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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
881 2026-08-23
Clofarabine Enhances the Transduction Efficiency of Recombinant AAV2 in the Retina
2025-05-01, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 本研究探讨了核苷酸还原酶抑制剂克罗拉滨增强重组腺相关病毒血清型2在小鼠视网膜中的转导效率及其机制 首次发现克罗拉滨能通过细胞周期同步化和转录重编程,安全增强rAAV2在视网膜中的转导效率 研究主要基于小鼠模型和细胞系,临床适用性及长期安全性需进一步验证 评估克罗拉滨增强rAAV2转导效率的潜力,并阐明其分子机制,以优化眼部基因治疗 ARPE-19细胞和小鼠视网膜 基因治疗与分子生物学 眼部疾病(基因治疗相关) RNA-seq, 单细胞RNA-seq 细胞系和小鼠模型 转录组数据 未明确样本数量,涉及ARPE-19细胞和小鼠视网膜 NA RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
882 2026-08-23
Recent Advances in Stem Cells of Corneal Epithelia
2025-05-01, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
review 综述角膜上皮干细胞的最新研究进展,包括其定位、群体维持和异质性 结合谱系追踪、活体成像和单细胞RNA测序等新技术,揭示了角膜上皮干细胞意想不到的特性 当前研究存在局限性,且角膜上皮干细胞领域内急需解决的关键问题尚未明确 阐明角膜上皮干细胞的基本特性,并探讨其在再生医学中治疗角膜疾病的潜力 角膜上皮干细胞 再生医学 角膜疾病 单细胞RNA测序 NA NA NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
883 2026-08-23
Single-Cell RNA Sequencing Revealed Functional Conjunctival Keratinocytes Loss via TGF-β-Wnt/β-Catenin Signaling in Sjögren's Syndrome Related Dry Eye
2025-04-01, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序技术揭示了干燥综合征相关干眼病中结膜功能性角质形成细胞通过TGF-β-Wnt/β-catenin信号通路丢失的机制 首次通过单细胞RNA测序技术全面解析干燥综合征结膜中实质细胞与免疫细胞的相互作用,发现TGF-β-Wnt/β-catenin轴下调功能性角质形成细胞的形成,并伴随促血管生成和促纤维化巨噬细胞及促炎T细胞的浸润 研究基于小鼠模型,未在人类样本中验证;样本量较小,可能限制了结果的普适性 探究结膜在干燥综合征相关干眼病病理生理中的作用,特别是功能性结膜上皮的改变 干燥综合征小鼠模型的结膜组织及细胞 单细胞转录组学 干燥综合征相关干眼病 单细胞RNA测序、T细胞受体测序、Western blot、免疫荧光、多重免疫组化、流式细胞术 Not applicable (未使用特定模型,而是基于小鼠模型和测序技术) 单细胞转录组数据、TCR测序数据、图像和流式细胞术数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Genomics单细胞RNA测序和TCR测序
884 2026-08-23
Spatial transcriptome and single-cell RNA sequencing reveal the molecular basis of cotton fiber initiation development
2025-03, The Plant journal : for cell and molecular biology
研究论文 结合空间转录组和单细胞RNA测序,构建了棉花胚珠在-1、0和1 DPA阶段的空间转录图谱,揭示了纤维起始发育的分子机制 首次构建棉花胚珠在不同发育阶段的空间转录组图谱,并整合单细胞RNA测序数据,发现关键基因SVB和SVBL在纤维起始中的功能冗余 未明确提及研究局限性 解析棉花纤维起始发育的分子基础,为提升皮棉产量提供见解 棉花胚珠(-1、0和1 DPA)及纤维细胞 单细胞转录组学、空间转录组学 NA 空间转录组测序、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据(空间转录组和单细胞转录组) 棉花胚珠样本,具体数量未明确 NA 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA NA
885 2026-08-23
Analysis of the Relationship Between NLRP3 and Alzheimer's Disease in Oligodendrocytes based on Bioinformatics and In Vitro Experiments
2025, Current Alzheimer research IF:1.8Q4
研究论文 基于生物信息学分析和体外实验,研究少突胶质细胞中NLRP3与阿尔茨海默病的关系 结合生物信息学分析和体外实验,首次在少突胶质细胞中验证NLRP3的高表达及其与AD的关联,并构建基于五个关键基因的诊断模型 研究基于公共数据集和体外实验,缺乏体内验证和临床样本验证 探讨少突胶质细胞中NLRP3与阿尔茨海默病的潜在关联,并构建诊断模型 少突胶质细胞中的NLRP3及相关基因 生物信息学、机器学习 阿尔茨海默病 基因表达谱分析、机器学习算法(LASSO、随机森林、SVM)、单细胞转录组学、RT-qPCR、免疫荧光、Western blot LASSO回归、随机森林、支持向量机 基因表达数据、单细胞转录组数据、实验数据 未明确样本数量,涉及多个公共数据集 NA bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq NA NA
886 2026-08-22
Secretory IgA dysfunction underlies poor prognosis in Fusobacterium-infected colorectal cancer
2025-12, Gut microbes IF:12.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析,探究具核梭杆菌(Fn)感染对结直肠癌(CRC)微环境中IgA浆细胞发育和分泌型IgA(sIgA)产生的破坏作用及其对预后的影响 首次揭示了Fn通过破坏与肿瘤相关巨噬细胞的通讯来损害IgA浆细胞发育和sIgA产生,并定义了一个失调的IgA成熟(IGAM)模块,可用于分层Fn阳性患者 未明确提及 阐明Fn影响结直肠癌肿瘤微环境及预后的机制,特别是对sIgA产生的影响 42例结直肠癌患者组织样本,以及无菌小鼠和具有完整肠道微生物组的CRC小鼠模型 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA-seq 未明确提及 单细胞转录组数据 42例结直肠癌患者组织,及两种小鼠模型 未明确提及 单细胞RNA-seq 未明确提及 未明确提及
887 2026-08-22
Tumor-derived RAC1A159V mutation promotes an immunosuppressive microenvironment that represses response to immune checkpoint inhibitor
2025-10-31, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本文通过基因编辑和单细胞测序揭示肿瘤来源的RAC1 A159V突变促进免疫抑制微环境并抑制免疫检查点抑制剂反应 首次揭示了RAC1 A159V突变通过上调糖鞘脂生物合成激活mTORC1信号,促进免疫冷肿瘤形成的机制,并提出了联合RAC1-mTOR信号靶向与免疫检查点抑制剂治疗免疫冷肿瘤的新策略 研究基于基因编辑的小鼠肿瘤模型,未涉及人类肿瘤样本的验证,且未详细探讨RAC1突变在其他癌症类型中的普遍性 阐明RAC1 A159V突变如何通过重塑肿瘤微环境导致免疫抑制和免疫治疗耐药,并探索潜在的治疗策略 携带内源性杂合或纯合RAC1 A159V突变的肿瘤细胞及免疫健全小鼠模型 机器学习 肿瘤 基因编辑, 流式细胞术, 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据, 流式细胞术数据 小鼠肿瘤样本(具体数量未在标题和摘要中提及) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 用于单细胞RNA测序,具体配置未在摘要中详细说明
888 2026-08-22
Circulating tumor cells as predictive biomarkers in the risk stratification of DCIS: Evidence of early dissemination
2025-10-31, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究探讨了循环肿瘤细胞作为导管原位癌风险分层预测生物标志物的潜力,并提供了早期播散的证据 首次将循环肿瘤细胞作为导管原位癌患者生物学侵袭性和早期播散的指标,并结合微流体富集、单细胞RNA测序及小鼠导管内模型进行验证 样本量较小(34例患者),且未明确循环肿瘤细胞检测的长期随访结果 评估循环肿瘤细胞作为导管原位癌患者风险分层和早期播散生物标志物的可行性 34例导管原位癌患者的循环肿瘤细胞、匹配的组织样本及健康对照 数字病理学 导管原位癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 34例导管原位癌患者及健康对照 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium 单细胞3'基因表达解决方案
889 2026-08-22
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Heterogeneity in Differentiation Trajectory and Tumor Microenvironment Leading to More Aggressive Phenotypes of Papillary Thyroid Cancer in Children and Young Adult Patients
2025-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 利用单细胞RNA测序揭示了儿童和年轻成人甲状腺乳头状癌的肿瘤生态系统异质性,包括细胞分化轨迹和肿瘤微环境差异。 首次揭示CAYA-PTC患者缺乏“轻度状态(BRAF样)”恶性甲状腺细胞群体,以及细胞外基质癌症相关成纤维细胞(emCAFs_LAMP5)在促进肿瘤血管生成和转移中的显著作用。 未说明具体限制,可能包括样本量有限和需要进一步验证。 研究儿童和年轻成人甲状腺乳头状癌的肿瘤生态系统异质性,以解释其更侵袭性的表型。 11例患者的肿瘤和癌旁组织中的单细胞转录组。 单细胞转录组学 甲状腺乳头状癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 11例患者的肿瘤和癌旁组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
890 2026-08-22
Large Language Models for Translational Cancer Informatics
2025-10, JCO clinical cancer informatics IF:3.3Q2
综述 该综述探讨了大语言模型在癌症研究中的应用,涵盖单细胞转录组学、空间转录组学和计算病理学领域,旨在展示其在精准肿瘤学中的潜力。 系统性地从细胞和病理两个角度全面概述了LLMs在癌症研究中的应用,并以2022至2025年间发表的24个模型为依据,提出了针对癌症领域进行模型微调和适应性优化的未来方向。 许多模型尚未针对癌症特定应用进行充分优化,缺乏领域特定的微调和可扩展的适应策略。 探索大语言模型在癌症研究中的应用,以推动精准肿瘤学的发展,并强调领域特定微调的必要性。 收录于2022至2025年间发表或预印本的24个大语言模型,以及它们处理的单细胞RNA测序、空间转录组和组织学图像数据。 自然语言处理 癌症 单细胞RNA测序、空间转录组学、组织学图像分析 大语言模型 文本、图像 24个大语言模型 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
891 2026-08-22
Single-Cell Transcriptomics of Human Pericarotid Lymph Nodes Indicating Stability of Carotid Atherosclerotic Plaques
2025-09-16, Journal of the American Heart Association IF:5.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学分析人颈动脉周围淋巴结,探讨其与颈动脉粥样硬化斑块稳定性的关联 首次在单细胞水平揭示颈动脉周围淋巴结在动脉粥样硬化斑块稳定性中的作用,提供了人类淋巴结在动脉粥样硬化中的全面单细胞转录组图谱 未明确提及研究的局限性 探讨颈动脉周围淋巴结与斑块稳定性的关系,并评估其作为斑块不稳定生物标志物的潜力 106例接受颈动脉内膜切除术的严重颈内动脉狭窄患者及其颈动脉周围淋巴结 单细胞转录组学 动脉粥样硬化 单细胞转录组测序、T/B细胞受体测序 NA 单细胞转录组数据、临床数据、组织学数据 106例患者 NA NA NA NA
892 2026-08-22
Single-cell epigenomic and transcriptomic analysis unveils the pivotal role of GATA5/ISL1+ fibroblasts in cardiac repair post-myocardial infarction
2025-08-14, Cardiovascular research IF:10.2Q1
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序,揭示了心肌梗死后心脏组织的表观遗传景观,并发现GATA5/ISL1+成纤维细胞在心脏修复中发挥关键作用 首次通过单细胞多组学整合分析发现两种新型成纤维细胞亚群(GATA5/ISL1+和Gli3high),并证实GATA5和ISL1通过共调控Wnt信号通路促进成纤维细胞向功能性心肌细胞转化 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;未深入探讨GATA5/ISL1+成纤维细胞在心脏修复中的具体分子机制 阐明心肌梗死后心脏组织的单细胞表观遗传和转录组景观,并鉴定心脏修复的关键调控因子 心肌梗死后不同时间点(1、3、7、14天)的小鼠心脏组织及人类心肌梗死患者的疤痕组织 单细胞表观基因组学、转录组学 心肌梗死 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 腺病毒介导的基因过表达, RNA测序, 蛋白质组学分析 NA 单细胞基因表达数据, 单细胞染色质可及性数据, RNA测序数据, 蛋白质组数据 小鼠心脏组织(多个时间点)及人类心肌梗死患者疤痕组织 NA 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 NA NA
893 2026-08-22
Deficiency of NPR-C triggers high salt-induced thoracic aortic dissection by impairing mitochondrial homeostasis
2025-07-08, Cardiovascular research IF:10.2Q1
研究论文 本研究探讨了NPR-C缺失在高盐诱导的胸主动脉夹层中的作用机制,发现其通过调节线粒体稳态发挥保护作用 首次揭示NPR-C在胸主动脉夹层中的保护作用,并阐明其通过ERK1/2-PPARγ-HADHB通路调控线粒体脂肪酸氧化的新机制 未明确说明研究的局限性 探究NPR-C在胸主动脉夹层发病机制中的作用及其分子机制 人类急性胸主动脉夹层患者主动脉组织、BAPN处理小鼠、NPR-C特异性敲除小鼠(VSMC和内皮细胞)、血管平滑肌细胞 数字病理学 胸主动脉夹层 转录组测序、单细胞测序、RNA-seq NA 基因表达数据、单细胞数据、组织病理图像 人类患者样本和多种小鼠模型,具体数量未明确 NA NA NA NA
894 2026-08-22
Peripheral blood neutrophils contribute to Claudin18.2-specific CAR-T cell treatment resistance in advanced gastric cancer
2025-Jun, British journal of cancer IF:6.4Q1
研究论文 本研究探讨外周血中性粒细胞对晚期胃癌中Claudin18.2特异性CAR-T细胞治疗耐药性的贡献,并揭示其分子机制 首次揭示中性粒细胞与淋巴细胞比率(NLR)在CAR-T治疗中的预后价值,并通过单细胞测序识别出与疾病进展相关的中性粒细胞亚群(NE-3)及其促肿瘤机制 需要进一步验证以及探索减轻中性粒细胞诱导免疫抑制的策略 评估NLR在CLDN18.2特异性CAR-T细胞治疗中的预后价值,并阐明治疗耐药的分子机制 接受CLDN18.2特异性CAR-T细胞治疗的晚期胃癌患者 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序 NA 外周血样本的基因表达数据 未在标题和摘要中明确 NA 单细胞RNA测序 NA NA
895 2026-08-22
Single-cell analysis reveals the implication of vascular endothelial cell-intrinsic ANGPT2 in human intracranial aneurysm
2025-05-06, Cardiovascular research IF:10.2Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析人类颅内动脉瘤及对照动脉,揭示血管内皮细胞中ANGPT2在动脉瘤形成和进展中的作用 首次通过高质量的单细胞转录组数据揭示内皮细胞在颅内动脉瘤中的转录组变化,并发现血管生成调节因子ANGPT2在动脉瘤形成中的新作用,为治疗提供潜在靶点 未明确说明研究的局限性 揭示人类颅内动脉瘤中细胞组成变化及血管内皮细胞的转录组变化,探究ANGPT2在动脉瘤发病机制中的作用 人类散发性颅内动脉瘤和对照动脉组织 单细胞转录组学 颅内动脉瘤 单细胞RNA测序 斑马鱼模型 单细胞转录组数据 43,462个细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
896 2026-08-22
Transcriptomics in the Study of Antiviral Innate Immunity
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
综述 本章节综述了多种转录组学技术在抗病毒天然免疫研究中的应用、重要性和实验流程 系统性地概述了从传统转录组技术到单细胞测序和空间转录组学的最新进展在抗病毒天然免疫领域的应用 未提及具体研究中的技术局限性 总结转录组学技术在抗病毒天然免疫研究中的作用和应用 抗病毒天然免疫相关的RNA分子 转录组学 病毒感染 RNA-seq、单细胞测序、空间转录组学 NA 转录组数据 NA NA NA NA NA
897 2026-08-22
PDGF-BB overexpressing dental pulp stem cells improve angiogenesis in dental pulp regeneration
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology IF:4.3Q2
研究论文 该研究通过单细胞RNA测序发现人牙髓中的PDGF阳性间充质亚群,并通过慢病毒载体过表达PDGF-BB增强牙髓干细胞的血管生成能力,促进牙髓再生中的血管形成 通过单细胞RNA测序鉴定出具有增强血管生成特征的PDGF阳性牙髓干细胞亚群,并利用PDGF-BB过表达策略增强干细胞的血管生成潜力,为牙髓再生提供了新的靶向细胞选择方法 研究主要基于体外和动物模型,临床应用的可行性和长期效果尚需进一步验证 探讨通过PDGF-BB过表达增强牙髓干细胞血管生成能力,以促进牙髓再生中的血管形成 人牙髓干细胞(DPSCs)及其PDGF阳性亚群 再生医学 牙髓损伤 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、多重免疫组化、慢病毒载体介导的基因过表达、CCK-8/Edu/细胞周期/transwell实验、HUVECs共培养、大鼠肾包膜移植 NA 单细胞转录组数据、图像数据、细胞增殖和迁移数据 人牙髓样本、大鼠移植模型 10x Genomics 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'转录组测序
898 2026-08-21
Human microbiota influence the immune cell composition and gene expression in the tumor environment of a murine model of glioma
2025-12, Gut microbes IF:12.2Q1
研究论文 本研究利用两种人源化微生物组小鼠模型,通过单细胞RNA测序揭示肠道微生物群影响胶质瘤微环境中免疫细胞组成和基因表达,并影响抗PD-1治疗反应 首次使用两种不同人源化微生物组小鼠模型结合scRNA-seq,探究人肠道微生物群对胶质瘤免疫微环境和抗PD-1疗效的影响 信息未提供 研究人肠道微生物群如何影响小鼠胶质瘤微环境中免疫细胞浸润和基因表达,以及对抗PD-1治疗的反应 两种人源化微生物组小鼠(HuM1和HuM2)的胶质瘤肿瘤免疫细胞 免疫学 胶质瘤 16S rRNA测序、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 两种人源化微生物组小鼠品系,具体数量未提供 NA 单细胞RNA测序 NA NA
899 2026-08-21
Gut microbial Nordihydroguaiaretic acid suppresses macrophage pyroptosis to regulate epithelial homeostasis and inflammation
2025-12, Gut microbes IF:12.2Q1
研究论文 本研究探讨了肠道微生物产生的去甲二氢愈创木酸通过抑制巨噬细胞焦亡来调节上皮稳态和炎症的机制 首次揭示衰老相关的菌群失调导致NDGA减少,进而通过GSDMD/NR4A1/NLRP3轴调控巨噬细胞焦亡,加重结肠炎 未明确NDGA对巨噬细胞焦亡的具体分子机制,且研究主要在动物模型中进行,临床验证有限 探究衰老相关的肠道菌群失调及其代谢物在加重炎症性肠病中的作用和机制 小鼠模型(野生型和IL-10缺陷)、IBD患者和老年人粪便样本 微生物组学 炎症性肠病 16S rDNA测序、代谢组学、单细胞RNA测序 NA 微生物序列数据、代谢物数据、单细胞转录组数据 小鼠(具体数量未提供)、IBD患者和老年人(具体数量未提供) NA 16S rDNA测序、代谢组学、单细胞RNA测序 NA NA
900 2026-08-21
Stereo cell: A new approach to the next generation of clinical precision medicine
2025-12, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
评论 本文提出“立体细胞生物医学”作为下一代精准医学的新方法,强调从基因组数据转向单细胞的多维时空复杂性。 提出“立体细胞生物医学”这一新兴学科,整合立体单细胞多组学、空间转录组学和单细胞表面组学,强调分子时空位置和蛋白质相互作用的重要性。 摘要未明确提及局限性,但作为评论文章,可能缺乏实验验证。 探讨立体细胞生物医学作为下一代精准医学的新方法,促进精准医学发展。 单细胞、组织中的细胞间相互作用以及细胞器界面和细胞表面的蛋白质。 生物信息学 不适用的 立体单细胞多组学(Stereo Cell-seq)、空间转录组学(Stereo-seq)、单细胞表面组学(sc-surfaceome) 不适用的 单细胞数据、空间转录组数据、表面组数据 不适用的 不适用的 单细胞多组学、空间转录组学、单细胞表面组学 不适用的 不适用的
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