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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8701 | 2025-05-09 |
Integrated multiomics and Mendelian randomization identify CHIT1 as a novel sepsis biomarker and therapeutic target
2025-May-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-99619-z
PMID:40325173
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和孟德尔随机化方法,发现CHIT1作为脓毒症的新型生物标志物和治疗靶点 | 首次将CHIT1鉴定为脓毒症的新生物标志物和潜在药物靶点,揭示了其在加剧中性粒细胞过度炎症和免疫抑制中的作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏前瞻性临床验证 | 寻找能预测脓毒症患者预后的新关键生物标志物并探索其分子机制 | 脓毒症患者 | 生物信息学 | 脓毒症 | 批量转录组测序、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、孟德尔随机化(MR)分析 | 单变量Cox回归模型 | 基因表达数据 | 多个GEO数据集(GSE65682等)和eQTLGen Consortium及IEU OpenGWAS项目数据 | NA | NA | NA | NA |
| 8702 | 2025-05-09 |
Modulation of senescent Lepr+ skeletal stem cells via suppression of leptin-induced STAT3‒FGF7 axis activation alleviates abnormal subchondral bone remodeling and osteoarthritis progression
2025-May-05, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04342-1
PMID:40325465
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和体内外实验,揭示了瘦素受体阳性骨骼干细胞(Lepr+ SSCs)在骨关节炎(OA)进展中的衰老机制及其通过STAT3-FGF7轴加剧软骨下骨异常重塑的作用 | 首次揭示了Lepr+ SSCs通过瘦素-Lepr信号通路激活STAT3-FGF7轴促进OA进展的新机制,为OA治疗提供了新的靶点 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类OA患者中进行验证 | 探究骨骼干细胞衰老在骨关节炎进展中的作用及其分子机制 | 小鼠创伤后骨关节炎(PTOA)模型中的Lepr+骨骼干细胞 | 骨生物学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、microCT、病理分析 | 小鼠PTOA模型 | 基因表达数据、影像数据、组织病理数据 | 未明确说明具体样本数量(小鼠模型) | NA | NA | NA | NA |
| 8703 | 2025-05-08 |
Identification of CXCL13 as a Promising Biomarker for Immune Checkpoint Blockade Therapy and PARP Inhibitor Therapy in Ovarian Cancer
2025-Jun, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-024-01207-5
PMID:38856873
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research paper | 该研究识别了CXCL13作为卵巢癌免疫检查点阻断疗法和PARP抑制剂疗法的潜在生物标志物 | 发现CXCL13在HRD肿瘤中显著上调,并作为反映HRD状态的生物标志物,为卵巢癌ICB治疗提供了新的预后生物标志物视角 | 研究依赖于公共数据库和独立队列的验证,可能需要更多实验数据进一步确认CXCL13的临床应用价值 | 探索卵巢癌中免疫检查点阻断疗法和PARP抑制剂疗法的生物标志物 | 卵巢癌患者 | digital pathology | ovarian cancer | 基因组测序、免疫组化、单细胞测序 | NA | 基因组数据、临床数据、单细胞测序数据 | 来自TCGA、ICGC、GEO等公共数据库的数据,以及独立验证队列 | NA | NA | NA | NA |
| 8704 | 2025-05-08 |
A Spatial Multi-Omic Framework Identifies Gliomas Permissive to TIL Expansion
2025-Apr-25, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6314842/v1
PMID:40313763
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研究论文 | 该研究通过多模态分析方法识别了允许肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)扩增的胶质瘤的空间和分子特征 | 整合了多种高通量技术(如单细胞RNA测序、空间蛋白质组学等)进行多模态分析,揭示了TIL扩增的基因组和空间决定因素 | 研究主要针对高级别胶质瘤,结果在其他免疫排斥性癌症中的普适性需要进一步验证 | 识别TIL扩增的基因组和空间决定因素,为基于T细胞的免疫治疗提供选择平台 | 高级别胶质瘤 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 光谱流式细胞术、TCR测序、单细胞RNA-seq、Xenium转录组学、CODEX空间蛋白质组学 | NA | 多组学数据(基因组、转录组、蛋白质组) | 未明确提及具体样本数量,但涉及高级别胶质瘤的TIL生成与非生成肿瘤对比 | NA | NA | NA | NA |
| 8705 | 2025-05-07 |
Identifying the Pattern Characteristics of Anoikis-Related Genes in Keloid
2025-May, Advances in wound care
IF:5.8Q1
DOI:10.1089/wound.2024.0027
PMID:38775414
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research paper | 该研究首次全面分析了anoikis相关基因(ARGs)在瘢痕疙瘩(KD)中的作用,并鉴定了六个核心ARGs | 首次研究ARGs在KD中的潜在价值,并鉴定了六个核心ARGs及其与KD免疫浸润的关联 | 研究仅基于三个KF RNA-seq数据集,样本量有限 | 探究ARGs在KD中的表达特征及其分子机制 | 瘢痕疙瘩(KD)和anoikis相关基因(ARGs) | 生物信息学 | 瘢痕疙瘩 | RNA-seq, 单细胞测序, LASSO-Cox回归分析 | LASSO回归模型 | 基因表达数据 | 三个KF RNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 8706 | 2025-05-07 |
Single-cell multiomics reveals a gene regulatory circuit driving leukemia cell differentiation
2025-May, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03309-z
PMID:39984714
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析揭示了ATRA诱导白血病细胞分化的基因调控回路 | 整合单细胞染色质可及性和转录组分析,发现SPI1和CEBPE组成的正反馈基因调控回路驱动白血病细胞分化 | 研究主要基于NB4细胞系,在其他白血病细胞类型中的普适性需要进一步验证 | 探索ATRA诱导急性早幼粒细胞白血病细胞分化的调控机制 | PML/RARα急性早幼粒细胞白血病(APL)细胞系NB4,以及非APL白血病细胞系HL60和K562 | 单细胞多组学 | 急性早幼粒细胞白血病 | 单细胞染色质可及性分析,单细胞转录组分析 | NA | 单细胞多组学数据 | NB4、HL60和K562白血病细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 8707 | 2025-05-07 |
SLC13A5 plays an essential role in the energy shift to oxidative phosphorylation in cisplatin-resistant mesothelioma stem cells
2025-Mar, Pathology international
IF:2.5Q2
DOI:10.1111/pin.70001
PMID:39912507
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research paper | 该研究探讨了SLC13A5在顺铂耐药间皮瘤干细胞能量代谢向氧化磷酸化转变中的关键作用 | 揭示了SLC13A5通过调节代谢转变和信号通路增强间皮瘤干细胞的顺铂耐药性 | 研究主要基于体外实验和数据库分析,缺乏体内实验验证 | 探索靶向癌症干细胞的新型治疗方法 | 人类间皮瘤细胞系和间皮瘤干细胞样细胞 | 肿瘤生物学 | 间皮瘤 | 微阵列分析、scRNA-seq | 水凝胶培养模型 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 人类间皮瘤细胞系和临床间皮瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 8708 | 2025-05-07 |
Immune microenvironment spatial landscapes of tertiary lymphoid structures in gastric cancer
2025-Feb-04, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-025-03889-3
PMID:39901202
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research paper | 该研究探讨了胃癌中三级淋巴结构(TLS)对免疫微环境空间景观的影响及其预后价值 | 首次全面分析了胃癌中TLS的免疫微环境空间特征,并开发了基于免疫细胞密度和空间特征的风险评分模型 | 样本量相对较小(单细胞测序仅12例,空间转录组仅2例) | 阐明TLS在胃癌免疫微环境中的作用机制及其预后意义 | 胃癌患者的肿瘤组织和免疫微环境 | digital pathology | gastric cancer | multispectral fluorescence imaging, single-cell RNA sequencing, spatial transcriptomics | Density and Spatial Score risk model | image, transcriptomic data | 59例接受免疫治疗的GC患者(预后分析),110例GC患者(免疫细胞分析),12例单细胞测序样本(4例TLS阳性,8例阴性),2例空间转录组样本 | NA | NA | NA | NA |
| 8709 | 2025-05-07 |
Single-cell sequencing provides clues about the developmental genetic basis of evolutionary adaptations in syngnathid fishes
2025-Feb-03, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97764
PMID:39898521
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序技术探索了海龙科鱼类进化适应的发育遗传基础 | 首次构建了海湾管鱼胚胎的单细胞RNA测序图谱,揭示了其特殊性状(如雄性怀孕、无齿等)的发育遗传机制 | 研究仅针对单一物种(海湾管鱼)的胚胎阶段,未来需要跨物种和多发育阶段的比较研究 | 探究海龙科鱼类特殊性状的发育遗传基础 | 海湾管鱼胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 海湾管鱼胚胎样本(具体数量未明确说明) | NA | NA | NA | NA |
| 8710 | 2025-05-07 |
Optimized gene transduction in human lung organoids: A high-efficiency method for advanced research applications
2025-Feb-03, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07461-w
PMID:39900972
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研究论文 | 本文优化了一种提高慢病毒载体在人iPSC来源肺类器官中转导效率的方法 | 通过物理破坏类器官增加表面积并结合旋转接种法,显著提高了转导效率 | 方法可能不适用于其他类型的类器官或细胞模型 | 提高基因转导效率以促进肺研究和疾病模型研究 | 人iPSC来源的肺类器官 | 生物医学工程 | 肺疾病 | 慢病毒载体转导、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8711 | 2025-05-07 |
IgG Signalling Involves in Skin Inflammation of Atopic Dermatitis
2025-Feb, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.70058
PMID:39912287
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研究论文 | 本研究探讨了IgE产生B细胞及其他免疫球蛋白同种型(特别是IgG)在特应性皮炎(AD)皮肤病变中的作用 | 揭示了IgG在AD皮肤炎症中的潜在作用及其通过巨噬细胞促进Th2炎症的机制 | 未明确IgG具体通过何种机制激活巨噬细胞及促进炎症 | 研究IgE产生B细胞及其他免疫球蛋白同种型在AD皮肤病变中的作用 | 特应性皮炎患者及非过敏性健康受试者的皮肤病变和PBMCs | 免疫学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序、BCR库分析 | NA | mRNA数据、单细胞RNA测序数据 | AD患者及健康受试者的皮肤病变和PBMCs样本 | NA | NA | NA | NA |
| 8712 | 2025-05-07 |
Analysis of synthetic polymer hydrogel-based generation of leukemia stem cells
2025-01, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2024.151149
PMID:39700762
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研究论文 | 本文通过合成聚合物水凝胶培养K562白血病细胞,使其获得白血病干细胞特性,并研究了AKR1B1和TSPYL5在干细胞特性生成中的关键作用 | 首次利用合成聚合物水凝胶培养系统快速生成白血病干细胞,并鉴定出AKR1B1和TSPYL5作为潜在的干细胞治疗靶点 | 研究仅针对K562白血病细胞系,未在其他白血病模型或体内实验中验证 | 开发快速生成白血病干细胞的方法并探索其治疗靶点 | K562白血病细胞 | 癌症研究 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | K562细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 8713 | 2025-05-07 |
TBX3 shapes an immunosuppressive microenvironment and induces immunotherapy resistance
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.103175
PMID:39897553
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research paper | 该研究探讨了TBX3在膀胱癌免疫抑制微环境中的作用及其对免疫治疗抵抗的影响 | 首次系统性地揭示了TBX3通过调节TGFβ1表达促进免疫抑制微环境形成的分子机制,并验证了TBX3作为免疫治疗疗效预测标志物的潜力 | 研究主要基于公共数据库和体外实验,需要更多临床样本验证TBX3的临床应用价值 | 探索膀胱癌免疫治疗抵抗的分子机制并寻找新的治疗靶点 | 膀胱癌组织和细胞 | 肿瘤免疫学 | 膀胱癌 | bulk RNA测序、单细胞RNA测序、高通量细胞因子阵列、ProcartaPlex多重免疫分析、TissueFAXS全景组织定量分析 | NA | RNA测序数据、组织微阵列数据 | 多个公共数据库样本和真实世界免疫治疗队列 | NA | NA | NA | NA |
| 8714 | 2025-05-07 |
Glycosphingolipids-Dependent Phospholipid Metabolism Enhances Cancer Initiation and Progression through SMPD1/GLTP/B3GALT4/ST8SIA6 Signaling Axis: A Novel Therapeutic Target
2025, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.103834
PMID:39898245
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研究论文 | 通过整合单细胞测序数据和TCGA数据库,研究鞘脂代谢在结直肠癌发生发展中的关键作用 | 发现鞘脂代谢失调在结直肠癌发展中的关键作用,并确定了几个潜在的治疗靶点 | 未提及实验验证或临床前研究的具体结果 | 探索结直肠癌发生发展的分子机制,并寻找潜在的治疗靶点 | 结直肠癌细胞 | 癌症研究 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8715 | 2025-05-07 |
Comprehensive Pan-Cancer Analysis of RAC1 Decoding the Impact on Cancer Prognosis and B cell immune Regulation
2025, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.104488
PMID:39898257
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研究论文 | 本文对RAC1在33种癌症类型中的表达及其对癌症预后和B细胞免疫调节的影响进行了全面分析 | 揭示了RAC1在多种癌症中的高表达及其与不良预后的关联,首次系统研究了RAC1在肿瘤免疫微环境中的作用 | 研究主要基于生物信息学分析,需要更多实验验证 | 探索RAC1在泛癌水平上的表达特征及其对肿瘤免疫微环境的调控作用 | 33种癌症类型中的RAC1表达 | 癌症基因组学 | 泛癌分析 | 基因组变异分析(CNV、TMB、MSI)、单细胞转录组分析、空间转录组分析 | 预后特征模型 | 基因组数据、转录组数据 | 33种癌症类型的多组学数据 | NA | NA | NA | NA |
| 8716 | 2025-05-07 |
Integrating Tissue Microarray to GeoMx® Digital Spatial Profiler : Spatial Transcriptomics Assay with Bioinformatics Analysis
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4276-4_9
PMID:39900760
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研究论文 | 本文介绍了如何将组织微阵列整合到GeoMx®数字空间分析仪中,进行空间转录组学检测及生物信息学分析 | 详细描述了数字空间分析仪(DSP)的NGS检测协议及生物信息学分析流程,特别关注组织微阵列的整合及GeoMx RNA检测的特定方法 | 依赖于NanoString公司提供的GeoMX DSP指南和GeoMx数据分析手册的当前版本,需定期检查更新 | 推动空间转录组学技术在疾病研究和治疗中的应用 | 组织微阵列和GeoMx RNA检测 | 空间转录组学 | NA | NGS, RNA-Seq, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8717 | 2025-05-07 |
Analysis of downstream targets of PAX6 and LHX2, fundamental regulators of the developing mammalian neocortex
2025, Journal of biosciences
IF:2.1Q2
PMID:39912400
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研究论文 | 分析PAX6和LHX2这两个哺乳动物大脑皮层发育中的基本调控因子的下游靶基因 | 比较了PAX6和LHX2的染色质占据情况以及各自缺失时的转录失调,识别了共同直接和间接靶基因,并分析了它们在神经发生过程中的表达模式 | 未进行实验验证所提出的假设 | 探究PAX6和LHX2在哺乳动物大脑皮层发育中的基因调控网络 | PAX6和LHX2转录因子及其下游靶基因 | 发育生物学 | NA | 染色质占据分析、单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8718 | 2025-10-07 |
Systems biology of Haemonchus contortus - Advancing biotechnology for parasitic nematode control
2025 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108567
PMID:40127743
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综述 | 本文综述了捻转血矛线虫分子生物学研究的关键进展及其在寄生虫控制中的生物技术应用 | 整合基因组学、转录组学和蛋白质组学技术解析关键分子通路,并应用机器学习和人工智能工具增强基因功能注释能力 | NA | 推动寄生虫线虫控制的生物技术发展 | 捻转血矛线虫及其与宿主的相互作用 | 生物信息学 | 寄生虫感染 | 基因组学, 转录组学, 蛋白质组学, 单细胞测序, 空间转录组学 | 机器学习算法, 人工智能驱动的蛋白质结构预测 | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 8719 | 2025-10-07 |
TREM2+ macrophages accumulate in childhood IgA nephropathy and soluble TREM2 represents a reliable non-invasive biomarker
2025-May-05, Experimental physiology
IF:2.6Q2
DOI:10.1113/EP092716
PMID:40321057
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现儿童IgA肾病中TREM2+巨噬细胞积累,并证实血浆可溶性TREM2可作为该病的非侵入性生物标志物 | 首次在儿童IgA肾病中发现TREM2+巨噬细胞亚群的积累,并验证血浆sTREM2水平与疾病严重程度的相关性 | 样本量有限(38例患者),需更大规模研究验证 | 探索儿童IgA肾病的发病机制并寻找非侵入性生物标志物 | 儿童IgA肾病患者 | 单细胞测序 | IgA肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 38例儿童IgA肾病患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8720 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics of human skin reveals age-associated specificity of distinct cell populations
2025-May-05, Archives of dermatological research
IF:1.8Q3
DOI:10.1007/s00403-025-04222-x
PMID:40323328
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示人类皮肤细胞在衰老过程中的功能特化和分子变化 | 首次在避光区域皮肤中系统揭示衰老相关的细胞特异性变化和细胞间通讯减少 | 样本量相对有限,仅关注健康供体的避光区域皮肤 | 阐明皮肤细胞在衰老过程中的分子和功能动态变化 | 人类皮肤细胞,重点关注真皮成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 皮肤衰老 | 单细胞RNA测序,差异基因表达分析,GO富集分析,KEGG通路分析,伪时序分析,CellChat分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过5,000个细胞,包括成纤维细胞、角质形成细胞和免疫细胞等多种皮肤细胞类型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |