 单细胞类型内的功能RNA和细胞命运 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组测序 | 图扩散功能图谱 | 单细胞RNA表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |