单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 10780 篇文献，本页显示第 7841 - 7860 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7841 | 2025-10-06 |
Lipoxin A4/FPR2 Signaling Mitigates Ferroptosis of Alveolar Epithelial Cells via NRF2-Dependent Pathway During Lung Ischemia-Reperfusion Injury
2025-Apr-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202401475R
PMID:40270323
|
研究论文 | 本研究探讨脂氧素A4通过FPR2受体激活NRF2通路抑制肺泡上皮细胞铁死亡，从而减轻肺缺血再灌注损伤的机制 | 首次揭示脂氧素A4/FPR2信号通路通过NRF2依赖性途径调控肺泡上皮细胞铁死亡在肺缺血再灌注损伤中的保护作用 | 研究主要基于小鼠模型，在人体中的直接验证尚需进一步研究 | 探究铁死亡在肺缺血再灌注损伤中的作用及脂氧素A4的保护机制 | 肺移植患者样本、C57BL/6野生型小鼠、Fpr2和Nrf2基因敲除小鼠、肺泡II型上皮细胞 | 生物医学研究 | 肺缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序、小鼠肺门结扎模型、小鼠原位肺移植模型、体外细胞实验 | 基因敲除动物模型、细胞模型 | 基因表达数据、生理指标数据、生化指标数据 | 未明确样本数量，包含患者组织样本、多种基因型小鼠和细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7842 | 2025-10-06 |
Vagal Sensory Gut-Brain Pathways That Control Eating-Satiety and Beyond
2025-Apr, Comprehensive Physiology
IF:4.2Q1
DOI:10.1002/cph4.70010
PMID:40229922
|
综述 | 本文挑战了迷走神经仅传递饱腹信号的传统观点，系统阐述了迷走神经作为整合餐食信息的复杂感觉系统 | 揭示了迷走神经传入神经元具有专门亚群和多样感觉模式，能够主动编码餐食相关信息的多个方面 | 作为综述文章，未进行原始实验研究，主要基于现有文献整合分析 | 探讨迷走神经感觉通路在肠脑通讯中的多重功能 | 迷走神经传入神经元及其下游脑回路 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学、神经回路映射、功能成像 | NA | 文献证据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7843 | 2025-10-06 |
Single-cell omics technologies - Fundamentals on how to create single-cell looking glasses for reproductive health
2025-Apr, American journal of obstetrics and gynecology
IF:8.7Q1
DOI:10.1016/j.ajog.2024.08.041
PMID:40253074
|
综述 | 本文综述单细胞组学技术在生殖健康研究中的应用进展 | 系统整合单细胞测序、空间转录组学和高维蛋白质组成像等多种技术，为生殖医学提供多维视角 | 未涉及具体实验数据验证，主要基于文献综述 | 探讨单细胞技术在生殖健康领域的临床应用前景 | 生殖道组织、胎儿发育、妊娠过程和妇科疾病 | 单细胞组学 | 妇科疾病、妊娠并发症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 蛋白质组成像 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 空间位置数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 7844 | 2025-10-06 |
Contribution of germline and somatic mutations to risk of neuromyelitis optica spectrum disorder
2025-Mar-12, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100776
PMID:39986280
|
研究论文 | 本研究通过基因组关联分析和单细胞RNA测序，揭示了种系和体细胞突变在视神经脊髓炎谱系障碍发病机制中的作用 | 首次整合种系变异和体细胞嵌合染色体变异分析，发现CCR6风险变异和21q缺失在NMOSD中的致病机制 | 样本量相对有限（240例患者），主要基于日本人群，可能限制结果的普适性 | 探索视神经脊髓炎谱系障碍的遗传背景和发病机制 | 日本人群中的NMOSD患者和健康对照 | 基因组学 | 自身免疫性疾病 | 全基因组关联分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | 基因组分析：240例患者和50,578例对照；单细胞RNA测序：25例患者和101例对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7845 | 2025-10-06 |
EfficientNet-resDDSC: A Hybrid Deep Learning Model Integrating Residual Blocks and Dilated Convolutions for Inferring Gene Causality in Single-Cell Data
2025-Mar, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-024-00667-2
PMID:39578307
|
研究论文 | 提出一种结合残差块和空洞卷积的混合深度学习模型EfficientNet-resDDSC，用于从单细胞数据推断基因因果关系 | 在EfficientNet-B0基础上引入残差块增强低层特征提取能力，结合深度可分离卷积和空洞卷积扩大感受野而不增加计算量 | NA | 构建基因调控网络以揭示基因间的因果关系 | 单细胞RNA测序数据中的基因调控关系 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | EfficientNet, 残差网络, 空洞卷积, 深度可分离卷积 | 单细胞基因表达数据 | 四个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7846 | 2025-10-06 |
Association of 5α-reductase inhibitor prescription with immunotherapy efficacy in metastatic renal cell carcinoma: a multicenter retrospective analysis
2025-Feb-25, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-011154
PMID:40010773
|
研究论文 | 本研究探讨5α-还原酶抑制剂使用史对转移性肾细胞癌患者免疫检查点抑制剂疗效的影响 | 首次在临床回顾性研究中证实5α-还原酶抑制剂可通过调节CD8+ T细胞功能增强免疫治疗效果 | 回顾性研究设计存在选择偏倚，样本量相对有限（185例患者） | 评估5α-还原酶抑制剂使用史对转移性肾细胞癌免疫治疗疗效的影响 | 185例接受免疫检查点抑制剂治疗的转移性肾细胞癌患者 | 肿瘤免疫学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序，Cox比例风险模型 | Cox回归模型 | 临床回顾性数据，单细胞RNA测序数据 | 185例转移性肾细胞癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7847 | 2025-10-06 |
Brain-wide cell-type-specific transcriptomic signatures of healthy ageing in mice
2025-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08350-8
PMID:39743592
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序系统描绘小鼠大脑在健康衰老过程中细胞类型特异性转录组变化 | 提供了首个涵盖全脑区域、包含约120万个高质量单细胞转录组的衰老数据集，识别了847个细胞簇和14个年龄偏向性胶质细胞簇 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及人类样本；主要关注转录组水平变化，缺乏功能验证 | 系统解析健康衰老过程中大脑细胞类型特异性转录组变化 | 年轻和年老雌雄小鼠的大脑细胞，涵盖前脑、中脑和后脑区域 | 单细胞转录组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约120万个高质量单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7848 | 2025-10-06 |
Single-cell analyses of intestinal epithelium reveal the dysregulation of gut immune microenvironment in systemic lupus erythematosus
2025-Jan-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06147-5
PMID:39871323
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示系统性红斑狼疮中肠道上皮免疫微环境的失调机制 | 首次在狼疮背景下构建肠道上皮的高分辨率单细胞图谱，发现CD8αα+ IELs减少、CD8αβ+ IELs增加以及γδT细胞减少与氧化应激和铁死亡的关联 | 研究主要基于MRL/Lpr小鼠模型，人类样本验证尚需进一步研究 | 探究系统性红斑狼疮中肠道免疫微环境的失调机制 | MRL/Lpr狼疮小鼠和MRL/Mpj对照小鼠的肠道上皮细胞 | 单细胞组学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序，qPCR，流式细胞术，体内实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 狼疮小鼠和对照小鼠的肠道上皮样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7849 | 2025-05-23 |
Author Correction: Uncovering functional lncRNAs by scRNA-seq with ELATUS
2025-Jan-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55730-9
PMID:39774948
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7850 | 2025-10-06 |
Self and parasite-derived peptides selected upon DERAA-bearing HLA-DRB1 alleles activate CD4+ T cells from Chagas cardiomyopathy patients and are associated with ventricular dysfunction
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1527115
PMID:40391216
|
研究论文 | 本研究揭示了携带DERAA基序的HLA-DRB1等位基因在查加斯心肌病患者中通过呈递宿主和寄生虫来源的肽段激活CD4+ T细胞，并与心室功能障碍相关 | 首次发现特定HLA-DRB1等位基因通过交叉反应性肽段激活致病性CD4+ T细胞，并建立其与心肌纤维化和心室功能障碍的直接关联 | 样本量有限，需要更大规模研究验证；机制研究尚未完全阐明T细胞活化的具体信号通路 | 探究HLA-DRB1等位基因在查加斯心肌病发病机制中的作用 | 查加斯病患者（包括无症状期和心肌病期患者）的CD4+ T细胞和心脏组织 | 免疫学 | 查加斯心肌病 | 计算分析、体外功能实验、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、功能实验数据、临床数据 | 查加斯病患者（包括IND和CCC两组） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7851 | 2025-10-06 |
Comprehensive Single-Cell RNA Sequencing Analysis of Cervical Cancer: Insights Into Tumor Microenvironment and Gene Expression Dynamics
2025, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/5027347
PMID:40395456
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析宫颈癌的肿瘤微环境和基因表达动态 | 首次在宫颈癌中应用大规模单细胞RNA测序技术揭示细胞异质性和基因表达动态 | NA | 探索宫颈癌的肿瘤微环境特征和基因表达动态 | 宫颈癌样本 | 生物信息学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | 细胞聚类分析、伪时间分析、基因共表达网络分析 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7852 | 2025-10-06 |
Pan-cancer analysis of phagocytosis regulators in female-specific cancers: a focus on HMGB2
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1565924
PMID:40396172
|
研究论文 | 通过对女性特有癌症中吞噬作用调节因子的泛癌分析，重点关注HMGB2的功能机制 | 首次系统分析女性特有癌症中吞噬作用调节因子的表达特征，并验证HMGB2在调控肿瘤细胞增殖、迁移和巨噬细胞吞噬功能中的关键作用 | 基于公共数据库的分析可能存在数据异质性，体外实验需要进一步体内验证 | 探索吞噬作用调节因子在女性特有癌症中的分子机制和临床意义 | 女性特有癌症（乳腺癌、宫颈癌、卵巢癌、子宫内膜癌） | 生物信息学 | 女性特有癌症 | 单细胞测序、DNA甲基化分析、体外功能验证 | NA | 基因组数据、转录组数据、表观遗传数据 | 公共数据库中的多癌种样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7853 | 2025-10-06 |
Integrative single-cell and spatial transcriptomics analysis reveals MDK-NCL pathway's role in shaping the immunosuppressive environment of lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1546382
PMID:40396179
|
研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组学分析揭示MDK-NCL通路在肺腺癌免疫抑制微环境形成中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序数据，系统揭示了MDK-NCL信号轴在肺腺癌免疫抑制微环境形成中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库数据，实验验证样本量有限，需要进一步的功能实验验证机制 | 研究肺腺癌肿瘤微环境的细胞组成及MDK-NCL信号通路的作用 | 肺腺癌组织样本及配对癌旁正常组织 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序,实时PCR,Western blotting | Seurat,inferCNV,MCPcounter,Niches | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,批量转录组数据 | TCGA-LUAD队列和内部队列的肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |
| 7854 | 2025-10-06 |
Application of Cellular Indexing of Transcriptomes and Epitopes by Sequencing (CITE-Seq) to Precisely Dissect the Brain Tumor Immune Microenvironment
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4558-1_3
PMID:40402445
|
研究论文 | 应用CITE-Seq技术精确解析脑肿瘤免疫微环境 | 将CITE-Seq技术应用于脑肿瘤研究，同时获取单细胞转录组和表面蛋白信息 | NA | 精确解析脑肿瘤免疫微环境的细胞组成和功能 | 脑肿瘤微环境中的恶性细胞、免疫细胞、星形胶质细胞和其他基质细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | CITE-Seq, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表位数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 7855 | 2025-10-06 |
Immune Single-Cell Annotation by Molecular Signature-Based Deconvolution with MIXTURE
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4558-1_13
PMID:40402455
|
研究论文 | 提出基于MIXTURE算法的单细胞RNA测序注释协议，用于改善肿瘤免疫微环境中细胞类型的识别 | 使用v-SVR反卷积算法MIXTURE解决无监督注释方法的局限性，提供更精确的细胞类型注释和组成分析 | NA | 优化单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别，以解析肿瘤免疫微环境和改进免疫治疗策略 | 黑色素瘤单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | v-SVR反卷积算法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7856 | 2025-10-06 |
Deciphering the Premetastatic Lymphatic Niche of Oral Squamous Cell Carcinoma
2025-Jun, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345241307894
PMID:40082761
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了口腔鳞状细胞癌转移前淋巴结生态位的细胞结构，发现并验证了CD4+ Tex-pre细胞在塑造免疫抑制转移前环境中的作用 | 首次在口腔鳞癌转移前淋巴结中鉴定出具有前衰竭状态的CD4+ T细胞亚群，并证明其促进淋巴结转移的机制 | 研究主要基于小鼠模型和有限的患者样本，需要更大规模临床验证 | 探索口腔鳞状细胞癌转移前淋巴结生态位的细胞组成和免疫抑制机制 | 口腔鳞状细胞癌患者的转移前肿瘤引流淋巴结和对侧淋巴结 | 单细胞组学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，RNAscope原位染色，计算机分析，体内实验 | NA | 单细胞RNA测序数据，bulk RNA测序数据，图像数据 | OSCC患者的淋巴结样本（包括转移前肿瘤引流淋巴结和配对对侧淋巴结） | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 7857 | 2025-10-06 |
Antioxidant interventions reduced cytokine-induced pyroptosis of peripheral MAIT cells in patients with HBV-related cirrhosis
2025-Jun-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000714
PMID:40377492
|
研究论文 | 本研究探讨了HBV相关肝硬化患者外周血MAIT细胞减少的特征及机制，发现细胞焦亡是主要因素，抗氧化干预可减轻此过程 | 首次揭示细胞焦亡是HBV相关肝硬化中MAIT细胞减少的关键机制，并证明抗氧化剂可有效干预 | 样本量有限（60例），缺乏长期随访数据 | 探究HBV相关肝硬化患者MAIT细胞耗竭的特征和机制 | 20名健康对照者和40名HBV相关肝硬化患者（代偿期20例，失代偿期20例） | 免疫学 | 乙型肝炎肝硬化 | 流式细胞术，单细胞RNA测序，多重免疫荧光，ELISA | NA | 单细胞RNA测序数据，流式细胞数据，免疫荧光图像，蛋白浓度数据 | 60例样本（20健康对照+40患者） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7858 | 2025-10-06 |
Single-cell analyses unravel ecosystem dynamics and intercellular crosstalk during gallbladder cancer malignant transformation
2025-Jun-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000697
PMID:40377484
|
研究论文 | 通过单细胞分析揭示胆囊癌恶性转化过程中的生态系统动态和细胞间通讯 | 首次构建了从正常组织到高级别上皮内瘤变再到侵袭性胆囊癌的单细胞图谱，揭示了TOP2A+上皮细胞亚型与免疫抑制巨噬细胞的关键作用 | 样本量相对有限（10个样本），需要更大队列验证发现 | 探索胆囊癌恶性转化过程中的细胞和分子变化，识别早期生物标志物和治疗靶点 | 胆囊组织样本，包括正常邻近组织、高级别上皮内瘤变和胆囊癌组织 | 单细胞生物学 | 胆囊癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，多重免疫荧光染色 | 10种机器学习方法 | 单细胞转录组数据，bulk RNA-seq数据，图像数据 | 98,113个细胞，来自2个正常组织、2个HGIN和6个GBC样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7859 | 2025-10-06 |
Spatiotemporal single-cell analysis elucidates the cellular and molecular dynamics of human cornea aging
2025-May-19, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01475-z
PMID:40390022
|
研究论文 | 通过单细胞时空分析揭示人类角膜衰老过程中的细胞和分子动态变化 | 首次构建人类角膜时空单细胞图谱，发现角膜上皮细胞的'时空向心迁移模式'新范式 | 样本量有限（8个供体），年龄跨度较大（33-88岁） | 阐明人类角膜衰老过程中的细胞和分子机制 | 人类角膜组织 | 单细胞组学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序, 免疫荧光染色, Western blotting | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 8个供体的角膜组织（年龄33-88岁） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | scStereo-seq | 单细胞空间增强分辨率组学测序 |
| 7860 | 2025-05-22 |
Corrigendum to "Deciphering the cell type-specific and zonal distribution of drug-metabolizing enzymes, transporters, and transcription factors in livers of mice using single-cell transcriptomics"
2025-May-19, Drug metabolism and disposition: the biological fate of chemicals
DOI:10.1016/j.dmd.2025.100088
PMID:40393347
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |