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当前共找到 10543 篇文献，本页显示第 941 - 960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 941 | 2026-04-25 |
Optical phenotyping using label-free microscopy and deep learning
2025-Jul, Biophotonics discovery
DOI:10.1117/1.BIOS.2.3.035001
PMID:42028248
|
研究论文 | 利用无标记显微镜和深度学习对胰腺癌样本进行光学表型分析 | 结合无标记多光子显微镜、空间转录组学和深度学习，提出一种非破坏性的光学表型分析方法 | 研究仅基于胰腺癌样本，未评估其他组织类型；准确性仍有提升空间，可能需要整合更多基因表达数据或互补成像模态 | 开发光学表型分析新方法以区分胰腺癌样本的结构和功能特征 | 胰腺癌标本 | 计算机视觉 | 胰腺癌 | 空间转录组学、无标记多光子显微镜 | 深度学习分类模型（具体类型未提及） | 图像、基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 942 | 2026-04-25 |
Single-cell profiling in ovarian germ cell and sex cord-stromal tumours
2025-Jun, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03012-6
PMID:40269311
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序绘制卵巢生殖细胞肿瘤和性索间质肿瘤的微环境图谱 | 首次对罕见卵巢生殖细胞肿瘤和性索间质肿瘤进行单细胞水平免疫和基质景观描绘 | 样本量有限，新鲜肿瘤样本仅来自12例，且部分肿瘤类型仅有单一样本 | 探索罕见卵巢生殖细胞肿瘤和性索间质肿瘤的免疫和基质微环境 | 66,919个细胞来自12个新鲜肿瘤样本，包括7例成人颗粒细胞瘤、1例幼年颗粒细胞瘤、1例支持-间质细胞瘤、2例未成熟畸胎瘤和1例无性细胞瘤 | 数字病理 | 卵巢生殖细胞肿瘤和性索间质肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 12个新鲜肿瘤样本，共66,919个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 943 | 2026-04-25 |
Spatiotemporal transcriptomics reveals key gene regulation for grain yield and quality in wheat
2025-Apr-11, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03569-8
PMID:40217326
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研究论文 | 通过空间转录组学揭示了小麦籽粒产量和品质的关键基因调控 | 首次对小麦籽粒早期发育阶段进行空间转录组分析，鉴定了10种细胞类型及192个标记基因，并识别了负调控胚胎和籽粒大小的转录因子TaABI3-B1 | NA | 理解小麦籽粒发育的时空转录调控，为改良小麦产量和品质提供遗传资源 | 小麦籽粒，授粉后4至12天 | 转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 多个时间点（授粉后4至12天）的小麦籽粒样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 944 | 2026-04-25 |
Male preference for TERT alterations and HBV integration in young-age HBV-related HCC: implications for sex disparity
2025-Apr, Clinical and molecular hepatology
IF:14.0Q1
DOI:10.3350/cmh.2024.0545
PMID:39743888
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research paper | 本研究探讨了端粒酶逆转录酶遗传改变和乙肝病毒整合在年轻男性乙肝相关肝细胞癌中的优势，並揭示了其对性别差异的影响 | 首次揭示了年轻男性中TERT遗传改变和HBV整合在TERT位点的显著富集与性别差异的关联，并通过单细胞RNA测序数据加以验证 | NA | 探究端粒酶逆转录酶遗传改变和乙肝病毒整合在乙肝相关肝细胞癌性别差异中的作用 | 310例乙肝相关肝细胞癌组织样本及其性别和年龄分层的TERT启动子突变和HBV整合谱 | machine learning | liver cancer | 单细胞RNA测序 | NA | 基因测序数据 | 310例乙肝相关肝细胞癌组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 945 | 2026-04-25 |
A single-cell atlas of circulating immune cells over the first 2 months of age in extremely premature infants
2025-Mar-05, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adr0942
PMID:40043141
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研究论文 | 对极早产儿出生后2个月内循环免疫细胞进行纵向多组学单细胞图谱分析 | 首次利用微量全血（250微升）对极早产儿进行纵向多组学分析，揭示其外周免疫发育轨迹与足月儿的差异，并发现早期持续激活的免疫特征 | 样本量较小（10名极早产儿），且未明确说明样本选择偏差或结果普适性 | 描述极早产儿出生后2个月内外周免疫细胞的发育轨迹 | 10名极早产儿（孕周小于30周）的外周血免疫细胞，以及健康成人和早产/足月脐带血样本 | 数字病理学 | 早产儿相关疾病 | 单细胞RNA测序、T细胞和B细胞受体测序、磷蛋白质谱流式细胞术 | NA | 单细胞转录组、免疫受体序列、蛋白质组学数据 | 10名极早产儿（1周、1个月、2个月共30个时间点样本），健康成人和早产/足月脐带血样本若干 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞免疫受体测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'转录组和免疫受体测序，磷蛋白质谱流式细胞术 |
| 946 | 2026-04-25 |
Integrating spatial transcriptomics and single-nucleus RNA-seq revealed the specific inhibitory effects of TGF-β on intramuscular fat deposition
2025-03, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2696-5
PMID:39422812
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研究论文 | 通过整合空间转录组和单核RNA测序，揭示TGF-β对肌内脂肪沉积的特异性抑制作用 | 首次结合空间转录组与单核RNA-seq技术，揭示TGF-β信号通路在不同脂肪含量猪肌内脂肪中的空间异质性及其对脂肪沉积的抑制作用，并发现肥胖小鼠中TGF-β抑制可加速肌肉修复 | 体外实验仅使用猪内皮细胞模拟高脂环境，且体内实验局限于小鼠模型，需进一步验证在人类中的适用性 | 研究TGF-β信号通路对肌内脂肪沉积的调控机制，探索其对肌肉萎缩和修复的潜在治疗靶点 | 猪背最长肌组织（不同肌内脂肪含量）、肥胖小鼠肌肉损伤模型 | 数字病理学 | 肌营养不良、肥胖相关肌肉萎缩 | 空间转录组学、单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据、单核RNA-seq数据 | 不同肌内脂肪含量的猪背最长肌样本（具体数量未说明）、肥胖小鼠样本（具体数量未说明） | NA | 空间转录组学、单核RNA测序 | NA | NA |
| 947 | 2026-04-25 |
Inhibiting mechanotransduction prevents scarring and yields regeneration in a large animal model
2025-Feb-19, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adt6387
PMID:39970235
|
研究论文 | 通过抑制机械传导（YAP）防止大型动物模型瘢痕形成并促进伤口再生 | 首次在红杜洛克猪（最接近人类瘢痕模型）中证明单次使用YAP抑制剂维替泊芬即可防止瘢痕形成并驱动伤口再生，并结合单细胞RNA测序和空间蛋白质组学分析揭示了成纤维细胞动态变化及YAP/IL-33信号轴的作用 | 未提及具体局限性 | 阐明YAP抑制在大型动物伤口再生中的作用机制，为临床转化预防人类皮肤瘢痕提供依据 | 红杜洛克猪伤口模型及人类新生儿包皮异种移植伤口模型 | 数字病理学 | 皮肤瘢痕 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间蛋白质组学分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质空间分布数据 | 未具体说明样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间蛋白质组学 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 948 | 2026-04-25 |
Transcriptional determinants of goal-directed learning and representational drift in the parahippocampal cortex
2025-01-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.115175
PMID:39792551
|
研究论文 | 本文通过双光子钙成像与空间转录组学技术，揭示了内嗅皮层中目标导向学习的转录决定因素及表征漂移机制 | 首次结合空间转录组学和钙成像技术，识别出即刻早期基因定义的神经元网络，并发现脑源性神经营养因子缺失会破坏该网络及学习能力 | 未说明 | 解析内嗅皮层中表征漂移的分子机制及其在目标导向学习中的作用 | 小鼠内嗅皮层神经元 | 神经科学 | NA | 双光子钙成像, 空间转录组学 | NA | 钙成像图像, 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 双光子成像 | NA | NA |
| 949 | 2026-04-25 |
Dissecting the cell microenvironment of ovarian endometrioma through single-cell RNA sequencing
2025-01, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2638-9
PMID:39470923
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序解析卵巢子宫内膜瘤的细胞微环境 | 首次利用单细胞转录组学揭示卵巢子宫内膜瘤中IGFBP5巨噬细胞激活、NK细胞耗竭及IQCG和KLF2上皮异常增殖等关键细胞和分子特征 | 样本量有限且仅聚焦于组织水平，可能未完全反映疾病进展中的动态变化 | 阐明卵巢子宫内膜瘤的分子和细胞机制，以改善诊断和治疗策略 | 卵巢子宫内膜瘤患者和健康捐赠者的子宫内膜组织细胞 | 单细胞转录组学 | 卵巢子宫内膜瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过52,000个来自卵巢子宫内膜瘤患者和健康捐赠者的单个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 950 | 2026-04-25 |
Resolving the developmental mechanisms of cardiac microthrombosis of SARS-CoV-2 based on single-cell transcriptome analysis
2025-01, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-023-2624-9
PMID:39470924
|
研究论文 | 利用单细胞转录组分析解析SARS-CoV-2引发心脏微血栓的发育机制 | 首次通过单细胞测序分析揭示了SARS-CoV-2感染后心脏微血栓形成的关键细胞类型（MYO1ERASGEF1B单核来源巨噬细胞）及其通过激活趋化因子CCL3和CCL5启动外源性凝血通路的机制，并发现铁含量升高、氧化应激和代谢改变在其中的作用 | 样本来源仅限于死亡患者，可能无法完全代表整体病程；缺乏对活体患者动态变化的验证 | 阐明SARS-CoV-2感染引起心脏微血栓的细胞和分子机制 | 健康捐赠者、COVID-19伴凝血异常高凝期死亡患者和纤溶期死亡患者的右心室游离壁组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 61,187个细胞，来自24种免疫细胞亚群和13种心脏驻留细胞亚群 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 951 | 2026-04-25 |
Lung macrophages in pulmonary homeostasis and disease: from basic biology to clinical applications
2025, Central-European journal of immunology
DOI:10.5114/ceji.2025.154651
PMID:42028388
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综述 | 总结了肺巨噬细胞在肺部稳态和疾病中的基本生物学功能及其作用机制 | 通过单细胞转录组学、CRISPR基因编辑和蛋白质组学等先进技术，系统揭示了肺巨噬细胞的异质性、发育起源和功能景观 | 该领域仍面临挑战，未来研究需要跨学科努力以阐明巨噬细胞在疾病中的分子机制 | 探讨肺巨噬细胞在肺部疾病中的作用机制及临床应用的潜在治疗靶点 | 肺巨噬细胞 | machine learning | lung cancer, acute respiratory distress syndrome, asthma, chronic obstructive pulmonary disease, influenza, tuberculosis | 单细胞转录组学、CRISPR基因编辑、蛋白质组学 | NA | NA | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 952 | 2026-04-24 |
Unraveling the developmental heterogeneity of human retinal ganglion cells within the developing retina to study to the continuity of maturation
2025-Dec, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2025.08.025
PMID:40912448
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术解析人类胎儿视网膜发育过程中视网膜神经节细胞的成熟异质性，并构建连续成熟轨迹 | 首次提出视网膜神经节细胞成熟是一个连续非离散过程，通过伪时间分析构建统一的成熟轨迹，并鉴定出驱动成熟的新基因及细胞内外特征 | 未提及 | 揭示人类视网膜发育过程中视网膜神经节细胞的成熟异质性和连续性 | 人类胎儿视网膜从第8周到第27周的视网膜神经节细胞 | 单细胞组学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析模型 | 单细胞转录组数据 | 人类胎儿视网膜样本，覆盖第8周到第27周 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 953 | 2026-04-24 |
Antibiotic treatment limits survival of peripheral and bone marrow B-cell populations
2025-Oct-14, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2024013694
PMID:40668665
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研究论文 | 本研究评估了抗生素暴露小鼠模型中的骨髓造血区室，发现抗生素处理导致骨髓B细胞在所有发育阶段显著耗竭 | 首次通过单细胞RNA测序揭示抗生素处理导致骨髓B细胞在所有发育阶段显著耗竭，并发现该耗竭与MYC生存信号下调相关，而非依赖于干扰素信号 | 粪便菌群移植未能有效恢复外周或骨髓B细胞群体，提示抗生素的细胞毒性效应和菌群耗竭共同作用 | 探究抗生素处理对骨髓造血区室和B细胞发育的影响及其机制 | 抗生素处理小鼠模型中的骨髓B细胞和外周B细胞群体 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞基因表达数据 | 抗生素处理小鼠模型，具体样本数量未在摘要中说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA测序 |
| 954 | 2026-04-24 |
The kinase ERK plays a conserved dominant role in the heterogeneity of epithelial-mesenchymal transition in pancreatic cancer cells
2025-Aug-12, Science signaling
IF:6.7Q1
DOI:10.1126/scisignal.ads7002
PMID:40794842
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研究论文 | 本研究结合迭代间接免疫荧光成像和互信息分析，揭示了ERK激酶在胰腺癌细胞上皮-间充质转化异质性中的主导作用 | 通过单细胞水平的信号蛋白测量，发现ERK活性变异驱动EMT异质性，且MEK抑制时JNK可代偿，群体水平模型无法捕捉这些关系 | 未提及具体局限性 | 在信号蛋白水平理解胰腺癌细胞EMT异质性的分子机制 | 胰腺癌细胞及肿瘤 | 计算机视觉 | 胰腺癌 | 迭代间接免疫荧光成像 | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 955 | 2026-04-24 |
Spatial transcriptomics reveals human cortical layer and area specification
2025-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09010-1
PMID:40369074
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研究论文 | 使用MERFISH技术与深度学习核分割方法，对人类胎儿皮层的单细胞空间发育进行详细解析，涵盖18百万个单细胞和8个皮层区域在7个发育时间点的数据 | 首次揭示了人类胎儿皮层六层结构在细胞构筑层出现前3个月就已通过兴奋性神经元亚型分层确立，并发现视觉皮层V1与V2区域间存在明显的二元边界，挑战了中期妊娠皮层区域化仅具有梯度过渡的传统观点 | 未明确提及，但可能受限于样本来源（胎儿组织）和MERFISH技术的检测通量，以及深度学习方法对细胞核分割的依赖 | 通过空间转录组学解析人类皮层发育过程中层和区域分子特化的机制 | 人类胎儿皮层组织 | 数字病理学 | NA | MERFISH, 单细胞RNA测序 | 深度学习（用于核分割） | 图像, 转录组数据 | 超过1800万个单细胞，涵盖8个皮层区域，7个发育时间点（未注明具体胎儿样本数） | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | MERFISH | 多重错误容忍荧光原位杂交技术结合深度学习核分割 |
| 956 | 2026-04-24 |
Single-cell transcriptomics of ventral forebrain progenitors identifies Evf2 enhancer lncRNA-enhancer gene guidance through direct RNA binding and RNP recruitment domains
2025-Jul-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62205-y
PMID:40715144
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研究论文 | 通过单细胞转录组学研究Evf2增强子lncRNA在小鼠胚胎腹侧前脑祖细胞中通过直接RNA结合和RNP招募域引导增强子与基因互作的机制 | 首次利用单细胞转录组学揭示Evf2-Dlx5/6UCE与基因引导和转录调控之间比先前报道更显著的一致性，并发现Evf2将染色体6划分为短程激活基因和长程/超长程抑制基因，以及RNP招募的组合调控机制 | 未明确提及 | 阐明Evf2超保守增强子lncRNA在脑发育过程中通过直接RNA结合和RNP招募域引导增强子与基因互作的分子机制 | 小鼠胚胎腹侧前脑祖细胞中的Evf2 lncRNA、Dlx5/6UCE及其调控的基因 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 小鼠胚胎腹侧前脑的单个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 957 | 2026-04-24 |
Artifacts in spatial transcriptomics data: their detection, importance, prevalence, and prevention
2025-Jul-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf306
PMID:40748322
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研究论文 | 开发了一种名为BLADE的自动化跨平台统计方法，用于检测和去除空间转录组学数据中的三种人工制品 | 首次提出了一套跨平台的自动化统计方法，专门检测和纠正空间转录组数据中的边界、组织边缘和位置批次故障三类人工制品 | 人工制品检测方法对于空间转录组学质量控制至关重要，但未具体说明局限性 | 检测和去除空间转录组数据中的人工制品，提高数据分析准确性 | 人类和小鼠的肝脏及脂肪组织样本 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 37个10x Visium样本（来自人类和小鼠的肝脏及脂肪组织） | 10x Genomics, Nanostring | 空间转录组学, 空间转录组学 | 10x Visium, CosMx | 10x Visium空间转录组平台, CosMx空间分子成像平台 |
| 958 | 2026-04-24 |
Technologies for Decoding Cancer Metabolism with Spatial Resolution
2025-Jul-01, Cold Spring Harbor perspectives in medicine
IF:7.8Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a041553
PMID:39284668
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综述 | 本文讨论了三种新兴的代谢组学技术：空间代谢组学、单细胞代谢组学和细胞器代谢组学，及其在解码癌症代谢空间分辨率中的应用 | 系统性地阐述了空间代谢组学、单细胞代谢组学和细胞器代谢组学这三种新兴技术，并探讨了它们与单细胞转录组学和蛋白质组学等传统方法结合使用将如何推动癌症研究的新发现和新问题 | 未具体说明各技术的局限性，仅作为概述性综述 | 讨论新兴代谢组学技术在解码癌症代谢空间分辨率方面的进展和应用前景 | 癌症细胞代谢途径、代谢物谱、空间代谢组学、单细胞代谢组学、细胞器代谢组学 | 数字病理学 | 癌症 | 质谱法 | NA | 代谢物数据 | NA | NA | 空间代谢组学, 单细胞代谢组学, 单细胞转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 959 | 2026-04-24 |
Mechanisms of hematopoietic clonal dominance in VEXAS syndrome
2025-Jun, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-025-03623-9
PMID:40195449
|
研究论文 | 本研究通过免疫表型分析和单细胞转录组学，揭示了VEXAS综合征中造血克隆优势的机制，并开发了人类化疾病模型 | 首次揭示UBA1突变造血干细胞的衰老样程序在炎症微环境中获得优势的克隆竞争机制，并利用碱基编辑技术构建了首个VEXAS综合征人类化模型 | 样本量有限（仅9名男性患者），且模型仅模拟单一突变的效应 | 阐明VEXAS综合征中驱动突变造血克隆优势的致病机制 | VEXAS综合征患者和基因编辑造血干细胞移植小鼠模型 | 数字病理学 | 自身炎症性疾病（VEXAS综合征） | 单细胞RNA测序、碱基编辑 | 人类化小鼠模型 | 单细胞转录组数据、免疫表型数据 | 9名VEXAS综合征男性患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 960 | 2026-04-24 |
Broad rim lesions are a new pathological and imaging biomarker for rapid disease progression in multiple sclerosis
2025-Jun, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-025-03625-7
PMID:40301560
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研究论文 | 本研究分析了多发性硬化症尸检队列，发现了一种新的病变类型，其特征为广泛的髓样细胞边缘，并与快速疾病进展相关，同时利用PET成像验证了其作为生物标记物的潜力 | 首次发现并定义了一种新的多发性硬化症病变类型——宽边缘病变，并利用空间转录组学和PET成像证实其与快速疾病进展的关联 | 尸检队列样本量有限，且仅基于荷兰脑库的数据；PET验证研究为独立队列，但缺乏纵向动态观察 | 探索多发性硬化症快速进展的病理机制并寻找新的影像学生物标记物 | 多发性硬化症患者的脑组织尸检样本（186例）和PET影像（114例） | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 空间转录组学 | NA | 组织切片和PET影像 | 尸检队列186例，PET队列114例 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |