单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 10570 篇文献，本页显示第 9241 - 9260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9241 | 2025-10-07 |
Identifying PSIP1 as a critical R-loop regulator in osteosarcoma via machine-learning and multi-omics analysis
2025-Apr-22, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03775-1
PMID:40264164
|
研究论文 | 本研究通过机器学习和多组学分析识别PSIP1作为骨肉瘤中关键的R-loop调控因子 | 首次构建R-loop基因预后评分模型(RGPSM)，并通过单细胞RNA测序结合实验验证PSIP1在骨肉瘤进展中的关键作用 | NA | 探索R-loop在骨肉瘤发生发展中的作用机制 | 骨肉瘤患者样本和细胞系 | 机器学习 | 骨肉瘤 | RNA测序,单细胞RNA测序,机器学习 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 多个骨肉瘤队列数据集 | NA | RNA-seq,scRNA-seq | NA | NA |
| 9242 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals the mechanism of Realgar improvement on erythropoiesis in mice with myelodysplastic syndrome
2025-Apr-08, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03768-0
PMID:40200265
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示雄黄改善骨髓增生异常综合征小鼠红细胞生成的机制 | 首次在单细胞水平研究雄黄及其活性成分AsS对小鼠成红细胞的影响，揭示其调控红细胞分化的转录组机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类临床样本中验证 | 探究雄黄改善骨髓增生异常综合征贫血症状的作用机制 | 小鼠成红细胞和骨髓细胞 | 单细胞测序 | 骨髓增生异常综合征 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9243 | 2025-10-07 |
Amino Acid Metabolism Subtypes in Neuroblastoma Identifying Distinct Prognosis and Therapeutic Vulnerabilities
2025-Apr-04, Journal of proteome research
IF:3.8Q1
DOI:10.1021/acs.jproteome.4c00554
PMID:39442086
|
研究论文 | 基于氨基酸代谢相关基因鉴定神经母细胞瘤的三种预后和治疗敏感性不同的亚型 | 首次在神经母细胞瘤中基于氨基酸代谢相关基因建立预后分型系统，并发现不同亚型对免疫治疗和化疗的敏感性差异 | NA | 探究氨基酸代谢与神经母细胞瘤预后的关联并建立分型系统 | 神经母细胞瘤患者 | 生物信息学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，基因表达分析 | NA | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9244 | 2025-10-07 |
Spatial and Single-Cell Transcriptomics Reveals the Regional Division of the Spatial Structure of MASH Fibrosis
2025-Apr, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.16125
PMID:39400982
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术揭示了MASH纤维化在肝脏中的区域分布特征及其分子机制 | 首次在MASH纤维化中表征了谱系特异性基因表达变化、亚群组成和伪时序分析，并识别了6个与纤维化相关的关键基因 | 样本量相对有限，需要更大规模的研究验证发现 | 阐明MASH纤维化在肝脏中的区域分布并识别潜在治疗靶点 | 健康对照、单纯性脂肪变性患者和MASH患者的肝脏组织 | 数字病理学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 伪时序分析 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 未明确具体样本数量，包含健康对照、单纯性脂肪变性和MASH患者肝脏切片 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9245 | 2025-10-07 |
Schwann Cell-Mediated M2-Like Macrophage Polarization in Rhabdomyosarcoma
2025-Apr, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.15214
PMID:39639424
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析头颈部横纹肌肉瘤微环境的细胞组成和免疫特征 | 首次发现施万细胞通过MIF-CD74和PTN-SDC3受体-配体对促进M2样巨噬细胞极化，并揭示其在轴突导向通路中的富集 | 样本量有限，主要聚焦头颈部横纹肌肉瘤，需要更多验证实验确认机制 | 研究横纹肌肉瘤微环境的细胞组成和免疫特征 | 头颈部横纹肌肉瘤样本 | 单细胞转录组学 | 横纹肌肉瘤 | 单细胞转录组测序，流式细胞术，免疫组织化学，bulk RNA测序 | CellChat，CIBERSORT，单样本基因集富集分析 | 单细胞转录组数据，基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9246 | 2025-10-07 |
Ozone-induced lung injury and inflammation: Pathways and therapeutic targets for pulmonary diseases caused by air pollutants
2025-Apr, Environment international
IF:10.3Q1
DOI:10.1016/j.envint.2025.109391
PMID:40121788
|
综述 | 探讨臭氧诱导肺损伤和炎症的分子通路及其作为空气污染物相关肺部疾病治疗靶点的潜力 | 通过单细胞转录组数据定位臭氧损伤感应与信号通路基因，识别臭氧反应热点区域 | NA | 阐明臭氧诱导肺损伤的病理机制并探索潜在治疗靶点 | 臭氧暴露导致的呼吸道上皮细胞损伤和炎症反应 | 数字病理学 | 肺损伤/肺部疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9247 | 2025-10-07 |
Identifying reproducible transcription regulator coexpression patterns with single cell transcriptomics
2025-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012962
PMID:40257984
|
研究论文 | 利用大规模单细胞转录组数据识别跨细胞类型可重复的转录调控因子共表达模式 | 整合了120个人类和103个小鼠单细胞RNA-seq数据集，构建跨物种可重复的转录调控因子共表达网络 | 未深入探讨特定生物学背景下的信号保存 | 识别跨生物背景可重复的转录调控因子共表达模式 | 人类和小鼠的转录调控因子及其共表达基因伙伴 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 共表达网络分析 | 单细胞转录组数据 | 超过2800万个细胞，来自223个数据集（120个人类，103个小鼠） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9248 | 2025-10-07 |
Distinct deregulation trends of transcriptional protein complexes in aging naive T cells
2025-Mar-14, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae231
PMID:39437255
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据和蛋白质相互作用网络，揭示了衰老对幼稚T细胞中转录蛋白复合物的不同调控趋势 | 首次将单细胞RNA测序数据与蛋白质-蛋白质和结构域-结构域相互作用网络整合，预测并比较不同年龄组幼稚T细胞中的转录蛋白复合物 | 研究仅关注幼稚CD4+和CD8+T细胞，未涉及其他T细胞亚型或免疫细胞 | 探究衰老过程中幼稚T细胞转录蛋白复合物的动态变化机制 | 来自3个不同年龄组的人类幼稚CD4+和CD8+T细胞 | 生物信息学 | 衰老相关免疫功能障碍 | 单细胞RNA测序 | 蛋白质相互作用网络分析 | 单细胞转录组数据 | 3个不同年龄组的幼稚CD4+和CD8+T细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9249 | 2025-10-07 |
Screening and validating genes associated with cuproptosis in systemic lupus erythematosus by expression profiling combined with machine learning
2025-Mar-07, Biomolecules & biomedicine
DOI:10.17305/bb.2024.10996
PMID:39388708
|
研究论文 | 通过机器学习结合单细胞RNA测序筛选和验证与系统性红斑狼疮铜死亡相关的基因 | 首次将铜死亡机制与系统性红斑狼疮关联，并采用机器学习方法筛选诊断基因标志物 | 研究依赖于公共数据库数据，样本来源有限，需要进一步实验验证 | 识别系统性红斑狼疮中与铜死亡相关的关键基因 | 系统性红斑狼疮患者外周血样本 | 机器学习 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, qPCR, 微阵列基因表达分析 | LASSO, 支持向量机递归特征消除 | 基因表达数据 | 两个公共数据集(GSE65391和GSE61635)的外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 9250 | 2025-10-07 |
scCrab: A Reference-Guided Cancer Cell Identification Method based on Bayesian Neural Networks
2025-Mar, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-024-00655-6
PMID:39348073
|
研究论文 | 提出一种基于贝叶斯神经网络和参考数据引导的自动癌细胞识别方法scCrab | 首次将贝叶斯神经网络与多头自注意力机制结合，能够整合外部参考数据作为先验信息进行癌细胞识别 | NA | 开发高效的癌细胞识别计算方法 | 癌细胞 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯神经网络, 线性回归模型, 多头自注意力机制 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9251 | 2025-10-07 |
Sandwich Therapy with Radionuclide Combined with Intralesional Injections Based on Differences in the Spatial Structure Components of Keloids
2025-Mar, Aesthetic plastic surgery
IF:2.0Q2
DOI:10.1007/s00266-024-04442-y
PMID:39402198
|
研究论文 | 基于瘢痕疙瘩空间结构成分差异设计放射性核素联合病灶内注射的'三明治'疗法 | 首次通过单细胞测序分析发现瘢痕疙瘩血管壁中两个高表达基因及其富集通路在血管生成和胶原合成中的关键作用，并基于空间结构差异设计改良疗法 | 样本量较小（40例患者41个部位），缺乏长期随访数据 | 开发基于瘢痕疙瘩空间结构成分差异的改良治疗方法 | 瘢痕疙瘩患者 | 数字病理学 | 皮肤瘢痕疾病 | 单细胞测序, 超声检查, 组织病理学染色 | NA | 基因表达数据, 影像数据, 病理图像 | 40例患者41个瘢痕部位 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9252 | 2025-10-07 |
SCG2 Mediates HNSCC Progression With CCL2/TGFβ1high M2 Macrophage Infiltration
2025-Mar, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.15154
PMID:39404611
|
研究论文 | 本研究揭示了SCG2在头颈部鳞状细胞癌中通过调控CCL2/TGFβ1促进M2巨噬细胞极化的机制 | 首次发现SCG2是HNSCC中M2巨噬细胞极化的关键调控因子，并鉴定出与M2巨噬细胞浸润相关的五基因预后标志物 | NA | 阐明头颈部鳞状细胞癌中M2巨噬细胞极化的机制并识别潜在治疗靶点 | 头颈部鳞状细胞癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 生物信息学分析、单细胞转录组测序、基因敲低、细胞共培养 | NA | 转录组数据、单细胞转录组数据 | TCGA和GEO数据库中的HNSCC批量转录组数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 9253 | 2025-10-07 |
Unraveling aging from transcriptomics
2025-Mar, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2024.09.006
PMID:39424502
|
综述 | 本文综述了利用转录组学技术研究衰老机制的最新进展 | 系统整合了不同类型转录本（mRNA、lncRNA、tRNA、miRNA）在衰老研究中的最新发现 | NA | 阐明衰老的生物学机制和年龄相关疾病，促进健康长寿 | 衰老相关的转录组变化 | 生物信息学 | 老年疾病 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 9254 | 2025-10-07 |
Active immunologic participation and metabolic shutdown of kidney structural cells during kidney transplant rejection
2025-Mar, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1016/j.ajt.2024.10.015
PMID:39461479
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究肾脏移植排斥中结构细胞的免疫参与和代谢变化 | 首次在单细胞水平揭示肾脏结构细胞在移植排斥中主动参与免疫过程并发生代谢关闭 | 样本量相对有限（18个活检样本来自14名受者） | 研究肾脏移植排斥过程中结构细胞的免疫反应和代谢变化 | 肾脏移植患者的活检组织 | 单细胞组学 | 肾脏移植排斥 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 18个肾脏移植活检样本来自14名受者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9255 | 2025-10-07 |
A multiplex single-cell RNA-Seq pharmacotranscriptomics pipeline for drug discovery
2025-Mar, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01761-8
PMID:39482470
|
研究论文 | 开发了一种结合药物筛选与单细胞RNA测序的药理转录组学流程，用于探索卵巢癌细胞的药物反应机制 | 首次将活细胞条形码技术与96重单细胞RNA测序相结合，实现高通量药理转录组分析 | 研究主要聚焦于高级别浆液性卵巢癌，尚未验证其他癌症类型的适用性 | 解析癌症药物反应的基因调控动态机制 | 原发性高级别浆液性卵巢癌细胞 | 单细胞转录组学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 45种药物处理的原代HGSOC细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 96重单细胞RNA测序 |
| 9256 | 2025-10-07 |
Recent advances in basic research on prostate cancer: Where we are heading?
2025-Mar, International journal of urology : official journal of the Japanese Urological Association
IF:1.8Q3
DOI:10.1111/iju.15628
PMID:39474871
|
综述 | 概述前列腺癌基础研究的最新进展，重点关注癌细胞及其肿瘤微环境两大领域 | 整合雄激素受体信号机制、基因组分析、液体活检与肿瘤微环境研究，强调单细胞RNA测序和空间转录组学等先进技术带来的新见解 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据，主要基于现有文献进行总结和分析 | 探讨前列腺癌研究的现状和未来发展方向 | 前列腺癌细胞及其肿瘤微环境 | 基础医学研究 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 液体活检, 基因组分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 临床样本数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 9257 | 2025-10-07 |
Multimodal Profiling of Peripheral Blood Identifies Proliferating Circulating Effector CD4+ T Cells as Predictors for Response to Integrin α4β7-Blocking Therapy in Inflammatory Bowel Disease
2025-Feb, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.09.021
PMID:39343250
|
研究论文 | 通过多模态分析外周血免疫特征，识别增殖性循环效应CD4+T细胞作为炎症性肠病患者对整合素α4β7阻断治疗反应的预测标志物 | 首次整合多组学数据识别出对vedolizumab治疗无应答者的特异性T细胞特征，并建立机器学习预测模型 | 样本量相对有限，需要在更大队列中验证预测模型的普适性 | 寻找炎症性肠病生物治疗反应的可靠预测标志物 | 接受vedolizumab治疗的炎症性肠病患者外周血样本 | 生物医学 | 炎症性肠病 | 质谱流式细胞术,单细胞RNA测序,单细胞BCR/TCR测序,血清蛋白质组学,多参数流式细胞术 | 机器学习 | 单细胞多组学数据 | 2个前瞻性队列的炎症性肠病患者 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞BCR/TCR测序,质谱流式细胞术,蛋白质组学 | NA | NA |
| 9258 | 2025-10-07 |
Matrix stiffness regulates mitochondria-lysosome contacts to modulate the mitochondrial network, alleviate the senescence of MSCs
2025-Feb, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13746
PMID:39353686
|
研究论文 | 本研究探讨基质硬度通过调控线粒体-溶酶体接触影响间充质干细胞衰老的机制 | 首次揭示基质硬度通过调控M-L接触影响线粒体网络和功能进而导致MSC衰老的分子机制 | 未明确M-L接触调控线粒体稳态的具体信号通路 | 探究基质硬度如何通过调控线粒体-溶酶体接触影响间充质干细胞衰老 | 人间充质干细胞 | 细胞生物学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序,原子力显微镜 | NA | 基因表达数据,力学性能数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9259 | 2025-10-07 |
Maternal infection with SARS-CoV-2 during early pregnancy induces hypoxia at the maternal-fetal interface
2025-Feb, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13749
PMID:39375953
|
研究论文 | 本研究探讨了孕早期SARS-CoV-2感染对母胎界面缺氧状态的影响 | 首次发现孕早期SARS-CoV-2感染会诱导母胎界面缺氧并伴随代谢异常，且这种影响随孕周增加而逐渐缓解 | 样本量有限，长期影响仍需进一步研究 | 探究SARS-CoV-2感染对母胎界面的影响机制 | 孕早期感染SARS-CoV-2孕妇的胎盘样本 | 病理学 | COVID-19 | 免疫荧光,免疫组化,单细胞RNA测序,代谢组学测序 | NA | 组织样本,基因表达数据,代谢数据 | 孕6-8周和12-16周孕妇胎盘样本 | NA | 单细胞RNA测序,代谢组学测序 | NA | NA |
| 9260 | 2025-10-07 |
Extraembryonic mesoderm cells derived from human embryonic stem cells rely on Wnt pathway activation
2025-Feb, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13761
PMID:39385268
|
研究论文 | 本研究开发了一种通过激活Wnt通路从人primed胚胎干细胞分化产生胚外中胚层细胞及其后续间充质干细胞的方案 | 首次证明人primed胚胎干细胞可分化为胚外中胚层细胞并产生具有特定分化潜能的间充质干细胞 | 未明确说明样本数量和研究规模 | 探索人primed胚胎干细胞向胚外中胚层细胞分化的可能性及其后续发育潜能 | 人primed胚胎干细胞、胚外中胚层细胞、间充质干细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞转录组分析、免疫染色分析、细胞分选、三维分化培养 | NA | 转录组数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |