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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9681 | 2025-10-07 |
EGFR-mediated local invasiveness and response to Cetuximab in head and neck cancer
2025-Mar-22, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02290-1
PMID:40121428
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研究论文 | 本研究通过功能基因图谱分析揭示了头颈癌中EGFR介导的局部侵袭基因调控网络及其与西妥昔单抗疗效的关系 | 首次构建了头颈癌局部侵袭基因调控网络(invGRN),发现INHBA和SNAI2作为核心枢纽,并证实SPHK1共抑制可增强西妥昔单抗的侵袭阻断效果 | 研究基于细胞3D模型和公共数据库,需要进一步临床验证 | 探索EGFR驱动头颈癌进展的分子网络机制,寻找联合治疗靶点和预测标志物 | 头颈鳞状细胞癌(HNSCC)细胞系、患者来源异种移植模型(PDX)和R/M-HNSCC患者 | 癌症生物学 | 头颈癌 | RNA测序(RNA-seq), 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 光转换示踪技术 | 3D细胞模型 | 基因表达数据 | 未明确具体样本数量,包含细胞模型、PDX模型和患者数据 | NA | RNA-seq, scRNA-seq | NA | NA |
| 9682 | 2025-10-07 |
Sox9 and nuclear factor I transcription factors regulate the timing of neurogenesis and ependymal maturation in dopamine progenitors
2025-Mar-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204421
PMID:39995267
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研究论文 | 本研究探讨Sox9和核因子I转录因子在中脑多巴胺神经元前体细胞周期停滞和室管膜细胞成熟过程中的调控作用 | 首次揭示Sox9和核因子I转录因子在调控中脑多巴胺神经元前体细胞向G0期退出和室管膜细胞成熟时序中的关键作用 | 研究主要聚焦于胚胎发育阶段,对成年后这些细胞的长期功能需要进一步验证 | 阐明中脑多巴胺神经元前体细胞发育过程中细胞周期退出和分化的分子调控机制 | 中脑多巴胺神经元前体细胞和室管膜细胞 | 发育神经生物学 | 神经系统发育疾病 | 单细胞RNA测序,组织学分析,条件性基因敲除 | NA | 基因表达数据,组织图像 | 不同胚胎发育阶段的中脑组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9683 | 2025-10-07 |
Utilizing sc-linker to integrate single-cell RNA sequencing and human genetics to identify cell types and driver genes associated with non-small cell lung cancer
2025-Jan-23, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-13525-1
PMID:39849454
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和人类遗传学数据,识别与非小细胞肺癌相关的细胞类型和驱动基因 | 使用sc-linker框架首次整合scRNA-seq、表观基因组SNP-基因映射和GWAS汇总统计数据,识别肺癌相关的特定细胞类型和驱动基因 | 研究主要基于计算分析,需要实验验证来确认RAB31的功能作用 | 识别与非小细胞肺癌相关的特定细胞类型和驱动基因 | 非小细胞肺癌患者和正常肺组织 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, GWAS, 表观基因组分析 | sc-linker框架, MAGMA | 单细胞RNA测序数据, GWAS汇总统计数据, 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9684 | 2025-10-07 |
The multi-target mechanism of action of Selaginella doederleinii Hieron in the treatment of nasopharyngeal carcinoma: a network pharmacology and multi-omics analysis
2025-01-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-83921-3
PMID:39747499
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研究论文 | 通过网络药理学和多组学分析探讨卷柏治疗鼻咽癌的多靶点作用机制 | 首次结合网络药理学、多组学分析和分子对接技术系统揭示卷柏治疗鼻咽癌的多靶点协同作用机制 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证 | 探索卷柏治疗鼻咽癌的作用机制 | 卷柏活性成分及其与鼻咽癌相关靶点的相互作用 | 生物信息学 | 鼻咽癌 | 网络药理学, WGCNA分析, 单细胞RNA测序, 分子对接, 分子动力学模拟 | 蛋白互作网络, 伪时间轨迹分析 | 基因表达数据, 化合物靶点数据 | GSE53819数据集及多个数据库数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 9685 | 2025-10-07 |
Discrepancies between human and murine model cerebral aneurysms at single-cell resolution
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1512938
PMID:40134579
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析比较人类与小鼠模型脑动脉瘤的细胞和分子差异 | 首次在单细胞分辨率系统比较人类与小鼠脑动脉瘤模型的细胞表型和分子特征差异 | 研究仅基于现有单细胞RNA测序数据集,缺乏实验验证 | 探究人类与小鼠脑动脉瘤模型在细胞和分子水平的差异 | 人类和小鼠模型的脑动脉瘤组织 | 单细胞组学 | 脑动脉瘤 | 单细胞RNA测序, 轨迹分析, 基因调控网络分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9686 | 2025-10-07 |
Erythroblastic island: the niche for erythroid terminal differentiation and beyond
2025-Jun, Blood science (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/BS9.0000000000000228
PMID:40129604
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综述 | 本文总结了红系造血岛作为红细胞终末分化微环境的最新研究进展,并探讨其潜在的免疫功能和异质性特征 | 挑战了红系造血岛仅支持红细胞分化的传统观点,发现促红细胞生成素受体可作为其巨噬细胞新标志物,并首次确认中性粒细胞为红系造血岛的新细胞组分 | 尚未明确免疫倾向性幼红细胞是否及如何在红系造血岛中成熟 | 探讨红系造血岛的细胞组成异质性和潜在免疫功能 | 红系造血岛及其包含的巨噬细胞、幼红细胞和中性粒细胞等细胞组分 | NA | NA | 谱系追踪小鼠模型、成像流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9687 | 2025-10-07 |
Inhibition of stromal MAOA leading activation of WNT5A enhance prostate cancer immunotherapy by involving the transition of cancer-associated fibroblasts
2025-Mar-22, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010555
PMID:40121032
|
研究论文 | 本研究揭示了基质细胞中MAOA通过WNT5A调控前列腺癌免疫微环境的新机制 | 首次发现抑制基质MAOA可通过WNT5A激活CD8+ T细胞,并与免疫检查点抑制剂产生协同抗肿瘤效应 | MAOA与肿瘤免疫微环境相互作用的详细机制尚未完全阐明 | 探究基质MAOA在前列腺癌免疫治疗中的作用机制 | 前列腺癌基质细胞、CD8+ T细胞、小鼠肿瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 前列腺癌 | 单细胞测序、体外共培养、小鼠移植瘤模型 | NA | 单细胞测序数据、体外实验数据、体内实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9688 | 2025-10-07 |
Mapping Gene Expression in Whole Larval Brains of Bicyclus anynana Butterflies
2025-Mar-13, Methods and protocols
IF:2.3Q3
DOI:10.3390/mps8020031
PMID:40126249
|
研究论文 | 本研究优化了HCR v3.0方案,实现了非洲蝴蝶幼虫全脑组织中十个基因表达域的单细胞分辨率空间定位 | 首次在蝴蝶幼虫全脑组织中应用HCR v3.0技术,实现了多基因表达的空间可视化 | 仅针对固定脑组织进行基因表达定位,未涉及动态行为过程中的实时变化 | 探索蝴蝶幼虫大脑在分子水平上的基因表达空间分布模式 | 非洲蝴蝶(Bicyclus anynana)幼虫的完整脑组织 | 空间转录组学 | NA | 杂交链式反应3.0(HCR v3.0) | NA | RNA分子空间表达图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 优化了聚丙烯酰胺凝胶包埋、固定和样品透化步骤的HCR v3.0方案 |
| 9689 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomic Approaches for Decoding Non-Coding RNA Mechanisms in Colorectal Cancer
2025-Mar-10, Non-coding RNA
IF:3.6Q2
DOI:10.3390/ncrna11020024
PMID:40126348
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组学方法在结直肠癌非编码RNA研究中的应用与进展 | 聚焦单细胞水平揭示非编码RNA异质性,整合生物信息学方法与实验验证 | 作为综述文章,不包含原始实验数据验证 | 探讨单细胞生物信息学方法在结直肠癌非编码RNA研究中的应用 | 结直肠癌中的非编码RNA | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | scRNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9690 | 2025-10-07 |
Identifying gene expression and cellular pathways involved in glomerular AL-amyloidosis and correlation with experimental data: seeking novel therapeutic interventions
2025-Mar-04, Ultrastructural pathology
IF:1.1Q4
DOI:10.1080/01913123.2025.2468708
PMID:39985165
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析肾小球淀粉样变性中系膜细胞的基因表达和细胞通路变化 | 首次在人类肾小球中揭示淀粉样轻链与系膜细胞相互作用过程中的基因表达谱和激活的细胞通路 | 样本量较小(仅5例肾活检样本),需要更大规模研究验证 | 寻找肾小球AL-淀粉样变性的新型治疗干预靶点 | 肾小球淀粉样变性患者的肾活检组织中的系膜细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 5例不同阶段肾小球淀粉样变性活检样本与正常对照 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 9691 | 2025-10-07 |
Esr1-Dependent Signaling and Transcriptional Maturation in the Medial Preoptic Area of the Hypothalamus Shapes the Development of Mating Behavior during Adolescence
2025-Feb-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.26.640339
PMID:40060480
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探索了下丘脑内侧视前区在青春期发育过程中对交配行为形成的分子机制 | 首次揭示Esr1在MPOA区GABA能神经元转录成熟过程中的关键作用,并发现其调控性别特异性基因调控网络 | 研究仅限于小鼠模型,未涉及其他物种验证 | 探究青春期神经系统发育过程中激素信号调控交配行为形成的分子机制 | 青春期发育过程中的雄性和雌性小鼠 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序,原位杂交 | NA | 基因表达数据,行为数据 | 青春期发育不同阶段的雄性和雌性小鼠 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 9692 | 2025-10-07 |
CD271 regulates osteogenic differentiation of ectomesenchymal stem cells via the RhoA/ROCK signaling pathway
2025-Feb-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114068
PMID:39826451
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研究论文 | 本研究探讨了CD271通过RhoA/ROCK信号通路调控外间充质干细胞成骨分化的机制 | 首次揭示CD271通过调控RhoA/ROCK信号通路影响外间充质干细胞的成骨分化过程 | NA | 研究CD271对外间充质干细胞成骨分化的影响及其分子机制 | 外间充质干细胞(EMSCs)和CD271缺陷小鼠 | 干细胞生物学 | 颌骨发育异常 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | CD271缺陷小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9693 | 2024-11-07 |
Metabolic reprogramming landscape of pan-cancer by single-cell transcriptome data integration
2025-Mar-30, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2024.10.026
PMID:39500689
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9694 | 2025-10-07 |
Checkpoint kinase 1 in colorectal cancer: Upregulation of expression and promotion of cell proliferation
2025-Mar-24, World journal of clinical oncology
IF:2.6Q3
DOI:10.5306/wjco.v16.i3.101725
PMID:40130044
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研究论文 | 本研究探讨了检查点激酶1在结直肠癌中的表达上调及其促进癌细胞增殖的作用 | 首次通过单细胞RNA测序结合组织芯片数据系统分析CHEK1在结直肠癌中的表达和功能,并发现硝基氯化物可作为其靶向药物 | 数据集多样性有限,需要进一步研究其具体作用机制 | 研究CHEK1在结直肠癌中的表达和功能 | 结直肠癌细胞和组织样本 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,分子对接,CRISPR基因敲除 | NA | 单细胞RNA测序数据,组织芯片数据,mRNA表达数据 | GSE144735数据集及多个公共数据库的结直肠癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9695 | 2025-10-07 |
Dissecting endothelial cell heterogeneity with new tools
2025-Mar-23, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-025-00223-3
PMID:40121354
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综述 | 本文综述了内皮细胞异质性的研究进展,重点关注单细胞RNA测序和血管类器官等新技术在揭示内皮细胞多样性中的应用 | 整合单细胞RNA测序与血管类器官等新兴技术,从表观遗传学和空间分辨率角度深入探索内皮细胞异质性 | NA | 解析内皮细胞异质性及其在器官发育和人类血管疾病中的意义 | 血管内皮细胞 | 生物医学 | 血管疾病 | 单细胞RNA测序, 高通量测序技术, 三维培养系统 | NA | 转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9696 | 2025-10-07 |
Integrating single-cell and bulk RNA sequencing data to characterize the heterogeneity of glycan-lipid metabolism polarization in hepatocellular carcinoma
2025-Mar-22, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06347-z
PMID:40121455
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据,揭示了肝细胞癌中糖代谢和脂代谢异质性亚型的特征及其临床意义 | 首次基于代谢相关通路识别出肝细胞癌的糖代谢-HCC和脂代谢-HCC两种异质性亚型,并开发了多种临床适用的分型方法 | 研究依赖于现有队列数据,需要进一步实验验证代谢亚型的生物学机制 | 表征肝细胞癌中糖代谢-脂代谢极化的异质性特征并开发临床转化策略 | 肝细胞癌患者样本 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 放射组学, 对比增强超声 | NA | RNA测序数据, 临床病理信息, 影像数据, 血清生物标志物 | 内部队列和公共HCC队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 9697 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals a new mechanism of endothelial cell heterogeneity and healing in diabetic foot ulcers
2025-Mar-22, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-025-00628-9
PMID:40121493
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示糖尿病足溃疡中内皮细胞异质性和愈合的新机制 | 发现SH3BGRL3基因在高葡萄糖条件下对内皮细胞增殖、迁移和血管生成能力的促进作用,为DFU治疗提供了新的潜在靶点 | NA | 识别与糖尿病足溃疡愈合和进展相关的关键细胞群和基因 | 糖尿病足溃疡患者的足部皮肤细胞和内皮细胞 | 数字病理学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9698 | 2025-10-07 |
Roles of TLR4 in macrophage immunity and macrophage-pulmonary vascular/lymphatic endothelial cell interactions in sepsis
2025-Mar-21, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07921-3
PMID:40119011
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研究论文 | 本研究探讨TLR4在脓毒症中调控巨噬细胞免疫代谢及其与肺血管/淋巴管内皮细胞相互作用的机制 | 首次通过单细胞RNA测序结合实验验证,揭示TLR4通过调控巨噬细胞胆固醇外流和糖酵解影响M2极化,并阐明其在免疫介导和直接内皮反应中的双重作用机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证;TLR4在多细胞群体中的具体靶向策略尚未明确 | 深入探索TLR4在脓毒症中调控巨噬细胞免疫代谢及其与肺内皮细胞相互作用的机制 | TLR4基因敲除小鼠的巨噬细胞、肺血管内皮细胞和淋巴管内皮细胞 | 免疫学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序,基因敲除技术 | NA | 基因表达数据 | TLR4基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9699 | 2025-10-07 |
B cells and energy metabolism in HER2-positive DCIS: insights into breast cancer progression from spatial-omics analyses
2025-Mar-21, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-025-01990-2
PMID:40119362
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研究论文 | 通过空间转录组学分析研究HER2阳性DCIS中B细胞与能量代谢在乳腺癌进展中的作用 | 首次发现HER2阳性DCIS中B细胞丰度与癌细胞能量代谢基因表达呈正相关,揭示B细胞可能通过代谢途径抑制癌症进展 | 样本量有限,主要关注HER2阳性亚型,机制研究仍需进一步验证 | 探究HER2阳性乳腺导管原位癌向浸润性乳腺癌转变的机制 | HER2阳性DCIS和伴随DCIS的浸润性乳腺肿瘤 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 9700 | 2025-10-07 |
TM4SF1 overexpression in tumor-associated endothelial cells promotes microvascular invasion in hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1526177
PMID:40123905
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现肿瘤相关内皮细胞中TM4SF1过表达通过影响上皮-间质转化促进肝细胞癌微血管侵袭 | 首次在单细胞水平揭示TM4SF1在肿瘤相关内皮细胞中的表达与肝细胞癌微血管侵袭的关联机制 | 样本量较小(初始3例MVI和2例非MVI患者),需要更大规模验证 | 探究肿瘤相关内皮细胞在肝细胞癌微血管侵袭中的作用机制 | 肝细胞癌患者的肿瘤相关内皮细胞 | 单细胞生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 生物信息学分析 | Seurat, monocle2 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 病理标本 | 初始5例患者(3例MVI+2例非MVI),另加5个空间转录组数据集和4例术后病理标本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |