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当前共找到 10542 篇文献，本页显示第 861 - 880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 861 | 2026-05-01 |
The Application of scRNA-Seq in Heart Development and Regeneration
2025-04, Genesis (New York, N.Y. : 2000)
DOI:10.1002/dvg.70013
PMID:40300044
|
综述 | 综述了单细胞RNA测序在心脏发育与再生中的应用 | 利用scRNA-seq技术揭示心脏发育与再生的分子机制，为成年心脏再生治疗提供新线索 | 仅总结现有研究，未提供实验验证或新型分析方法 | 探讨scRNA-seq在心脏发育与再生研究中的应用及潜在治疗策略 | 心脏组织中的单细胞，包括新生儿和成年哺乳动物心脏及斑马鱼心脏 | 机器学习和数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 862 | 2026-05-01 |
Inorganic pyrophosphatase 1: a key player in immune and metabolic reprogramming in ankylosing spondylitis
2025-02, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-024-00308-0
PMID:39511317
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研究论文 | 通过孟德尔随机化和单细胞测序分析，发现无机焦磷酸酶1在强直性脊柱炎的免疫和代谢重编程中起关键作用 | 首次结合孟德尔随机化、表达量性状位点分析和单细胞代谢分析，鉴定出PPA1作为强直性脊柱炎中CD8+记忆T细胞代谢和免疫应答的关键基因 | 样本量较小（仅3例患者），且未涉及功能验证实验 | 探究免疫细胞和代谢物在强直性脊柱炎中的作用机制 | 强直性脊柱炎患者与非患者的椎骨骨髓血样本中的免疫细胞和代谢物 | 自然语言处理， 机器学习 | 强直性脊柱炎 | 单细胞测序， 孟德尔随机化， 表达量性状位点分析 | NA | 基因表达数据， 代谢数据 | 3例强直性脊柱炎患者和3例非患者的椎骨骨髓血样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10×单细胞测序 |
| 863 | 2026-05-01 |
Deciphering normal and cancer stem cell niches by spatial transcriptomics: opportunities and challenges
2025-01-07, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.351956.124
PMID:39496456
|
综述 | 讨论空间转录组学在解析正常和癌症干细胞生态位中的机遇与挑战 | 系统总结了不同空间技术如何用于识别干细胞并揭示其微环境空间模式，同时强调了计算工具在克服技术瓶颈中的作用 | 受技术限制，表征干细胞生态位仍面临挑战，且计算解决方案需进一步优化 | 探讨空间转录组学在正常和癌症干细胞生态位研究中的应用及挑战 | 正常干细胞和癌症干细胞及其相关微环境生态位 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 864 | 2026-05-01 |
Single Cell Data Enables Dissecting Cell Types Present in Bulk Transcriptome Data
2025-01, Stem cells and development
IF:2.5Q2
DOI:10.1089/scd.2024.0152
PMID:39611952
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研究论文 | 提出一个管道，利用单细胞RNA测序数据解析批量转录组数据中的细胞类型组成 | 整合scRNA-seq数据与解卷积方法，实现了从批量转录组数据中估计细胞类型比例，为类器官质量评估提供了新工具 | 未明确说明该方法在不同组织或条件下的泛化能力，可能受限于已有scRNA-seq数据集的代表性 | 开发一种方法，通过单细胞数据解析批量转录组中的细胞类型组成，用于类器官模型的质量评估 | iPSC衍生的肾和脑类器官批量转录组数据 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 解卷积模型 | 基因表达数据 | 使用两个肾脏scRNA-seq数据集和一个脑scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 865 | 2026-05-01 |
Characterization of Ferroptosis-Related Genes in Aplastic Anaemia: An Integrated Analysis of Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Data
2025, Acta haematologica
IF:1.7Q3
DOI:10.1159/000543656
PMID:39938486
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研究论文 | 利用批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，综合分析了再生障碍性贫血中与铁死亡相关的基因 | 首次基于批量与单细胞RNA测序数据整合分析，发现铁死亡相关基因（DDIT4和NCF2）在再生障碍性贫血（AA）中的作用，并揭示它们在血小板和基质细胞中的活性升高 | 研究基于公共数据集，缺乏实验验证；样本量有限，可能影响结论的通用性 | 探索再生障碍性贫血（AA）中关键的铁死亡相关基因（FRGs）及其潜在机制 | 再生障碍性贫血（AA）患者和对照样本 | 机器学习 | 再生障碍性贫血 | NA | NA | 基因表达数据 | NA（使用公共数据库数据，未明确样本数量） | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 866 | 2026-05-01 |
Cell signaling characterization for spatial transcriptomics (ST) data using network analysis
2025, Complex networks & their applications. International Conference on Complex Networks and Their Applications
DOI:10.1007/978-3-031-82435-7_32
PMID:40510773
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研究论文 | 提出一种基于网络分析的细胞通讯方法，用于空间转录组学数据的细胞信号表征 | 首次为空间转录组学数据构建全连接有向加权网络模型，利用低维嵌入和加权入度中心性量化配体-受体交互的信号活动 | 仅在三个特定配体-受体交互上验证，未评估高通量交互的扩展性 | 开发一种从空间转录组学数据中表征细胞信号活动的方法 | 空间转录组学数据中的配体-受体相互作用 | 机器学习， 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 网络模型（加权有向图） | 基因表达数据 | 一个真实空间转录组学数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 867 | 2026-04-30 |
Mechanosensitive genomic enhancers potentiate the cellular response to matrix stiffness
2025-Dec-11, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adl1988
PMID:40997217
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研究论文 | 本研究结合全基因组表观组图谱、表观基因组编辑、表型及单细胞RNA测序CRISPR筛选，发现了一类对机械微环境响应的基因组增强子，并探究其如何通过表观遗传调控影响细胞功能及疾病相关基因 | 首次鉴定出对细胞外基质软硬度响应的“机械增强子”，并通过表观遗传编辑重编程细胞对机械微环境的响应 | 未提及具体局限性 | 探究机械微环境如何通过表观遗传状态调控转录，并识别响应机械信号的基因组增强子 | 肺成纤维细胞（来自健康及纤维化供体） | 表观遗传学、单细胞组学 | 纤维化疾病 | 全基因组表观组学、表观基因组编辑、单细胞RNA测序、CRISPR筛选 | NA | 表观组数据、单细胞转录组数据 | 健康及纤维化供体的肺成纤维细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 868 | 2026-04-30 |
Single-cell transcriptomics of human organoid-derived enteroendocrine cell populations from the small intestine
2025-12, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP287463
PMID:39639676
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类小肠类器官来源的肠内分泌细胞群体 | 首次利用CRISPR-Cas9标记的类器官模型结合单细胞RNA测序，系统绘制人类小肠肠内分泌细胞图谱，并揭示不同细胞亚型的激素、营养感应机制及转录因子的差异表达 | 未提及具体局限性，但类器官模型可能无法完全模拟体内微环境 | 利用单细胞RNA测序绘制人类小肠肠内分泌细胞图谱，比较不同细胞类型的分子特征 | 人类十二指肠和回肠类器官来源的肠内分泌细胞（EECs） | 单细胞转录组学 | 糖尿病、肥胖、肠道疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、CRISPR-Cas9 | 细胞类器官模型 | 单细胞转录组数据 | 人类十二指肠和回肠类器官 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 单细胞RNA测序平台 |
| 869 | 2026-04-30 |
Spatial Dynamics of Tumor Cell Plasticity in Lung Adenocarcinoma Revealed by Region-Specific Single Cell Transcriptomics
2025-12, Genes, chromosomes & cancer
DOI:10.1002/gcc.70101
PMID:41454525
|
研究论文 | 通过区域特异性单细胞转录组学揭示肺腺癌中肿瘤细胞可塑性的空间动态 | 首次在单个肺腺癌肿瘤的不同区域（核心、核心旁、边缘）进行单细胞RNA测序，系统刻画了EMT和干性特征的空间异质性，并发现与预后相关的生物标志物PCBP1和PA2G4 | 样本仅来自单个肺腺癌患者，可能限制了结论的普适性；EMT与干性之间的相关性较弱（R=0.17），需进一步验证 | 研究肺腺癌中肿瘤细胞可塑性（EMT和干性）的空间分布及其与预后的关联 | 肺腺癌患者的肿瘤组织样本（10个肿瘤片段来自3个区域） | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 1例肺腺癌患者的10个肿瘤片段（核心、核心旁、边缘各若干个） | BGI | 单细胞RNA测序 | SURFSeq 5000 | BGI SURFSeq 5000测序平台进行单细胞RNA测序 |
| 870 | 2026-04-30 |
Monocyte/macrophage-derived NLRP3 Promotes the Onset and Progression of Ankylosing Spondylitis Via the NOD-like Receptor Pathway
2025-Nov-26, Journal of clinical immunology
IF:7.2Q1
DOI:10.1007/s10875-025-01961-4
PMID:41291215
|
research paper | 本研究通过单细胞测序和转录组分析揭示了单核细胞/巨噬细胞衍生的NLRP3通过NOD样受体通路促进强直性脊柱炎的发病和进展 | 首次通过单细胞测序分析强直性脊柱炎患者骨髓样本，明确单核细胞-巨噬细胞-炎症性巨噬细胞分化轨迹，并识别NLRP3的核心作用及上游调控因子 | 未提及具体局限性 | 阐明强直性脊柱炎的致病通路并探索潜在治疗策略 | 从强直性脊柱炎患者和骨折对照患者收集的骨髓样本 | machine learning | 强直性脊柱炎 | 单细胞测序, 转录组分析 | NA | 单细胞数据, 转录组数据 | 强直性脊柱炎患者与骨折对照患者的骨髓样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 871 | 2026-04-30 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Depletion and Dysregulation of Mycobacterium tuberculosis-Specific Th1 and Th17 Cells Early After Acquisition of Human Immunodeficiency Virus
2025-Oct-15, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiaf354
PMID:40605619
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示HIV感染早期后结核分枝杆菌特异性Th1和Th17细胞的耗竭与失调 | 首次纵向研究HIV感染前后Mtb特异性CD4 T细胞的单细胞RNA测序，揭示早期感染后Th1/Th17细胞优先耗竭及转录调控异常 | 未提及具体局限性 | 评估HIV感染对Mtb特异性CD4 T细胞频率和功能的影响 | HIV阳性与阴性个体中的Mtb特异性CD4 T细胞 | 单细胞转录组学 | 结核病、HIV感染 | 流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 部分个体在HIV感染前后进行纵向单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 872 | 2026-04-30 |
Single-cell RNA-sequencing of BCG naïve and recurrent non-muscle invasive bladder cancer reveals a CD6/ALCAM-mediated immune-suppressive pathway
2025-Sep-26, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01093-3
PMID:41006678
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析BCG初治和复发性非肌层浸润性膀胱癌，揭示CD6/ALCAM介导的免疫抑制通路 | 首次发现CD6/ALCAM信号通路与BCG耐药性之间的关联，并指出该通路可作为增强BCG疗效的潜在治疗靶点 | 未明确说明局限性，样本量可能有限，且需进一步验证CD6/ALCAM信号在其他队列中的普适性 | 探究BCG治疗抵抗背后的免疫机制，以改善复发非肌层浸润性膀胱癌的治疗效果 | BCG初治和复发性非肌层浸润性膀胱癌患者的肿瘤组织 | 单细胞组学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、全外显子测序 | NA | 基因表达数据、外显子变异数据 | 多个NMIBC患者样本（具体数量未提供），包括BCG治疗前后 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于scRNA-seq |
| 873 | 2026-04-30 |
Redefining macrophage phenotypes after spinal cord injury: An open data approach
2025-Jun, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2025.115222
PMID:40113007
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研究论文 | 通过开放数据方法重新定义脊髓损伤后巨噬细胞表型 | 利用三种公开单细胞RNA测序数据集进行跨数据集比较，采用无偏分析方法识别出脊髓损伤后四种保守的巨噬细胞群体 | 未提及具体局限性，但可能包括样本仅限于年轻雌性小鼠，且仅分析损伤后7天的时间点 | 利用公开单细胞RNA测序数据重新定义脊髓损伤后巨噬细胞的异质性 | 脊髓损伤后7天的年轻雌性小鼠 | 机器学习 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | Seurat分析流程、SingleR跨数据集比较工具 | 基因表达数据 | 三个独立研究团队的数据集，具体样本量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 874 | 2026-04-30 |
SlideCNA: spatial copy number alteration detection from Slide-seq-like spatial transcriptomics data
2025-May-02, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03573-y
PMID:40317049
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研究论文 | SlideCNA是一种从Slide-seq类空间转录组数据中检测空间拷贝数变异（CNA）的计算工具 | 利用表达感知的空间分箱方法克服数据稀疏性，从近单细胞分辨率的空间转录组数据中提取拷贝数变异信号，实现空间亚克隆检测 | 未提及具体局限性 | 开发从稀疏空间转录组数据中检测拷贝数变异的方法，以揭示实体瘤的遗传空间异质性 | 模拟数据和真实Slide-seq数据（转移性乳腺癌样本） | 机器学习, 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学, RNA-seq | 分箱算法 | 空间基因表达数据 | 模拟数据和真实乳腺癌数据 | 未指定平台公司 | 空间转录组学（Slide-seq类） | Slide-seq | 近单细胞分辨率的空间转录组数据 |
| 875 | 2026-04-30 |
Single-Cell Profiling of Mononuclear Cells Identifies Transcriptomics Signatures Differentiating Prostate Cancer From Benign Prostatic Hyperplasia
2025-05, Genes, chromosomes & cancer
DOI:10.1002/gcc.70051
PMID:40346907
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析外周血单核细胞，揭示前列腺癌与良性前列腺增生的转录组学差异 | 首次利用单细胞转录组学方法系统比较前列腺癌与良性前列腺增生患者外周血单核细胞的免疫细胞亚群及基因表达差异，发现CD14+单核细胞、NK细胞和γδT细胞在前列腺癌中显著升高，并鉴定出多个潜在生物标志物 | 样本量较小，仅包含4例前列腺癌和3例良性前列腺增生患者，且未进行功能验证 | 探究前列腺癌与良性前列腺增生在外周血单核细胞水平的分子差异，寻找区分两种疾病的潜在生物标志物 | 4例前列腺癌患者和3例良性前列腺增生患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 7例外周血样本（4例前列腺癌，3例良性前列腺增生） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 876 | 2026-04-30 |
Molecular and cellular neurocardiology in heart disease
2025-03, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP284739
PMID:38778747
|
综述 | 本文更新并扩展了关于心脏病分子和细胞神经生物学的基础，重点讨论了心脏自主神经发育、新型细胞内通路和神经可塑性的最新发现 | 利用患者特异性干细胞研究交感神经损伤，通过空间转录组学和新型成像技术发现治疗心脏自主神经功能障碍的分子靶点 | 文中强调了尚未解答的问题和存在争议的领域 | 探讨心脏病的分子和细胞神经心脏学机制及治疗潜力 | 心脏自主神经系统、神经化学通路、患者特异性干细胞 | 机器学习, 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 877 | 2026-04-30 |
Biophysical modelling of intrinsic cardiac nervous system neuronal electrophysiology based on single-cell transcriptomics
2025-03, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP287595
PMID:40077928
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研究论文 | 基于单细胞转录组数据开发心脏内在神经系统神经元电生理模型的计算库 | 首次利用单神经元转录组数据构建心脏内在神经系统神经元电生理模型计算库，通过循环阈值选择离子通道组合，结合被动电学特性约束模型参数，成功预测了与实验观察一致的神经元相位和强直反应分布 | 未明确提及 | 构建心脏内在神经系统神经元电生理多尺度计算模型，研究其在心脏调节和病理中的功能作用 | 心脏内在神经系统（ICNS）神经元 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 单细胞转录组数据中的ICNS神经元 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 878 | 2026-04-29 |
UV induces common cutaneous amyloid-like melanosomal protein aggregates
2025-Dec-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.17.689083
PMID:41446198
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研究论文 | 研究表明紫外线诱导黑色素细胞中α-突触核蛋白等形成类淀粉样蛋白聚集体，导致常见色素性疾病和光老化 | 发现紫外线以类朊病毒方式诱导黑色素体蛋白自传播聚集，并首次将黑色素体蛋白病与常见色素异常和光老化联系起来 | 未提及具体局限性 | 阐明紫外线诱导黑色素体蛋白聚集的机制及其在色素性疾病中的作用 | 黑色素细胞、小鼠模型、临床色素性病变样本 | 数字病理学 | 色素性疾病, 帕金森病, 光老化 | RT-QuIC, CUT&RUN, 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 电子显微镜 | NA | 图像, 文本 | 多种临床色素性病变样本、原代黑色素细胞和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 879 | 2026-04-29 |
Multi-omics reveals changes in astrocyte fatty acid metabolism during early stages of Alzheimer's disease
2025-11, Neurochemistry international
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.neuint.2025.106049
PMID:40889558
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研究论文 | 通过多组学分析揭示阿尔茨海默病早期星形胶质细胞脂肪酸代谢的变化 | 首次通过多组学（转录组学、蛋白质组学、空间代谢组学）联合分析，系统描述了阿尔茨海默病早期星形胶质细胞中脂肪酸代谢的动态变化，并利用人类单细胞RNA测序数据验证了这些变化的临床相关性 | 尚未说明具体局限性 | 探究阿尔茨海默病早期星形胶质细胞中脂肪酸代谢的分子动态变化及其与疾病进展的关系 | 阿尔茨海默病模型APP/PS1小鼠和野生型小鼠的星形胶质细胞，以及人脑样本中的星形胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 多组学（转录组学、蛋白质组学、空间代谢组学）、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、代谢物空间分布数据、单细胞转录组数据 | APP/PS1和WT小鼠在5个时间点（2、4、6、9、12月龄）的星形胶质细胞样本；人脑单细胞核RNA测序样本 | NA | 单细胞RNA测序、空间代谢组学 | NA | NA |
| 880 | 2026-04-29 |
Dynamic interaction of oligodendrocyte precursor cells with other cell types in the central nervous system
2025-11, Neurochemistry international
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.neuint.2025.106050
PMID:40930164
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综述 | 系统梳理少突胶质前体细胞与中枢神经系统中其他细胞类型的动态相互作用机制 | 利用单细胞测序和体内成像等新技术，揭示了OPC在神经发育、组织稳态维持和病理微环境重塑中与多种CNS细胞群进行广泛动态相互作用的功能可塑性 | NA | 综合OPC多模式功能的现有证据，评估非成髓鞘贡献，并探讨神经再生医学的有前景治疗靶点 | 少突胶质前体细胞（OPCs）及其与神经元、星形胶质细胞、小胶质细胞和血管内皮细胞的相互作用 | 数字病理学 | 多发性硬化症、脑缺血 | 单细胞测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |