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当前共找到 10542 篇文献，本页显示第 921 - 940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 921 | 2026-04-27 |
Morphodynamics of human early brain organoid development
2025-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09151-3
PMID:40533563
|
研究论文 | 本研究建立了长期活体光片显微镜技术，用于追踪人脑类器官发育过程中的形态动力学，并结合多通道标记和计算解复用方法，揭示了细胞形态、组织状态转变及基质力学感应在大脑区域化中的作用 | 首次实现对未引导人脑类器官长达数周的活体光片显微成像，开发了双通道、多镶嵌和多蛋白标记策略结合计算解复用方法，同时量化多种亚细胞特征，并发现基质诱导的力学感应与WNT和Hippo信号通路相关 | 研究依赖于体外类器官模型，可能无法完全重现体内大脑发育的复杂性；实验条件（如基质存在与否）可能影响结果的可推广性 | 研究人脑早期发育中的形态动力学，特别是基质力学感应在大脑区域化中的作用 | 人类诱导多能干细胞衍生的未引导脑类器官 | 机器学习 | 神经退行性疾病 | 活体光片显微镜、单细胞转录组测序 | 计算解复用模型 | 图像, 转录组数据 | 多个未引导脑类器官样本，具体数量未明确提及 | NA | 单细胞RNA测序, 显微镜成像 | NA | 活体光片显微镜系统，具体配置未指定 |
| 922 | 2026-04-27 |
An updated and spatially validated somatic single-cell atlas of Hydractinia symbiolongicarpus
2025-Jun-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.03.657738
PMID:40502179
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研究论文 | 通过整合新数据构建了Hydractinia symbiolongicarpus的更新单细胞图谱，鉴定了主要体细胞谱系及新型免疫细胞群，并进行了空间验证 | 首次鉴定出假定的免疫细胞群、新神经亚型、两种空间分离的腺细胞群体及水螅体特异性细胞类型，并完善了刺细胞发育轨迹 | 现有图谱在细胞数量和转录组深度上仍有局限，细胞类型分配部分依赖计算方法 | 提升对Hydractinia symbiolongicarpus细胞多样性和动态变化的理解，为刺胞动物研究提供资源 | Hydractinia symbiolongicarpus的取食息肉和匍匐茎组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 超过47,000个细胞，来自固定细胞和活细胞数据整合 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 923 | 2026-04-27 |
Histological signatures map anti-fibrotic factors in mouse and human lungs
2025-05, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08727-3
PMID:40108456
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研究论文 | 通过组织学特征图谱揭示小鼠和人类肺部的抗纤维化因素 | 首次整合高维组织学纤维特征与多组学数据，构建时空分辨的基质转化轨迹，并识别出促纤维化与抗纤维化的成纤维细胞亚型及其相关因子 | 未在更大的样本集或不同纤维化模型中验证，且外泌实验的体内效果可能具有局限性 | 揭示肺纤维化进程中促纤维化与抗纤维化的生物学特征，并探索其对人类纤维化的功能性价值 | 博来霉素损伤的小鼠肺部及特发性肺纤维化患者肺部组织 | 数字病理学， 计算机视觉 | 肺纤维化 | 单细胞测序， Visium空间转录组学 | NA | 组织图像， 单细胞转录组数据， 空间转录组数据 | 小鼠肺部样本（博来霉素损伤后多个时间点）， 人类特发性肺纤维化患者肺部样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序， 空间转录组学 | 10x Chromium， 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序，10x Visium空间转录组分析 |
| 924 | 2026-04-27 |
Smooth Muscle Cells and Fibroblasts in the Proximal Thoracic Aorta Exhibit Minor Differences Between Embryonic Origins in Angiotensin II-driven Transcriptional Alterations
2025-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.23.610985
PMID:39896657
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研究论文 | 探究在血管紧张素II驱动的转录变化中，近端胸主动脉平滑肌细胞和成纤维细胞在胚胎起源间的微小差异 | 首次在预病理阶段比较了血管紧张素II诱导下第二心场和心脏神经嵴起源的平滑肌细胞与成纤维细胞的转录组差异，并发现了新的成纤维细胞亚群 | 仅关注预病理阶段，未涉及长期血管紧张素II输注后的进展期变化；且差异微小，可能需更大样本量或更敏感的方法来验证 | 揭示血管紧张素II介导的胸主动脉病变中不同胚胎起源细胞（平滑肌细胞和成纤维细胞）的转录组响应差异 | 小鼠近端胸主动脉的平滑肌细胞和成纤维细胞，分为第二心场起源和非第二心场起源 | 机器学习和生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠近端胸主动脉组织，经血管紧张素II输注或基线对照，每组样本量未明确说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 925 | 2026-04-25 |
The High Expression of PD-1 Defines A Subpopulation of Tfh Cells Responding to COVID-19 Vaccine in Humans
2025-Dec-22, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf019
PMID:40080696
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研究论文 | 利用单细胞测序和流式细胞术，研究了COVID-19疫苗加强针后PD-1高表达Tfh细胞亚群的应答特征及其对抗体反应的长期维持作用 | 首次发现PD-1高表达经典Tfh细胞亚群在COVID-19疫苗加强针后显著活化，其比例与抗体滴度相关，并通过定制算法识别病毒诱导的T细胞受体，揭示了该亚群可维持超过90天的免疫应答 | 未明确说明局限性（基于摘要推断） | 研究COVID-19疫苗加强针后CD4+ T细胞尤其是Tfh细胞的应答特征及其对抗体产生的作用 | COVID-19疫苗接种后的人体CD4+ T细胞（包括Tfh细胞） | 机器学习, 数字病理学 | 新型冠状病毒肺炎（COVID-19） | 单细胞测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞免疫数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 926 | 2026-04-25 |
Histology-Based Virtual RNA Inference Identifies Pathways Associated With Metastasis Risk in Colorectal Cancer
2025-Nov, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2025.100866
PMID:40803647
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研究论文 | 通过深度学习从H&E染色组织图像推断虚拟RNA表达，揭示结直肠癌转移相关通路 | 首次在大规模结直肠癌空间转录组数据集上训练虚拟RNA推断模型，利用多种先进深度学习架构实现从常规H&E图像推断近细胞分辨率的空间基因表达，无需进行昂贵的空间转录组实验 | 某些肿瘤相关通路无法完全通过组织学图像捕获，模型对‘组织学相关’通路的推断效果较好但对其他通路覆盖有限 | 开发并验证一种从常规H&E染色图像推断空间转录组水平分子信息的方法，用于大规模流行病学研究中肿瘤微环境表征和预后评估 | 结直肠癌患者的原发肿瘤组织样本及其对应H&E染色图像和空间转录组数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | HE染色成像，空间转录组测序，虚拟RNA推断 | UNI，ResNet-50，视觉Transformer，Vision Mamba | 组织图像，基因表达数据 | 45名结直肠癌患者的超过30万个Visium斑点 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 927 | 2026-04-25 |
Deciphering genetic associations with blood pressure in peripheral blood mononuclear cells through single-cell transcriptomic profiling
2025-11, Hypertension research : official journal of the Japanese Society of Hypertension
IF:4.3Q1
DOI:10.1038/s41440-025-02344-3
PMID:40877473
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析，解析外周血单核细胞中与血压相关的遗传关联 | 利用单细胞转录组测序结合全基因组关联研究和孟德尔随机化方法，在免疫细胞亚型中识别与血压相关的候选基因，并发现ERAP2在CD8+ T细胞和自然杀伤细胞中的显著失调 | 样本量较小（10个个体用于测序，8个个体用于验证），可能限制结果的泛化性 | 鉴定与血压相关的免疫细胞特异性功能基因 | 外周血单核细胞中的免疫细胞亚型 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 10个个体（111,694个细胞）用于测序，8个个体（28,919个细胞）用于验证 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 928 | 2026-04-25 |
Myocardial reprogramming by HMGN1 underlies heart defects in trisomy 21
2025-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09593-9
PMID:41125893
|
研究论文 | 本文鉴定出HMGN1基因是21三体综合征（唐氏综合症）相关先天性心脏缺陷的关键驱动因子 | 首次将HMGN1鉴定为21号染色体上影响房室管发育的剂量敏感基因，并通过单细胞转录组学、CRISPR激活筛选和动物模型验证其致病机制 | 研究主要依赖人诱导多能干细胞和转基因小鼠模型，可能需要更多临床样本验证结果 | 阐明21三体综合征中先天性心脏缺陷的遗传机制 | 人诱导多能干细胞来源的心肌细胞、唐氏综合症转基因小鼠模型 | 数字病理学、机器学习 | 唐氏综合症、先天性心脏缺陷 | 单细胞转录组学、CRISPR激活筛选、CROP-seq | 单细胞RNA测序、CRISPR激活筛选 | 基因表达数据 | 人诱导多能干细胞系、小鼠胚胎心脏样本（具体数量未在摘要中明确） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' RNA测序、CROP-seq筛选 |
| 929 | 2026-04-25 |
Data-driven fine-grained region discovery in the mouse brain with transformers
2025-Oct-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64259-4
PMID:41057352
|
研究论文 | 使用Transformer模型实现小鼠大脑空间转录组学数据的细粒度区域发现 | 提出一种自监督框架CellTransformer，可扩展到百万细胞级MERFISH和Slide-seqV2数据集，并实现跨组织切片的细胞整合 | 未讨论模型在非脑组织或低分辨率空间数据中的泛化能力 | 建立自监督空间域检测流程，用于发现小鼠大脑中的精细组织区域 | 小鼠大脑组织 | 数字病理学 | 神经科学 | MERFISH, Slide-seqV2 | Transformer (编码器-解码器架构) | 空间转录组数据 | 4只小鼠的900万个细胞，超过200个组织切片 | Vizgen, 10x Genomics | 空间转录组学 | MERFISH, Slide-seqV2 | MERFISH全脑成像系统，Slide-seqV2空间转录组学平台 |
| 930 | 2026-04-25 |
Single-cell nanodroplet processing proteomics pipeline for analysis of human-derived microglia
2025-Oct-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.02.680067
PMID:41256374
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研究论文 | 提出了基于FACS辅助分离、冷冻保存和纳米液滴处理的单细胞质谱蛋白质组学工作流程，用于分析人类死后脑皮层来源的小胶质细胞 | 首次将纳米液滴处理技术与FACS辅助分离和冷冻保存相结合，实现对死后人脑小胶质细胞的单细胞蛋白质组学分析 | 样本来源仅限于死后脑组织，可能无法完全反映活体状态；作为概念验证，样本量有限 | 开发单细胞蛋白质组学方法以探索小胶质细胞的异质性 | 人类死后脑皮层来源的小胶质细胞 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞质谱蛋白质组学 | NA | 蛋白质组数据 | 单个小胶质细胞 | NA | 单细胞质谱蛋白质组学 | NA | 基于FACS辅助分离、冷冻保存和纳米液滴处理的单细胞质谱蛋白质组学工作流程 |
| 931 | 2026-04-25 |
The Landscape of SPP1 + Macrophages Across Tissues and Diseases: A Comprehensive Review
2025-10, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13952
PMID:40395129
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综述 | 系统总结了分泌型磷蛋白1阳性巨噬细胞在不同组织和疾病中的功能与适应性 | 通过跨疾病比较揭示了SPP1+巨噬细胞的共享特征和组织特异性差异，为其治疗靶向提供新视角 | 基于现有单细胞测序研究进行综述，可能受限于各研究的方法学差异和样本异质性 | 综合解析SPP1+巨噬细胞在肿瘤与非肿瘤疾病中的作用及其微环境适应性 | SPP1+巨噬细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 932 | 2026-04-25 |
Microglia-neuron crosstalk through Hex-GM2-MGL2 maintains brain homeostasis
2025-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09477-y
PMID:40769205
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研究论文 | 通过脂质组学、空间脂质成像、单细胞转录组学和细胞特异性突变体，发现小胶质细胞通过Hex-GM2-MGL2通路与神经元交互，维持脑稳态 | 首次揭示小胶质细胞通过溶酶体酶β-己糖胺酶将GM2神经节苷脂降解物传递给神经元的新型交互模式，并阐明该通路失调导致神经退行性病变的机制 | 主要基于小鼠模型，人类患者数据有限；具体机制细节尚需进一步验证 | 探究小胶质细胞与神经元在维持脑稳态中的相互作用机制 | 小胶质细胞与神经元之间的通讯 | 机器学习 | 神经退行性疾病（桑德霍夫病） | 脂质组学、空间脂质成像、单细胞转录组学 | NA | 图像、文本 | 小鼠模型和人类患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 933 | 2026-04-25 |
Insights into tissue- and cell type-specific effects of Grb10 on pig skeletal muscle growth by multi-omics analysis
2025-09, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2910-7
PMID:40545505
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研究论文 | 通过多组学分析揭示GRB10在猪骨骼肌生长中的组织和细胞类型特异性影响 | 首次结合基因组学、转录组学、表观组学和单细胞转录组学，定位肥胖型和瘦肉型猪中GRB10在肌肉组织和细胞中的特异性，并发现其肌肉特异性启动子及转录因子KLF15的结合 | 尚未详细说明该机制的完整调控网络及其在人类中的直接验证 | 探究猪肌肉组织发育的关键基因和调控机制，特别关注GRB10的组织和细胞类型特异性作用 | 肥胖型和瘦肉型猪的肌肉组织和细胞 | 机器学习 | NA | 基因组学、转录组学、表观组学、单核RNA测序、双荧光素酶和染色质免疫沉淀(ChIP)实验 | NA | 多组学数据（基因组、转录组、表观组、单细胞转录组） | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 934 | 2026-04-25 |
Cholinergic neuronal activity promotes diffuse midline glioma growth through muscarinic signaling
2025-Aug-21, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.05.031
PMID:40541184
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研究论文 | 发现中脑胆碱能神经元通过毒蕈碱受体信号促进弥漫性中线胶质瘤生长 | 首次揭示胆碱能神经元活动以环路依赖方式调节弥漫性中线胶质瘤增殖，不同于已知的谷氨酸能神经元作用 | 未提供明确局限性信息 | 探究中脑胆碱能神经元活动对弥漫性中线胶质瘤生长的影响及其机制 | 弥漫性中线胶质瘤细胞及健康少突胶质前体细胞 | 神经科学 | 弥漫性中线胶质瘤 | 光遗传学、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 原发性弥漫性中线胶质瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 935 | 2026-04-25 |
Single-cell sequencing and spatial transcriptomics reveal FAS+ T cell and autophagy-related signatures predicting chemoimmunotherapy response in diffuse large B-cell lymphoma patients
2025-08, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2849-2
PMID:40374987
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研究论文 | 通过单细胞测序和空间转录组学揭示FAS+ T细胞和自噬相关标志物预测弥漫性大B细胞淋巴瘤患者化疗免疫反应 | 首次整合单细胞测序和空间转录组学数据，构建基于自噬相关基因的预后模型，并发现FAS阳性T细胞在肿瘤微环境中的免疫激活作用与良好预后相关 | 研究样本量有限（单细胞测序仅4例DLBCL，空间转录组学10例），且缺乏独立的前瞻性验证队列 | 探索自噬相关基因在弥漫性大B细胞淋巴瘤中的预后预测价值及免疫微环境特征 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者和健康对照者 | 数字病理学 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤 | 单细胞测序， 空间转录组学， 抗体芯片 | NA | 转录组数据， 单细胞测序数据， 空间转录组数据， 蛋白质组数据 | 1409例DLBCL患者（转录组），531例健康对照，4例DLBCL（单细胞测序），10例DLBCL（空间转录组），110例DLBCL（本地队列蛋白质组） | NA | 单细胞RNA测序， 空间转录组学 | NA | NA |
| 936 | 2026-04-25 |
Embryonic mast cells arise from the Cpa3-expressing precursors but not granulocyte-monocyte progenitors
2025-08, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2891-1
PMID:40419842
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研究论文 | 结合单细胞RNA测序和遗传命运图谱模型，揭示胚胎肥大细胞起源于表达Cpa3的前体细胞而非粒细胞-单核细胞祖细胞 | 首次通过单细胞RNA测序和多种遗传命运图谱模型，明确鉴定出胚胎肥大细胞起源于Cpa3阳性前体细胞，而非Ms4a3或Elane阳性粒细胞-单核细胞祖细胞，并发现跨物种保守的发育程序 | 研究主要关注胚胎期皮肤肥大细胞的起源，对其他组织中肥大细胞的发育路径未充分探索；体内移植实验的样本量未明确说明 | 探究胚胎肥大细胞的起源和发育过程，明确其在胚胎造血中的前体细胞类型 | 小鼠胚胎（卵黄囊、胎肝、外周组织）及人类早期卵黄囊和胎肝样本 | 单细胞生物学 | 过敏性疾病 | 单细胞RNA测序、体外分化、体内移植实验、遗传命运图谱 | NA | 单细胞基因表达数据 | 未明确具体样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞RNA测序平台 |
| 937 | 2026-04-25 |
CCR5-mediated dynamic maintenance of resident memory T cells in the respiratory tract
2025-08, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2920-y
PMID:40459692
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研究论文 | 通过条形码谱系追踪和单细胞转录组分析，揭示了呼吸道中组织驻留记忆T细胞通过CCR5介导的肺到淋巴结逆向迁移维持的机制 | 首次发现肺引流淋巴结中存在与肺驻留记忆T细胞共享条形码和转录谱的CD69+CD103+病毒特异性CD8+ T细胞，并阐明CCR5-CCL5轴驱动肺到淋巴结的逆向迁移以维持T细胞驻留记忆 | 未知 | 探讨呼吸道中组织驻留记忆T细胞的维持机制及其与淋巴器官中记忆T细胞的关系 | 小鼠肺引流淋巴结和肺组织中的CD8+ T细胞亚群 | 免疫学 | 流感病毒感染 | 单细胞转录组分析、条形码谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | 流感感染小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 938 | 2026-04-25 |
Comprehensive insight on immune landscape in intracerebral hemorrhage patients with single-cell RNA sequencing: from blood to hematoma
2025-Jul-30, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03518-z
PMID:40739271
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序对脑出血患者从血液到血肿的免疫景观进行全面解析 | 首次对脑出血患者血肿样本进行单细胞转录组分析，揭示免疫细胞特征及动态炎症过程 | 样本量较小（4名患者、3名健康对照），未提及外部验证队列 | 探究脑出血患者血肿中免疫细胞的转录谱，阐明组织损伤机制 | 脑出血患者的血肿样本和外周血样本，健康志愿者外周血样本 | 单细胞转录组学 | 脑出血 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 4名脑出血患者（血肿+血液样本），3名健康志愿者（血液样本） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 939 | 2026-04-25 |
Prenatally derived macrophages support choroidal health and decline in age-related macular degeneration
2025-Jul-07, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20242007
PMID:40261298
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研究论文 | 该研究利用三维多重免疫荧光、单细胞RNA测序和流式细胞术，揭示了人脉络膜中FOLR2+巨噬细胞在年龄相关性黄斑变性（AMD）中数量减少和脂质代谢障碍，并证明其产前来源对维持脉络膜健康至关重要 | 首次在单细胞水平描述人类脉络膜免疫景观，发现两种FOLR2表达不同的巨噬细胞亚群，并揭示产前来源的FOLR2+巨噬细胞在AMD中的减少是疾病标志特征之一 | 研究主要基于小鼠模型和部分人眼样本，可能无法完全反映人类AMD的长期病程；巨噬细胞亚群功能验证尚需更直接的人类实验证据 | 阐明脉络膜免疫环境在年龄相关性黄斑变性（AMD）病理过程中的变化及其作用 | 人类及小鼠的脉络膜组织，特别是FOLR2+巨噬细胞 | 机器学习 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、三维多重免疫荧光 | NA | 图像、文本 | NA | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 单细胞RNA测序使用10x Chromium进行文库构建，在Illumina NovaSeq上测序 |
| 940 | 2026-04-25 |
Optical phenotyping using label-free microscopy and deep learning
2025-Jul, Biophotonics discovery
DOI:10.1117/1.BIOS.2.3.035001
PMID:42028248
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研究论文 | 利用无标记显微镜和深度学习对胰腺癌样本进行光学表型分析 | 结合无标记多光子显微镜、空间转录组学和深度学习，提出一种非破坏性的光学表型分析方法 | 研究仅基于胰腺癌样本，未评估其他组织类型；准确性仍有提升空间，可能需要整合更多基因表达数据或互补成像模态 | 开发光学表型分析新方法以区分胰腺癌样本的结构和功能特征 | 胰腺癌标本 | 计算机视觉 | 胰腺癌 | 空间转录组学、无标记多光子显微镜 | 深度学习分类模型（具体类型未提及） | 图像、基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |