单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 10618 篇文献，本页显示第 9401 - 9420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9401 | 2025-10-07 |
Understanding the cellular and molecular heterogeneity in colorectal cancer through the use of single-cell RNA sequencing
2025-May, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102374
PMID:40163910
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术解析结直肠癌的细胞和分子异质性 | 首次在结直肠癌中系统鉴定B细胞亚型并发现C3 B细胞在免疫调控中的关键作用，构建了基于C3 B细胞标志基因的生存预测模型 | 样本量相对有限，未进行多中心验证 | 解析结直肠癌的肿瘤微环境异质性 | 结直肠癌患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 预测模型 | 单细胞转录组数据 | 51,204个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9402 | 2025-10-07 |
TriDeNT : Triple deep network training for privileged knowledge distillation in histopathology
2025-May, Medical image analysis
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.media.2025.103479
PMID:40174325
|
研究论文 | 提出一种名为TriDeNT的新型自监督方法，用于在组织病理学中利用推理时不可用的特权数据进行知识蒸馏 | 开发了TriDeNT三重深度网络训练方法，能够利用推理时不可用的特权数据（如额外免疫组化染色和空间转录组学）来提升模型性能 | 需要配对的特权数据进行训练，这些数据可能稀缺或获取成本高昂 | 提高计算病理学模型的性能，通过利用推理时不可用的特权数据 | 组织病理学数据，包括免疫组化染色、空间转录组学和专家核注释 | 数字病理学 | NA | 深度学习，知识蒸馏 | 三重深度网络 | 图像，空间转录组数据，专家注释 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 9403 | 2025-10-07 |
Discovering genetically-supported drug targets for multisite chronic pain through multi-omics Mendelian randomization and single-cell RNA-sequencing
2025-Apr-19, Neuroscience
IF:2.9Q2
|
研究论文 | 通过多组学孟德尔随机化和单细胞RNA测序发现多部位慢性疼痛的遗传支持药物靶点 | 首次结合多组学孟德尔随机化与单细胞RNA测序识别多部位慢性疼痛的药物靶点 | 研究主要基于UK Biobank的汇总数据，缺乏实验验证 | 识别多部位慢性疼痛的潜在治疗靶点 | 多部位慢性疼痛患者 | 生物信息学 | 慢性疼痛 | 多组学孟德尔随机化，单细胞RNA测序，贝叶斯共定位，蛋白互作分析 | 孟德尔随机化，贝叶斯模型 | 基因表达数据，蛋白质丰度数据，单细胞测序数据 | UK Biobank数据库样本 | NA | 单细胞RNA测序，转录组关联研究 | NA | NA |
| 9404 | 2025-10-07 |
Identification of a Novel Mitochondrial-Related Gene Signature for BMSCs in Osteoporosis Combining Single-Cell and Bulk Transcriptome Data
2025-Apr-13, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-025-11099-y
PMID:40221950
|
研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组数据，鉴定骨质疏松中骨髓间充质干细胞的新型线粒体相关基因特征 | 首次结合单细胞RNA测序和批量转录组数据识别骨质疏松中BMSCs的线粒体相关基因特征，并发现DUT基因的关键调控作用 | 研究样本量有限，需要更大规模的验证研究 | 鉴定骨质疏松患者BMSCs中线粒体相关基因特征并探索其功能 | 骨质疏松患者和健康个体的骨髓间充质干细胞(BMSCs) | 单细胞转录组学 | 骨质疏松 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, RT-qPCR, Western blot, 免疫荧光, 电镜扫描 | LASSO逻辑回归, 随机森林 | 转录组数据 | 使用GSE147287(单细胞)和GSE35956(批量)数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 9405 | 2025-10-07 |
Identification of the disulfidptosis-related key gene CD2AP as a potential biomarker and new therapeutic target for LUAD patients by comprehensive multi-omics analysis
2025-Apr-11, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02308-6
PMID:40214854
|
研究论文 | 通过多组学分析鉴定双硫死亡相关关键基因CD2AP作为肺腺癌患者的潜在生物标志物和治疗靶点 | 首次将双硫死亡机制与CD2AP基因在肺腺癌中的功能联系起来，并系统评估其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 基于公共数据库的回顾性分析，缺乏实验验证 | 探索CD2AP在肺腺癌中的功能及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 转录组学、甲基化分析、免疫浸润分析、空间转录组学 | Kaplan-Meier生存分析、富集分析 | 基因组数据、转录组数据、临床数据 | TCGA、GEO等公共数据库中的肺腺癌样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 9406 | 2025-10-07 |
Integrated single cell and bulk RNA sequencing analyses reveal the impact of tryptophan metabolism on prognosis and immunotherapy in colon cancer
2025-Apr-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-85893-4
PMID:40216815
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序分析，揭示了色氨酸代谢对结肠癌预后和免疫治疗的影响 | 首次结合单细胞和批量RNA测序系统分析色氨酸代谢在结肠癌中的作用，并构建了色氨酸代谢风险评分模型 | 研究依赖于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 分析结肠癌中色氨酸代谢特征并预测免疫治疗反应 | 结肠癌患者 | 生物信息学 | 结肠癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 随机森林算法 | 基因表达数据 | 训练队列473个肿瘤和41个正常组织，验证队列902名癌症患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 9407 | 2025-10-07 |
Spatiotemporal transcriptomics reveals key gene regulation for grain yield and quality in wheat
2025-Apr-11, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03569-8
PMID:40217326
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析小麦籽粒早期发育过程，鉴定了关键调控基因 | 首次构建小麦籽粒发育的空间转录组图谱，识别了10种细胞类型和192个标记基因，发现TaABI3-B1等关键调控因子 | 仅关注早期发育阶段（授粉后4-12天），未覆盖完整籽粒发育周期 | 解析小麦籽粒发育的时空基因调控网络，为提升产量和品质提供遗传资源 | 小麦籽粒发育过程 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，WGCNA分析，基序分析 | NA | 空间转录组数据 | 授粉后4-12天的小麦籽粒发育阶段 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 9408 | 2025-10-07 |
The crucial role of neutrophil extracellular traps and IL-17 signaling in indomethacin-induced gastric injury in mice
2025-Apr-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-95880-4
PMID:40204883
|
研究论文 | 本研究探讨了中性粒细胞胞外诱捕网和IL-17信号通路在吲哚美辛诱导的小鼠胃损伤中的关键作用 | 首次通过蛋白质组学和单细胞RNA测序揭示IL-17信号通路是NETs形成的关键细胞内机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人体中验证 | 阐明吲哚美辛诱导胃损伤的分子机制 | 小鼠胃组织、外周血中性粒细胞、胃上皮细胞系 | 分子生物学 | 胃损伤 | 蛋白质组学分析、单细胞RNA测序、ELISA、免疫荧光、Western blot、实时PCR、透射电镜 | NA | 蛋白质组数据、单细胞转录组数据、图像数据 | 小鼠模型，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9409 | 2025-10-07 |
Identification of BHLHE40-Expressing CD4+ T Cells Producing GM-CSF in Rheumatoid Arthritis
2025-Apr, International journal of rheumatic diseases
IF:2.4Q2
DOI:10.1111/1756-185X.70219
PMID:40223427
|
研究论文 | 本研究分析了类风湿关节炎患者CD4+ T细胞中BHLHE40和CSF2基因的表达特征 | 首次在IL-1富集的炎症部位揭示了BHLHE40表达与GM-CSF产生的CD4+ T细胞在类风湿关节炎中的关联 | 研究基于已有数据库的二次分析，缺乏实验验证 | 探究BHLHE40和CSF2基因在类风湿关节炎CD4+ T细胞中的表达关系 | 类风湿关节炎患者和健康对照者的外周血和滑膜液CD4+ T细胞 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序, RNA测序, 微阵列 | NA | 基因表达数据 | 来自公共数据库的类风湿关节炎患者和健康对照者样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 微阵列 | NA | NA |
| 9410 | 2025-10-07 |
Genome-wide association meta-analysis identifies 126 novel loci for diverticular disease and implicates connective tissue and colonic motility
2025-Mar-28, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.03.27.25324777
PMID:40196262
|
研究论文 | 本研究通过全基因组关联分析荟萃分析发现了126个新的憩室病相关基因位点，并揭示了该疾病与结缔组织和结肠运动功能的关联 | 发现了126个新的憩室病相关基因位点，首次通过多种分析策略系统性地将憩室病与结缔组织生物学和结肠运动功能联系起来 | NA | 识别憩室病的遗传风险因素并阐明其生物学机制 | 憩室病患者群体 | 基因组学 | 憩室病 | 全基因组关联分析, 单细胞RNA测序, 组织富集分析, 统计精细定位, 等位基因特异性表达, 蛋白数量性状位点分析 | NA | 基因组数据, 单细胞RNA测序数据, 手术标本数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 全基因组关联分析 | NA | NA |
| 9411 | 2025-10-07 |
Multi-Manifolds fusing hyperbolic graph network balanced by pareto optimization for identifying spatial domains of spatial transcriptomics
2025-Mar-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf162
PMID:40220278
|
研究论文 | 提出一种融合双曲图网络的多流形方法，通过帕累托优化平衡，用于识别空间转录组学中的空间域 | 首次在空间转录组学分析中引入双曲流形，开发多流形编码器和基于注意力机制的融合方法，使用帕累托优化平衡多重重建损失 | 未在摘要中明确说明 | 识别空间转录组学中的空间域，以深入了解基因表达的发病机制 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 图神经网络，双曲神经网络，注意力机制，帕累托优化 | 双曲图网络，多流形编码器 | 空间转录组数据 | 常用基准数据集（未指定具体数量） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 9412 | 2025-10-07 |
Role of TGF-β/SMAD/YAP/TAZ signaling in skeletal muscle fibrosis
2025-Mar-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00541.2024
PMID:39925133
|
研究论文 | 本研究揭示了TGF-β通过SMAD/YAP/TAZ信号通路调控骨骼肌纤维化的分子机制 | 首次阐明TGF-β通过机械敏感性转录调节因子YAP/TAZ决定FAPs向肌成纤维细胞分化的新机制 | 对FAPs分化的核因子调控机制研究尚处于早期阶段 | 探究TGF-β/SMAD/YAP/TAZ信号通路在骨骼肌纤维化中的作用机制 | 骨骼肌纤维化、纤维/脂肪生成祖细胞(FAPs)、肌成纤维细胞 | 分子生物学 | 肌肉萎缩症 | 空间转录组学分析、原代细胞培养 | NA | 基因表达数据、蛋白质活性数据 | 小鼠模型和原代FAPs细胞 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 9413 | 2025-10-07 |
Cohesin rad21 mutation dysregulates erythropoiesis and granulopoiesis output within the whole kidney marrow of adult zebrafish
2025-Jan-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00657.2024
PMID:39548947
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了cohesin亚基rad21突变对成年斑马鱼肾脏骨髓中红细胞生成和粒细胞生成的调控作用 | 首次在成年斑马鱼模型中系统研究cohesin亚基rad21杂合突变对造血过程的特异性影响 | 未观察到明显的造血细胞形态学异常，突变的具体分子机制仍需进一步研究 | 探究cohesin突变对造血过程的影响机制 | 携带rad21杂合突变的成年斑马鱼 | 单细胞测序分析 | 血液系统恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 斑马鱼疾病模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9414 | 2025-10-07 |
Glomerular mesangial cells derived complement factor H regulates complement activation, influences cell proliferation, and maintains actin cytoskeleton
2025-May-08, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114544
PMID:40157080
|
研究论文 | 本研究探讨肾小球系膜细胞来源的补体因子H在补体激活调控、细胞增殖和细胞骨架维持中的功能 | 首次发现肾小球系膜细胞来源的CFH不仅具有经典的补体调控功能，还能通过调控KLF4/p21信号通路和Cdc42表达影响细胞增殖和细胞骨架 | 研究主要基于体外细胞实验，缺乏体内动物模型验证；外源性补充CFH未能重现内源性CFH的非经典功能 | 探究肾小球系膜细胞来源的补体因子H的多重生物学功能 | 原代人肾小球系膜细胞(pHGMCs) | 细胞生物学 | IgA肾病 | 单细胞测序, 基因沉默, 基因过表达 | 细胞模型 | 基因表达数据, 蛋白沉积数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9415 | 2025-10-07 |
Pan-HDAC inhibitor LAQ824 inhibits the progression of pancreatic ductal adenocarcinoma and suppresses immune escape by promoting antigen presentation
2025-May-08, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114528
PMID:40158429
|
研究论文 | 本研究探讨了泛HDAC抑制剂LAQ824在胰腺导管腺癌中的抗肿瘤作用及其通过促进抗原呈递抑制免疫逃逸的机制 | 首次揭示LAQ824通过增强染色质可及性上调MHC-I表达，促进抗原呈递和CD8 T细胞成熟，连接表观遗传调控与免疫原性 | 仅使用小鼠皮下肿瘤模型，尚未在临床患者中验证 | 评估LAQ824对胰腺导管腺癌的治疗潜力及其调节免疫逃逸机制的作用 | 胰腺导管腺癌细胞和小鼠模型 | 癌症研究 | 胰腺癌 | 免疫组化、流式细胞术、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | C57BL/6J小鼠皮下肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9416 | 2025-10-07 |
The characterization and validation of regulated cell death-related genes in chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2025-May-08, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114509
PMID:40158428
|
研究论文 | 本研究系统分析了调控性细胞死亡相关基因在慢性鼻窦炎伴鼻息肉中的特征和功能 | 首次在CRSwNP中构建了细胞死亡指数(CDI)，并揭示了8种RCD亚型的特异性激活模式 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据，需要更多实验验证 | 探讨调控性细胞死亡机制在CRSwNP发病和进展中的作用 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者组织样本 | 生物信息学 | 慢性鼻窦炎 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, qRT-PCR | LASSO回归, WGCNA, GSVA | 基因表达数据 | 多个GEO数据集(GSE136825等)和临床组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 9417 | 2025-10-07 |
Targeting inflammation and necroptosis in diabetic kidney disease: A novel approach via PPARα modulation
2025-May-08, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114562
PMID:40174339
|
研究论文 | 本研究通过调控PPARα探索了其在糖尿病肾病中抑制炎症和坏死性凋亡的保护机制 | 首次揭示PPARα通过抑制RIP1/RIP3/MLKL介导的坏死性凋亡和NF-κB信号通路来延缓糖尿病肾病进展 | PPARα在糖尿病肾病中的具体下游靶点和完整信号网络仍需进一步阐明 | 阐明PPARα在糖尿病肾病中的保护作用机制 | 糖尿病肾病小鼠模型和肾小管上皮细胞 | 生物医学研究 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序, RNA测序, 病毒载体转染 | 动物疾病模型 | 基因表达数据 | 糖尿病肾病小鼠模型和对照组的肾脏组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 9418 | 2025-10-07 |
Leveraging machine learning for integrative analysis of T-cell receptor repertoires in colorectal cancer: Insights into MAIT cell dynamics and risk assessment
2025-May, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102358
PMID:40088748
|
研究论文 | 通过机器学习整合分析结直肠癌患者T细胞受体库，揭示MAIT细胞动态与风险评估 | 发现跨不同数据集的共享TCR序列，识别MAIT细胞在转移和非转移患者中的升高现象，并验证TCR序列作为疾病结局生物标志物的潜力 | 样本量有限，单细胞数据集仅包含22例患者，且TCR序列重叠概率较低 | 研究结直肠癌中T细胞受体库的特征及其与疾病风险的关联 | 结直肠癌患者 | 机器学习 | 结直肠癌 | bulk测序, 单细胞测序 | 机器学习 | 序列数据 | 205例bulk测序患者 + 22例单细胞测序患者 | NA | 单细胞测序, bulk测序 | NA | NA |
| 9419 | 2025-10-07 |
The Potential Role of C4 MYH11+ Fibroblasts and the MDK-SDC2 Ligand-Receptor Pair in Lung Adenocarcinoma: Implications for Prognosis and Therapeutic Strategies
2025-May, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102364
PMID:40121996
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析肺腺癌肿瘤微环境，揭示C4 MYH11+成纤维细胞亚型和MDK-SDC2配体-受体对在肿瘤进展中的作用 | 首次发现MDK-SDC2配体-受体对作为肺腺癌进展的关键调控机制，并构建了基于基因的预后预测模型 | 样本量较小（仅9例患者），需要更大规模研究验证 | 阐明肺腺癌肿瘤微环境特征和关键生物学过程 | 肺腺癌患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 预后预测模型 | 单细胞转录组数据 | 9例肺腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9420 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing reveals PHLDA1-positive smooth muscle cells promote local invasion in head and neck squamous cell carcinoma
2025-May, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102301
PMID:40132389
|
研究论文 | 通过单细胞测序发现PHLDA1阳性平滑肌细胞通过THBS1促进头颈部鳞状细胞癌的局部侵袭 | 首次鉴定出PHLDA1阳性平滑肌细胞亚群在头颈部鳞癌侵袭中的关键作用，并揭示THBS1-SDC1信号轴的作用机制 | 研究主要基于公共数据库数据和体外实验，缺乏体内实验验证 | 探究肿瘤微环境中平滑肌细胞介导的细胞相互作用在头颈部鳞癌局部侵袭中的作用 | 头颈部鳞状细胞癌肿瘤微环境中的平滑肌细胞 | 单细胞测序 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞测序, 免疫荧光染色, 体外实验 | NA | 单细胞测序数据 | 来自GSE164690和GSE181919公共数据库的数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |