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当前共找到 10549 篇文献,本页显示第 841 - 860 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
841 2026-03-06
SORBET: Automated cell-neighborhood analysis of spatial transcriptomics or proteomics for interpretable sample classification via GNN
2025-Apr-21, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了SORBET,一种几何深度学习框架,用于分析空间转录组学或蛋白质组学数据,通过图卷积网络进行可解释的样本分类 SORBET是首个在空间转录组学数据上进行表型预测的示例,利用新颖的数据增强技术和定制可解释性分析,无需将完整细胞谱压缩为有限注释 NA 开发一种自动化细胞邻域分析框架,以整合空间信息与多重分子数据,准确预测表型,如免疫治疗反应 转移性黑色素瘤、非小细胞肺癌和结直肠癌样本 机器学习 黑色素瘤, 非小细胞肺癌, 结直肠癌 空间转录组学, 空间蛋白质组学 图卷积网络(GCN) 空间转录组学数据, 空间蛋白质组学数据 NA NA 空间转录组学, 空间蛋白质组学 CosMx, Imaging Mass Cytometry (IMC), Co-detection by indexing (CODEX) CosMx空间转录组学数据集, Imaging Mass Cytometry (IMC)和CODEX空间蛋白质组学数据集
842 2026-03-06
Mapping dynamic regulation of gene expression using single-cell transcriptomics and application to complex disease genetics
2025-Apr-10, HGG advances
研究论文 本研究开发了一种基于单细胞转录组学的遗传模型,用于量化基因表达的动态遗传调控及其细胞类型特异性,并应用于精神分裂症等复杂疾病遗传学分析 开发了细胞类型特异性和细胞状态调整的基因表达遗传模型,能够量化基因表达的动态遗传调控并评估其细胞类型特异性,为复杂疾病机制提供新见解 NA 利用单细胞转录组学数据揭示遗传变异如何影响人类生理和疾病相关的生物过程,并应用于复杂疾病遗传学研究 诱导多能干细胞分化为中脑神经元的单细胞转录组数据,以及英国生物库中超过1,500种表型数据 自然语言处理 精神分裂症 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
843 2026-03-06
An expandable synthetic library of human paired antibody sequences
2025-Apr, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 本文介绍了IgHuAb,一种用于高通量生成配对人类抗体序列的大型语言模型,并基于此创建了模拟自然抗体序列特征的合成抗体库SynAbLib 开发了首个基于大型语言模型的高通量配对人类抗体序列生成方法,并构建了具有更高序列多样性的合成抗体库 未提及具体实验验证的抗体数量或功能活性数据 解决当前单细胞测序方法在配对抗体序列数据获取中的低通量和高成本问题,以更好地理解人类抗体序列的潜在多样性 人类抗体序列 自然语言处理 NA 单细胞测序 大型语言模型 序列数据 NA NA NA NA NA
844 2026-03-06
The tectum transversum(TTR) maintains patency of the developing coronal suture
2025-Mar-31, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了小鼠模型中短暂软骨结构TTR在冠状缝发育中的作用,发现其通过抑制BMP信号通路维持冠状缝开放,为冠状缝早闭的病因提供了新见解 首次通过基因消融实验证明TTR在维持冠状缝开放中的关键作用,并利用空间转录组学数据揭示其作为BMP信号屏障的潜在机制 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证;BMP信号调控机制的具体分子通路有待深入探索 探究冠状缝发育的调控机制及冠状缝早闭的病因 小鼠模型中的冠状缝、TTR软骨及相关组织(颅骨、硬脑膜) 发育生物学 颅缝早闭 空间转录组学、基因消融 NA 空间转录组数据、组织学图像 NA NA 空间转录组学 NA NA
845 2026-03-06
Histidine metabolism drives liver cancer progression via immune microenvironment modulation through metabolic reprogramming
2025-Mar-04, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究探讨了组氨酸代谢如何通过代谢重编程和免疫微环境调控驱动肝细胞癌进展 揭示了组氨酸代谢通过下调关键细胞通讯通路(如MIF、CLEC、MHC II)和促进BUD23基因表达来重塑免疫抑制微环境的新机制 具体组氨酸代谢产物如何直接调控BUD23的分子机制尚未完全阐明,且临床样本量有限 探究组氨酸代谢在肝细胞癌进展中的作用及其对肿瘤免疫微环境的调控机制 肝细胞癌样本中的不同细胞类型,包括实质细胞、巨噬细胞和T细胞 肿瘤代谢与免疫学 肝细胞癌 单细胞RNA测序、体内外实验、TCGA数据库分析、多变量Cox回归模型 预后模型(基于多变量Cox回归) 单细胞RNA测序数据、TCGA数据库的转录组数据 未明确指定样本数量,但使用了HCC样本和TCGA数据库 NA 单细胞RNA测序 NA NA
846 2026-03-06
Transcriptomic responses of lung mesenchymal cells during pneumonia
2025-Feb-25, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了小鼠肺炎期间肺间充质细胞的转录组响应,揭示了其多样化和特异性的免疫活动 首次系统性地鉴定了肺炎期间肺间充质细胞的五种亚型及其转录组动态变化,并发现了跨细胞类型的核心响应和亚型特异性响应 研究仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证,且时间点有限(仅24小时和6周),可能未覆盖所有疾病阶段 探究肺间充质细胞在肺炎期间的转录组响应及其免疫功能 小鼠肺组织中的间充质细胞 单细胞转录组学 肺炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 来自小鼠肺单细胞悬液的间充质细胞,包括初始组、肺炎组和感染恢复组 NA 单细胞RNA-seq NA NA
847 2026-03-06
Ag-driven CD8 + T cell clonal expansion is a prominent feature of MASH in humans and mice
2025-Feb-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 本研究通过单细胞测序和流式细胞术,揭示了MASH(代谢功能障碍相关脂肪性肝炎)中肝脏T细胞的表型、T细胞受体多样性及抗原驱动的克隆扩增现象 首次在人类和小鼠模型中证实MASH诱导的肝硬化导致肝脏中T细胞发生抗原依赖性克隆扩增和功能分化,并识别了PD1、TIGIT和TOX等慢性抗原刺激标志物 研究未明确驱动T细胞激活的具体抗原靶点,且样本来源限于人类肝硬化和小鼠饮食诱导MASH模型,可能无法完全代表所有MASH亚型 旨在解析MASH进展中T细胞在肝脏积累的表型、T细胞受体多样性及其功能作用 人类肝硬化患者和小鼠饮食诱导MASH模型的肝脏驻留T细胞 免疫学 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎 5'单细胞测序, 流式细胞术 NA 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据 人类肝硬化患者和小鼠MASH模型的肝脏T细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
848 2026-03-06
Mapping cell-cell fusion at single-cell resolution
2025-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文开发了一种名为ClonMapper Duo(CMDuo)的分子工具包,用于在单细胞分辨率下映射肿瘤细胞群体中的细胞-细胞融合事件 通过结合报告基因表达和工程化的荧光相关索引序列与随机生成的核苷酸条形码,CMDuo能够识别并追踪单个细胞融合事件的起源和结果,这是首次在单细胞水平上实现此类映射 由于依赖于特定的实验系统和条形码技术,CMDuo可能不适用于所有细胞类型或疾病模型,且需要单细胞RNA-seq数据支持 研究细胞-细胞融合在癌症进展和治疗反应中的作用,开发一种高通量单细胞数据平台来映射融合事件 三阴性乳腺癌细胞 单细胞组学 乳腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
849 2026-03-06
Dimensionality reduction for visualizing spatially resolved profiling data using SpaSNE
2025-Jan-06, GigaScience IF:11.8Q1
研究论文 本文开发了一种名为SpaSNE的空间解析t-SNE方法,用于整合空间和分子信息,以更准确地可视化空间解析分析数据 SpaSNE是首个针对空间解析分析数据定制的降维方法,整合了空间和分子信息,相比传统方法如t-SNE和UMAP能提供更准确和有意义的数据可视化 NA 开发一种针对空间解析分析数据的降维和可视化方法,以更好地解释细胞类型和分子结构 空间解析分析数据集,包括来自不同疾病、组织和细胞类型的细胞 空间转录组学 NA 空间解析分析技术 t-SNE, UMAP, SpaSNE 空间解析分析数据 多个公共数据集,涵盖3个实验平台和不同疾病、组织及细胞类型 10x Genomics, 其他 空间转录组学, 空间解析分析 Visium, STARmap, MERFISH Visium, STARmap, MERFISH平台生成的空间解析分析数据
850 2026-03-06
Lifting the curse from high-dimensional data: automated projection pursuit clustering for a variety of biological data modalities
2025-Jan-06, GigaScience IF:11.8Q1
研究论文 本文提出了一种名为自动投影追踪(APP)的无监督聚类方法,通过将高维数据顺序投影到低维表示来缓解维度诅咒,并在多种生物数据模态上验证其有效性 提出了一种替代传统高维空间聚类的方法,通过自动投影追踪技术降低维度诅咒的影响,从而更有效地揭示生物数据中的模式 未明确说明方法在极端高维或噪声数据下的鲁棒性,以及计算效率的详细评估 开发一种能缓解维度诅咒的无监督聚类方法,以改善高维生物数据的分析 高维生物数据,包括转录组学、蛋白质组学、单细胞组学数据等 机器学习 NA 自动投影追踪(APP) 无监督聚类算法 高维生物数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 流式细胞术, 质谱细胞术, 多重成像, T细胞受体库分析 NA NA
851 2026-03-06
Keeping an Eye Out for Autophagy in the Cornea: Sample Preparation for Single-Cell RNA-Sequencing
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 本文描述了利用单细胞RNA测序技术研究角膜缘上皮干细胞群及自噬对其功能影响的样本制备方法 开发了针对角膜/角膜缘组织活细胞单细胞悬液的分离协议,并结合自噬缺陷模型进行scRNA-seq分析 NA 研究自噬对角膜缘上皮干细胞功能的影响 小鼠角膜缘上皮干细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
852 2026-03-06
Characterizing the immune infiltrate in secondary syphilis: implications for transmission and pathology
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过免疫组化、bulk RNA测序和单细胞RNA测序技术,分析了二期梅毒皮肤病变中的免疫浸润特征,并探讨了梅毒螺旋体在皮肤中的免疫逃逸机制 首次结合单细胞RNA测序和免疫组化技术,系统描绘了二期梅毒皮肤病变中的免疫细胞组成和细胞间通讯网络,并揭示了表皮TLR-MYD88通路在宿主应答中的关键作用 研究样本来源于福尔马林固定石蜡包埋的组织,可能影响RNA质量和单细胞测序的灵敏度;体外实验模型可能无法完全模拟体内复杂的免疫微环境 阐明梅毒螺旋体在皮肤感染过程中的免疫逃逸机制和宿主免疫应答特征 二期梅毒患者的皮肤活检组织、健康人外周血单个核细胞(PBMCs)、原代角质形成细胞和MyD88敲除角质形成细胞 数字病理学 梅毒 免疫组化(IHC)、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 NA 图像、转录组数据 二期梅毒患者的皮肤活检样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
853 2026-03-06
Serine supplementation suppresses hypoxia-induced pathological retinal angiogenesis
2025, Theranostics IF:12.4Q1
研究论文 本研究探讨了丝氨酸补充对抑制缺氧诱导的病理性视网膜血管新生的作用及其机制 首次系统性地在氧诱导视网膜病变小鼠模型中,通过多组学分析和单细胞RNA测序,揭示了丝氨酸通过增强线粒体脂肪酸氧化和氧化磷酸化来抑制病理性血管新生的新机制,并鉴定出HMGB1蛋白作为关键介导因子 研究主要基于小鼠模型,其在人类疾病中的直接适用性尚需进一步验证;干预时间点和剂量方案有待优化;对丝氨酸代谢下游具体信号通路的解析还不够深入 探究丝氨酸代谢在抑制缺氧驱动的病理性视网膜血管新生中的作用及分子机制 野生型C57BL/6J小鼠的氧诱导视网膜病变模型 数字病理学 视网膜病变 代谢组学, 脂质组学, 蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 蛋白质印迹 动物模型 多组学数据, 图像, 文本 未明确具体数量的小鼠视网膜样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
854 2026-03-06
Comparative transcriptomic analysis of tumor- infiltrating canine natural killer cells and candidate biomarkers from first-in-dog NK immunotherapy trials
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序比较了犬和人类肿瘤浸润自然杀伤细胞的转录组特征,并评估了犬NK免疫疗法试验中的候选生物标志物 首次在犬类中整合血液、组织和肿瘤样本进行单细胞RNA测序分析,建立了犬肉瘤浸润NK细胞特征,并将此特征应用于首次犬免疫疗法临床试验的NK细胞变化背景分析 研究样本可能有限,且犬类模型虽与人类相似,但物种间差异仍需谨慎考虑,临床试验的规模和多样性可能不足 改善NK细胞在实体癌症中的疗效,并识别跨物种反应的潜在生物标志物 犬和人类捐赠者的血液、组织和肿瘤样本中的自然杀伤细胞 单细胞转录组学 肉瘤 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 来自犬和人类捐赠者的血液、组织和肿瘤样本,具体数量未在摘要中指定 NA 单细胞RNA测序 NA NA
855 2026-03-05
Tumor-infiltrating B cells produce tumor-specific antibodies and may contribute to suppressing tumor in head and neck squamous cell carcinoma
2025-Dec, Oncoimmunology IF:6.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序等多组学技术,首次揭示了头颈部鳞状细胞癌中肿瘤浸润B细胞通过产生肿瘤特异性抗体并激活免疫细胞来抑制肿瘤的机制 首次在头颈部鳞状细胞癌中系统性地证明了肿瘤浸润B细胞能够产生肿瘤特异性抗体,并揭示了其通过激活巨噬细胞和NK细胞来增强抗肿瘤免疫的新机制 研究主要基于手术切除的肿瘤样本,缺乏对治疗过程中B细胞动态变化的纵向观察,且抗体功能验证主要在体外进行 阐明肿瘤浸润B细胞在头颈部鳞状细胞癌肿瘤免疫中的作用 头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤组织样本 数字病理学 头颈部鳞状细胞癌 单细胞RNA测序,B细胞受体谱分析,多重免疫荧光染色,空间转录组学分析,蛋白质微阵列 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据,蛋白质表达数据,免疫组化图像 68例头颈部鳞状细胞癌手术切除标本 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
856 2026-03-05
Spatial analysis reveals the cellular microenvironments and mechanisms of inflammation and kidney injury in acute interstitial nephritis
2025-Oct-30, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用高分辨率成像质谱流式细胞术和单细胞空间转录组学分析急性间质性肾炎(AIN)患者肾活检组织,揭示了其独特的免疫微环境和分子机制 首次通过空间多组学技术系统解析AIN的细胞微环境,发现CXCL9-CXCR3轴是AIN的特异性免疫特征,并鉴定出烟酰胺磷酸核糖转移酶(NAMPT)在协调代谢-炎症微环境中的关键作用 样本量相对有限,且为横断面研究,未能验证潜在治疗靶点的临床疗效 阐明急性间质性肾炎的发病机制并识别潜在治疗靶点 人类肾活检组织(包括AIN、非免疫性急性肾小管损伤及对照组织) 数字病理学 肾脏疾病 成像质谱流式细胞术,单细胞空间转录组学 空间分析模型 空间多组学数据(蛋白质+转录组) 人类肾活检组织样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞空间转录组学 NA NA
857 2026-03-05
p53 maintains lineage fidelity during lung capillary injury-repair in neonatal hyperoxia
2025-Sep-09, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究揭示了p53在新生儿高氧损伤后肺毛细血管修复过程中维持内皮细胞谱系保真性的关键作用 首次发现Cap2细胞在高氧损伤中被Cap1细胞替代,并证实EC特异性p53缺失可通过诱导过渡性内皮细胞状态改善血管表型和肺泡简化 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限;过渡性EC状态的具体调控机制仍需进一步探索 探究p53在新生儿高氧诱导肺损伤修复过程中对内皮细胞谱系保真性的调控作用 新生小鼠肺组织内皮细胞亚群(Cap1/Cap2)及人类支气管肺发育不良(BPD)伴肺动脉高压样本 单细胞组学 支气管肺发育不良(BPD) 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量(含小鼠模型和人类BPD样本) NA 单细胞RNA-seq NA NA
858 2026-03-05
Increased inflammation as well as decreased endoplasmic reticulum stress and translation differentiate pancreatic islets from donors with pre-symptomatic stage 1 type 1 diabetes and non-diabetic donors
2025-Jul, Diabetologia IF:8.4Q1
研究论文 本研究通过蛋白质组学分析比较了1型糖尿病前期(阶段1)与非糖尿病供体的胰岛蛋白质变化 首次在人类胰岛中应用无偏蛋白质组学方法,揭示1型糖尿病前期胰岛的分子变化,包括免疫反应增强和内质网应激及蛋白质翻译减少 样本量较小(n=3 vs n=3),存在供体间变异,统计分析的挑战性较大 识别胰岛中指示β细胞功能障碍的途径,了解1型糖尿病前期的分子机制 来自器官供体的胰岛组织,包括多自身抗体阳性(mAAb+)的1型糖尿病前期供体与非糖尿病(ND)对照供体 蛋白质组学 1型糖尿病 激光显微切割,质谱(MS)蛋白质组学,无标记定量,单细胞RNA-seq NA 蛋白质组数据,RNA-seq数据 10名器官供体(5名自身抗体阳性,5名非糖尿病对照),最终分析聚焦于3名多自身抗体阳性供体与3名匹配对照 NA 单细胞RNA-seq NA NA
859 2026-03-04
Deciphering precursor cell dynamics in esophageal preneoplasia via genetic barcoding and single-cell transcriptomics
2025-Dec-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本文通过结合遗传条形码和单细胞转录组学技术,追踪食管癌前病变细胞的谱系,揭示了高可塑性前体细胞的动态变化及其在肿瘤发生中的作用 首次将遗传条形码与单细胞RNA测序结合,用于追踪食管癌前病变细胞的谱系,并识别出具有高可塑性的独特前体细胞群体 未明确提及样本量或具体技术平台细节,可能限制结果的普遍性 阐明食管癌前病变细胞的起源和轨迹,以理解早期肿瘤发生机制 食管癌前病变细胞 数字病理学 食管鳞状细胞癌 单细胞RNA测序,遗传条形码,空间转录组学 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
860 2026-03-04
Single-cell analysis identifies PI3+S100A7+keratinocytes in early cervical squamous cell carcinoma with HPV infection
2025-Oct-20, Chinese medical journal IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,在早期宫颈鳞状细胞癌中鉴定出与HPV感染相关的PI3+S100A7+角质形成细胞,并揭示了其与肿瘤微环境中巨噬细胞和癌症相关成纤维细胞的相互作用 首次在早期HPV阳性宫颈鳞状细胞癌中鉴定出PI3+S100A7+角质形成细胞亚群,并系统揭示了该细胞亚群与巨噬细胞之间的空间邻近性和信号通路互作,以及不同HPV亚型(如HPV16与HPV66)驱动的独特肿瘤促进机制 样本量较小(仅4例患者),且研究聚焦于早期肿瘤,未涵盖晚期或转移性病例 探究HPV感染在早期宫颈鳞状细胞癌发生发展中的作用机制,特别是肿瘤微环境中细胞异质性和细胞间互作 早期宫颈鳞状细胞癌患者的肿瘤组织及配对癌旁组织 数字病理学 宫颈癌 单细胞RNA测序,病毒序列比对,轨迹分析,免疫荧光染色,CIBERSORTx分析 NA 单细胞转录组数据,临床预后数据,免疫荧光图像数据 4例早期宫颈鳞状细胞癌患者的肿瘤及配对癌旁组织 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Genomics平台(具体配置未在摘要中说明,推断为10x Chromium单细胞3'基因表达解决方案)
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