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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7981 | 2025-10-06 |
Temporal and spatial distribution of histone acetylation in mouse molar development
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.19215
PMID:40183048
|
研究论文 | 本研究通过绘制小鼠磨牙发育过程中组蛋白H3和H4及其乙酰化位点的分布模式,揭示组蛋白乙酰化在牙齿发育中的作用机制 | 首次系统揭示小鼠磨牙发育过程中组蛋白乙酰化的时空分布特征及其调控机制 | 研究局限于小鼠模型,尚未在人类或其他物种中验证 | 探究组蛋白乙酰化修饰与牙齿发育的关联机制 | 小鼠磨牙发育过程中的上皮细胞和间充质细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,组织切片图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7982 | 2025-10-06 |
Characterizing macrophage diversity in colorectal malignancies through single-cell genomics
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1526668
PMID:40191203
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综述 | 通过单细胞基因组学方法表征结直肠恶性肿瘤中巨噬细胞的多样性 | 从单细胞组学角度探索近年定义的独特巨噬细胞亚型,并基于其潜在功能进行分类 | 缺乏对巨噬细胞多样性命名和分子特征的统一阐述 | 评估传统巨噬细胞极化亚型在结直肠恶性肿瘤中的应用 | 结直肠癌肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞基因组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7983 | 2025-10-06 |
Successful cryopreservation of marine invertebrates immune cells enables long-term studies of common octopus, Octopus vulgaris Cuvier 1797, hemocyte immune functions
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1543587
PMID:40191212
|
研究论文 | 本研究建立了普通章鱼血细胞冷冻保存方法,实现了长期保存后细胞仍保持高活性和免疫功能 | 首次报道了海洋无脊椎动物免疫细胞成功冷冻保存的方法,并验证了冷冻保存后细胞的功能活性 | 仅针对普通章鱼血细胞进行研究,方法在其他软体动物中的适用性需要进一步验证 | 开发软体动物免疫细胞的长期保存方法,为免疫机制研究提供可靠细胞来源 | 普通章鱼(Octopus vulgaris)的血细胞(免疫细胞) | 细胞生物学 | NA | 细胞冷冻保存技术、基因表达分析、吞噬功能检测 | NA | 细胞功能数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 7984 | 2025-10-06 |
Molecular biology of the deadliest cancer - glioblastoma: what do we know?
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1530305
PMID:40191211
|
综述 | 本文整合了当前关于胶质母细胞瘤细胞及其微环境的生物学特性和分子通讯模式的知识 | 强调单细胞RNA测序技术揭示了胶质母细胞瘤的新见解,并提出个性化多免疫疗法的重要性 | NA | 总结胶质母细胞瘤的分子生物学特征并探讨潜在治疗策略 | 胶质母细胞瘤细胞及其肿瘤微环境 | 分子生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7985 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveals immunosuppressive microenvironment and highlights tumor-promoting macrophage cells in Glioblastoma
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0312764
PMID:40193323
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示胶质母细胞瘤免疫抑制微环境特征及肿瘤促进性巨噬细胞亚型 | 首次在单细胞水平系统鉴定胶质母细胞瘤中五种肿瘤相关巨噬细胞亚型,并发现具有M2极化特征的TAM_MRC1亚型和耗竭表型的CD56dim_DNAJB1自然杀伤细胞亚群 | 样本量相对有限(24名患者),未进行功能性验证实验 | 解析胶质母细胞瘤微环境的细胞异质性和免疫抑制机制 | 胶质母细胞瘤患者肿瘤组织中的免疫细胞和肿瘤细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 24名胶质母细胞瘤患者的48个肿瘤片段 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7986 | 2025-05-17 |
Single-cell analysis reveals potential therapeutic markers of peripheral blood mononuclear cells from bladder cancer patients
2025, Brazilian journal of medical and biological research = Revista brasileira de pesquisas medicas e biologicas
DOI:10.1590/1414-431X2025e14002
PMID:40367012
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析膀胱癌患者外周血单个核细胞,揭示潜在的治疗标志物 | 首次在膀胱癌患者外周血单个核细胞中鉴定出LAG-3和TIM-3等新型潜在免疫检查点抑制剂靶点,并发现多个与肿瘤进展相关的细胞亚群及其特征基因 | 样本量相对较小(仅包括患者和一名健康供体),且未进行功能验证实验 | 探索膀胱癌免疫治疗的潜在新靶点和生物标志物 | 膀胱癌患者和健康供体的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 44,022个细胞(来自膀胱癌患者和一名健康供体的外周血单个核细胞样本) | NA | NA | NA | NA |
| 7987 | 2025-05-17 |
The CD38+HLA-DR+ T cells with activation and exhaustion characteristics as predictors of severity and mortality in COVID-19 patients
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1577803
PMID:40370439
|
研究论文 | 该研究通过流式细胞术和单细胞RNA测序技术,分析了COVID-19患者外周免疫细胞的特征,发现CD38+HLA-DR+ T细胞的扩增与疾病严重程度和死亡率相关 | 首次将CD38+HLA-DR+ T细胞确定为COVID-19预后的新型生物标志物,并揭示了其独特的激活-耗竭表型及对NAD+代谢的影响 | 样本来源仅限于外周血,未评估组织中的免疫细胞特征;研究人群的多样性可能有限 | 寻找COVID-19的新型治疗靶点和早期预测生物标志物 | 健康人、细菌性肺炎患者和COVID-19患者的外周免疫细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 流式细胞术、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞表型数据、基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量,但包括健康人、细菌性肺炎患者和COVID-19患者三类人群 | NA | NA | NA | NA |
| 7988 | 2025-05-17 |
Single-cell transcriptome reveals potential mechanisms for gout in children
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1577109
PMID:40370447
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探索了儿童痛风的分子机制 | 揭示了CD14+单核细胞和DN T细胞在儿童痛风中的关键作用,以及与成人痛风的异同 | 样本来源仅限于外周血,未涉及痛风关节组织 | 探索儿童痛风的分子机制 | 儿童痛风患者和健康对照的外周血样本 | 生物医学 | 痛风 | scRNA-seq | NA | RNA测序数据 | 儿童痛风患者和健康对照的外周血样本(具体数量未说明) | NA | NA | NA | NA |
| 7989 | 2025-05-17 |
Exploration the role of pro-inflammatory fibroblasts and related markers in periodontitis: combing with scRNA-seq and bulk-seq data
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1537046
PMID:40370461
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量转录组数据分析,探索了促炎性牙龈成纤维细胞(PIGFs)在牙周炎中的作用及其相关分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别出与牙周炎发展密切相关的促炎性牙龈成纤维细胞亚群,并发现MME和TSPAN11两个基因作为潜在治疗靶点 | 研究样本量有限,且未在更大人群中验证MME和TSPAN11的临床效果 | 探索促炎性牙龈成纤维细胞在牙周炎发病机制中的作用及其分子机制 | 牙龈成纤维细胞(GFs)及其亚群促炎性牙龈成纤维细胞(PIGFs) | 数字病理学 | 牙周炎 | scRNA-seq, bulk-seq, qPCR, 免疫荧光染色 | 多种机器学习算法 | RNA测序数据 | 来自正常和牙周炎患者的scRNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 7990 | 2025-05-17 |
Unraveling the role of histone acetylation in sepsis biomarker discovery
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1582181
PMID:40370519
|
研究论文 | 本研究通过转录组和单细胞RNA测序数据,结合机器学习算法,发现了与组蛋白乙酰化相关的脓毒症生物标志物 | 首次将组蛋白乙酰化与脓毒症生物标志物发现联系起来,并利用多种机器学习算法和孟德尔随机化方法进行验证 | 研究样本量未明确说明,且需要进一步临床验证 | 发现脓毒症早期诊断和预后的有效生物标志物 | 脓毒症患者(具体样本信息未提供) | 生物信息学 | 脓毒症 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 孟德尔随机化 | LASSO, SVM-RFE, Boruta | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7991 | 2025-05-17 |
Resveratrol targeting MDM2/P53/PUMA axis to inhibit colonocyte apoptosis in DSS-induced ulcerative colitis mice
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1572906
PMID:40371345
|
research paper | 该研究探讨了白藜芦醇通过调节MDM2/P53/PUMA轴抑制结肠细胞凋亡,从而治疗DSS诱导的溃疡性结肠炎的潜力 | 揭示了白藜芦醇通过MDM2/P53/PUMA轴抑制结肠细胞凋亡的新机制,并验证了MDM2作为溃疡性结肠炎治疗靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人体中进行验证 | 研究白藜芦醇在溃疡性结肠炎治疗中的作用机制和疗效 | DSS诱导的溃疡性结肠炎小鼠模型和体外培养的结肠细胞 | 生物医学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞测序、免疫荧光染色、腺相关病毒系统 | 小鼠溃疡性结肠炎模型 | 实验数据 | 未明确说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 7992 | 2025-10-06 |
PINK1 link mitochondria-ER contacts controls deposition of intramuscular fat in pigs
2025-May-20, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151672
PMID:40138759
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研究论文 | 本研究探讨PINK1通过调控线粒体-内质网相互作用调节猪肌内脂肪沉积的分子机制 | 首次揭示PINK1在猪肌内脂肪沉积中通过调控线粒体-内质网接触发挥作用 | PINK1在猪肌内脂肪沉积中的具体调控网络仍需进一步研究 | 探究PINK1调控猪肌内脂肪沉积的分子机制 | 猪的纤维-脂肪祖细胞和脂肪细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个猪品种的纤维-脂肪祖细胞和脂肪细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7993 | 2025-10-06 |
Unraveling the Heterogeneity of CD8+ T-Cell Subsets in Liver Cirrhosis: Implications for Disease Progression
2025-May-15, Gut and liver
IF:3.4Q2
DOI:10.5009/gnl230345
PMID:38623058
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研究论文 | 本研究通过转录组和单细胞测序分析揭示了肝硬化中CD8+ T细胞的异质性及其在疾病进展中的作用 | 首次在肝硬化中系统鉴定出8种CD8+ T细胞亚型,特别是发现CXCL13+ Tex细胞这一终末耗竭亚型与疾病严重程度相关 | 研究主要基于测序数据分析,需要进一步实验验证这些细胞亚型的具体功能机制 | 阐明肝硬化中CD8+ T细胞的异质性及其在疾病进展中的分子机制 | 肝硬化患者的CD8+ T细胞 | 单细胞生物学 | 肝硬化 | 转录组测序, 单细胞测序 | 加权基因共表达网络分析, 谱系追踪, 差异分析 | RNA-seq数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7994 | 2025-05-16 |
Pdgfrβ marks distinct mesenchymal and pericyte populations within the periosteum with overlapping cellular features
2025-May-15, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxaf020
PMID:40237625
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和转基因小鼠模型,探讨了骨膜中Pdgfrβ阳性细胞的异质性及其在骨修复中的作用 | 揭示了骨膜中Pdgfrβ阳性细胞的不同亚群,包括间充质细胞和周细胞,并分析了它们的增殖、迁移和成骨能力 | 研究主要基于小鼠模型,结果在人类中的适用性尚需验证 | 探讨骨膜中Pdgfrβ阳性细胞的异质性及其在骨修复中的作用 | 小鼠长骨骨膜中的Pdgfrβ阳性细胞 | 细胞生物学 | 骨疾病 | 单细胞RNA测序,转基因小鼠模型 | Pdgfrβ-CreERT2-mT/mG报告小鼠 | 基因表达数据,组织学数据 | 转基因小鼠模型中的Pdgfrβ阳性细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 7995 | 2025-10-06 |
IAP dependency of T-cell prolymphocytic leukemia identified by high-throughput drug screening
2025-May-15, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024027171
PMID:39869826
|
研究论文 | 通过高通量药物筛选识别T细胞幼淋巴细胞白血病对IAP抑制剂的依赖性 | 首次系统绘制T-PLL的药物敏感性图谱,发现其对IAP抑制剂、核输出抑制剂和自噬抑制剂的特异性脆弱性 | 研究基于体外实验,样本量相对有限(30例患者样本) | 发现T-PLL的新治疗靶点和治疗策略 | T细胞幼淋巴细胞白血病(T-PLL)患者原代细胞 | 肿瘤学研究 | 白血病 | 高通量药物筛选,RNA测序,单细胞RNA测序,光谱流式细胞术 | NA | 药物敏感性数据,基因表达数据,细胞表型数据 | 30例原代患者样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 7996 | 2025-05-16 |
Evidence of secondary Notch signaling within the rat small intestine
2025-May-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204277
PMID:40371707
|
research paper | 该研究探讨了大鼠小肠中一种罕见的上皮细胞群体CFTR高表达细胞(CHEs)的特定形成机制 | 揭示了CHEs通过Notch信号通路的二次激活从其他分泌细胞中分化出来的新机制 | 研究主要基于大鼠模型,未在小鼠中发现CHEs,可能限制结果的普遍性 | 理解小肠分泌细胞谱系的多样性形成机制 | 大鼠小肠中的CFTR高表达细胞(CHEs) | 分子生物学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),假时间轨迹分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7997 | 2025-10-06 |
Single cell multiome analysis of the bovine placenta identifies gene regulatory networks in trophoblast differentiation†
2025-May-13, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioaf036
PMID:39987557
|
研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析揭示了牛胎盘发育过程中的染色质可及性景观和基因调控网络 | 首次在牛胎盘中应用10X Genomics多组学平台同时分析单细胞转录组和染色质可及性,揭示了滋养层细胞分化的调控机制 | 仅分析了妊娠第40天和第170天两个时间点,可能无法完全捕捉发育过程中的连续动态变化 | 探究牛胎盘发育过程中滋养层细胞分化的基因调控机制 | 牛胎盘组织 | 单细胞多组学 | 生殖疾病 | 单细胞多组学测序 | NA | 单细胞RNA-seq数据,单细胞ATAC-seq数据 | 妊娠第40天和第170天的牛胎盘样本 | 10x Genomics | single-cell multi-omics, snRNA-seq, snATAC-seq | 10x Genomics multiome平台 | 10X Genomics多组学平台(同时进行单细胞核RNA-seq和单细胞核ATAC-seq) |
| 7998 | 2025-10-06 |
Parvalbumin neurons mediate neurological phenotypes of anti-NMDAR encephalitis
2025-May-13, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awae374
PMID:40071389
|
研究论文 | 本研究揭示了小白蛋白神经元在抗NMDAR脑炎神经症状中的关键作用机制 | 首次证明抗NMDAR IgG直接导致小白蛋白神经元功能障碍,并通过光遗传学技术成功逆转认知缺陷 | 动物模型可能无法完全模拟人类疾病复杂性,研究主要聚焦于mPFC和海马区 | 阐明抗NMDAR脑炎认知缺陷的神经病理机制 | 小鼠模型及其中前额叶皮层和海马区的小白蛋白神经元 | 神经科学 | 自身免疫性脑炎 | 免疫组织化学染色、电生理记录、光遗传学、化学遗传学、单细胞测序 | 动物疾病模型 | 电生理数据、基因表达数据、行为学数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7999 | 2025-05-16 |
KLHL17 as a Prognostic Indicator and Therapeutic Target in Cervical Cancer: A Comprehensive Analysis
2025-May-13, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
|
research paper | 该研究通过生物信息学分析和实验验证,探讨了KLHL17在宫颈癌中的表达模式及其作为预后指标和治疗靶点的潜力 | 首次全面分析了KLHL17在宫颈癌中的表达模式、临床相关性及其与免疫细胞浸润、免疫检查点基因表达和微卫星不稳定性的关联 | 研究主要基于TCGA数据库和细胞系实验,缺乏大规模临床样本验证 | 阐明KLHL17在宫颈癌中的生物学功能和临床意义 | 宫颈癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 宫颈癌 | 生物信息学分析、qRT-PCR、单细胞测序 | NA | 基因表达数据、临床数据 | TCGA数据库中的宫颈癌样本和GSE145372数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 8000 | 2025-05-16 |
snPATHO-seq: A Detailed Protocol for Single Nucleus RNA Sequencing From FFPE
2025-May-05, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5291
PMID:40364991
|
research paper | 介绍了一种名为snPATHO-seq的稳健且适应性强的单核RNA测序方法,用于从FFPE组织中生成高质量的转录组数据 | snPATHO-seq通过优化的核分离和10× Genomics Flex检测,有效减少了组织碎片并保持了RNA完整性,优于现有的FFPE工作流程 | 未明确提及方法的局限性 | 开发一种能够从FFPE组织中生成高质量单核转录组数据的方法,以推动单细胞组学在转化和临床研究中的应用 | FFPE组织样本,包括乳腺癌等疾病组织 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单核RNA测序(snRNA-seq),10× Genomics Flex检测 | NA | 转录组数据 | 多样化的FFPE样本,包括疾病组织 | NA | NA | NA | NA |