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当前共找到 10570 篇文献,本页显示第 801 - 820 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
801 2026-08-29
Macrophage KDM2A promotes atherosclerosis via regulating FYN and inducing inflammatory response
2025, International journal of biological sciences IF:8.2Q1
研究论文 本研究通过转录调控网络和机器学习识别巨噬细胞特异性转录调控因子KDM2A,揭示其通过调控靶基因FYN促进炎症反应,从而推动动脉粥样硬化发展 首次揭示KDM2A在动脉粥样硬化巨噬细胞炎症反应中的转录调控作用,并通过虚拟筛选发现潜在靶向药物 未明确提及研究局限性 探究巨噬细胞炎症反应的转录调控机制及其在动脉粥样硬化中的作用 人类动脉斑块样本、小鼠骨髓来源巨噬细胞、ApoE小鼠、外周血单核/巨噬细胞 机器学习, 生物信息学 动脉粥样硬化 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 染色质免疫沉淀测序, 免疫荧光, 孟德尔随机化 机器学习算法(未指定具体模型) 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 图像 未明确样本数量 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
802 2026-08-29
NAMPT Impairs Vascular Permeability in Periodontitis by Influencing FASN-mediated Lipogenesis
2025, International journal of biological sciences IF:8.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序发现牙周炎中NAMPT上调,通过影响FASN介导的脂质生成增加血管通透性,从而促进骨吸收 首次揭示NAMPT通过调控FASN介导的脂质生成影响内皮细胞通透性,从而参与牙周炎进展的新机制 未提及具体局限性,但可能包括研究仅在细胞和动物模型中进行,缺乏临床干预验证 探究调节内皮细胞通透性的关键分子及其在牙周炎进展中的作用 人及小鼠牙周炎组织、HUVEC内皮细胞、牙周炎小鼠模型 数字病理学 牙周炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据、组织图像、细胞实验数据 未明确具体样本量,但包含人和小鼠牙周炎组织、HUVEC细胞系、牙周炎小鼠 NA 单细胞RNA测序 NA NA
803 2026-08-29
Skeletal stem/progenitor cell-derived rather than osteoblast-derived IGF2 supports the development and homeostasis of skeletal system via STAT3
2025, International journal of biological sciences IF:8.2Q1
研究论文 本研究揭示了骨骼干细胞/祖细胞来源的IGF2而非成骨细胞来源的IGF2,通过STAT3信号通路支持骨骼系统的发育和稳态 首次从细胞水平阐明IGF2在骨骼微环境中的表达模式,并证实SSPCs来源的IGF2而非成骨细胞来源的IGF2通过STAT3信号通路调控骨骼发育和稳态,且STAT3激动剂可逆转骨骼畸形 未提供明确的局限性信息 阐明IGF2在骨骼发育和稳态中的作用机制及其细胞来源 骨骼干细胞/祖细胞、成骨细胞、骨髓间充质干细胞、小鼠骨骼系统 数字病理学 Silver-Russell综合征相关骨骼畸形 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、RNA测序(RNA-seq) 条件性基因敲除小鼠模型 基因表达数据、组织学图像 多种条件性基因敲除小鼠模型,具体数量未提及 NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
804 2026-08-29
Omics-based Approach Towards Macrophages: New Perspectives of Biology and Function in the Normal and Diseased Heart
2025, International journal of biological sciences IF:8.2Q1
综述 本文系统总结了巨噬细胞在正常和疾病心脏中的生物学功能和表型异质性,重点阐述了多组学技术(如单细胞RNA测序、空间转录组学和代谢组学)在揭示巨噬细胞异质性、细胞间相互作用及空间组织方面的最新进展。 利用多组学方法全面解析巨噬细胞在心血管疾病中的异质性和功能可塑性,为临床靶向巨噬细胞的策略提供了新的视角和参考依据。 作为综述,本文未包含原始实验数据,可能受限于现有研究的覆盖范围和文献选择偏差。 总结巨噬细胞在心血管疾病中的表型多样性和功能可塑性,并强调多组学方法提供的新见解,为临床治疗提供参考。 巨噬细胞在心脏生理和病理状态下的亚型、空间分布及功能特征。 多组学、心血管生物学 心血管疾病(心肌梗死、动脉粥样硬化、心力衰竭、心肌炎) 单细胞RNA测序、空间转录组学、代谢组学 NA 基因表达数据、空间转录数据、代谢数据 NA NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
805 2026-08-29
Integrative Single-Cell and Spatial Transcriptomics Analysis Reveals ECM-remodeling Cancer-associated Fibroblast-Derived POSTN as a Key Mediator in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Progression
2025, International journal of biological sciences IF:8.2Q1
研究论文 整合单细胞转录组和空间转录组数据,揭示细胞外基质重塑型癌症相关成纤维细胞来源的POSTN在胰腺导管腺癌进展中的关键作用 首次通过大规模单细胞和空间转录组整合分析,精确识别出细胞外基质重塑型成纤维细胞亚群,并阐明其通过POSTN-ITGAV/ITGB5配体-受体轴促进肿瘤上皮间质转化的新机制 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内动物模型的验证;临床样本量可能有限,需要更大规模的临床研究证实 解析胰腺导管腺癌中成纤维细胞的异质性及其与上皮细胞的相互作用,探索促进肿瘤进展的关键分子机制和治疗靶点 胰腺导管腺癌组织中的成纤维细胞亚群、上皮细胞及其细胞间相互作用 数字病理学 胰腺导管腺癌 单细胞转录组测序,空间转录组测序,免疫组化,药理学抑制实验 伪时间轨迹分析,转录因子分析,配体-受体相互作用分析 单细胞转录组数据,空间转录组数据,基因表达数据 大规模临床样本(具体数量未在摘要中提及) NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
806 2026-08-29
ITLN1 exacerbates Crohn's colitis by driving ZBP1-dependent PANoptosis in intestinal epithelial cells through antagonizing TRIM8-mediated CAPN2 ubiquitination
2025, International journal of biological sciences IF:8.2Q1
研究论文 本研究探讨了肠上皮细胞PANoptosis促进克罗恩病进展的机制,并确定了ITLN1-TRIM8-CAPN2轴的作用 首次发现ITLN1通过拮抗TRIM8介导的CAPN2泛素化,驱动ZBP1依赖性PANoptosis,从而加重克罗恩病结肠炎,并提出了靶向ITLN1的治疗策略 研究主要基于体外实验和小鼠模型,尚需临床验证;具体信号通路的细节未完全阐明 阐明ITLN1在克罗恩病中调控肠上皮细胞PANoptosis的分子机制,并评估其作为治疗靶点的潜力 克罗恩病患者的结肠组织、肠上皮细胞、IL-10基因敲除小鼠 免疫学 克罗恩病 单细胞RNA测序、共免疫沉淀、质谱、RNA测序、短发夹RNA敲低 体外细胞模型、小鼠模型 测序数据、蛋白质互作数据、组织病理数据 未明确样本数量,但包括克罗恩病患者和IL-10 KO小鼠 NA 单细胞RNA-seq NA NA
807 2026-08-29
Interferon Regulatory Factor 4 Recruits Immature B Cells to Signal Tertiary Lymphoid Structure Immaturity and Progression of Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2025, International journal of biological sciences IF:8.2Q1
研究论文 本研究整合转录组和临床数据,构建了与三级淋巴结构相关的预后风险评分,并揭示了干扰素调节因子4在透明细胞肾细胞癌中促进TLS不成熟和免疫功能障碍的机制 首次系统地结合转录组学、单细胞RNA测序和空间转录组学,阐明了IRF4通过招募未成熟B细胞导致TLS不成熟和肿瘤进展的新机制,并建立了基于TLS的预后风险评分模型 未明确提出局限性 探讨TLS在透明细胞肾细胞癌中的预后价值及其调控机制,特别是IRF4在TLS形成和成熟中的作用 928例透明细胞肾细胞癌患者的转录组和临床数据,以及786-O和769-P细胞系 机器学习和数字病理学 透明细胞肾细胞癌 批量RNA测序、单细胞RNA测序、空间转录组学、多重免疫荧光、免疫组化 机器学习算法 转录组数据、临床数据、图像数据 928例患者样本和2种细胞系 未提供 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 未提供 未提供
808 2026-08-28
HKDC1 promotes liver cancer stemness under hypoxia through stabilizing β-catenin
2025-06-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 本研究揭示HKDC1在缺氧条件下通过稳定β-catenin促进肝癌干性,从而推动转移,为晚期肝癌治疗提供新靶点 首次发现HKDC1与肝癌转移潜力最强相关,并通过结合糖原合成酶激酶3β稳定β-catenin,增强肝癌细胞干性 未提供具体局限性信息 比较HKDC1与其他HK在肝癌中的细胞类型特异性,并探究其促进肝癌转移的分子机制 肝癌细胞、小鼠模型及患者肿瘤样本 数字病理学 肝细胞癌、胆管癌 RNA原位杂交、单细胞RNA测序、代谢组学分析 NA 基因表达数据、代谢谱数据 来自两种肝癌小鼠模型的肿瘤和类器官,以及肝癌和胆管癌患者肿瘤样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序用于分析HKDC1在恶性细胞中的特异性表达
809 2026-08-28
LIM domain only 7: a novel driver of immune evasion through regulatory T cell differentiation and chemotaxis in pancreatic ductal adenocarcinoma
2025-02, Cell death and differentiation IF:13.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间蛋白质组学发现LMO7在胰腺导管腺癌中通过促进调节性T细胞分化与趋化,驱动免疫逃逸,并验证了靶向LMO7-Foxp1-TGF-β/CCL5轴的治疗潜力 首次揭示LMO7作为PDAC免疫逃逸的新驱动因子,通过其LIM结构域直接结合并促进Foxp1泛素化降解,上调TGF-β和CCL5,增强Treg细胞富集并抑制CD8 T细胞和自然杀伤细胞功能 未明确提及研究的局限性 探究胰腺导管腺癌的免疫微环境异质性,揭示驱动免疫逃逸的分子机制,并评估靶向治疗的潜力 胰腺导管腺癌细胞、调节性T细胞、CD8 T细胞、自然杀伤细胞、小鼠模型 数字病理学 胰腺导管腺癌 单细胞RNA测序、空间蛋白质组学 NA 单细胞转录组数据、空间蛋白质组数据、图像 未明确提及 NA 单细胞RNA测序、空间蛋白质组学 NA NA
810 2026-08-27
Divergence of immune cell types in chordate blood
2025-Dec-15, Current biology : CB IF:8.1Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序、原位杂交和活体报告基因技术,定义了脊索动物海鞘(Ciona robusta)血液细胞状态,揭示了其免疫细胞类型的分化层级和谱系多样性 首次对尾索动物亚门的代表物种进行了全面的单细胞水平血液细胞图谱绘制,发现超过75%的循环细胞包含至少五个主要谱系,并揭示了与脊椎动物免疫细胞之间的广泛分化 摘要未明确提及研究的局限性,可能涉及样本数量有限或功能验证不足等未说明的约束 通过分子特征鉴定无脊椎动物(海鞘)的免疫细胞类型,并评估其与脊椎动物免疫细胞的同源性 尾索动物亚门的海鞘(Ciona robusta)循环血液细胞 单细胞生物学 NA 单细胞RNA测序、原位杂交、活体报告基因成像 NA 单细胞转录组数据、原位杂交图像、活体成像数据 海鞘循环血液细胞(具体数量未提供) 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'(推测)
811 2026-08-27
LIMD2 is associated with an exhausted CD8⁺ T cell state linked to ICI response in clear cell renal cell carcinoma
2025-12-04, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 该研究通过整合公开的bulk和单细胞RNA测序数据及独立验证队列,发现透明细胞肾细胞癌中多数肿瘤浸润CD8+ T细胞呈耗竭表型,并鉴定出高表达LIMD2的CD8+耗竭T细胞与免疫检查点抑制剂反应相关。 首次鉴定LIMD2作为与透明细胞肾细胞癌ICB反应相关的CD8+耗竭T细胞标志物,并利用多组学数据及多重免疫荧光验证其表达和定位。 研究依赖于公开数据集和有限的验证队列,需进一步前瞻性研究确认LIMD2的预测价值及其机制。 阐明透明细胞肾细胞癌中CD8+ T细胞的功能状态,特别是耗竭相关亚群与ICB反应的关系,并评估LIMD2作为预测性生物标志物的潜力。 透明细胞肾细胞癌患者的肿瘤浸润CD8+ T细胞 数字病理学 肾细胞癌 RNA测序, 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 六个公开数据集及独立验证队列 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
812 2026-08-27
Chemosensory protein 3 is a brain host factor for the induction of enhanced-locomotory activity in the BmNPV-silkworm infection model
2025-12, PLoS pathogens IF:5.5Q1
研究论文 本研究通过单核RNA测序和分子实验,揭示了化学感觉蛋白3在BmNPV感染家蚕模型中诱导增强运动活性中的关键作用。 首次在单细胞转录组水平上鉴定了CSP3作为脑宿主因子调节病毒诱导的行为改变,并发现其具有大疏水口袋可结合神经递质和脂质。 对CSP3下游信号通路及行为调节的分子机制尚未完全阐明。 探究家蚕幼虫脑内宿主因子在BmNPV感染诱导增强运动活性中的作用机制。 家蚕幼虫脑细胞(包括Kenyon细胞、胶质细胞、嗅觉投射神经元、视叶神经元、血细胞、肌肉细胞等)。 机器学习 病毒性感染 单核RNA测序 NA 基因表达数据 家蚕幼虫脑样本(具体数量未提供) 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
813 2026-08-27
D3Impute: Dropout-aware discrimination, distribution-aware modeling, and density-guide imputation for scRNA-seq data
2025-12, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 本文介绍了D3Impute,一种用于单细胞RNA测序数据的判别性插补框架,通过分布感知归一化、双网络判别器和密度引导插补来区分非生物零值与真实生物零值,提升下游分析性能 创新点包括分布感知归一化、利用双网络判别器结合bulk RNA-seq作为生物学参考来精确识别非生物零值,以及密度引导的插补引擎保持局部细胞邻域结构 文中未明确提及局限性,但可能包括对bulk RNA-seq参考数据的依赖以及在不同数据集上的泛化性挑战 开发一种鲁棒且生物学信息丰富的插补方法,以改善scRNA-seq数据的零膨胀问题,提高下游分析准确性 六种不同的scRNA-seq数据集,涉及细胞聚类、轨迹推断和差异表达检测 机器学习 NA 单细胞RNA测序 双网络判别器和密度引导插补引擎 基因表达数据 六个不同的scRNA-seq数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
814 2026-08-27
Long-read sequencing transcriptome quantification with lr-kallisto
2025-12, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 本研究展示了利用ONT长读长测序数据进行快速准确的转录本定量,并开发了lr-kallisto工具以适配长读长技术。 提出lr-kallisto方法,将kallisto定量流程适配长读长测序,实现快速准确的转录本异构体定量,并证明外显子捕获可提升定量效果。 文章未明确提及局限性。 实现长读长测序数据中转录本异构体的常规、准确且经济的定量。 ONT数据以及对应的转录本异构体定量。 生物信息学 NA 长读长测序(ONT)、外显子捕获 kallisto(基于伪比对) RNA测序数据(长读长) 未明确说明。 Oxford Nanopore Technologies (ONT) 长读长RNA-seq ON NA
815 2026-08-27
Randomized Spatial PCA (RASP): A computationally efficient method for dimensionality reduction of high-resolution spatial transcriptomics data
2025-12, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 提出了一种名为RASP的随机空间PCA方法,用于高分辨率空间转录组数据的降维,显著提升计算效率。 RASP采用随机两阶段PCA框架和可配置的空间平滑,实现比现有方法快数个数量级的速度,支持超过10万个位置的数据集,并能整合非转录组协变量和重建去噪平滑的基因表达值。 RASP本身不是聚类或域检测方法,需要依赖kNN图和β参数进行聚类,且未提及对极端复杂组织或噪声数据的适应性限制。 开发一种高效的空间转录组数据降维方法,以快速识别组织空间域并支持大规模数据分析。 多种空间转录组数据集,包括10x Visium、Stereo-Seq、MERFISH和10x Xenium,来自人类和小鼠组织。 生物信息学 不适用 空间转录组测序 PCA 基因表达数据 多个数据集,包含超过10万个位置,具体样本数量未详细说明 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium, 10x Xenium 10x Visium和10x Xenium平台,以及Stereo-Seq和MERFISH技术
816 2026-08-27
MAGNET: Multi-view graph autoencoder with cell-gene attention for cell interaction network reconstruction from spatial transcriptomics
2025-12, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 提出了一种名为MAGNET的多视图图自编码器框架,通过细胞-基因注意力模块从空间转录组数据中重建细胞间相互作用网络 创新性地引入了细胞-基因注意力模块,将细胞的外部互作与其内部基因调控整合到统一表示中,避免了简单拼接或加法的局限 未明确提及局限性,但可能依赖基准数据集的质量和代表性 提高从空间转录组数据中推断细胞间相互作用的准确性,并揭示细胞通讯与内部分子状态的关联 空间转录组数据中的细胞及其基因表达,包括基准数据集(seqFISH、MERFISH、STARMAP)和乳腺癌数据集 机器学习 乳腺癌 空间转录组学 图自编码器 图像和转录组数据 包含seqFISH、MERFISH、STARMAP基准数据集和一个乳腺癌数据集(具体样本数量未提供) NA 空间转录组学 NA NA
817 2026-08-27
ASPEN: Robust detection of allelic dynamics in single cell RNA-seq
2025-12, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 提出ASPEN统计方法,用于检测单细胞RNA-seq数据中的等位基因动态变化 结合敏感映射流程、适度beta-binomial模型和自适应收缩,显著提高单细胞等位基因不平衡检测的灵敏度 未明确说明局限性 开发稳健的统计方法以区分单细胞等位基因不平衡和等位基因方差变化 小鼠脑类器官和T细胞 生物信息学 不适用 单细胞RNA测序 适度beta-binomial模型 基因表达数据 多项模拟和实证数据集,包括小鼠脑类器官和T细胞(具体数量未提供) 不适用 单细胞RNA-seq 不适用 不适用
818 2026-08-27
DAGFormer: A graph-based domain adaptation approach for single-cell cancer drug response prediction
2025-12, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 提出DAGFormer,一种基于图的域适应框架,整合bulk和单细胞RNA测序数据以预测单细胞药物反应 利用多样拓扑策略构建细胞邻接图,并采用图域适应桥接bulk和单细胞数据间的分布差异,同时通过双域解码器分离共享和模态特定表示 未在文中明确说明局限性 提高单细胞药物反应预测的准确性和鲁棒性 单细胞药物反应预测 机器学习 癌症 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 图神经网络、图域适应 基因表达数据 十个独立的单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
819 2026-08-27
CRISPLD2, a novel insulin-sensitizing adipokine that alters adipocyte size
2025-Nov, Obesity (Silver Spring, Md.)
研究论文 本文研究了新型脂肪因子CRISPLD2在脂肪组织中的作用,发现其通过减小脂肪细胞大小和减少纤维化来改善胰岛素敏感性 首次揭示CRISPLD2作为胰岛素增敏脂肪因子,通过调节脂肪细胞大小和纤维化来影响代谢功能 未提供明确的局限性信息 探讨脂肪组织特异性CRISPLD2过表达对组织结构和功能的影响,以及其改善胰岛素敏感性的机制 小鼠模型及3T3-L1脂肪细胞 机器学习 肥胖相关胰岛素抵抗 单细胞RNA测序、质谱分析 NA 基因表达数据、蛋白质结合数据 小鼠(具体数量未提供)及3T3-L1脂肪细胞 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序用于基质血管组分分析
820 2026-08-27
The cervicovaginal microbiome associates with spatially restricted host transcriptional signatures throughout the human ectocervical epithelium and submucosa
2025-11, PLoS pathogens IF:5.5Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学分析了不同宫颈阴道微生物组分组下的外宫颈组织转录景观,发现微生物组与黏膜屏障完整性及HIV易感性相关 首次将空间转录组学应用于宫颈阴道微生物组与宫颈组织转录景观关联研究,揭示微生物组影响不仅限于腔面,还扩展至基底膜两侧的黏膜全层 样本量较小(n=21),且未提供具体样本来源的详细临床信息 探究宫颈阴道微生物组对外宫颈上皮和黏膜下组织转录景观的影响及其与HIV易感性的关联 来自肯尼亚女性性工作者的外宫颈组织样本,按主导微生物组分为乳杆菌 crispatus/acidophilus、乳杆菌 iners、加德纳菌和高度多样组 空间转录组学 HIV易感性 空间转录组学 NA 空间转录组数据 21例外宫颈组织样本 NA 空间转录组学 NA NA
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