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当前共找到 10543 篇文献，本页显示第 8461 - 8480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8461 | 2025-05-10 |
Precise gene expression deconvolution in spatial transcriptomics with STged
2025-Feb-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf087
PMID:39970279
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研究论文 | 提出了一种名为STged的新型计算框架，用于从空间转录组学数据中精确解卷积细胞类型特异性基因表达谱 | STged通过整合基于图的空间相关性和参考基因特征，超越了传统的细胞类型解卷积方法，能够重建混合点中的细胞类型特异性基因表达谱 | NA | 解决空间转录组学中细胞类型特异性基因表达模式被掩盖的问题 | 人类胰腺导管腺癌、人类鳞状细胞癌数据集以及小鼠肾脏组织 | 数字病理学 | 胰腺癌、鳞状细胞癌 | 空间转录组学 | 非负最小二乘回归框架 | 基因表达数据 | 人类和小鼠组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 8462 | 2025-05-10 |
Single-cell sequencing elucidates the mechanism of NUSAP1 in glioma and its diagnostic and prognostic significance
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1512867
PMID:39975552
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研究论文 | 通过单细胞测序技术探索NUSAP1在神经胶质瘤中的作用机制及其诊断和预后意义 | 利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据结合基础实验，揭示了NUSAP1作为神经胶质瘤终末亚群的关键标记物及其与不良预后的关联 | 研究主要基于TCGA和GEO数据库的RNA-seq和微阵列数据，可能需要更多独立样本验证 | 探索神经胶质瘤的个性化精准治疗策略 | 神经胶质瘤细胞亚群 | 数字病理学 | 神经胶质瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), RNA-seq, 微阵列 | NA | RNA-seq数据, 微阵列数据, scRNA-seq数据 | 来自TCGA和GEO数据库的神经胶质瘤患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 8463 | 2025-05-10 |
Advancing personalized, predictive, and preventive medicine in bladder cancer: a multi-omics and machine learning approach for novel prognostic modeling, immune profiling, and therapeutic target discovery
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1572034
PMID:40330458
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，识别并分析了膀胱癌中与免疫原性细胞死亡相关的多组学特征，构建了一个预后标志物ICDRS，并探讨了其临床和生物学意义 | 利用多组学数据和机器学习算法构建了膀胱癌的预后标志物ICDRS，揭示了其与免疫细胞浸润、肿瘤微环境及药物敏感性的关联 | 研究依赖于公开数据集，样本量有限，且未进行实验验证 | 推进膀胱癌的个性化、预测性和预防性医学研究 | 膀胱癌患者 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 批量RNA测序(bulk RNA-seq), WGCNA, ssGSEA | Lasso, Ridge, CoxBoost | RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据9个样本，批量RNA测序数据TCGA-BLCA 403个样本，GSE13507 160个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 8464 | 2025-05-10 |
METTL1-driven nucleotide metabolism reprograms the immune microenvironment in hepatocellular carcinoma: a multi-omics approach for prognostic biomarker discovery
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1582203
PMID:40330476
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research paper | 本研究揭示了METTL1通过驱动核苷酸代谢重编程在肝细胞癌（HCC）中调节肿瘤免疫微环境的新机制，并开发了一个基于多组学方法的预后生物标志物模型 | 首次揭示了METTL1驱动的核苷酸代谢重编程在HCC免疫微环境重塑中的关键作用，并构建了整合METTL1表达和免疫检查点特征的预后预测模型 | 研究主要基于计算分析和体外实验，需要更多体内实验和临床样本验证 | 探索HCC中代谢和免疫失调的分子机制，并开发预后预测模型 | 肝细胞癌（HCC）患者样本和细胞模型 | digital pathology | liver cancer | 多组学分析（包括单细胞RNA测序）、NMF聚类、WGCNA、机器学习算法 | 预后预测模型（基于多种机器学习算法） | 基因组数据、转录组数据、临床数据 | 来自TCGA、GEO和ICGC数据库的HCC患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 8465 | 2025-05-10 |
Comprehensive analysis of plasma cell heterogeneity and immune interactions in multiple myeloma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1549742
PMID:40330467
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和转录组数据分析，深入探讨了多发性骨髓瘤中浆细胞的异质性及其免疫相互作用 | 首次通过单细胞测序鉴定出10种主要细胞类型，并构建了预后预测模型，揭示了风险组与免疫特征的关联 | 研究依赖于公共数据库的数据，可能受到样本来源和数量的限制 | 探索多发性骨髓瘤发展的潜在机制，为改进治疗方法和提高患者预后提供新方向 | 多发性骨髓瘤中的浆细胞及其异质性 | 生物信息学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞测序，转录组分析，NMF，WGCNA，LASSO，multiCox回归分析 | 预后预测模型 | 转录组数据 | 多个公共数据库中的样本，具体数量未明确说明 | NA | NA | NA | NA |
| 8466 | 2025-05-10 |
Multi-omics identification of a polyamine metabolism related signature for hepatocellular carcinoma and revealing tumor microenvironment characteristics
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1570378
PMID:40330470
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研究论文 | 本研究通过多组学方法鉴定了一个与多胺代谢相关的肝细胞癌特征，并揭示了肿瘤微环境特征 | 使用101种机器学习算法构建了一个包含9个基因的多胺代谢相关特征（PMRS），并验证了其在肝细胞癌患者中的预后价值 | 研究结果需要进一步的临床实验验证 | 探索多胺代谢在肝细胞癌中的作用，并开发预后风险特征 | 肝细胞癌（HCC）患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | RNA-seq, scRNA-seq, RT-qPCR, 机器学习算法 | 机器学习算法（未指定具体模型） | RNA测序数据, 单细胞RNA测序数据 | TCGA和GEO数据库中的肝细胞癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 8467 | 2025-05-10 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis Reveals the Role of Macrophage-Mediated CD44-AKT-CCL2 Pathways in Renal Tubule Injury during Calcium Oxalate Crystal Formation
2025, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0690
PMID:40330661
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示了巨噬细胞介导的CD44-AKT-CCL2通路在草酸钙晶体形成过程中肾小管损伤的作用 | 发现了肾小管损伤和S1近端小管细胞通过SPP1-CD44对与巨噬细胞的主要通讯方式，以及CD44-AKT通路介导的CCL2分泌在草酸钙晶体形成中的关键作用 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证 | 深入了解草酸钙晶体形成过程中肾脏功能的改变及其分子机制 | 小鼠肾脏组织 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠草酸钙模型 | RNA测序数据 | 5个时间点的小鼠肾脏组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 8468 | 2025-05-10 |
The first single-cell sequencing of Plasmodiophora brassicae reveals genetic diversity and clonal dynamics
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1581233
PMID:40330724
|
研究论文 | 首次对芸薹根肿菌进行单细胞测序，揭示其遗传多样性和克隆动态 | 首次对芸薹根肿菌进行单细胞测序，揭示了其遗传多样性和克隆动态，支持了平衡选择维持病原体种群内多基因型的假说 | 研究仅基于单个根的样本，可能无法完全代表田间种群的遗传多样性 | 研究芸薹根肿菌的遗传多样性和繁殖生物学 | 芸薹根肿菌 | 基因组学 | 植物病害 | 单细胞测序 | NA | DNA序列数据 | 4,000个原生质体（来自单个根），其中500个细胞进行了更详细的分析 | NA | NA | NA | NA |
| 8469 | 2025-05-10 |
Neuroinflammation and stress-induced pathophysiology in major depressive disorder: mechanisms and therapeutic implications
2025, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2025.1538026
PMID:40336842
|
综述 | 本文综述了神经炎症与压力诱导的病理生理学在重度抑郁症中的作用机制及治疗意义 | 聚焦于压力诱导的神经炎症过程及其在抑郁症发病和进展中的作用，探讨了抗炎活性小分子在治疗中的潜在效果 | 未提及具体实验数据或样本量，主要基于现有研究的总结和分析 | 探讨神经炎症在重度抑郁症中的机制及治疗潜力 | 神经炎症过程，特别是小胶质细胞和星形胶质细胞的过度激活及促炎细胞因子水平升高 | 神经科学 | 重度抑郁症 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8470 | 2025-05-10 |
Spatial visualization provides insight into immune modulation by an L-DBF vaccine formulation against Shigella
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1577040
PMID:40336950
|
研究论文 | 本研究探讨了L-DBF疫苗配方在肺部免疫调节中的作用，通过空间转录组学方法分析了两剂L-DBF/ME疫苗对肺部免疫景观的影响 | 首次使用空间转录组学方法揭示L-DBF/ME疫苗如何重塑肺部免疫架构，包括B细胞、T细胞标记物表达的变化，以及成纤维细胞和心肌细胞的重新编程 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体临床试验中验证 | 评估L-DBF/ME疫苗配方对肺部免疫反应的调节作用 | L-DBF疫苗配方及其对肺部免疫系统的影响 | 免疫学 | 志贺菌病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8471 | 2025-05-09 |
Integrated multiomics and Mendelian randomization identify CHIT1 as a novel sepsis biomarker and therapeutic target
2025-May-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-99619-z
PMID:40325173
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和孟德尔随机化方法，发现CHIT1作为脓毒症的新型生物标志物和治疗靶点 | 首次将CHIT1鉴定为脓毒症的新生物标志物和潜在药物靶点，揭示了其在加剧中性粒细胞过度炎症和免疫抑制中的作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，缺乏前瞻性临床验证 | 寻找能预测脓毒症患者预后的新关键生物标志物并探索其分子机制 | 脓毒症患者 | 生物信息学 | 脓毒症 | 批量转录组测序、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、孟德尔随机化(MR)分析 | 单变量Cox回归模型 | 基因表达数据 | 多个GEO数据集(GSE65682等)和eQTLGen Consortium及IEU OpenGWAS项目数据 | NA | NA | NA | NA |
| 8472 | 2025-05-09 |
Modulation of senescent Lepr+ skeletal stem cells via suppression of leptin-induced STAT3‒FGF7 axis activation alleviates abnormal subchondral bone remodeling and osteoarthritis progression
2025-May-05, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04342-1
PMID:40325465
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和体内外实验，揭示了瘦素受体阳性骨骼干细胞（Lepr+ SSCs）在骨关节炎（OA）进展中的衰老机制及其通过STAT3-FGF7轴加剧软骨下骨异常重塑的作用 | 首次揭示了Lepr+ SSCs通过瘦素-Lepr信号通路激活STAT3-FGF7轴促进OA进展的新机制，为OA治疗提供了新的靶点 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类OA患者中进行验证 | 探究骨骼干细胞衰老在骨关节炎进展中的作用及其分子机制 | 小鼠创伤后骨关节炎（PTOA）模型中的Lepr+骨骼干细胞 | 骨生物学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、microCT、病理分析 | 小鼠PTOA模型 | 基因表达数据、影像数据、组织病理数据 | 未明确说明具体样本数量（小鼠模型） | NA | NA | NA | NA |
| 8473 | 2025-05-08 |
Identification of CXCL13 as a Promising Biomarker for Immune Checkpoint Blockade Therapy and PARP Inhibitor Therapy in Ovarian Cancer
2025-Jun, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-024-01207-5
PMID:38856873
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research paper | 该研究识别了CXCL13作为卵巢癌免疫检查点阻断疗法和PARP抑制剂疗法的潜在生物标志物 | 发现CXCL13在HRD肿瘤中显著上调，并作为反映HRD状态的生物标志物，为卵巢癌ICB治疗提供了新的预后生物标志物视角 | 研究依赖于公共数据库和独立队列的验证，可能需要更多实验数据进一步确认CXCL13的临床应用价值 | 探索卵巢癌中免疫检查点阻断疗法和PARP抑制剂疗法的生物标志物 | 卵巢癌患者 | digital pathology | ovarian cancer | 基因组测序、免疫组化、单细胞测序 | NA | 基因组数据、临床数据、单细胞测序数据 | 来自TCGA、ICGC、GEO等公共数据库的数据，以及独立验证队列 | NA | NA | NA | NA |
| 8474 | 2025-05-08 |
Single-cell analysis reveals the implication of vascular endothelial cell-intrinsic ANGPT2 in human intracranial aneurysm
2025-May-06, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae186
PMID:39187926
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research paper | 通过单细胞RNA测序揭示血管内皮细胞内在的ANGPT2在人颅内动脉瘤中的意义 | 首次通过单细胞RNA测序全面分析颅内动脉瘤的细胞组成和血管内皮细胞的转录组变化，并发现ANGPT2在动脉瘤形成中的作用 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，需要进一步的实验验证 | 探索颅内动脉瘤的发病机制和潜在治疗靶点 | 人颅内动脉瘤和对照动脉组织 | digital pathology | cardiovascular disease | scRNA-seq | zebrafish model | RNA sequencing data | 43,462个细胞的转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 8475 | 2025-05-08 |
A Spatial Multi-Omic Framework Identifies Gliomas Permissive to TIL Expansion
2025-Apr-25, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6314842/v1
PMID:40313763
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研究论文 | 该研究通过多模态分析方法识别了允许肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）扩增的胶质瘤的空间和分子特征 | 整合了多种高通量技术（如单细胞RNA测序、空间蛋白质组学等）进行多模态分析，揭示了TIL扩增的基因组和空间决定因素 | 研究主要针对高级别胶质瘤，结果在其他免疫排斥性癌症中的普适性需要进一步验证 | 识别TIL扩增的基因组和空间决定因素，为基于T细胞的免疫治疗提供选择平台 | 高级别胶质瘤 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 光谱流式细胞术、TCR测序、单细胞RNA-seq、Xenium转录组学、CODEX空间蛋白质组学 | NA | 多组学数据（基因组、转录组、蛋白质组） | 未明确提及具体样本数量，但涉及高级别胶质瘤的TIL生成与非生成肿瘤对比 | NA | NA | NA | NA |
| 8476 | 2025-05-07 |
Identifying the Pattern Characteristics of Anoikis-Related Genes in Keloid
2025-May, Advances in wound care
IF:5.8Q1
DOI:10.1089/wound.2024.0027
PMID:38775414
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research paper | 该研究首次全面分析了anoikis相关基因(ARGs)在瘢痕疙瘩(KD)中的作用，并鉴定了六个核心ARGs | 首次研究ARGs在KD中的潜在价值，并鉴定了六个核心ARGs及其与KD免疫浸润的关联 | 研究仅基于三个KF RNA-seq数据集，样本量有限 | 探究ARGs在KD中的表达特征及其分子机制 | 瘢痕疙瘩(KD)和anoikis相关基因(ARGs) | 生物信息学 | 瘢痕疙瘩 | RNA-seq, 单细胞测序, LASSO-Cox回归分析 | LASSO回归模型 | 基因表达数据 | 三个KF RNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 8477 | 2025-05-07 |
Single-cell multiomics reveals a gene regulatory circuit driving leukemia cell differentiation
2025-May, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03309-z
PMID:39984714
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析揭示了ATRA诱导白血病细胞分化的基因调控回路 | 整合单细胞染色质可及性和转录组分析，发现SPI1和CEBPE组成的正反馈基因调控回路驱动白血病细胞分化 | 研究主要基于NB4细胞系，在其他白血病细胞类型中的普适性需要进一步验证 | 探索ATRA诱导急性早幼粒细胞白血病细胞分化的调控机制 | PML/RARα急性早幼粒细胞白血病(APL)细胞系NB4，以及非APL白血病细胞系HL60和K562 | 单细胞多组学 | 急性早幼粒细胞白血病 | 单细胞染色质可及性分析，单细胞转录组分析 | NA | 单细胞多组学数据 | NB4、HL60和K562白血病细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 8478 | 2025-05-07 |
SLC13A5 plays an essential role in the energy shift to oxidative phosphorylation in cisplatin-resistant mesothelioma stem cells
2025-Mar, Pathology international
IF:2.5Q2
DOI:10.1111/pin.70001
PMID:39912507
|
research paper | 该研究探讨了SLC13A5在顺铂耐药间皮瘤干细胞能量代谢向氧化磷酸化转变中的关键作用 | 揭示了SLC13A5通过调节代谢转变和信号通路增强间皮瘤干细胞的顺铂耐药性 | 研究主要基于体外实验和数据库分析，缺乏体内实验验证 | 探索靶向癌症干细胞的新型治疗方法 | 人类间皮瘤细胞系和间皮瘤干细胞样细胞 | 肿瘤生物学 | 间皮瘤 | 微阵列分析、scRNA-seq | 水凝胶培养模型 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 人类间皮瘤细胞系和临床间皮瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 8479 | 2025-05-07 |
scRecover: Discriminating True and False Zeros in Single-Cell RNA-Seq Data for Imputation
2025-Feb-28, Statistics in medicine
IF:1.8Q1
DOI:10.1002/sim.10334
PMID:39912305
|
研究论文 | 介绍了一种名为scRecover的新工具，用于区分单细胞RNA-seq数据中的真实零值和假零值，并进行有效的插补 | 提出了一种统计框架，能有效区分真实零值（基因未表达）和假零值（信号丢失），并开发了新的插补工具scRecover | 需要与其他插补方法（如scImpute、SAVER和MAGIC）结合使用 | 提高单细胞RNA-seq数据中零值插补的准确性 | 单细胞RNA-seq数据中的零值 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | 零膨胀负二项模型，Good和Toulmin模型的改进版 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8480 | 2025-05-07 |
Immune microenvironment spatial landscapes of tertiary lymphoid structures in gastric cancer
2025-Feb-04, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-025-03889-3
PMID:39901202
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research paper | 该研究探讨了胃癌中三级淋巴结构（TLS）对免疫微环境空间景观的影响及其预后价值 | 首次全面分析了胃癌中TLS的免疫微环境空间特征，并开发了基于免疫细胞密度和空间特征的风险评分模型 | 样本量相对较小（单细胞测序仅12例，空间转录组仅2例） | 阐明TLS在胃癌免疫微环境中的作用机制及其预后意义 | 胃癌患者的肿瘤组织和免疫微环境 | digital pathology | gastric cancer | multispectral fluorescence imaging, single-cell RNA sequencing, spatial transcriptomics | Density and Spatial Score risk model | image, transcriptomic data | 59例接受免疫治疗的GC患者（预后分析），110例GC患者（免疫细胞分析），12例单细胞测序样本（4例TLS阳性，8例阴性），2例空间转录组样本 | NA | NA | NA | NA |