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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8301 | 2025-05-17 |
Inhibition of CTSC contributes to psoriasis inflammation and keratinocyte hyperproliferation by NF-κB signaling pathway
2025-Jun-05, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114808
PMID:40339488
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研究论文 | 本研究探讨了CTSC在银屑病中的作用及其机制,发现抑制CTSC可通过NF-κB信号通路促进炎症和角质形成细胞过度增殖 | 首次揭示CTSC抑制通过NF-κB通路促进银屑病炎症和角质形成细胞过度增殖的机制 | 研究主要基于体外细胞和小鼠模型,临床样本验证有限 | 探究CTSC在银屑病中的作用及分子机制 | 银屑病患者皮肤组织、IMQ诱导的银屑病样小鼠模型、HaCaT细胞 | 分子生物学 | 银屑病 | scRNA-seq、siRNA敲降 | IMQ诱导的小鼠银屑病模型 | 基因表达数据、细胞增殖数据 | 银屑病患者皮肤组织、小鼠模型和HaCaT细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 8302 | 2025-05-17 |
TGF-β1 induces autophagy and mediates the effect on macrophages differentiation in primary liver cancer
2025-Jun-05, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114799
PMID:40339499
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了原发性肝癌中肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)的异质性和分化谱,并探讨了TGF-β1通过自噬信号调控TAMs表型转换的机制 | 首次在原发性肝癌中鉴定出四种不同的TAMs亚群,并发现TGF-β1通过自噬信号驱动TAMs表型转换的新机制 | 样本量相对较小(19例患者),且需要进一步验证TGF-β1调控TAMs分化的具体分子机制 | 探究原发性肝癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其分化机制 | 原发性肝癌患者的肿瘤相关巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 原发性肝癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),Ingenuity通路分析(IPA) | NA | 单细胞转录组数据 | 19例原发性肝癌患者的单细胞数据,TCGA数据库中428例患者的生存数据 | NA | NA | NA | NA |
| 8303 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis identifies subclusters and signature with N-glycosylation in endometrial cancer
2025-Jun, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-024-03802-z
PMID:39589706
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析鉴定子宫内膜癌中N-糖基化相关的亚群和特征 | 首次在子宫内膜癌中通过单细胞RNA测序结合非负矩阵分解识别N-糖基化相关细胞亚型,并整合多种机器学习算法构建预后特征 | 样本量较小(仅5例患者),数据来源于公共数据库缺乏实验验证 | 阐明N-糖基化相关基因在子宫内膜癌细胞异质性、预后和免疫治疗反应中的作用 | 子宫内膜癌患者细胞 | 单细胞转录组学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序,非负矩阵分解,机器学习算法 | 非负矩阵分解,集成机器学习框架 | 单细胞RNA测序数据 | 5例子宫内膜癌患者,30,233个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8304 | 2025-10-06 |
EXPLORING THE POTENTIAL OF BEND7 AS AN IMMUNOMODULATORY BIOMARKER IN SEPSIS THROUGH INTEGRATIVE GENOMIC AND TRANSCRIPTOMIC ANALYSIS
2025-Jun-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002529
PMID:39617402
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研究论文 | 通过整合基因组和转录组分析探索BEND7作为脓毒症免疫调节生物标志物的潜力 | 首次通过整合GWAS和eQTL数据识别脓毒症相关基因,并利用单细胞RNA测序揭示BEND7在血小板中的特异性表达及其与免疫细胞的相互作用机制 | 需要进一步实验验证BEND7的功能机制,样本来源和数量可能限制结果的普适性 | 探索脓毒症的遗传基础并识别潜在的免疫调节生物标志物 | 脓毒症相关基因和血小板 | 生物信息学 | 脓毒症 | 基于汇总数据的孟德尔随机化,全基因组关联研究,表达数量性状位点分析,单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据,转录组数据 | 来自Gene Expression Omnibus的转录组数据集和独立验证数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8305 | 2025-10-06 |
Diverse RNA methylation patterns in neutrophils: key drivers in hepatocellular carcinoma
2025-Jun, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-024-03756-2
PMID:39621240
|
研究论文 | 本研究通过分析肝细胞癌中的单细胞测序数据,揭示了中性粒细胞RNA甲基化模式与肿瘤微环境异质性的关系 | 首次发现中性粒细胞中TRPM3特异性表达可能调控RNA修饰,并建立了新型中性粒细胞RNA甲基化评分系统 | 研究基于单细胞测序数据的生物信息学分析,需要进一步实验验证 | 探索中性粒细胞RNA甲基化在肝细胞癌中的作用机制 | 肝细胞癌患者的中性粒细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序, LASSO Cox回归, 共识聚类 | 预后评分模型, nomogram | 单细胞测序数据, lncRNA数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8306 | 2025-05-17 |
Novel approaches to CAR T cell target identification in acute myeloid leukemia
2025-Jun, Current opinion in pharmacology
IF:4.0Q1
DOI:10.1016/j.coph.2025.102524
PMID:40311558
|
review | 本文综述了急性髓系白血病(AML)中CAR T细胞靶点识别的新方法 | 介绍了结构表面组学识别肿瘤特异性蛋白构象,以及AI驱动的单细胞RNA测序整合多源数据以确定最佳靶点 | NA | 提高CAR T细胞的特异性并减少对正常组织的副作用,为AML及更广泛的癌症治疗提供更安全有效的途径 | 急性髓系白血病(AML) | 肿瘤免疫治疗 | 急性髓系白血病 | 结构表面组学,AI驱动的单细胞RNA测序,细胞表面捕获技术 | NA | RNA测序数据,蛋白质构象数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8307 | 2025-05-17 |
Dissecting Autophagy Gene Expression in Endothelial Cells of Pulmonary Arterial Hypertension at Single-Cell Resolution
2025-Jun, Cardiology research
IF:1.4Q3
DOI:10.14740/cr2055
PMID:40370624
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了肺动脉高压(PAH)内皮细胞中自噬相关基因的表达特征,并鉴定了DDIT4作为潜在的生物标志物 | 首次在单细胞分辨率下解析PAH内皮细胞中自噬相关基因的表达特征,并发现DDIT4作为新的PAH生物标志物 | 研究主要基于体外模型和生物信息学分析,需要进一步的体内实验验证 | 探究肺动脉高压内皮细胞中自噬相关基因的表达特征及其在疾病进展中的作用 | 肺动脉高压患者的内皮细胞 | 单细胞转录组学 | 肺动脉高压 | scRNA-seq, 高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA), 蛋白质印迹(Western blotting) | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8308 | 2025-10-06 |
Acute kidney injury triggers hypoxemia by lung intravascular neutrophil retention that reduces capillary blood flow
2025-May-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI186705
PMID:40048367
|
研究论文 | 本研究揭示了急性肾损伤通过肺血管内中性粒细胞滞留导致低氧血症的机制 | 发现AKI诱导的远程肺部炎症中中性粒细胞在肺泡毛细血管内滞留而不外渗,通过减少肺毛细血管血流导致低氧血症 | 研究主要基于小鼠模型,临床验证需要进一步研究 | 探究急性肾损伤引发低氧血症的细胞机制 | 小鼠和人类的中性粒细胞、单核细胞和肺泡巨噬细胞 | 病理生理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8309 | 2025-05-17 |
CD49d promotes T-cell senescence in chronic lymphocytic leukaemia
2025-May-15, British journal of haematology
IF:5.1Q1
DOI:10.1111/bjh.20135
PMID:40375447
|
research paper | 该研究探讨了CD49d在慢性淋巴细胞白血病(CLL)中对T细胞衰老的影响 | 揭示了CD49d在CLL患者T细胞衰老中的新作用,并提出了针对CD49d依赖性衰老途径可能逆转T细胞功能障碍的治疗策略 | 研究未涉及CD49d如何具体调控T细胞衰老的分子机制 | 探究CD49d对CLL患者T细胞生物学的影响 | CLL患者和健康捐赠者的CD4+和CD8+ T细胞 | 免疫学 | 慢性淋巴细胞白血病 | 流式细胞术和单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞数据和基因表达数据 | 未明确提及样本数量,但包括CLL患者和健康捐赠者的T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 8310 | 2025-05-17 |
Potential mechanisms of epigenetic regulation in diabetic retinopathy from the perspectives of multi-omics
2025-May-14, Diabetology & metabolic syndrome
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s13098-025-01723-7
PMID:40369608
|
research paper | 本研究通过多组学数据探索了糖尿病视网膜病变(DR)的表观遗传调控机制 | 构建了DR相关的全面表观遗传调控网络,并鉴定了关键调控基因 | 研究依赖于公共数据库数据,未进行实验验证 | 探索糖尿病视网膜病变的表观遗传调控机制 | 糖尿病视网膜病变(DR)相关的表观遗传修饰 | 生物信息学 | 糖尿病视网膜病变 | DNA甲基化分析、mRNA和miRNA表达分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因组学数据、转录组学数据 | 包括10,716个差异甲基化基因、1,181个差异表达mRNA和615个差异表达miRNA | NA | NA | NA | NA |
| 8311 | 2025-05-17 |
Microglia transcriptional states and their functional significance: Context drives diversity
2025-May-13, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.04.009
PMID:40328255
|
综述 | 探讨小胶质细胞在不同环境下的转录状态多样性及其功能意义 | 综述了单细胞测序技术揭示的小胶质细胞转录状态多样性,并评估非稳态条件如何诱导特定环境下的转录特征 | 未提及具体实验数据或样本量,主要基于现有研究的总结 | 理解小胶质细胞转录状态与功能的关系,并推动针对小胶质细胞的治疗策略 | 小胶质细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8312 | 2025-05-17 |
Combining spatial transcriptomics with tissue morphology
2025-May-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58989-8
PMID:40360467
|
review | 本文介绍了一种将空间转录组学与组织形态学相结合的框架,重点讨论了将形态学特征转化为或整合到空间转录组学中的方法 | 提出了一个分类框架,用于结合空间转录组学和组织形态学,包括转化和整合两种方法 | NA | 探索空间转录组学与组织形态学相结合的方法及其应用 | 空间转录组学数据和组织形态学特征 | digital pathology | NA | spatial transcriptomics, imaging AI | NA | gene expression data, morphological features | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8313 | 2025-05-17 |
TAT-CRE inhalation enables tumor induction corresponding to adenoviral Cre-recombinase in a lung cancer mouse model
2025-May-13, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08146-0
PMID:40360735
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research paper | 该研究比较了TAT-CRE和腺病毒Cre重组酶在诱导小鼠肺癌模型中的效果,发现TAT-CRE是一种安全且有效的替代方法 | 提出TAT-CRE作为一种生物安全级别S1的替代方法,用于诱导肺癌,并可能应用于其他癌症模型 | 研究中发现的TAT-CRE诱导的肺肿瘤在微血管和巨噬细胞方面存在差异,可能影响某些研究结果 | 比较TAT-CRE和腺病毒Cre重组酶在诱导肺癌模型中的效果,寻找更安全的基因工程方法 | 小鼠肺癌模型 | 癌症研究 | 肺癌 | 计算机断层扫描、单细胞RNA测序、免疫组织化学和流式细胞术 | NA | 图像、RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8314 | 2025-05-17 |
Arginine methylation modulates tumor fate and prognosis in clear cell renal cell carcinoma
2025-May-13, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02505-3
PMID:40360844
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research paper | 该研究探讨了精氨酸甲基化相关基因在透明细胞肾细胞癌(ccRCC)中的预后价值,并开发了一个基于精氨酸甲基化的预后模型 | 首次系统地评估了精氨酸甲基化相关基因在ccRCC中的预后意义,并构建了一个具有临床指导价值的预后特征模型 | 需要进一步的临床验证来确认模型的预测准确性,并且未涉及实验验证 | 评估精氨酸甲基化相关基因在ccRCC中的预后价值并开发预后模型 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者 | digital pathology | 肾癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | Cox回归模型 | 转录组数据 | 来自TCGA、E-MTAB-1980和ICGC数据库的公共数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 8315 | 2025-05-17 |
Profiling triple-negative breast cancer-specific super-enhancers identifies high-risk mesenchymal development subtype and BETi-Targetable vulnerabilities
2025-May-13, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02342-6
PMID:40361105
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研究论文 | 该研究通过分析三阴性乳腺癌(TNBC)中的超级增强子(SEs)异质性,识别出一个高风险间充质发育亚型,并发现其对BET抑制剂(BETi)具有更高的敏感性 | 发现了由SE-VAX2核心转录调控回路驱动的高风险间充质发育亚型,并验证了其对BETi的敏感性 | 临床样本和实验模型的多样性可能影响结果的广泛适用性 | 研究TNBC中SEs的异质性及其对BETi疗效的影响,以推进BETi的精准治疗策略 | 三阴性乳腺癌(TNBC)细胞系和临床样本 | 肿瘤生物学 | 三阴性乳腺癌 | H3K27ac ChIP-Seq, bulk RNA-Seq, scRNA-Seq, stRNA-Seq, CERES评分 | NA | 测序数据 | TNBC细胞系和临床样本 | NA | NA | NA | NA |
| 8316 | 2025-05-17 |
The immunological age prediction of monocytes indicates that gestational diabetes mellitus accelerates the aging of monocytes in offspring
2025-May-13, Immunity & ageing : I & A
IF:5.2Q1
DOI:10.1186/s12979-025-00513-z
PMID:40361109
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research paper | 该研究通过单细胞测序技术探索了妊娠期糖尿病(GDM)对子代单核细胞衰老的影响 | 首次在单细胞水平上揭示了GDM加速子代单核细胞衰老的转录组特征,并建立了预测单核细胞免疫年龄的随机森林模型 | 样本量相对有限,且部分数据来自公开数据库 | 探究GDM对子代免疫细胞衰老的影响 | 56名健康个体(0-100岁)的单核细胞,包括GDM母亲子代的单核细胞 | 生物医学 | 妊娠期糖尿病 | 单细胞测序,随机森林模型 | 随机森林 | 单细胞转录组数据 | 56个样本(6个自测样本+50个GEO公开数据) | NA | NA | NA | NA |
| 8317 | 2025-05-17 |
Transcriptomic Plasticity of Human Alveolar Macrophages Revealed by Single-Cell RNA Sequencing Following Drug Exposure: Implications for Therapeutic Development
2025-May-07, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26094439
PMID:40362676
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究药物暴露后人类肺泡巨噬细胞的转录组可塑性,为治疗开发提供新见解 | 揭示了肺泡巨噬细胞转录程序的可塑性,并证实药物可以重编程这些细胞的表型 | 研究仅基于体外实验,未在体内模型中验证 | 探讨肺泡巨噬细胞的转录可塑性及其在肺纤维化治疗中的潜在应用 | 人类肺泡巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 肺纤维化 | scRNA-seq, qPCR | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8318 | 2025-05-17 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Stem Cell-Derived Exosomes Attenuate Inflammatory Gene Expression in Pulmonary Oxygen Toxicity
2025-May-07, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26094462
PMID:40362698
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学技术揭示了干细胞来源的外泌体在减轻肺氧毒性炎症基因表达中的作用 | 首次报道了外泌体在肺氧毒性中的作用及机制,并整合了单细胞RNA测序和批量分析技术 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证 | 探究干细胞外泌体保护肺组织的机制及潜在分子调控网络 | 小鼠肺氧毒性模型 | 单细胞转录组学 | 肺氧毒性 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 8319 | 2025-05-17 |
A Transfer Learning Framework for Predicting and Interpreting Drug Responses via Single-Cell RNA-Seq Data
2025-May-04, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26094365
PMID:40362602
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research paper | 提出一个基于迁移学习的框架,通过单细胞RNA测序数据预测和解释药物反应 | 设计了一个共享编码器将批量和单细胞测序数据投影到统一的潜在空间进行药物反应预测,并通过先验生物知识引导的稀疏解码器增强可解释性 | 临床样本获取有限,且单细胞RNA测序药物反应数据的系统收集和利用仍有限 | 提高药物反应预测的性能和可解释性,理解药物反应的分子机制 | 单细胞RNA测序药物反应数据集 | machine learning | cancer | scRNA-seq | transfer learning | RNA sequencing data | 五个精选的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 8320 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatial transcriptomic analyses reveal transcriptional cell lineage heterogeneity in extracranial arteriovenous malformation
2025-May, Journal of dermatological science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.jdermsci.2025.02.005
PMID:40118698
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组分析揭示颅外动静脉畸形中转录细胞谱系异质性 | 首次在单细胞分辨率下整合scRNA-seq和空间转录组数据,揭示eAVMs中内皮细胞、血管周围细胞和免疫细胞的异质性状态及细胞间相互作用 | 样本量有限(9个eAVMs样本和2个对照),空间转录组分析仅在一个eAVM样本中进行 | 在单细胞水平生成eAVMs分子信息概览,解析其转录异质性 | 颅外动静脉畸形组织样本 | 数字病理学 | 血管畸形 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 | 9个eAVMs样本和2个非病变组织对照样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组技术 |