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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8561 | 2025-10-07 |
A novel Wnt/β-catenin signaling gene signature for progression and metastasis of gastric cancer
2025, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2024.054366
PMID:40296906
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研究论文 | 本研究通过识别Wnt/β-catenin信号通路相关基因特征,开发了胃癌预后预测模型并揭示了AEBP1与TCF3在胃癌转移中的协同作用机制 | 首次发现AEBP1和TCF3在细胞核内相互作用并协同增强Wnt信号通路基因表达,促进胃癌侵袭转移 | 研究未明确说明样本量大小及数据来源的具体细节 | 开发胃癌预后预测基因特征并探索其分子机制 | 胃癌细胞及相关的基因表达数据 | 生物信息学 | 胃癌 | LASSO回归, 单细胞RNA测序, 双荧光素酶报告基因检测, 基因敲低和过表达实验 | LASSO回归模型 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8562 | 2025-10-07 |
Ginkgo biloba extract EGb 761® ameliorates cognitive impairment and alleviates TNFα response in 5xFAD Alzheimer's disease model mice
2025-Jan, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2024.156327
PMID:39778487
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研究论文 | 本研究探讨银杏叶提取物EGb 761®在5xFAD阿尔茨海默病模型小鼠中的认知改善作用及其抗炎机制 | 首次系统揭示EGb 761®通过影响疾病相关小胶质细胞DAM2亚型发挥抗炎作用,并发现其疗效具有性别特异性 | 研究仅限于小鼠模型,未在人类中验证;单细胞RNA测序仅针对雄性小鼠前额叶皮层 | 探究EGb 761®在阿尔茨海默病中的药理作用机制和性别依赖性效应 | 5xFAD阿尔茨海默病模型小鼠和野生型小鼠 | 神经药理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,器官型脑切片培养,行为学测试,基因表达分析 | 动物模型(小鼠) | 基因表达数据,行为数据,组织病理数据 | 8周龄5xFAD和野生型小鼠,治疗周期8周 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8563 | 2025-10-07 |
scRNA-Seq-Based Transcriptome Profiling and Relevant Bioinformatics Approaches to Uncover Novel Insights in Studying Human Spermatogenesis
2025, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-031-82990-1_9
PMID:40301258
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术研究人类精子发生过程及其在病理条件下的分子机制 | 揭示了支持细胞在精子发生中的关键作用及其在病理条件下的功能紊乱 | NA | 研究人类精子发生的细胞和分子机制 | 人类睾丸组织中的支持细胞、间质细胞和生殖细胞 | 生物信息学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8564 | 2025-10-07 |
Computational Approaches in Spatial Transcriptomics for the Study of Mammalian Spermatogenesis
2025, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-031-82990-1_8
PMID:40301257
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综述 | 本文综述了空间转录组学技术在哺乳动物精子发生研究中的计算方法与应用 | 将空间转录组学技术引入精子发生研究,从单细胞水平扩展到二维空间坐标系统,揭示睾丸组织中细胞类型的空间定位和分子互作 | NA | 探讨空间转录组学计算方法在哺乳动物精子发生研究中的应用 | 啮齿类和人类睾丸组织中的精子发生过程 | 空间转录组学 | 男性不育 | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8565 | 2025-10-07 |
Identifying Reproducible Transcription Regulator Coexpression Patterns with Single Cell Transcriptomics
2025-Feb-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.15.580581
PMID:38559016
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研究论文 | 利用大规模单细胞转录组数据识别跨细胞类型可重复的转录调控因子共表达模式 | 整合了223个单细胞RNA-seq数据集(超过2800万个细胞),构建跨物种共表达网络,优先考虑跨细胞类型的可重复模式 | 未深入分析特定背景下的信号保存,主要关注跨生物背景的一致性 | 识别人类和小鼠转录调控因子最协调的基因伙伴,理解跨生物背景的共表达谱一致性 | 人类和小鼠转录调控因子及其共表达基因 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 共表达网络分析 | 单细胞转录组数据 | 223个数据集,超过2800万个细胞(120个人类数据集,103个小鼠数据集) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8566 | 2025-10-07 |
Broflanilide induces zebrafish neurobehavioral defects by interfering with synaptic homeostasis
2025-Jun, Aquatic toxicology (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.aquatox.2025.107355
PMID:40209298
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研究论文 | 研究溴虫氟苯双酰胺通过干扰突触稳态诱导斑马鱼神经行为缺陷的机制 | 首次在斑马鱼模型中揭示溴虫氟苯双酰胺通过跨细胞类型的转录调控介导神经毒性 | 仅研究单一农药的长期暴露效应,缺乏多农药联合暴露的对比研究 | 探究溴虫氟苯双酰胺对斑马鱼神经行为的影响及其神经细胞异质性机制 | 成年斑马鱼 | 神经毒理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序,靶向代谢组学,神经行为测试 | 斑马鱼模型 | 基因表达数据,代谢组数据,行为数据 | 暴露于5和25 μg/L溴虫氟苯双酰胺30天的斑马鱼 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8567 | 2025-10-07 |
Spatially resolved multi-omics reveals the renal cortex-metabolic reprogramming of Shenhua Tablet for intervention on IgA nephropathy
2025-Jun, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.156742
PMID:40233505
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研究论文 | 本研究利用空间多组学技术揭示了肾华片通过调节谷胱甘肽代谢、糖酵解和L-脯氨酸代谢干预IgA肾病的分子机制 | 首次采用空间多组学策略解析中药复方在肾脏不同区域的代谢重编程作用机制 | 研究基于大鼠模型,缺乏人体临床试验验证 | 探索肾华片干预IgA肾病的分子机制 | IgA肾病大鼠模型 | 空间多组学 | IgA肾病 | 空间代谢组学, 空间转录组学, 质谱成像 | NA | 代谢组数据, 转录组数据, 图像数据 | IgA肾病大鼠模型 | NA | 空间代谢组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 8568 | 2025-10-07 |
Discovering governing equations of biological systems through representation learning and sparse model discovery
2025-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf048
PMID:40290314
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研究论文 | 提出了一种名为CLERA的端到端计算框架,通过表示学习和稀疏模型发现来揭示生物系统的控制方程 | 将监督自编码器架构与非线性动力学稀疏识别相结合,利用先验知识同时提取低维表示并发现驱动过程的潜在动力系统 | NA | 从单细胞RNA测序数据中发现简约的动态模型并识别活跃基因程序 | 合成数据和生物数据中的基因表达动态 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 监督自编码器, Sparse Identification of Nonlinear Dynamics | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8569 | 2025-10-07 |
ScRNA-Seq reveals T cell immunity in COVID-19 patients and implications for immunotherapy
2025-May-16, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114663
PMID:40233451
|
综述 | 通过单细胞RNA测序技术揭示COVID-19患者T细胞免疫特征及其对免疫治疗的启示 | 首次系统阐述scRNA-seq在解析COVID-19患者T细胞异质性和功能障碍中的应用,揭示不同临床表型患者的T细胞特征差异 | 现有靶向T细胞的治疗策略效果不一致,需联合治疗方法 | 阐明T细胞异质性对COVID-19疾病严重程度的影响机制 | COVID-19患者的常规T细胞(CD8、CD4 T细胞)和非常规T细胞(NKT、MAIT、γδT细胞) | 单细胞组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 不同临床表现的COVID-19患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8570 | 2025-10-07 |
Therapeutic and prognostic values of ferroptosis signature in glioblastoma
2025-May-16, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114597
PMID:40239336
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研究论文 | 探讨铁死亡特征在胶质母细胞瘤中的治疗和预后价值 | 通过单细胞RNA测序揭示胶质母细胞瘤中铁死亡的分子特征及其与肿瘤微环境的相互作用 | 铁死亡与GBM免疫景观的关系复杂,可能产生正向或负向影响 | 研究铁死亡在胶质母细胞瘤中的治疗潜力和预后价值 | 胶质母细胞瘤细胞及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8571 | 2025-10-07 |
Characterization of the Biochemical Recurrence Prediction Ability and Progression Correlation of Peroxiredoxins Family in Prostate Cancer Based on Integrating Single-Cell RNA-Seq and Bulk RNA-Seq Cohorts
2025-May, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70855
PMID:40281661
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,探讨了过氧化物氧化还原酶家族在前列腺癌中的预后预测价值及与疾病进展的关联 | 首次系统评估PRDXs家族在前列腺癌中的临床价值,发现PRDX5与疾病进展最相关,并开发了整合PRDX5表达和临床特征的预测模型 | 研究主要基于公共数据集,部分发现需进一步实验验证 | 评估PRDXs家族在前列腺癌预后预测和治疗反应中的作用 | 前列腺癌患者样本和去势抵抗性前列腺癌细胞系 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫组织化学, 体外细胞实验 | 列线图预测模型 | 基因表达数据, 临床数据 | 2个单细胞RNA数据集和8个批量RNA数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 8572 | 2025-10-07 |
Role of different Lyl1 transcripts in zebrafish primitive hematopoiesis
2025-May, Yi chuan = Hereditas
DOI:10.16288/j.yczz.24-288
PMID:40287790
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研究论文 | 本研究通过分析斑马鱼单细胞RNA测序数据,发现Lyl1基因存在长短两种转录本,并在原始造血过程中发挥不同调控作用 | 首次在斑马鱼和人类中发现Lyl1基因的长短转录本,并揭示它们在原始髓系造血中的不同功能 | 研究主要基于斑马鱼模型,人类中的功能验证需要进一步研究 | 探究Lyl1不同转录本在原始造血过程中的作用机制 | 斑马鱼胚胎造血细胞 | 发育生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序, 5'RACE, Morpholino基因敲降 | NA | 单细胞RNA测序数据, RNA测序数据 | 斑马鱼造血细胞 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 8573 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptome Reveals the Cellular Response to PEG-Induced Stress in Wheat Leaves
2025-Apr-27, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c12749
PMID:40287963
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了小麦叶片在PEG诱导胁迫下的细胞响应机制 | 首次构建小麦叶片单细胞图谱,揭示不同细胞类型在干旱胁迫下的响应异质性和调控网络 | 研究仅基于PEG模拟的干旱胁迫,未涉及真实田间干旱条件 | 探究小麦在细胞水平对干旱胁迫的响应机制 | 抗旱和感旱小麦幼苗叶片 | 单细胞组学 | 植物胁迫响应 | 单细胞RNA测序 | 伪时间轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8574 | 2025-10-07 |
Single-nucleus RNA sequencing and spatial transcriptomics reveal the mechanism by which Xiaozhiling injection treats internal hemorrhoids
2025-Apr-27, World journal of gastrointestinal surgery
IF:1.8Q2
DOI:10.4240/wjgs.v17.i4.103494
PMID:40291892
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序和空间转录组学揭示了消痔灵注射液治疗内痔的作用机制 | 首次结合单核RNA测序和空间转录组学技术研究消痔灵注射液治疗内痔的分子机制,发现Sphk1-S1P通路在促进纤维化中的关键作用 | 研究仅基于大鼠模型,缺乏人类临床样本验证 | 探究消痔灵注射液治疗内痔的分子机制 | 内痔模型大鼠的成纤维细胞 | 空间转录组学 | 内痔 | 单核RNA测序,空间转录组学,电子显微镜,免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据,图像数据 | 大鼠内痔模型(分为对照组和治疗组) | NA | 单核RNA测序,空间转录组学 | Stereo-seq | NA |
| 8575 | 2025-10-07 |
Integrated Analysis of Single-Cell and Transcriptome Data Reveals the Role and Regulatory Mechanisms of Neuroinflammation in Parkinson's Disease
2025-Apr-26, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-025-02306-4
PMID:40285838
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研究论文 | 通过整合单细胞和转录组数据分析,揭示神经炎症在帕金森病中的作用及STAT3转录因子的调控机制 | 首次通过整合单细胞RNA测序和微阵列数据,系统揭示STAT3作为小胶质细胞促炎活化的核心调控因子在帕金森病中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库数据,样本来源有限;动物和细胞模型可能无法完全模拟人类疾病复杂性 | 探究帕金森病中不同细胞类型的炎症特征及其调控机制 | 人类PD中脑黑质致密部组织、MPTP诱导的PD小鼠模型、MPP+诱导的BV2细胞和SH-SY5Y细胞 | 生物信息学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序, 微阵列分析, GSVA, GSEA, KEGG, GO分析, 轨迹分析, SCENIC分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞数据 | 来自GEO数据库的人类PD中脑组织数据,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, 微阵列 | NA | NA |
| 8576 | 2025-10-07 |
Blockade of TIGAR prevents CD8+ T cell dysfunction and elicits anti-AML immunity
2025-Apr-26, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04042-y
PMID:40285889
|
研究论文 | 本研究通过阻断TIGAR基因表达,揭示了其能够防止CD8+ T细胞功能失调并诱导抗急性髓系白血病免疫反应的机制 | 首次证明TIGAR沉默不仅能直接抑制AML细胞,还能增强T细胞功能,通过调节糖代谢途径逆转T细胞耗竭状态 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 | 探究TIGAR沉默是否能够消除AML细胞并恢复功能失调的T细胞功能 | C57BL/6J背景的TIGAR基因敲除小鼠和C1498细胞建立的AML小鼠模型 | 免疫学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,细胞因子检测 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,细胞表型数据,生存数据 | 未明确说明具体样本数量,使用基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8577 | 2025-10-07 |
In silico-based analysis and in vitro experiments identify SIGMAR1 as a potential marker of putative lung cancer stem cells
2025-Apr-26, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02394-6
PMID:40285994
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析结合体外实验,鉴定SIGMAR1作为肺癌干细胞潜在标志物 | 首次通过单细胞RNA测序数据识别SIGMAR1在肺癌干细胞中的特异性表达,并验证其在调控干细胞自我更新能力中的功能 | 研究主要基于体外实验和已有数据集,未来需要进一步探索SIGMAR1调控干细胞特性的具体机制 | 识别肺癌干细胞的新型标志物并验证其功能 | A549细胞系来源的肿瘤球体及人类肺癌组织单细胞测序数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,轨迹分析,siRNA敲低 | NA | 单细胞RNA测序数据,体外实验数据 | 两个公共单细胞RNA测序数据集及A549细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8578 | 2025-10-07 |
Perturbing local steroidogenesis to improve breast cancer immunity
2025-Apr-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59356-3
PMID:40287432
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研究论文 | 通过抑制局部类固醇生成来增强三阴性乳腺癌的抗肿瘤免疫反应 | 首次揭示免疫细胞局部类固醇生成在乳腺癌免疫抑制中的作用机制,并发现泊沙康唑可作为类固醇生成抑制剂 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 探索通过调控局部类固醇生成改善乳腺癌免疫治疗效果的策略 | 三阴性乳腺癌患者肿瘤样本和人源化TNBC小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 靶向代谢组学,免疫组织化学,单细胞转录组学,代谢建模 | NA | 代谢组数据,转录组数据,组织切片图像 | TNBC患者肿瘤样本和实验小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,靶向代谢组分析 | NA | NA |
| 8579 | 2025-10-07 |
Comprehensive single-cell transcriptome analysis of autologous platelet-rich plasma therapy on human thin endometrium
2025-Apr-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-99468-w
PMID:40287476
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析研究自体富血小板血浆治疗对人类薄型子宫内膜的影响 | 首次通过单细胞转录组分析研究PRP治疗机制,发现PRP治疗能增强细胞干性、促进间质-上皮转化并增强巨噬细胞功能 | 样本量较小(仅10名患者),需要更大规模研究验证 | 探究自体富血小板血浆治疗薄型子宫内膜的分子机制 | 薄型子宫内膜患者的子宫内膜组织 | 单细胞转录组学 | 薄型子宫内膜 | 单细胞RNA测序,苏木精-伊红染色,免疫组织化学 | CytoTRACE细胞轨迹重建分析,基因集变异分析 | 单细胞转录组数据,组织学图像数据 | 10名薄型子宫内膜患者的配对样本(治疗前后) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8580 | 2025-10-07 |
Dynamics of tertiary lymphoid structures and immune cross talk in early versus advanced colorectal cancer: potential implications for immunotherapy
2025-Apr-26, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04027-x
PMID:40287532
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了早期与晚期结直肠癌中三级淋巴结构动态变化及其对免疫治疗的影响 | 发现CD8+Tex细胞表达CXCL13以及CD4+Tfh与BGC细胞间的CD40-CD40L相互作用是三级淋巴结构功能的关键调节因子 | 研究主要基于三个内部队列,需要更大规模的外部验证 | 探究早期与晚期结直肠癌肿瘤微环境和三级淋巴结构的差异及其对免疫治疗的潜在影响 | 结直肠癌患者肿瘤组织 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA转录分析, 病理组织分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA转录数据, 病理组织数据 | 三个内部队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |