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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7821 | 2025-10-06 |
Cutaneous granulomas: mechanisms, cellular interactions and therapeutic insights
2025-May-19, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf096
PMID:40080709
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综述 | 本文系统综述皮肤肉芽肿的形成机制、细胞相互作用及治疗前景 | 重点关注TREM2+巨噬细胞在肉芽肿形成中的作用及单细胞RNA测序技术揭示的细胞异质性 | 肉芽肿形成的精确过程及其功能意义仍不明确 | 探讨肉芽肿的本质及其在皮肤疾病中的形成机制 | 皮肤肉芽肿及相关疾病(结节病、环状肉芽肿、结核、麻风等) | NA | 皮肤肉芽肿性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7822 | 2025-05-20 |
Scar-associated macrophages and biliary epithelial cells interaction exacerbates hepatic fibrosis in biliary atresia
2025-May-18, Pediatric research
IF:3.1Q1
DOI:10.1038/s41390-025-04100-2
PMID:40383871
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间定位数据,揭示了胆道闭锁(BA)肝脏中疤痕相关巨噬细胞(SAMs)和胆道上皮细胞(BECs)的相互作用如何加剧肝纤维化 | 首次发现SAMs通过调节BECs的上皮-间质转化(EMT)促进肝纤维化进展,并识别出BA诊断的生物标志物 | 样本量较小(仅8例组织样本),且缺乏长期随访数据验证治疗效果 | 探究BA肝脏微环境变化及其在肝纤维化中的作用机制 | 胆道闭锁患者的肝脏组织 | 单细胞转录组学 | 胆道闭锁 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 8例肝脏组织(2例正常组织,2例胆总管囊肿组织,4例BA组织) | NA | NA | NA | NA |
| 7823 | 2025-10-06 |
New insights into tumor microenvironment and HPV integrations in cervical cancer pathogenesis revealed by single-cell transcriptome data
2025-May-17, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddaf027
PMID:40151001
|
研究论文 | 通过单细胞转录组数据分析宫颈癌肿瘤微环境和HPV整合事件 | 开发了从单细胞RNA测序数据识别HPV整合事件的方法,发现了新的HPV重复整合基因 | 样本量相对有限,仅分析了特定疾病阶段的患者 | 研究宫颈癌发病机制中细胞异质性与HPV整合的关联 | 正常患者和三个疾病阶段(HSIL、MIC、CSCC)的宫颈组织 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 正常患者和三个疾病阶段患者的宫颈组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7824 | 2025-10-06 |
Engineering sonogenetic EchoBack-CAR T cells
2025-May-15, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.02.035
PMID:40179881
|
研究论文 | 开发了可通过聚焦超声激活的声遗传学EchoBack-CAR T细胞,用于实体瘤治疗 | 通过筛选超敏感热休克启动子库并结合CAR信号正反馈回路,实现了聚焦超声刺激下的长效CAR表达 | NA | 开发更安全有效的CAR-T细胞疗法治疗实体瘤 | 胶质母细胞瘤和前列腺癌 | 细胞工程 | 胶质母细胞瘤,前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7825 | 2025-10-06 |
Rorγt-positive dendritic cells are required for the induction of peripheral regulatory T cells in response to oral antigens
2025-May-15, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.03.020
PMID:40185101
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研究论文 | 本研究通过基因工程小鼠模型揭示了Rorγt阳性树突状细胞在口服抗原诱导外周调节性T细胞形成中的关键作用 | 首次通过特异性删除Rorc基因的顺式调控元件构建了RORγt抗原呈递细胞减少的小鼠模型,并证实了RORγt树突状细胞(而非ILC3s)在外周Treg诱导中的特异性功能 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类系统中验证;对RORγt树突状细胞的具体作用机制仍需进一步探索 | 探究RORγt阳性抗原呈递细胞在肠道免疫耐受建立中的作用机制 | 基因工程小鼠模型、RORγt阳性树突状细胞、外周调节性T细胞 | 免疫学 | 食物过敏、炎症性肠病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、谱系追踪 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7826 | 2025-10-06 |
Histone HIST1 genes and tumor-infiltrating lymphocytes in a child with γδ T cell acute lymphoblastic leukemia by single-cell sequencing
2025-Apr-23, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiaf022
PMID:39973604
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病例报告 | 通过单细胞测序技术研究儿童γδ T细胞急性淋巴细胞白血病中HIST1组蛋白基因与肿瘤浸润淋巴细胞的关系 | 首次在γδ T-ALL中发现HIST1组蛋白基因与疾病的相关性,并揭示γδ T细胞对抗该白血病的潜在效应功能 | 单一样本病例研究,结果需要更大样本量验证 | 探索γδ T-ALL的生物学特征和潜在治疗靶点 | 儿童γδ T细胞急性淋巴细胞白血病患者 | 单细胞测序 | 急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例儿童患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7827 | 2025-10-06 |
Exploring the comorbidity mechanisms between atherosclerosis and hashimoto's thyroiditis based on microarray and single-cell sequencing analysis
2025-01-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-85112-0
PMID:39805933
|
研究论文 | 本研究通过微阵列和单细胞测序分析探索动脉粥样硬化与桥本甲状腺炎之间的共病机制 | 首次结合WGCNA、生物信息学分析和单细胞测序技术系统揭示AS与HT的共享致病机制,鉴定出PTPRC和TYROBP作为关键生物标志物 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证;样本来源和数量可能存在限制 | 探索动脉粥样硬化与桥本甲状腺炎之间的共病分子机制 | 动脉粥样硬化和桥本甲状腺炎患者基因表达数据 | 生物信息学 | 心血管疾病,自身免疫性疾病 | 微阵列测序,单细胞测序分析,生物信息学分析 | WGCNA, Limma, CIBERSORT, cytoHubba | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的多个数据集,包含119个候选基因 | NA | 单细胞测序,微阵列分析 | NA | NA |
| 7828 | 2025-10-06 |
TransAnno-Net: A Deep Learning Framework for Accurate Cell Type Annotation of Mouse Lung Tissue Using Self-supervised Pretraining
2025-Jul, Computer methods and programs in biomedicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.cmpb.2025.108809
PMID:40315689
|
研究论文 | 提出一种基于自监督预训练和Transformer架构的深度学习框架,用于小鼠肺组织单细胞RNA测序数据的细胞类型注释 | 采用自监督预训练策略,利用大量未标记数据预训练模型,仅需少量标记数据进行微调,显著降低标注成本并提高模型效率和可迁移性 | 主要针对小鼠肺组织数据,在其他组织或物种中的适用性需要进一步验证 | 开发高效准确的单细胞RNA测序数据细胞类型注释方法 | 小鼠肺组织单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 肺疾病 | 单细胞RNA测序 | Transformer | 基因表达数据 | 约100,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7829 | 2025-10-06 |
DNA hypermethylation of PLTP mediated by DNMT3B aggravates vascular dysfunction in diabetic retinopathy via the AKT/GSK3β signaling pathway
2025-May-17, Clinical epigenetics
IF:4.8Q1
DOI:10.1186/s13148-025-01874-4
PMID:40380281
|
研究论文 | 本研究揭示DNMT3B介导的PLTP基因DNA高甲基化通过AKT/GSK3β信号通路加重糖尿病视网膜病变中的血管功能障碍 | 首次发现DNMT3B介导的PLTP启动子高甲基化在糖尿病视网膜病变血管功能障碍中的关键作用机制 | 研究主要基于细胞和小鼠模型,需要进一步临床验证 | 阐明PLTP在糖尿病视网膜病变血管功能障碍中的作用及DNA甲基化调控机制 | 人视网膜微血管内皮细胞和高糖处理的糖尿病小鼠模型 | 分子生物学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞测序,转录组测序,免疫共沉淀,荧光素酶报告基因检测 | NA | 基因表达数据,甲基化数据,蛋白互作数据 | 细胞系和小鼠模型 | NA | 单细胞测序,转录组测序 | NA | NA |
| 7830 | 2025-10-06 |
Anti-BCL2 therapy eliminates giant congenital melanocytic nevus by senolytic and immune induction
2025-May-16, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02247-2
PMID:40374605
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研究论文 | 本研究通过抗BCL2疗法成功消除巨大先天性黑色素细胞痣,揭示了衰老细胞清除和免疫诱导的双重作用机制 | 首次发现BCL2在GCMN的衰老细胞和增殖细胞中表达,并证明BCL2抑制剂通过衰老细胞清除和激活中性粒细胞免疫反应的双重机制治疗GCMN | 研究主要基于动物模型,需要进一步临床试验验证 | 开发治疗巨大先天性黑色素细胞痣的有效疗法 | 巨大先天性黑色素细胞痣患者样本、患者来源异种移植模型、转基因小鼠模型 | 疾病治疗研究 | 皮肤疾病 | 单细胞测序、免疫染色、体外细胞毒性实验 | 患者来源异种移植模型、转基因动物模型 | 基因表达数据、组织学图像、细胞功能数据 | 多种基因突变的GCMN患者样本及动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7831 | 2025-10-06 |
Integrating multi-omics data to identify the role of Aggrephagy-related genes in tumor microenvironment and key tumorigenesis factors of GB from the perspective of single-cell sequencing
2025-May-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02431-4
PMID:40377747
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术探索聚集性自噬相关基因在胶质母细胞瘤肿瘤微环境中的作用及其与肿瘤发生的关系 | 首次从单细胞测序角度系统研究聚集性自噬相关基因在胶质母细胞瘤中的作用,发现TUBA1C和UBB作为潜在治疗靶点 | NA | 揭示聚集性自噬相关基因在胶质母细胞瘤肿瘤微环境和肿瘤发生中的关键作用 | 胶质母细胞瘤肿瘤微环境中的细胞亚型 | 单细胞测序 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞测序,非负矩阵分解,分子对接分析 | 非负矩阵分解 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 7832 | 2025-10-06 |
Deciphering the interaction between the expression of LRP2 served as a mitochondrial metabolism-related gene and prognosis in colon cancer integrating multi-omics analysis
2025-May-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02568-2
PMID:40377809
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研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨线粒体代谢相关基因LRP2在结肠癌中的表达及其预后价值 | 首次将LRP2鉴定为结肠癌中线粒体代谢相关关键基因,并系统验证其与预后、病理分期和药物敏感性的关联 | 研究样本量有限,机制研究深度不足,需要更多实验验证LRP2的具体作用机制 | 探索LRP2在结肠癌中的表达特征及其临床预后价值 | 结肠腺癌患者样本和结肠癌细胞系 | 生物信息学 | 结肠癌 | 单细胞测序,转录组学,免疫组化,细胞增殖检测 | Cox回归分析,共识聚类 | 基因表达数据,临床数据,细胞实验数据 | TCGA数据库结肠癌样本和GEO数据库验证样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7833 | 2025-10-06 |
Sialyltransferase gene signature as a predictor of prognosis and therapeutic response in kidney renal clear cell carcinoma
2025-May-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02566-4
PMID:40377806
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研究论文 | 本研究基于唾液酸转移酶相关基因构建了一个预测肾透明细胞癌预后和治疗反应的预后模型 | 首次基于唾液酸转移酶相关基因构建KIRC预后模型,并通过单细胞RNA测序分析揭示了唾液酸化在肿瘤微环境中的关键作用 | 研究主要依赖公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 开发基于唾液酸转移酶相关基因的预后模型,预测KIRC患者的预后和治疗反应 | 肾透明细胞癌患者 | 生物信息学 | 肾癌 | RNA-Seq, 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | Cox回归风险模型 | 基因表达数据 | TCGA和ICGC数据库中的KIRC样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7834 | 2025-10-06 |
The critical role of BMP signaling in gastric epithelial cell differentiation revealed by organoids
2025-May-16, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-025-00237-x
PMID:40377813
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研究论文 | 本研究通过胃类器官模型揭示了BMP信号在胃上皮细胞分化中的关键作用 | 发现BMP4信号刺激pit细胞和壁细胞分化,鉴定Zbtb7b为pit细胞分化的新调控因子,并揭示小鼠与人类在壁细胞和主细胞分化要求上的差异 | 研究主要基于体外类器官模型,需要进一步在体内验证 | 阐明胃上皮细胞分化的分子调控机制 | 小鼠和人类胃类器官 | 发育生物学 | 胃疾病 | 单细胞RNA测序,信号通路调控,类器官培养 | 类器官模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7835 | 2025-10-06 |
SARS-CoV-2 induced immune perturbations in infants vary with disease severity and differ from adults' responses
2025-May-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59411-z
PMID:40379618
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了SARS-CoV-2感染婴儿与成人不同的免疫反应特征 | 首次系统研究重症COVID-19住院婴儿的免疫反应,发现婴儿T细胞和B细胞中干扰素刺激基因特征显著增强 | 样本量有限(26名感染婴儿),仅关注住院病例 | 解析SARS-CoV-2感染婴儿的免疫反应特征及其与疾病严重程度的关系 | SARS-CoV-2感染婴儿(n=26)和匹配对照组(n=14) | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),细胞因子检测 | NA | 单细胞转录组数据,血清细胞因子数据 | 40名婴儿(26名感染者,14名对照) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7836 | 2025-10-06 |
Advances in spatial transcriptomics and its application in the musculoskeletal system
2025-May-16, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-025-00429-w
PMID:40379648
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综述 | 总结空间转录组学技术进展及其在肌肉骨骼系统研究中的应用 | 系统梳理空间转录组学在肌肉骨骼系统研究中的最新应用,强调其在解析组织空间结构和细胞互作方面的独特优势 | NA | 探讨空间转录组学技术在肌肉骨骼系统研究中的应用现状与前景 | 肌肉骨骼系统 | 空间转录组学 | 肌肉骨骼系统疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达空间数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 7837 | 2025-10-06 |
USP2 inhibition unleashes CD47-restrained phagocytosis and enhances anti-tumor immunity
2025-May-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59621-5
PMID:40379682
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研究论文 | 本研究揭示USP2通过去泛素化稳定CD47蛋白,抑制USP2可促进CD47降解并重塑肿瘤微环境,从而增强抗PD-1免疫治疗效果 | 首次发现USP2通过去泛素化机制调控CD47稳定性,并证明靶向USP2-CD47轴可增强抗肿瘤免疫 | 研究主要基于小鼠模型,临床相关性仍需进一步验证 | 探索CD47的调控机制并开发更有效的联合免疫疗法 | 肿瘤细胞、巨噬细胞、CD8 T细胞等免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7838 | 2025-10-06 |
A novel LncRNA risk model for disulfidptosis-related prognosis prediction and response to chemotherapy in acute myeloid leukemia
2025-May-16, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-01730-8
PMID:40379722
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研究论文 | 本研究构建了一个基于双硫死亡相关lncRNA的风险模型,用于预测急性髓系白血病患者的预后和化疗反应 | 首次将双硫死亡机制与AML预后预测相结合,建立了基于六个特异性DRLs的预测模型 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证模型的临床适用性 | 探索双硫死亡与AML的关联,开发预后预测模型 | 急性髓系白血病患者 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序,RT-qPCR,Cox回归分析,LASSO回归 | Cox比例风险模型,LASSO回归模型 | 单细胞RNA测序数据,基因表达数据 | 从GEO数据库获取的AML患者单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7839 | 2025-10-06 |
M2-ApoBDs as a therapeutic strategy for systemic lupus erythematosus: targeted macrophage reprogramming and treg differentiation
2025-May-16, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03437-4
PMID:40380199
|
研究论文 | 本研究探索通过M2巨噬细胞来源的凋亡小体靶向调控巨噬细胞重编程和Treg细胞分化治疗系统性红斑狼疮 | 首次发现M2-ApoBDs能选择性靶向脾脏并被脾巨噬细胞吞噬,通过单细胞RNA测序揭示其可触发M2巨噬细胞转录变化并促进Treg细胞分化 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体验证疗效和安全性 | 开发系统性红斑狼疮的有效靶向治疗策略 | 系统性红斑狼疮小鼠模型、巨噬细胞、Treg细胞 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序、免疫学实验 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | SLE小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7840 | 2025-10-06 |
Spatiotemporal dynamic changes of meningeal microenvironment influence meningeal lymphatic function following subarachnoid hemorrhage: from inflammatory response to tissue remodeling
2025-May-16, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03460-0
PMID:40380229
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了蛛网膜下腔出血后脑膜微环境从炎症反应到组织重塑的时空动态变化及其对脑膜淋巴管功能的影响 | 首次系统揭示蛛网膜下腔出血后脑膜微环境的时空动态变化规律,发现胎盘生长因子(PGF)是促进脑膜淋巴管早期修复的关键因子 | 研究基于小鼠模型,需要进一步验证在人类中的适用性 | 探究蛛网膜下腔出血后脑膜转录反应及微环境对脑膜淋巴管功能的动态影响 | 小鼠蛛网膜下腔出血模型中的脑膜组织 | 生物信息学 | 蛛网膜下腔出血 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |