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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 921 | 2026-01-20 |
Ex vivo model of functioning human lymph node reveals role for innate lymphocytes and stroma in response to vaccine adjuvant
2025-Jul-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115938
PMID:40608517
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研究论文 | 本文介绍了一种使用人淋巴结切片作为功能性模型系统,研究疫苗佐剂早期炎症反应的方法 | 开发了精确切割的人淋巴结切片作为保持组织结构完整的全器官模型系统,结合单细胞转录组学和多重成像技术,揭示了先天淋巴细胞和基质细胞在疫苗佐剂反应中的新作用 | 模型系统可能无法完全模拟体内复杂免疫环境,且研究聚焦于早期炎症反应,长期效应未涉及 | 研究人类免疫系统对疫苗佐剂的早期炎症反应机制 | 人淋巴结切片中的免疫细胞和基质细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组学,多重成像 | NA | 转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 922 | 2026-01-19 |
Single-Cell Transcriptomic Profiling of GL261 Glioblastoma Cells Reveals Gene Expression Signatures Underlying Tumorigenicity
2025-Dec-16, Cellular and molecular neurobiology
IF:3.6Q2
DOI:10.1007/s10571-025-01635-0
PMID:41400763
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,对GL261胶质母细胞瘤细胞进行转录组分析,揭示了与肿瘤发生相关的基因表达特征 | 首次在GL261胶质母细胞瘤模型中应用单细胞RNA测序技术,全面解析了贴壁和神经球培养条件下细胞的转录组差异,并识别了与肿瘤发生相关的关键基因表达模式 | 研究仅基于GL261细胞系,未涉及患者样本或体内模型,可能无法完全反映临床胶质母细胞瘤的异质性 | 探究GL261胶质母细胞瘤细胞的转录组特征,以理解肿瘤生物学和潜在治疗靶点 | GL261胶质母细胞瘤细胞系,包括贴壁培养和神经球培养的细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | PCA, UMAP | 单细胞转录组数据 | 10715个细胞(5764个贴壁细胞和4951个神经球细胞) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 923 | 2026-01-19 |
Decreased scleral Wnt5ahi fibroblasts exacerbate myopia progression by disrupting extracellular matrix homeostasis in mice
2025-Dec-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67246-x
PMID:41402314
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,探讨了小鼠巩膜中Wnt5a高表达成纤维细胞在近视进展中的作用机制 | 首次在近视模型中识别出Wnt5a高表达巩膜成纤维细胞亚群,并揭示其通过调控细胞外基质稳态影响近视进展 | 研究仅基于雄性小鼠模型,未涉及雌性动物或人类样本,且机制研究主要依赖基因敲低技术 | 探究巩膜成纤维细胞表型异质性与形觉剥夺性近视之间的关联及其分子机制 | 雄性小鼠的巩膜组织 | 数字病理学 | 近视 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 雄性小鼠巩膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 924 | 2026-01-19 |
Establishment of a novel brainstem ischemic dysphagia model: single-cell sequencing reveals the molecular mechanisms underlying mPES intervention
2025-Dec-16, Journal of neuroengineering and rehabilitation
IF:5.2Q1
DOI:10.1186/s12984-025-01841-3
PMID:41402839
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研究论文 | 本研究通过建立一种新型的脑干缺血性吞咽困难大鼠模型,并利用改良咽部电刺激(mPES)干预,结合单细胞转录组学揭示了其治疗机制 | 首次通过脑干缺血诱导建立稳定的吞咽困难动物模型,并应用单细胞测序技术探索mPES干预的分子机制 | 研究仅基于大鼠模型,未涉及人类样本,且单细胞测序结果需要进一步功能验证 | 建立新型脑干缺血性吞咽困难模型并探索mPES干预的治疗机制 | 大鼠脑干缺血模型 | 数字病理学 | 脑卒中后吞咽困难 | 单细胞转录组测序,光化学栓塞,磁共振成像,视频荧光吞咽研究 | NA | 转录组数据,影像数据,行为数据 | 未明确说明具体样本数量的大鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 925 | 2026-01-19 |
Persistent pneumococcal colonisation in antiretroviral-treated HIV infection is associated with nasal inflammation
2025-Dec-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67258-7
PMID:41398159
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研究论文 | 本研究揭示了长期接受抗逆转录病毒治疗的HIV感染者鼻腔黏膜免疫持续失调,并与肺炎球菌定植相关 | 首次在长期ART治疗的HIV感染者中,通过单细胞转录组学等技术系统揭示了鼻腔特异性免疫失调特征,并发现上皮细胞驱动的中性粒细胞炎症与病原体定植密度间的正反馈循环 | 研究为观察性研究,未进行干预性实验验证治疗靶点;样本量相对有限;未评估其他呼吸道病原体的影响 | 探究长期ART治疗的HIV感染者鼻腔黏膜免疫失调机制及其与肺炎球菌定植的关联 | 接受抗逆转录病毒治疗超过1年的HIV感染者 | 数字病理学 | HIV感染 | 流式细胞术, 单细胞转录组学, 中性粒细胞功能检测 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据, 功能实验数据 | 接受ART治疗超过1年的HIV感染者队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 926 | 2026-01-19 |
PD-1/ PD-L1 bispecific antibody IBI318 combined with lenvatinib in advanced non-small cell lung cancer with acquired resistance to immune checkpoint inhibitors: a phase II trial
2025-Dec-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67262-x
PMID:41398162
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研究论文 | 本研究是一项II期临床试验,评估了双特异性抗体IBI318联合乐伐替尼在晚期非小细胞肺癌中对免疫检查点抑制剂获得性耐药患者的疗效和安全性 | 首次在获得性耐药患者中评估PD-1/PD-L1双特异性抗体联合酪氨酸激酶抑制剂的疗效,并利用单细胞RNA测序数据开发了预测模型以识别潜在生物标志物 | 单臂、开放标签的II期试验设计,样本量较小(40例患者),且为事后探索性分析 | 评估IBI318联合乐伐替尼在晚期非小细胞肺癌中对免疫检查点抑制剂获得性耐药患者的疗效和安全性,并探索预测性生物标志物 | 晚期非小细胞肺癌患者,且对一线免疫检查点抑制剂产生获得性耐药 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | XGBoost | 单细胞RNA测序数据 | 40例患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 927 | 2026-01-19 |
Hic-5 drives epithelial mechanotransduction promoting a feed-forward cycle of bronchoconstriction
2025-Dec-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67210-9
PMID:41387449
|
研究论文 | 本研究揭示了Hic-5作为上皮细胞机械转导的关键调节因子,在哮喘中通过促进支气管收缩的正反馈循环驱动疾病进展 | 首次发现Hic-5在气道上皮细胞机械转导中的核心作用,并阐明其通过分泌内皮素-1促进支气管收缩正反馈循环的机制 | 研究主要基于体外细胞模型和单细胞RNA-seq数据重分析,缺乏体内实验直接验证 | 探究哮喘中支气管收缩引起的机械力如何通过上皮细胞机械转导驱动疾病进展 | 人气道上皮细胞(体外模型)和哮喘患者单细胞RNA-seq数据 | 生物医学研究 | 哮喘 | 单细胞RNA-seq,基因敲低,机械压缩模拟 | 体外细胞培养模型 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 未明确样本数量,但包括体外细胞实验和哮喘患者单细胞RNA-seq数据重分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 928 | 2026-01-19 |
Functional KCC2 expression marks an evolutionarily conserved population of early-maturing interneurons in the perinatal cortex
2025-Dec-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67270-x
PMID:41365903
|
研究论文 | 本研究在小鼠和人类中识别并表征了一类在胚胎期表达KCC2、出生时即具有超极化GABA反应的早期成熟皮层中间神经元 | 首次揭示了皮层中间神经元亚群中GABA能功能成熟的异质性,确立了KCC2作为早期成熟中间神经元的标志物,并证明了其在进化上的保守性 | NA | 探究皮层中间神经元GABA能反应成熟的时间模式及其分子标志 | 小鼠和人类皮层中的中间神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、差异基因表达分析 | NA | 基因表达数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 929 | 2026-01-19 |
A phenotype-driven data and drug repurposing strategy used to identify potential treatments targeting chondrocyte hypertrophy in osteoarthritis
2025-Dec, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118773
PMID:41223767
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞转录组学数据和药物重定位策略,识别出能够逆转骨关节炎中软骨细胞肥大表型的潜在药物 | 采用表型驱动的方法,结合单细胞转录组学数据和签名逆转原理,首次应用于骨关节炎软骨细胞肥大表型的药物筛选 | 研究主要基于体外和离体实验,尚未进行体内验证,且样本量有限 | 加速骨关节炎有效药物治疗的发现,通过靶向软骨细胞肥大表型 | 骨关节炎患者的软骨细胞和软骨组织 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组学数据 | 患者骨关节炎软骨样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 930 | 2026-01-19 |
Development and validation of a glycosyltransferase-associated prognostic model for melanoma and characterization of the tumor immune microenvironment using single-cell sequencing data
2025-Dec, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102237
PMID:41542167
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研究论文 | 本研究开发并验证了一个基于糖基转移酶相关基因的预后模型,用于预测皮肤黑色素瘤患者的生存时间,并利用单细胞测序数据表征肿瘤免疫微环境 | 首次构建了基于糖基转移酶相关基因的个体化预测模型,并整合单细胞分析揭示了关键基因MGAT4A与CD8 T细胞和单核/巨噬细胞浸润的关联 | 模型主要基于回顾性转录组数据,需要前瞻性临床研究进一步验证 | 开发预测皮肤黑色素瘤患者生存的预后模型并探索糖基转移酶影响预后的机制 | 皮肤黑色素瘤患者 | 生物信息学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞测序, RNA-seq, qPCR, Western Blot, 免疫组化 | Cox回归模型, LASSO回归, 列线图 | 转录组数据, 单细胞测序数据 | TCGA和GEO数据库中的皮肤黑色素瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 931 | 2026-01-19 |
Deciphering the combinatorial expression pattern and genetic regulatory mechanisms of Beats and Sides in the olfactory circuits of Drosophila
2025-Aug-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.31.657193
PMID:40502011
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研究论文 | 本文通过分析果蝇嗅觉电路中Beat和Side基因家族的表达模式,探索其在嗅觉神经元组合识别和电路组装中的作用 | 利用公开单细胞RNA-seq数据集和新生成的基因陷阱转基因驱动线,首次系统揭示了Beat和Side基因在嗅觉受体神经元及其突触目标投射神经元中的类别特异性组合表达模式,并发现这种模式在昆虫进化中具有保守性 | 虽然研究了Beat-IIa-Side-IV相互作用的扰动,但未观察到显著的靶向错误,表明可能需要更广泛的基因组合扰动来验证其功能 | 探究果蝇嗅觉电路中Beat和Side基因家族的组合表达模式及其遗传调控机制,以理解它们如何贡献于嗅觉电路的组装 | 果蝇的嗅觉受体神经元和投射神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA-seq,基因陷阱转基因驱动线 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 932 | 2026-01-19 |
p53 mutation biases squamocolumnar junction progenitor cells towards dysplasia rather than metaplasia in Barrett's oesophagus
2025-Jan-17, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-332095
PMID:39353725
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研究论文 | 本研究探讨了p53突变在Barrett食管(BE)向食管腺癌(EAC)进展过程中,对贲门祖细胞命运和功能的影响,特别是在慢性损伤条件下 | 揭示了p53突变在慢性损伤环境中作为开关,促进祖细胞扩增并抑制其向化生分化,直接导致不典型增生,而非通过化生阶段进展 | 研究基于小鼠模型(L2-IL1β),可能无法完全模拟人类BE进展的复杂性;且聚焦于特定Trp53突变(R172H),其他p53突变的影响可能不同 | 探究p53突变在BE向EAC进展中对贲门祖细胞行为的影响 | 小鼠BE模型(L2-IL1β)中的Cck2r+贲门祖细胞 | 数字病理学 | 食管癌 | 谱系追踪、病理分析、类器官培养、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、计算分析、原位移植 | 小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据、病理图像、类器官培养数据 | 未明确指定样本数量,但涉及小鼠模型、类器官培养和单细胞测序分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 933 | 2026-01-18 |
A human lung organoid platform for studying radiation-induced pulmonary fibrosis and antifibrotic drug screening
2025-Dec-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-31582-1
PMID:41466095
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研究论文 | 本研究建立了一个源自人类胚胎干细胞的人类肺类器官模型,用于研究辐射诱导的肺纤维化及抗纤维化药物筛选 | 开发了一个包含主要上皮细胞类型的人类肺类器官模型,能够模拟辐射诱导肺纤维化的关键特征,为药物筛选提供了生理相关的人源体外平台 | 模型可能无法完全复制体内复杂的肺微环境,且研究基于体外类器官,需进一步验证其与临床病理的相关性 | 研究辐射诱导的肺纤维化机制并开发抗纤维化药物筛选平台 | 人类胚胎干细胞衍生的人类肺类器官 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 934 | 2026-01-18 |
S1PR3 Inhibition in alveolar epithelial cells alleviates pulmonary fibrosis by enhancing alveolar barrier function
2025-Dec-12, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-025-03435-y
PMID:41387860
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研究论文 | 本文研究了S1PR3在肺泡上皮细胞中的表达及其在肺纤维化中对肺泡-毛细血管屏障功能的影响 | 首次揭示了S1PR3在肺纤维化中通过调节紧密连接蛋白表达影响肺泡屏障功能的具体机制,并提出了S1PR3作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人体中进行验证,且S1PR3抑制的长期安全性未知 | 探究S1PR3在肺纤维化发病机制中的作用,并评估其作为治疗靶点的可行性 | 肺泡上皮细胞、特发性肺纤维化患者样本、博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序、siRNA敲低、选择性拮抗剂抑制 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、组织病理学图像 | 公共单细胞RNA测序数据集中的IPF患者样本、博来霉素诱导的肺纤维化小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 935 | 2026-01-18 |
NSUN7 is a catalytically inactive RNA m5C methyltransferase essential for sperm flagellum assembly
2025-Dec-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67233-2
PMID:41381527
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研究论文 | 本研究揭示了NSUN7是一种无催化活性的RNA m5C甲基转移酶,对精子鞭毛组装至关重要 | 首次明确了NSUN7缺乏催化活性,并揭示了其通过非催化调控功能在精子发生中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,在人类中的直接相关性尚需进一步验证 | 阐明NSUN7的酶学功能和生理作用 | 小鼠睾丸组织、精子细胞 | 分子生物学 | 男性不育症 | 转录组m5C质谱分析、超快速亚硫酸氢盐测序、单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据、质谱数据 | Nsun7基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 936 | 2026-01-18 |
Unveiling key genes for intervertebral disc degeneration prediction and potential drug discovery
2025-Dec-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-31675-x
PMID:41381667
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研究论文 | 本研究通过整合多个基因表达数据集和单细胞RNA测序数据,识别了与椎间盘退变(IDD)相关的关键基因,并构建了诊断模型及探索了潜在治疗药物 | 首次结合三个基因表达数据集和单细胞RNA测序数据识别IDD关键基因,并利用Connectivity Map数据库进行药物发现,同时通过临床样本验证基因表达 | 研究依赖于公开数据集,临床样本量可能有限,且药物发现部分需进一步实验验证 | 探索椎间盘退变的致病基因,构建诊断模型并识别潜在治疗药物 | 椎间盘退变(IDD)相关的基因表达数据和临床椎间盘组织样本 | 生物信息学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫组织化学(IHC)染色、分子对接 | 诊断模型 | 基因表达数据、单细胞测序数据、临床组织样本 | 三个基因表达数据集、一个单细胞RNA测序数据集及临床椎间盘组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 937 | 2026-01-18 |
Single-cell and spatial detection of senescent cells using DeepScence
2025-Dec-10, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.101035
PMID:41061702
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研究论文 | 本文开发了一种基于深度神经网络的工具DeepScence,用于在单细胞和空间转录组数据中准确识别衰老细胞 | 提出了一个整合多个已发表基因集的衰老相关基因集CoreScence,并基于此开发了首个能同时处理单细胞和空间转录组数据的深度学习方法DeepScence,其性能显著优于现有方法 | 未在摘要中明确说明 | 开发一种能准确识别衰老细胞的计算方法,以研究其空间和分子特征 | 衰老细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞转录组测序,空间转录组测序 | 深度神经网络 | 基因表达数据 | 未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 938 | 2026-01-18 |
Tregs With High CD29 Expression Promote Cell Adhesion and Contribute to the Malignant Transformation of MASLD
2025-Dec, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.70421
PMID:41200753
|
研究论文 | 本研究揭示了在代谢功能障碍相关脂肪肝病(MASLD)微环境中,高表达CD29的调节性T细胞(Tregs)通过促进细胞粘附驱动疾病向肝细胞癌(HCC)恶性转化 | 首次在MASLD背景下,通过单细胞RNA测序识别出高表达整合素β1(CD29)的Treg亚群,并阐明其通过增强细胞粘附驱动MASH向HCC转化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,其在人类疾病中的普适性仍需进一步验证;CD29靶向治疗策略的临床转化潜力有待评估 | 探究Tregs在MASLD向HCC恶性转化过程中的作用机制,并评估CD29作为潜在治疗靶点的价值 | MASLD小鼠模型(通过高脂饮食和2-乙酰氨基芴诱导)及肝脏中的T淋巴细胞亚群 | 单细胞组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),流式细胞术,体外功能实验 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | MASLD小鼠模型(具体数量未在摘要中明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 939 | 2026-01-18 |
scRNA-Seq Reveals Sustained Pro-Inflammation by Innate Immune Activation in In Utero HBV-Exposed Neonates of High HBsAg Mothers
2025-Dec, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.70405
PMID:41204708
|
研究论文 | 本研究通过单细胞多组学测序分析了高HBsAg母亲所生新生儿在乙肝疫苗接种前后的免疫状态,揭示了先天免疫激活导致的持续促炎症状态 | 首次使用单细胞多组学测序技术,结合转录组和表面标记物表达,系统评估了高HBsAg母亲所生新生儿在乙肝疫苗接种前后的免疫细胞功能变化,特别是CD8+T细胞的耗竭标记物表达和先天免疫细胞的促炎症特征 | 样本量相对较小,仅包括低和高HBsAg滴度两组母亲所生婴儿,且未涉及长期随访数据以评估免疫状态的持久性影响 | 探究高HBsAg母亲所生新生儿在乙肝疫苗接种前后的免疫状态,特别是先天免疫激活和适应性免疫受损的机制 | 来自低和高HBsAg滴度母亲的新生儿外周血单个核细胞(PBMCs) | 单细胞组学 | 乙型肝炎 | 单细胞多组学测序,免疫表型分析 | NA | 单细胞转录组和表面标记物表达数据 | 两组新生儿(低HBsAg滴度组和高HBsAg滴度组),具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞多组学测序 | NA | NA |
| 940 | 2026-01-18 |
Reconstruction and analysis of the gene network regulating apoptosis in hepatocellular carcinoma based on scRNA-seq data and the ANDSystem knowledge base
2025-Dec, Vavilovskii zhurnal genetiki i selektsii
IF:0.9Q3
DOI:10.18699/vjgb-25-102
PMID:41541554
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研究论文 | 本研究基于单细胞转录组测序数据和ANDSystem知识库,重建并分析了肝细胞癌中调控肝细胞凋亡的基因网络 | 结合scRNA-seq数据和人工智能驱动的知识库,重建了肝细胞癌凋亡调控网络,并识别了未在Gene Ontology中标注为凋亡参与者的关键蛋白(如CDKN1A、ERBB2、IL8、EGR1)在凋亡中的作用 | 研究依赖于计算分析和现有知识库注释,未进行实验验证;网络重建可能受数据质量和知识库完整性的限制 | 分析肝细胞癌中凋亡过程的分子机制,识别关键调控基因和蛋白,为寻找新的治疗靶点提供依据 | 肝细胞癌中的肝细胞(肿瘤肝细胞与正常肝组织肝细胞) | 计算系统生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序 | 基因网络重建与分析 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |