单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 10763 篇文献，本页显示第 7801 - 7820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7801 | 2025-10-06 |
scRNA-seq reveals chemotherapy-induced tumor microenvironment changes in pancreatic ductal adenocarcinoma
2025-Apr-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-103
PMID:40386264
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析化疗诱导的胰腺导管腺癌肿瘤微环境变化 | 发现LYZ在化疗后肿瘤细胞中显著增加，揭示化疗改变抗原呈递机制和PVR信号通路从T细胞向髓系细胞转移 | 使用公开可用数据，缺乏实验验证 | 研究化疗诱导的肿瘤微环境变化并优化胰腺癌免疫治疗反应 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者样本（接受或未接受标准化疗） | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7802 | 2025-10-06 |
Single cell sequencing technology reveals the correlation between B lymphocytes and vascular inflammatory symptoms of Kawasaki disease
2025-Apr-30, Translational pediatrics
IF:1.5Q2
DOI:10.21037/tp-2025-19
PMID:40386362
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了川崎病血管炎症症状与B淋巴细胞的相关性 | 首次通过单细胞测序技术系统分析川崎病不同血管炎症阶段的免疫细胞变化，发现CD19+B细胞与疾病进程的关联 | 样本量相对有限，单细胞测序仅包含10例样本 | 探索川崎病早期血管炎症症状中的免疫细胞活化，寻找潜在诊断标志物并指导IVIG治疗时机 | 川崎病患儿和对照组儿童 | 单细胞组学 | 川崎病 | 单细胞测序,流式细胞术,定量PCR | NA | 单细胞RNA测序数据,流式细胞数据,基因表达数据 | 单细胞测序10例(7例KD+3对照)，验证队列277例(95例KD+12健康儿童+170例发热儿童) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞测序平台 |
| 7803 | 2025-10-06 |
Identification and Exploration of Pyroptosis-Related Genes in Macrophage Cells Reveal Necrotizing Enterocolitis Heterogeneity Through Single-Cell and Bulk-Sequencing
2025-Apr-24, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26094036
PMID:40362275
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研究论文 | 通过单细胞和批量测序技术鉴定和探索巨噬细胞中焦亡相关基因，揭示坏死性小肠结肠炎的异质性 | 首次在NEC中发现了一个新的巨噬细胞亚群，并证实TREM1在焦亡过程中的关键作用 | 焦亡相关基因在NEC发病机制中的具体分子机制仍需进一步研究 | 识别焦亡相关细胞群体和基因，探索NEC的潜在治疗靶点 | 坏死性小肠结肠炎(NEC)患者肠道组织和巨噬细胞 | 单细胞测序分析 | 坏死性小肠结肠炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫荧光染色, PCR, Western blot | WGCNA, GSEA, 细胞通讯分析 | RNA测序数据, 图像数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 7804 | 2025-10-06 |
scVAEDer: integrating deep diffusion models and variational autoencoders for single-cell transcriptomics analysis
2025-Mar-21, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03519-4
PMID:40119479
|
研究论文 | 提出结合变分自编码器和深度扩散模型的scVAEDer方法，用于单细胞转录组数据的嵌入学习和分析 | 首次将变分自编码器与深度扩散模型相结合，学习同时保留全局结构和局部变异的单细胞数据表示 | NA | 开发用于单细胞转录组数据分析的深度学习方法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器, 深度扩散模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7805 | 2025-10-06 |
Divergence in cellular markers observed in single-cell transcriptomics datasets between cultured primary trabecular meshwork cells and tissues
2025-Feb-14, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-025-04528-5
PMID:39952952
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序比较体外培养的原代人小梁网细胞与组织样本，揭示细胞标记物的差异 | 首次报道比较原代hTM细胞培养物与hTM组织的单细胞转录组数据集 | 样本量相对有限，仅包含14个体外样本 | 研究小梁网细胞在体外培养与组织原位状态下的基因表达差异 | 原代人小梁网细胞和组织的单细胞转录组 | 单细胞转录组学 | 青光眼 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 14个原代hTM体外样本（包含4个青光眼患者样本），传代1-4代 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7806 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing on Formalin-Fixed and Paraffin-Embedded (FFPE) Tissue Identified Multi-Ciliary Cells in Breast Cancer
2025-01-29, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14030197
PMID:39936988
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研究论文 | 本研究评估了FFPE和FF样本用于单细胞RNA测序的适用性，并在乳腺癌中识别出多纤毛细胞亚群 | 首次在乳腺癌中通过单细胞RNA测序识别并验证了肿瘤性多纤毛细胞亚群的存在 | 研究样本量较小，仅包括一例浸润性导管癌和一例浸润性小叶癌 | 评估FFPE和FF样本用于单细胞RNA测序的适用性，并分析乳腺癌细胞异质性 | 乳腺癌组织样本，包括FFPE和匹配的FF样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，荧光原位杂交，电子显微镜 | NA | 单细胞RNA测序数据，图像数据 | 2例乳腺癌患者（1例IDC，1例ILC），扩展验证包含214例ER阳性浸润性癌 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7807 | 2025-10-06 |
Smooth Muscle Cells and Fibroblasts in the Proximal Thoracic Aorta Exhibit Minor Differences Between Embryonic Origins in Angiotensin II-driven Transcriptional Alterations
2025-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.23.610985
PMID:39896657
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析血管紧张素II诱导的胸主动脉近端平滑肌细胞和成纤维细胞的转录组变化 | 首次在血管紧张素II诱导的主动脉病变前病理阶段，比较了不同胚胎起源（第二心场和心脏神经嵴）的平滑肌细胞和成纤维细胞的转录组差异 | 研究仅关注了病变前病理阶段（3天灌注），未观察长期效应；样本量有限 | 探究不同胚胎起源的胸主动脉近端细胞在血管紧张素II诱导的转录改变中的差异 | 小鼠胸主动脉近端的平滑肌细胞和成纤维细胞 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，细胞分选 | NA | 单细胞转录组数据 | Mef2c-Cre R26R mT/mG小鼠，基线组和3天血管紧张素II灌注组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7808 | 2025-10-06 |
A panoramic view of cell population dynamics in mammalian aging
2025-Jan-17, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adn3949
PMID:39607904
|
研究论文 | 通过构建包含2000多万个细胞的单细胞转录组图谱，系统揭示哺乳动物衰老过程中的细胞群体动态变化 | 开发了PanSci单细胞转录组图谱，首次在哺乳动物中系统描绘了不同生命阶段、性别和基因型的细胞群体动态变化 | 研究主要基于小鼠模型，在人类中的适用性需要进一步验证 | 阐明衰老相关的细胞群体动态变化规律 | 623个小鼠组织的2000多万个细胞 | 单细胞组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过2000万个细胞，来自623个小鼠组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7809 | 2025-10-06 |
Cholecystokinin (CCK) Is a Mediator Between Nutritional Intake and Gonadal Development in Teleosts
2025-01-08, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14020078
PMID:39851506
|
研究论文 | 本研究揭示了胆囊收缩素(CCK)作为营养摄入与硬骨鱼性腺发育之间的中介分子 | 首次发现CCK通过下丘脑-垂体-性腺轴调控鱼类生殖过程，并证实CCK可作为营养传感器 | 研究主要基于草鱼模型，结果在其他硬骨鱼中的普适性需要进一步验证 | 探究营养摄入影响性腺发育的分子机制 | 草鱼的下丘脑-垂体-性腺轴组织及原代培养细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 原代细胞培养, 体外实验 | NA | 基因表达数据, 细胞培养数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7810 | 2025-10-06 |
Comprehensive Analysis Identifies THEMIS2 as a Potential Prognostic and Immunological Biomarker in Glioblastoma
2025-01-07, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14020066
PMID:39851494
|
研究论文 | 首次发现THEMIS2作为胶质母细胞瘤中肿瘤相关巨噬细胞介导免疫抑制的关键调控因子 | 首次揭示THEMIS2在胶质母细胞瘤免疫微环境中的关键作用及其与肿瘤相关巨噬细胞免疫抑制功能的关联 | NA | 探索胶质母细胞瘤免疫逃逸机制并寻找新的预后标志物和治疗靶点 | 胶质母细胞瘤患者样本和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7811 | 2025-10-06 |
Skeletal stem/progenitor cell-derived rather than osteoblast-derived IGF2 supports the development and homeostasis of skeletal system via STAT3
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.112605
PMID:40384861
|
研究论文 | 本研究揭示了骨骼干细胞/祖细胞来源的IGF2通过STAT3信号通路维持骨骼系统发育和稳态的机制 | 首次发现SSPCs而非成骨细胞来源的IGF2通过STAT3信号调控骨骼发育，为Silver-Russell综合征骨骼畸形提供了新的治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床应用的转化仍需进一步验证 | 探究IGF2在骨骼系统发育和稳态维持中的细胞来源和作用机制 | 小鼠模型、骨髓间充质干细胞、骨骼干细胞/祖细胞 | 发育生物学 | 骨骼发育异常 | 单细胞RNA测序,RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 多种细胞特异性Igf2敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7812 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing of adult primate neocortex reveals the regulatory dynamics of neural plasticity
2025, American journal of translational research
IF:1.7Q4
DOI:10.62347/ZEOR5569
PMID:40385068
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析成年灵长类新皮质基因表达动态，揭示神经可塑性的调控机制 | 首次在成年灵长类新皮质中发现抑制性神经元的基因表达轨迹与发育期相似，并识别出与神经可塑性相关的关键驱动基因 | 研究仅聚焦于初级视觉皮层的特定抑制神经元亚型，未涵盖其他脑区或神经元类型 | 探究成年灵长类新皮质基因表达动态及其分子基础 | 食蟹猴初级视觉皮层的抑制性神经元（源自内侧神经节隆起） | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序, RNA velocity, scVelo算法 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7813 | 2025-10-06 |
Intra-tumoural RAMP1+ B cells promote resistance to neoadjuvant anti-PD-1-based therapy in oesophageal squamous cell carcinoma
2025, Immunotherapy advances
IF:4.1Q2
DOI:10.1093/immadv/ltaf012
PMID:40385640
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现RAMP1+ B细胞在食管鳞癌中对新辅助免疫治疗产生耐药性，并揭示了其通过CGRP-RAMP轴抑制CD8+ T细胞活性的机制 | 首次在食管鳞癌中发现RAMP1+ B细胞亚群介导免疫治疗耐药，并证明靶向CGRP-RAMP轴可增强抗PD-1疗法效果 | 研究主要基于体外实验，需要进一步临床验证 | 研究B细胞亚群及其分化上游信号在食管鳞癌免疫治疗耐药中的作用 | 食管鳞癌患者肿瘤样本 | 单细胞生物学 | 食管鳞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 具有不同免疫治疗反应的食管鳞癌标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7814 | 2025-10-06 |
Targeting Tumor Differentiation Grade-related Genes Prognostic Signature Including COL5A1 Based on Single-cell RNA-seq in Gastric Cancer
2025, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.107509
PMID:40386054
|
研究论文 | 基于单细胞RNA测序技术鉴定胃癌肿瘤分化等级相关基因预后标志物 | 首次通过单细胞RNA测序结合WGCNA分析构建包含COL5A1的胃癌分化等级相关基因预后特征 | 基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 建立胃癌肿瘤分化等级相关的基因预后标志物 | 胃癌患者样本 | 单细胞测序分析 | 胃癌 | 单细胞RNA测序，加权基因共表达网络分析，HE染色，Kaplan-Meier生存分析 | Cox回归模型 | 单细胞RNA测序数据，临床数据 | GEO数据库中的胃癌单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7815 | 2025-10-06 |
IL7-IL7R Interaction Mediates Fibroblast-Driven Macrophage-to-Osteoclast Differentiation in Periodontitis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S524284
PMID:40386183
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和实验验证发现IL7R+巨噬细胞是牙周炎中潜在的破骨细胞前体，并揭示了成纤维细胞通过IL7-IL7R信号轴驱动巨噬细胞向破骨细胞分化的新机制 | 首次鉴定出IL7R+巨噬细胞作为牙周炎中具有显著破骨分化潜能的特定亚群，并揭示成纤维细胞通过分泌IL7激活该信号通路的新机制 | NA | 鉴定牙周炎中具有破骨细胞生成潜能的巨噬细胞亚群及其调控机制 | 人类和小鼠牙周炎样本中的巨噬细胞和单核细胞 | 单细胞生物学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序, ELISA, TRAP染色, micro-CT, qPCR, 流式细胞术, 免疫荧光染色 | 机器学习 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7816 | 2025-10-06 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomics Explore Purine Metabolism-Related Prognostic Risk Model and Tumor Immune Microenvironment Modulation in Ovarian Cancer
2025, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/5530325
PMID:40386292
|
研究论文 | 本研究利用单细胞和空间转录组学探索嘌呤代谢相关预后风险模型及其在卵巢癌肿瘤免疫微环境调控中的作用 | 首次构建基于12个嘌呤代谢相关基因的预后风险模型，并发现NME6+上皮细胞作为卵巢癌保护性因子 | 使用公共数据集，样本来源可能受限；需要进一步实验验证 | 探索嘌呤代谢在卵巢癌预后评估和免疫微环境调控中的作用机制 | 卵巢癌患者样本和细胞系 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, RT-qPCR | LASSO回归, 多元回归分析 | 单细胞测序数据, 空间转录组数据, 基因表达数据 | 来自不同公共数据集的卵巢癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7817 | 2025-10-06 |
Spatial multi-omics analysis of metabolic heterogeneity in zebrafish exposed to microcystin-LR and its disinfection byproducts
2025-Jul-15, Water research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.watres.2025.123599
PMID:40209558
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研究论文 | 本研究采用空间多组学技术分析斑马鱼暴露于微囊藻毒素-LR及其消毒副产物后的代谢异质性 | 首次将空间多组学技术应用于环境污染物研究，整合代谢组学、空间代谢组学和空间转录组学，揭示污染物在器官层面的空间分布特征 | 研究仅针对斑马鱼模型，结果向其他物种的推广需要进一步验证 | 探究微囊藻毒素-LR及其消毒副产物对斑马鱼的生物效应和空间代谢异质性 | 斑马鱼 | 空间多组学 | 环境毒理学 | 空间代谢组学, 空间转录组学, 代谢组学 | NA | 空间多组学数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | NA |
| 7818 | 2025-10-06 |
HKDC1 promotes liver cancer stemness under hypoxia through stabilizing β-catenin
2025-Jun-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001085
PMID:39250463
|
研究论文 | 本研究揭示HKDC1在缺氧条件下通过稳定β-连环蛋白促进肝癌干细胞特性 | 首次发现HKDC1在肝癌恶性细胞中特异性高表达，并阐明其通过结合GSK3β稳定β-连环蛋白促进肝癌转移的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验，尚未在大型临床队列中验证 | 探究HKDC1在肝癌转移中的分子机制 | 肝癌细胞、肝癌小鼠模型、肝癌患者肿瘤样本 | 癌症生物学 | 肝癌 | RNA原位杂交、单细胞RNA-seq、代谢组学分析 | NA | 基因表达数据、代谢组数据、单细胞测序数据 | 2种肝癌小鼠模型及其来源的类器官，肝癌患者肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7819 | 2025-10-06 |
TREM2 macrophages mediate the beneficial effects of bariatric surgery against MASH
2025-Jun-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001098
PMID:39292863
|
研究论文 | 本研究揭示了TREM2+巨噬细胞介导减重手术改善代谢功能障碍相关脂肪性肝炎的修复机制 | 首次证明减重手术通过TREM2+巨噬细胞以体重非依赖方式改善MASH，并阐明其分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证尚需进一步研究 | 探究减重手术改善MASH的免疫调节机制 | 小鼠模型及肝脏脂质相关巨噬细胞 | 免疫学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7820 | 2025-05-20 |
Integration of Bulk RNA and Single-Cell Analyses Reveal Distinct Expression Patterns of Anoikis-Related Genes and the Immunosuppressive Role of NQO1+ Macrophages in Hepatocellular Carcinoma
2025-May-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501310R
PMID:40386974
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研究论文 | 本研究通过整合批量RNA和单细胞RNA测序分析，探讨了anoikis相关基因（ARGs）在肝细胞癌（HCC）中的预后价值及其对免疫抑制微环境的影响 | 建立了一个包含11个ARGs的anoikis相关基因风险评分模型（ARGRS），并通过单细胞RNA测序评估了ARGs在HCC中的异质性，同时揭示了NQO1+巨噬细胞的免疫抑制作用 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，缺乏体内实验验证 | 探讨ARGs在HCC中的预后价值及其对免疫抑制微环境的影响 | 肝细胞癌（HCC）患者和NQO1+巨噬细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 批量RNA测序和单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习模型 | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |