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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9521 | 2025-10-07 |
Construction and Validation of a T Cell Exhaustion-Related Prognostic Signature in Cholangiocarcinoma
2025, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/8823837
PMID:40226355
|
研究论文 | 本研究构建并验证了基于T细胞耗竭相关基因的胆管癌预后预测模型 | 首次在胆管癌中系统识别T细胞耗竭相关基因模块并建立四基因预后特征 | 研究基于公共数据集,需要更多独立队列验证模型的普适性 | 开发胆管癌预后预测的生物标志物 | 胆管癌患者样本和细胞 | 生物信息学 | 胆管癌 | WGCNA, LASSO Cox回归, ssGSEA, scRNA-seq, qRT-PCR, western blot | 预后特征模型 | 基因表达数据 | E-MTAB-6389数据集中的胆管癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 9522 | 2025-10-07 |
A novel tumor-associated macrophage risk signature predicts prognosis and immunotherapy response in lung adenocarcinoma
2025, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
DOI:10.62347/SQUF6988
PMID:40226479
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据,建立了一个基于肿瘤相关巨噬细胞的10基因风险特征,用于预测肺腺癌患者的预后和免疫治疗反应 | 首次系统鉴定肺腺癌中肿瘤相关巨噬细胞亚群并构建具有预后预测价值的10基因特征,该特征还能预测免疫检查点抑制剂治疗反应 | 研究基于回顾性数据,需要前瞻性临床试验进一步验证 | 建立肺腺癌预后预测模型并评估免疫治疗反应 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, Cox回归分析, LASSO回归 | 风险特征模型, 诺模图 | 基因表达数据, 临床数据 | 多个独立队列验证(包括IMvigor210和GSE78220数据集) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 9523 | 2025-10-07 |
Unveiling the power of Treg.Sig: a novel machine-learning derived signature for predicting ICI response in melanoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1508638
PMID:40226609
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于机器学习的Treg.Sig特征,用于预测黑色素瘤患者对免疫检查点抑制剂治疗的响应 | 首次通过机器学习方法构建了Treg相关特征Treg.Sig,并在黑色素瘤中验证了其预测ICI疗效的能力,优于51个已有特征 | 研究主要基于转录组数据,需要进一步临床验证 | 开发预测黑色素瘤患者对免疫检查点抑制剂治疗响应的生物标志物 | 黑色素瘤患者和黑色素瘤小鼠模型 | 机器学习 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | 机器学习 | 转录组数据 | 训练数据集和外部测试数据集(具体样本数未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 9524 | 2025-10-07 |
Identification of a novel prognostic marker ADGRG6 in pancreatic adenocarcinoma: multi-omics analysis and experimental validation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1530789
PMID:40226617
|
研究论文 | 通过多组学分析和实验验证发现ADGRG6是胰腺腺癌的新型预后标志物和治疗靶点 | 首次发现ADGRG6在胰腺腺癌中的预后价值及其通过突变p53调控肿瘤进展的新机制 | 研究主要基于公共数据库和实验模型,需要进一步临床验证 | 探索胰腺腺癌的新型预后标志物和治疗靶点 | 胰腺腺癌患者数据和细胞/动物模型 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 多组学分析,单细胞测序,免疫浸润分析,细胞实验,动物实验 | NA | 基因组数据,转录组数据,蛋白质数据 | TCGA和GEO数据库中的多个胰腺腺癌队列 | NA | 单细胞测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 9525 | 2025-10-07 |
Reevaluating the role of Pou3f1 in striatal development: Evidence from transgenic mouse models
2025-May, Brain research bulletin
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 通过转基因小鼠模型重新评估Pou3f1在纹状体发育中的作用 | 通过遗传学实验证明Pou3f1缺失不影响纹状体中间棘神经元的发育,挑战了基于人类单细胞RNA测序数据的计算预测 | 不能完全排除Pou3f1在纹状体发育其他方面的潜在作用 | 研究Pou3f1转录因子在纹状体发育中的具体功能 | 转基因小鼠模型中的纹状体中间棘神经元 | 神经发育生物学 | NA | 条件性基因敲除,单细胞RNA测序数据分析 | NA | 基因表达数据,细胞计数数据 | Pou3f1条件性敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9526 | 2025-10-07 |
Understanding the cellular and molecular heterogeneity in colorectal cancer through the use of single-cell RNA sequencing
2025-May, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102374
PMID:40163910
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术解析结直肠癌的细胞和分子异质性 | 首次在结直肠癌中系统鉴定B细胞亚型并发现C3 B细胞在免疫调控中的关键作用,构建了基于C3 B细胞标志基因的生存预测模型 | 样本量相对有限,未进行多中心验证 | 解析结直肠癌的肿瘤微环境异质性 | 结直肠癌患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 预测模型 | 单细胞转录组数据 | 51,204个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9527 | 2025-10-07 |
TriDeNT : Triple deep network training for privileged knowledge distillation in histopathology
2025-May, Medical image analysis
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.media.2025.103479
PMID:40174325
|
研究论文 | 提出一种名为TriDeNT的新型自监督方法,用于在组织病理学中利用推理时不可用的特权数据进行知识蒸馏 | 开发了TriDeNT三重深度网络训练方法,能够利用推理时不可用的特权数据(如额外免疫组化染色和空间转录组学)来提升模型性能 | 需要配对的特权数据进行训练,这些数据可能稀缺或获取成本高昂 | 提高计算病理学模型的性能,通过利用推理时不可用的特权数据 | 组织病理学数据,包括免疫组化染色、空间转录组学和专家核注释 | 数字病理学 | NA | 深度学习,知识蒸馏 | 三重深度网络 | 图像,空间转录组数据,专家注释 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 9528 | 2025-10-07 |
Discovering genetically-supported drug targets for multisite chronic pain through multi-omics Mendelian randomization and single-cell RNA-sequencing
2025-Apr-19, Neuroscience
IF:2.9Q2
|
研究论文 | 通过多组学孟德尔随机化和单细胞RNA测序发现多部位慢性疼痛的遗传支持药物靶点 | 首次结合多组学孟德尔随机化与单细胞RNA测序识别多部位慢性疼痛的药物靶点 | 研究主要基于UK Biobank的汇总数据,缺乏实验验证 | 识别多部位慢性疼痛的潜在治疗靶点 | 多部位慢性疼痛患者 | 生物信息学 | 慢性疼痛 | 多组学孟德尔随机化,单细胞RNA测序,贝叶斯共定位,蛋白互作分析 | 孟德尔随机化,贝叶斯模型 | 基因表达数据,蛋白质丰度数据,单细胞测序数据 | UK Biobank数据库样本 | NA | 单细胞RNA测序,转录组关联研究 | NA | NA |
| 9529 | 2025-10-07 |
Identification of the disulfidptosis-related key gene CD2AP as a potential biomarker and new therapeutic target for LUAD patients by comprehensive multi-omics analysis
2025-Apr-11, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02308-6
PMID:40214854
|
研究论文 | 通过多组学分析鉴定双硫死亡相关关键基因CD2AP作为肺腺癌患者的潜在生物标志物和治疗靶点 | 首次将双硫死亡机制与CD2AP基因在肺腺癌中的功能联系起来,并系统评估其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 基于公共数据库的回顾性分析,缺乏实验验证 | 探索CD2AP在肺腺癌中的功能及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 转录组学、甲基化分析、免疫浸润分析、空间转录组学 | Kaplan-Meier生存分析、富集分析 | 基因组数据、转录组数据、临床数据 | TCGA、GEO等公共数据库中的肺腺癌样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 9530 | 2025-10-07 |
Integrated single cell and bulk RNA sequencing analyses reveal the impact of tryptophan metabolism on prognosis and immunotherapy in colon cancer
2025-Apr-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-85893-4
PMID:40216815
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序分析,揭示了色氨酸代谢对结肠癌预后和免疫治疗的影响 | 首次结合单细胞和批量RNA测序系统分析色氨酸代谢在结肠癌中的作用,并构建了色氨酸代谢风险评分模型 | 研究依赖于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 分析结肠癌中色氨酸代谢特征并预测免疫治疗反应 | 结肠癌患者 | 生物信息学 | 结肠癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 随机森林算法 | 基因表达数据 | 训练队列473个肿瘤和41个正常组织,验证队列902名癌症患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 9531 | 2025-10-07 |
The crucial role of neutrophil extracellular traps and IL-17 signaling in indomethacin-induced gastric injury in mice
2025-Apr-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-95880-4
PMID:40204883
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研究论文 | 本研究探讨了中性粒细胞胞外诱捕网和IL-17信号通路在吲哚美辛诱导的小鼠胃损伤中的关键作用 | 首次通过蛋白质组学和单细胞RNA测序揭示IL-17信号通路是NETs形成的关键细胞内机制 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人体中验证 | 阐明吲哚美辛诱导胃损伤的分子机制 | 小鼠胃组织、外周血中性粒细胞、胃上皮细胞系 | 分子生物学 | 胃损伤 | 蛋白质组学分析、单细胞RNA测序、ELISA、免疫荧光、Western blot、实时PCR、透射电镜 | NA | 蛋白质组数据、单细胞转录组数据、图像数据 | 小鼠模型,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9532 | 2025-10-07 |
Identification of BHLHE40-Expressing CD4+ T Cells Producing GM-CSF in Rheumatoid Arthritis
2025-Apr, International journal of rheumatic diseases
IF:2.4Q2
DOI:10.1111/1756-185X.70219
PMID:40223427
|
研究论文 | 本研究分析了类风湿关节炎患者CD4+ T细胞中BHLHE40和CSF2基因的表达特征 | 首次在IL-1富集的炎症部位揭示了BHLHE40表达与GM-CSF产生的CD4+ T细胞在类风湿关节炎中的关联 | 研究基于已有数据库的二次分析,缺乏实验验证 | 探究BHLHE40和CSF2基因在类风湿关节炎CD4+ T细胞中的表达关系 | 类风湿关节炎患者和健康对照者的外周血和滑膜液CD4+ T细胞 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序, RNA测序, 微阵列 | NA | 基因表达数据 | 来自公共数据库的类风湿关节炎患者和健康对照者样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 微阵列 | NA | NA |
| 9533 | 2025-10-07 |
Genome-wide association meta-analysis identifies 126 novel loci for diverticular disease and implicates connective tissue and colonic motility
2025-Mar-28, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.03.27.25324777
PMID:40196262
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研究论文 | 本研究通过全基因组关联分析荟萃分析发现了126个新的憩室病相关基因位点,并揭示了该疾病与结缔组织和结肠运动功能的关联 | 发现了126个新的憩室病相关基因位点,首次通过多种分析策略系统性地将憩室病与结缔组织生物学和结肠运动功能联系起来 | NA | 识别憩室病的遗传风险因素并阐明其生物学机制 | 憩室病患者群体 | 基因组学 | 憩室病 | 全基因组关联分析, 单细胞RNA测序, 组织富集分析, 统计精细定位, 等位基因特异性表达, 蛋白数量性状位点分析 | NA | 基因组数据, 单细胞RNA测序数据, 手术标本数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 全基因组关联分析 | NA | NA |
| 9534 | 2025-10-07 |
Multi-Manifolds fusing hyperbolic graph network balanced by pareto optimization for identifying spatial domains of spatial transcriptomics
2025-Mar-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf162
PMID:40220278
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研究论文 | 提出一种融合双曲图网络的多流形方法,通过帕累托优化平衡,用于识别空间转录组学中的空间域 | 首次在空间转录组学分析中引入双曲流形,开发多流形编码器和基于注意力机制的融合方法,使用帕累托优化平衡多重重建损失 | 未在摘要中明确说明 | 识别空间转录组学中的空间域,以深入了解基因表达的发病机制 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 图神经网络,双曲神经网络,注意力机制,帕累托优化 | 双曲图网络,多流形编码器 | 空间转录组数据 | 常用基准数据集(未指定具体数量) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 9535 | 2025-10-07 |
Cohesin rad21 mutation dysregulates erythropoiesis and granulopoiesis output within the whole kidney marrow of adult zebrafish
2025-Jan-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00657.2024
PMID:39548947
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了cohesin亚基rad21突变对成年斑马鱼肾脏骨髓中红细胞生成和粒细胞生成的调控作用 | 首次在成年斑马鱼模型中系统研究cohesin亚基rad21杂合突变对造血过程的特异性影响 | 未观察到明显的造血细胞形态学异常,突变的具体分子机制仍需进一步研究 | 探究cohesin突变对造血过程的影响机制 | 携带rad21杂合突变的成年斑马鱼 | 单细胞测序分析 | 血液系统恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 斑马鱼疾病模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9536 | 2025-10-07 |
Glomerular mesangial cells derived complement factor H regulates complement activation, influences cell proliferation, and maintains actin cytoskeleton
2025-May-08, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114544
PMID:40157080
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研究论文 | 本研究探讨肾小球系膜细胞来源的补体因子H在补体激活调控、细胞增殖和细胞骨架维持中的功能 | 首次发现肾小球系膜细胞来源的CFH不仅具有经典的补体调控功能,还能通过调控KLF4/p21信号通路和Cdc42表达影响细胞增殖和细胞骨架 | 研究主要基于体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证;外源性补充CFH未能重现内源性CFH的非经典功能 | 探究肾小球系膜细胞来源的补体因子H的多重生物学功能 | 原代人肾小球系膜细胞(pHGMCs) | 细胞生物学 | IgA肾病 | 单细胞测序, 基因沉默, 基因过表达 | 细胞模型 | 基因表达数据, 蛋白沉积数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9537 | 2025-10-07 |
Pan-HDAC inhibitor LAQ824 inhibits the progression of pancreatic ductal adenocarcinoma and suppresses immune escape by promoting antigen presentation
2025-May-08, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114528
PMID:40158429
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研究论文 | 本研究探讨了泛HDAC抑制剂LAQ824在胰腺导管腺癌中的抗肿瘤作用及其通过促进抗原呈递抑制免疫逃逸的机制 | 首次揭示LAQ824通过增强染色质可及性上调MHC-I表达,促进抗原呈递和CD8 T细胞成熟,连接表观遗传调控与免疫原性 | 仅使用小鼠皮下肿瘤模型,尚未在临床患者中验证 | 评估LAQ824对胰腺导管腺癌的治疗潜力及其调节免疫逃逸机制的作用 | 胰腺导管腺癌细胞和小鼠模型 | 癌症研究 | 胰腺癌 | 免疫组化、流式细胞术、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | C57BL/6J小鼠皮下肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9538 | 2025-10-07 |
The characterization and validation of regulated cell death-related genes in chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2025-May-08, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114509
PMID:40158428
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研究论文 | 本研究系统分析了调控性细胞死亡相关基因在慢性鼻窦炎伴鼻息肉中的特征和功能 | 首次在CRSwNP中构建了细胞死亡指数(CDI),并揭示了8种RCD亚型的特异性激活模式 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据,需要更多实验验证 | 探讨调控性细胞死亡机制在CRSwNP发病和进展中的作用 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者组织样本 | 生物信息学 | 慢性鼻窦炎 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, qRT-PCR | LASSO回归, WGCNA, GSVA | 基因表达数据 | 多个GEO数据集(GSE136825等)和临床组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 9539 | 2025-10-07 |
Targeting inflammation and necroptosis in diabetic kidney disease: A novel approach via PPARα modulation
2025-May-08, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114562
PMID:40174339
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研究论文 | 本研究通过调控PPARα探索了其在糖尿病肾病中抑制炎症和坏死性凋亡的保护机制 | 首次揭示PPARα通过抑制RIP1/RIP3/MLKL介导的坏死性凋亡和NF-κB信号通路来延缓糖尿病肾病进展 | PPARα在糖尿病肾病中的具体下游靶点和完整信号网络仍需进一步阐明 | 阐明PPARα在糖尿病肾病中的保护作用机制 | 糖尿病肾病小鼠模型和肾小管上皮细胞 | 生物医学研究 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序, RNA测序, 病毒载体转染 | 动物疾病模型 | 基因表达数据 | 糖尿病肾病小鼠模型和对照组的肾脏组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 9540 | 2025-10-07 |
Leveraging machine learning for integrative analysis of T-cell receptor repertoires in colorectal cancer: Insights into MAIT cell dynamics and risk assessment
2025-May, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102358
PMID:40088748
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研究论文 | 通过机器学习整合分析结直肠癌患者T细胞受体库,揭示MAIT细胞动态与风险评估 | 发现跨不同数据集的共享TCR序列,识别MAIT细胞在转移和非转移患者中的升高现象,并验证TCR序列作为疾病结局生物标志物的潜力 | 样本量有限,单细胞数据集仅包含22例患者,且TCR序列重叠概率较低 | 研究结直肠癌中T细胞受体库的特征及其与疾病风险的关联 | 结直肠癌患者 | 机器学习 | 结直肠癌 | bulk测序, 单细胞测序 | 机器学习 | 序列数据 | 205例bulk测序患者 + 22例单细胞测序患者 | NA | 单细胞测序, bulk测序 | NA | NA |