单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 3310 篇文献，本页显示第 881 - 900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 881 | 2025-04-03 |
A novel lactylation-related gene signature to predict prognosis and treatment response in lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1549724
PMID:40161374
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研究论文 | 研究通过构建乳酸化相关基因特征模型，预测肺腺癌患者的预后和治疗反应 | 首次在肺腺癌中研究乳酸化相关基因特征，并构建风险预后模型，探索其与免疫浸润和化疗药物敏感性的关系 | 研究主要基于TCGA和GEO数据库的RNA测序数据，需要进一步实验验证 | 探索乳酸化相关基因特征在肺腺癌中的作用及其临床意义 | 肺腺癌患者和细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | RNA测序，单细胞测序，CCK8实验，transwell实验 | LASSO回归分析，列线图 | RNA测序数据，单细胞测序数据 | 来自TCGA和GEO数据库的肺腺癌患者样本 |
| 882 | 2025-04-03 |
Early Detection of Malignant Cells in Gastric Lavage via Hexokinase 2 and Single-Cell Sequencing for Gastric Cancer Diagnosis
2025, Risk management and healthcare policy
IF:2.7Q2
DOI:10.2147/RMHP.S510123
PMID:40161902
|
research paper | 本研究提出了一种通过检测胃灌洗液中脱落的肿瘤细胞来早期诊断胃癌的创新方法 | 利用HK2代谢标记物和单细胞测序技术识别胃灌洗液中的高糖酵解活性肿瘤细胞，为胃癌早期诊断提供了新方法 | 样本量较小（60人），对严重不典型增生的敏感性仅为57% | 开发一种非侵入性的胃癌早期诊断方法 | 胃灌洗液中的脱落肿瘤细胞 | digital pathology | gastric cancer | single-cell sequencing (SCS), genome-wide copy number variation analysis | NA | single-cell sequencing data | 60人（10例胃癌患者，26例癌前病变患者，15例良性胃病患者，9例健康对照） |
| 883 | 2025-04-03 |
Analysis and Validation of Mitophagy-Related Genes in Diabetic Foot Ulcers
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S504001
PMID:40162084
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研究论文 | 本研究旨在鉴定与糖尿病足溃疡(DFU)发病和进展相关的线粒体自噬枢纽基因，并分析其免疫细胞浸润特征和单细胞表达谱 | 首次发现ANO6和ALDH2两个枢纽基因在DFU组织中显著下调，并证实其诊断潜力及与免疫细胞浸润的关联 | 需要更大样本量的队列研究以及更深入的炎症机制探索才能将发现转化为治疗策略 | 探索线粒体自噬相关基因在糖尿病足溃疡发病机制中的作用 | 糖尿病足溃疡患者的皮肤组织 | 生物信息学 | 糖尿病足溃疡 | limma差异分析、GSEA富集分析、机器学习算法、CIBERSORT免疫浸润分析、scRNA-seq、RT-PCR、Western blot | 机器学习算法 | 基因表达数据 | GSE80178和GSE68183数据集中的DFU样本 |
| 884 | 2025-04-03 |
scCCTR: An iterative selection-based semi-supervised clustering model for single-cell RNA-seq data
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.03.018
PMID:40165824
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研究论文 | 提出了一种名为scCCTR的新型半监督聚类算法，用于单细胞RNA测序数据的细胞聚类 | 通过迭代选择高置信度细胞和标签指导深度学习模型，结合Transformer神经网络的多头注意力机制提高聚类精度 | 未明确提及具体局限性 | 提高单细胞RNA测序数据聚类的准确性和有效性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | Transformer | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本量 |
| 885 | 2025-04-03 |
Inflammation and cancer: molecular mechanisms and clinical consequences
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1564572
PMID:40165901
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综述 | 本文综述了炎症与癌症之间的分子机制及其临床后果，强调了癌症相关炎症在肿瘤进展和治疗反应中的作用 | 结合单细胞RNA测序和空间分子成像分析等先进技术，阐明了慢性炎症与癌症之间的关联通路 | 主要关注胃肠道癌症，可能不适用于所有癌症类型 | 探讨炎症与癌症之间的分子和细胞机制及其对癌症进展和治疗反应的影响 | 癌症相关炎症、肿瘤微环境(TME)中的癌细胞、免疫细胞、基质细胞及可溶性分子 | NA | 癌症 | 单细胞RNA测序、空间分子成像分析 | NA | NA | NA |
| 886 | 2025-04-03 |
T-cell receptors identified by a personalized antigen-agnostic screening approach target shared neoantigen KRAS Q61H
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1509855
PMID:40165973
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研究论文 | 本文提出了一种个性化抗原无关筛选方法，用于识别靶向共享新抗原KRAS Q61H的T细胞受体 | 开发了一种抗原无关的方法，直接识别肿瘤特异性T细胞克隆型，并通过TCR-T细胞制造推进了ACT治疗 | 研究样本量较小，仅分析了7名NSCLC患者 | 开发一种无需预先知道靶抗原的TCR筛选方法，以扩大ACT治疗的适用性 | 非小细胞肺癌（NSCLC）患者中的肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）和邻近组织驻留淋巴细胞 | 免疫治疗 | 肺癌 | scRNA-Seq, TCRβ-chain repertoire分析 | NA | 基因表达数据, TCR序列数据 | 7名NSCLC患者 |
| 887 | 2025-04-03 |
Identification of immune characteristic biomarkers and therapeutic targets in cuproptosis for rheumatoid arthritis by integrated bioinformatics analysis and single-cell RNA sequencing analysis
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1520400
PMID:40166070
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研究论文 | 通过整合生物信息学分析和单细胞RNA测序分析，识别类风湿性关节炎中铜死亡相关的免疫特征生物标志物和治疗靶点 | 首次在类风湿性关节炎中系统研究了铜死亡相关基因的表达变化及其生物学功能，并探索了其与免疫浸润和潜在治疗药物的关联 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证 | 阐明铜死亡相关基因与类风湿性关节炎的潜在关联，寻找新的生物标志物和治疗靶点 | 类风湿性关节炎患者和对照组的铜死亡相关基因 | 生物信息学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 888 | 2025-04-03 |
A dynamic peripheral immune landscape during human pregnancy
2025-Jan, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2022.06.011
PMID:40166108
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了孕妇外周血单个核细胞在妊娠不同阶段的动态转录变化，探讨了母体免疫系统的适应性变化 | 提出了妊娠对免疫系统的促衰老作用的新观点，并发现这种作用可能在产后恢复 | 研究仅关注了外周血单个核细胞，未涉及其他免疫组织或细胞类型 | 阐明妊娠期间母体免疫系统的动态变化及其与疾病风险的关系 | 妊娠期女性的外周血单个核细胞 | 免疫学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 妊娠不同阶段的孕妇外周血单个核细胞样本 |
| 889 | 2025-04-02 |
Comprehensive single-cell profiling of T and B cell subsets in mice reveals impacts on memory immune responses in FMDV infection
2025-May, Virology
IF:2.8Q3
DOI:10.1016/j.virol.2025.110496
PMID:40090183
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序技术，全面分析了小鼠T细胞和B细胞亚群在口蹄疫病毒(FMDV)感染中对记忆免疫反应的影响 | 首次利用单细胞RNA测鉴定了小鼠脾脏中大多数T和B细胞亚群的特定基因标记，揭示了FMDV感染对记忆细胞功能的独特影响机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在更大动物模型或人体中进行验证 | 探究FMDV感染对记忆免疫反应的影响机制 | 小鼠脾脏中的T细胞和B细胞亚群 | 免疫学 | 口蹄疫 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量的小鼠脾脏细胞 |
| 890 | 2025-04-02 |
Central FGF19 signaling enhances energy homeostasis and adipose tissue thermogenesis through sympathetic activation in obese mice
2025-Apr-01, American journal of physiology. Endocrinology and metabolism
DOI:10.1152/ajpendo.00488.2024
PMID:40059865
|
research paper | 研究探讨了中枢FGF19信号通过激活交感神经增强肥胖小鼠能量稳态和脂肪组织产热的机制 | 揭示了FGF19不仅通过减少食物摄入，还能通过激活交感神经增强白色和棕色脂肪组织的产热作用 | 研究主要在肥胖小鼠模型中进行，人类中的效果尚不明确 | 探究中枢FGF19信号对肥胖小鼠能量稳态和脂肪组织产热的影响 | 饮食诱导的肥胖（DIO）小鼠 | 代谢研究 | 肥胖症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 肥胖小鼠模型 |
| 891 | 2025-04-02 |
Integrated multi-omics analyses provide new insights into genomic variation landscape and regulatory network candidate genes associated with walnut endocarp
2025-Apr, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70113
PMID:40162720
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析，揭示了核桃内果皮发育和壳厚度的遗传变异和调控网络候选基因 | 构建了核桃品种'湘灵'的高质量基因组组装和八个核桃物种的图形结构泛基因组，通过GWAS鉴定了与核桃驯化和改良相关的19个位点，并通过多组学分析揭示了与次生细胞生物合成和木质素积累相关的候选基因 | 研究主要集中于核桃内果皮发育和壳厚度的遗传变异，对其他性状的遗传基础研究较少 | 系统阐明核桃内果皮发育和壳厚度的遗传变异和调控网络 | 波斯核桃（Juglans regia）及其八个近缘种 | 基因组学 | NA | 多组学分析（包括转录组学、代谢组学、DNA甲基化和空间转录组学）和GWAS | NA | 基因组序列、转录组数据、代谢组数据、DNA甲基化数据和空间转录组数据 | 285个核桃种质资源 |
| 892 | 2025-04-02 |
scPANDA: PAN-Blood Data Annotator with a 10-Million Single-Cell Atlas
2025-Apr-01, Chinese medical sciences journal = Chung-kuo i hsueh k'o hsueh tsa chih
DOI:10.24920/004472
PMID:40164519
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research paper | 开发了一个名为scPANDA的PAN-blood单细胞数据注释工具，利用包含1000万个细胞的图谱进行精确的细胞类型注释 | 利用大规模单细胞图谱进行细胞类型注释，采用三层推断方法逐步细化细胞类型 | 未提及具体的技术限制或潜在问题 | 提高血液系统中细胞类型注释的准确性和可靠性 | 血液系统中的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 来自16项研究的1000万个细胞 |
| 893 | 2025-04-02 |
Enhancer Extrachromosomal Circular DNA ANKRD28 Elicits Drug Resistance via POU2F2-Mediated Transcriptional Network in Multiple Myeloma
2025-Apr-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202415695
PMID:40167268
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研究论文 | 本文研究了多发性骨髓瘤(MM)中药物抵抗的机制，特别是通过增强子环状DNA ANKRD28 (eccANKRD28)介导的转录网络 | 首次揭示了非编码环状DNA作为增强子在多发性骨髓瘤药物抵抗中的作用，并阐明了POU2F2介导的转录调控网络 | 研究主要基于体外和动物模型，临床样本数量有限，需要进一步验证 | 探索多发性骨髓瘤药物抵抗的分子机制 | 多发性骨髓瘤患者血清样本和耐药细胞系 | 表观遗传学 | 多发性骨髓瘤 | H3K27ac ChIP-seq, scRNA-seq, scATAC-seq, CUT&Tag, CRISPR/Cas9 | NA | 基因组数据、转录组数据、表观遗传数据 | 多发性骨髓瘤患者血清样本和耐药细胞系(具体数量未明确说明) |
| 894 | 2025-04-02 |
Inflammatory Milieu by Crosstalk between Glomerulus and Proximal Tubular Cells in Type 2 Diabetes Mellitus Kidney Disease
2025-Mar-31, Diabetes & metabolism journal
IF:6.8Q1
DOI:10.4093/dmj.2024.0535
PMID:40160027
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序等技术，探讨了2型糖尿病肾病中肾小球和近端肾小管细胞间的炎症相互作用 | 首次在诱导型2型糖尿病肾病模型中应用单细胞RNA测序技术，并验证了CXCL12介导的T细胞浸润的关键作用 | 研究结果仍需在更大规模的人类样本中进一步验证 | 探索2型糖尿病肾病中肾小球和近端肾小管细胞间的炎症相互作用机制 | 诱导型2型糖尿病肾病小鼠模型及人类肾脏活检组织 | digital pathology | diabetic kidney disease | scRNA-seq, flow cytometry, histological analysis | NA | RNA-seq data, histological images, flow cytometry data | 诱导型T2DKD小鼠模型及人类肾脏活检组织（具体数量未明确说明） |
| 895 | 2025-04-02 |
Srsf3-Dependent APA Drives Macrophage Maturation and Limits Atherosclerosis
2025-Mar-31, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.326111
PMID:40160097
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research paper | 该研究揭示了Srsf3依赖的APA（选择性多聚腺苷酸化）在巨噬细胞成熟和动脉粥样硬化中的保护作用 | 首次揭示了Srsf3通过调控线粒体相关基因Aars2的3'UTR长度影响线粒体翻译效率，进而调控巨噬细胞成熟和动脉粥样硬化进程的分子机制 | 研究主要基于Apoe-/-小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究单核/巨噬细胞亚型在动脉粥样硬化斑块中的转化轨迹及其调控机制 | Apoe-/-小鼠动脉斑块中的单核/巨噬细胞亚型 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、3'端测序、流式细胞术、组织病理学分析、多核糖体分析、代谢组学分析 | NA | RNA测序数据、流式细胞数据、代谢组数据 | Apoe-/-小鼠动脉斑块样本及部分人类斑块样本 |
| 896 | 2025-04-02 |
Understanding psoriatic disease at single-cell resolution: an update
2025-Mar-31, Current opinion in rheumatology
IF:5.2Q1
DOI:10.1097/BOR.0000000000001085
PMID:40160177
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综述 | 本文综述了单细胞技术在银屑病研究中的最新进展，包括单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学，揭示了银屑病的细胞多样性及其在疾病进展中的关键作用 | 利用单细胞和空间转录组学技术揭示了银屑病中免疫细胞、角质形成细胞和成纤维细胞的亚型及其相互作用，特别是IL-17/IL-36和PRSS3-F2R通路的作用，以及代谢失调在慢性炎症中的关键角色 | NA | 探讨单细胞技术在银屑病研究中的应用及其对疾病机制的理解和治疗策略的影响 | 银屑病中的免疫细胞、角质形成细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | scRNA-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 897 | 2025-04-02 |
PPY-Induced iCAFs Cultivate an Immunosuppressive Microenvironment in Pancreatic Cancer
2025-Mar-31, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202413432
PMID:40162859
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研究论文 | 本研究揭示了胰腺多肽（PPY）在胰腺导管腺癌（PDAC）中通过诱导炎症性癌症相关成纤维细胞（iCAFs）塑造免疫抑制微环境的新机制 | 首次发现PPY作为iCAFs的新型诱导剂，并验证其通过非经典NF-κB通路激活的机制，为PDAC免疫治疗提供了新靶点 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人体临床试验中验证PPY靶向治疗的效果 | 探索PDAC免疫抑制微环境形成机制并寻找改善免疫治疗疗效的新策略 | 胰腺导管腺癌（PDAC）微环境中的炎症性癌症相关成纤维细胞（iCAFs） | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、多重免疫组化（mIHC）、免疫共沉淀-质谱分析、分子对接 | KPC（Kras; Trp53; Pdx1-Cre）小鼠原位移植瘤模型 | 单细胞转录组数据、蛋白质组数据、影像数据（PET-CT） | 人类PDAC组织微阵列、小鼠模型及共培养实验样本（具体数量未明确说明） |
| 898 | 2025-04-02 |
Spatial transcriptomics of progression gene signature and tumor microenvironment leading to progression in mycosis fungoides
2025-Mar-31, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2024014495
PMID:40163757
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术，探究了蕈样肉芽肿（MF）疾病进展过程中的基因表达变化和肿瘤微环境特征 | 首次系统揭示了MF从斑片期到斑块期再到肿瘤期的动态转录组变化特征，并发现M2巨噬细胞和癌症相关成纤维细胞（CAF）在早期MF进展中的关键作用 | 样本量相对有限，且未进行长期预后随访验证 | 识别早期MF患者疾病进展的生物标志物和微环境特征 | 蕈样肉芽肿（MF）患者组织样本 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 空间转录组学、免疫组织化学染色 | NA | 转录组数据、免疫组化图像 | 未明确说明具体样本数量，包含斑片期MF、斑块期MF和肿瘤期MF多阶段样本 |
| 899 | 2025-04-02 |
IFN-γ promotes the progression of iMCD by activating inflammatory monocytes
2025-Mar-31, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024027689
PMID:40163892
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序技术探索了特发性多中心Castleman病(iMCD)患者的免疫景观，揭示了IL-6和IFN-γ在疾病进展中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示iMCD中CCL单核细胞通过IFN-II信号通路与特定NK/NKT细胞相互作用，并发现血清IFN-γ水平与疾病严重程度和治疗抵抗呈正相关 | 样本量较小(15例患者和4例健康对照)，且部分发现需要在大规模独立队列中进一步验证 | 探索iMCD的免疫发病机制，寻找早期预后分层标志物和新治疗靶点 | 特发性多中心Castleman病(iMCD)患者的外周血单个核细胞(PBMCs)、淋巴结和骨髓样本 | 免疫学 | Castleman病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 15例iMCD患者和4例健康对照的外周血样本，以及部分淋巴结和骨髓样本 |
| 900 | 2025-04-02 |
Targeting IGF1-Induced Cellular Senescence to Rejuvenate Hair Follicle Aging
2025-Mar-30, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70053
PMID:40159808
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research paper | 该研究探讨了IGF-1信号通路在毛囊衰老中的作用，并提出了针对性的干预措施 | 揭示了IGF-1过度表达通过触发毛囊干细胞衰老导致毛囊老化的新机制，并验证了通过干预IGF-1信号通路下游机制来恢复毛囊健康的潜在治疗方法 | 研究主要基于小鼠模型，人类皮肤中的验证数据有限 | 探究IGF-1信号通路如何调控器官衰老，特别是毛囊老化过程 | 小鼠和人类皮肤中的毛囊干细胞 | geriatric disease | geriatric disease | 单细胞RNA测序 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据 | 转基因小鼠和对照小鼠的皮肤样本 |