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当前共找到 10619 篇文献,本页显示第 821 - 840 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
821 2026-01-24
CelLink: integrating single-cell multi-omics data with weak feature linkage and imbalanced cell populations
2025-Nov-26, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本文介绍了一种名为CelLink的新型单细胞多组学数据整合方法,旨在解决特征弱关联和细胞群体不平衡的挑战 CelLink通过特征归一化与平滑处理以及多阶段最优传输算法迭代,动态优化细胞对应关系,有效适应弱特征关联和不平衡细胞群体,并在数据混合、细胞流形结构保持和特征插补准确性方面表现优异 NA 开发一种高效整合单细胞多组学数据的方法,以克服特征弱关联和细胞群体不平衡的问题 单细胞RNA测序数据、空间蛋白质组学数据以及配对的CITE-seq数据 机器学习 NA 单细胞多组学技术 最优传输算法 单细胞多组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间蛋白质组学, CITE-seq NA NA
822 2026-01-24
IGFBP7 and CCT2 are novel lactylation-driven mediators of endothelial-to-mesenchymal transition in idiopathic pulmonary fibrosis
2025-Nov-20, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞和批量RNA测序技术,系统探讨了乳酰化修饰在特发性肺纤维化中的作用,并识别出IGFBP7和CCT2作为乳酰化驱动的内皮-间质转化的关键基因 首次系统研究乳酰化在IPF中的作用,结合多算法识别IGFBP7和CCT2为乳酰化驱动的EndMT新介质,并通过实验验证TGF-β诱导代谢重编程的机制 研究主要基于测序数据和体外实验,缺乏体内动物模型验证,且样本量未明确说明,可能限制结论的普适性 探究乳酰化修饰在特发性肺纤维化发病机制中的角色及其临床意义 特发性肺纤维化患者与健康人的样本,重点关注血管内皮细胞 生物信息学与计算生物学 特发性肺纤维化 单细胞测序,批量RNA测序,机器学习算法,Cox回归分析,孟德尔随机化,假时间分析,基因通路活性分析,细胞间通讯分析,代谢评估,RNA干扰,伤口愈合实验 多种机器学习算法(具体未指定),Cox回归模型 单细胞RNA测序数据,批量RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
823 2026-01-24
The aberrant migration and differentiation of neural crest cells are associated with the production of HVP in bearded chicken
2025-Nov-14, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了胡须鸡内脏腹膜色素沉着过度的细胞起源和分子机制 首次使用单细胞RNA测序技术解析HVP的细胞起源,并识别了SEMA3C-PLXND1和TNC-SDC1轴在黑色素细胞迁移和粘附中的关键作用 研究样本仅来自胡须鸡,可能不适用于其他鸡种或物种 探究内脏腹膜色素沉着过度的细胞起源和分子机制,以指导育种策略 胡须鸡的黑色、褪色和正常腹膜组织,以及成纤维细胞系和原代黑色素细胞 单细胞组学 色素沉着异常 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 来自胡须鸡的黑色、褪色和正常腹膜组织,在40天和120天龄取样 NA 单细胞RNA-seq NA NA
824 2026-01-24
Integrative single-cell and bulk RNA-seq analysis identifies glycosyltransferases-related signature in triple negative breast cancer
2025-Nov-08, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞和bulk RNA-seq数据,识别了三阴性乳腺癌中与糖基转移酶相关的分子特征,并构建了一个17基因的风险模型用于预后预测 结合单细胞和bulk RNA-seq数据,利用AUCell评分识别与糖基转移酶相关的基因,并构建了一个具有预测能力的17基因特征模型 研究依赖于公开数据集,未进行大规模独立验证,实验验证部分可能样本量有限 识别三阴性乳腺癌中糖基转移酶的分子靶点,以提高预后准确性和免疫治疗效果 三阴性乳腺癌患者的数据和细胞系 生物信息学 乳腺癌 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq 风险模型 RNA-seq数据 未明确指定,使用公开数据集 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
825 2026-01-24
Genome-Wide Association Analysis and Multi-Omic Mendelian Randomization Insight Into the Molecular Network of Immune-Related Dysfunction in the Pathogenesis of Rheumatoid Arthritis
2025-Nov, International journal of rheumatic diseases IF:2.4Q2
研究论文 本研究通过整合GWAS、eQTL、pQTL和单细胞RNA测序等多组学数据,揭示了免疫相关基因在类风湿关节炎发病机制中的因果作用 首次通过多组学孟德尔随机化框架系统鉴定RA的因果基因,并发现7个新的风险位点,将ERAP2、SWAP70和LTBR等基因分类为高或中等置信度的因果基因 研究主要基于欧洲人群数据,可能限制了结果在其他种族群体中的普适性,且功能验证实验相对有限 阐明免疫相关基因在类风湿关节炎发病机制中的因果作用 类风湿关节炎患者及其遗传与免疫数据 生物信息学 类风湿关节炎 GWAS, eQTL, pQTL, 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 孟德尔随机化, 基于汇总数据的MR 遗传数据, 表达数据, 单细胞转录组数据 三个RA队列的大规模样本 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
826 2026-01-24
The transcription factor RBPJ is required for inflammatory macrophage activation in thoracic aortic dissection by mediating mechanotransduction-induced glycolysis
2025-Oct-28, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1
研究论文 本研究揭示了转录因子RBPJ通过介导机械转导诱导的糖酵解,在胸主动脉夹层中促炎性单核来源巨噬细胞活化中的关键作用 首次阐明RBPJ在胸主动脉夹层巨噬细胞活化中的核心机制,发现机械力通过Piezo1上调RBPJ表达,进而通过PDK1调控糖酵解代谢重编程 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证相对有限;DCA的治疗效果需进一步临床验证 探究RBPJ在胸主动脉夹层巨噬细胞活化中的作用机制 胸主动脉夹层患者样本、BAPN诱导的小鼠模型、骨髓来源巨噬细胞 分子生物学 心血管疾病 RNA测序、scRNA-seq、基因敲除 NA 基因表达数据、单细胞测序数据 小鼠模型及体外细胞实验 NA 单细胞RNA-seq NA NA
827 2026-01-24
Integrated multi-omics analysis reveals AKR1C1 as a key mediator of intervertebral disc degeneration: protecting against ferroptosis via PI3K/AKT signaling
2025-Oct-24, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过整合多组学分析,揭示了AKR1C1作为椎间盘退变的关键介质,并通过PI3K/AKT信号通路抑制铁死亡 首次通过整合孟德尔随机化、QTL数据、单细胞RNA-seq和bulk RNA-seq等多组学方法,系统性地将AKR1C1鉴定为椎间盘退变的因果基因,并阐明其通过激活PI3K/AKT通路抑制髓核细胞铁死亡的保护机制 研究主要基于体外功能实验,缺乏体内动物模型验证;临床转化潜力和具体治疗策略尚未探索 系统识别椎间盘退变的新型治疗靶点 椎间盘退变的遗传基础和分子通路 多组学整合分析 椎间盘退变 孟德尔随机化、QTL分析、单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq NA 基因组关联研究汇总统计数据、基因表达数据 大规模GWAS汇总统计数据(具体数量未说明) NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
828 2026-01-24
CRLS1 influences liver metastasis in colon cancer by regulating lipid metabolism pathways
2025-Oct-21, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
研究论文 本研究探讨了结肠癌肝转移与临床病理因素的关系,并揭示了CRLS1基因通过调节脂质代谢途径在肝转移中的关键作用 首次通过WGCNA和机器学习算法识别出CRLS1作为结肠癌肝转移的核心基因,并证实其通过脂质代谢途径影响肿瘤进展 研究主要基于临床数据和细胞实验,缺乏体内动物模型验证,且候选药物的临床有效性尚未验证 探索结肠癌肝转移的分子机制并寻找潜在的治疗靶点 结肠癌患者临床样本和结肠癌细胞系 机器学习 结肠癌 scRNA-seq, WGCNA, 机器学习算法 机器学习算法 基因表达数据, 临床数据 结肠癌患者临床样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
829 2026-01-24
Pan-cancer single-cell and spatial transcriptomics implicate cancer-associated fibroblasts in neutrophil immunosuppressive phenotypic transitions and immunotherapy resistance
2025-Oct-10, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过泛癌单细胞和空间转录组学分析,揭示了癌症相关成纤维细胞在促进中性粒细胞向免疫抑制表型转变及导致免疫治疗耐药中的作用 构建了涵盖21种癌症类型、462名患者的中性粒细胞单细胞图谱,识别出关键的免疫抑制亚群CXCR2+VNN2+Neu,并通过空间转录组学首次系统性地揭示了成纤维细胞活性与该亚群表型转变的关联 研究主要基于转录组数据,功能验证和机制细节有待进一步实验确认 探究中性粒细胞在肿瘤微环境中的异质性、表型转变机制及其对免疫治疗反应的影响 21种癌症类型的462名患者样本中的中性粒细胞 数字病理学 泛癌研究 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 深度学习模型 (Deepsurv) 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 462名患者 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
830 2026-01-24
Next-generation translational genomics for developing future crops
2025-Sep-24, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
综述 本文综述了现代转化基因组学在作物育种中的全面进展,强调从传统方法向整合基因组、转录组和表型数据的下一代策略的转变 从单一基因组转向泛基因组以更好地捕获种内多样性,并从批量转录组分析转向单细胞转录组学,实现对基因调控和功能基因组学的细胞特异性洞察 NA 探索现代转化基因组学在作物育种中的应用,以加速作物改良并应对农业挑战 作物育种和未来作物开发 机器学习 NA 基因组学、转录组学、表型组学、单细胞转录组学 灵活模型(基于AI和机器学习) 基因组、转录组、表型数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
831 2026-01-24
Human brain cell types shape host-rabies virus transcriptional interactions revealing a preexisting pro-viral astrocyte subpopulation
2025-Sep-23, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析人脑细胞共培养中狂犬病毒与宿主细胞的转录相互作用,揭示了病毒基因表达受宿主细胞类型影响,并发现了一个预先存在的促病毒星形胶质细胞亚群 首次在单细胞水平上揭示了狂犬病毒如何通过抑制先天免疫来塑造人脑不同细胞类型的转录调控,并意外发现了一个独立于感染的促病毒星形胶质细胞亚群 研究基于体外共培养模型,可能无法完全模拟体内复杂的大脑环境;样本规模有限,促病毒星形胶质细胞亚群在人类大脑中的稀有性需要进一步验证 探究病毒-宿主细胞相互作用和先天免疫拮抗如何影响神经嗜性病毒在不同脑细胞类型中的感染动态 人脑细胞共培养体系中的狂犬病毒及其突变体 单细胞转录组学 狂犬病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
832 2026-01-24
Integrative analysis identifies FERMT3 as a key regulator of metabolic reprogramming in keloid scarring and metabolic syndrome
2025-Sep-10, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过整合分析瘢痕疙瘩和代谢综合征的公共微阵列数据集,识别出共享的转录组特征,并发现FERMT3作为调控代谢重编程和炎症表型的关键潜在调节因子 首次通过整合分析识别瘢痕疙瘩和代谢综合征之间的共享转录组特征,并利用单细胞RNA测序数据将关键基因FERMT3定位到特定细胞类型,通过体外实验验证其在代谢和炎症表型中的调控作用 研究主要基于公共数据集和体外实验,缺乏体内或临床验证,且样本来源和数量可能限制结果的普适性 识别瘢痕疙瘩和代谢综合征之间的共享致病机制和潜在治疗靶点 瘢痕疙瘩和代谢综合征患者的组织样本,以及巨噬细胞和成纤维细胞体外模型 生物信息学 瘢痕疙瘩和代谢综合征 微阵列分析、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、LASSO回归、机器学习、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、体外细胞实验 LASSO回归、机器学习模型 微阵列数据、单细胞RNA测序数据 来自公共数据集的瘢痕疙瘩、代谢综合征及健康对照组织样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
833 2026-01-24
Single-cell atlas of human liver and blood immune cells across fatty liver disease stages reveals distinct signatures linked to liver dysfunction and fibrogenesis
2025-Sep, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序图谱,揭示了人类脂肪肝疾病不同阶段中肝脏和血液免疫细胞的独特特征,并关联到肝功能障碍和纤维生成 提供了首个涵盖全谱MASLD/MASH阶段的配对外周血和肝脏细针穿刺样本的单细胞RNA测序图谱,识别了与疾病进展相关的阶段特异性免疫细胞特征 研究基于人类样本,但样本获取可能受限,且未详细讨论治疗干预的直接影响 探究MASLD/MASH中免疫细胞的阶段特异性作用,以识别新的治疗靶点 人类肝脏和血液免疫细胞,覆盖MASLD/MASH全谱阶段 数字病理学 脂肪肝疾病 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 全谱MASLD/MASH人类队列的配对外周血和肝脏细针穿刺样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
834 2026-01-24
Correction to: Integration of scRNA-seq and bulk tissue RNA-seq data to identify cancer-associated fibroblast-related gene RGMA as a potential treatment target for esophageal cancer
2025-Aug-12, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
835 2026-01-24
Integration of scRNA-seq and bulk tissue RNA-seq data to identify cancer-associated fibroblast-related gene RGMA as a potential treatment target for esophageal cancer
2025-Jul-11, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量组织RNA测序数据,识别出癌症相关成纤维细胞相关基因RGMA,并探讨其作为食管癌潜在治疗靶点的作用 首次结合scRNA-seq和WGCNA分析识别CAF相关基因RGMA,并验证其在食管癌中的抑癌功能及调控机制 研究主要基于公共数据集和细胞系实验,缺乏大规模临床样本验证,且体内实验模型有限 识别食管癌中癌症相关成纤维细胞的关键基因,探索其作为治疗靶点的潜力 食管癌组织、细胞系(ECA109)、癌症相关成纤维细胞(CAFs)和正常成纤维细胞(NFs) 生物信息学 食管癌 scRNA-seq, 批量RNA-seq, WGCNA, RT-qPCR, western blot, 体外和体内实验 NA 基因表达数据 TCGA-ESCA队列数据集和GSE196756 scRNA-seq数据集 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
836 2026-01-24
Palmitoylation Dynamics in Systemic Lupus Erythematosus: Multi-Omics Insights and Potential Therapeutic Implications
2025-Jul, International journal of rheumatic diseases IF:2.4Q2
研究论文 本研究通过多组学分析揭示了棕榈酰化在系统性红斑狼疮中的动态作用及其潜在治疗靶点 结合多组学数据、单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法,首次系统性鉴定了与SLE相关的棕榈酰化相关基因及因果代谢物 研究结果基于公共数据集GSE61635,需要进一步实验验证;样本来源和临床异质性可能影响结论的普适性 探究棕榈酰化在系统性红斑狼疮发病机制中的作用并识别潜在生物标志物和治疗靶点 系统性红斑狼疮患者与健康对照的基因表达数据及免疫细胞 生物信息学 系统性红斑狼疮 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 机器学习模型, 孟德尔随机化 机器学习模型 基因表达数据 基于公共数据集GSE61635,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
837 2026-01-24
Noncanonical Differentiation of Memory B Cells Drives Latent Tuberculosis Infection Reactivation Upon Tumor Necrosis Factor-Alpha Inhibitor Therapy: An Integrative Transcriptomic Study
2025-Jul, International journal of rheumatic diseases IF:2.4Q2
研究论文 本研究通过整合转录组学分析,揭示了记忆B细胞在结核病进展和肿瘤坏死因子抑制剂治疗中的非经典分化轨迹及其代谢重编程作用 首次识别ROR1+记忆B细胞在结核病进展中的非经典分化轨迹,并发现其代谢重编程可能破坏免疫平衡,导致潜伏结核感染再激活 研究基于六个转录组数据集,样本量有限,且为回顾性分析,需进一步实验验证 探究肿瘤坏死因子抑制剂治疗中潜伏结核感染再激活的致病机制 记忆B细胞在结核病进展和肿瘤坏死因子抑制剂治疗中的转录变化 生物信息学 结核病 转录组分析、单细胞RNA测序 NA 转录组数据 六个转录组数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
838 2026-01-24
WISP2/CCN5 revealed as a potential diagnostic biomarker for endometriosis based on machine learning and single-cell transcriptomic analysis
2025-Jun-19, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过机器学习算法和单细胞转录组分析,揭示了WISP2/CCN5作为子宫内膜异位症潜在诊断生物标志物的可能性 首次结合机器学习与单细胞转录组学技术,识别并验证了WISP2/CCN5在子宫内膜异位症诊断中的潜在生物标志物作用,并探索了其表达调控机制 未明确说明样本的具体数量或来源,且研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证的详细描述 开发子宫内膜异位症的非侵入性诊断生物标志物,以缩短诊断延迟并实现早期筛查 子宫内膜组织(包括正常、在位和异位子宫内膜) 机器学习 子宫内膜异位症 单细胞转录组测序 机器学习算法(具体未指定,但使用了三种算法) 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
839 2026-01-24
Integrated muti-omics data and machine learning reveal CD151 as a key biomarker inducing chemoresistance in metabolic syndrome-related early-onset left-sided colorectal cancer
2025-Jun-09, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过整合多组学数据和机器学习方法,揭示了CD151是代谢综合征相关的早发性左侧结直肠癌中诱导化疗耐药的关键生物标志物 首次将代谢综合征与早发性左侧结直肠癌联系起来,并利用机器学习算法从多组学数据中识别出CD151作为关键生物标志物,揭示了其在基质重塑和化疗耐药中的作用 研究主要基于院内队列和生物信息学分析,虽然进行了体外实验验证,但缺乏大规模前瞻性临床队列的验证 识别和表征与代谢综合征相关的早发性左侧结直肠癌进展和治疗反应相关的关键生物标志物 早发性左侧结直肠癌患者,特别是与代谢综合征相关的亚型 机器学习 结直肠癌 单细胞RNA测序,定量实时PCR,Western blotting,免疫组织化学染色,分子对接 随机森林,支持向量机-递归特征消除 多组学数据,基因表达数据,单细胞RNA测序数据 院内队列的早发性结直肠癌患者(具体数量未在摘要中明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
840 2026-01-24
Analyzing the potential targets and mechanism of per- and polyfluoroalkyl substances (PFAS) on breast cancer by integrating network toxicology, single-cell sequencing, spatial transcriptomics, and molecular simulation
2025-Jun-04, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过整合网络毒理学、单细胞测序、空间转录组学和分子模拟,分析了PFAS对乳腺癌的潜在靶点和作用机制 首次将网络毒理学、单细胞测序、空间转录组学和分子模拟相结合,系统揭示PFAS在乳腺癌发展中的分子机制,并识别了六个核心基因 研究主要基于计算和模拟方法,缺乏体内或体外实验验证,且PFAS的具体暴露剂量和长期效应未详细探讨 探究PFAS如何促进乳腺癌发展的分子机制,以评估环境污染物在癌症风险中的作用 PFAS(特别是PFOA和PFOS)及其对乳腺癌的影响 计算生物学 乳腺癌 网络毒理学、单细胞测序、空间转录组学、分子模拟 蛋白质-蛋白质相互作用网络、分子模拟模型 基因表达数据、空间转录组数据、分子结构数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
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