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当前共找到 10543 篇文献，本页显示第 9521 - 9540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9521 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing advances in revealing the development and progression of MASH: the identifications and interactions of non-parenchymal cells
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1513993
PMID:40201243
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在揭示代谢相关脂肪性肝炎中非实质细胞发育和进展方面的应用 | 系统总结了单细胞转录组测序技术对MASH中非实质细胞异质性和细胞相互作用的最新发现 | 作为综述文章，主要基于已有研究进行总结，未提供原始实验数据 | 探讨单细胞RNA测序技术在MASH研究中的应用，理解非实质细胞在疾病中的作用机制 | 肝脏非实质细胞（包括Kupffer细胞、肝星状细胞和肝窦内皮细胞） | 数字病理学 | 代谢相关脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9522 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing and spatial transcriptomics reveal the evolution of glucose metabolism in hepatocellular carcinoma and identify G6PD as a potential therapeutic target
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1553722
PMID:40201344
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和空间转录组学揭示肝细胞癌中葡萄糖代谢的时空演化特征，并验证G6PD作为潜在治疗靶点 | 首次从时空维度解析肝细胞癌葡萄糖代谢演化规律，发现G6PD通过谷胱甘肽代谢和ROS产生调控肿瘤进展 | 样本量有限（7例单细胞测序样本，4例空间转录组样本），需更大规模验证 | 探索肝细胞癌中葡萄糖代谢的时空演化特征并寻找治疗靶点 | 肝细胞癌组织及癌旁组织 | 空间转录组学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序, 空间转录组学, 高通量测序, 伤口愈合实验, CCK-8实验, transwell实验 | 伪时间分析, Cox回归分析 | 单细胞测序数据, 空间转录组数据 | 7例HCC及癌旁组织（单细胞测序），4例HCC组织（空间转录组） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 9523 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing reveals the role of aggrephagy-related patterns in tumor microenvironment, prognosis and immunotherapy in endometrial cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1560625
PMID:40201347
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研究论文 | 通过单细胞测序技术研究聚集性自噬相关模式在子宫内膜癌肿瘤微环境、预后和免疫治疗中的作用 | 首次在子宫内膜癌中系统分析聚集性自噬相关基因在肿瘤微环境中的作用，并发现TUBA1A+巨噬细胞亚型与良好预后的关联 | 样本量相对有限（5个肿瘤样本），需要更大规模研究验证 | 阐明聚集性自噬在子宫内膜癌肿瘤微环境中的功能及其对预后和免疫治疗的影响 | 子宫内膜癌患者肿瘤样本中的单细胞 | 单细胞测序分析 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学染色 | 非负矩阵分解算法，CellChat分析 | 单细胞RNA测序数据，批量RNA测序数据 | 5个子宫内膜癌肿瘤样本中的36,227个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 9524 | 2025-10-07 |
Comprehensive Analyses of Single-Cell and Bulk RNA Sequencing Data From M2 Macrophages to Elucidate the Immune Prognostic Signature in Patients with Gastric Cancer Peritoneal Metastasis
2025, ImmunoTargets and therapy
IF:6.2Q1
DOI:10.2147/ITT.S506143
PMID:40201390
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研究论文 | 基于单细胞和批量RNA测序数据构建M2巨噬细胞相关基因的预后风险模型，用于预测胃癌腹膜转移患者的预后和免疫治疗反应 | 首次结合单细胞RNA测序和加权基因共表达网络分析识别M2巨噬细胞相关基因，构建了针对胃癌腹膜转移的预后预测模型 | 模型验证主要依赖公共数据库数据，需要进一步的前瞻性临床验证 | 构建能够有效预测胃癌腹膜转移患者预后和免疫治疗反应的生物标志物模型 | 胃癌腹膜转移患者 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, WGCNA, LASSO分析 | 预后风险模型 | 基因表达数据 | TCGA、GSE62254和IMvigor210等多个队列数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 9525 | 2025-04-10 |
FoxO1 mediates odontoblast differentiation of hDPSCs via B cell-derived ANGPTL1 in dental caries: A laboratory investigation
2025-May, International endodontic journal
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/iej.14206
PMID:39904951
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research paper | 本研究探讨了B细胞及其分泌因子ANGPTL1在龋齿条件下促进人牙髓干细胞(hDPSCs)向成牙本质细胞分化的作用，重点关注FoxO1的激活 | 揭示了B细胞分泌的ANGPTL1通过上调FoxO1促进hDPSCs向成牙本质细胞分化的新机制 | 研究主要基于实验室数据，尚未进行临床验证 | 探索龋齿环境下牙髓修复和再生的分子机制 | 人牙髓干细胞(hDPSCs)和B细胞 | dental research | dental caries | scRNA-Seq, ELISA, 免疫荧光染色, 双荧光素酶报告基因检测, 染色质免疫沉淀 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9526 | 2025-04-10 |
ROICellTrack: A deep learning framework for integrating cellular imaging modalities in subcellular spatial transcriptomic profiling of tumor tissues
2025-Apr-08, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf152
PMID:40199763
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研究论文 | 开发了一个名为ROICellTrack的深度学习框架，用于更好地整合细胞成像与空间转录组分析 | 提出了一种新的深度学习框架，将细胞成像与空间转录组分析相结合，以分析肿瘤异质性 | 研究样本量较小，仅分析了56个ROI | 提高对肿瘤异质性的理解，以支持个性化和靶向治疗 | 膀胱尿路上皮癌（UCB）和上尿路尿路上皮癌（UTUC）的肿瘤组织 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 空间转录组技术（如GeoMx Digital Spatial Profiler） | 深度学习 | 图像和转录组数据 | 56个ROI | NA | NA | NA | NA |
| 9527 | 2025-10-07 |
Exploring and validating the marmoset as a primate model for chromosomal instability in early development
2025-Apr-07, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaaf012
PMID:40193493
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研究论文 | 本研究验证了狨猴作为研究灵长类早期发育中染色体不稳定性的合适模型 | 首次发现狨猴胚胎中存在异质性非整倍体，建立了naïve样狨猴多能干细胞系，揭示了非整倍体在囊胚发育中促进腔体形成的新作用 | 研究受限于动物模型系统，无法直接验证人类胚胎中的机制 | 探索灵长类早期发育中染色体不稳定性的调控机制 | 狨猴胚胎细胞和naïve样狨猴多能干细胞 | 发育生物学 | 胚胎发育异常 | 单细胞RNA测序，转录组分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9528 | 2025-10-07 |
Integrating microbial GWAS and single-cell transcriptomics reveals associations between host cell populations and the gut microbiome
2025-Apr-07, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-025-01978-w
PMID:40195537
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研究论文 | 开发计算框架scBPS整合微生物GWAS和单细胞转录组数据，揭示宿主细胞群体与肠道微生物组的关联 | 首次将微生物全基因组关联研究(GWAS)与单细胞RNA测序数据整合，开发scBPS计算方法系统解析宿主-微生物相互作用 | 研究主要基于计算预测和有限实验验证，需要更多功能实验确认机制 | 探索宿主遗传、肠道微生物组与特定细胞环境之间的关联机制 | 人类24个器官的单细胞RNA测序数据和207种微生物分类群 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,微生物GWAS,转录组分析 | 计算框架(scBPS) | 基因组数据,转录组数据 | 24个人类器官,207种微生物分类群,254种宿主细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq,单核RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 9529 | 2025-10-07 |
Multi-omics analysis identifies DLX4 as a novel biomarker for diagnosis, prognosis, and immune infiltration: from pan-cancer to renal cancer
2025-Apr-05, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02258-z
PMID:40186710
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨DLX4基因在泛癌及肾癌中的诊断、预后和免疫浸润价值 | 首次系统揭示DLX4在泛癌中的表达模式及其与免疫浸润的关联，特别是在肾透明细胞癌中的空间定位特征 | 研究主要基于数据库分析，实验验证部分相对有限 | 探索DLX4在癌症中的分子机制及其作为生物标志物的潜力 | 多种癌症类型，特别关注肾透明细胞癌(KIRC) | 生物信息学 | 肾癌 | 多组学分析, 空间转录组学, 实时PCR, 免疫组化 | NA | 基因表达数据, 突变数据, 甲基化数据, 免疫数据 | 26种癌症类型，具体样本数量未明确说明 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 9530 | 2025-10-07 |
Multi-omics insights into the roles of CCNB1, PLK1, and HPSE in breast cancer progression: implications for prognosis and immunotherapy
2025-Apr-05, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02282-z
PMID:40186712
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研究论文 | 通过多组学方法研究CCNB1、PLK1和HPSE在乳腺癌进展中的作用及其预后和免疫治疗意义 | 首次整合转录组学、蛋白质组学、DNA甲基化分析、免疫浸润分析和单细胞RNA测序等多组学方法系统研究这三个基因在乳腺癌中的协同作用 | 未明确说明样本来源和具体样本量，功能验证实验仅限于细胞增殖分析 | 探究CCNB1、PLK1和HPSE在乳腺癌进展中的具体作用机制 | 乳腺癌肿瘤组织和细胞系 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 转录组学, 蛋白质组学, DNA甲基化分析, 免疫浸润分析, 单细胞RNA测序, siRNA敲低 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 甲基化数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 多组学分析 | NA | NA |
| 9531 | 2025-10-07 |
Revealing NAPSA's role in ccRCC: Insights from single-cell RNA sequencing
2025-Apr-05, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149478
PMID:40194687
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示NAPSA基因在透明细胞肾细胞癌中的表达特征和潜在作用机制 | 首次在单细胞水平系统分析NAPSA在ccRCC中的表达模式，并发现其与EMT过程及肿瘤微环境中细胞通讯的关联 | 样本量较小（7个肿瘤和2个正常样本），需要更大规模研究验证；机制研究尚不完善 | 探究NAPSA基因在透明细胞肾细胞癌中的表达特征和功能作用 | 透明细胞肾细胞癌组织样本和细胞系（OS-RC-2和Caki-1） | 单细胞测序分析 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序，免疫荧光染色，siRNA转染 | Seurat分析流程 | 单细胞RNA测序数据，基因表达数据 | 7个肿瘤样本和2个正常样本（来自GEO数据库GSE210042），外加两个ccRCC细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9532 | 2025-10-07 |
Origin and stepwise evolution of vertebrate lungs
2025-Apr, Nature ecology & evolution
IF:13.9Q1
DOI:10.1038/s41559-025-02642-6
PMID:39953253
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析脊椎动物肺器官的起源和逐步演化过程 | 首次在软骨鱼类中发现肺发育相关的遗传基础，识别哺乳动物特异性肺泡细胞类型和基因 | 研究主要基于基因表达数据，功能验证仅限于小鼠模型 | 探究脊椎动物肺器官的演化起源和分子机制 | 脊椎动物成年和发育期肺组织 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多种脊椎动物物种的肺组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9533 | 2025-10-07 |
Aspartame increases the risk of liver cancer through CASP1 protein: A comprehensive network analysis insights
2025-Apr-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118089
PMID:40139029
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研究论文 | 通过综合网络毒理学、孟德尔随机化、分子动力学和单细胞RNA测序分析，系统探索阿斯巴甜通过CASP1蛋白增加肝癌风险的机制 | 首次整合网络毒理学、孟德尔随机化、分子动力学和单细胞技术系统研究阿斯巴甜的致癌机制，发现CASP1是阿斯巴甜诱导肝癌的关键靶点 | 需要后续实验验证阿斯巴甜的致癌机制，研究结果主要基于计算和预测方法 | 系统探索阿斯巴甜的致癌潜力及其对肝脏的作用机制 | 阿斯巴甜及其与肝癌相关的分子靶点 | 计算生物学 | 肝癌 | 网络毒理学、孟德尔随机化、分子动力学模拟、单细胞RNA测序 | 分子对接模型、分子动力学模型 | 计算预测数据、分子对接数据、单细胞表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9534 | 2025-10-07 |
H1-0 is a specific mediator of the repressive ETV6::RUNX1 transcriptional landscape in preleukemia and B cell acute lymphoblastic leukemia
2025-Apr, HemaSphere
IF:7.6Q1
DOI:10.1002/hem3.70116
PMID:40177616
|
研究论文 | 本研究通过hiPSC模型发现H1-0是ETV6::RUNX1融合基因诱导的转录抑制景观的关键调控因子 | 首次揭示连接组蛋白H1-0在ETV6::RUNX1阳性前白血病状态中的关键调控作用 | 研究主要基于hiPSC模型，需要进一步在体内验证 | 探索ETV6::RUNX1阳性前白血病细胞维持静息状态的分子机制 | ETV6::RUNX1阳性B细胞前体急性淋巴细胞白血病 | 分子生物学 | 急性淋巴细胞白血病 | CRISPR/Cas9基因编辑，单细胞测序，双荧光素酶报告基因检测 | hiPSC模型 | 转录组数据 | 1,727例白血病患者样本 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 9535 | 2025-10-07 |
In Situ Graphene-Seq: Spatial Transcriptomics and Chronic Electrophysiological Characterization of Tissue Microenvironments
2025-Mar-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.25.645278
PMID:40196689
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研究论文 | 开发了一种集成慢性电生理记录和空间分辨3D转录组学的原位石墨烯测序平台 | 首次将可拉伸网状纳米电子学与透明石墨烯电极结合，实现长期单细胞水平的多模态分析 | NA | 研究细胞功能与分子身份之间的复杂相互作用 | 人诱导多能干细胞衍生的心肌细胞和内皮细胞共培养体系 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 原位测序, 电生理记录, 光学成像 | NA | 电生理信号, 基因表达数据, 空间图像 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞电生理记录, 3D成像 | 原位石墨烯测序平台 | 集成可拉伸网状纳米电子学和透明石墨烯/PEDOT:PSS电极的多模态分析系统 |
| 9536 | 2025-10-07 |
Lignature: A Comprehensive Database of Ligand Signatures to Predict Cell-Cell Communication
2025-Mar-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.22.644770
PMID:40196598
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研究论文 | 开发了一个名为Lignature的配体特征数据库，用于预测细胞间通讯 | 构建了包含362种人类配体的细胞内转录组特征数据库，显著扩展了可用配体响应特征库，在基因和通路水平上优于现有方法 | NA | 预测配体-受体相互作用和细胞间通讯 | 人类配体及其诱导的转录组特征 | 生物信息学 | NA | 转录组分析，单细胞测序 | NA | 转录组数据，单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9537 | 2025-10-07 |
Streptococcus lutetiensis inhibits CD8+ IL17A+ TRM cells and leads to gastric cancer progression and poor prognosis
2025-Feb-09, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00810-2
PMID:39924593
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研究论文 | 本研究通过微生物组和单细胞分析揭示路氏链球菌通过抑制CD8+ IL17A+ TRM细胞促进胃癌进展 | 首次发现路氏链球菌在胃癌组织中富集并通过激活Nrf2介导的氧化应激反应抑制CD8IL17A TRM细胞 | NA | 探究胃微生物组对胃癌进展和免疫调节的影响 | 胃癌患者组织样本和小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 胃癌 | 16s rRNA测序, 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 微生物组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9538 | 2025-10-07 |
Transcriptomics in the Study of Antiviral Innate Immunity
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4108-8_10
PMID:39192121
|
综述 | 本章介绍多种转录组学技术在抗病毒天然免疫研究中的应用、意义和实验流程 | 重点介绍了单细胞测序和空间转录组学等新兴技术在该领域的应用前景 | NA | 探讨转录组学技术在抗病毒天然免疫研究中的应用 | 抗病毒天然免疫相关的RNA分子 | 自然语言处理 | NA | 微阵列, RNA测序, 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | RNA分子数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 9539 | 2025-10-07 |
Identification of Alzheimer's disease biomarkers and their immune function characterization
2025, Archives of medical science : AMS
IF:3.0Q1
DOI:10.5114/aoms/188721
PMID:40190307
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研究论文 | 本研究通过多组学方法识别阿尔茨海默病生物标志物并分析其免疫功能特征 | 结合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据，首次发现RBM3、GOLGA8A和ALS2等生物标志物与AD中CD8 T细胞浸润的关联 | 研究依赖于公共数据库数据，缺乏实验验证 | 探究阿尔茨海默病的生物标志物及其免疫机制 | 阿尔茨海默病患者样本和正常对照样本 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 机器学习算法 | 机器学习诊断模型 | 基因表达数据 | 多个GEO数据集（GSE122063、GSE97760、GSM4996463、GSM4996462） | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 9540 | 2025-10-07 |
The single-cell transcriptional landscape of lung cells from PCV2d-infected mice
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1554961
PMID:40196036
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了PCV2d感染小鼠肺组织中10种细胞类型的转录组特征和免疫应答机制 | 首次系统绘制PCV2d感染小鼠肺组织的单细胞转录组图谱，鉴定出高病毒载量的单核巨噬细胞及其通过CD40-CD40L和CXCL14-CXCR4介导的细胞互作网络 | 研究仅使用BALB/c小鼠模型，未验证其他动物模型或临床样本 | 探究PCV2d亚型感染的生物学特性及其驱动的炎症性肺损伤机制 | PCV2d感染BALB/c小鼠的肺组织细胞 | 单细胞转录组学 | 病毒感染性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | PCV2d感染和未感染对照小鼠肺组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |