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当前共找到 10619 篇文献，本页显示第 901 - 920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 901 | 2026-01-21 |
Spatial transcriptomics of glioblastoma defines biologically and clinically significant reprogramming patterns across unique spatial microenvironments
2025-Oct-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.17.683110
PMID:41279756
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析胶质母细胞瘤，揭示了其在独特空间微环境中的生物学重编程模式及其临床意义 | 开发了一种新颖的空间信息整合方法，将基因共表达网络模块识别的生物学重编程与细胞间通讯的特定变化相结合，提供了对转录因子调控、细胞相互作用和生物通路活性的空间模式的新见解 | 研究样本量相对较小（14个样本），可能限制了结果的普遍性 | 定义胶质母细胞瘤的生物学重编程、肿瘤微环境重组和细胞间相互作用，以揭示空间微环境对肿瘤行为和治疗反应的影响 | 胶质母细胞瘤（GBM）肿瘤样本，特别是来自Ivy胶质母细胞瘤图谱项目的空间定义区域 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学 | 基因共表达网络模块 | 空间转录组数据 | 14个胶质母细胞瘤样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | Visium空间转录组学平台 |
| 902 | 2026-01-21 |
Clinical Interventions and Inflammatory Signaling Shape the Transcriptional and Cellular Architecture of the Early Postnatal Lung
2025-Oct-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.17.683116
PMID:41278997
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术构建了人类出生后早期（0-2岁）肺部的细胞图谱，揭示了肺泡II型细胞的两种新转录状态及其与炎症信号和临床干预的关联 | 首次在人类出生后早期肺部发现了肺泡II型细胞的两种互斥转录状态，并建立了其与炎症信号通路及临床抗炎干预的直接联系 | 样本量相对有限（23例），且均为组织学正常的标本，可能无法完全代表疾病状态下的情况 | 探究人类出生后早期肺部的细胞发育和重塑机制，及其与肺部疾病的关系 | 人类出生后早期（0-2岁）的肺部组织 | 单细胞组学 | 肺部疾病 | 单核RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 23例个体的组织学正常肺部标本 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 903 | 2026-01-21 |
Cell and molecular profiles in peripheral nerves shift toward inflammatory phenotypes in diabetic peripheral neuropathy
2025-Oct-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI184075
PMID:40828619
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研究论文 | 本研究通过转录组学和空间转录组学分析，揭示了糖尿病周围神经病变（DPN）中周围神经的细胞和分子谱向炎症表型转变，并探讨了感觉轴突mRNA转运在神经退行性变中的潜在作用 | 首次在人类DPN神经中结合转录组学和空间转录组学分析，揭示了神经类型特异性免疫特征，并发现了感觉轴突中mRNA（如SCN9A和TRPV1）的显著定位现象 | 样本主要来自截肢手术的糖尿病患者，对照组来自跨面神经移植手术，可能存在组织来源和疾病状态的异质性 | 深入探究糖尿病周围神经病变的分子机制和细胞表型变化 | 糖尿病患者的胫神经和腓肠神经，以及对照组的腓肠神经 | 数字病理学 | 糖尿病周围神经病变 | 转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据 | 来自下肢截肢术的胫神经和腓肠神经（主要来自糖尿病患者），以及来自跨面神经移植手术的对照腓肠神经 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 904 | 2026-01-21 |
Spatia: Multimodal Model for Prediction and Generation of Spatial Cell Phenotypes
2025-Jul-07, ArXiv
PMID:40671942
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Spatia的多模态模型，用于预测和生成空间细胞表型，通过融合细胞形态、基因表达和空间上下文信息来学习统一表示 | Spatia首次提出了一种多尺度生成和预测模型，能够整合图像衍生的形态标记和转录组向量标记，并通过跨注意力机制和Transformer模块在单细胞、生态位和组织水平上捕获空间依赖性，同时利用生成扩散解码器合成高分辨率细胞图像 | NA | 学习统一的、空间感知的表示，以整合细胞形态、基因表达和空间上下文，从而理解组织功能 | 细胞形态、基因表达和空间组织 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | Transformer, 生成扩散模型 | 图像, 基因表达数据 | 涉及49名捐赠者、17种组织类型和12种疾病状态，包括1700万个细胞-基因对、100万个生态位-基因对和1万个组织-基因对 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 905 | 2026-01-21 |
Altered Hepatic Metabolism in Down Syndrome
2025-May-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.27.656393
PMID:40502193
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了唐氏综合征患者中肝脏代谢的改变，特别是胆汁酸水平升高和肝功能异常蛋白标志物 | 首次在唐氏综合征中系统报道了广泛的代谢变化，并利用小鼠模型和单细胞转录组学验证了胆汁酸代谢紊乱与肝脏病理的关联 | 研究样本量相对有限，且主要基于血浆分析，未深入探讨其他组织或长期临床影响 | 探究唐氏综合征中肝脏代谢的改变及其潜在机制 | 唐氏综合征患者和小鼠模型 | 代谢组学 | 唐氏综合征 | 多组学分析、bulk RNA-seq、单细胞转录组学 | Dp16小鼠模型 | 血浆、RNA序列数据 | 超过400人 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 906 | 2026-01-21 |
Interpretable Trajectory Inference with Single Cell Linear Adaptive Negative-binomial Expression (scLANE) Testing
2025-May-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.19.572477
PMID:38187622
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研究论文 | 本文提出了一种名为scLANE的可解释轨迹推断方法，用于单细胞RNA-seq数据中的基因表达动态分析 | scLANE测试基于可解释的广义线性模型，通过经验选择的基样条处理非线性，并扩展至估计方程和混合模型，以支持复杂实验设计下的可靠轨迹测试 | NA | 开发一种可解释的轨迹推断方法，以识别与生物轨迹进展显著相关的基因表达变化 | 单细胞RNA-seq数据中的基因表达动态 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | 广义线性模型（GLM）、基样条、估计方程、混合模型 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 907 | 2026-01-21 |
Metabolic Adaptations Rewire CD4 T Cells in a Subset-Specific Manner in Human Critical Illness with and without Sepsis
2025-Jan-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.27.635146
PMID:39975258
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研究论文 | 本研究探讨了危重病（包括脓毒症）患者中CD4 T细胞的代谢适应如何以亚群特异性方式重塑其功能 | 揭示了调节性T细胞（Tregs）在危重病中通过获得糖酵解能力来稳定其抑制性标志物，并与临床疾病严重程度相关，同时通过单细胞转录组学鉴定了犬尿氨酸代谢在Tregs中的差异作用 | 未明确说明样本量是否足够大以覆盖所有危重病亚型，且机制研究可能仅限于体外验证 | 旨在阐明危重病（包括脓毒症）中CD4 T细胞的代谢与免疫功能障碍之间的机制联系 | 人类CD4 T细胞，特别是来自危重病（有或无脓毒症）患者和健康成年人的样本 | 免疫学 | 脓毒症 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 908 | 2026-01-21 |
Cigarette smoke and biological age induce degenerative heterogeneity in retinal pigment epithelium
2025-Jan-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.27.635096
PMID:39974955
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研究论文 | 本研究探讨了香烟烟雾通过表观遗传变化诱导视网膜色素上皮细胞退行性异质性，并加速衰老的过程 | 首次结合snRNA-seq和snATAC-seq技术，揭示了香烟烟雾诱导的RPE细胞退行性异质性及其与衰老的差异，并在人类样本中验证了与早期年龄相关性黄斑变性的关联 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本，可能无法完全反映人类疾病的复杂性 | 探究香烟烟雾如何通过表观遗传机制诱导视网膜色素上皮细胞的退行性异质性，并加速衰老过程 | 年轻和老年小鼠的视网膜色素上皮/脉络膜组织，以及吸烟者、早期AMD患者和非吸烟者的人类视网膜样本 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | snRNA-seq, snATAC-seq, scRNA-seq, TUNEL标记 | NA | 单细胞转录组数据，单细胞染色质可及性数据 | 年轻和老年小鼠的RPE/脉络膜组织，以及来自吸烟者、早期AMD患者和非吸烟者的人类视网膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 909 | 2026-01-20 |
Erythrocyte-microglia crosstalk contributing to sex differences in pediatric brain tumorigenesis
2025-Dec-10, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6323329/v1
PMID:41510281
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研究论文 | 本研究揭示了红细胞与小胶质细胞之间的相互作用如何导致儿童脑肿瘤（以髓母细胞瘤为模型）发病率的性别差异，并发现新生儿高胆红素血症是潜在的可干预风险因素 | 首次发现红细胞膜糖蛋白GYPA表达差异通过影响小胶质细胞的红细胞吞噬作用及脂质代谢，导致神经前体细胞分化速度的性别差异，从而解释男性儿童脑肿瘤发病率更高的机制 | 研究主要基于髓母细胞瘤模型，其他儿童脑肿瘤类型的普适性需进一步验证；临床数据的meta分析可能存在混杂因素 | 探究儿童脑肿瘤发病率性别差异的细胞与分子机制 | 发育中的人和小鼠小脑组织、神经前体细胞、小胶质细胞、红细胞 | 肿瘤生物学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据、临床数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及人和小鼠的发育小脑组织及临床数据meta分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 910 | 2026-01-20 |
Hypoxia-induced USP13 expression drives ferroptosis resistance and tumor immune evasion in hepatocellular carcinoma through the stabilization of ACLY
2025-Dec-02, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02869-z
PMID:41330897
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研究论文 | 本研究揭示了缺氧诱导的USP13通过稳定ACLY蛋白，驱动肝细胞癌的铁死亡抵抗和肿瘤免疫逃逸，并验证了靶向USP13的治疗潜力 | 首次阐明了缺氧/HIF-1α/USP13/ACLY轴在肝细胞癌中介导铁死亡抵抗和免疫逃逸的分子机制，并发现USP13抑制剂2-Methoxyestradiol具有抗肿瘤疗效 | 研究主要基于临床前模型（细胞系、动物模型、PDOs），尚未进行人体临床试验；USP13抑制剂的特异性和潜在脱靶效应需进一步评估 | 探索USP13在肝细胞癌进展中的作用，并评估其作为诱导铁死亡和增强免疫反应的治疗靶点的潜力 | 肝细胞癌患者来源的类器官、肝细胞癌细胞系和动物模型 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术分析、蛋白质稳定性分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质互作数据、细胞表型数据 | 未明确具体样本数量，但使用了患者来源的类器官、多种细胞系和动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 911 | 2026-01-20 |
Folic acid prevents inner hair cell degeneration via genomic stability
2025-Dec-02, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02880-4
PMID:41330911
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研究论文 | 本研究揭示了钙稳态破坏在内毛细胞损伤中的作用，并发现叶酸可能是一种有前景的保护毛细胞的治疗剂 | 首次揭示了低频率与高频率内毛细胞在钙清除率上的差异与PMCA1表达相关，并利用特异性敲除小鼠模型结合单细胞RNA-seq分析，发现叶酸通过降低DNA损伤标志物γ-H2A.X水平来保护内毛细胞 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需进一步验证，且具体分子机制细节有待深入探索 | 探究内毛细胞损伤的机制及预防策略 | 内毛细胞，特别是Pmca1特异性敲除小鼠模型中的内毛细胞 | NA | 听力损失 | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 912 | 2026-01-20 |
HDAC4 Promotes Neuroprotection of Retinal Ganglion Cells After Optic Nerve Injury
2025-Dec-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.15.60
PMID:41533933
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研究论文 | 本研究探讨了HDAC4在视神经损伤后视网膜神经节细胞神经保护和轴突再生中的作用 | 首次将HDAC4鉴定为视神经损伤后RGC生存和轴突再生的关键调节因子，并展示了其突变体对基因表达变化的调控能力 | 研究基于小鼠视神经挤压模型，可能无法完全模拟人类青光眼或其他视神经病变的复杂性 | 探索HDAC4在视网膜神经节细胞神经保护和轴突再生中的功能，以开发针对青光眼等视神经病变的治疗策略 | 小鼠视网膜神经节细胞 | 神经科学 | 青光眼 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 913 | 2026-01-20 |
CHD7 regulates cardiac neural crest cell differentiation through SOX5-mediated self-activation
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113726
PMID:41210995
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了CHD7通过SOX5介导的自激活机制调控心脏神经嵴细胞分化，为CHARGE综合征相关心脏缺陷提供了新见解 | 首次发现CHD7通过SOX5介导的自激活机制调控其自身表达，并证明SOX5过表达可恢复CHD7单倍体不足细胞中的基因表达和心肌细胞分化能力 | 研究主要基于体外细胞培养模型，体内验证和临床转化潜力仍需进一步探索 | 探究CHD7在心脏神经嵴细胞分化中的作用机制及其与CHARGE综合征心脏缺陷的关联 | 心脏神经嵴细胞 | 发育生物学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 914 | 2026-01-20 |
HNRNPA2B1 confers immune escape of non-small cell lung cancer through targeting lactate/ferroptosis
2025-Nov-21, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08232-5
PMID:41271615
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研究论文 | 本研究探讨了m6A阅读蛋白HNRNPA2B1通过调控LDHA mRNA稳定性和乳酸积累，促进非小细胞肺癌免疫逃逸和铁死亡抵抗的机制 | 首次揭示了HNRNPA2B1作为m6A阅读器，通过靶向LDHA mRNA的m6A修饰位点增强其稳定性，进而通过乳酸积累和干扰素-γ分泌抑制，介导非小细胞肺癌的免疫逃逸和铁死亡抵抗 | 研究主要在体外共培养体系中进行，体内模型验证相对有限；机制研究聚焦于LDHA通路，可能存在其他下游靶点 | 探究HNRNPA2B1在非小细胞肺癌免疫逃逸和铁死亡抵抗中的作用及分子机制 | 非小细胞肺癌细胞、活化的CD8 T细胞 | 肿瘤生物学 | 肺癌 | 单细胞转录组测序、体外共培养实验 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 非小细胞肺癌临床样本及单细胞测序数据（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 915 | 2026-01-20 |
The Spatial Atlas of Human Anatomy (SAHA): A Multimodal Subcellular-Resolution Reference Across Human Organs
2025-Nov-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.16.658716
PMID:40611896
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研究论文 | 本文介绍了空间人体解剖学图谱（SAHA），这是一个跨多器官系统的健康成人组织的多模态亚细胞分辨率参考图谱 | 首次创建了跨多器官系统的多模态亚细胞分辨率健康成人组织参考图谱，整合了空间转录组学、蛋白质组学和组织学特征 | NA | 构建一个全面的健康人体组织图谱，以支持空间诊断和下一代精准医学的发展 | 健康成人组织，包括胃肠道和免疫组织，以及结直肠癌和炎症性肠病的比较分析 | 数字病理学 | 结直肠癌, 炎症性肠病 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 单核RNA-seq | NA | 空间转录组数据, 蛋白质组数据, 组织学图像 | 超过100名捐赠者的超过1500万个细胞 | 10x Genomics, NanoString | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | CosMx SMI, 10x Xenium, RNAscope, GeoMx DSP | CosMx SMI, 10x Xenium, RNAscope, GeoMx DSP, 单核RNA-seq |
| 916 | 2026-01-20 |
Integrated single-cell transcriptomics and spatial metabolomics unveil cellular differentiation and ginsenosides biosynthesis in Panax root tips
2025-Nov, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhaf202
PMID:41180020
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序和空间代谢组学分析，揭示了人参属植物根尖的细胞分化轨迹和人参皂苷生物合成的细胞异质性 | 首次在人参属植物根尖中整合单细胞转录组和空间代谢组学，识别了新的转录因子并验证了其在内皮层木栓化和人参皂苷生物合成中的调控作用 | 研究仅聚焦于三种人参属物种，可能无法完全代表该属的多样性，且功能验证实验范围有限 | 探究人参属植物根尖早期发育过程中的细胞命运转变及人参皂苷生物合成的细胞异质性 | 三种人参属植物（Panax ginseng、Panax quinquefolius和Panax notoginseng）的根尖组织 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间代谢组学、LC-MS/MS、RNA原位杂交、双荧光素酶报告基因检测（dual-LUC）、电泳迁移率变动分析（EMSA） | NA | 转录组数据、代谢组数据、图像数据 | 三种人参属物种的根尖样本 | NA | 单细胞RNA-seq、空间代谢组学 | NA | NA |
| 917 | 2026-01-20 |
RetiGene, a comprehensive gene atlas for inherited retinal diseases
2025-Oct-02, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2025.08.017
PMID:40961941
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研究论文 | 本文介绍了RetiGene，一个专为遗传性视网膜疾病设计的专家策划基因图谱，整合了变异数据、批量与单细胞RNA测序以及功能注释 | 开发了首个综合性的专家策划基因图谱，整合多源数据以支持遗传性视网膜疾病的基因发现、功能研究和治疗开发 | 未提及样本量或具体技术限制，可能依赖于现有数据源的完整性和准确性 | 解决遗传性视网膜疾病中基因目录不完整和变异解释困难的问题，促进分子诊断和遗传研究 | 遗传性视网膜疾病相关基因 | 数字病理学 | 遗传性视网膜疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因变异数据、RNA测序数据、功能注释 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 918 | 2026-01-20 |
Regional Transcriptomic Architecture of Glioblastoma Reveals NUCB2 as a Key Orchestrator of Tumour Aggression and Immune Dysfunction
2025-Sep, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70814
PMID:40913484
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序分析，揭示了胶质母细胞瘤中NUCB2作为肿瘤侵袭和免疫功能障碍的关键调控因子 | 首次将NUCB2鉴定为胶质母细胞瘤中协调肿瘤细胞增殖和免疫调节功能的多功能调控因子，并揭示了其在肿瘤中心区域神经祖细胞样肿瘤细胞中的特异性上调 | 研究基于公共数据集，缺乏实验验证NUCB2在体内模型中的具体作用机制 | 阐明胶质母细胞瘤空间分子程序驱动肿瘤进展的机制 | 胶质母细胞瘤中心和外周区域的细胞群体 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两个公共数据集中的胶质母细胞瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 919 | 2026-01-20 |
Numbat-multiome: inferring copy number variations by combining RNA and chromatin accessibility information from single-cell data
2025-Aug-31, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf516
PMID:41104806
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Numbat-multiome的新算法，该算法通过结合单细胞RNA测序和染色质可及性数据来推断拷贝数变异 | Numbat-multiome扩展了原始Numbat算法的功能，使其能够从scRNA-seq和scATAC-seq数据中单独或整合地进行CNV推断，通过基于共同基因组坐标系统的分箱策略统一不同模态的数据 | NA | 开发一种能够从单细胞多组学数据中准确推断拷贝数变异的算法，以更好地理解癌症中的遗传和表观遗传变化 | 癌症样本，包括早期多发性骨髓瘤和由慢性淋巴细胞白血病引发的Richter综合征 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞RNA-seq数据, 单细胞ATAC-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 920 | 2026-01-20 |
Interpretable and integrative analysis of single-cell multiomics with scMKL
2025-Aug-06, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08533-7
PMID:40770488
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研究论文 | 介绍一种基于多核学习（scMKL）的创新方法，用于单细胞多组学数据的可解释和整合分析 | 结合复杂模型的预测能力和线性方法的可解释性，在单细胞多组学数据整合中实现高精度且可解释的结果，识别关键转录组和表观遗传特征及多模态通路 | NA | 提供一种可解释且整合的单细胞多组学分析方法，以增强对癌症生物学和肿瘤进展的理解 | 健康与癌性细胞群体，包括乳腺癌、淋巴癌、前列腺癌和肺癌 | 机器学习 | 乳腺癌, 淋巴癌, 前列腺癌, 肺癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 多组学分析 | 多核学习（MKL） | 单细胞多组学数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | 10x Multiome | NA |