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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 881 | 2026-03-03 |
Single-Cell Sequencing-Based Exploration of the Role of Tip Cells on Astrocytes and Macrophages After Spinal Cord Injury
2025-09, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.70088
PMID:40891625
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研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序和体外实验,探讨了尖端细胞在脊髓损伤后对星形胶质细胞和巨噬细胞的作用 | 揭示了尖端细胞通过Angptl4-Sdc4配体-受体通路调控星形胶质细胞迁移和巨噬细胞极化,并首次报道其在脊髓损伤中的核糖体蛋白表达特征 | 研究主要基于体外实验和单细胞测序数据,体内验证和临床转化潜力尚需进一步探索 | 探索脊髓损伤后尖端细胞对炎症微环境中星形胶质细胞和巨噬细胞的影响 | 尖端细胞、星形胶质细胞、巨噬细胞 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 882 | 2026-03-03 |
Population analysis and immunologic landscape of melanoma in people living with HIV
2025-Aug-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.17.648995
PMID:40313919
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研究论文 | 本研究通过分析HIV感染者(PLWH)与HIV阴性者(PLw/oH)的黑色素瘤临床数据,结合空间免疫转录组学和多色免疫荧光技术,揭示了PLWH患者肿瘤微环境的免疫抑制特征及其与不良临床结局的关联 | 首次在HIV感染背景下,结合大规模临床队列分析与空间免疫转录组学技术,系统揭示了黑色素瘤肿瘤微环境的免疫抑制特征及其与治疗延迟、脑转移风险增加和生存率降低的关联 | 样本量相对有限(空间转录组学n=11,多色免疫荧光n=29),且为回顾性研究,可能受混杂因素影响 | 剖析HIV感染者黑色素瘤的临床和免疫学特征,以解释其比HIV阴性患者更差的临床结局 | HIV感染者(PLWH)和HIV阴性者(PLw/oH)的黑色素瘤患者 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间免疫转录组学,多色免疫荧光 | NA | 电子健康记录,空间转录组数据,免疫荧光图像 | 临床队列:1,019名PLWH和373,121名PLw/oH;空间转录组:11个肿瘤样本;多色免疫荧光:15名PLWH和14名PLw/oH的样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 883 | 2026-03-03 |
Epigenetic Reprogramming of Autophagy Leads to Uncovering a Novel Therapeutic Target for Mutant IDH1 Astrocytomas
2025-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.08.584091
PMID:38559270
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研究论文 | 本研究揭示了自噬在突变IDH1胶质瘤生存中的关键作用,并通过靶向Atg7抑制自噬,增强了肿瘤对放疗的敏感性 | 首次发现mIDH1胶质瘤通过表观遗传重编程激活自噬作为能量来源,并开发了靶向Atg7的合成蛋白纳米颗粒siRNA递送系统,在体内实现放疗增敏 | 研究主要基于基因工程小鼠模型和患者样本分析,临床转化效果仍需进一步验证 | 探索mIDH1胶质瘤的生存机制并开发新的治疗靶点 | 突变IDH1胶质瘤细胞、患者肿瘤样本、基因工程小鼠模型 | 肿瘤生物学 | 胶质瘤 | RNA-seq, ChIP-seq, scRNA-seq, siRNA纳米递送 | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据、表观遗传数据、单细胞转录组数据 | 人类和小鼠mIDH1胶质瘤细胞及患者样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, ChIP-seq | NA | NA |
| 884 | 2024-10-04 |
A Single-Cell RNA Sequencing Atlas of the Chronic Obstructive Pulmonary Disease Distal Lung to Predict Cell-Cell Communication
2025-Mar, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0232LE
PMID:39356793
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 885 | 2026-03-03 |
Glial 'omics in ischemia: Acute stroke and chronic cerebral small vessel disease
2025-Mar, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24634
PMID:39463002
|
综述 | 本文综述了在急性缺血性中风和慢性脑小血管病中,胶质细胞(特别是小胶质细胞)在神经免疫反应中的作用,以及转录组学、单细胞RNA测序和空间转录组学等技术在揭示胶质细胞亚群和功能中的应用 | 整合了多种组学方法(如单细胞RNA测序、空间转录组学和核糖体标记策略)来阐明胶质细胞在缺血性疾病中的动态响应,并强调了这些技术在识别新型细胞亚型和生成新假设方面的潜力 | NA | 阐明胶质细胞在急性缺血性中风和慢性脑小血管病中的神经免疫反应,并探索多组学方法在进一步解析这些反应中的应用 | 胶质细胞,包括小胶质细胞和星形胶质细胞,在缺血性中风和脑小血管病中的响应 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 核糖体标记策略, 转录组分析 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 886 | 2026-03-03 |
All the single cells: Single-cell transcriptomics/epigenomics experimental design and analysis considerations for glial biologists
2025-Mar, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24633
PMID:39558887
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综述 | 本文为胶质细胞生物学家提供单细胞RNA-seq实验设计与分析的入门指南 | 针对胶质细胞研究领域,系统梳理单细胞组学实验设计与分析的关键决策点 | 作为入门指南,未涉及具体算法或工具的深入技术细节 | 提升胶质生物学家对单细胞组学数据的分析、解释与批判能力 | 胶质细胞及其在神经疾病中的亚型与功能 | 单细胞组学 | 神经疾病 | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 887 | 2026-03-03 |
Analysis of human neutrophils from nasal polyps by single-cell RNA sequencing reveals roles of neutrophils in chronic rhinosinusitis
2025-Mar, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.10.032
PMID:39522652
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析鼻息肉组织中的中性粒细胞,揭示了其在慢性鼻窦炎伴鼻息肉发病机制中的潜在作用及异质性 | 首次利用基于微孔的单细胞RNA测序技术,对鼻息肉组织中的中性粒细胞进行高分辨率分析,揭示了其基因表达谱的改变和亚群异质性 | 样本量较小(5例对照、5例鼻息肉组织),且仅分析了粒细胞富集样本,可能未完全捕获所有细胞类型 | 揭示中性粒细胞在慢性鼻窦炎伴鼻息肉发病机制中的作用和异质性 | 鼻息肉组织、对照鼻窦组织及患者匹配的外周血样本中的中性粒细胞 | 单细胞组学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 单细胞RNA测序 | Benjamini-Hochberg算法、通路富集分析、基因本体富集分析 | 单细胞转录组数据 | 5例对照鼻窦组织、5例鼻息肉组织及匹配外周血样本 | 未明确 | 单细胞RNA-seq | 微孔基单细胞RNA测序检测方法 | 新型基于微孔的单细胞RNA测序检测方法,使用粒细胞富集样本 |
| 888 | 2026-03-03 |
Microglial Responses to Alzheimer's Disease Pathology: Insights From "Omics" Studies
2025-Mar, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24666
PMID:39760224
|
综述 | 本文综述了利用多种组学技术研究阿尔茨海默病小鼠模型中小胶质细胞反应的文献,旨在阐明小胶质细胞在AD病理中的作用机制 | 整合了多种组学技术(如单细胞转录组学、空间转录组学、蛋白质组学等)来系统分析AD小鼠模型中小胶质细胞的异质性和分子模式变化 | 主要基于小鼠模型研究,可能无法完全反映人类AD的复杂性;且为综述性文章,未提供原始实验数据 | 阐明小胶质细胞在阿尔茨海默病病理中的驱动和贡献机制 | 阿尔茨海默病小鼠模型中的小胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 转录组学、表观基因组学、空间转录组学、蛋白质组学、脂质组学、代谢组学 | NA | 组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 889 | 2026-03-03 |
Techniques and analytic workflow for spatial transcriptomics and its application to allergy and inflammation
2025-Mar, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.01.009
PMID:39837466
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综述 | 本文综述了空间转录组学技术及其在过敏和炎症研究中的应用,重点关注数据处理和分析方法 | 通过整合单细胞基因表达数据与细胞定位,在完整空间背景下提供前所未有的生物学见解,为数据解释增加新维度 | NA | 总结空间转录组学领域的最新进展及其在过敏和炎症研究中的应用 | 过敏和炎症疾病,如特应性皮炎和慢性阻塞性肺疾病 | 数字病理学 | 过敏和炎症疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 890 | 2026-03-03 |
Deciphering key roles of B cells in prognostication and tailored therapeutic strategies for lung adenocarcinoma: a multi-omics and machine learning approach towards predictive, preventive, and personalized treatment strategies
2025-Mar, The EPMA journal
DOI:10.1007/s13167-024-00390-4
PMID:39991096
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研究论文 | 本研究通过多组学和机器学习方法,揭示了B细胞在肺腺癌预后中的关键作用,并开发了SRBS评分以支持预测性、预防性和个性化治疗策略 | 整合了多组学数据(包括bulk RNA、ATAC-seq、单细胞RNA和空间转录组测序)和机器学习算法,首次构建了与B细胞相关的SRBS评分,用于肺腺癌的预后预测和个性化治疗指导 | 未明确说明样本量大小,且实验验证部分可能有限,需要进一步临床验证 | 探索B细胞在肺腺癌预后中的作用,并开发个性化治疗策略以改善患者结局 | 肺腺癌患者及其相关的多组学数据 | 机器学习 | 肺癌 | 多组学整合分析,包括bulk RNA-seq、ATAC-seq、单细胞RNA-seq、空间转录组测序 | 多种机器学习算法整合 | 多组学数据(RNA、ATAC、单细胞、空间转录组) | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq, bulk ATAC-seq | NA | NA |
| 891 | 2026-03-03 |
Spatial Transcriptomics in Inflammatory Skin Diseases Using GeoMx Digital Spatial Profiling: A Practical Guide for Applications in Dermatology
2025-Jan, JID innovations : skin science from molecules to population health
DOI:10.1016/j.xjidi.2024.100317
PMID:39559817
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研究论文 | 本文提供了使用NanoString GeoMx数字空间分析仪在炎症性皮肤病中进行空间转录组学研究的实用指南 | 提供了制造商指南中未包含的RNA捕获优化方法和潜在问题解决方案,并通过具体疾病案例展示了空间分析策略 | 主要关注GeoMx平台在皮肤病学的应用,可能不直接适用于其他空间转录组技术或其他组织类型 | 为皮肤病研究者提供数字空间分析技术的实用操作指南和优化策略 | 炎症性皮肤病(银屑病、扁平苔藓、盘状红斑狼疮)的组织样本 | 数字病理学 | 皮肤病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | GeoMx数字空间分析仪 |
| 892 | 2026-03-03 |
Network pharmacology, bioinformatics and in vitro/in vivo validation elucidate the anti-lung cancer activities and potential targets of Rhoifolin
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1727729
PMID:41614077
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研究论文 | 本研究通过整合网络药理学、生物信息学及体外/体内实验,系统探讨了Rhoifolin的抗肺癌活性及其潜在分子靶点EPHB2 | 首次将网络药理学、转录组学与机器学习相结合,识别出EPHB2作为Rhoifolin的关键治疗靶点,并通过分子对接、动力学模拟及体内外实验验证了其直接作用机制 | 研究主要基于H358细胞系和小鼠异种移植模型,临床前数据需在更多肺癌模型和临床试验中进一步验证 | 系统研究Rhoifolin的抗肿瘤效应并识别其关键分子靶点,为肺癌治疗提供新策略 | 肺癌细胞系(如H358)及H358异种移植小鼠模型 | 生物信息学 | 肺癌 | 网络药理学、转录组分析、机器学习、RT-qPCR、Western blot、免疫荧光、分子对接、动力学模拟 | 机器学习 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、临床数据 | 体外细胞实验及H358异种移植小鼠模型,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 893 | 2026-03-02 |
Vasculogenic Precedes Neurogenic Differentiation in Dental Pulp Stem Cells
2025-Nov-03, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251379776
PMID:41178677
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和体内移植实验,揭示了人牙髓干细胞在分化过程中的异质性,并发现血管生成分化先于神经生成分化发生 | 首次在单细胞水平上展示了人牙髓干细胞的异质性,并明确了在移植后微环境中血管生成分化先于神经生成分化的时间顺序 | 研究主要基于免疫缺陷小鼠模型,可能无法完全模拟人体内的复杂微环境;样本量相对较小 | 探究人牙髓干细胞的分化机制,特别是血管生成、成牙本质细胞生成和神经生成分化的顺序与调控 | 人牙髓干细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序,流式细胞术,体内移植实验 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确具体样本数量,但涉及体外诱导分化及小鼠移植实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 894 | 2026-03-02 |
Single-Cell Sequencing of Human Neural Organoids in a Model of Intracerebral Hemorrhage Reveals Temporally Dynamic Responses to Blood
2025-Nov, Stroke
IF:7.8Q1
DOI:10.1161/STROKEAHA.125.051788
PMID:40905149
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研究论文 | 本研究利用人类神经类器官模型,通过单细胞RNA测序分析了脑出血后血液暴露对不同脑细胞类型的时序动态影响 | 首次在可扩展的人类神经类器官模型中,通过单细胞测序揭示了血液暴露引起的细胞特异性转录组变化及其时间动态性,并识别了潜在的治疗靶点 | 研究基于体外类器官模型,可能无法完全模拟体内脑出血的复杂微环境;样本量相对有限(18个类器官) | 探究脑出血后血液诱导的继发性神经损伤对不同脑细胞类型的影响,以优化手术清除时机 | 人类神经类器官,包含兴奋性神经元、抑制性神经元、神经祖细胞、星形胶质细胞、内皮细胞和小胶质细胞 | 单细胞测序 | 脑出血 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 18个类器官,共96,725个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 895 | 2026-03-02 |
Profibrotic monocyte-derived alveolar macrophages as a biomarker and therapeutic target in systemic sclerosis-associated interstitial lung disease
2025-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.07.669006
PMID:40832362
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研究论文 | 本文探讨了系统性硬化症相关间质性肺病中促纤维化单核来源肺泡巨噬细胞作为生物标志物和治疗靶点的作用 | 首次在SSc-ILD患者中通过流式细胞术和单细胞RNA测序分析BAL液中的MoAM和间质巨噬细胞,并发现其丰度与肺纤维化严重程度相关 | 样本量较小(仅9名SSc-ILD患者和13名健康对照),且为前瞻性研究,需更大规模验证 | 评估MoAM在SSc-ILD中的生物标志物潜力和治疗靶点价值 | SSc-ILD患者和健康对照的BAL液样本及肺移植组织 | 数字病理学 | 间质性肺病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 细胞计数数据, 转录组数据, 空间转录组数据 | 9名SSc-ILD患者和13名健康对照的BAL液样本,以及SSc-ILD肺移植组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 896 | 2026-03-02 |
Deconvoluting single-cell transcriptomics reveals cellular programs regulated by cell-cell communication in colorectal cancer
2025-Sep-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.09.648030
PMID:40321215
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荟萃分析 | 本研究通过整合八个单细胞队列数据,开发了一种新颖的分析框架,以揭示结直肠癌中细胞间通讯网络及其调控的细胞程序 | 采用分层主题建模识别反映单细胞信号状态的基因表达模块,并结合因果发现方法系统揭示可能受配体-受体信号和跨细胞类型通讯调控的模块,通过空间转录组学验证了这些模块在空间域中的共定位 | NA | 深入理解结直肠癌中细胞间通讯网络的复杂性及其在肿瘤微环境中的作用 | 结直肠癌患者样本中的单细胞转录组数据 | 单细胞转录组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 分层主题建模,因果发现方法 | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | 153名患者,279个样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 897 | 2026-03-02 |
Interferon Epsilon Loss Is Elusive 9p21 Link to Immune-Cold Tumors, Resistant to Immune Checkpoint Therapy, and Endogenous CXCL9/10 Induction
2025-Sep, Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer
IF:21.0Q1
DOI:10.1016/j.jtho.2024.12.020
PMID:39725169
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研究论文 | 本研究揭示了9号染色体短臂(9p)缺失通过干扰素ε(IFNϵ)信号通路导致免疫冷肿瘤及免疫检查点疗法(ICT)耐药性的机制 | 首次将9p缺失与IFNϵ信号联系起来,并证明IFNϵ是调控CXCL9/10表达和免疫细胞浸润的关键因子 | IFNϵ在肿瘤免疫微环境中的作用具有显著的组织特异性,且部分肿瘤类型中相关性较弱 | 探究9p缺失导致免疫冷肿瘤和ICT耐药的分子机制 | 人类肿瘤样本、细胞系及小鼠模型,涵盖头颈鳞癌、非鳞非小细胞肺癌、黑色素瘤等多种癌症类型 | 肿瘤免疫学 | 多种癌症(头颈鳞癌、非鳞非小细胞肺癌、黑色素瘤等) | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、拷贝数变异分析、介导分析 | 小鼠基因工程模型(ΔS与ΔL缺失模型) | 基因组数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 13项研究报告、36个ICT队列数据,涵盖多种肿瘤类型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 898 | 2026-03-02 |
Nerve-associated macrophages control adipose homeostasis across lifespan and restrain age-related inflammation
2025-Sep, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-025-00952-9
PMID:40897908
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和流式细胞术,揭示了神经相关巨噬细胞在脂肪组织稳态和年龄相关炎症中的关键作用 | 首次定义了神经相关巨噬细胞作为脂肪组织巨噬细胞的一个特殊亚群,并发现其随年龄减少会加剧炎症和脂解功能障碍 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关性尚需进一步验证 | 探究脂肪组织巨噬细胞在年龄相关炎症中的作用机制 | 小鼠脂肪组织中的巨噬细胞亚群 | 单细胞生物学 | 年龄相关炎症 | 单细胞测序,多参数流式细胞术,血管内标记 | NA | 单细胞RNA测序数据,流式细胞术数据 | 小鼠脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 899 | 2026-03-02 |
Dynamic GLUT trafficking at high glucose levels enhances insulin secretion: Dysregulation leads to decreased insulin secretion during type 2 diabetes
2025-Aug-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2425955122
PMID:40811462
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研究论文 | 本研究揭示了葡萄糖转运蛋白(GLUT)在高葡萄糖浓度下的动态转运机制及其在胰岛素分泌中的作用,并发现2型糖尿病中该过程的失调 | 首次阐明了GLUT在β细胞质膜上的招募与网格蛋白介导的内存作用之间的动态耦合关系,并揭示了其在2型糖尿病胰岛素分泌缺陷中的作用 | 研究主要基于体外细胞模型和人类胰岛组织,体内生理环境下的验证尚需进一步研究 | 探究葡萄糖刺激下GLUT转运的动态调控机制及其在2型糖尿病胰岛素分泌障碍中的作用 | 胰腺β细胞、人类胰岛组织(来自非糖尿病和2型糖尿病供体) | 细胞生物学与糖尿病研究 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序、分子生物学技术 | NA | 基因表达数据、细胞成像数据 | 人类胰岛组织(非糖尿病与2型糖尿病供体) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 900 | 2026-03-02 |
Persistent type I interferon signaling within the brain of people with HIV on ART with cognitive impairment
2025-Aug, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013411
PMID:40833988
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研究论文 | 本研究通过分析HIV感染者大脑蛋白质谱和单细胞RNA测序,揭示了I型干扰素信号在神经胶质和内皮细胞中的持续激活,这可能与神经炎症和认知障碍相关 | 首次结合蛋白质组学和单细胞RNA测序技术,在HIV感染者大脑中系统性地识别了I型干扰素信号的持续激活,并发现其可由内源性逆转录病毒触发,即使在有效抗逆转录病毒治疗下仍持续存在 | 样本量相对较小(27个HIV感染者大脑和9个对照),且主要基于快速尸检组织,可能限制了结果的普遍性 | 探究HIV感染者神经炎症的分子机制,特别是I型干扰素信号在认知障碍中的作用 | HIV感染者的大脑组织、迷你脑类器官模型以及对照样本 | 数字病理学 | HIV相关神经认知障碍 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、蛋白质谱分析 | NA | 蛋白质数据、单细胞RNA测序数据 | 27个HIV感染者大脑和9个对照大脑 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |