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当前共找到 10619 篇文献，本页显示第 881 - 900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 881 | 2026-01-23 |
Segger: Fast and accurate cell segmentation of imaging-based spatial transcriptomics data
2025-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.14.643160
PMID:40161614
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研究论文 | 本文介绍了一种名为segger的快速准确细胞分割方法，用于成像空间转录组学数据 | 提出了一种基于异构图表示和图神经网络的细胞分割方法，将细胞分割视为转录本到细胞的链接预测任务，并利用单细胞RNA-seq信息改进转录本分配 | NA | 解决成像空间转录组学中转录本准确分配到细胞的问题 | 成像空间转录组学数据 | 计算机视觉 | NA | 成像空间转录组学 | 图神经网络 | 图像 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | NA |
| 882 | 2026-01-23 |
LST1: a novel biomarker for efferocytosis in the co-occurrence of type 2 diabetes mellitus and clear cell renal cell carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1737749
PMID:41488617
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，识别出LST1是2型糖尿病与肾透明细胞癌共病的关键调控基因，并验证了其在巨噬细胞介导的胞葬作用及免疫调控中的核心作用 | 首次发现LST1作为T2DM与ccRCC共病的关键调控因子，揭示了其在连接两种疾病的免疫调控通路中的新作用，为研究糖尿病与恶性肿瘤共存的免疫机制提供了新框架 | 研究主要基于公共数据库的单细胞转录组数据，虽然进行了体内外验证，但样本来源和数量可能有限，且具体分子机制有待进一步深入探索 | 识别T2DM与ccRCC共病的共同分子通路和新型生物标志物 | 2型糖尿病和肾透明细胞癌的共病模型 | 生物信息学 | 肾透明细胞癌, 2型糖尿病 | 单细胞转录组测序, 机器学习算法, GSEA算法, 体内外实验验证 | 机器学习算法（未指定具体模型） | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 883 | 2026-01-23 |
scVAR: integrating genomics and transcriptomics from single-cell RNA-seq -insights from leukemia case studies
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1604484
PMID:41555915
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研究论文 | 本文介绍了scVAR，一种利用变分自编码器从单细胞RNA测序数据中学习和整合遗传变异的计算框架，应用于白血病案例研究 | 开发了基于交叉注意力融合层的编码器-解码器架构，将转录组和变异信息整合到统一潜在表示中，增强了在噪声和稀疏条件下检测细微细胞差异的能力 | 由于使用3' scRNA-seq，变异检测仅限于捕获区域 | 整合单细胞RNA测序中的基因组和转录组信息，以更好地表征细胞状态和疾病过程 | 急性髓系白血病（AML）和急性淋巴细胞白血病（ALL） | 机器学习 | 白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 变分自编码器（VAE） | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 884 | 2026-01-22 |
Transient interferon-driven NK cell activation in acute hepatitis C
2025-Dec-27, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiaf654
PMID:41453396
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研究论文 | 本研究通过流式细胞术和单细胞测序技术，探讨了急性丙型肝炎病毒感染期间自然杀伤（NK）细胞的动态变化及其在抗病毒反应中的作用 | 首次在急性丙型肝炎患者中，通过纵向采样结合单细胞测序，识别出一个具有强烈I型干扰素印记的高度激活NK细胞亚群，并揭示了其在病毒清除后的动态变化 | 研究样本量可能有限，且未详细探讨NK细胞激活的具体分子机制或长期功能影响 | 探究急性丙型肝炎病毒感染期间NK细胞的免疫反应特征及其与病毒清除的关系 | 急性丙型肝炎患者、慢性丙型肝炎患者和健康对照者 | 数字病理学 | 丙型肝炎 | 流式细胞术, 单细胞RNA-seq | NA | 细胞表型数据, 转录组数据 | 纵向采样的急性丙型肝炎患者、慢性丙型肝炎患者和健康对照者（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 885 | 2026-01-22 |
Spatial transcriptomics uncovers unique tumor microenvironments in folliculotropic versus classic mycosis fungoides
2025-Dec-01, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.11.013
PMID:41338334
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，揭示了滤泡性蕈样肉芽肿与经典型蕈样肉芽肿之间肿瘤微环境的差异 | 首次应用空间转录组学技术，在空间分辨率上直接比较了滤泡性蕈样肉芽肿（FMF）和经典型蕈样肉芽肿（MF）的肿瘤微环境，明确了恶性T细胞在滤泡微环境中的独特表型和代谢适应性 | 研究样本量未明确说明，且研究结果主要基于转录组数据，缺乏蛋白质水平的功能验证 | 探究滤泡性蕈样肉芽肿（FMF）相较于经典型蕈样肉芽肿（MF）更具临床侵袭性的肿瘤微环境机制 | 滤泡性蕈样肉芽肿（FMF）和经典型蕈样肉芽肿（MF）患者的皮肤组织样本 | 空间转录组学 | 皮肤T细胞淋巴瘤（蕈样肉芽肿） | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 886 | 2026-01-22 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Identifies a Novel OLR1+ SLC7A7+ Liver-Enriched Metastatic Subset With Immunometabolic Rewiring in Pancreatic Cancer
2025-Nov, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71345
PMID:41176774
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，识别出一种新型的OLR1+ SLC7A7+肝脏富集转移亚群（LEMS），并揭示了其在胰腺癌肝转移中的免疫代谢重编程机制 | 首次识别并验证了LEMS这一终末分化的恶性细胞亚群，其特征为代谢重编程和免疫抑制通路超活化，并发现其与SPP1+巨噬细胞通过配体-受体网络相互作用，驱动侵袭和免疫逃逸 | 需要扩大临床队列和体内模型来全面阐明LEMS与巨噬细胞之间的具体机制性相互作用 | 识别驱动PDAC肝转移的关键细胞亚群，阐明其与转移微环境的相互作用，并定义肝脏定植的潜在机制 | 胰腺导管腺癌（PDAC）的原发肿瘤（PT）和肝转移（LM）样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 来自PDAC PT和LM患者的临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 887 | 2026-01-22 |
Integration of Transcriptome Profiling and Single-Cell Sequencing Analysis to Establish a CD8+ T Cell-Related Prognostic Model for Patients With NSCLC: From Assessment to Therapy
2025-Nov, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71337
PMID:41223031
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组分析和单细胞测序，构建了一个基于CD8+ T细胞的预后模型，用于非小细胞肺癌患者的精准预后评估和免疫治疗决策 | 首次结合加权基因共表达网络分析和单细胞测序技术，识别出CD52、CD69和PLIN2作为生物标志物，构建了高精度的CD8+ T细胞相关风险模型，并开发了临床预后列线图 | 研究依赖于公共数据集（TCGA-NSCLC、GSE183219、GSE42127），可能受到样本异质性和数据质量的限制，且模型需要在独立的前瞻性队列中进行进一步验证 | 开发一个CD8+ T细胞相关的预后模型，以改善非小细胞肺癌患者的预后评估和免疫治疗临床决策 | 非小细胞肺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 转录组分析，单细胞测序 | LASSO回归，Cox回归，列线图 | 基因表达数据，单细胞数据 | 三个公共数据集（TCGA-NSCLC、GSE183219、GSE42127）中的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 888 | 2026-01-22 |
Lyz1-Expressing Alveolar Type II Cells Contribute to Lung Regeneration
2025, Journal of respiratory biology and translational medicine
DOI:10.70322/jrbtm.2025.10011
PMID:41550210
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别并表征了一个表达Lyz1的肺泡II型细胞亚群，揭示了其在肺损伤后肺泡再生中的关键作用 | 首次发现并定义了表达Lyz1的AT2细胞作为一个先前未被识别的肺泡祖细胞群，扩展了肺泡再生的范式 | NA | 探究异质性肺泡II型细胞在肺修复中的贡献 | 小鼠肺组织中的肺泡II型细胞亚群 | 单细胞生物学 | 肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 889 | 2026-01-22 |
Single-cell RNA sequencing unraveled immune-related expression heterogeneity and lymphoid cell development dysregulation in childhood asthma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1606650
PMID:41550933
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了儿童哮喘患者与健康对照的外周血单个核细胞，揭示了免疫相关表达异质性和淋巴细胞发育失调在儿童哮喘中的作用 | 首次在单细胞水平上系统揭示了儿童哮喘中免疫细胞发育轨迹的异常模式，并识别了JUN、SPI1等关键基因及S100A家族蛋白的普遍上调，为理解哮喘的分子机制提供了新视角 | 样本量较小（仅3例患者和4例对照），且未涉及组织特异性分析，可能限制结果的普适性 | 阐明免疫失调在儿童哮喘发病机制中的作用 | 儿童哮喘患者和健康对照的外周血单个核细胞（PBMCs） | 单细胞组学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3例儿童哮喘患者和4例年龄匹配的健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 890 | 2026-01-22 |
Role of SUV39H2 in shaping the malignant phenotype of triple-negative breast cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1679640
PMID:41551146
|
研究论文 | 本研究探讨了SUV39H2在三阴性乳腺癌中的表达模式、临床相关性及功能作用 | 首次系统分析SUV39H2在多种癌症中的表达，并验证其在TNBC中的促癌功能 | 临床实用性需进一步验证，样本量有限 | 阐明SUV39H2在TNBC恶性表型中的作用 | 三阴性乳腺癌细胞系及患者样本 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、免疫组化、Western印迹、功能实验 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 5对TNBC患者样本，MDA-MB-231和Hs-578T细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 891 | 2026-01-22 |
Research progress of stem cells in the treatment of atherosclerosis
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1722416
PMID:41552013
|
综述 | 本文系统综述了干细胞在治疗动脉粥样硬化中的研究进展，包括其作用机制、动物实验与临床试验证据、当前面临的挑战以及未来的优化策略与应用前景 | 聚焦于2023-2025年的最新研究证据，并提出了结合单细胞测序、类器官模型和精准递送系统等前沿技术来推动干细胞临床转化的具体实施路径 | 本文为综述性文章，未报告原始实验数据，其分析基于对现有文献的总结 | 总结干细胞治疗动脉粥样硬化的研究进展，分析核心挑战，并探讨促进其临床转化的未来方向 | 间充质干细胞、诱导多能干细胞、内皮祖细胞等用于治疗动脉粥样硬化的干细胞类型 | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 892 | 2026-01-22 |
Bu-Yi-Xin-Shen formula targets monocytes through PI3K-Akt/NF-κB signaling in post-percutaneous coronary intervention angina
2025, American journal of translational research
IF:1.7Q4
DOI:10.62347/CMPK4691
PMID:41552316
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，探讨了补益心肾方治疗经皮冠状动脉介入术后心绞痛的机制 | 结合生物信息学、分子对接、单细胞RNA测序和体内实验，首次系统揭示了补益心肾方通过靶向单核细胞中的PI3K-Akt/NF-κB信号通路发挥治疗作用 | 研究主要基于动物实验和生物信息学预测，缺乏临床样本的直接验证，且活性成分的具体体内药效学需进一步确认 | 探究补益心肾方治疗经皮冠状动脉介入术后心绞痛的作用机制 | 单核细胞及相关信号通路（PI3K-Akt、NF-κB） | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、分子对接、蛋白质-蛋白质相互作用网络分析、功能富集分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 893 | 2026-01-22 |
Visualizing stability: a sensitivity analysis framework for t-SNE embeddings
2025, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2025.1719516
PMID:41552665
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研究论文 | 本文提出一个计算框架，用于扩展标准t-SNE图，通过可视化线索展示t-SNE嵌入的稳定性 | 结合隐函数定理与自动微分进行敏感性分析，计算嵌入对输入数据的敏感性，并通过雅可比矩阵热图可视化特征影响和结构不稳定区域 | 未明确讨论框架的计算复杂度或在大规模数据集上的可扩展性限制 | 开发一个框架来评估t-SNE嵌入的稳定性和可解释性，以增强生物信息学中的科学结论严谨性 | 高维生物数据，包括批量RNA-seq、蛋白质组学和单细胞转录组学数据集 | 机器学习 | NA | t-SNE, 敏感性分析, 自动微分 | t-SNE | 高维数据 | 三个不同的生物数据集 | NA | bulk RNA-seq, proteomics, single-cell transcriptomics | NA | NA |
| 894 | 2026-01-22 |
Emerging technologies and current challenges in intratumoral microbiota research
2025, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2025.1685862
PMID:41552720
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综述 | 本文综述了肿瘤内微生物组研究中的新兴技术、当前挑战以及未来的发展方向 | 系统性地总结了用于克服肿瘤内微生物低生物量检测挑战的新兴技术，包括改进的污染控制策略、高分辨率检测方法以及人工智能辅助的多组学整合分析，并指出了该领域从描述性研究向机制理解和临床转化发展的趋势 | NA | 探讨肿瘤内微生物组研究领域的技术挑战、最新进展及未来前景，以推动该领域向机制研究和临床转化发展 | 肿瘤内微生物组 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 厌氧培养优化, 基因组解析分析, 酶水平分析, 人工智能辅助分析 | NA | 微生物组数据, 临床数据, 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 895 | 2026-01-22 |
Tumor-like characteristics of vascular smooth muscle cells in atherosclerosis
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1734123
PMID:41552822
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综述 | 本文综述了动脉粥样硬化中血管平滑肌细胞表现出的类肿瘤特征，包括DNA损伤、基因组不稳定性、逃避衰老、过度增殖、迁移与侵袭激活、癌症干细胞样特性以及癌症相关信号通路激活 | 通过谱系追踪和单细胞转录组学技术，揭示了血管平滑肌细胞在动脉粥样硬化中表现出高度可塑性和类肿瘤特征，这一发现挑战了传统观点 | NA | 探讨动脉粥样硬化中血管平滑肌细胞的类肿瘤特征，为针对血管平滑肌细胞的新治疗策略提供理论基础 | 血管平滑肌细胞及其衍生细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 谱系追踪，单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 896 | 2026-01-21 |
The role of IRF-1 in mediating T-cell immune imbalance in systemic lupus erythematosus and the construction of a diagnostic model
2025-12-31, Autoimmunity
IF:3.3Q3
DOI:10.1080/08916934.2025.2581723
PMID:41261757
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研究论文 | 本研究探讨了IRF-1在系统性红斑狼疮中T细胞免疫失衡的作用，并构建了一个基于机器学习的诊断模型 | 整合单细胞转录组、批量转录组和临床样本数据，首次系统分析了IRF-1在SLE不同疾病阶段T细胞亚群中的动态变化，并开发了基于IRF-1相关基因的机器学习诊断模型 | NA | 阐明IRF-1在系统性红斑狼疮免疫失衡中的作用，并开发一种非侵入性诊断工具 | 系统性红斑狼疮患者和对照个体的T细胞亚群 | 自然语言处理 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序 | 广义线性模型, 偏最小二乘法, 以及其他四种机器学习模型 | 转录组数据, 临床数据 | 单细胞数据集GSE254176，6个批量转录组数据集（共1079名SLE患者和137名对照），以及临床样本（70名SLE患者和58名对照） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 897 | 2026-01-21 |
Transcriptome-wide mapping reveals an RNA-dependent mechanism of platinum cancer drugs
2025-Dec-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.20.694502
PMID:41509293
|
研究论文 | 本文通过开发PlatRNA-seq技术，系统性地研究了铂类抗癌药物（如顺铂）与RNA的相互作用，揭示了其RNA依赖性作用机制 | 首次开发了PlatRNA-seq技术，在全转录组水平上绘制顺铂的RNA结合图谱，并发现顺铂通过结合RNA G-四链体结构介导细胞毒性，为非经典RNA作用机制提供了直接证据 | 研究主要聚焦于顺铂，其他铂类药物的RNA结合特性尚未全面探索；临床样本分析仅限于卵巢癌患者，需在其他癌症类型中验证 | 探究临床抗癌药物（特别是顺铂）与RNA的相互作用及其在化疗中的功能意义 | 临床批准的抗癌药物（以顺铂为代表）及其在癌细胞中的RNA靶标 | 转录组学 | 卵巢癌 | PlatRNA-seq（点击化学增强的全转录组分析）、单细胞RNA-seq、基因组学、生物物理学和计算分析 | NA | RNA-seq数据 | 来自初治卵巢癌患者肿瘤活检的单细胞RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 898 | 2026-01-21 |
PD-1 regulates CD4+ T cell-mediated CD8+ T cell responses in the brain to balance viral control and neuroinflammation
2025-Dec-12, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8215051/v1
PMID:41510262
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研究论文 | 本研究探讨了PD-1在鼠多瘤病毒脑炎中如何通过调节CD4+ T细胞介导的CD8+ T细胞反应，平衡病毒控制与神经炎症 | 揭示了PD-1在脑部自主性作用中，通过CD4 T细胞内在信号调节CD8 T细胞效应功能，平衡抗病毒防御与神经损伤的新机制 | 研究基于鼠模型，可能不完全反映人类进行性多灶性白质脑病的复杂情况，且未详细探讨PD-1阻断治疗在患者中效果多变的临床因素 | 探究PD-1在多瘤病毒中枢神经系统感染中调节T细胞反应以平衡病毒清除与神经炎症的机制 | 鼠多瘤病毒感染模型中的脑部CD4和CD8 T细胞 | 免疫学 | 神经感染性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 899 | 2026-01-21 |
Single-cell transcriptomic datasets of the amphibious plant Water wisteria
2025-Nov-29, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-025-06341-6
PMID:41318588
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了水蓑衣在陆生和水生环境中的叶片细胞，以探索异叶性的分子机制 | 首次对水蓑衣这一新兴异叶性模型植物进行单细胞转录组测序，为在单细胞水平解析植物环境适应机制提供了基础数据 | 未明确提及实验样本量或技术重复次数，可能影响统计可靠性 | 探索异叶性（植物根据环境改变叶片形态的适应策略）的分子机制 | 水蓑衣（Hygrophila difformis）在陆生和水生环境中的叶片原生质体 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 900 | 2026-01-21 |
LMNA-PRKDC axis enhances DNA repair and promotes chemoresistance in glioblastoma
2025-Nov-21, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08226-3
PMID:41271669
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研究论文 | 本研究揭示了胶质母细胞瘤中LMNA-PRKDC轴通过增强DNA修复能力驱动替莫唑胺耐药的新机制 | 首次发现LMNA-PRKDC轴通过形成DNA修复复合物增强胶质母细胞瘤的DNA修复能力，并鉴定PRKDC抑制剂可作为逆转耐药的新策略 | 研究主要基于患者来源的异种移植模型和单细胞测序数据，临床转化效果仍需进一步验证 | 探究胶质母细胞瘤对替莫唑胺产生耐药性的分子机制，并寻找逆转耐药的潜在治疗靶点 | 胶质母细胞瘤患者来源的肿瘤组织、异种移植模型以及原发和复发肿瘤标本 | 肿瘤生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学分析、免疫共沉淀 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | 患者来源的异种移植模型和原发/复发胶质母细胞瘤标本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |