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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8681 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome analysis reveals cellular reprogramming and changes of immune cell subsets following tetramethylpyrazine treatment in LPS-induced acute lung injury
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.18772
PMID:39822976
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示川芎嗪在LPS诱导的急性肺损伤中对细胞重编程和免疫细胞亚群的影响 | 首次在单细胞分辨率下系统揭示川芎嗪通过调节免疫细胞亚群和转录因子FOSL1/JunB发挥肺保护作用的新机制 | 研究仅基于小鼠模型,未进行临床验证;细胞亚群功能验证不够充分 | 探究川芎嗪对急性肺损伤肺组织微环境的保护作用及分子机制 | LPS诱导的急性肺损伤小鼠模型 | 单细胞组学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析,免疫组织化学,酶联免疫吸附试验 | NA | 单细胞转录组数据 | LPS诱导的急性肺损伤小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8682 | 2025-10-07 |
Cellular Senescence Genes as Cutting-Edge Signatures for Abdominal Aortic Aneurysm Diagnosis: Potential for Innovative Therapeutic Interventions
2025-Jan, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70323
PMID:39823264
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研究论文 | 本研究通过识别细胞衰老相关基因并验证其在腹主动脉瘤诊断中的潜力,揭示了细胞衰老在AAA进展中的关键作用 | 首次系统识别并验证ETS1和ITPR3作为腹主动脉瘤诊断生物标志物,结合机器学习算法和单细胞RNA测序技术 | 样本量相对有限,需要更大规模临床验证 | 识别与腹主动脉瘤发展相关的细胞衰老基因并评估其作为治疗靶点的潜力 | 腹主动脉瘤患者样本和小鼠模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, WB, IF, RT-qPCR, 机器学习算法 | LASSO, SVM-RFE, 随机森林 | 基因表达数据, 血清样本, 组织样本 | GSE57691训练集和两个独立验证数据集,人类血清样本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 8683 | 2025-10-07 |
BuDDI: Bulk Deconvolution with Domain Invariance to predict cell-type-specific perturbations from bulk
2025-Jan, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012742
PMID:39823522
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研究论文 | 提出一种名为BuDDI的批量数据反卷积方法,通过域适应技术整合批量数据和单细胞RNA测序数据,预测细胞类型特异性扰动效应 | 利用域适应技术学习独立的潜在空间,能够在不使用单细胞扰动数据的情况下预测细胞类型特异性扰动响应 | NA | 开发能够从批量数据预测细胞类型特异性扰动效应的方法 | 批量RNA测序数据和单细胞RNA测序参考数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | 变分自编码器(VAE) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 8684 | 2025-10-07 |
Macrophage Infiltration and ITGB2 Expression in ESCC: A Novel Correlation
2025-Jan, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70604
PMID:39825491
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据发现并验证了食管鳞癌中巨噬细胞浸润与ITGB2表达的正相关性 | 首次发现ITGB2在浸润巨噬细胞中的表达随其向促肿瘤表型极化而增加,并提出了ITGB2敲除M1巨噬细胞回输的新型免疫治疗策略 | NA | 探索食管鳞癌中与肿瘤免疫相关的关键分子和治疗策略 | 食管鳞癌组织样本和免疫细胞 | 生物信息学 | 食管鳞癌 | 高通量测序、基因芯片、单细胞测序、生物信息学分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8685 | 2025-10-07 |
Unveiling the mechanism of micro-and-nano plastic phytotoxicity on terrestrial plants: A comprehensive review of omics approaches
2025-Jan, Environment international
IF:10.3Q1
DOI:10.1016/j.envint.2025.109257
PMID:39818003
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综述 | 本文综述了组学方法在揭示微纳塑料对陆生植物毒性机制方面的应用 | 系统整合了多种前沿组学技术(包括4D组学、表型组学、空间转录组学和单细胞组学)在微纳塑料植物毒性研究中的应用 | NA | 阐明微纳塑料对陆生植物的毒性机制 | 陆生植物 | 环境毒理学 | NA | 蛋白质组学、代谢组学、转录组学、微生物组学、4D组学、表型组学、空间转录组学、单细胞组学 | NA | 组学数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞组学 | NA | NA |
| 8686 | 2025-10-07 |
Taurine ameliorates liver fibrosis by repressing Fpr2-regulated macrophage M1 polarization
2025-Jun-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2025.177614
PMID:40216178
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研究论文 | 本研究揭示牛磺酸通过抑制Fpr2/NF-κBp65通路调控巨噬细胞M1极化来改善肝纤维化的作用机制 | 首次阐明牛磺酸通过Fpr2/NF-κBp65信号轴调控巨噬细胞极化状态在肝纤维化中的保护作用 | NA | 探究牛磺酸对肝纤维化的保护作用及其分子机制 | 人类肝纤维化组织样本和两种不同的小鼠肝纤维化模型 | NA | 肝纤维化 | 氨基酸代谢组学, 基因表达微阵列分析, 单细胞RNA测序 | NA | 代谢组数据, 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8687 | 2025-10-07 |
Integrating Bulk RNA and Single-Cell Sequencing Data Unveils Efferocytosis Patterns and ceRNA Network in Ischemic Stroke
2025-Jun, Translational stroke research
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s12975-024-01255-8
PMID:38678526
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA和单细胞测序数据,揭示了缺血性脑卒中中的胞葬作用模式和ceRNA网络 | 首次整合bulk RNA和单细胞测序数据系统分析缺血性脑卒中中的胞葬作用,并构建了相关的ceRNA调控网络 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限 | 探索缺血性脑卒中后炎症反应和胞葬作用的细胞分子机制及其对脑损伤和恢复的影响 | 缺血性脑卒中患者和小鼠模型 | 生物信息学 | 缺血性脑卒中 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 生物信息学分析 | LASSO回归分析 | 基因表达数据 | 多个GEO数据集(GSE137482, GSE30655, GSE174574等),包括小鼠和人类样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8688 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomics Revealed White Matter Repair Following Subarachnoid Hemorrhage
2025-Jun, Translational stroke research
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s12975-024-01265-6
PMID:38861152
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了蛛网膜下腔出血后白质修复的细胞机制 | 首次在SAH模型中识别出修复性小胶质细胞在白质富集区域的浸润和克隆扩增,并发现小胶质细胞相关多效蛋白通过mTOR信号通路调节少突胶质前体细胞 | 研究仅使用小鼠模型,结果向人类临床应用的转化需要进一步验证 | 阐明蛛网膜下腔出血急性期和亚急性期脑细胞亚群在白质修复中的作用机制 | 蛛网膜下腔出血模型小鼠 | 单细胞组学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序, 基因集富集分析, 磁共振成像, 免疫荧光双染色, Western blot | NA | 单细胞转录组数据, 影像数据, 蛋白质数据 | SAH模型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8689 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing reveals a regulatory role of WT1 in mast cell proliferation in endometrial polyps
2025-May-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202500116R
PMID:40304994
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术研究子宫内膜息肉中肥大细胞的调控机制 | 首次在单细胞分辨率下揭示WT1转录因子调控子宫内膜息肉中肥大细胞增殖的新机制 | 样本量有限,需要进一步验证WT1调控机制的功能性实验 | 探索子宫内膜息肉的细胞异质性和分子机制 | 子宫内膜息肉组织和邻近正常子宫内膜组织 | 单细胞生物学 | 子宫内膜息肉 | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | 转录调控网络分析 | 基因表达数据 | 子宫内膜息肉和邻近正常子宫内膜组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 8690 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics in a child with coenzyme Q10 nephropathy: potential of single-cell RNA sequencing in pediatric kidney disease
2025-May, Pediatric nephrology (Berlin, Germany)
DOI:10.1007/s00467-024-06611-2
PMID:39805995
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了一名辅酶Q10肾病患儿的肾脏活检样本,揭示了该疾病中细胞类型比例和基因表达的变化 | 首次在辅酶Q10肾病中应用单细胞RNA测序技术,揭示了跨细胞类型的线粒体基因表达普遍下调 | 仅基于单个病例的研究,样本量有限 | 阐明辅酶Q10肾病在单细胞水平的基因表达变化 | 5岁辅酶Q10肾病患儿的肾脏活检组织 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例患儿肾脏活检样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8691 | 2025-10-07 |
T-type calcium channels regulate medulloblastoma and can be targeted for therapy
2025-May, Journal of neuro-oncology
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s11060-025-04967-5
PMID:39961940
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研究论文 | 本研究探讨T型钙通道在髓母细胞瘤中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 首次对髓母细胞瘤中T型钙通道进行全面的多组学表征,为米贝地尔药物重新用于治疗提供临床前数据 | 研究主要基于临床前模型,需要进一步临床试验验证 | 研究T型钙通道在髓母细胞瘤中的作用机制及治疗靶向性 | 髓母细胞瘤肿瘤细胞和异种移植模型 | 癌症研究 | 髓母细胞瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 反向蛋白质阵列(RPPA), 高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA) | NA | 基因表达数据, 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | 超过30%的髓母细胞瘤肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 8692 | 2025-10-07 |
Differential cellular origins of the extracellular matrix of tumor and normal tissues according to colorectal cancer subtypes
2025-May, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-02964-z
PMID:40032993
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研究论文 | 通过整合定量蛋白质组学和单细胞RNA测序数据,研究结直肠癌肿瘤微环境中细胞外基质的细胞来源异质性 | 首次系统鉴定结直肠癌中正常组织和肿瘤组织细胞外基质蛋白的差异细胞来源,并建立细胞-基质组数据库 | 样本量相对较小(21例患者),主要依赖公共数据集进行验证 | 解析结直肠癌肿瘤微环境中细胞外基质的异质性及其与临床预后的关系 | 结直肠癌患者组织样本和癌旁正常组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | TMT蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 生物信息学分析 | CMS分子分型, 单细胞水平反卷积分析 | 蛋白质组数据, RNA测序数据 | 21例结直肠癌患者的24个组织样本及癌旁正常组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 8693 | 2025-10-07 |
Macrophage-mediated IL-6 signaling drives ryanodine receptor-2 calcium leak in postoperative atrial fibrillation
2025-May-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI187711
PMID:40048254
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示浸润性CCR2+巨噬细胞通过IL-6-STAT3-CaMKII信号通路驱动兰尼碱受体2钙泄漏,导致术后房颤发生 | 首次发现巨噬细胞介导的IL-6信号通过STAT3-CaMKII通路调控RyR2-S2814磷酸化,揭示术后房颤的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 探究术后房颤发生的细胞和分子机制 | 小鼠心房非肌细胞、人类心包液、分离的心房肌细胞 | 单细胞测序 | 心血管疾病 | 单细胞RNA-seq、伪时间轨迹分析、共聚焦成像、条件性基因敲除 | NA | 基因表达数据、钙成像数据 | 小鼠模型和人类心脏手术患者心包液样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8694 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals distinct plasma cell populations in chronic thromboembolic pulmonary hypertension
2025-May, Journal of thrombosis and haemostasis : JTH
IF:5.5Q1
DOI:10.1016/j.jtha.2025.02.010
PMID:39965671
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示慢性血栓栓塞性肺动脉高压中浆细胞的独特亚群特征 | 首次发现AHNAK和IGLC3两个新型浆细胞亚群,并揭示其分化轨迹和功能特征 | 样本量有限(5例患者和6例正常肺动脉),需要更大规模验证 | 识别CTEPH中浆细胞的表型改变和分化模式 | 慢性血栓栓塞性肺动脉高压患者的肺动脉内膜切除组织和血浆样本 | 单细胞转录组学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序,蛋白电泳 | GeneSwitches分析,轨迹分析 | 单细胞转录组数据,蛋白质数据 | 5例CTEPH患者,6例正常肺动脉,273例CTEPH患者,259例IPAH患者,251例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8695 | 2025-10-07 |
Claudin18.2-positive gastric cancer-specific changes in neoadjuvant chemotherapy-driven immunosuppressive tumor microenvironment
2025-May, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-02981-y
PMID:40128286
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了CLDN18.2阳性胃癌在新辅助化疗驱动下肿瘤微环境的特异性免疫抑制变化 | 首次在单细胞水平揭示了CLDN18.2阳性胃癌对化疗的特异性免疫应答机制,发现了化疗诱导的独特细胞间相互作用网络 | 样本量较小(仅37例胃癌样本,其中11例CLDN18.2阳性),需要更大规模研究验证 | 探究CLDN18.2阳性胃癌在新辅助化疗作用下肿瘤微环境的免疫抑制变化机制 | 胃癌患者组织样本,特别关注CLDN18.2阳性亚型 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,免疫荧光图像数据 | 37例胃癌样本(包含11例CLDN18.2阳性病例) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8696 | 2025-10-07 |
Micro-region transcriptomics profiling of cerebral organoids using a capillary-based microdissection system
2025-May-01, Analytical methods : advancing methods and applications
IF:2.7Q1
DOI:10.1039/d5ay00277j
PMID:40211824
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研究论文 | 开发了一种基于毛细管的组织微切割系统,用于脑类器官微区域的空间转录组分析 | 建立了毛细管组织微切割系统(CMS),实现了对培养脑类器官微区域的高效获取和mRNA测序 | NA | 探索脑类器官中细胞命运的空间发育轨迹 | 脑类器官中的神经祖细胞、中间祖细胞、成熟神经元和星形胶质细胞 | 空间转录组学 | NA | mRNA测序,基因本体(GO)分析,KEGG富集分析 | NA | 空间转录组数据,基因表达数据 | 第20天和第60天的脑类器官样本 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | 毛细管组织微切割系统(CMS) | 毛细管组织微切割系统用于脑类器官微区域获取 |
| 8697 | 2025-10-07 |
Restoring mitochondrial function promotes hematopoietic reconstitution from cord blood following cryopreservation-related functional decline
2025-May-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI183607
PMID:40036065
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了脐带血冷冻保存对造血干细胞功能的影响机制,并发现萝卜硫素可改善线粒体功能恢复造血重建能力 | 首次系统评估不同冷冻时长对脐带血造血干细胞功能的影响,发现线粒体功能障碍是关键机制,并验证萝卜硫素的改善作用 | 研究样本时间跨度有限,临床验证需要进一步开展 | 探究冷冻保存对脐带血造血干细胞功能的影响及其机制 | 脐带血来源的CD34+造血干细胞和祖细胞及单个核细胞 | 单细胞组学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 包含新鲜和冷冻1年、5年、10年、19年的脐带血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8698 | 2025-10-07 |
A Visible-Light Photocatalysis/Hydrolysis Hydrogen-Generating Nanoplatform for Dynamic Inflammation Management via Immune Metabolism Orchestration during Wound Repair
2025-Apr-30, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.5c00667
PMID:40117501
|
研究论文 | 本研究开发了一种可见光催化/水解产氢纳米平台,通过免疫代谢调控实现伤口修复过程中的动态炎症管理 | 首次整合可见光光催化和水解反应实现可控氢释放,并揭示了氢疗法通过线粒体应激和HIF-1α诱导糖酵解调控免疫代谢的新机制 | 未明确说明动物模型样本量及临床转化潜力 | 开发可控氢释放纳米平台并研究其在伤口修复中的免疫代谢调控机制 | 炎症微环境中的先天免疫细胞和成纤维细胞 | 纳米医学 | 慢性伤口 | 可见光光催化、水解反应、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 8699 | 2025-05-02 |
Spatial transcriptomics: advances and challenges in peripheral nerve sheath tumor
2025-Apr-30, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf116
PMID:40305521
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8700 | 2025-10-07 |
Innate immune training in the neonatal response to sepsis
2025-Apr-30, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01179-5
PMID:40307728
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研究论文 | 本研究揭示了新生儿接种卡介苗通过重编程骨髓生成增强对脓毒症免疫反应的机制 | 首次证明BCG疫苗接种通过同时重编程骨髓生成的多个方面来改善新生儿对脓毒症的生存率 | 训练免疫影响宿主保护性反应的具体机制仍未完全明确 | 探究先天免疫训练在新生儿脓毒症反应中的作用机制 | 新生儿(特别是早产儿)的免疫系统 | 免疫学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |