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当前共找到 10542 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-07-13 |
Early developmental neuronal activity inhibits oligodendrocyte differentiation through AMPA receptor activation
2025-Oct-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.17.683139
PMID:41279286
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研究论文 | 本研究探讨早期神经元活动通过AMPA受体激活抑制少突胶质细胞分化 | 首次发现发育早期神经元活动抑制而非促进少突胶质细胞分化，并揭示AMPAR信号是关键调节因子 | 研究仅限于小鼠模型，且主要关注感觉诱发和化学遗传调控的神经元活动 | 探究发育早期神经元活动如何影响少突胶质细胞成熟 | 小鼠嗅球、体感皮层和胼胝体中的少突胶质细胞及神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠组织样本，具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 62 | 2026-07-13 |
Rethinking large-scale phylogenomics with EukPhylo v.1.0, a flexible toolkit to enable phylogeny-informed data curation and analyses of diverse eukaryotic lineages
2025-10-08, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01770-25
PMID:40862604
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研究论文 | 介绍EukPhylo v.1.0，一个模块化、用户友好的管道，用于通过系统发育信息进行数据筛选和分析多种真核生物谱系 | EukPhylo v.1.0 提供基于系统发育信息的污染去除、同源基因家族估计和多序列比对及基因树生成的模块化管道，并包含约15000个古代基因家族的Hook数据库，易于替换，提升了系统发育基因组分析的可重复性和灵活性 | 主要依赖单细胞测序数据，对于不可培养微生物谱系，污染问题仍然存在；最终树挑战了某些文献假说（如CRuMs、Obazoa、Diaphoretickes），需要更多数据验证 | 改进微生物真核生物的系统发育基因组分析，特别是不可培养谱系的数据筛选和污染去除 | 1000种多样真核生物、细菌和古菌中的500个保守基因家族 | 机器学习 | NA | 系统发育基因组分析、单细胞测序 | NA | 序列数据 | 1000种物种（包括真核生物、细菌和古菌）的500个保守基因家族 | NA | NA | NA | NA |
| 63 | 2026-07-13 |
ST6GALNAC1-mediated sialylation in uterine endometrial epithelium facilitates the epithelium-embryo attachment
2025-06, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.07.021
PMID:39111624
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研究论文 | 探究ST6GALNAC1介导的唾液酸化在子宫子宫内膜上皮中促进胚胎附着的作用 | 首次揭示ST6GALNAC1/sTn-Siglecs轴在胚胎着床中的功能，并鉴定了CD44作为sTn的载体分子 | 未明确说明，但可推测为研究主要基于体外模型和小鼠实验，人类样本分析有限 | 研究ST6GALNAC1和sTn-Siglecs轴在胚胎着床中的作用 | 人类和鼠类子宫内膜细胞及胚胎细胞 | 数字病理学 | 生殖系统疾病 | 免疫组化、免疫沉淀、质谱分析、单细胞RNA测序、蛋白质相互作用分析、RNA干扰 | NA | 图像、文本 | 人类子宫内膜组织样本（具体数目未提供）和鼠类模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 已发表的单细胞RNA测序数据集用于分析人类胚胎中的Siglec-6 |
| 64 | 2026-07-13 |
Single-cell transcriptomic profiling of heart reveals ANGPTL4 linking fibroblasts and angiogenesis in heart failure with preserved ejection fraction
2025-02, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.02.006
PMID:38346487
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示保留射血分数心力衰竭中心脏成纤维细胞与血管生成之间的联系及ANGPTL4的作用 | 首次在单细胞分辨率下系统解析了HFpEF心脏中细胞异质性和血管生成障碍的机制，发现成纤维细胞过度分泌ANGPTL4通过调控血管生成与内皮细胞谱系交叉作用 | 基于小鼠模型，需在人体组织中验证；ANGPTL4作为药物靶点的预测基于计算方法，需进一步功能验证 | 揭示保留射血分数心力衰竭的细胞异质性和潜在病理机制 | HFpEF小鼠模型的心脏组织，重点研究成纤维细胞和内皮细胞谱系 | N/A | 心血管疾病 | 单细胞测序, 批量RNA测序, 免疫组织化学, 免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据, 图像 | 小鼠心脏组织样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 65 | 2026-07-13 |
The role of fibroblast in chronic rhinosinusitis with nasal polyps: a key player in the inflammatory process
2025-02, Expert review of clinical immunology
IF:3.9Q2
DOI:10.1080/1744666X.2024.2414774
PMID:39378160
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综述 | 综述了成纤维细胞在慢性鼻窦炎伴鼻息肉中通过产生细胞外基质、引发和加剧炎症反应的关键作用，并利用单细胞RNA测序数据探讨了其异质性和功能机制 | 强调了鼻息肉源性成纤维细胞在触发和加剧炎症反应中的关键角色，并通过单细胞RNA测序数据深入探索了成纤维细胞的异质性和功能机制，指出其作为治疗靶点的潜力 | 尽管单细胞RNA测序为靶向和清除病理成纤维细胞亚群提供了方向，但成纤维细胞靶向疗法在临床开发中仍面临挑战 | 总结鼻息肉源性成纤维细胞在慢性鼻窦炎伴鼻息肉组织重塑和炎症反应中的关键作用，并评估其作为治疗靶点的潜力 | 鼻息肉源性成纤维细胞（NPDFs） | 自然语言处理 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 66 | 2026-07-10 |
Piezo1 promotes colitis progression by modulating the Nrf2/NF-κB/NLRP3 signaling pathway
2025-Dec, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2025.117293
PMID:40886854
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研究论文 | 该研究探讨了机械敏感离子通道Piezo1通过调节Nrf2/NF-κB/NLRP3信号通路促进结肠炎进展的机制 | 首次揭示Piezo1通过机械感知特性调控Nrf2/NF-κB/NLRP3信号通路在结肠炎发展中的作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类IBD患者中验证，Piezo1介导机械信号的具体分子机制仍需进一步阐明 | 探究Piezo1在肠道炎症病理生理中的作用及其对Nrf2/NF-κB/NLRP3信号通路的调节机制 | 野生型和Piezo1Lyz2溃疡性结肠炎小鼠模型的结肠组织及巨噬细胞 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞测序， RNA测序 | NA | 基因表达数据， 图像 | 小鼠结肠组织样本及巨噬细胞样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA-seq， 批量RNA-seq | NA | NA |
| 67 | 2026-07-10 |
Multi-omic profiling reveals age-related immune dynamics in healthy adults
2025-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09686-5
PMID:41162704
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研究论文 | 通过对300多名健康成年人进行单细胞RNA测序、蛋白质组学和流式细胞术等多组学分析，揭示了年龄相关的免疫动态变化 | 发现了年龄相关的T细胞亚群非线性转录重编程，且该过程不由系统性炎症或慢性巨细胞病毒感染驱动，并揭示了记忆T细胞中T2细胞偏向性功能与流感疫苗中高度增强抗原的B细胞反应失调相关 | 未明确提及局限性 | 研究年龄如何影响外周免疫的组成和状态，以及免疫衰老的机制 | 300多名健康成年人（25至90岁），其中96人接受为期2年的纵向季节性流感疫苗接种随访 | 单细胞组学 | 免疫衰老 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质组数据、流式细胞术数据 | 300多名健康成年人（16百万以上外周血单核细胞，71个免疫细胞亚群），96人纵向随访 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 68 | 2026-07-10 |
Structural and functional characteristics of local immune memory formation in SARS-CoV-2-infected cynomolgus macaques
2025-Dec, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2025.110589
PMID:40882689
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研究论文 | 使用单细胞RNA测序、空间转录组学和免疫检测技术，研究SARS-CoV-2奥密克戎感染的非人灵长类动物模型中局部免疫记忆的形成机制 | 首次在非人灵长类动物模型中揭示iBALT形成功能性三级淋巴结构及其在SARS-CoV-2感染后局部免疫记忆中的作用 | 样本量有限，且仅针对奥密克戎变种，未涵盖其他SARS-CoV-2变种 | 探究SARS-CoV-2感染后肺部局部免疫记忆的结构和功能特征 | SARS-CoV-2奥密克戎感染的食蟹猴 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,免疫检测 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据,免疫检测数据 | 非人灵长类动物（食蟹猴）样本，具体数量未提供 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium,10x Visium | 10x Chromium 单细胞RNA测序，10x Visium 空间转录组学 |
| 69 | 2026-07-10 |
Exploring the toxicological impact of 6PPDQ exposure on psoriasis through network toxicology, machine learning, and multidimensional bioinformatics analysis
2025-Dec-01, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2025.127291
PMID:41120051
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研究论文 | 通过网络毒理学、机器学习和多维生物信息学分析，探究轮胎抗氧化剂衍生物6PPDQ暴露对银屑病的毒性影响 | 首次结合网络毒理学框架、机器学习（LASSO和SVM-RFE）及单细胞RNA测序数据，系统揭示6PPDQ通过核心基因（如NR3C1）调控免疫炎症通路（如IL-23/Th17轴）加重银屑病的机制，并建立了不良结局通路模型 | 研究基于计算预测和公开数据集，缺乏体内外实验验证；分子对接和动力学模拟未考虑代谢物或实际环境暴露浓度的影响 | 探索环境污染物6PPDQ暴露与银屑病发病之间的潜在关联及分子机制 | 6PPDQ与银屑病重叠的290个靶点基因，以及通过机器学习筛选的四个核心基因（CD3D、IRF7、NR3C1、HDAC1） | 机器学习和生物信息学 | 银屑病 | 网络毒理学、机器学习（LASSO和SVM-RFE）、基因本体论和KEGG通路分析、免疫浸润分析、单细胞RNA-seq、分子对接、分子动力学模拟 | LASSO回归和SVM-RFE模型 | 基因表达数据和单细胞RNA-seq数据 | 使用公开数据集GSE13355（银屑病转录组样本），具体样本量未在标题和摘要中明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 70 | 2026-07-10 |
Mapping the tumor immune landscape: single-cell RNA sequencing in cancer immunotherapy
2025-Nov-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.218012
PMID:40889736
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综述 | 系统总结了单细胞RNA测序在肿瘤免疫微环境研究中的分析流程、最佳实践及新兴应用与挑战 | 全面梳理了scRNA-seq在肿瘤免疫治疗中的核心分析工作流及数据处理最佳实践 | 未提及具体局限性 | 探讨scRNA-seq在肿瘤免疫微环境研究和转化肿瘤学中的应用 | 肿瘤免疫微环境中的免疫细胞状态和细胞间相互作用 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 71 | 2026-07-10 |
Insights into the lactylation-immune regulatory axis as a mechanistic bridge in migraine pathophysiology
2025-Nov-18, The journal of headache and pain
IF:7.3Q1
DOI:10.1186/s10194-025-02208-8
PMID:41254496
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评论 | 对一篇关于乳酰化-免疫调节轴在偏头痛病理生理学中作用的多组学孟德尔随机化研究提出四个方面的澄清请求 | 通过多组学孟德尔随机化框架首次将乳酰化-免疫介导通路与偏头痛风险联系起来，并提名EP300、SIRT1和SLC16A1为潜在因果驱动因子 | 未能明确EP300和SIRT1在多组学修饰中的特异性、外周与中枢免疫的权重比较、单细胞RNA测序中SIRT1和SLC16A1的差异表达在样本量或技术层面可能存在的局限性，以及该通路在不同偏头痛亚型中的临床异质性有待探索 | 澄清乳酰化-免疫调节轴在偏头痛中的机制，并为生物标志物选择和转化研究提供指导 | 偏头痛相关的乳酰化修饰、免疫细胞表型（B细胞和NKT细胞）及基因（EP300、SIRT1、SLC16A1） | 机器学习和生物信息学 | 偏头痛 | 多组学孟德尔随机化、单细胞RNA测序 | 孟德尔随机化模型 | 基因表达数据、免疫细胞表型数据 | 未明确提及，但包括外周血单细胞RNA测序样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 72 | 2026-07-10 |
Paired single-cell and spatial transcriptional profiling reveals a central osteopontin macrophage response mediating tuberculous granuloma formation
2025-09-10, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01559-25
PMID:40772762
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研究论文 | 通过配对单细胞和空间转录组测序揭示了骨桥蛋白巨噬细胞在结核肉芽肿形成中的核心作用 | 首次结合单细胞与空间转录组分析，绘制了人类结核肉芽肿的细胞转录层结构，并鉴定出SPP1/骨桥蛋白表达的巨噬细胞为关键调节细胞群 | 样本数量有限，且主要依赖于活检组织，可能无法完全代表肉芽肿的动态发展过程 | 解析结核肉芽肿的细胞组成、空间组织及分子调控机制 | 结核病患者活检组织中的肉芽肿 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序，空间转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 多名结核病患者活检标本 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组测序 | NA | NA |
| 73 | 2026-07-10 |
Defining the host dependencies and the transcriptional landscape of RSV infection
2025-09-10, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01010-25
PMID:40815167
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研究论文 | 该论文结合全基因组CRISPR敲除筛选和单细胞RNA测序，解析呼吸道合胞病毒（RSV）感染中宿主依赖性因素及转录组景观 | 首次联合CRISPR筛选和单细胞测序，揭示RSV感染细胞与旁观者细胞的差异转录模式，并系统比较29个已发表筛选结果 | 未提供具体局限性说明 | 阐明RSV感染的宿主决定因素及宿主应答的细胞类型特异性转录特征 | RSV感染的宿主细胞及未感染旁观者细胞 | 机器学习 | 呼吸道合胞病毒感染 | CRISPR敲除筛选, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 29个已发表筛选研究（覆盖17种病毒的交叉分析） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3'测序平台 |
| 74 | 2026-07-10 |
AP2X-1 is a negative regulator of Toxoplasma gondii sexual commitment
2025-09-10, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00052-25
PMID:40823841
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研究论文 | 本研究揭示了AP2X-1是弓形虫有性发育的关键负调控因子，通过调节HDAC3/MORC复合体功能抑制缓殖子分化和有性转化 | 首次发现AP2X-1作为负调控因子控制弓形虫有性发育，阐明其通过影响染色质可及性和HDAC3/MORC复合体功能的新机制 | 未明确AP2X-1与HDAC3/MORC复合体相互作用的分子细节，且体内实验仅局限于小鼠模型 | 探究弓形虫生命周期转换的调控机制，特别是有性发育的负调控因子 | 弓形虫AP2X-1基因及其在速殖子、缓殖子、裂殖子阶段的表达和功能 | 分子生物学 | 弓形虫病 | 单细胞测序, CUT&Tag, ATAC-seq, 基因敲除 | NA | 测序数据, 基因表达数据 | 弓形虫野生型及AP2X-1敲除株, 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 75 | 2026-07-10 |
Defining the host dependencies and the transcriptional landscape of RSV infection and bystander activation
2025-Aug-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.26.645108
PMID:40196489
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研究论文 | 结合CRISPR筛选和单细胞RNA测序，揭示RSV感染和旁观者激活的宿主依赖性和转录景观 | 首次将全基因组CRISPR敲除筛选与单细胞RNA测序结合，系统解析RSV感染细胞与未感染旁观者细胞中不同的宿主反应和转录模式 | 未明确提及，但可能限于体外实验模型，需要进一步验证 | 理解RSV感染的宿主决定因素及感染细胞和未感染旁观者细胞的宿主反应 | RSV感染的细胞和未感染的旁观者细胞 | 机器学习和基因组学 | 呼吸道合胞病毒感染 | CRISPR敲除筛选，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 全基因组CRISPR筛选和单细胞RNA测序数据集 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 76 | 2026-07-10 |
Rethinking eco-evo studies of gene expression for non-model organisms in the genomic era
2025-08, Molecular ecology
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/mec.17378
PMID:38721834
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评论 | 本文回顾了长读长测序和单细胞RNA测序等新兴基因组技术在对非模式生物进行生态基因组学研究中的潜力与影响 | 强调将长读长测序与单细胞RNA测序结合用于非模式生物，以解决传统批量RNA-seq无法捕捉稀有细胞类型表达和细胞组成变化的问题 | 未提及具体实验验证或量化技术限制，可能依赖未来技术成熟度 | 探讨基因组技术如何推动非模式生物基因表达的生态与进化研究 | 非模式生物（生态基因组学研究中的物种） | 机器学习 | NA | 长读长测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 短读长RNA测序 | NA | NA |
| 77 | 2026-07-10 |
Integrated ultrasensitive metabolomics and single-cell transcriptomics identify crucial regulators of sheep oocyte maturation and early embryo development in vitro
2025-07, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.08.040
PMID:39233000
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研究论文 | 利用超灵敏代谢组学和单细胞转录组学整合分析，识别绵羊卵母细胞体外成熟和早期胚胎发育的关键调节因子 | 首次通过超灵敏代谢组学和单细胞RNA-seq整合分析，在微量样本中鉴定出体外培养系统中缺失的关键代谢物（甜菜碱、肉碱和肌酸），并验证其补充能显著提高囊胚形成率 | 未明确说明具体局限性，但研究仅针对绵羊，可能需验证其他物种；机制探索基于组学分析，需进一步功能验证 | 提高绵羊卵母细胞体外发育能力，识别并补充培养系统中缺失的关键代谢物 | 绵羊卵母细胞和早期胚胎 | 数字病理学 | NA | 超灵敏代谢组学、单细胞RNA-seq | NA | 代谢组学数据、转录组学数据 | 微量样本（卵母细胞、胚胎、卵泡液、输卵管液、体外培养系统） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 超灵敏代谢组学分析（基于微量样本） |
| 78 | 2026-07-10 |
Interrogating mediators of single-cell transcriptional changes in the acute damaged cerebral cortex: Insights into endothelial-astrocyte interactions
2025-06, Molecular and cellular neurosciences
DOI:10.1016/j.mcn.2025.104003
PMID:40090391
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序研究急性损伤大脑皮层中内皮细胞EphA4敲除对星形胶质细胞转录组变化的影响，揭示了内皮-星形胶质细胞相互作用的介导机制 | 首次通过内皮细胞特异性EphA4敲除模型结合单细胞RNA测序，系统解析了创伤性脑损伤后内皮细胞与星形胶质细胞之间的细胞特异性互作机制，并验证了一个新的Sox9+/Mertk+星形胶质细胞簇在凋亡细胞清除和抗炎反应中的介导作用 | 未提及具体局限性，但可能包括实验模型（小鼠）与人类的差异、单细胞测序覆盖深度有限、仅关注急性期变化等 | 探究内皮细胞EphA4受体在调节受损大脑皮层中细胞特异性转录组变化中的作用，特别关注内皮-星形胶质细胞互作 | 实验性创伤性脑损伤小鼠模型中的内皮细胞和星形胶质细胞 | 数字病理学 | 创伤性脑损伤（神经系统疾病） | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA（未明确样本数量，但涉及小鼠内皮细胞特异性EphA4敲除组与对照组） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 79 | 2026-07-10 |
Systematic evaluation of single-cell RNA-seq analyses performance based on long-read sequencing platforms
2025-05, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.05.020
PMID:38782298
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研究论文 | 系统评估基于长读长测序平台的单细胞RNA测序分析性能 | 首次系统比较Oxford Nanopore Technologies (ONT)和Pacific Biosciences (PacBio)两种第三代测序技术在单细胞RNA测序分析中的性能，并使用NGS作对照评估其在细胞类型鉴定、新异构体识别和等位基因特异性表达方面的表现 | 未明确提及限制 | 系统性评估ONT和PacBio平台在单细胞RNA-seq分析中的性能，为单细胞转录组研究设计测序策略提供指导 | 来自相同单细胞cDNA文库的不同数量细胞 | 数字病理学 | 不适用 | 单细胞RNA测序, 长读长测序 | 不适用 | 基因表达数据 | 不同数量细胞的单细胞cDNA文库 | Oxford Nanopore Technologies, Pacific Biosciences | 单细胞RNA测序 | ONT, PacBio | ONT长读长测序平台, PacBio长读长测序平台 |
| 80 | 2026-07-10 |
Life-long microbiome rejuvenation improves intestinal barrier function and inflammaging in mice
2025-04-02, Microbiome
IF:13.8Q1
DOI:10.1186/s40168-025-02089-8
PMID:40176137
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研究论文 | 通过长期肠道微生物组年轻化干预，评估其对小鼠肠道屏障功能和炎症老化的改善作用 | 首次在非反刍哺乳动物中证明终生反复粪菌移植（FMT）可延缓衰老相关过程，并利用单细胞RNA测序揭示肠道细胞表型变化机制 | 研究仅在小鼠模型中进行，结果向人类转化的可行性尚未验证；未对特定细菌菌株或代谢产物进行因果验证 | 探索终生肠道微生物组年轻化策略是否能够延缓或预防哺乳动物的衰老进程 | 小鼠（年轻供体与同龄受体） | 机器学习, 数字病理学 | 老年疾病 | 粪菌移植（FMT）, 16S rRNA基因测序, 宏基因组学, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 微生物组数据 | 小鼠，具体数量未在摘要中提及 | NA | 单细胞RNA测序, 16S rRNA基因测序, 宏基因组学 | NA | NA |