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当前共找到 10799 篇文献，本页显示第 781 - 800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 781 | 2026-01-06 |
scCotag: Diagonal integration of single-cell multi-omics data via prior-informed co-optimal transport and regularized barycentric mapping
2025-Dec-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.11.693589
PMID:41446270
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研究论文 | 本文提出了一种名为scCotag的深度学习框架，用于单细胞多组学数据的对角线整合，通过先验信息引导的协同最优传输和正则化重心映射来解决现有方法的局限性 | 提出了一种基于协同最优传输的深度学习框架，能够迭代推断细胞对齐和特征对应关系，并利用先验信息，同时通过正则化重心映射和图重加权联合学习细胞和特征嵌入，特别擅长处理并非所有细胞都可对齐的模拟不平衡场景 | 未明确提及 | 开发一种更稳健的单细胞多组学数据对角线整合方法，以促进更精细的生物学解释和调控机制推断 | 单细胞多组学数据（RNA-seq和ATAC-seq） | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | 深度学习框架（基于协同最优传输） | 单细胞多组学数据 | 涉及人脑、骨髓和血液数据集，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 782 | 2026-01-06 |
Considerations for Spatial Omics, Metabolite Analyses, and Tissue-Harvesting Artifacts
2025-Dec, Journal of neurochemistry
IF:4.2Q2
DOI:10.1111/jnc.70315
PMID:41347273
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评论 | 本文讨论了空间组学、代谢物分析及组织采集过程中可能产生的伪影问题 | 强调了在空间生物学新兴技术背景下，组织采集和酶失活方法对保持神经化学物质完整性和避免伪影生成的重要性 | 本文为社论性质，未提供具体实验数据或案例研究 | 探讨空间分子分析技术应用中组织准备的关键考虑因素 | 空间组学和代谢物分析技术 | 空间生物学 | NA | 空间质谱成像、空间转录组学、激光显微切割、单细胞类型分析、下一代RNA测序 | NA | 空间分子数据、代谢物数据 | NA | NA | 空间质谱成像、空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 783 | 2026-01-06 |
Comparative Single-Cell Transcriptomics Uncovers Shared and Distinct Molecular Signatures in Cystic Fibrosis and Primary Ciliary Dyskinesia
2025-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.17.688876
PMID:41332697
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研究论文 | 本研究通过比较单细胞转录组学分析，揭示了囊性纤维化和原发性纤毛运动障碍在分子特征上的异同 | 首次使用预训练的transformer模型（scGPT）进行基因调控网络分析，通过差异注意力分析识别两种疾病间注意力分数改变的基因和通路 | 研究依赖于公开可用数据及本团队生成的数据，可能存在样本选择偏差，且未进行实验验证 | 比较囊性纤维化和原发性纤毛运动障碍的分子特征，以指导个性化治疗策略 | 囊性纤维化和原发性纤毛运动障碍患者的呼吸道细胞 | 自然语言处理 | 囊性纤维化,原发性纤毛运动障碍 | 单细胞RNA-seq | transformer (scGPT) | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 784 | 2026-01-06 |
Rationale, design and baseline characteristics of REMODEL, a mechanism-of-action trial with semaglutide in people with type 2 diabetes and chronic kidney disease
2025-Oct-30, Nephrology, dialysis, transplantation : official publication of the European Dialysis and Transplant Association - European Renal Association
DOI:10.1093/ndt/gfaf114
PMID:40608494
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研究论文 | 本文介绍了REMODEL试验的设计和基线特征，该试验旨在研究索马鲁肽在2型糖尿病和慢性肾脏病患者中的肾脏特异性效应和作用机制 | 该试验首次结合了MRI成像、肾脏活检以及单核和空间转录组学等多维度方法，以探索GLP-1受体激动剂在肾脏保护中的机制 | 样本量相对较小（106名参与者），且试验周期为52周，可能无法完全捕捉长期效应 | 研究索马鲁肽在2型糖尿病和慢性肾脏病患者中的肾脏特异性效应及作用机制 | 2型糖尿病和慢性肾脏病的成年患者 | 数字病理学 | 2型糖尿病和慢性肾脏病 | 磁共振成像（MRI）、单核转录组学、空间转录组学、病理学和组织学评估 | NA | 医学影像、组织样本、临床数据 | 106名参与者（其中33名为肾脏活检亚组） | NA | 单核转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 785 | 2026-01-06 |
Identification of lipid metabolism-related signature in nonalcoholic fatty liver: evidences from transcriptomics and single cell RNA-sequencing analysis
2025-Oct-13, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-03215-w
PMID:41084051
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研究论文 | 本研究通过转录组学和单细胞RNA测序分析，识别了与非酒精性脂肪肝相关的脂质代谢基因，构建了诊断模型并探索了其免疫浸润机制 | 结合转录组学、单细胞RNA测序和机器学习算法，识别了PRKAA2和ME1作为NAFLD的关键脂质代谢基因，并构建了高诊断性能的列线图模型 | 研究依赖于公共数据库数据，实验验证仅针对ME1基因，样本来源和多样性可能有限 | 识别脂质代谢相关基因，构建NAFLD诊断模型，并揭示其潜在机制 | 非酒精性脂肪肝疾病（NAFLD） | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝 | 转录组学，单细胞RNA测序，qRT-PCR，Western blotting | 机器学习算法，列线图模型 | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 786 | 2026-01-06 |
Spatial Transcriptome Analysis of B7-H4 in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma: A Novel Therapeutic Target for Anti-Immune Checkpoint Inhibitors
2025-Jun-30, Head and neck pathology
DOI:10.1007/s12105-025-01815-w
PMID:40586978
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研究论文 | 本研究通过免疫组化和空间转录组学分析，探讨了B7-H4在头颈部鳞状细胞癌中的表达模式及其作为免疫检查点抑制剂耐药治疗靶点的潜力 | 揭示了B7-H4与PD-L1在肿瘤细胞中的互斥表达模式，并首次结合空间转录组学证实了B7-H4蛋白与VTCN1 mRNA的共定位，为ICI耐药患者提供了新的治疗靶点 | 样本量相对较小（空间转录组学仅分析6例），且未进行功能性验证实验 | 评估B7-H4在头颈部鳞状细胞癌中的表达及其作为免疫检查点抑制剂替代治疗靶点的可行性 | 头颈部鳞状细胞癌患者组织样本，包括肿瘤组织、相邻鳞状上皮内瘤变和正常口腔黏膜 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 免疫组化，空间转录组学 | NA | 组织图像，空间转录组数据 | 组织微阵列包含94例HNSCC、94例相邻SIN和69例相邻NOM样本；空间转录组学分析6例HNSCC及其配对的SIN和NOM | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 787 | 2026-01-06 |
Mapping satellite glial cell heterogeneity reveals distinct spatial organization and signifies functional diversity in the dorsal root ganglion
2025-May-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.19.654813
PMID:40475507
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研究论文 | 本研究首次全面表征了小鼠背根神经节中卫星胶质细胞的异质性，并通过整合单细胞RNA测序与免疫组化等技术，识别、验证并空间定位了四个不同的SGC亚群 | 首次在小鼠背根神经节中对卫星胶质细胞异质性进行综合表征，识别并空间定位了四个功能不同的SGC亚群，并在人类DRG中发现了内外双层SGC结构 | NA | 探究背根神经节中卫星胶质细胞的异质性、空间分布及其潜在功能意义 | 小鼠和人类背根神经节中的卫星胶质细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 免疫组化, 原位杂交, 先进成像技术 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 788 | 2026-01-06 |
High-Sensitivity PD-L1 Staining Using Clone 73-10 Antibody and Spatial Transcriptomics for Precise Expression Analysis in Non-Tumorous, Intraepithelial Neoplasia, and Squamous Cell Carcinoma of Head and Neck
2025-May-20, Head and neck pathology
DOI:10.1007/s12105-025-01798-8
PMID:40392349
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研究论文 | 本研究利用高灵敏度克隆73-10抗体和空间转录组学技术，评估头颈部鳞状细胞癌中PD-L1的表达，旨在扩大免疫检查点抑制剂治疗的适用患者范围 | 首次结合高灵敏度克隆73-10抗体和空间转录组学分析，系统评估PD-L1在头颈部鳞状细胞癌、上皮内瘤变及正常组织中的表达，并揭示其与免疫微环境及预后的关联 | 样本量相对有限（94例临床样本，其中6例进行空间转录组学分析），且为单中心研究，可能影响结果的普遍性 | 评估PD-L1在头颈部鳞状细胞癌中的表达，探索其作为免疫治疗生物标志物的潜力，以优化患者筛选策略 | 头颈部鳞状细胞癌患者组织样本，包括癌组织、配对的上皮内瘤变及正常口腔黏膜 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 免疫组织化学染色，空间转录组学 | NA | 组织图像，转录组数据 | 94例头颈部鳞状细胞癌临床样本，包括配对的鳞状上皮内瘤变和正常口腔黏膜样本，其中6例进行了空间转录组学分析 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 789 | 2026-01-05 |
Plasma apolipoprotein E protein attenuates pulmonary fibrosis through LRP1 and PLAU dual receptor-mediated TGF-β/Smad inhibition
2025-Dec-29, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.12.045
PMID:41475664
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研究论文 | 本研究揭示了血浆载脂蛋白E（apoE）通过双重受体LRP1和PLAU抑制TGF-β/Smad信号通路，从而减轻肺纤维化的新机制，并提出了LXR激动剂RGX-104作为潜在治疗策略 | 首次发现血浆apoE是肺纤维化的因果性保护因子，并阐明其通过LRP1和PLAU双重受体协同作用抑制TGF-β/Smad信号通路的新机制；利用CRISPR工程APOE缺陷犬模型和单细胞转录组学等技术进行跨物种验证和机制解析 | 研究主要基于动物模型和体外实验，其临床转化效果和长期安全性仍需进一步的人体临床试验验证 | 识别肺纤维化的新治疗靶点并阐明血浆apoE减轻该疾病的机制 | 特发性肺纤维化（IPF） | NA | 肺纤维化 | 整合荟萃分析、双样本孟德尔随机化、CRISPR基因编辑、单细胞转录组学、SPIDER技术、表面等离子体共振（SPR） | NA | 血浆队列数据、基因数据、转录组数据、蛋白质相互作用数据 | 七个血浆队列（具体样本数未明确）、APOE缺陷犬、Apoe‒/‒小鼠、人精准切割肺切片 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 790 | 2026-01-05 |
Expression patterns and clinical implications of chaperonin subunit 3 mRNA and protein in laryngeal squamous cell carcinoma
2025-Dec-24, World journal of clinical oncology
IF:2.6Q3
DOI:10.5306/wjco.v16.i12.112161
PMID:41480162
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研究论文 | 本研究探讨了伴侣蛋白亚基3（CCT3）在喉鳞状细胞癌（LSCC）中的表达模式、临床意义及其对癌细胞生长的影响 | 首次通过整合多数据库mRNA表达数据、单细胞RNA-seq验证、免疫组化分析及CRISPR基因敲除功能实验，系统揭示了CCT3在LSCC中的致癌作用及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 临床样本量相对有限（88例免疫组化样本），且临床参数亚组分析未发现显著差异，需更大规模队列验证 | 探究CCT3在喉鳞状细胞癌中的表达特征、临床相关性及其对癌细胞生长的调控机制 | 喉鳞状细胞癌（LSCC）组织样本（269例mRNA数据、88例蛋白数据）及LSCC细胞系 | 数字病理学 | 喉癌 | 单细胞RNA-seq, 免疫组化, CRISPR基因敲除, 基因集富集分析, 蛋白质相互作用网络构建 | NA | mRNA表达数据, 单细胞RNA-seq数据, 免疫组化图像数据 | 269例LSCC组织（mRNA数据）, 88例临床样本（30例LSCC vs 58例非LSCC，蛋白数据） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 791 | 2026-01-05 |
Predictive markers for the efficacy of CAR T-cell therapy: the interplay between CAR T-cell fitness and systemic immunity
2025-Dec-23, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2025017873
PMID:41061151
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综述 | 本文探讨了CAR T细胞疗法疗效的预测标志物，重点关注CAR T细胞适应性与系统性免疫之间的相互作用 | 整合了单细胞转录组学、蛋白质组学分析和细胞因子多功能性检测等新兴技术，结合机器学习方法，用于识别预测性生物标志物并优化治疗策略 | NA | 识别和优化CAR T细胞疗法的预测性生物标志物，以改善患者分层和治疗效果 | CAR T细胞疗法在复发或难治性淋巴恶性肿瘤患者中的应用 | 机器学习 | 淋巴恶性肿瘤 | 单细胞转录组学、蛋白质组学分析、细胞因子多功能性检测 | 机器学习 | 转录组、蛋白质组、细胞因子数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 792 | 2026-01-05 |
Guardians within: Cross-talk between the gut microbiome and host immune system
2025-Dec-22, World journal of gastrointestinal pathophysiology
DOI:10.4291/wjgp.v16.i4.111245
PMID:41479870
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综述 | 本文综述了肠道微生物群与宿主免疫系统之间的复杂互作，探讨了微生物如何影响免疫细胞分化、调节炎症反应并维持免疫稳态 | 整合了宏基因组学、代谢组学和单细胞测序等最新技术进展，深入揭示了微生物-免疫轴的作用机制，为基于微生物组的治疗策略开辟了新途径 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据，且微生物-免疫互作的因果机制仍需进一步实验验证 | 探讨肠道微生物群与宿主免疫系统之间的互作关系及其在健康和疾病中的作用 | 肠道微生物群、宿主免疫细胞（如巨噬细胞、树突状细胞、自然杀伤细胞、先天淋巴细胞、T细胞、B细胞）及其代谢产物（如短链脂肪酸） | NA | 自身免疫性疾病、炎症性疾病、癌症 | 宏基因组学、代谢组学、单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 793 | 2026-01-05 |
Protocol for reconstructing spatially aware receptor-TF-target signaling cascades using spatial transcriptomics
2025-Dec-10, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104237
PMID:41385380
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研究论文 | 本文介绍了一种使用SpaGRN框架从空间转录组学数据重建空间感知的受体-转录因子-靶点信号级联的协议 | 通过整合细胞外信号和空间依赖性，克服了传统方法忽视空间约束的局限，实现了信号通路的系统映射 | NA | 开发一种从空间转录组学数据推断基因调控网络的协议 | 复杂组织如发育胚胎和肿瘤中的信号通路 | 空间转录组学 | 肿瘤 | 空间转录组学 | 统计框架（SpaGRN） | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 794 | 2026-01-05 |
Glutathione accelerates the cell cycle and cellular reprogramming in plant regeneration
2025-04-21, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.12.019
PMID:39755116
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研究论文 | 本研究探讨了谷胱甘肽（GSH）在植物细胞再生过程中如何通过加速细胞周期和促进细胞重编程来发挥作用 | 首次在植物再生过程中，通过单细胞RNA测序和活体成像技术，揭示了GSH在调控G1期缩短和细胞重编程中的关键作用，并提出了一个基于GSH释放的损伤响应模型 | 研究主要基于拟南芥根系统，可能不直接适用于其他植物组织或物种，且GSH的具体信号传导机制尚未完全阐明 | 探究细胞周期动态在植物细胞重编程和再生过程中的作用机制 | 拟南芥（Arabidopsis）根细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），活体成像 | NA | RNA测序数据，图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 795 | 2026-01-05 |
Single-cell RNA-seq reveals that granulosa cells are a target of phthalate toxicity in the ovary
2025-Apr-01, Toxicological sciences : an official journal of the Society of Toxicology
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/toxsci/kfaf001
PMID:39752319
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了邻苯二甲酸盐对卵巢颗粒细胞的毒性作用及其分子机制 | 首次在单细胞分辨率下系统揭示了邻苯二甲酸盐对卵巢颗粒细胞（特别是壁层颗粒细胞）的特异性毒性作用，并发现批量测序可能掩盖对脆弱细胞类型的影响 | 研究仅使用小鼠模型和特定浓度的邻苯二甲酸盐代谢混合物，体外培养系统可能无法完全模拟体内环境 | 探究邻苯二甲酸盐对卵巢毒性的分子机制 | 小鼠卵巢卵泡（特别是颗粒细胞、膜细胞/基质细胞） | 单细胞组学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠卵泡体外培养96小时（处理组与对照组） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 796 | 2026-01-05 |
Refining breast cancer genetic risk and biology through multi-ancestry fine-mapping analyses of 192 risk regions
2025-Jan, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-02031-y
PMID:39753771
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研究论文 | 通过多祖先精细定位分析192个风险区域，精炼乳腺癌遗传风险和生物学机制 | 整合多祖先基因组数据，识别了332个独立关联信号（包括131个新信号），并确定了195个候选易感基因，支持多祖先数据在精细定位中的价值 | 未明确提及，但可能包括功能验证的局限性或样本多样性不足 | 精细定位已知乳腺癌风险位点，揭示因果变异和靶基因 | 172,737例女性乳腺癌病例和242,009例对照（非洲、亚洲和欧洲祖先） | 基因组学 | 乳腺癌 | 全基因组关联研究（GWAS）、单细胞RNA测序、体外实验 | NA | 基因组关联数据、功能基因组学数据 | 414,746个样本（病例和对照） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 797 | 2026-01-05 |
Microfluidics and molecular diagnostics in renal cell carcinoma: advances, challenges, and future directions
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1674789
PMID:41479787
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综述 | 本文全面探讨了肾细胞癌的临床病理学现状，并重点回顾了微流控和分子诊断技术的最新进展及其在肾癌管理中的应用 | 整合了微流控平台与分子诊断技术，用于分析循环肿瘤细胞、循环肿瘤DNA和外泌体等生物标志物，并探讨了单细胞测序、空间转录组学等新技术在肿瘤异质性和治疗耐药性研究中的应用 | 临床转化面临检测标准化和监管障碍等挑战 | 探讨微流控和分子诊断技术在肾细胞癌管理中的进展、挑战和未来方向，以推动精准医疗 | 肾细胞癌 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞测序, 空间转录组学, 下一代测序, 多组学整合 | NA | 生物标志物数据, 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 下一代测序 | NA | NA |
| 798 | 2026-01-05 |
Macrophage-driven immunopathology in pulmonary arterial hypertension: from mechanisms to targeted therapies
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1721071
PMID:41479889
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综述 | 本文综述了巨噬细胞极化在肺动脉高压发病机制中的关键作用及其作为治疗靶点的潜力 | 强调了巨噬细胞极化通过M1/M2表型驱动局部炎症和纤维化，并揭示了“肺-心免疫轴”在右心室重塑中的间接影响，同时指出巨噬细胞异质性、单细胞转录组学和精准免疫调节策略作为未来研究方向 | NA | 探讨巨噬细胞驱动的免疫病理在肺动脉高压中的机制，并评估靶向治疗策略 | 肺动脉高压的发病机制，特别是巨噬细胞在血管重塑和炎症中的作用 | NA | 肺动脉高压 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 799 | 2026-01-05 |
Dynamic genetic regulation of CD4+ T cells in obstructive sleep apnea: integrating context-specific eQTL, Mendelian randomization, single-cell sequencing, and experimental validation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1691347
PMID:41479897
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研究论文 | 本研究整合了多种分析方法，探究了CD4+ T细胞在阻塞性睡眠呼吸暂停发病机制中的动态遗传调控机制 | 首次整合了情境特异性eQTL分析、孟德尔随机化、共定位分析、单细胞RNA测序和实验验证，系统揭示了CD4+ T细胞在OSA中的时间动态性和细胞类型特异性免疫调控 | 样本仅来自欧洲血统的119名供体，可能限制了结果在其他人群中的普适性；研究主要关注CD4+ T细胞，其他免疫细胞的作用未充分探讨 | 探究阻塞性睡眠呼吸暂停中CD4+ T细胞的动态遗传调控机制，特别是在间歇性缺氧诱导的免疫和炎症反应中的作用 | 来自119名欧洲血统供体的CD4+ T细胞，以及间歇性缺氧小鼠模型 | 生物信息学 | 阻塞性睡眠呼吸暂停 | 情境特异性eQTL分析, 孟德尔随机化, 共定位分析, 单细胞RNA测序, qPCR | NA | 基因表达数据, 遗传变异数据, 单细胞转录组数据 | 119名欧洲血统供体的CD4+ T细胞（在0小时、16小时、40小时和5天多个时间点） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 800 | 2026-01-04 |
Identifying vascular stiffening-sensitive macrophages through integration of single-cell transcriptomics and imaging flow cytometry
2025-Dec-31, Biophysics reports
DOI:10.52601/bpr.2025.240063
PMID:41477484
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和成像流式细胞术，识别了在血管硬化过程中对细胞外基质刚度敏感的SPP1+巨噬细胞亚群 | 首次结合单细胞转录组学与成像流式细胞术，在动脉硬化模型中系统性地识别并验证了SPP1+巨噬细胞是对细胞外基质刚度敏感的特定免疫细胞亚群 | 研究主要基于小鼠模型和体外培养系统，在人体样本中的验证尚不充分，且未深入探讨SPP1+巨噬细胞促进血管硬化的具体分子机制 | 旨在识别在心血管疾病中响应动脉硬化的特定免疫细胞成分和关键因子 | 硬化颈动脉斑块中的免疫细胞、不同刚度聚丙烯酰胺凝胶上培养的巨噬细胞、急性钙化小鼠模型中的血管组织 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，成像流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |