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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8381 | 2025-10-06 |
Molecular biology of the deadliest cancer - glioblastoma: what do we know?
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1530305
PMID:40191211
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综述 | 本文整合了当前关于胶质母细胞瘤细胞及其微环境的生物学特性和分子通讯模式的知识 | 强调单细胞RNA测序技术揭示了胶质母细胞瘤的新见解,并提出个性化多免疫疗法的重要性 | NA | 总结胶质母细胞瘤的分子生物学特征并探讨潜在治疗策略 | 胶质母细胞瘤细胞及其肿瘤微环境 | 分子生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8382 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveals immunosuppressive microenvironment and highlights tumor-promoting macrophage cells in Glioblastoma
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0312764
PMID:40193323
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示胶质母细胞瘤免疫抑制微环境特征及肿瘤促进性巨噬细胞亚型 | 首次在单细胞水平系统鉴定胶质母细胞瘤中五种肿瘤相关巨噬细胞亚型,并发现具有M2极化特征的TAM_MRC1亚型和耗竭表型的CD56dim_DNAJB1自然杀伤细胞亚群 | 样本量相对有限(24名患者),未进行功能性验证实验 | 解析胶质母细胞瘤微环境的细胞异质性和免疫抑制机制 | 胶质母细胞瘤患者肿瘤组织中的免疫细胞和肿瘤细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 24名胶质母细胞瘤患者的48个肿瘤片段 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8383 | 2025-05-17 |
Single-cell analysis reveals potential therapeutic markers of peripheral blood mononuclear cells from bladder cancer patients
2025, Brazilian journal of medical and biological research = Revista brasileira de pesquisas medicas e biologicas
DOI:10.1590/1414-431X2025e14002
PMID:40367012
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析膀胱癌患者外周血单个核细胞,揭示潜在的治疗标志物 | 首次在膀胱癌患者外周血单个核细胞中鉴定出LAG-3和TIM-3等新型潜在免疫检查点抑制剂靶点,并发现多个与肿瘤进展相关的细胞亚群及其特征基因 | 样本量相对较小(仅包括患者和一名健康供体),且未进行功能验证实验 | 探索膀胱癌免疫治疗的潜在新靶点和生物标志物 | 膀胱癌患者和健康供体的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 44,022个细胞(来自膀胱癌患者和一名健康供体的外周血单个核细胞样本) | NA | NA | NA | NA |
| 8384 | 2025-05-17 |
The CD38+HLA-DR+ T cells with activation and exhaustion characteristics as predictors of severity and mortality in COVID-19 patients
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1577803
PMID:40370439
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研究论文 | 该研究通过流式细胞术和单细胞RNA测序技术,分析了COVID-19患者外周免疫细胞的特征,发现CD38+HLA-DR+ T细胞的扩增与疾病严重程度和死亡率相关 | 首次将CD38+HLA-DR+ T细胞确定为COVID-19预后的新型生物标志物,并揭示了其独特的激活-耗竭表型及对NAD+代谢的影响 | 样本来源仅限于外周血,未评估组织中的免疫细胞特征;研究人群的多样性可能有限 | 寻找COVID-19的新型治疗靶点和早期预测生物标志物 | 健康人、细菌性肺炎患者和COVID-19患者的外周免疫细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 流式细胞术、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞表型数据、基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量,但包括健康人、细菌性肺炎患者和COVID-19患者三类人群 | NA | NA | NA | NA |
| 8385 | 2025-05-17 |
Single-cell transcriptome reveals potential mechanisms for gout in children
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1577109
PMID:40370447
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探索了儿童痛风的分子机制 | 揭示了CD14+单核细胞和DN T细胞在儿童痛风中的关键作用,以及与成人痛风的异同 | 样本来源仅限于外周血,未涉及痛风关节组织 | 探索儿童痛风的分子机制 | 儿童痛风患者和健康对照的外周血样本 | 生物医学 | 痛风 | scRNA-seq | NA | RNA测序数据 | 儿童痛风患者和健康对照的外周血样本(具体数量未说明) | NA | NA | NA | NA |
| 8386 | 2025-05-17 |
Exploration the role of pro-inflammatory fibroblasts and related markers in periodontitis: combing with scRNA-seq and bulk-seq data
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1537046
PMID:40370461
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量转录组数据分析,探索了促炎性牙龈成纤维细胞(PIGFs)在牙周炎中的作用及其相关分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别出与牙周炎发展密切相关的促炎性牙龈成纤维细胞亚群,并发现MME和TSPAN11两个基因作为潜在治疗靶点 | 研究样本量有限,且未在更大人群中验证MME和TSPAN11的临床效果 | 探索促炎性牙龈成纤维细胞在牙周炎发病机制中的作用及其分子机制 | 牙龈成纤维细胞(GFs)及其亚群促炎性牙龈成纤维细胞(PIGFs) | 数字病理学 | 牙周炎 | scRNA-seq, bulk-seq, qPCR, 免疫荧光染色 | 多种机器学习算法 | RNA测序数据 | 来自正常和牙周炎患者的scRNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 8387 | 2025-05-17 |
Unraveling the role of histone acetylation in sepsis biomarker discovery
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1582181
PMID:40370519
|
研究论文 | 本研究通过转录组和单细胞RNA测序数据,结合机器学习算法,发现了与组蛋白乙酰化相关的脓毒症生物标志物 | 首次将组蛋白乙酰化与脓毒症生物标志物发现联系起来,并利用多种机器学习算法和孟德尔随机化方法进行验证 | 研究样本量未明确说明,且需要进一步临床验证 | 发现脓毒症早期诊断和预后的有效生物标志物 | 脓毒症患者(具体样本信息未提供) | 生物信息学 | 脓毒症 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 孟德尔随机化 | LASSO, SVM-RFE, Boruta | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8388 | 2025-05-17 |
Resveratrol targeting MDM2/P53/PUMA axis to inhibit colonocyte apoptosis in DSS-induced ulcerative colitis mice
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1572906
PMID:40371345
|
research paper | 该研究探讨了白藜芦醇通过调节MDM2/P53/PUMA轴抑制结肠细胞凋亡,从而治疗DSS诱导的溃疡性结肠炎的潜力 | 揭示了白藜芦醇通过MDM2/P53/PUMA轴抑制结肠细胞凋亡的新机制,并验证了MDM2作为溃疡性结肠炎治疗靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人体中进行验证 | 研究白藜芦醇在溃疡性结肠炎治疗中的作用机制和疗效 | DSS诱导的溃疡性结肠炎小鼠模型和体外培养的结肠细胞 | 生物医学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞测序、免疫荧光染色、腺相关病毒系统 | 小鼠溃疡性结肠炎模型 | 实验数据 | 未明确说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 8389 | 2025-05-16 |
Pdgfrβ marks distinct mesenchymal and pericyte populations within the periosteum with overlapping cellular features
2025-May-15, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxaf020
PMID:40237625
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和转基因小鼠模型,探讨了骨膜中Pdgfrβ阳性细胞的异质性及其在骨修复中的作用 | 揭示了骨膜中Pdgfrβ阳性细胞的不同亚群,包括间充质细胞和周细胞,并分析了它们的增殖、迁移和成骨能力 | 研究主要基于小鼠模型,结果在人类中的适用性尚需验证 | 探讨骨膜中Pdgfrβ阳性细胞的异质性及其在骨修复中的作用 | 小鼠长骨骨膜中的Pdgfrβ阳性细胞 | 细胞生物学 | 骨疾病 | 单细胞RNA测序,转基因小鼠模型 | Pdgfrβ-CreERT2-mT/mG报告小鼠 | 基因表达数据,组织学数据 | 转基因小鼠模型中的Pdgfrβ阳性细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 8390 | 2025-10-06 |
IAP dependency of T-cell prolymphocytic leukemia identified by high-throughput drug screening
2025-May-15, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024027171
PMID:39869826
|
研究论文 | 通过高通量药物筛选识别T细胞幼淋巴细胞白血病对IAP抑制剂的依赖性 | 首次系统绘制T-PLL的药物敏感性图谱,发现其对IAP抑制剂、核输出抑制剂和自噬抑制剂的特异性脆弱性 | 研究基于体外实验,样本量相对有限(30例患者样本) | 发现T-PLL的新治疗靶点和治疗策略 | T细胞幼淋巴细胞白血病(T-PLL)患者原代细胞 | 肿瘤学研究 | 白血病 | 高通量药物筛选,RNA测序,单细胞RNA测序,光谱流式细胞术 | NA | 药物敏感性数据,基因表达数据,细胞表型数据 | 30例原代患者样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 8391 | 2025-05-16 |
Evidence of secondary Notch signaling within the rat small intestine
2025-May-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204277
PMID:40371707
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research paper | 该研究探讨了大鼠小肠中一种罕见的上皮细胞群体CFTR高表达细胞(CHEs)的特定形成机制 | 揭示了CHEs通过Notch信号通路的二次激活从其他分泌细胞中分化出来的新机制 | 研究主要基于大鼠模型,未在小鼠中发现CHEs,可能限制结果的普遍性 | 理解小肠分泌细胞谱系的多样性形成机制 | 大鼠小肠中的CFTR高表达细胞(CHEs) | 分子生物学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),假时间轨迹分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8392 | 2025-10-06 |
Single cell multiome analysis of the bovine placenta identifies gene regulatory networks in trophoblast differentiation†
2025-May-13, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioaf036
PMID:39987557
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析揭示了牛胎盘发育过程中的染色质可及性景观和基因调控网络 | 首次在牛胎盘中应用10X Genomics多组学平台同时分析单细胞转录组和染色质可及性,揭示了滋养层细胞分化的调控机制 | 仅分析了妊娠第40天和第170天两个时间点,可能无法完全捕捉发育过程中的连续动态变化 | 探究牛胎盘发育过程中滋养层细胞分化的基因调控机制 | 牛胎盘组织 | 单细胞多组学 | 生殖疾病 | 单细胞多组学测序 | NA | 单细胞RNA-seq数据,单细胞ATAC-seq数据 | 妊娠第40天和第170天的牛胎盘样本 | 10x Genomics | single-cell multi-omics, snRNA-seq, snATAC-seq | 10x Genomics multiome平台 | 10X Genomics多组学平台(同时进行单细胞核RNA-seq和单细胞核ATAC-seq) |
| 8393 | 2025-10-06 |
Parvalbumin neurons mediate neurological phenotypes of anti-NMDAR encephalitis
2025-May-13, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awae374
PMID:40071389
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研究论文 | 本研究揭示了小白蛋白神经元在抗NMDAR脑炎神经症状中的关键作用机制 | 首次证明抗NMDAR IgG直接导致小白蛋白神经元功能障碍,并通过光遗传学技术成功逆转认知缺陷 | 动物模型可能无法完全模拟人类疾病复杂性,研究主要聚焦于mPFC和海马区 | 阐明抗NMDAR脑炎认知缺陷的神经病理机制 | 小鼠模型及其中前额叶皮层和海马区的小白蛋白神经元 | 神经科学 | 自身免疫性脑炎 | 免疫组织化学染色、电生理记录、光遗传学、化学遗传学、单细胞测序 | 动物疾病模型 | 电生理数据、基因表达数据、行为学数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8394 | 2025-05-16 |
snPATHO-seq: A Detailed Protocol for Single Nucleus RNA Sequencing From FFPE
2025-May-05, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5291
PMID:40364991
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research paper | 介绍了一种名为snPATHO-seq的稳健且适应性强的单核RNA测序方法,用于从FFPE组织中生成高质量的转录组数据 | snPATHO-seq通过优化的核分离和10× Genomics Flex检测,有效减少了组织碎片并保持了RNA完整性,优于现有的FFPE工作流程 | 未明确提及方法的局限性 | 开发一种能够从FFPE组织中生成高质量单核转录组数据的方法,以推动单细胞组学在转化和临床研究中的应用 | FFPE组织样本,包括乳腺癌等疾病组织 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单核RNA测序(snRNA-seq),10× Genomics Flex检测 | NA | 转录组数据 | 多样化的FFPE样本,包括疾病组织 | NA | NA | NA | NA |
| 8395 | 2025-10-06 |
CALB1 and RPL23 Are Essential for Maintaining Oocyte Quality and Function During Aging
2025-May, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14466
PMID:39748132
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序发现CALB1和RPL23是维持衰老过程中卵母细胞质量的关键基因 | 首次在单细胞分辨率下揭示钙离子稳态失调是卵母细胞衰老的核心特征,并鉴定出CALB1和RPL23两个关键调控基因 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类卵母细胞中验证 | 探究卵母细胞衰老的分子机制 | 年轻和年老雌性小鼠的卵母细胞 | 生殖生物学 | 生殖衰老 | 单细胞转录组测序, 蛋白质组学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据 | 年轻和年老小鼠的卵母细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8396 | 2025-05-16 |
SCGB3A1-Epi and KLK10-Epi Crosstalk With Fibroblasts Promotes Liver Metastasis of Breast Cancer and Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2025-May, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70904
PMID:40357856
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序揭示了乳腺癌和胰腺导管腺癌肝转移的关键上皮细胞亚型及其与成纤维细胞的相互作用机制 | 首次鉴定出SCGB3A1-Epi和KLK10-Epi作为乳腺癌和PDAC肝转移的关键驱动亚型,并揭示了它们与成纤维细胞的特定配体-受体相互作用 | 研究主要基于单细胞测序数据,需要进一步的体内外实验验证这些发现 | 阐明乳腺癌和胰腺导管腺癌肝转移的细胞亚型及其作用机制 | 乳腺癌和胰腺导管腺癌(PDAC)的肝转移样本 | 肿瘤生物学 | 乳腺癌, 胰腺导管腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 8397 | 2025-10-06 |
Map3k3 I441M Knock-In Mouse Model of Cerebral Cavernous Malformations
2025-Apr, Stroke
IF:7.8Q1
DOI:10.1161/STROKEAHA.124.049935
PMID:40127145
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研究论文 | 本研究建立了Map3k3 I441M基因敲入小鼠模型,用于研究脑海绵状血管畸形的发病机制 | 首次成功构建了Map3k3 I441M基因敲入小鼠模型,更准确地模拟了临床患者单等位基因突变的情况 | 研究基于小鼠模型,与人类疾病存在物种差异 | 探究Map3k3 I441M突变在脑海绵状血管畸形发病机制中的作用 | 基因工程小鼠模型 | 分子病理学 | 脑海绵状血管畸形 | 基因敲入技术, 单细胞RNA测序, 免疫染色, 磁共振成像 | 基因敲入小鼠模型 | 基因表达数据, 影像数据, 组织染色数据 | 多种基因工程小鼠品系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8398 | 2025-10-06 |
Biophysical and Biochemical Roles of Shear Stress on Endothelium: A Revisit and New Insights
2025-Mar-28, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325685
PMID:40146803
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综述 | 回顾血流剪切应力对内皮细胞的生物物理特性和生化效应及其在心血管病理生理中的作用 | 整合生物物理与生化视角探讨剪切应力机制,涵盖单细胞测序、空间组学等新兴技术 | 未涉及具体实验数据,主要基于现有文献综合分析 | 阐明剪切应力在血管稳态维持和心血管疾病发展中的作用机制 | 内皮细胞及心血管系统 | 生物医学工程 | 心血管疾病 | 单细胞测序, 空间组学, 代谢组学, 多组学技术 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8399 | 2025-10-06 |
Uncovering Hippo pathway-related biomarkers in acute myocardial infarction via scRNA-seq binding transcriptomics
2025-Mar-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-94820-6
PMID:40133574
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序识别急性心肌梗死中Hippo信号通路相关生物标志物 | 首次结合单细胞RNA测序和机器学习算法鉴定出五个AMI特异性生物标志物,并预测了179种潜在治疗药物 | 研究样本量有限,需要在更大队列中验证生物标志物的临床价值 | 探索急性心肌梗死的发病机制并寻找诊断生物标志物 | 急性心肌梗死患者和对照人群 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, Western blot | 机器学习算法 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8400 | 2025-10-06 |
Clonal expansion dictates the efficacy of mitochondrial lineage tracing in single cells
2025-Mar-26, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03540-7
PMID:40134031
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研究论文 | 本研究通过计算建模和单细胞基因组学探讨了mtDNA变异作为细胞谱系追踪标记的有效性 | 揭示了克隆扩增程度决定线粒体谱系追踪效果的关键机制,并开发了谱系信息评分系统 | 研究主要基于计算模拟和特定生物场景,需要在更多实验条件下验证 | 评估mtDNA变异作为内源性条形码在单细胞水平追踪人类细胞谱系的有效性 | 线粒体DNA变异在不同生物环境中的克隆动态 | 计算生物学 | NA | 单细胞基因组学, 计算建模 | 计算模型 | 基因组数据 | NA | NA | 单细胞基因组学 | NA | NA |