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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7781 | 2025-10-06 |
An analysis of single-cell data reveals therapeutic effects of AMG487 in experimental autoimmune uveitis
2025-02, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2024.116671
PMID:39615601
|
研究论文 | 通过单细胞测序分析揭示AMG487在实验性自身免疫性葡萄膜炎中的治疗作用机制 | 首次在单细胞水平系统分析CXCR3拮抗剂AMG487对葡萄膜炎免疫细胞的调控机制 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化需要进一步验证 | 探究AMG487在自身免疫性葡萄膜炎中的治疗作用和分子机制 | Vogt-小柳-原田综合征患者外周血和实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠淋巴结免疫细胞 | 单细胞组学 | 自身免疫性葡萄膜炎 | 单细胞ATAC测序, 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | single-cell ATAC-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 7782 | 2025-10-06 |
CMAP prediction and experimental validation of Forskolin as a podocyte protective and anti-proteinuric drug for nephrotoxic serum-treated mice
2025-02, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2024.116727
PMID:39716644
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研究论文 | 通过结合肾脏单细胞RNA测序数据库和CMAP数据库预测并验证毛喉素对肾毒性血清诱导的足细胞损伤的保护作用 | 首次将肾脏单细胞RNA测序与CMAP数据库结合预测足细胞损伤治疗药物 | 研究主要聚焦于肾毒性血清诱导的足细胞损伤模型 | 开发针对特定足细胞损伤机制的治疗策略 | 小鼠足细胞和肾毒性血清处理的小鼠模型 | 生物信息学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, GO和KEGG富集分析, CMAP分析 | NA | 基因表达数据 | 肾毒性血清处理和对照组小鼠的肾小球单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7783 | 2025-10-06 |
Mapping Human Uterine Disorders Through Single-Cell Transcriptomics
2025-01-21, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14030156
PMID:39936948
|
综述 | 通过单细胞转录组学技术绘制人类子宫疾病图谱 | 系统整合单细胞RNA测序和空间转录组学在子宫疾病研究中的最新进展,揭示细胞异质性和分子机制 | 存在可扩展性和可重复性方面的挑战 | 探索单细胞转录组学在子宫疾病研究中的应用价值 | 子宫内膜异位症、子宫腺肌症、子宫内膜癌和子宫肌瘤等子宫疾病 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7784 | 2025-10-06 |
Liver X receptor unlinks intestinal regeneration and tumorigenesis
2025-Jan, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08247-6
PMID:39567700
|
研究论文 | 本研究揭示了肝X受体(LXR)在肠道损伤修复中作为调控开关,既能促进组织再生又能抑制肿瘤发生 | 首次发现LXR通路在肠道损伤适应中的双重作用机制,通过调控amphiregulin协调再生与肿瘤发生的平衡 | NA | 探索肠道再生与肿瘤发生之间的解偶联机制 | 肠道上皮细胞、肠道类器官、结直肠癌模型 | 分子生物学 | 结直肠癌 | RNA测序、单细胞RNA测序、药理学干预、转录组学分析、基因敲除实验 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7785 | 2025-10-06 |
A research protocol for a prospective, multicenter, cohort study on interferon therapy for chronic hepatitis B combined with metabolism-associated fatty liver disease to achieve clinical cure
2025, Frontiers in public health
IF:3.0Q2
DOI:10.3389/fpubh.2025.1546182
PMID:40161022
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研究论文 | 评估聚乙二醇干扰素治疗慢性乙型肝炎合并代谢相关脂肪性肝病患者的疗效和安全性 | 填补慢性乙型肝炎合并代谢相关脂肪性肝病患者治疗策略的研究空白,首次探讨MAFLD对HBsAg清除的影响 | 干扰素治疗常伴随副作用可能影响患者依从性,MAFLD人群异质性可能对治疗效果产生不同影响 | 阐明MAFLD对聚乙二醇干扰素治疗慢性乙型肝炎患者实现临床治愈的影响 | 优势慢性乙型肝炎患者和慢性乙型肝炎合并MAFLD患者 | 数字病理 | 慢性乙型肝炎, 代谢相关脂肪性肝病 | 单细胞转录组测序 | NA | 临床数据, 转录组数据 | 多中心研究,具体样本量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7786 | 2025-10-06 |
TNFRSF12A expression in stomach adenocarcinoma and its preliminary role in predicting immunotherapy response
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1578068
PMID:40391219
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研究论文 | 本研究探讨TNFRSF12A在胃腺癌中的表达模式及其在预测免疫治疗反应中的潜在作用 | 首次系统分析TNFRSF12A在胃腺癌中的表达特征,发现其与免疫细胞浸润和免疫治疗反应的相关性,并验证其对癌细胞迁移和侵袭能力的影响 | TNFRSF12A表达与临床特征无显著差异,需要更大样本验证其临床价值 | 研究TNFRSF12A在胃腺癌中的表达模式及其在免疫治疗预测中的作用 | 胃腺癌细胞和组织样本 | 生物信息学 | 胃腺癌 | scRNA-seq, 体外功能实验, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据, 体外实验数据 | 来自TCGA、GEO和GEPIA数据库的多个数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 7787 | 2025-10-06 |
Single-cell and multi-omics integration reveals cholesterol biosynthesis as a synergistic target with HER2 in aggressive breast cancer
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.04.030
PMID:40391299
|
研究论文 | 通过单细胞和多组学整合分析发现胆固醇生物合成与HER2在侵袭性乳腺癌中的协同治疗靶点 | 开发了整合单细胞RNA测序和多组学分析的计算框架,首次揭示胆固醇生物合成与HER2表达在乳腺癌中的显著相关性,并验证了联合靶向治疗的协同效应 | 研究主要基于计算分析和体外实验验证,缺乏体内动物模型和临床试验数据支持 | 通过系统计算方法解码乳腺癌分子机制并识别新的治疗靶点 | 乳腺癌患者的恶性细胞亚群 | 计算生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,多组学分析,蛋白质组学,基因表达谱分析 | 整合计算框架 | 单细胞RNA测序数据,多组学数据,蛋白质组数据,药物处理数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,多组学分析 | NA | NA |
| 7788 | 2025-10-06 |
Integrating single-cell with transcriptome-proteome Mendelian randomization reveals colorectal cancer targets
2025-May-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02636-7
PMID:40381082
|
研究论文 | 通过整合单细胞数据、转录组数据、蛋白质组数据和孟德尔随机化分析,识别结直肠癌的潜在治疗靶点 | 首次将单细胞转录组学与转录组-蛋白质组孟德尔随机化相结合,解析结直肠癌发病机制中的细胞类型特异性驱动基因 | 依赖于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 识别结直肠癌发病机制中的关键因果基因 | 结直肠癌相关基因和细胞类型 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, GWAS, eQTL分析, pQTL分析, 孟德尔随机化 | 孟德尔随机化模型, SMR分析 | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据, 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 7789 | 2025-10-06 |
Effects of ER-phagy regulatory genes on the microenvironment of hepatocellular carcinoma: a comprehensive analysis
2025-May-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02649-2
PMID:40381129
|
研究论文 | 通过综合分析内质网自噬调控基因对肝细胞癌微环境的影响 | 首次结合单细胞测序数据、孟德尔随机化和生物信息学分析,系统研究ER-phagy基因在肝癌微环境中的作用 | 研究为初步探索,需要进一步实验验证ER-phagy基因的具体作用机制 | 阐明内质网自噬调控基因在肝细胞癌微环境中的作用及其临床意义 | 肝细胞癌患者样本及相关的免疫细胞(T细胞、树突状细胞、巨噬细胞和单核细胞) | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序, 孟德尔随机化, 生物信息学分析 | 预后预测模型 | 单细胞测序数据, 基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7790 | 2025-10-06 |
Mendelian randomization analysis reveals potential association between allergic rhinitis and nasopharyngeal carcinoma
2025-May-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02658-1
PMID:40382519
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化分析探索过敏性鼻炎与鼻咽癌之间的潜在关联,并利用单细胞测序解析鼻咽癌肿瘤微环境的免疫特征 | 首次结合孟德尔随机化分析与单细胞测序技术系统揭示鼻咽癌与过敏性鼻炎的潜在关联,并识别出三个独特的B细胞亚群及其时空动态变化 | 未明确说明样本来源和具体样本量,研究结果需要进一步实验验证 | 探索鼻咽癌的免疫微环境特征及其与并发症的关联机制 | 鼻咽癌肿瘤微环境中的免疫细胞和基因表达 | 生物信息学 | 鼻咽癌 | 孟德尔随机化分析, 单细胞测序, 基因表达谱分析, 时空分析 | NA | 基因组数据, 单细胞测序数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7791 | 2025-10-06 |
BAX-mediated ammonia-driven cell death: a novel prognostic and therapeutic target in clear cell renal cell carcinoma
2025-May-17, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-025-00764-3
PMID:40382614
|
研究论文 | 本研究构建了透明细胞肾细胞癌的氨相关特征模型,发现BAX介导的氨驱动细胞死亡通路可作为预后标志物和治疗靶点 | 首次在ccRCC中系统研究氨相关细胞死亡机制,鉴定BAX为关键基因并揭示其与免疫抑制细胞的相互作用 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,需要更多体内实验验证 | 探索氨相关细胞死亡在透明细胞肾细胞癌中的预后和治疗价值 | 透明细胞肾细胞癌患者和细胞系 | 生物信息学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序,细胞增殖实验,克隆形成实验,迁移和侵袭实验 | 预后模型 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 多个独立队列包括TCGA、PMID 35,440,542队列、E-MTAB-1980和GSE29609 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7792 | 2025-10-06 |
Navigating single-cell RNA-sequencing: protocols, tools, databases, and applications
2025-May-17, Genomics & informatics
DOI:10.1186/s44342-025-00044-5
PMID:40382658
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综述 | 本文全面探讨了单细胞RNA测序技术的协议、工具、数据库和应用领域 | 系统性地总结了单细胞RNA测序数据分析的挑战与优化方法,强调了增强单细胞水平分辨率和准确性的创新技术 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据和研究 | 探讨单细胞RNA测序技术的发展现状、挑战和应用前景 | 单细胞RNA测序技术及其在生物医学研究中的应用 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7793 | 2025-10-06 |
A single-cell transcriptomic atlas of immune cells in Wilson disease identifies copper-specific immune regulation
2025-May-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112450
PMID:40384935
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序构建威尔逊病免疫细胞图谱,揭示铜特异性免疫调控机制 | 首次在威尔逊病中建立单细胞水平的免疫细胞图谱,发现铜浓度异常对HLA分子表达和抗原处理通路的影响 | 样本量有限,主要关注外周血单个核细胞,未涉及其他组织类型 | 研究铜代谢异常对免疫调控和造血发育的影响机制 | 威尔逊病患者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 威尔逊病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 威尔逊病患者和健康供者的PBMCs | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7794 | 2025-10-06 |
Overcoming myeloid-driven resistance to CAR T therapy by targeting SPP1
2025-May-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.01.646202
PMID:40236117
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现SPP1+巨噬细胞在胶质瘤CAR T细胞治疗耐药性中的关键作用,并证实抗SPP1抗体可逆转免疫抑制微环境 | 首次通过单细胞RNA测序揭示SPP1+巨噬细胞在CAR T治疗耐药中的核心机制,并证明靶向SPP1可有效克服耐药性 | 研究主要聚焦胶质瘤模型,在其他实体瘤中的普适性需要进一步验证 | 探索实体瘤对CAR T细胞治疗产生耐药性的机制并开发克服策略 | 胶质瘤患者样本和干扰素信号缺陷的同源小鼠模型 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 41例胶质瘤患者样本及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7795 | 2025-10-06 |
Subcellular level spatial transcriptomics with PHOTON
2025-May-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59801-3
PMID:40368943
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PHOTON的高分辨率空间转录组学方法,能够在亚细胞水平分析RNA的空间分布 | 开发了结合高分辨率成像与高通量测序的PHOTON方法,首次实现亚细胞分辨率的空间转录组分析 | NA | 开发能够分析RNA亚细胞空间分布的新技术方法 | 卵巢颗粒细胞、核仁、线粒体、应激颗粒等亚细胞结构 | 空间转录组学 | NA | 高分辨率成像、高通量测序 | NA | 空间转录组数据、图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | PHOTON | 结合高分辨率成像与高通量测序的空间转录组平台,具有亚细胞分辨率 |
| 7796 | 2025-10-06 |
Smooth muscle cells and fibroblasts in the ascending aorta exhibit minor differences between embryonic origins in angiotensin II-driven transcriptional alterations
2025-May-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-99862-4
PMID:40360730
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析血管紧张素II诱导下升主动脉中不同胚胎来源平滑肌细胞和成纤维细胞的转录组差异 | 首次在血管紧张素II诱导的主动脉病变前期,系统比较了第二心区和非第二心区来源细胞的转录组响应差异,并发现了一个新的成纤维细胞亚群 | 研究仅关注病变前期阶段,未涉及疾病进展后期;样本量相对有限;差异表现较为轻微 | 探究不同胚胎来源细胞在血管紧张素II诱导的胸主动脉病变中的特异性响应 | 小鼠升主动脉中的平滑肌细胞和成纤维细胞 | 单细胞转录组学 | 胸主动脉病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | Mef2c-Cre R26RmT/mG转基因小鼠,基线组和血管紧张素II输注3天组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7797 | 2025-10-06 |
Glial changes and gene expression in Alzheimer's disease from snRNA-Seq and spatial transcriptomics
2025-May, Journal of Alzheimer's disease : JAD
DOI:10.1177/13872877251330320
PMID:40267277
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研究论文 | 本研究整合单核RNA测序和空间转录组学数据,分析阿尔茨海默病中胶质细胞的变化和基因表达特征 | 首次将SEA-AD单核测序数据与空间转录组学整合,系统量化AD易感脑区的细胞变化 | 研究样本来源有限,仅关注前额叶皮层和颞回区域 | 阐明阿尔茨海默病进展中细胞水平的变化机制 | 阿尔茨海默病患者前额叶皮层和颞回脑组织 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7798 | 2025-10-06 |
The cell-intrinsic circadian clock is dispensable for lateral posterior clock neuron regulation of Drosophila rest-activity rhythms
2025-May, Neurobiology of sleep and circadian rhythms
DOI:10.1016/j.nbscr.2025.100124
PMID:40386580
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研究论文 | 本研究通过基因工具探究了果蝇侧后时钟神经元在调节休息-活动节律中的作用 | 发现侧后时钟神经元可作为驱动振荡器,在缺乏细胞内在分子时钟的情况下仍能传递昼夜节律信息 | 研究仅限于果蝇模型,未在其他生物体中验证 | 探究分子时钟功能和神经元活动在侧后时钟神经元调节休息-活动节律中的作用 | 果蝇侧后时钟神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞测序, CRISPR基因编辑, 基因沉默 | NA | 基因表达数据, 行为数据 | 约240个大脑时钟神经元分为约20个亚群 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7799 | 2025-10-06 |
Identification of druggable genetic targets for prostate cancer risk based on mendelian randomization and single-cell RNA sequencing
2025-Apr-30, International urology and nephrology
IF:1.8Q3
DOI:10.1007/s11255-025-04525-y
PMID:40304996
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研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化、共定位分析和单细胞RNA测序技术,识别与前列腺癌风险相关的可成药遗传靶点 | 首次将孟德尔随机化、共定位分析和单细胞RNA测序技术相结合,系统性地识别前列腺癌的可成药遗传靶点 | 部分基因(如BAK1)可能伴随副作用,需要进一步验证 | 识别与前列腺癌风险相关的可成药遗传靶点,为靶向治疗提供新方向 | 前列腺癌相关遗传靶点和肿瘤细胞类型 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 孟德尔随机化分析, 共定位分析, 单细胞RNA测序, 全表型关联研究 | NA | 基因组数据, 单细胞表达数据 | 2608个可成药基因 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7800 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing for characterizing the immune communication and iron metabolism roles in CD31+ glioma cells
2025-Apr-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-377
PMID:40386270
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究CD31+胶质瘤细胞在免疫通讯和铁代谢中的作用 | 首次在胶质瘤微环境中系统分析CD31+免疫细胞的细胞通讯网络和铁代谢功能,发现铁蛋白在免疫调节中的潜在作用 | 研究局限于CD31+细胞亚群,未涵盖胶质瘤微环境中所有细胞类型 | 阐明CD31+免疫细胞在胶质瘤进展中的作用机制 | 胶质瘤微环境中的CD31+免疫细胞(巨噬细胞和T细胞) | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | CellChat, Monocle3 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |