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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 781 | 2026-01-26 |
Clonal hematopoiesis is clonally unrelated to multiple myeloma and is associated with specific microenvironmental changes
2025-Jul-31, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024026236
PMID:40112284
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研究论文 | 本研究探讨了克隆造血与多发性骨髓瘤的共存关系及其对肿瘤微环境的影响 | 首次证明克隆造血与多发性骨髓瘤在诊断时频繁共存,且两者克隆起源无关,并通过单细胞RNA测序揭示了克隆造血阳性患者肿瘤微环境的显著变化 | 样本量相对较小(106例患者),且克隆造血与较低血红蛋白中位数的关联趋势不显著 | 研究克隆造血在多发性骨髓瘤肿瘤微环境中的修饰作用及其临床意义 | 多发性骨髓瘤患者 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 106例多发性骨髓瘤患者,其中16例进行了单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 782 | 2026-01-26 |
Aberrant single-cell phenotype and clinical implications of genotypically defined polyclonal plasma cells in myeloma
2025-Jun-26, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024025643
PMID:40009503
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和B细胞受体分析,探讨了多发性骨髓瘤中基因型定义的多克隆浆细胞的异常表型及其临床意义 | 首次在单细胞水平上基因型识别多克隆浆细胞,并揭示其在疾病进展中的频率变化、表型异常以及与肿瘤微环境的相互作用失调 | 样本量相对有限(46例患者样本和21例健康供体),且主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平验证 | 研究多发性骨髓瘤中残留多克隆浆细胞是否被破坏,及其对疾病病理和临床结局的影响 | 多发性骨髓瘤患者和健康供体的浆细胞,包括克隆性和多克隆性浆细胞 | 单细胞组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序,单细胞B细胞受体分析 | NA | 单细胞转录组数据,B细胞受体序列数据 | 46例浆细胞异常样本和21例健康供体,共分析234,789个浆细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 783 | 2026-01-26 |
NOTCH1 dimeric signaling is essential for T-cell leukemogenesis and leukemia maintenance
2025-Jun-12, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024027020
PMID:40009499
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研究论文 | 本研究揭示了NOTCH1二聚体信号在T细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL)发生和维持中的关键作用 | 首次系统阐明NOTCH1二聚体信号通过HES4转录因子调控Δ133p53亚型和BCL2L1表达,促进白血病细胞存活的新机制 | 研究主要基于体外模型和患者来源异种移植模型,临床转化效果需进一步验证 | 探究NOTCH1二聚体信号在T-ALL发病机制中的具体作用 | 人类造血干细胞/祖细胞、T-ALL细胞系、原发性T-ALL样本 | 肿瘤生物学 | T细胞急性淋巴细胞白血病 | RNA测序、染色质免疫沉淀测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、表观遗传数据、单细胞转录组数据 | 脐带血来源的造血干细胞/祖细胞、患者来源异种移植模型、原发性T-ALL样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 784 | 2026-01-26 |
Resolving spatiotemporal dynamics in bacterial multicellular populations: approaches and challenges
2025-Mar-27, Microbiology and molecular biology reviews : MMBR
IF:8.0Q1
DOI:10.1128/mmbr.00138-24
PMID:39853129
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综述 | 本文综述了研究细菌多细胞群体时空动态的方法与挑战,重点介绍单细胞技术在解析细菌生物膜(菌落)结构和功能中的应用 | 强调单细胞技术(如空间转录组学、单细菌RNA测序)在细菌多细胞性研究中的协同潜力,以单细胞分辨率解析群体结构和功能 | 未具体讨论技术整合的实际操作难点或数据解释的局限性 | 探索细菌多细胞群体的组装、动态和功能,以理解其进化过渡和复杂生命形式的出现 | 细菌多细胞群体,特别是分化的细菌生物膜(菌落)中的个体细胞 | 微生物学 | NA | 单细胞技术,包括显微技术、质谱成像、流式细胞术、空间转录组学、单细菌RNA测序 | NA | 空间和时间数据,单细胞数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 785 | 2026-01-26 |
Elucidating the role of SHROOM4 in non-small cell lung cancer: expression patterns, clinical correlations, and potential functions
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1723844
PMID:41573567
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析探讨了SHROOM4在非小细胞肺癌中的表达模式、临床相关性及其潜在功能 | 首次系统研究SHROOM4在NSCLC中的表达及其与临床预后的关联,并发现其通过影响肿瘤微环境和信号通路(如血管生成和Wnt/Beta-Catenin途径)参与肺癌进展 | 研究主要基于公共数据库的生物信息学分析,实验验证有限,需要进一步的功能研究来确认SHROOM4的具体作用机制 | 阐明SHROOM4在非小细胞肺癌中的表达模式、临床意义及其潜在生物学功能 | 非小细胞肺癌(NSCLC)组织,特别是肺鳞状细胞癌(LUSC)组织及对应正常组织 | 生物信息学 | 肺癌 | 生物信息学分析,单细胞RNA-seq,差异表达分析 | NA | mRNA表达数据,蛋白质表达数据,单细胞RNA-seq数据 | 公共数据库中的肺癌组织样本及验证用的LUSC组织与正常组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 786 | 2026-01-26 |
Study on the spatiotemporal regulation of interferon-stimulated genes during Zika virus infection
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1702266
PMID:41573570
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研究论文 | 本研究通过整合多系统转录组数据、细胞实验和生物信息学分析,系统探讨了寨卡病毒感染期间干扰素刺激基因的时空调控特征和功能 | 整合了人脑类器官、单核细胞来源的树突状细胞和患者外周血单个核细胞的多系统转录组数据,结合单细胞转录组学揭示了细胞异质性,并通过交叉分析筛选出跨系统共享的干扰素刺激基因 | NA | 阐明宿主干扰素刺激基因在寨卡病毒感染中的抗病毒机制,为治疗策略开发提供关键靶点和理论支持 | 寨卡病毒感染期间的人脑类器官、单核细胞来源的树突状细胞、患者外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 寨卡病毒感染 | 转录组学、单细胞转录组学、生物信息学分析、siRNA敲低实验 | LASSO回归 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 787 | 2026-01-25 |
Spatial Transcriptomics Analysis of Macrophage-to-Myofibroblast Transition in Bronchiolitis Obliterans Following Hematopoietic Stem Cell Transplantation
2025-Dec-20, Transplantation and cellular therapy
IF:3.6Q1
DOI:10.1016/j.jtct.2025.12.950
PMID:41429336
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析了造血干细胞移植后闭塞性细支气管炎中巨噬细胞向肌成纤维细胞转化的作用 | 首次在BO中应用空间转录组学技术,揭示了MMT在疾病发展中的贡献以及基因表达从炎症到纤维化的动态转变 | 样本量较小(3例BO患者,2例对照),且为回顾性研究 | 探究巨噬细胞向肌成纤维细胞转化是否参与造血干细胞移植后闭塞性细支气管炎的发病机制 | 接受肺移植的BO患者的肺组织样本(n=3)以及肺癌患者的对照肺组织(n=2) | 空间转录组学 | 闭塞性细支气管炎 | 免疫荧光染色,空间转录组学 | 无监督聚类 | 空间基因表达数据,图像数据 | 5例患者(3例BO,2例肺癌对照) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 788 | 2026-01-25 |
Accurate imputation of pathway-specific gene expression in spatial transcriptomics with PASTA
2025-Dec-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67421-0
PMID:41397970
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研究论文 | 本研究提出了一种名为PASTA的空间通路表达插补方法,通过整合细胞类型和空间邻近性信息,提高空间转录组学数据中未测量基因表达的预测准确性 | PASTA方法首次将通路信息整合到空间基因表达插补过程中,利用细胞类型和空间邻近性假设,提升了预测的稳健性和生物学相关性 | NA | 开发一种计算方法来预测空间转录组学数据中未测量的基因表达,以克服靶向原位技术基因测量数量有限的障碍 | 空间转录组学数据和单细胞RNA测序数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | PASTA(通路导向的空间基因插补方法) | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 789 | 2026-01-25 |
Characterization of T cell markers in endometrial carcinoma through single-cell RNA sequencing
2025-Dec-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04289-y
PMID:41402657
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别T细胞标志基因,并基于此构建了一个八基因预测模型,用于预测子宫内膜癌患者的预后及免疫治疗反应 | 首次结合单细胞RNA测序数据与大量临床样本数据,构建了基于T细胞标志基因的子宫内膜癌预后预测模型,并验证了其与免疫治疗反应和药物敏感性的关联 | 需要进一步验证模型的临床适用性 | 开发子宫内膜癌的预后预测模型并探索其与免疫治疗的关系 | 子宫内膜癌患者 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 预测模型 | 基因表达数据, 临床数据 | 544例子宫内膜癌患者 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 790 | 2026-01-25 |
Single-cell transcriptomic profiling of eosinophils and airway immune cells in childhood asthma
2025-Oct, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.06.034
PMID:40684957
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研究论文 | 本研究通过优化单细胞RNA测序方法,提高了儿童哮喘患者鼻灌洗样本中粒细胞(特别是嗜酸性粒细胞)的捕获效率,并揭示了不同哮喘表型下的细胞转录差异和亚群特征 | 采用10× Genomics Flex平台结合定制化数据处理流程,实现了粒细胞恢复的16倍以上提升,首次在组织样本中高效捕获嗜酸性粒细胞和中性粒细胞,并识别出与哮喘表型相关的独特亚群 | 研究仅基于鼻灌洗样本,可能无法完全代表下呼吸道或全身性炎症状态;样本量相对有限,且未涵盖所有哮喘亚型或健康对照组 | 优化单细胞RNA测序技术以改善粒细胞(尤其是嗜酸性粒细胞)在组织样本中的捕获,并探索儿童哮喘的免疫细胞异质性和炎症机制 | 儿童哮喘患者的鼻灌洗样本中的嗜酸性粒细胞、中性粒细胞及其他免疫细胞和上皮细胞 | 单细胞组学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 定制化数据处理流程(包括高级计算技术) | 单细胞转录组数据 | 儿童哮喘患者的鼻灌洗样本(具体数量未在摘要中明确说明) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Genomics Flex | 10× Genomics Flex平台结合定制化样本处理(如固定化以保持细胞质量) |
| 791 | 2026-01-25 |
Spatially resolved transcriptomics of benign and malignant peripheral nerve sheath tumors
2025-Sep-17, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf016
PMID:39847441
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研究论文 | 本研究应用空间转录组学技术分析良性和恶性外周神经鞘瘤,揭示其空间和生物学异质性 | 首次将空间转录组学应用于外周神经鞘瘤,构建了空间细胞分化图谱,并整合了组织学特征和单细胞数据 | 作为一项试点研究,样本量有限,未来需要更大规模验证 | 确定外周神经鞘瘤的空间和生物学异质性,以改善其分类和诊断 | 福尔马林固定石蜡包埋的患病外周神经组织样本 | 数字病理学 | 外周神经鞘瘤 | 空间转录组学 | 空间聚类和加权相关网络分析 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 792 | 2026-01-25 |
Comparative single-cell lineage tracing identifies distinct adipocyte precursor dynamics in skin and inguinal fat
2025-Aug-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.07.004
PMID:40744015
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序谱系追踪,比较了皮肤和腹股沟脂肪组织中脂肪前体细胞的动态差异 | 识别了未表征的未成熟前脂肪细胞群,揭示了脂肪前体细胞的不同分化潜能,并重新定义了皮肤脂肪组织中快速脂肪生成的细胞层次和分子机制 | NA | 比较皮肤和腹股沟脂肪组织中脂肪前体细胞的动态差异,以理解快速脂肪生成的机制 | 脂肪前体细胞(包括祖细胞和前脂肪细胞) | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 793 | 2026-01-25 |
SETDB1 ensures the continuity of embryonic to adult neural stem cells through metabolic alterations in the dentate gyrus
2025-Jul-29, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2424315122
PMID:40699919
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研究论文 | 本研究揭示了SETDB1通过调控代谢状态,确保胚胎神经祖细胞向成年神经干细胞(aNSCs)的连续性,防止其分化为星形胶质细胞 | 发现SETDB1通过靶向线粒体复合物成分COX6B2调控氧化磷酸化,从而控制aNSCs命运,防止星形胶质细胞分化 | NA | 探究胚胎神经祖细胞如何过渡为成年神经干细胞,同时避免星形胶质细胞命运,以维持aNSCs池 | 齿状回发育过程中的胚胎神经祖细胞和成年神经干细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 794 | 2026-01-25 |
Integration of single cell and bulk transcriptomic analyses identifies FAM189A2 as a key prognostic gene in lung cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1701806
PMID:41567189
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组分析,识别出FAM189A2作为肺癌的关键预后基因 | 结合单细胞RNA测序和批量转录组数据,构建了一个八基因LASSO-Cox风险模型,并在多个独立队列中验证,首次将FAM189A2鉴定为肺癌的潜在肿瘤抑制基因和生物标志物 | 研究样本量相对较小(13个原发性肺癌肿瘤),且主要基于回顾性数据,需要前瞻性研究进一步验证 | 探究肺癌恶性细胞状态与患者预后及治疗脆弱性的关联,并开发预后风险模型 | 肺癌肿瘤组织及匹配的正常肺组织细胞,以及外部验证队列中的肺癌患者数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | LASSO-Cox风险模型 | 转录组数据 | 13个原发性肺癌肿瘤及匹配正常组织(48,149个细胞),外加多个外部验证队列(GSE131907、TCGA-LUAD、GSE30219、GSE31210) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 795 | 2026-01-25 |
Decoding HSP90AA1-driven inflammatory signaling in the uveal melanoma microenvironment: an integrated analysis at single-cell resolution
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1730622
PMID:41567202
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研究论文 | 本研究通过整合计算生物学筛选与单细胞分辨率分析,解码了HSP90AA1作为葡萄膜黑色素瘤炎症和免疫微环境关键调节因子的作用 | 首次在单细胞分辨率下系统解析了HSP90AA1在葡萄膜黑色素瘤微环境中的表达谱和功能,揭示了其通过调控NF-κB、STAT3等炎症信号通路影响肿瘤进展的新机制 | 研究主要基于体外实验和动物模型,临床样本验证相对有限,且未深入探讨HSP90AA1抑制剂的具体治疗策略 | 识别和验证介导葡萄膜黑色素瘤炎症与免疫信号转导的关键分子调节因子,并探索其作为治疗靶点的潜力 | 葡萄膜黑色素瘤肿瘤微环境中的细胞群体,特别是恶性细胞、CD8+ T细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序,siRNA敲低,体外功能实验,体内异种移植模型 | 网络计算筛选模型 | 单细胞RNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 796 | 2026-01-25 |
Integrative analysis of bulk and single-cell transcriptomics identifies factors related to immunosuppressive microenvironment to predict unfavorable prognosis in inflammatory breast cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1727590
PMID:41567210
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研究论文 | 本研究通过整合分析bulk和单细胞转录组数据,识别了与免疫抑制微环境相关的因子,以预测炎性乳腺癌的不良预后 | 结合bulk和单细胞转录组学分析,揭示了GZMB和SPP1作为炎性乳腺癌中免疫抑制相关预后生物标志物的潜在作用,并明确了浆细胞样树突状细胞在重塑免疫抑制微环境中的关键角色 | 免疫组化分析的样本量极小,可能影响结果的可靠性 | 探究炎性乳腺癌肿瘤微环境的异质性及细胞间通讯,识别与免疫抑制微环境和不良预后相关的生物标志物 | 炎性乳腺癌和非炎性乳腺癌样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序, 免疫组化 | WGCNA | 转录组数据, 图像数据 | 未明确具体样本数量,但提及免疫组化分析基于极小的样本量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 797 | 2026-01-25 |
A review of omics studies in sarcopenia: from molecular mechanisms to hepatic-gut-muscle interactions in chronic liver disease comorbidity
2025, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2025.1710582
PMID:41568005
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综述 | 本文综述了肌少症的组学研究,从分子机制到慢性肝病共病中的肝-肠-肌肉相互作用,并提出了一个双层的“共性-特异性”框架 | 提出了一个双层的“共性-特异性”框架来解释肌少症的病理机制,并针对慢性肝病共病背景提出了“多弱信号协同累积”假说 | 目前组学研究结果多为相关性,对临床转化构成挑战,未来需要从静态分析转向动态机制解析 | 系统梳理肌少症的分子机制,并特别关注其在慢性肝病共病背景下的病理网络扰动 | 肌少症,以及慢性肝病相关的肌少症 | NA | 老年病 | 多组学技术 | NA | NA | 整合了10项肌少症组学研究和6项慢性肝病相关肌少症研究 | NA | 单细胞多组学,空间转录组学 | NA | NA |
| 798 | 2026-01-25 |
BMP4 dose dictates lineage specification bias in human periodontal ligament stem cells
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1738051
PMID:41568233
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和体外功能实验,系统探究了BMP4剂量如何调控人牙周膜干细胞向成骨和肌腱谱系的分化 | 首次在单细胞水平揭示了BMP4剂量依赖性调控人牙周膜干细胞谱系分化的双相动力学机制,并明确了BMP受体在成骨和肌腱分化中的特异性作用 | 研究主要基于体外实验,缺乏体内验证;样本量相对有限;未探讨其他可能影响分化的协同因子 | 探究BMP4剂量对人牙周膜干细胞谱系分化的调控机制,以优化基于PDLSC的牙周再生治疗策略 | 人牙周膜干细胞 | 单细胞转录组学 | 牙周疾病 | 单细胞RNA测序,体外功能实验 | NA | 单细胞转录组数据,体外实验数据 | 未明确具体样本数量,但涉及人牙周膜干细胞亚群分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 799 | 2026-01-25 |
Growth Hormone Alleviates Atherosclerosis Through Regulating the Activity of PI3K/AKT Pathway: Insights From Single-Cell Sequence and Mechanism Exploration
2025, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/9710652
PMID:41089172
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,探讨了生长激素通过调节PI3K/AKT通路活性缓解动脉粥样硬化的机制 | 结合单细胞RNA测序数据与机制探索,首次系统揭示了生长激素通过PI3K/AKT通路在动脉粥样硬化中的保护作用 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化需进一步验证;体外实验使用ox-LDL模拟损伤,可能与体内复杂环境存在差异 | 探究生长激素对动脉粥样硬化的影响及其分子机制 | 小鼠动脉血管平滑肌细胞、C57BL/6和ApoE-/-小鼠模型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, RNA测序, 液相色谱-质谱联用, 蛋白质印迹分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 代谢组学数据, 基因表达数据 | 小鼠动脉组织样本(包括健康与动脉粥样硬化组织),具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 800 | 2026-01-24 |
Protective IFIH1 variant reduces immune-mediated islet stress and dysfunction in a type 1 diabetes genetic background
2025-Dec-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.30.697107
PMID:41509220
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研究论文 | 本研究通过CRISPR-Cas9技术将IFIH1基因的保护性变异E627*和风险变异A946T引入1型糖尿病患者的干细胞衍生的胰岛中,探讨MDA5变异在胰岛应激和功能中的作用 | 首次在人类干细胞衍生的胰岛模型中,结合单细胞RNA测序和功能分析,揭示了MDA5保护性变异通过减弱应激介导的转录反应、减少细胞功能障碍和防止凋亡来保护胰岛细胞 | 研究基于单一T1D患者来源的干细胞模型,可能无法完全反映人群遗传多样性;体外模型可能无法完全模拟体内复杂环境 | 探究IFIH1基因变异在1型糖尿病发病机制中对胰岛细胞应激和功能的影响 | 人类多能干细胞衍生的胰岛(SC-islets)及其β、α和δ细胞亚群 | 单细胞组学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序,CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 单细胞转录组数据 | 基于T1D患者来源的hPSCs衍生的SC-islets | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |