单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202501-202512] [清除筛选条件]
当前共找到 10799 篇文献,本页显示第 761 - 780 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
761 2026-01-07
Identification of osteoarthritis-related genes and potential drugs based on single cell RNA-seq data
2025-Nov-25, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
研究论文 本研究基于单细胞RNA测序数据,识别骨关节炎相关基因并预测潜在药物 结合hdWGCNA、随机森林和PPI网络分析识别关键基因,并利用孟德尔随机化和斑马鱼实验验证药物效果 研究主要依赖公共数据集和预测算法,实验验证仅在斑马鱼模型中进行,未涉及人类临床试验 寻找骨关节炎的预防和治疗药物 骨关节炎相关基因和候选药物 数字病理学 骨关节炎 单细胞RNA测序,批量RNA测序,RT-qPCR 随机森林,hdWGCNA,PPI网络 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
762 2026-01-07
Consensus Molecular Subtypes (CMS) Classification: a progress towards Subtype-Driven treatments in colorectal cancer
2025-Nov-24, World journal of surgical oncology IF:2.5Q1
综述 本文综述了结直肠癌共识分子亚型分类的研究进展及其在预后预测和个性化治疗中的应用 系统总结了CMS分类的预后价值、预测作用、鉴定方法(包括基于深度学习的图像分类器)、与免疫治疗等靶向治疗的关联,并探讨了肿瘤内异质性带来的挑战及单细胞测序等新兴解决方案 肿瘤内异质性和技术壁垒阻碍了临床广泛应用 回顾CMS分类在结直肠癌中的研究进展,旨在推动亚型驱动的治疗策略 结直肠癌及其共识分子亚型 自然语言处理 结直肠癌 基因表达谱分析、免疫组织化学、单细胞RNA测序 深度学习 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
763 2026-01-07
Multienzymatic nanocatalysts attenuate acute pancreatitis via dual modulation of pyroptotic pathways and autodigestion blockade
2025-Nov-23, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1
研究论文 本研究设计了一种多酶纳米催化剂,通过双重调节细胞焦亡通路和阻断胰腺自消化来治疗急性胰腺炎 开发了表面修饰有胰蛋白酶抑制剂Rhamnetin的单原子钴基纳米酶(Rh@SAE),首次将催化疗法应用于急性胰腺炎治疗,并同时靶向细胞焦亡和胰腺酶过度激活两个关键病理过程 研究主要基于动物模型,尚未进行临床试验;纳米材料的长期生物安全性需要进一步评估 开发新型纳米药物治疗急性胰腺炎,改善临床预后 急性胰腺炎(AP)和重症急性胰腺炎(SAP)的病理过程 纳米医学 急性胰腺炎 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
764 2026-01-07
SpaMWGDA: Identifying spatial domains of spatial transcriptomes using multi-view weighted fusion graph convolutional network and data augmentation
2025-Nov, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 本文提出了一种基于多视图加权融合图卷积网络和数据增强的新型深度学习模型SpaMWGDA,用于空间转录组数据的空间域识别 通过多视图加权融合图卷积网络和数据增强,成功捕获了spot特征的全面邻域信息,并自适应地学习空间信息与基因特征之间的依赖关系 未在摘要中明确提及 提高空间转录组数据中空间域识别的准确性和效率 空间转录组数据 空间转录组学 NA 空间转录组学 多视图加权融合图卷积网络(GCN) 基因表达和空间信息数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
765 2026-01-07
An integrative analysis of transcriptome, methylome and single-cell RNA sequencing data identifies UBE2H as a marker of oxaliplatin resistance in colorectal cancer
2025-Oct-31, Cancer cell international IF:5.3Q1
研究论文 本研究通过整合转录组、甲基化组和单细胞RNA测序数据,识别出UBE2H作为结直肠癌对奥沙利铂耐药的潜在标志物 首次将多组学数据(转录组、甲基化组、单细胞RNA测序)整合分析,系统揭示了UBE2H在奥沙利铂耐药中的作用及其与免疫微环境、细胞分化和增殖状态的关联 研究主要基于细胞系和公共数据集,缺乏前瞻性临床队列验证;耐药机制的具体分子通路尚未完全阐明 识别结直肠癌对奥沙利铂耐药的生物标志物并探索其生物学机制 结直肠癌细胞系、TCGA和GEO数据库中的结直肠癌样本、正常结肠组织单细胞数据 生物信息学 结直肠癌 RNA-seq, DNA甲基化测序, 单细胞RNA测序 Cox比例风险模型, 差异表达分析 转录组数据, 甲基化数据, 单细胞基因表达数据 多个公共数据集(TCGA及5个GEO数据集)及细胞系数据,具体样本数未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, DNA甲基化测序 NA NA
766 2026-01-07
[Progress of scRNA-seq technology in nasopharyngeal carcinoma research]
2025-Sep, Lin chuang er bi yan hou tou jing wai ke za zhi = Journal of clinical otorhinolaryngology head and neck surgery
综述 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术在鼻咽癌研究中的应用进展 总结了scRNA-seq技术在揭示鼻咽癌肿瘤细胞亚群、进化轨迹及肿瘤微环境细胞功能与相互作用方面的新思路 NA 探讨scRNA-seq技术在鼻咽癌发病机制、肿瘤异质性、肿瘤微环境、耐药性及治疗反应研究中的应用 鼻咽癌 数字病理学 鼻咽癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
767 2026-01-07
Multi-region spatial transcriptomics reveals region specific differences in response to amyloid beta (Aβ) plaque induced changes in Alzheimer's Disease (AD)
2025-Aug-02, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用多区域空间转录组学结合Aβ免疫荧光染色,揭示了阿尔茨海默病中不同脑区对Aβ斑块诱导变化的区域特异性差异 首次在多个脑区同时进行空间转录组学与Aβ斑块分析,识别了抑制性神经元和细胞通讯网络的区域特异性变化 样本量较小(仅两名患者),且局限于Braak III和Thal 4阶段的AD病例,可能无法代表疾病全谱 探究阿尔茨海默病中脑区特异性对Aβ斑块诱导变化的脆弱性和恢复力的细胞与分子机制 两名Braak III和Thal 4阶段阿尔茨海默病患者的多个脑区组织,包括内嗅、枕颞、背外侧前额和纹状皮质 空间转录组学 阿尔茨海默病 空间转录组学,免疫荧光染色 NA 空间转录组数据,免疫荧光图像 两名患者,覆盖四个脑区 NA 空间转录组学 NA NA
768 2026-01-07
Single-cell transcriptomics reveal alveolar macrophages-specific responses in single-hit ozone exposure model in mice
2025-Jul-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了小鼠在单次臭氧暴露模型中肺泡巨噬细胞的特异性转录组响应及其功能调控 首次在单细胞分辨率下系统分析了不同浓度臭氧暴露对肺泡巨噬细胞转录组的影响,并识别出浓度依赖性的通路富集和亚群特异性变化 研究仅使用雄性C57BL/6J小鼠,未考虑性别或品系差异;暴露时间固定为3小时,未探索不同时间点的动态变化 探究肺泡巨噬细胞对臭氧暴露的响应机制,特别是不同浓度下的转录组变化和功能调控 C57BL/6J雄性成年小鼠的肺泡巨噬细胞 单细胞转录组学 呼吸系统疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 C57BL/6J雄性成年小鼠,分为过滤空气暴露组、1 ppm臭氧暴露组和1.5 ppm臭氧暴露组 NA 单细胞RNA测序 NA NA
769 2026-01-07
Intrinsic OASL expression licenses interferon induction during influenza A virus infection
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文通过分析流感A病毒感染细胞的单细胞RNA测序数据,揭示了宿主因子OASL的内在表达对IFNL诱导的关键作用 开发了一种分析时间序列单细胞RNA测序数据的方法,以识别调控细胞间干扰素诱导异质性的宿主因子,并首次发现干扰素刺激基因OASL的内在表达是流感A病毒感染中IFNL稳健诱导所必需的 未明确说明样本量或实验设计的详细限制,可能局限于流感A病毒感染的特定模型 识别在病毒感染中调控细胞间干扰素诱导异质性的宿主因子 流感A病毒感染的细胞 自然语言处理 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
770 2026-01-07
Dissection of Gαs and Hedgehog signaling crosstalk reveals therapeutic opportunities to target adenosine receptor 2b in Hedgehog-dependent tumors
2025-Feb-27, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文通过组织学、bulk RNA测序和单细胞RNA测序,揭示了Gαs信号通路失活与Hedgehog信号在基底细胞癌中的相互作用,并提出了靶向腺苷受体2B作为潜在治疗策略 首次发现Gαs通路失活驱动的肿瘤与经典Hedgehog SMO驱动的肿瘤相似,并证明腺苷2B受体激活可抑制Hedgehog信号和肿瘤形成 研究主要基于小鼠模型,人类BCC中的临床验证尚需进一步探索 探究Gαs与Hedgehog信号通路的交叉调控机制,并寻找基底细胞癌的治疗新靶点 小鼠基底细胞癌样肿瘤及人类基底细胞癌样本 数字病理学 基底细胞癌 组织学分析、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 NA 图像、RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
771 2026-01-07
Spatially distinct cellular and molecular landscapes define prognosis in triple negative breast cancer
2025-Feb-12, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用空间转录组学技术,深入分析了三阴性乳腺癌中不同预后患者的细胞和分子异质性 首次利用空间转录组学技术,系统揭示了三阴性乳腺癌不同预后背后的空间和分子异质性,并识别出能高精度分类预后的上皮基因特征 研究样本量相对较小(32例),且为回顾性设计,可能限制结果的普遍性 探究三阴性乳腺癌不同预后的细胞和分子基础,以推动精准诊断和治疗策略 三阴性乳腺癌患者的FFPE组织样本 数字病理学 乳腺癌 空间转录组学 卷积神经网络(CNN) 空间转录组数据 32例女性患者(17例良好预后,15例不良预后) NA 空间转录组学 GeoMX® Digital Spatial Profiler GeoMx人类全转录组图谱(WTA)面板
772 2026-01-07
The Single-Cell Landscape of Peripheral and Tumor-infiltrating Immune Cells in HPV- HNSCC
2025-Jan-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序数据,揭示了HPV阴性头颈鳞状细胞癌中免疫细胞的动态变化及其与疾病进展的关系 首次整合两个单细胞RNA测序数据集,全面分析HPV阴性HNSCC中免疫细胞的分子特征和细胞间通讯模式,并发现细胞毒性免疫细胞作为生物标志物和治疗靶点的潜力 样本量相对较小(29个样本),且仅针对HPV阴性HNSCC,可能无法推广到其他亚型 探索HPV阴性头颈鳞状细胞癌的复杂免疫景观,以识别潜在的治疗靶点 HPV阴性头颈鳞状细胞癌患者的外周血单个核细胞和肿瘤浸润免疫细胞 单细胞组学 头颈鳞状细胞癌 单细胞RNA测序,高度多重免疫荧光检测 NA 单细胞RNA测序数据,免疫荧光图像 29个样本,近300,000个免疫细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
773 2026-01-07
An integrated single-cell and spatial transcriptomic atlas of thyroid cancer progression identifies prognostic fibroblast subpopulations
2025-Jan-09, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过整合单细胞测序和空间转录组学数据,构建了甲状腺癌进展的图谱,识别了与疾病进展相关的成纤维细胞亚群 结合单细胞测序、空间转录组学和批量RNA测序,首次在甲状腺癌中定义了炎症性和肌成纤维性癌症相关成纤维细胞亚群及其空间分布 NA 研究甲状腺癌进展过程中的基质细胞亚群和肿瘤-基质相互作用 甲状腺癌样本,包括分化良好和未分化的类型 数字病理学 甲状腺癌 单细胞测序,空间转录组学,批量RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,批量RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学,批量RNA-seq NA NA
774 2026-01-07
Construction and validation of an anoikis-related prognostic model for lung adenocarcinoma based on bulk and single-cell transcriptomic data
2025, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究基于批量转录组和单细胞转录组数据,构建并验证了一个与失巢凋亡相关的肺腺癌预后模型 首次结合批量转录组和单细胞RNA测序数据,利用机器学习方法开发了一个包含7个基因的失巢凋亡相关预后模型,并深入探讨了TIMP1在肿瘤微环境中的作用 模型仅在GEO数据库的两个队列中进行了验证,需要更多独立队列和前瞻性研究来确认其临床适用性 开发并验证一个用于肺腺癌预后预测的失巢凋亡相关基因模型 肺腺癌患者及其转录组数据 生物信息学 肺腺癌 单细胞RNA测序, 免疫组化, 多重免疫荧光 Cox回归, LASSO回归, 随机森林 转录组数据 来自GEO数据库的两个肺腺癌队列 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
775 2026-01-06
G protein inhibitory alpha subunits 1 and 3 regulate Wnt/beta-catenin signaling to promote osteogenesis and bone formation
2025-Dec-30, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research IF:5.1Q1
研究论文 本研究揭示了Gαi1/3蛋白通过调控Wnt/β-catenin信号通路促进成骨作用与骨形成的新机制 首次发现Gαi1/3(而非Gαi2)介导Wnt/β-catenin信号通路,并阐明其通过结合Axin1并招募至细胞膜使β-catenin降解复合体失活的具体分子机制 研究主要基于小鼠胚胎成骨前体细胞模型,人体组织验证及临床转化潜力需进一步探索 探究Gαi1/3蛋白是否及如何介导Wnt/β-catenin信号通路以调控骨形成 小鼠胚胎成骨前体细胞及不同Gαi1/3表达水平的小鼠模型 分子细胞生物学 骨质疏松症 单细胞测序分析、病毒转染、基因编辑、免疫共沉淀、共聚焦显微镜、Western blot、碱性磷酸酶染色、茜素红染色、显微CT NA 基因表达数据、蛋白质相互作用数据、影像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
776 2026-01-06
Single-Cell RNA sequencing identifies NAMPT as a potential therapeutic target in autoimmune uveitis
2025-Dec-29, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了NAMPT在自身免疫性葡萄膜炎中的关键作用,并探讨了其作为潜在治疗靶点的机制 首次利用单细胞RNA测序技术全面分析NAMPT在自身免疫性葡萄膜炎中对免疫细胞亚群、转录程序和细胞间通讯网络的影响,并验证了NAMPT-Hif1α轴在人类疾病中的保守性 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本,需要更大规模的人类临床试验来验证NAMPT抑制剂的疗效和安全性 探究NAMPT在自身免疫性葡萄膜炎中的作用及其潜在机制,以发现新的治疗靶点 实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠的颈引流淋巴结细胞、VKH病患者的PBMCs以及健康对照 单细胞测序 自身免疫性葡萄膜炎 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、过继转移实验 NA 单细胞转录组数据 包括正常、EAU和NAMPT抑制剂处理的EAU小鼠的CDLN细胞,以及VKH患者和健康对照的PBMCs NA 单细胞RNA-seq NA NA
777 2026-01-06
Cre-dependent gene expression enables thymic development of autoreactive tumor-associated antigen targeting CAR-T cells
2025-Dec-24, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy IF:12.1Q1
研究论文 本研究开发了一种通过基因工程改造造血干细胞,使其在胸腺微环境中持续产生CAR-T细胞的平台,以解决CAR-T细胞体内持久性不足和肿瘤复发的问题 首次利用胸腺微环境支持造血干细胞分化为T细胞的特性,建立可诱导表达CAR的基因工程平台,通过调节共刺激信号和内源性T细胞受体库来规避胸腺阴性选择,实现自体反应性CAR-T细胞的胸腺内发育 研究主要在小鼠模型中进行,尚未在人体验证;长期安全性和对正常组织的潜在影响仍需进一步评估;诱导表达系统的精确调控和时效性需要优化 开发能够持续在体内生成、具有自我更新能力的CAR-T细胞疗法,以克服现有CAR-T细胞治疗中持久性不足和肿瘤复发的挑战 基因工程改造的造血干细胞和祖细胞、胸腺微环境、CD19 CAR-T细胞 细胞与基因治疗 癌症 单细胞RNA测序、连续移植研究、基因工程 NA 单细胞RNA测序数据、移植实验数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
778 2026-01-06
MDA5-MAVS and interferon-lambda signaling in the intestinal epithelium limit murine astrovirus infection
2025-Dec-21, Mucosal immunology IF:7.9Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序揭示了小鼠星状病毒(muAstV)在肠道上皮细胞中的感染特性,并阐明了MDA5-MAVS信号通路和干扰素-λ在限制病毒感染中的关键作用 首次通过单细胞RNA测序明确了muAstV在多种肠道上皮细胞(包括杯状细胞和多种肠上皮细胞)中的感染特性,并揭示了MDA5-MAVS通路调控干扰素-λ诱导的具体机制 研究主要基于小鼠模型,结果向人类星状病毒感染的直接转化需要进一步验证 阐明小鼠星状病毒感染中先天免疫调控机制,特别是MDA5-MAVS信号通路和干扰素-λ的作用 小鼠星状病毒(muAstV)及其感染的肠道上皮细胞 单细胞组学 肠道病毒感染 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
779 2026-01-06
Senescent CD8 T Effector Memory Cells are Functionally Impaired, Enriched in Aging and Disease, and a Barrier to Immunotherapy
2025-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文研究了表达SA-βGal的CD8 T效应记忆细胞的衰老状态、功能特性及其在衰老和疾病中的作用 首次在单细胞水平上揭示了SA-βGal表达CD8 T细胞的独特转录特征,并证明T细胞衰老与T细胞耗竭不同且占主导地位,限制了免疫疗法的反应 研究主要基于人类样本,未涉及动物模型验证;样本来源和疾病类型可能有限,需要进一步扩大验证 探究CD8 T细胞的衰老状态及其在衰老、疾病和免疫疗法反应中的功能影响 人类CD8 T细胞,特别是表达SA-βGal的效应记忆T细胞 免疫学 衰老相关疾病、癌症 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 来自老年供体、年龄相关疾病患者、癌症患者和吸烟者的CD8 T细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
780 2026-01-06
Integrated Single-cell Analysis Uncovers Regulatory Logic of Cranial Ectoderm Development
2025-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序数据分析,揭示了颅部外胚层发育的调控逻辑,重点关注转录因子下游活性及跨胚层信号网络 首次在鸡中脑轴向水平发育系列中,通过高分辨率单细胞转录组分析,识别了与特定发育域时空限制相关的泛表达染色质修饰因子,并建立了分析scRNAseq数据以理解组织模式的新框架 研究基于鸡胚胎模型,可能不完全适用于其他物种;且主要依赖计算推断,需实验验证 探究颅部外胚层发育过程中,相邻组织间时空协调的基因调控机制 鸡胚胎中脑轴向水平从原肠胚形成到神经胚后阶段的发育系列细胞 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序(scRNAseq) NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部