单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202501-202512] [清除筛选条件]
当前共找到 10496 篇文献,本页显示第 8781 - 8800 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
8781 2025-10-07
Repurposing large-format microarrays for scalable spatial transcriptomics
2025-Jan, Nature methods IF:36.1Q1
研究论文 开发了一种利用传统寡核苷酸微阵列进行空间转录组分析的新方法Array-seq 将传统DNA微阵列重新用于空间转录组分析,实现了低成本、易操作且可扩展的空间分子研究平台 NA 开发易于采用、低成本且可扩展的空间转录组分析工具 小鼠组织切片、多器官切片、连续切片和完整人类器官 空间转录组学 NA 空间转录组学, 下一代测序 NA 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学, 微阵列技术 Array-seq 基于定制设计探针的微阵列载玻片,包含侧翼有共同序列的独特条形码
8782 2025-10-07
Serinc5 Regulates Sequential Chondrocyte Differentiation by Inhibiting Sox9 Function in Pre-Hypertrophic Chondrocytes
2025-Jan, Journal of cellular physiology IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序发现Serinc5是前肥大软骨细胞的标志基因,并揭示其通过抑制Sox9功能调控软骨细胞顺序分化的机制 首次鉴定Serinc5为前肥大软骨细胞的标志基因,并阐明其在软骨细胞分化过程中的调控机制 前肥大软骨细胞的分子基础仍有许多未明确之处 探究前肥大软骨细胞的分子特征及其在软骨细胞分化中的调控作用 生长板软骨细胞,特别是前肥大软骨细胞 发育生物学 骨骼发育疾病 scRNA-seq, ChIP-seq, ATAC-seq, 组织学分析 NA 单细胞RNA测序数据, 染色质免疫沉淀测序数据, 染色质可及性测序数据 荧光标记的生长板软骨细胞 NA 单细胞RNA测序, 染色质免疫沉淀测序, 染色质可及性测序 NA NA
8783 2025-10-07
Cryptotanshinone alleviates immunosuppression in endometriosis by targeting MDSCs through JAK2/STAT3 pathway
2025-Jan, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1
研究论文 本研究探讨了隐丹参酮通过JAK2/STAT3通路调控髓源性抑制细胞,从而缓解子宫内膜异位症免疫抑制的机制 首次证明隐丹参酮通过靶向JAK2/STAT3通路调节MDSCs,是治疗子宫内膜异位症的潜在天然化合物 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床转化价值需进一步验证 研究隐丹参酮通过JAK2/STAT3信号通路调节MDSCs的治疗潜力及其对EMS免疫微环境和病灶生长的影响 子宫内膜异位症患者组织样本、C57BL/6J小鼠模型、骨髓源性MDSCs 生物医学研究 子宫内膜异位症 转录组测序、单细胞RNA测序、网络药理学分析、表面等离子共振、细胞热位移分析、流式细胞术、免疫荧光、Western blot NA 基因表达数据、单细胞测序数据、蛋白质印迹数据 使用公共数据库GSE141549和GSE213216数据,建立小鼠模型进行体内外验证 NA 单细胞RNA测序, 转录组测序 NA NA
8784 2025-10-07
Comprehensive single-cell aging atlas of healthy mammary tissues reveals shared epigenomic and transcriptomic signatures of aging and cancer
2025-Jan, Nature aging IF:17.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞分辨率构建健康乳腺组织衰老图谱,揭示衰老与癌症共享的表观基因组和转录组特征 首次在单细胞分辨率系统揭示乳腺组织衰老过程中的转录组和表观基因组重编程,并发现衰老特征与人类乳腺癌的潜在联系 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 探究衰老如何影响乳腺组织细胞和分子程序,及其与癌症发生的关联 小鼠乳腺组织中的上皮细胞、基质细胞和免疫细胞 单细胞生物学 乳腺癌 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 NA 单细胞转录组数据, 表观基因组数据, 空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 NA NA
8785 2025-10-07
Single-Cell RNA-Seq and Histological Analysis Reveals Dynamic Lrig1 Expression During Salivary Gland Development
2025-Jan, Journal of cellular physiology IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和组织学分析揭示了Lrig1在唾液腺发育过程中的动态表达模式 首次系统揭示LRIG1在唾液腺发育各阶段的动态表达特征及其与祖细胞标记物的共定位关系 研究主要基于小鼠模型,人类细胞验证仅限于HSG细胞系 探究Lrig1在发育和成熟小鼠颌下腺中的表达模式和功能 小鼠颌下腺组织、人类唾液腺细胞系 单细胞生物学 NA 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 免疫荧光, RNAscope染色 NA 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据, 图像数据 不同发育阶段的小鼠颌下腺组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
8786 2025-10-07
H. Pylori-Facilitated TERT/Wnt/β-Catenin Triggers Spasmolytic Polypeptide-Expressing Metaplasia and Oxyntic Atrophy
2025-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究揭示了幽门螺杆菌通过CagA激活TERT/Wnt/β-Catenin通路促进胃主细胞去分化和SPEM发生的分子机制 首次发现CagA通过破坏TERT与其新型E3连接酶SYVN1的相互作用来稳定TERT蛋白,并证实Tert敲除可抑制Wnt/β-Catenin通路和SPEM发生 NA 阐明幽门螺杆菌诱导胃黏膜SPEM发生的分子机制 胃主细胞和幽门螺杆菌感染模型 分子生物学 胃部癌前病变 单细胞RNA测序,基因敲除 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
8787 2025-10-07
Spatiotemporal Cellular Dynamics of Germinal Center Reaction in Coronavirus Disease 2019 Lung-Draining Lymph Node Based on Imaging-Based Spatial Transcriptomics
2025-Jan, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
研究论文 利用成像空间转录组学揭示COVID-19康复期和再感染过程中肺引流淋巴结生发中心反应的细胞动态变化 首次通过成像空间转录组学解析SARS-CoV-2感染过程中淋巴组织结构恢复的时空动态特征 研究基于非人灵长类动物模型,结果向人类临床转化的适用性需进一步验证 阐明SARS-CoV-2感染后淋巴结构恢复特征及其对免疫记忆的影响 SARS-CoV-2感染的非人灵长类动物肺引流淋巴结 空间转录组学 COVID-19 成像空间转录组学 NA 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
8788 2025-10-07
PKMζ, a Brain-specific PKCζ Isoform, is Required for Glycolysis and Myofibroblastic Activation of Hepatic Stellate Cells
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究揭示了脑特异性PKCζ异构体PKMζ在肝星状细胞糖酵解和肌成纤维细胞活化中的关键作用 首次发现PKMζ通过磷酸化VASP促进Glut1在质膜上的锚定,驱动肝星状细胞的代谢重编程和活化 研究主要基于体外细胞实验和小鼠模型,尚未在人类肝脏疾病中进行临床验证 阐明肝星状细胞中葡萄糖转运蛋白Glut1在质膜上锚定/停靠的分子机制 人源和鼠源肝星状细胞、结直肠肝转移瘤相关成纤维细胞 细胞生物学 肝纤维化、结直肠肝转移 RT-PCR、Western blotting、免疫荧光、shRNA、过表达、生物素化、2-NBDG检测、Seahorse糖酵解压力测试、位点定向突变、RNA测序、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、蛋白质数据、细胞功能数据 原代人源和鼠源肝星状细胞、结直肠肝转移患者和小鼠模型样本 NA 单细胞RNA测序、RNA测序 NA NA
8789 2025-10-07
Spatial and Single-Cell Transcriptomics Unraveled Spatial Evolution of Papillary Thyroid Cancer
2025-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示甲状腺乳头状癌的空间异质性和进化机制 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,在保留空间信息和形态特征的同时解析甲状腺乳头状癌的肿瘤内异质性 NA 阐明甲状腺乳头状癌空间异质性、恶性进展和转移的分子机制 甲状腺乳头状癌组织和细胞 数字病理学 甲状腺癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 转录组数据, 空间定位数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
8790 2025-10-07
A comprehensive human embryo reference tool using single-cell RNA-sequencing data
2025-Jan, Nature methods IF:36.1Q1
研究论文 开发了一个基于单细胞RNA测序数据的综合人类胚胎参考工具,用于评估人类胚胎模型 整合了六个已发表的人类胚胎数据集,构建了首个从受精卵到原肠胚发育阶段的通用参考工具 依赖于已发表数据集,可能受原始数据质量和注释准确性的限制 建立人类胚胎发育的标准化参考工具,用于胚胎模型的验证和评估 人类胚胎发育过程(从受精卵到原肠胚阶段) 单细胞生物学 NA 单细胞RNA测序 Uniform Manifold Approximation and Projection (UMAP) 单细胞转录组数据 整合六个已发表人类数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
8791 2025-10-07
Identification of novel metabolism-related biomarkers of Kawasaki disease by integrating single-cell RNA sequencing analysis and machine learning algorithms
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过整合单细胞RNA测序分析和机器学习算法识别川崎病的新型代谢相关生物标志物 首次在单细胞水平系统分析川崎病中胆汁酸代谢和脂肪酸代谢相关特征基因,并利用机器学习算法鉴定出VIM、CLIC1和ITGB2作为新型诊断标志物 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证这些基因在川崎病发病机制中的具体功能 识别川崎病中与胆汁酸代谢和脂肪酸代谢相关的特征细胞和基因,探索其在疾病发病机制中的作用 川崎病患者免疫细胞(单核细胞和自然杀伤细胞) 生物信息学 川崎病 单细胞RNA测序, 机器学习算法, 实时定量PCR, ROC曲线分析 hdWGCNA, 机器学习算法 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据 公共数据集GSE1687323和GSE68004,验证数据集GSE73461 NA 单细胞RNA测序 NA NA
8792 2025-10-07
Pan-cancer analysis identified CD248 as a potential target for multiple tumor types
2025, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
研究论文 通过泛癌分析鉴定CD248作为多种肿瘤类型的潜在治疗靶点 首次通过多数据库整合分析和实验验证,系统性地揭示了CD248在泛癌中的表达特征、预后价值及功能机制 研究主要基于数据库分析和体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证和临床样本的直接证据 探索CD248在多种肿瘤类型中的表达模式、临床意义和生物学功能 多种肿瘤类型(重点关注头颈鳞状细胞癌)及相应细胞系 生物信息学 泛癌分析 qRT-PCR, Western blot, transwell assay, scratch wound healing assay, EdU assay, 单细胞测序 NA 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 临床预后数据, 单细胞测序数据 多种肿瘤数据库数据及HNSC细胞系 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
8793 2025-10-07
Decoding glioblastoma's diversity: Are neurons part of the game?
2025-Jun-28, Cancer letters IF:9.1Q1
综述 本文综述胶质母细胞瘤与神经元相互作用的机制,分析其如何利用神经发育途径并重塑神经元网络 首次系统整合胶质母细胞瘤-神经元相互作用研究,并通过生物信息学分析提出驱动胶质瘤-神经元动态的细胞间相互作用假说 依赖公开数据库的snRNA-seq数据,需要进一步实验验证提出的相互作用机制 阐明胶质母细胞瘤与神经元的相互作用机制及其治疗潜力 胶质母细胞瘤(WHO 4级)及其与神经元的相互作用 数字病理学 胶质母细胞瘤 单核RNA测序(snRNA-seq),生物信息学分析 NA 单细胞转录组数据 公开数据库中的snRNA-seq数据集 NA 单核RNA测序 NA NA
8794 2025-10-07
Developmental landscape and asymmetric gene expression in the leaf vasculature of Brassica rapa revealed by single-cell transcriptome
2025-Jun, Horticulture research IF:7.6Q1
研究论文 通过单细胞转录组技术揭示白菜叶脉系统的发育轨迹和不对称基因表达模式 首次构建白菜叶脉系统的单细胞转录组图谱,揭示不同维管细胞类型的特异性基因表达模式及同源基因的不对称表达 研究仅限于白菜叶脉系统,未与其他植物物种进行直接比较 解析叶脉系统细胞类型特征及其在叶片形态建成中的作用 白菜叶脉系统细胞 植物生物学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 12个细胞簇覆盖7种已知细胞类型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
8795 2025-10-07
Fibroblasts fluctuating between mesenchyme and epithelium are involved in hair follicle mesenchyme development
2025-Jun, Biochemistry and biophysics reports IF:2.3Q3
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和免疫组织化学分析,揭示了在新生小鼠皮肤中成纤维细胞在间充质和上皮间波动参与毛囊间充质发育的过程 首次发现表达特定标记的成纤维细胞具有向上皮细胞转换的能力,并证实这些细胞对毛囊真皮干细胞发育的重要贡献 研究仅限于小鼠模型,人类皮肤中的类似机制尚未验证 阐明上皮-间充质/间充质-上皮转换在皮肤发育中的具体作用和功能 新生小鼠皮肤组织 发育生物学 NA 单细胞RNA测序, 免疫组织化学分析 NA 基因表达数据, 组织图像数据 小鼠皮肤样本(包括胚胎期16.5天和老年小鼠) NA 单细胞RNA测序 NA NA
8796 2025-10-07
Emerging clinical applications of single-cell RNA sequencing in oncology
2025-May, Nature reviews. Clinical oncology
综述 本文总结了单细胞RNA测序技术在肿瘤学中的临床应用前景 重点关注单细胞RNA测序在肿瘤临床相关性方面的发现,并系统归纳了四大研究方向 讨论了单细胞RNA测序技术本身的局限性 探索单细胞RNA测序在肿瘤临床应用的潜力 癌症患者的肿瘤样本 生物信息学 肿瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 数百项研究涉及的肿瘤样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
8797 2025-10-07
Chemokine (C-C Motif) Ligand 2 Expressing Adventitial Fibroblast Expansion During Loeys-Dietz Syndrome Aortic Aneurysm Formation
2025-May, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析揭示了Loeys-Dietz综合征主动脉瘤形成过程中外膜成纤维细胞向促炎状态转变的关键作用 首次在LDS主动脉瘤中发现外膜成纤维细胞而非平滑肌细胞的表型调节是主要病理机制,并鉴定出促炎性成纤维细胞亚群 样本量相对有限(人类样本n=5 LDS和n=2对照),需要更大规模研究验证 阐明Loeys-Dietz综合征主动脉瘤形成的细胞状态转变和分子机制 小鼠LDS模型和人类LDS手术标本的主动脉根/升主动脉组织 单细胞转录组学 主动脉瘤 单细胞RNA测序, RNA原位杂交, 免疫荧光, 免疫组织化学 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 >30,000个细胞(来自小鼠和人类样本) NA 单细胞RNA测序 NA NA
8798 2025-10-07
Decoding the role of lipid metabolism in NSCLC: From macrophage subtype identification to prognostic model development
2025-Apr-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序分析,识别了与非小细胞肺癌进展相关的脂质相关巨噬细胞标志基因,并开发了预后风险评分模型 首次系统识别脂质相关巨噬细胞亚型及其关键标志基因S100A10、HLA-DMB和CTSL,并构建了高精度的NSCLC预后模型 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步临床验证 探索脂质代谢在非小细胞肺癌肿瘤微环境中的作用机制并开发预后预测工具 非小细胞肺癌患者样本和肿瘤微环境中的巨噬细胞 生物信息学 肺癌 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 生存分析, ROC曲线分析, 体内实验 预后风险评分模型 RNA测序数据, 突变数据 TCGA和GEO数据库中的NSCLC患者样本 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
8799 2025-10-07
Local DIO2 Elevation Is an Adaption in Malformed Cerebrovasculature
2025-Apr-25, Circulation research IF:16.5Q1
研究论文 本研究揭示了DIO2介导的甲状腺激素信号通路在脑血管畸形中的适应性作用及其治疗潜力 首次发现脑血管畸形中局部DIO2升高是一种适应性机制,并阐明FOXK1-PI3K-Akt-mTOR信号轴调控DIO2转录及Pgc1a介导的线粒体功能修复机制 研究主要基于动物模型,人类样本验证仍需扩展 探究甲状腺激素信号在脑血管畸形病理过程中的作用及治疗潜力 人类脑血管畸形样本(脑海绵状血管畸形和脑动静脉畸形)及相应基因修饰小鼠模型 单细胞转录组学 脑血管畸形 单细胞转录组分析、腺相关病毒介导的基因操作、药物干预 基因敲除小鼠模型(Pdcd10内皮特异性敲除、KrasG12D突变) 单细胞转录组数据、组织切片 人类脑血管畸形单细胞样本及多种基因修饰小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
8800 2025-10-07
Srsf3-Dependent APA Drives Macrophage Maturation and Limits Atherosclerosis
2025-Apr-25, Circulation research IF:16.5Q1
研究论文 本研究揭示了Srsf3通过调控选择性多聚腺苷酸化促进巨噬细胞成熟并抑制动脉粥样硬化的新机制 首次发现Srsf3依赖性APA通过调控线粒体翻译驱动巨噬细胞成熟,揭示了3'UTR长度变化在动脉粥样硬化中的新作用机制 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 探究单核细胞向巨噬细胞转化的调控机制及其在动脉粥样硬化中的作用 Apoe-/-小鼠动脉斑块中的单核/巨噬细胞,人类动脉粥样硬化斑块 单细胞生物学 心血管疾病 单细胞RNA测序, 3'端测序, 流式细胞术, 组织病理分析, 多核糖体分析, 代谢组学 基因敲除小鼠模型 单细胞RNA测序数据, bulk RNA测序数据, 流式细胞数据, 代谢组数据 Apoe-/-小鼠动脉斑块,人类动脉粥样硬化斑块样本 NA 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 3'端测序 NA NA
回到顶部