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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9301 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing analysis reveals the essential role of the m 6A reader YTHDF1 in retinal visual function by regulating TULP1 and DHX38 translation
2025-Mar-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析揭示m6A阅读器YTHDF1通过调控TULP1和DHX38翻译在视网膜视觉功能中的关键作用 | 首次发现YTHDF1在成熟视网膜功能维持中的新作用,揭示其通过识别m6A修饰直接调控视网膜变性相关基因TULP1和DHX38翻译的新机制 | 研究主要基于基因敲除模型,在人类视网膜疾病中的直接应用仍需进一步验证 | 探究m6A阅读器YTHDF1在视网膜功能维持中的分子机制 | 小鼠视网膜组织及视网膜细胞 | 单细胞生物学 | 视网膜变性疾病 | 单细胞RNA测序, MeRIP测序, RIP测序 | 基因敲除模型 | 单细胞转录组数据, 表观转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 甲基化RNA免疫沉淀测序 | NA | NA |
| 9302 | 2025-10-07 |
Integrated single-cell transcriptomic map of pig kidney cells across various periods and anatomical sites
2025-Mar-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建了猪肾脏在不同时期和不同解剖部位的单细胞转录组图谱 | 首次系统构建了猪肾脏跨胚胎期、育肥期和妊娠期的单细胞转录组图谱,发现了近端小管细胞代谢相关转录因子的表达特征,并揭示了厚壁升支细胞亚群和肾脏驻留巨噬细胞的功能异质性 | 研究样本数量有限(12个样本),且仅针对猪模型,人类肾脏验证数据相对较少 | 构建猪肾脏单细胞转录组图谱,研究肾脏细胞在不同生理时期和不同解剖部位的功能异质性 | 猪肾脏细胞 | 单细胞组学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序,荧光同源双标记 | NA | 单细胞转录组数据,组织切片图像 | 138,469个细胞,来自12个猪肾脏样本(涵盖胚胎期、育肥期和妊娠期) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9303 | 2025-10-07 |
Mechanistic elucidation of human pancreatic acinar development using single-cell transcriptome analysis on a human iPSC differentiation model
2025-02-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-88690-1
PMID:39920294
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析研究人iPSC分化模型中胰腺腺泡细胞的发育机制 | 首次在hiPSC分化模型中鉴定REG4作为胰腺腺泡祖细胞标志物,并发现cAMP信号通路在腺泡细胞分化中的关键作用 | 研究依赖于小鼠体内分化模型,体外分化效率仍需优化 | 阐明胰腺外分泌腺泡谱系的发育机制,建立hiPSC定向分化为胰腺腺泡细胞的方法 | 人诱导多能干细胞分化的胰腺腺泡细胞 | 单细胞组学 | 胰腺外分泌疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9304 | 2025-10-07 |
Integration of scRNA-Seq and Bulk RNA-Seq Identifies Circadian Rhythm Disruption-Related Genes Associated with Prognosis and Drug Resistance in Colorectal Cancer Patients
2025, ImmunoTargets and therapy
IF:6.2Q1
DOI:10.2147/ITT.S499806
PMID:40241740
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量RNA测序数据,鉴定与结直肠癌预后和耐药相关的昼夜节律紊乱基因 | 首次系统揭示昼夜节律相关基因在结直肠癌中的表达特征及其与肿瘤进展和免疫治疗反应的关系 | NA | 探索昼夜节律相关基因在结直肠癌中的作用机制及其临床意义 | 结直肠癌患者样本 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, WGCNA, GSEA | 预后模型 | 基因表达数据 | GSE178318数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 9305 | 2025-10-07 |
An Integrative Analysis of Transcriptome Combined with Machine Learning and Single-Cell RNA-Seq for the Common Biomarkers in Crohn's Disease and Kidney Stone Disease
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S502513
PMID:40242727
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研究论文 | 通过整合转录组分析结合机器学习和单细胞RNA测序技术,鉴定克罗恩病和肾结石病的共同生物标志物 | 首次整合机器学习算法和单细胞RNA测序技术识别克罗恩病与肾结石病的共同生物标志物 | 研究基于公共数据库数据,样本量有限,需要进一步实验验证 | 识别能够预测克罗恩病合并肾结石病的生物标志物 | 克罗恩病和肾结石病患者数据及人肠道细胞和近端肾小管上皮细胞模型 | 生物信息学 | 克罗恩病,肾结石病 | 转录组分析,机器学习,单细胞RNA测序 | Limma,WGCNA,机器学习算法 | 基因表达数据 | 三个克罗恩病数据集和一个肾结石病数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9306 | 2025-10-07 |
Cross one single body 49 tissues single-cell transcriptome reveals detailed macrophage heterogeneity during pig pregnancy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1574120
PMID:40242774
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研究论文 | 通过单头健康怀孕猪49个组织的单细胞转录组测序,揭示妊娠期间巨噬细胞的详细异质性 | 首次在单一个体水平构建了涵盖49个组织的巨噬细胞单细胞转录组图谱,揭示了妊娠期巨噬细胞的跨组织异质性和物种间保守性 | 研究仅基于单一个体,样本量有限,需要在更多个体中验证结果 | 研究妊娠期间巨噬细胞的转录组异质性和组织特异性适应机制 | 健康怀孕猪的巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 妊娠相关生理变化 | 单细胞RNA测序,免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据 | 单头怀孕猪的49个组织,共114,881个巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9307 | 2025-04-19 |
Editorial: Spatial transcriptome and single-cell sequencing for exploring molecular mechanisms of neuroimmunity and discovering novel markers of neurological diseases
2025, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2025.1582019
PMID:40248015
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9308 | 2025-10-07 |
Mutation S139N on Zika virus prM protein shifts immune response from Asian to contemporary strain
2025-May, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2025.02.012
PMID:39986659
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研究论文 | 通过单细胞测序技术揭示寨卡病毒prM蛋白S139N突变如何改变免疫反应模式 | 首次发现S139N单点突变可使亚洲株免疫反应特征转变为当代流行株模式 | 研究仅使用1日龄小鼠模型,未在更成熟动物模型或人体中验证 | 探究寨卡病毒prM蛋白S139N突变对免疫反应的影响 | 寨卡病毒感染的小鼠脑组织免疫细胞 | 单细胞生物学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1日龄小鼠感染三种寨卡病毒株 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9309 | 2025-10-07 |
CD44+ cells enhance pro-tumor stroma in the spatial landscape of colorectal cancer leading edge
2025-May, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-02968-9
PMID:40069574
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组和单细胞RNA测序揭示了结直肠癌前缘CD44+肿瘤细胞通过PTN信号重塑肿瘤微环境的机制 | 首次发现CD44+肿瘤细胞在肿瘤前缘通过PTN信号诱导CAFs表型转换,揭示了肿瘤异质性在空间结构上的作用机制 | 研究主要基于小鼠模型,临床样本验证相对有限 | 探索结直肠癌异质性如何影响肿瘤空间结构并促进疾病进展 | AOM/DSS诱导的结直肠癌小鼠模型和临床患者样本 | 空间转录组学 | 结直肠癌 | 空间转录组分析, 单细胞RNA测序, 伪时间轨迹分析, 细胞间通讯分析, 免疫荧光染色 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 图像数据 | AOM/DSS诱导的结直肠癌模型和临床样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9310 | 2025-10-07 |
Single-cell profiling reveals monocyte heterogeneity and association with liver fibrosis in patients with chronic HBV
2025-May-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000672
PMID:40227083
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示慢性乙型肝炎患者循环单核细胞的异质性及其与肝纤维化的关联 | 首次在慢性乙型肝炎患者中发现单核细胞-血小板聚集体(MPA)亚群,并揭示其通过CCL5信号通路促进肝纤维化的新机制 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证发现;机制研究主要基于体外实验 | 探究慢性乙型肝炎患者循环单核细胞的异质性及其在肝纤维化进展中的作用机制 | 慢性乙型肝炎伴肝纤维化患者和健康对照者的循环单核细胞 | 单细胞组学 | 慢性乙型肝炎、肝纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 慢性乙型肝炎患者组和健康对照组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9311 | 2025-04-18 |
Identification of Novel Protein Biomarkers for Intrahepatic Cholangiocarcinoma by Integrating Human Plasma Proteome with Genome
2025-Apr-17, Journal of gastrointestinal cancer
IF:1.6Q4
DOI:10.1007/s12029-025-01226-8
PMID:40240670
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研究论文 | 本研究通过整合人类血浆蛋白质组与基因组数据,识别出与肝内胆管癌(ICC)潜在相关的蛋白质生物标志物 | 首次对ICC进行蛋白质组-MR分析,揭示了其复杂的遗传结构,并鉴定出5种与疾病有潜在因果关联的新型血液蛋白 | 研究主要基于欧洲人群数据,可能在其他人群中的普适性有待验证 | 发现ICC的潜在治疗和诊断靶点 | 肝内胆管癌(ICC)相关蛋白质生物标志物 | 生物信息学 | 肝内胆管癌 | 蛋白质组范围孟德尔随机化(MR)、ELISA、scRNA-seq | 孟德尔随机化模型 | 基因组数据、蛋白质组数据、RNA-seq数据 | 来自deCODE血浆蛋白质组GWAS和欧洲meta分析的遗传数据,TCGA和GTEx数据库样本 | NA | NA | NA | NA |
| 9312 | 2025-10-07 |
Virus-associated inflammation imprints an inflammatory profile on monocyte-derived macrophages in the human liver
2025-Apr-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI175241
PMID:40231469
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了慢性乙型肝炎患者肝脏中单核细胞来源的炎症性巨噬细胞的特征及其在炎症消退后的持续存在 | 首次在人类肝脏中鉴定出具有炎症转录特征的单核细胞来源巨噬细胞,并证明其在炎症消退后仍保留核心转录特征 | 研究样本仅限于慢性乙型肝炎患者,未涵盖其他病因的肝病 | 探究病毒相关炎症对肝脏巨噬细胞组成的重塑作用 | 慢性乙型肝炎患者的肝脏组织和血液单核细胞 | 单细胞生物学 | 乙型肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 慢性乙型肝炎患者纵向样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9313 | 2025-10-07 |
How is single-cell RNA sequencing contributing to the advancement of cancer therapeutics?
2025-Apr-15, World journal of gastrointestinal oncology
IF:2.5Q3
DOI:10.4251/wjgo.v17.i4.103480
PMID:40235873
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析胃癌肿瘤微环境中细胞群体的分布和动态变化 | 利用scRNA-seq技术全面揭示胃癌不同阶段肿瘤微环境中的关键细胞相互作用 | NA | 探索单细胞RNA测序在癌症治疗进展中的贡献,特别关注胃癌治疗策略开发 | 胃癌患者的肿瘤微环境细胞群体 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9314 | 2025-10-07 |
Parallel comparison of T cell and B cell subpopulations of adenoid hypertrophy and tonsil hypertrophy of children
2025-Apr-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58094-w
PMID:40229254
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较儿童腺样体肥大和扁桃体肥大的T细胞和B细胞亚群差异 | 首次在单细胞水平上平行比较AH和TH的免疫微环境差异,发现AH具有更多幼稚B细胞和调节性CD4 T细胞,但浆细胞较少 | 样本量相对有限,仅包含12对配对样本 | 探究儿童腺样体肥大和扁桃体肥大的免疫微环境差异 | 1209名1-15岁被诊断为腺样体肥大的儿科患者,其中12对配对AH和TH样本 | 单细胞生物学 | 儿童耳鼻喉疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1209名患者,12对配对AH和TH样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9315 | 2025-10-07 |
Multi-omics analysis identifies diagnostic circulating biomarkers and potential therapeutic targets, revealing IQGAP1 as an oncogene in gastric cancer
2025-Apr-14, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00895-9
PMID:40229327
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研究论文 | 通过多组学整合分析识别胃癌循环生物标志物和潜在治疗靶点 | 首次通过多组学整合方法识别出IQGAP1等8个胃癌生物标志物,并揭示IQGAP1在胃癌中的致癌作用 | NA | 识别胃癌诊断性循环生物标志物和潜在治疗靶点 | 胃癌患者 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 基因定量性状位点分析, 蛋白定量性状位点分析, 共定位分析, 孟德尔随机化 | NA | 血浆样本, 肿瘤组织样本, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9316 | 2025-10-07 |
IL1RAP is an immunotherapeutic target for normal karyotype triple-mutated acute myeloid leukemia
2025-Apr-14, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-025-00769-z
PMID:40229904
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研究论文 | 本研究通过多组学分析鉴定IL1RAP作为正常核型三重突变急性髓系白血病的免疫治疗靶点 | 首次通过多组学方法系统识别IL1RAP作为NKt-AML特异性表面抗原,并证明其可作为抗体-药物偶联物的潜在靶点 | 样本量有限(仅12例NKt-AML样本进行表面蛋白质组分析),需进一步验证 | 寻找NKt-AML特异性表面抗原以开发新型免疫疗法 | 原发性急性髓系白血病样本 | 生物医学 | 急性髓系白血病 | 表面蛋白质组富集、转录组分析、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 100例原发性AML样本(表面蛋白质组),691例原发性AML样本(转录组),23例原发性AML样本(单细胞RNA测序) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9317 | 2025-10-07 |
Extracellular vesicle-derived miRNA-mediated cell-cell communication inference for single-cell transcriptomic data with miRTalk
2025-Apr-14, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03566-x
PMID:40229908
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研究论文 | 开发了一种名为miRTalk的新方法,用于从单细胞转录组数据推断细胞外囊泡来源的miRNA介导的细胞间通讯 | 首次提出通过细胞外囊泡来源的miRNA-靶标相互作用推断细胞间通讯的创新方法 | NA | 开发从单细胞RNA测序数据推断细胞间通讯的计算方法 | 细胞外囊泡来源的miRNA及其靶标相互作用 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | miRTalk(专门开发的推断算法) | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9318 | 2025-10-07 |
Comprehensive bioinformatics and immunohistochemical analyses identify phosphoinositide metabolism and PNPLA7 as potential biomarkers in urological cancers
2025-Apr-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-97118-9
PMID:40221501
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研究论文 | 通过生物信息学和免疫组化分析发现磷酸肌醇代谢和PNPLA7基因可作为泌尿系统癌症的潜在生物标志物 | 首次系统研究磷酸肌醇代谢在泌尿系统癌症中的作用,并发现PNPLA7作为新型生物标志物 | 基于公共数据库的分析,需要进一步实验验证 | 探讨磷酸肌醇代谢在泌尿系统癌症中的预后价值和治疗指导意义 | 透明细胞肾癌、膀胱癌和前列腺腺癌 | 生物信息学 | 泌尿系统癌症 | 生物信息学分析,单细胞RNA测序,免疫组化 | NA | 基因表达数据,临床样本 | 公共数据库中的泌尿系统癌症数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9319 | 2025-10-07 |
Exploring the tumor microenvironment of breast cancer to develop a prognostic model and predict immunotherapy responses
2025-Apr-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-97784-9
PMID:40221624
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研究论文 | 本研究通过分析乳腺癌肿瘤微环境开发预后模型并预测免疫治疗反应 | 识别了12个独立预后基因并构建预后模型,首次揭示内皮细胞比例与患者预后的显著关联 | 基于公共数据库的回顾性分析,缺乏前瞻性临床验证 | 开发乳腺癌预后模型并预测免疫治疗反应 | 乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 转录组测序,单细胞RNA测序 | Cox回归,LASSO回归,共识聚类,WGCNA | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 公共数据库中的乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq,转录组测序 | NA | NA |
| 9320 | 2025-10-07 |
Overcoming immunotherapy resistance in hepatocellular carcinoma by targeting myeloid IL-8/CXCR2 signaling
2025-Apr-02, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.02.002
PMID:39916327
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研究论文 | 本研究通过靶向髓系IL-8/CXCR2信号通路克服肝细胞癌的免疫治疗耐药性 | 首次在单细胞水平揭示IL-8/CXCR2通路通过髓系抑制细胞介导免疫检查点抑制剂耐药机制,并验证CXCR2拮抗剂的联合治疗策略 | 研究样本量有限,主要基于临床前模型验证机制 | 阐明肝细胞癌免疫检查点抑制剂耐药机制并开发联合治疗策略 | 晚期肝细胞癌患者和小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 原位小鼠模型 | 基因表达数据 | 晚期肝细胞癌患者队列(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |