单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 10549 篇文献，本页显示第 8721 - 8740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8721 | 2025-10-07 |
PD-1 activation mitigates lupus nephritis by suppressing hyperactive and heterogeneous PD-1+CD8+ T cells
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.107418
PMID:40303350
|
研究论文 | 本研究揭示PD-1+CD8+ T细胞在狼疮性肾炎中的过度活跃特性，并通过PD-L1 Fc融合蛋白治疗验证其治疗潜力 | 首次系统阐明PD-1+CD8+ T细胞在自身免疫疾病中的非耗竭特性，发现其具有克隆扩增和过度活化特征 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化需进一步验证 | 探究PD-1+CD8+ T细胞在狼疮性肾炎中的作用机制及治疗策略 | 狼疮性肾炎患者和NZB/W F1小鼠 | 免疫学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞RNA测序, RNA-seq, q-PCR, 流式细胞术, Western blot | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 细胞表型数据 | 狼疮性肾炎患者和NZB/W F1小鼠（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8722 | 2025-10-07 |
Identification of disulfidptosis in esophageal squamous cell carcinoma based on single-cell and bulk RNA-seq data to predict prognosis and treatment response
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1567793
PMID:40303412
|
研究论文 | 基于单细胞和批量RNA-seq数据识别食管鳞状细胞癌中的二硫键死亡特征，构建预后模型并预测治疗反应 | 首次在食管鳞癌中系统识别二硫键死亡相关分子亚型，构建具有独立预后价值的特征模型，并发现潜在靶向药物 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 建立食管鳞癌预后预测模型并探索治疗靶点 | 食管鳞状细胞癌患者 | 生物信息学 | 食管癌 | RNA-seq, 单细胞测序 | Cox回归, LASSO-Cox回归 | 基因表达数据 | GSE53625和TCGA-ESCC队列数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 8723 | 2025-10-07 |
Heterogenous cancer-associated fibroblasts related tumor microenvironment marked by CD10/KLF4/TIAM1 were identified in pancreatic adenocarcinoma by integrated transcriptomics
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1557698
PMID:40303408
|
研究论文 | 通过整合转录组学识别胰腺导管腺癌中CD10/KLF4/TIAM1标记的异质性癌症相关成纤维细胞相关肿瘤微环境 | 首次系统识别胰腺癌中三种不同的CAF相关TME亚型，并发现关键CAF亚群与肿瘤细胞和巨噬细胞的相互作用机制 | 研究样本量有限，需要进一步验证CAF亚型在治疗反应中的具体作用机制 | 探索胰腺导管腺癌肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞亚型的组成、比例及其临床意义 | 胰腺导管腺癌患者肿瘤组织和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 整合转录组学，多重免疫组织化学，空间转录组学 | NA | 基因表达数据，空间转录组数据，免疫组织化学图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 空间转录组学，转录组分析 | NA | NA |
| 8724 | 2025-10-07 |
Decoding immune cell dynamics in ischemic stroke: insights from single-cell RNA sequencing analysis
2025, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2025.1549518
PMID:40303468
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析解码缺血性卒中中的免疫细胞动态 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统分析缺血性卒中中的细胞类型、吞噬作用及相关分子机制 | 样本量相对有限（5,582个单细胞），仅基于生物信息学分析需要实验验证 | 研究缺血性卒中的细胞类型和分子生物学过程 | 健康对照和缺血性卒中患者的单细胞 | 生物信息学 | 缺血性卒中 | 单细胞RNA测序 | UMAP, iTALK | 基因表达数据 | 5,582个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8725 | 2025-10-07 |
Heterogeneity of Renal Endothelial Cells, Interact with Neighboring Cells, and Endothelial Injury in Chronic Kidney Disease: Mechanisms and Therapeutic Implications
2025, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.108299
PMID:40303495
|
综述 | 探讨肾脏内皮细胞异质性及其与邻近细胞相互作用在慢性肾脏病中的机制与治疗意义 | 整合单细胞测序技术揭示肾脏内皮细胞异质性及其微环境影响的最新研究进展 | 作为综述文章，未包含原始实验数据验证 | 阐明慢性肾脏病中内皮细胞异质性及损伤机制，探索治疗策略 | 肾脏内皮细胞及其与邻近细胞的相互作用 | 单细胞生物学 | 慢性肾脏病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8726 | 2025-10-07 |
Comprehensive Characterization of the Oxidative Stress Profiles in Neonatal Necrotizing Enterocolitis
2025, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.109008
PMID:40303487
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk-RNA测序和单细胞RNA测序数据，系统揭示了坏死性小肠结肠炎中氧化应激特征及相关机制 | 首次整合bulk-RNA和单细胞RNA测序数据系统分析NEC中氧化应激特征，识别了关键枢纽基因和四种巨噬细胞亚型 | 枢纽基因列表在摘要中未完整呈现，具体药物名称也未明确列出 | 阐明坏死性小肠结肠炎中氧化应激特征，识别关键基因和相关机制，探索潜在治疗药物 | 坏死性小肠结肠炎组织和细胞，NEC小鼠模型 | 生物信息学 | 坏死性小肠结肠炎 | bulk-RNA测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 免疫荧光染色, 差异分析, 基因集富集分析, 免疫浸润分析 | NEC小鼠模型 | RNA测序数据, 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 8727 | 2025-10-07 |
Integrative analysis of m6A-SNPs and single-cell RNA sequencing reveals key drivers of endocrine combined with CDK4/6 inhibitor therapy resistance in ER+ breast cancer
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1590363
PMID:40303916
|
研究论文 | 通过整合m6A-SNPs和单细胞RNA测序分析，揭示ER+乳腺癌对内分泌联合CDK4/6抑制剂治疗耐药的关键驱动因素 | 首次结合m6A-SNPs和单细胞RNA测序技术，在单细胞分辨率下解析ER+乳腺癌治疗耐药的分子机制 | 研究样本量有限，需要更大规模验证；机制研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证 | 探索m6A修饰在ER+乳腺癌对内分泌联合CDK4/6抑制剂治疗耐药中的作用机制 | ER阳性乳腺癌患者 | 单细胞转录组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联分析, 伪时间轨迹分析 | 伪时间轨迹分析 | 单细胞转录组数据, GWAS数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8728 | 2025-10-07 |
Single Cell Transcriptomics Genomics Based on Machine Learning Algorithm: Constructing and Validating Neutrophil Extracellular Trap Gene Model in COPD
2025, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S516139
PMID:40308227
|
研究论文 | 本研究基于单细胞转录组学数据，通过机器学习算法构建并验证了针对吸烟和非吸烟COPD患者的中性粒细胞胞外诱捕网特征基因模型 | 首次针对吸烟和非吸烟COPD患者分别构建了NET特征基因模型，并进行了内外验证 | 样本量相对有限，需要在更大队列中进一步验证模型的普适性 | 识别不同COPD患者中的中性粒细胞胞外诱捕网特征基因 | COPD和非COPD个体的中性粒细胞 | 单细胞转录组学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序，机器学习算法 | 机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | COPD和非COPD个体的单细胞数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8729 | 2025-10-07 |
The suppressive role of GLS in radiosensitivity and irradiation-induced immune response in LUAD: integrating bioinformatics and experimental insights
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1582587
PMID:40308578
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学和实验验证揭示了谷氨酰胺酶(GLS)在肺腺癌放射敏感性和放疗诱导免疫应答中的抑制作用 | 首次系统阐明GLS通过调控铁死亡和免疫景观重塑在肺腺癌放疗中的双重调节作用，并建立了GLS-DSBr预后预测模型 | GLS调控免疫应答的具体分子机制仍需进一步深入研究 | 探究GLS在肺腺癌放射敏感性和放疗诱导免疫应答中的作用机制及临床价值 | 肺腺癌(LUAD)细胞、动物模型和2,066例LUAD患者数据 | 生物信息学 | 肺腺癌 | RNA-seq、单细胞转录组学、空间转录组学、流式细胞术、共培养实验 | 机器学习模型 | 转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 2,066例LUAD患者 | NA | bulk RNA-seq, single-cell transcriptomics, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 8730 | 2025-10-07 |
Harnessing single-cell and multi-omics insights: STING pathway-based predictive signature for immunotherapy response in lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1575084
PMID:40308576
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和转录组数据，开发了基于STING通路的肺腺癌免疫治疗反应预测标志物 | 首次结合单细胞RNA测序和批量转录组数据，开发STING通路相关特征，并通过动物实验验证关键基因ERRFI1的免疫调节功能 | 研究主要基于公共数据库数据，需要更多独立队列验证预测模型的临床适用性 | 探索STING信号通路与肺腺癌免疫治疗反应的关系，开发预测性生物标志物 | 肺腺癌患者样本数据和小鼠模型 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, 多色流式细胞术, 生物信息学分析 | 101种机器学习框架 | 基因表达数据, 单细胞数据 | 来自GEO和TCGA数据库的公共数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 8731 | 2025-10-07 |
The single-cell atlas of short-chain fatty acid receptors in human and mice hearts
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1538384
PMID:40308581
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序数据绘制人和小鼠心脏中短链脂肪酸受体FFAR2/3的分布图谱 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘FFAR2/3受体在正常和梗死心脏中的分布特征 | 基于公共数据库分析，缺乏实验验证 | 阐明短链脂肪酸受体在心脏中的分布模式和作用机制 | 人和小鼠心脏组织 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 18个公共单细胞RNA-seq和单核RNA-seq数据集 | NA | single-cell RNA-seq, single-nuclear RNA-seq | NA | NA |
| 8732 | 2025-10-07 |
Multi-omics landscape of alternative splicing in diffuse midline glioma reveals immune- and neural-driven subtypes with implications for spliceosome-targeted therapy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1587009
PMID:40308585
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了弥漫性中线胶质瘤中可变剪接的景观，识别了神经和免疫驱动的亚型 | 首次在H3K27突变弥漫性中线胶质瘤中系统分析可变剪接景观，并基于RNA结合蛋白建立了新的疾病亚型分类 | 研究主要基于细胞系和已发表数据集，需要进一步在临床样本中验证 | 探索可变剪接在弥漫性中线胶质瘤中的作用及其治疗意义 | H3WT和H3K27突变弥漫性中线胶质瘤细胞系 | 生物信息学 | 弥漫性中线胶质瘤 | RNA-seq, scRNA-seq, 多组学分析 | NA | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 患者来源的细胞系和已发表数据集 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8733 | 2025-10-07 |
Artificial intelligence-assisted RNA-binding protein signature for prognostic stratification and therapeutic guidance in breast cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1583103
PMID:40308601
|
研究论文 | 开发人工智能辅助的RNA结合蛋白特征模型用于乳腺癌预后分层和治疗指导 | 首次构建基于三个关键RBP基因的人工智能辅助特征模型，在14个队列9000+患者中验证其预后价值并揭示相关分子机制 | 需要在更多样化人群中验证结果，并扩展功能分析研究 | 提高乳腺癌预后准确性并指导个性化治疗 | 乳腺癌患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序，基因组分析 | 机器学习模型组合 | 基因组数据，转录组数据，单细胞数据 | 14个队列9000+患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8734 | 2025-10-07 |
SUMOylation substrate encoding genes as prognostic biomarkers in pancreatic ductal adenocarcinoma with functional assessment of SAF-B2
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1532658
PMID:40308776
|
研究论文 | 本研究通过构建SUMOylation相关预后模型Sscore，揭示了SAFB2在胰腺导管腺癌中的肿瘤抑制功能 | 首次构建基于SUMOylation底物编码基因的预后模型Sscore，并发现SAFB2通过抑制Wnt/β-Catenin通路发挥抑癌作用 | 研究主要基于公共数据库和体外实验，需要进一步体内实验验证 | 探讨SUMOylation在胰腺导管腺癌中的预后价值及相关分子机制 | 胰腺导管腺癌组织和细胞系 | 生物信息学 | 胰腺癌 | Western blot, 单细胞RNA测序, LASSO回归, Cox回归 | 预后风险评分模型 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | TCGA和GTEx数据库中的胰腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 8735 | 2025-10-07 |
The mechanism by which MALAT1/CREG1 regulates premature rupture of fetal membrane through autophagy mediated differentiation of amniotic fibroblasts
2025-Aug, Non-coding RNA research
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.ncrna.2025.04.004
PMID:40297152
|
研究论文 | 本研究探讨了MALAT1/CREG1通过自噬介导羊膜成纤维细胞分化调控胎膜早破的机制 | 首次发现MALAT1与CREG1相互作用调控自噬过程，介导羊膜成纤维细胞向肌成纤维细胞分化 | NA | 探索通过干预成纤维细胞修复羊膜的科学问题，为临床治疗胎膜早破提供证据 | 胎膜组织和原代羊膜成纤维细胞 | 生物医学研究 | 胎膜早破 | 单细胞测序,天狼星红染色,荧光染色,拉曼光谱,Western blot,PCR,RNA Pulldown,RIP,分子对接 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,细胞图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8736 | 2025-10-07 |
Uncovering differences in cadmium accumulation capacity of different Ipomoea aquatica cultivars at the level of root cell types
2025-Jun, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhaf077
PMID:40297020
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了不同空心菜品种根部细胞类型在镉积累能力差异中的机制 | 首次在单细胞水平比较了低镉积累和高镉积累空心菜品种根部细胞类型的基因表达差异，揭示了表皮细胞木质素沉积和激素相关基因在镉固定与转运中的关键作用 | 研究仅针对两个栽培品种，样本规模有限，且机制验证主要基于基因表达分析和荧光检测，需要进一步的功能实验证实 | 阐明不同空心菜品种根部细胞类型在镉积累能力差异中的分子机制 | 空心菜（Ipomoea aquatica）QLQ（低镉积累）和T308（高镉积累）两个栽培品种的根尖细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序，荧光检测 | NA | 基因表达数据，荧光成像数据 | 两个空心菜栽培品种的根尖细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8737 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Uncovers Molecular Features Underlying the Disrupted Neurogenesis Following Traumatic Brain Injury
2025-May, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24671
PMID:39760225
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示创伤性脑损伤后神经发生破坏的分子特征 | 首次通过大规模单细胞转录组测序识别出表达Tubb3基因的NSC-4亚群减少是神经发生破坏的关键原因，并发现转录因子Dlx2的下调及其过表达可促进神经元谱系分化 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究创伤性脑损伤后神经干细胞分化偏向的分子机制 | 小鼠脑室下区神经干细胞及其衍生细胞 | 单细胞测序 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8738 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Developmental Landscape of Wheat Roots
2025-May, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.15321
PMID:39763237
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小麦根尖细胞的转录组异质性和发育轨迹 | 首次在小麦中应用单细胞RNA测序技术解析根尖细胞类型组成和发育轨迹，并进行跨物种比较分析 | 仅分析了中国春小麦品种的根尖组织，样本来源相对有限 | 解析小麦根尖细胞类型特异的转录程序和发育机制 | 中国春小麦品种的根尖细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 中国春小麦根尖单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8739 | 2025-10-07 |
Myeloid deficiency of Z-DNA binding protein 1 restricts septic cardiomyopathy via promoting macrophage polarisation towards the M2-subtype
2025-May, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70315
PMID:40289345
|
研究论文 | 本研究揭示了ZBP1蛋白在脓毒症心肌病中的作用机制，发现巨噬细胞中STAT1-ZBP1轴促进心肌功能障碍 | 首次发现巨噬细胞中STAT1-ZBP1信号轴在脓毒症心肌病中的关键作用，并证明ZBP1缺失可促进巨噬细胞向M2亚型极化 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化价值需进一步验证 | 探究ZBP1在脓毒症心肌病发生发展中的分子机制 | LPS处理的小鼠模型，重点关注心肌组织中的巨噬细胞 | 分子生物学 | 脓毒症心肌病 | 单细胞mRNA测序, 单核mRNA测序, 免疫荧光, 超声心动图 | NA | 基因表达数据, 影像数据 | LPS处理的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 8740 | 2025-10-07 |
cGAS/STING signalling in macrophages aggravates obliterative bronchiolitis via an IFN-α-dependent mechanism after orthotopic tracheal transplantation in mice
2025-May, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70323
PMID:40292672
|
研究论文 | 本研究通过小鼠原位气管移植模型，揭示了cGAS/STING信号通路通过IFN-α2依赖性机制加剧闭塞性细支气管炎的分子机制 | 首次证明巨噬细胞中cGAS/STING信号通路通过IFN-α2依赖性方式加重移植排斥反应，并发现STING抑制可增强CTLA4-Ig的治疗效果 | 研究仅使用小鼠模型，尚未在人类临床样本中验证 | 探究cGAS/STING信号通路在闭塞性细支气管炎发病机制中的具体作用 | 小鼠原位气管移植模型和巨噬细胞特异性Sting1基因敲除小鼠 | 免疫学 | 闭塞性细支气管炎 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色, qRT-PCR, 流式细胞术 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 细胞表型数据, 组织病理数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |