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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8641 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Biomechanical Loading-Induced Imbalance in Bone and Fat, Leading to Ossification in Lumbar Intervertebral Disc Nucleus Pulposus Degeneration
2025-Jan, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31506
PMID:39854079
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示生物力学负荷通过骨-脂肪失衡导致腰椎间盘髓核退变中骨化的机制 | 首次识别出受生物力学负荷影响的CITED4+METRN+髓核软骨细胞亚群,并揭示MIF调控的骨-脂肪平衡在骨化过程中的关键作用 | 样本量较小(5例新鲜组织),部分验证采用回顾性石蜡样本 | 探究生物力学负荷对椎间盘退变中髓核骨化的细胞机制 | 腰椎L3-S1节段髓核组织,包括健康与退变样本 | 单细胞组学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序,组织病理学评估,免疫组织化学,免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,组织图像数据 | 5例新鲜髓核组织,另加回顾性石蜡样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8642 | 2025-10-07 |
Exploring a pico-well based scRNA-seq method (HIVE) for simplified processing of equine bronchoalveolar lavage cells
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0317343
PMID:39854349
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研究论文 | 评估HIVE™单细胞RNA测序方法在马哮喘支气管肺泡灌洗细胞处理中的应用效果 | 首次将pico-well基础的HIVE™ scRNA-seq技术应用于马支气管肺泡灌洗细胞分析,并发现该方法能检测到先前研究中未表征的嗜酸性粒细胞 | T细胞和巨噬细胞比例与细胞学预期存在偏差,T辅助细胞亚群定义不够清晰,粒细胞和肥大细胞检测数量低于预期 | 评估HIVE单细胞RNA测序方法在马哮喘研究中的应用可行性 | 马哮喘患者的支气管肺泡灌洗细胞 | 单细胞测序 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 马支气管肺泡灌洗细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | HIVE™ | pico-well基础的scRNA-seq技术 |
| 8643 | 2025-10-07 |
Preliminary screening of new biomarkers for sepsis using bioinformatics and experimental validation
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0317608
PMID:39854580
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研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证筛选脓毒症的新型生物标志物 | 首次通过整合WGCNA、荟萃分析和单细胞测序技术系统筛选出S100A11、QPCT和IFITM2作为脓毒症潜在生物标志物 | 研究样本来源为公共数据库,需要进一步扩大临床样本验证 | 筛选脓毒症的新型生物标志物 | 脓毒症相关RNA和基因 | 生物信息学 | 脓毒症 | 生物信息学分析,qPCR,单细胞测序,WGCNA,GSEA | NA | 基因表达数据,RNA测序数据 | 来自中国国家基因库和多个公共数据库的脓毒症数据 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 8644 | 2025-10-07 |
Comprehensive transcriptomic analysis integrating bulk and single-cell RNA-seq with machine learning to identify and validate mitochondrial unfolded protein response biomarkers in patients with ischemic stroke
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1582252
PMID:40313716
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研究论文 | 通过整合bulk和单细胞RNA测序与机器学习方法,识别并验证缺血性卒中患者中线粒体未折叠蛋白反应的生物标志物 | 首次将bulk RNA-seq与单细胞RNA-seq相结合,利用机器学习识别UPRmt相关生物标志物,并通过虚拟敲除实验验证CLEC4D在炎症调节中的功能作用 | 研究样本量有限,主要基于公共数据库数据,需要更大规模临床验证 | 探索线粒体未折叠蛋白反应在缺血性卒中中的机制并识别相关生物标志物 | 缺血性卒中患者和大脑中动脉闭塞模型 | 生物信息学 | 缺血性卒中 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 机器学习, RT-qPCR, 免疫浸润分析 | 机器学习 | 基因表达数据 | GSE58294数据集,人类外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 8645 | 2025-10-07 |
CITED2 Binding to EP300 Regulates Human Spermatogonial Stem Cell Proliferation and Survival Through HSPA6
2025, Stem cells international
IF:3.8Q2
DOI:10.1155/sci/2362489
PMID:40313859
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研究论文 | 本研究通过分析人类睾丸单细胞测序数据,揭示了CITED2通过结合EP300调控HSPA6基因表达,从而影响人类精原干细胞增殖与存活的新机制 | 首次发现CITED2在人类精原干细胞中的主导表达,并阐明其通过EP300-HSPA6轴调控干细胞增殖与凋亡的新信号通路 | 研究主要基于细胞系实验,缺乏体内验证;样本来源和数量未明确说明 | 探索人类精原干细胞自我更新与分化的调控机制 | 人类精原干细胞 | 单细胞生物学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序,RNA测序,免疫共沉淀 | NA | 单细胞测序数据,RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8646 | 2025-10-07 |
The malignant signature gene of cancer-associated fibroblasts serves as a potential prognostic biomarker for colon adenocarcinoma patients
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1589678
PMID:40313961
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别癌症相关成纤维细胞的恶性特征基因,并验证FNDC5作为结肠腺癌的潜在预后生物标志物 | 首次结合单细胞RNA测序与CNV推断、伪时间轨迹分析系统鉴定CAFs恶性相关基因,并发现FNDC5的独立预后价值 | 研究样本量相对有限(8,911个细胞),且主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 识别与癌症相关成纤维细胞恶性相关的基因标志物,建立结肠腺癌预后模型 | 结肠腺癌患者组织样本中的细胞,特别是癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序,CNV分析,伪时间轨迹分析,LASSO回归,Cox回归,细胞功能实验 | Cox回归模型,LASSO回归,诺莫图 | 单细胞RNA测序数据,基因表达数据 | 8,911个细胞(来自正常和肿瘤样本) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8647 | 2025-10-07 |
BTG2-deficient mast cells remodel the tumor and tumor-draining lymph node microenvironment leading to chemotherapy resistance in breast cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1562700
PMID:40313959
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现BTG2缺陷的肥大细胞通过调节肿瘤微环境和引流淋巴结导致乳腺癌化疗耐药 | 首次揭示BTG2缺陷的肥大细胞通过诱导Treg细胞产生和促进成纤维细胞分化导致化疗耐药的新机制 | 样本量较小(仅4例患者),需要在更大队列中验证 | 探究乳腺癌新辅助化疗耐药的免疫机制 | 乳腺癌患者肿瘤组织和转移性引流淋巴结中的细胞 | 单细胞测序分析 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 4例乳腺癌患者(化疗敏感与耐药各半) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8648 | 2025-10-07 |
Revisiting the role of cancer-associated fibroblasts in tumor microenvironment
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1582532
PMID:40313969
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综述 | 深入分析肿瘤相关成纤维细胞在肿瘤微环境中的作用及当前研究面临的挑战 | 系统性地提出了CAF研究中的关键障碍并指明了未来研究方向 | CAF亚群命名缺乏标准化、特异性生物标志物缺失、体外培养难以维持原代特性、检测方法缺乏标准化 | 分析CAF研究挑战,提出未来研究方向,改进CAF靶向治疗策略 | 肿瘤相关成纤维细胞(CAFs) | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞转录组测序、抗体检测、mRNA探针 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8649 | 2025-10-07 |
Perivascular RELMα-positive synovial macrophages recruit monocytes at the onset of inflammatory arthritis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1567661
PMID:40313955
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研究论文 | 本研究揭示了RELMα阳性滑膜巨噬细胞在炎症性关节炎起始阶段通过分泌CCL2招募单核细胞的机制 | 首次定位并证实RELMα阳性血管周围巨噬细胞在关节炎起始阶段通过CCL2介导单核细胞向滑膜间质招募的作用 | 主要使用小鼠模型研究,人类样本验证尚不充分 | 探究炎症性关节炎起始阶段滑膜巨噬细胞在单核细胞招募中的作用机制 | 滑膜巨噬细胞、单核细胞、中性粒细胞等髓系细胞 | 免疫学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 报告基因小鼠模型 | 抗原诱导关节炎小鼠模型 | 基因表达数据、细胞定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8650 | 2025-10-07 |
Dissecting the Single-Cell Diversity and Heterogeneity Underlying Cervical Precancerous Lesions and Cancer Tissues
2025-May, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
DOI:10.1007/s43032-024-01695-5
PMID:39354287
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研究论文 | 通过整合单细胞数据研究宫颈癌前病变到宫颈鳞癌的细胞多样性和异质性 | 首次系统揭示宫颈癌进展过程中七个细胞类型的组成变化,鉴定出95个关键转录因子和上皮细胞亚群标志物KRT8/KRT15 | 研究样本量有限,需要更大规模验证;部分机制仍需进一步功能实验证实 | 解析宫颈癌前病变到宫颈鳞癌的细胞多样性和异质性机制 | 宫颈正常组织、癌旁组织、癌前病变组织和宫颈肿瘤组织 | 单细胞组学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, RT-qPCR, 免疫组化 | 逻辑回归模型 | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据, 基因表达数据 | 四个单细胞数据集(包含正常组织、癌旁组织、癌前病变和宫颈肿瘤) | NA | 单细胞RNA测序, ATAC-seq | NA | NA |
| 8651 | 2025-10-07 |
Chronic Rejection After Kidney Transplantation
2025-04-01, Transplantation
IF:5.3Q1
DOI:10.1097/TP.0000000000005187
PMID:39192468
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综述 | 探讨肾脏移植后慢性排斥反应的免疫机制及新兴治疗策略 | 提出CD38单抗felzartamab通过靶向NK细胞效应功能治疗抗体介导排斥反应的新策略 | 现有临床试验结果多为阴性,felzartamab尚处于探索性二期试验阶段 | 解析肾脏移植慢性排斥的免疫机制并评估新型治疗方案的潜力 | 肾脏移植受者的慢性排斥反应过程 | 移植免疫学 | 肾脏移植排斥 | 免疫组织化学、转录组学、功能遗传学 | NA | 分子表达数据、形态学数据 | NA | NA | 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 8652 | 2025-10-07 |
Protocol for mitochondrial variant enrichment from single-cell RNA sequencing using MAESTER
2025-Mar-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103564
PMID:39817913
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研究论文 | 介绍一种从单细胞RNA测序数据中富集线粒体DNA变异以同时研究细胞状态和克隆结构的实验方案 | 开发了从3'端条形码全长cDNA中富集mtDNA变异的protocol,可同时获取细胞状态和克隆信息 | NA | 建立同时分析细胞状态和组织克隆结构的实验方法 | 人类原代组织 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序, mtDNA变异富集, 双端测序 | maegatk | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 3'端条形码全长cDNA |
| 8653 | 2025-10-07 |
The Microscope and Beyond: Current Trends in the Characterization of Kidney Allograft Rejection From Tissue Samples
2025-03-01, Transplantation
IF:5.3Q1
DOI:10.1097/TP.0000000000005153
PMID:39436268
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综述 | 本文综述了当前用于增强肾脏移植排斥反应特征描述的新兴技术工具 | 整合了数字病理学、深度学习、多重免疫组化、转录组学和空间转录组学等创新工具,有望解决Banff分类系统的局限性 | Banff分类系统主要依赖活检组织,缺乏可重复性和精细度,组织病理学损伤和批量组织转录组学分析在准确推断排斥反应发病机制方面存在疑问 | 增强从组织样本中表征肾脏移植排斥反应的能力 | 肾脏移植排斥反应的组织样本 | 数字病理学 | 肾脏移植排斥反应 | 深度学习, 多重免疫组化, 转录组学, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | 深度学习 | 组织切片图像, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 8654 | 2025-10-07 |
Biological and clinical significance of tumour-infiltrating lymphocytes in the era of immunotherapy: a multidimensional approach
2025-Mar, Nature reviews. Clinical oncology
DOI:10.1038/s41571-024-00984-x
PMID:39820025
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综述 | 本文探讨肿瘤浸润淋巴细胞在免疫治疗时代的生物学和临床意义,并提出系统性研究框架 | 提出多维度的TIL研究概念框架,整合单细胞技术、空间平台和计算模型的最新进展 | 缺乏标准化的TIL量化策略,对不同TIL亚群功能特征和空间分布的研究不足 | 系统评估肿瘤浸润淋巴细胞的生物学特性和作为免疫检查点抑制剂生物标志物的潜力 | 肿瘤浸润淋巴细胞及其亚群 | 肿瘤免疫学 | 实体肿瘤 | 单细胞转录组学、蛋白质组学、空间组学 | 计算模型 | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 8655 | 2025-10-07 |
Intratumoral Collagen Deposition Supports Angiogenesis Suggesting Anti-angiogenic Therapy in Armored and Cold Tumors
2025-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202409147
PMID:39823457
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研究论文 | 本研究系统分析了胶原沉积与肿瘤血管生成的关系,发现装甲冷肿瘤具有最高血管生成活性并验证了抗血管生成治疗的疗效 | 首次系统揭示胶原沉积通过SOX18上调驱动肿瘤血管生成的机制,并提出装甲冷肿瘤作为抗血管生成治疗的新型生物标志物 | 研究主要聚焦肺腺癌,在其他癌症类型中的普适性需要进一步验证 | 探究胶原沉积对肿瘤血管生成的影响及治疗意义 | 实体肿瘤(重点关注肺腺癌)、成纤维细胞、内皮细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组测序,空间转录组学,体外实验 | NA | 基因表达数据,空间分布数据 | 多个晚期肺腺癌队列 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 8656 | 2025-10-07 |
YTHDF2-mediated m6A modification of ONECUT2 promotes stemness and oxaliplatin resistance in gastric cancer through transcriptionally activating TFPI
2025-Mar, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2024.101200
PMID:39823826
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研究论文 | 本研究揭示了YTHDF2介导的ONECUT2 m6A修饰通过转录激活TFPI促进胃癌干细胞特性和奥沙利铂耐药性的分子机制 | 首次发现ONECUT2+TFPI+胃癌细胞亚群在奥沙利铂耐药肿瘤微环境中的作用,并阐明YTHDF2-m6A-ONECUT2-TFPI信号轴 | 研究主要基于细胞和小鼠模型,需要进一步临床验证 | 鉴定胃癌奥沙利铂耐药相关的细胞亚群并解析其分子机制 | 胃癌细胞、小鼠模型、肿瘤微环境 | 癌症生物学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,m6A修饰分析 | 细胞模型,小鼠模型 | 基因表达数据,测序数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8657 | 2025-10-07 |
Investigating subpopulation dynamics in clonal CHO-K1 cells with single-cell RNA sequencing
2025-Mar, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.01.010
PMID:39824362
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序研究克隆CHO-K1细胞中亚群动态变化 | 首次在单细胞水平揭示克隆CHO细胞中低产亚群的存在及其与基因表达不稳定性的关联 | 需要进一步的多组学研究来更好表征这种异质性 | 研究克隆CHO细胞中亚群动态与稳定性表型的关系 | 两个具有不同稳定性表型的克隆CHO-K1细胞群体 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 两个克隆CHO-K1细胞群体在90天培养期内的样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8658 | 2025-10-07 |
scRNA-seq reveals involvement of monocytes in immune response in SLE patients
2025-Mar, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.110994
PMID:39818255
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示系统性红斑狼疮患者单核细胞参与免疫反应的机制 | 首次通过scRNA-seq技术系统性分析SLE患者循环免疫细胞中单核细胞的炎症上调现象,并发现IRF1在单核细胞中的高表达 | 样本量有限,需要更大规模研究验证;机制研究不够深入 | 探索系统性红斑狼疮患者单核细胞的炎症因子特征和免疫反应机制 | 系统性红斑狼疮患者和健康志愿者的循环免疫细胞 | 单细胞组学 | 系统性红斑狼疮 | scRNA-seq, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据 | SLE患者和健康志愿者(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8659 | 2025-10-07 |
Unveiling the role of MDH1 in breast cancer drug resistance through single-cell sequencing and schottenol intervention
2025-Mar, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.111608
PMID:39818404
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研究论文 | 通过单细胞测序揭示MDH1在乳腺癌耐药中的作用,并发现植物甾醇Schottenol通过下调MDH1增强紫杉醇敏感性 | 首次发现MDH1在乳腺癌耐药中的关键调控作用,并验证植物甾醇Schottenol通过靶向MDH1增强化疗敏感性 | NA | 研究MDH1在乳腺癌耐药中的作用机制及潜在治疗策略 | 乳腺癌细胞、正常上皮细胞、髓系细胞、肿瘤浸润淋巴细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8660 | 2025-10-07 |
Spatiotemporal and genetic cell lineage tracing of endodermal organogenesis at single-cell resolution
2025-Feb-06, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.12.012
PMID:39824184
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研究论文 | 本研究通过创新性遗传追踪技术和单细胞RNA测序,揭示了内胚层器官发生的时空和遗传谱系分化过程 | 开发了针对14个不同内胚层区域的创新遗传追踪编码系统,并在单细胞分辨率上发现了早期内胚层区域具有意外多能性 | NA | 探索早期哺乳动物发育过程中内胚层器官发生的细胞谱系分化机制 | 小鼠内胚层细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 遗传追踪, 成像技术 | NA | 单细胞转录组数据, 成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |