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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8321 | 2025-10-07 |
Herpesviruses mimic zygotic genome activation to promote viral replication
2025-Jan-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-55928-5
PMID:39814710
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研究论文 | 研究发现DNA病毒通过激活胚胎发育关键因子DUX4来模拟合子基因组激活过程,促进病毒转录和复制 | 首次揭示疱疹病毒等DNA病毒通过诱导DUX4表达来模拟胚胎发育中的合子基因组激活机制 | NA | 探究DNA病毒如何利用宿主细胞发育机制促进自身复制 | 疱疹病毒、乳头瘤病毒、Merkel细胞多瘤病毒 | 分子生物学 | 病毒感染 | 单细胞测序, CRISPR/Cas9基因编辑, 纳米抗体技术 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8322 | 2025-10-07 |
Inhibition of Interleukin-40 prevents multi-organ damage during sepsis by blocking NETosis
2025-Jan-16, Critical care (London, England)
DOI:10.1186/s13054-025-05257-2
PMID:39819454
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研究论文 | 本研究揭示了白细胞介素40(IL-40)通过促进中性粒细胞胞外诱捕网(NETs)形成加剧脓毒症多器官损伤的新机制 | 首次发现IL-40在脓毒症中的关键作用,证实其通过调控NETosis过程影响疾病进展 | 研究主要基于动物模型,临床转化需要进一步验证 | 探索IL-40在脓毒症发病机制中的作用及治疗潜力 | 脓毒症患者队列和基因敲除小鼠模型 | 免疫学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | 基因表达数据, 临床指标 | 两个独立脓毒症患者队列和实验小鼠 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 8323 | 2025-10-07 |
Enhancing single-cell transcriptomics using interposed anchor oligonucleotide sequences
2025-Jan-16, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07474-5
PMID:39819888
|
研究论文 | 通过改进寡核苷酸捕获设计,在条形码和UMI之间插入锚定序列,显著提升单细胞转录组测序数据质量 | 在条形码和UMI之间插入锚定序列的创新设计,有效减少因寡核苷酸合成错误导致的数据丢弃 | NA | 解决单细胞转录组测序中寡核苷酸合成错误对数据质量的影响 | 单细胞转录组测序数据 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 液滴式单细胞测序 |
| 8324 | 2025-10-07 |
The Human Microglia Atlas (HuMicA) unravels changes in disease-associated microglia subsets across neurodegenerative conditions
2025-Jan-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56124-1
PMID:39820004
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研究论文 | 构建了人类小胶质细胞图谱(HuMicA),揭示了神经退行性疾病中小胶质细胞亚群的变化 | 首次在人类组织中识别出四种疾病相关小胶质细胞亚型和疾病炎症巨噬细胞,这些细胞类型最近在小鼠中被描述 | 研究样本来源多样,可能存在批次效应;部分发现需要在更多疾病模型中验证 | 研究神经退行性疾病中小胶质细胞的变化及其在疾病发展中的作用 | 人类大脑免疫细胞,特别是小胶质细胞 | 单细胞基因组学 | 神经退行性疾病 | 单核RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据 | 241个样本,包含90,716个核/细胞,来自阿尔茨海默病、自闭症谱系障碍、癫痫、多发性硬化、路易体病、COVID-19患者和健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 8325 | 2025-10-07 |
The High-Affinity IL-2 Receptor Affects White Matter Damage after Cerebral Ischemia by Regulating CD8 + T Lymphocyte Differentiation
2025-Jan-16, Journal of neuroimmune pharmacology : the official journal of the Society on NeuroImmune Pharmacology
IF:5.2Q1
DOI:10.1007/s11481-025-10169-7
PMID:39821696
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研究论文 | 本研究探讨高亲和力IL-2受体通过调节CD8+T淋巴细胞分化影响脑缺血后白质损伤的机制 | 首次揭示高亲和力IL-2R在CD8+T细胞中的特异性表达及其通过干扰素-α反应通路等机制促进脑缺血后白质损伤 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 阐明高亲和力IL-2受体在脑缺血后免疫调节和白质损伤中的作用机制 | CD8+T淋巴细胞、脑缺血小鼠模型、内皮细胞 | 免疫学、神经科学 | 脑缺血、缺血性卒中 | 单细胞RNA测序、RNA-seq、qPCR、免疫荧光、多重检测、扩散张量成像、电生理学 | NA | 基因表达数据、影像数据、行为数据 | IL-2Rα基因敲除小鼠和对照小鼠 | NA | 单细胞RNA测序、RNA测序 | NA | NA |
| 8326 | 2025-10-07 |
Inhibition of aortic CX3CR1+ macrophages mitigates thoracic aortic aneurysm progression in Marfan syndrome in mice
2025-Jan-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI178198
PMID:39817456
|
研究论文 | 本研究通过靶向CX3CR1+巨噬细胞及其分泌因子,揭示了其在马凡综合征胸主动脉瘤形成中的关键作用 | 首次发现主动脉内膜CX3CR1+巨噬细胞通过旁分泌TNF-α和IGF1驱动血管平滑肌细胞炎症,是胸主动脉瘤形成的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床转化需进一步验证 | 探究免疫细胞介导的炎症在马凡综合征胸主动脉瘤发病机制中的作用 | Fbn1C1041G/+基因修饰小鼠和马凡综合征患者样本 | 单细胞生物学 | 胸主动脉瘤 | 单细胞RNA测序,骨髓移植,联体共生,shRNA慢病毒转导 | NA | 单细胞转录组数据,病理学数据 | 基因修饰小鼠模型和人类患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8327 | 2025-10-07 |
Aligned membranes regulate wound healing via MMP12 secreted by macrophages
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0317194
PMID:39813228
|
研究论文 | 本研究揭示了排列电纺膜通过调控巨噬细胞分泌MMP12促进伤口愈合的机制 | 首次发现排列电纺膜通过上调MMP12表达抑制成纤维细胞迁移,从而促进无疤痕伤口愈合 | 未明确排列电纺膜调控MMP12表达的具体分子通路 | 阐明排列电纺纤维膜加速伤口愈合的分子机制 | 皮肤伤口愈合过程及相关细胞类型 | 组织工程 | 皮肤创伤 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8328 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis Reveals Exercise-Induced Transcriptional Dynamics in Half-Marathon Runners
2025-Jan, Scandinavian journal of medicine & science in sports
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/sms.70018
PMID:39817606
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析半马拉松业余跑者耐力运动后外周血单个核细胞的转录动态变化 | 首次在单细胞水平揭示耐力运动诱导的免疫细胞转录组变化,并采用伪批量分析方法与传统单细胞分析形成互补 | 样本量较小(仅4名参与者),研究结果需要更大规模研究验证 | 探究耐力运动对免疫细胞转录动态的影响及其潜在机制 | 半马拉松业余跑者的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 4名参与者在跑半马拉松前后的血液样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8329 | 2025-10-07 |
Integration of unpaired single cell omics data by deep transfer graph convolutional network
2025-Jan, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012625
PMID:39821189
|
研究论文 | 提出基于图卷积网络的深度迁移模型scTGCN,用于整合未配对的单细胞组学数据 | 开发了能够保持生物变异性的深度迁移图卷积网络,可在低内存消耗下快速整合数十万个细胞 | 未在摘要中明确说明 | 提高单细胞组学数据中从scRNA-seq到scATAC-seq的标签迁移性能 | 单细胞RNA测序数据和单细胞染色质可及性数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞染色质可及性测序 | 图卷积网络(GCN) | 单细胞组学数据 | 数十万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 多模态组学 | NA | APSA-seq, CITE-seq |
| 8330 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome analysis reveals cellular reprogramming and changes of immune cell subsets following tetramethylpyrazine treatment in LPS-induced acute lung injury
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.18772
PMID:39822976
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示川芎嗪在LPS诱导的急性肺损伤中对细胞重编程和免疫细胞亚群的影响 | 首次在单细胞分辨率下系统揭示川芎嗪通过调节免疫细胞亚群和转录因子FOSL1/JunB发挥肺保护作用的新机制 | 研究仅基于小鼠模型,未进行临床验证;细胞亚群功能验证不够充分 | 探究川芎嗪对急性肺损伤肺组织微环境的保护作用及分子机制 | LPS诱导的急性肺损伤小鼠模型 | 单细胞组学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析,免疫组织化学,酶联免疫吸附试验 | NA | 单细胞转录组数据 | LPS诱导的急性肺损伤小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8331 | 2025-10-07 |
Cellular Senescence Genes as Cutting-Edge Signatures for Abdominal Aortic Aneurysm Diagnosis: Potential for Innovative Therapeutic Interventions
2025-Jan, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70323
PMID:39823264
|
研究论文 | 本研究通过识别细胞衰老相关基因并验证其在腹主动脉瘤诊断中的潜力,揭示了细胞衰老在AAA进展中的关键作用 | 首次系统识别并验证ETS1和ITPR3作为腹主动脉瘤诊断生物标志物,结合机器学习算法和单细胞RNA测序技术 | 样本量相对有限,需要更大规模临床验证 | 识别与腹主动脉瘤发展相关的细胞衰老基因并评估其作为治疗靶点的潜力 | 腹主动脉瘤患者样本和小鼠模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, WB, IF, RT-qPCR, 机器学习算法 | LASSO, SVM-RFE, 随机森林 | 基因表达数据, 血清样本, 组织样本 | GSE57691训练集和两个独立验证数据集,人类血清样本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 8332 | 2025-10-07 |
BuDDI: Bulk Deconvolution with Domain Invariance to predict cell-type-specific perturbations from bulk
2025-Jan, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012742
PMID:39823522
|
研究论文 | 提出一种名为BuDDI的批量数据反卷积方法,通过域适应技术整合批量数据和单细胞RNA测序数据,预测细胞类型特异性扰动效应 | 利用域适应技术学习独立的潜在空间,能够在不使用单细胞扰动数据的情况下预测细胞类型特异性扰动响应 | NA | 开发能够从批量数据预测细胞类型特异性扰动效应的方法 | 批量RNA测序数据和单细胞RNA测序参考数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | 变分自编码器(VAE) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 8333 | 2025-10-07 |
Macrophage Infiltration and ITGB2 Expression in ESCC: A Novel Correlation
2025-Jan, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70604
PMID:39825491
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据发现并验证了食管鳞癌中巨噬细胞浸润与ITGB2表达的正相关性 | 首次发现ITGB2在浸润巨噬细胞中的表达随其向促肿瘤表型极化而增加,并提出了ITGB2敲除M1巨噬细胞回输的新型免疫治疗策略 | NA | 探索食管鳞癌中与肿瘤免疫相关的关键分子和治疗策略 | 食管鳞癌组织样本和免疫细胞 | 生物信息学 | 食管鳞癌 | 高通量测序、基因芯片、单细胞测序、生物信息学分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8334 | 2025-10-07 |
Unveiling the mechanism of micro-and-nano plastic phytotoxicity on terrestrial plants: A comprehensive review of omics approaches
2025-Jan, Environment international
IF:10.3Q1
DOI:10.1016/j.envint.2025.109257
PMID:39818003
|
综述 | 本文综述了组学方法在揭示微纳塑料对陆生植物毒性机制方面的应用 | 系统整合了多种前沿组学技术(包括4D组学、表型组学、空间转录组学和单细胞组学)在微纳塑料植物毒性研究中的应用 | NA | 阐明微纳塑料对陆生植物的毒性机制 | 陆生植物 | 环境毒理学 | NA | 蛋白质组学、代谢组学、转录组学、微生物组学、4D组学、表型组学、空间转录组学、单细胞组学 | NA | 组学数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞组学 | NA | NA |
| 8335 | 2025-10-07 |
Taurine ameliorates liver fibrosis by repressing Fpr2-regulated macrophage M1 polarization
2025-Jun-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2025.177614
PMID:40216178
|
研究论文 | 本研究揭示牛磺酸通过抑制Fpr2/NF-κBp65通路调控巨噬细胞M1极化来改善肝纤维化的作用机制 | 首次阐明牛磺酸通过Fpr2/NF-κBp65信号轴调控巨噬细胞极化状态在肝纤维化中的保护作用 | NA | 探究牛磺酸对肝纤维化的保护作用及其分子机制 | 人类肝纤维化组织样本和两种不同的小鼠肝纤维化模型 | NA | 肝纤维化 | 氨基酸代谢组学, 基因表达微阵列分析, 单细胞RNA测序 | NA | 代谢组数据, 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8336 | 2025-10-07 |
Integrating Bulk RNA and Single-Cell Sequencing Data Unveils Efferocytosis Patterns and ceRNA Network in Ischemic Stroke
2025-Jun, Translational stroke research
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s12975-024-01255-8
PMID:38678526
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研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA和单细胞测序数据,揭示了缺血性脑卒中中的胞葬作用模式和ceRNA网络 | 首次整合bulk RNA和单细胞测序数据系统分析缺血性脑卒中中的胞葬作用,并构建了相关的ceRNA调控网络 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限 | 探索缺血性脑卒中后炎症反应和胞葬作用的细胞分子机制及其对脑损伤和恢复的影响 | 缺血性脑卒中患者和小鼠模型 | 生物信息学 | 缺血性脑卒中 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 生物信息学分析 | LASSO回归分析 | 基因表达数据 | 多个GEO数据集(GSE137482, GSE30655, GSE174574等),包括小鼠和人类样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8337 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomics Revealed White Matter Repair Following Subarachnoid Hemorrhage
2025-Jun, Translational stroke research
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s12975-024-01265-6
PMID:38861152
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了蛛网膜下腔出血后白质修复的细胞机制 | 首次在SAH模型中识别出修复性小胶质细胞在白质富集区域的浸润和克隆扩增,并发现小胶质细胞相关多效蛋白通过mTOR信号通路调节少突胶质前体细胞 | 研究仅使用小鼠模型,结果向人类临床应用的转化需要进一步验证 | 阐明蛛网膜下腔出血急性期和亚急性期脑细胞亚群在白质修复中的作用机制 | 蛛网膜下腔出血模型小鼠 | 单细胞组学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序, 基因集富集分析, 磁共振成像, 免疫荧光双染色, Western blot | NA | 单细胞转录组数据, 影像数据, 蛋白质数据 | SAH模型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8338 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing reveals a regulatory role of WT1 in mast cell proliferation in endometrial polyps
2025-May-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202500116R
PMID:40304994
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研究论文 | 通过单细胞测序技术研究子宫内膜息肉中肥大细胞的调控机制 | 首次在单细胞分辨率下揭示WT1转录因子调控子宫内膜息肉中肥大细胞增殖的新机制 | 样本量有限,需要进一步验证WT1调控机制的功能性实验 | 探索子宫内膜息肉的细胞异质性和分子机制 | 子宫内膜息肉组织和邻近正常子宫内膜组织 | 单细胞生物学 | 子宫内膜息肉 | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | 转录调控网络分析 | 基因表达数据 | 子宫内膜息肉和邻近正常子宫内膜组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 8339 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics in a child with coenzyme Q10 nephropathy: potential of single-cell RNA sequencing in pediatric kidney disease
2025-May, Pediatric nephrology (Berlin, Germany)
DOI:10.1007/s00467-024-06611-2
PMID:39805995
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了一名辅酶Q10肾病患儿的肾脏活检样本,揭示了该疾病中细胞类型比例和基因表达的变化 | 首次在辅酶Q10肾病中应用单细胞RNA测序技术,揭示了跨细胞类型的线粒体基因表达普遍下调 | 仅基于单个病例的研究,样本量有限 | 阐明辅酶Q10肾病在单细胞水平的基因表达变化 | 5岁辅酶Q10肾病患儿的肾脏活检组织 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例患儿肾脏活检样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8340 | 2025-10-07 |
T-type calcium channels regulate medulloblastoma and can be targeted for therapy
2025-May, Journal of neuro-oncology
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s11060-025-04967-5
PMID:39961940
|
研究论文 | 本研究探讨T型钙通道在髓母细胞瘤中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 首次对髓母细胞瘤中T型钙通道进行全面的多组学表征,为米贝地尔药物重新用于治疗提供临床前数据 | 研究主要基于临床前模型,需要进一步临床试验验证 | 研究T型钙通道在髓母细胞瘤中的作用机制及治疗靶向性 | 髓母细胞瘤肿瘤细胞和异种移植模型 | 癌症研究 | 髓母细胞瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 反向蛋白质阵列(RPPA), 高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA) | NA | 基因表达数据, 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | 超过30%的髓母细胞瘤肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |