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当前共找到 10400 篇文献，本页显示第 781 - 800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 781 | 2025-12-09 |
Correction: Identification of novel lipid metabolism-related biomarkers of aortic dissection by integrating single-cell RNA sequencing analysis and machine learning algorithms
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1742065
PMID:41357238
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correction | 本文是对先前一篇关于整合单细胞RNA测序分析和机器学习算法识别主动脉夹层新型脂质代谢相关生物标志物文章的更正 | NA | NA | NA | NA | NA | 主动脉夹层 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 782 | 2025-12-08 |
Neutrophil extracellular traps released by CD177+ neutrophils aggravated inflammation and neuronal impairment post-SCI
2025-Dec-07, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02553-w
PMID:41353336
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定脊髓损伤后三种不同的中性粒细胞亚群，并揭示CD177+中性粒细胞通过形成中性粒细胞胞外陷阱加剧炎症和神经元损伤 | 首次在脊髓损伤模型中系统鉴定中性粒细胞亚群，并阐明CD177+中性粒细胞通过PAD4和ROS依赖的NETs形成机制促进炎症和神经元凋亡 | 研究主要基于小鼠模型和有限的患者样本，人类脊髓损伤的异质性可能未被完全涵盖 | 探究脊髓损伤后中性粒细胞的异质性及其在神经炎症和神经元损伤中的作用机制 | 脊髓损伤小鼠模型和患者样本中的中性粒细胞 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量，包括SCI小鼠模型和患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 783 | 2025-12-08 |
A mitochondria-related gene-based signature predicts pancreatic ductal adenocarcinoma clinical outcome and revealed CAMK2A/THEM4 regulates progression phenotypes and mitophagy in vivo and in vitro
2025-Dec-06, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07456-5
PMID:41353164
|
研究论文 | 本研究开发了一个基于线粒体相关基因的12基因预后特征，用于预测胰腺导管腺癌（PDAC）的临床结局，并揭示了CAMK2A/THEM4在体内外调控进展表型和线粒体自噬的分子机制 | 首次在胰腺癌中开发了一个基于线粒体相关基因的预后特征，并深入研究了候选基因CAMK2A和THEM4的协同作用及其通过CAMK2A-THEM4-AKT轴调控PDAC进展的机制 | NA | 开发一个稳健的分子特征以改善PDAC的风险分层并识别潜在的治疗靶点 | 胰腺导管腺癌（PDAC）患者 | 机器学习 | 胰腺癌 | 机器学习、单细胞测序、免疫组织化学（IHC）微阵列、体内异种移植模型 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据、免疫组织化学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 784 | 2025-12-08 |
CSDE1 depletion inhibits tumor progression through enhancing B-cell infiltration in NSCLC
2025-Dec-06, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08282-9
PMID:41353256
|
研究论文 | 本研究探讨了CSDE1基因在非小细胞肺癌（NSCLC）进展中的作用及其对肿瘤免疫微环境的影响，发现CSDE1通过调节肿瘤浸润B淋巴细胞（TIL-Bs）促进肿瘤进展 | 首次揭示了CSDE1通过调节肿瘤浸润B淋巴细胞（TIL-Bs）来促进肺癌进展的新机制，并证明B细胞在此过程中的关键作用，为肿瘤免疫治疗提供了新的潜在靶点 | 研究主要基于小鼠模型，其在人体中的具体作用机制和临床转化潜力仍需进一步验证 | 探究CSDE1在肺癌进展中的作用及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 非小细胞肺癌（NSCLC） | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫荧光 | 小鼠肿瘤模型 | 单细胞RNA测序数据、流式细胞数据、免疫荧光图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 785 | 2025-12-08 |
Immune landscape-driven subtyping reveals distinct microenvironment and prognostic profiles in thymic epithelial tumors
2025-Dec-06, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01197-w
PMID:41353296
|
研究论文 | 本研究通过整合公共数据集和内部验证队列的免疫相关基因表达数据，对胸腺上皮肿瘤进行了免疫亚型分类，并揭示了不同亚型在微环境特征和预后方面的显著差异 | 首次基于免疫相关基因表达谱对胸腺上皮肿瘤进行共识聚类，识别出淋巴细胞富集亚型和髓系/基质富集亚型这两种具有不同预后和微环境特征的亚型，并利用单细胞转录组学揭示了MIF介导的CD8+ T细胞功能抑制机制 | 研究样本量相对有限（总样本数119例），且验证队列主要依赖于单一机构（瑞金医院）的FFPE-RNA测序数据，未来需要在更大规模的多中心队列中进行验证 | 揭示胸腺上皮肿瘤的免疫异质性，建立与临床相关的免疫分类系统，为个性化治疗策略提供依据 | 胸腺上皮肿瘤患者样本 | 数字病理学 | 胸腺上皮肿瘤 | RNA测序，单细胞转录组学，多重免疫荧光 | 共识聚类，ROC曲线分析 | 基因表达数据，单细胞转录组数据，免疫荧光图像数据 | 119例（LRS亚型86例，MSRS亚型33例） | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 786 | 2025-12-08 |
From bulk RNA sequencing to spatial transcriptomics: a comparative review of differential gene expression analysis methods
2025-Dec-06, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-025-00884-w
PMID:41353326
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 787 | 2025-12-08 |
Plate-based 10X Genomics-compatible single-cell RNA-sequencing based on Smart-seq3xpress
2025-Dec-06, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-12286-2
PMID:41353535
|
研究论文 | 本文开发了一种基于Smart-seq3xpress原理的平板式、与10X Genomics兼容的单细胞RNA测序策略，旨在解决10X技术在小规模细胞群体分析中的限制 | PB10X方法结合了平板式单细胞RNA测序的灵活性和10X测序库制备的稳健性，同时保持与下游Cell Ranger数据处理的完全兼容性，特别在免疫受体库测序中表现出色 | NA | 开发一种成本效益高、与10X兼容的平板式单细胞RNA测序方法，以支持小规模细胞群体的基因表达和免疫受体分析 | Jurkat淋巴母细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达和T细胞受体序列数据 | NA | 10X Genomics | 单细胞RNA-seq | 10X Single Cell 5' library construction kit, 5' V(D)J kit, 5' Gene Expression kit | 基于Smart-seq3xpress原理的平板式10X兼容策略，支持384孔板中的荧光激活细胞分选 |
| 788 | 2025-12-08 |
Regenerative teeth induced by in vitro mesenchymal cells in mice via repressing BMP4 and activating retinoic acid/osteopontin
2025-Dec-05, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-025-00271-9
PMID:41345270
|
研究论文 | 本研究开发了一种优化的N2B27培养基，成功在小鼠中通过抑制BMP4和激活视黄酸/骨桥蛋白，诱导了体外培养的牙间充质细胞再生牙齿 | 开发了能维持牙间充质细胞成牙潜能长达14天的优化培养基，显著优于传统方法（≤24小时），并揭示了BMP4抑制和骨桥蛋白/视黄酸激活在牙齿再生中的关键机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类细胞或临床环境中验证，且培养基的长期效果和安全性需进一步评估 | 研究牙齿再生中牙间充质细胞的体外培养和功能维持，以推进组织工程应用 | 小鼠牙间充质细胞（mDMCs） | 组织工程与再生医学 | 牙齿疾病或缺失 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 789 | 2025-12-08 |
A phenotypic brain organoid atlas and biobank for neurodevelopmental disorders
2025-Dec-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.10.006
PMID:41187745
|
研究论文 | 本研究介绍了一个针对神经发育障碍（NDD）的表型脑类器官图谱和生物库，包含352个遗传多样性患者来源的iPSCs，并分析了超过6,000个脑类器官的组织学和单细胞转录组数据 | 创建了一个公开可用的NDD生物库，整合了临床、脑成像和基因组数据，并通过脑类器官模型揭示了不同NDD类别（如小头畸形、多小脑回、癫痫和智力障碍）的特定细胞缺陷 | 研究仅基于35名代表性患者和10名神经典型对照，样本规模相对有限，可能无法涵盖所有NDD亚型或遗传变异 | 通过建立NDD生物库和脑类器官模型，探索神经发育障碍的机制，以填补基因关联与靶向治疗之间的空白 | 神经发育障碍患者来源的诱导多能干细胞（iPSCs）和由此衍生的脑类器官 | 数字病理学 | 神经发育障碍 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq数据、组织学图像、临床数据、脑成像数据、基因组数据 | 352个患者来源的iPSCs（来自35名代表性患者），超过6,000个脑类器官，以及10名神经典型对照的类器官库 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 790 | 2025-12-08 |
Space-associated stem cell hallmarks of aging and resilience in astronauts
2025-Dec-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.11.001
PMID:41289992
|
研究论文 | 本研究对9名宇航员在国际空间站短期任务前后进行了造血干细胞和祖细胞（HSPC）的多组学分析，揭示了太空飞行对HSPC生存、自我更新及相关基因表达的短期可逆影响 | 首次对宇航员HSPC进行功能组织的多组学老化与恢复力分析，结合全基因组测序、单细胞RNA测序等技术，系统评估太空环境对造血干细胞的影响 | 样本量较小（9名宇航员），仅针对短期太空任务，未验证长期太空飞行的影响 | 研究太空环境对造血干细胞和祖细胞（HSPC）的影响及其恢复力特性 | 宇航员的造血干细胞和祖细胞（HSPC）及免疫细胞亚群 | 单细胞组学 | NA | 全基因组测序, 全转录组测序, 单细胞RNA测序, 细胞因子阵列, 流式细胞分选 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 单细胞数据, 蛋白质组数据 | 9名宇航员（国际空间站短期任务前后） | NA | 单细胞RNA-seq, 全基因组测序, 全转录组测序 | NA | NA |
| 791 | 2025-12-08 |
Reversing lysosomal dysfunction restores youthful state in aged hematopoietic stem cells
2025-Dec-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.10.012
PMID:41289991
|
研究论文 | 本研究揭示了溶酶体功能障碍是造血干细胞衰老的关键驱动因素，并通过抑制溶酶体过度活化来恢复其年轻状态 | 首次发现衰老造血干细胞中溶酶体过度酸化、耗竭和异常激活，并证明通过v-ATPase抑制剂干预可逆转这些变化，显著提升干细胞再生能力 | 研究主要基于体外实验和动物模型，尚未在人体中进行验证，长期安全性和临床转化效果需进一步评估 | 探究溶酶体在造血干细胞衰老中的作用机制，并寻找恢复其功能的干预策略 | 衰老的造血干细胞 | 干细胞生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞转录组学、功能分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 792 | 2025-12-08 |
Human peripheral osteoclast-precursor-development patterns reveal the significance of RPS17-dependent ribosome synthesis to Ankylosing Spondylitis lesions
2025-Dec-04, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-025-00474-5
PMID:41345114
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了强直性脊柱炎（AS）患者外周血中破骨细胞前体（OCP）发育模式的改变，并发现RPS17依赖性核糖体合成在AS病变中的关键作用 | 首次在AS患者外周血单核细胞中系统描绘了OCP发育轨迹，并识别出RPS17依赖性核糖体合成作为AS病变的核心机制，同时提出RPS17过表达的单核性OCP具有治疗潜力 | 研究样本量有限，且主要基于外周血分析，未深入探讨局部关节微环境的影响 | 阐明AS条件下破骨细胞前体发育模式的变化及其在AS病变中的作用 | 健康供体和AS患者（早期、加重期和缓解期）的外周血单核细胞（PBMCs） | 单细胞转录组学 | 强直性脊柱炎 | 单细胞转录组测序 | 轨迹分析 | 单细胞RNA-seq数据 | 健康供体和AS患者（早期、加重期和缓解期）的PBMCs样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 793 | 2025-12-08 |
LIMD2 is associated with an exhausted CD8⁺ T cell state linked to ICI response in clear cell renal cell carcinoma
2025-Dec-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-27315-z
PMID:41345477
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据，发现LIMD2高表达的CD8⁺ T细胞与肾透明细胞癌患者对免疫检查点抑制剂的反应相关 | 首次将LIMD2鉴定为与CD8⁺ T细胞耗竭状态及免疫治疗反应相关的候选预测生物标志物 | 研究主要基于回顾性队列和公开数据集，需要前瞻性临床验证 | 阐明肾透明细胞癌中CD8⁺ T细胞功能状态与免疫检查点抑制剂反应的关系 | 肾透明细胞癌患者肿瘤浸润CD8⁺ T细胞 | 数字病理学 | 肾癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光 | NA | 转录组数据, 图像数据 | 整合六个公开数据集及独立验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 794 | 2025-12-08 |
A decreased proportion of naïve MAIT cells is associated with the incomplete immune reconstitution in antiretroviral therapy-treated HIV-1 patients
2025-Dec-04, Virologica Sinica
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.virs.2025.12.003
PMID:41352538
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术，揭示了在接受抗逆转录病毒治疗的HIV-1患者中，幼稚MAIT细胞比例降低与不完全免疫重建之间的关联 | 首次结合单细胞RNA测序和单细胞TCR测序，对HIV-1治疗中的免疫无应答者（INRs）进行全面的免疫特征分析，并识别出幼稚MAIT细胞亚群减少这一关键特征 | 研究主要基于外周血单核细胞，未涉及组织驻留免疫细胞；样本量相对有限；机制性研究（如功能验证）尚不充分 | 探究抗逆转录病毒治疗后不完全免疫重建的免疫学机制 | HIV-1感染患者（包括免疫无应答者和免疫应答者）及健康对照个体的外周血单核细胞 | 免疫学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据, TCR序列数据 | HIV-1患者（INRs和IRs）及健康对照个体，具体数量未在摘要中明确 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 795 | 2025-12-08 |
Tumor necrosis factor from leukemic environment stimulates hematopoietic stem / progenitor cells toward megakaryocyte / myeloid lineage bias
2025-Dec-04, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2025.105332
PMID:41352655
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研究论文 | 本研究探讨了急性髓系白血病（AML）骨髓环境中肿瘤坏死因子（TNF-α）如何驱动正常造血干细胞/祖细胞向巨核细胞/髓系谱系偏倚，导致其耗竭 | 揭示了白血病骨髓环境中TNF-α信号上调是导致正常造血干细胞/祖细胞向巨核细胞/髓系谱系偏倚的关键机制，为理解白血病生物学和正常造血提供了新视角 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人类患者中验证，且TNF-α以外的其他环境因素可能也参与其中 | 探究AML骨髓中残留正常造血系统受损的机制 | 小鼠MLL-AF9诱导的AML模型中的非白血病造血干细胞/祖细胞（nl-HSPC）及正常造血干细胞/祖细胞（HSC/HSPC） | 血液学与肿瘤学 | 急性髓系白血病 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 796 | 2025-12-08 |
Multi-omics integrated analysis identifies causal risk factors and therapeutic targets for diabetic retinopathy
2025-Dec-03, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07353-x
PMID:41340073
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研究论文 | 本研究通过多组学整合分析，系统识别了糖尿病视网膜病变的因果风险因素和治疗靶点 | 首次通过双样本孟德尔随机化、共定位/SMR、NHANES数据、转录组学和机器学习等多方法整合，系统识别DR的因果基因、风险因素和核心调控靶点 | 研究主要基于观察性数据和遗传学证据，需要进一步实验验证靶点的功能机制 | 探索糖尿病视网膜病变的风险因素、致病机制和潜在治疗靶点 | 糖尿病视网膜病变患者及其亚型（背景性DR、增殖性DR） | 生物信息学 | 糖尿病视网膜病变 | 孟德尔随机化、共定位分析、SMR、转录组学、单细胞转录组学、机器学习 | 逻辑回归、限制性立方样条、机器学习模型、列线图 | 遗传数据、蛋白质数据、转录组数据、临床调查数据 | NHANES 1999-2010横断面数据，涉及16,989个基因和2,923个蛋白质 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 797 | 2025-12-08 |
Multi-omics data mining reveals macrophage-mediated effects of cathepsin B on esophageal adenocarcinoma risk
2025-Dec-03, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.149423
PMID:41349740
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研究论文 | 本研究通过多组学数据挖掘揭示了组织蛋白酶B通过调控巨噬细胞影响食管腺癌风险的因果机制 | 首次整合孟德尔随机化、全转录组关联研究、单细胞RNA测序和单细胞表达数量性状位点分析，系统阐明了CTSB通过巨噬细胞清道夫受体调控肿瘤相关巨噬细胞表型从而影响EAC风险的分子通路 | 研究主要基于西方人群数据，结论在其他人群中的普适性有待验证；实验验证部分主要依赖免疫组化，后续需要更多功能实验支撑 | 探究组织蛋白酶家族与食管腺癌的因果关系及潜在发病机制 | 组织蛋白酶B（CTSB）与食管腺癌风险 | 生物信息学 | 食管腺癌 | 单细胞RNA测序，孟德尔随机化，全转录组关联研究，单细胞表达数量性状位点分析，免疫组化，蛋白质对接 | 多组学整合分析模型 | 基因组数据，转录组数据，单细胞表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 798 | 2025-12-08 |
Pan-cancer gene set discovery via scRNA-seq for optimal deep learning based downstream tasks
2025-Dec-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-27296-z
PMID:41330999
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研究论文 | 本研究提出了一种通过整合单细胞RNA测序数据和先进分析技术，为癌症基因组学下游任务进行特征选择的稳健方法 | 首次提出利用单细胞RNA测序数据推导的基因集在泛癌研究中优于基于批量RNA测序选择的基因集，并整合hdWGCNA和XGBoost进行特征选择 | 研究仅分析了13种癌症类型的181个肿瘤活检样本，样本量和癌症类型覆盖范围可能有限 | 开发优化的基因集选择方法以提高泛癌下游任务的预测准确性 | 13种癌症类型的肿瘤活检样本及TCGA泛癌RNA测序数据 | 机器学习 | 泛癌研究 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 多层感知机，图神经网络，XGBoost | 转录组数据 | 181个肿瘤活检样本（来自13种癌症类型） | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 799 | 2025-12-08 |
Deciphering the liver's role in pancreatic cancer metastasis: pathways and therapeutic approaches
2025-Dec-02, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01202-2
PMID:41331510
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综述 | 本文综述了胰腺导管腺癌肝转移的机制，重点关注肝脏作为转移前微环境的形成过程及其分子通路 | 结合空间组织学图谱、单细胞测序等前沿技术，重新审视并批判性评估了Paget的‘种子与土壤’假说在肝转移微环境研究中的适用性 | 作为一篇综述文章，主要基于现有文献进行分析，未提出新的原始实验数据或临床验证 | 深入理解胰腺导管腺癌肝转移的生物学机制，为开发靶向治疗和改善临床预后提供理论基础 | 胰腺导管腺癌（PDAC）及其肝转移病灶 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间组织学图谱、单细胞测序、分子标记物鉴定 | NA | 组织切片、测序数据、分子标记数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 800 | 2025-12-08 |
Single-cell analysis of lung cancer metabolism and its clinical implications
2025-Dec-02, Cancer treatment and research communications
DOI:10.1016/j.ctarc.2025.101055
PMID:41352205
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术系统探索了肺癌肿瘤微环境中不同细胞类型的代谢通路，并识别了具有诊断和预后意义的潜在生物标志物 | 首次在单细胞分辨率下对肺癌恶性细胞的代谢特征进行全面探索，并根据代谢活性将恶性细胞分为高、中、低代谢三个亚组，揭示了低代谢状态与免疫信号通路及癌症干细胞样特征的关联 | NA | 探索肺癌肿瘤微环境中不同细胞类型的代谢特征及其临床意义 | 肺癌肿瘤微环境中的细胞，包括恶性细胞和非恶性细胞类型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |