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当前共找到 10536 篇文献，本页显示第 7681 - 7700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7681 | 2025-10-06 |
Investigation of the Significance of Blood Signatures on Sepsis-Induced Acute Lung Injury in Sepsis Within 24 Hours
2025, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/5684300
PMID:40421173
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研究论文 | 本研究通过生物信息学和机器学习方法探讨了脓毒症患者外周血生物标志物对脓毒症诱导的急性肺损伤的影响 | 首次结合多种机器学习算法识别C3AR1和SLPI作为脓毒症关键生物标志物，并通过单细胞RNA测序验证SLPI在脓毒症早期免疫器官细胞中的表达升高 | 研究主要基于公共数据库数据，样本来源有限，需要进一步临床验证 | 研究脓毒症发病24小时内血液生物标志物对脓毒症诱导急性肺损伤的意义 | 脓毒症患者和脓毒症诱导的急性肺损伤动物模型 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, CIBERSORT, 生物信息学分析 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 两个GEO数据集(GSE54514和GSE95233) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7682 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics and machine learning unveil ferroptosis features in tumor-associated macrophages: Prognostic model and therapeutic strategies for lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1598756
PMID:40421217
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和机器学习方法，揭示了肺腺癌中肿瘤相关巨噬细胞的铁死亡特征，并构建了预后风险模型 | 首次基于巨噬细胞铁死亡相关基因构建肺腺癌预后模型，揭示了高风险组的免疫微环境特征和药物敏感性差异 | 研究主要基于公共数据库分析，需要更多实验验证；样本量相对有限 | 筛选巨噬细胞中铁死亡相关关键基因，构建肺腺癌预后风险模型 | 肺腺癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序，Western blot | LASSO, SVM, XGBoost, Cox回归 | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | TCGA-LUAD、GSE131907和GSE13213数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7683 | 2025-10-06 |
Deciphering Intercellular Communication of the Immune Landscape within Autosomal Dominant Polycystic Kidney Disease Microenvironment at Single-Cell Resolution
2025 Jan-Dec, Kidney diseases (Basel, Switzerland)
DOI:10.1159/000545663
PMID:40421435
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了常染色体显性多囊肾病微环境中免疫细胞间的复杂通讯网络 | 首次在单细胞分辨率下系统解析ADPKD微环境中免疫细胞互作网络，发现M2样巨噬细胞亚群通过IL-10信号促进囊肿细胞增殖的新机制 | 样本量较小（7例ADPKD和3例健康对照），需更大规模研究验证发现 | 解析ADPKD肾脏微环境中关键细胞类型及其相互作用机制 | ADPKD患者和健康人的肾脏组织样本 | 单细胞生物学 | 常染色体显性多囊肾病 | 单细胞RNA测序 | CellChat, VISION, pySCENIC, Monocle V3 | 单细胞转录组数据 | 7例ADPKD患者和3例健康人肾脏样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7684 | 2025-10-06 |
Ligand-receptor dynamics in heterophily-aware graph neural networks for enhanced cell type prediction from single-cell RNA-seq data
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1547231
PMID:40421418
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研究论文 | 本研究探索了异质性感知图神经网络在单细胞RNA测序数据分析中的应用，通过整合配体-受体动态信息提升细胞类型预测准确性 | 通过提取配体-受体关联并构建具有不同边同质性比例的细胞-细胞关联网络，增强了细胞通讯通路的生物学相关性和准确性，特别关注异质性数据处理方法 | 研究仅基于六个数据集进行验证，需要更多样化的数据集来进一步验证方法的普适性 | 提升单细胞RNA测序数据中细胞类型预测的准确性和生物学意义 | 单细胞RNA测序数据和细胞-细胞相互作用网络 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图卷积网络, GraphSAGE, 图注意力网络, MixHop, 门控双核GNN | 基因表达数据, 配体-受体相互作用数据 | 六个不同的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7685 | 2025-10-06 |
Identification of PRKCQ-AS1 as a Keratinocyte-Derived Exosomal lncRNA That Promotes Th17 Differentiation and IL-17 secretion in Psoriasis Through Bioinformatics, Machine Learning Algorithms, and Cell Experiments
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S521553
PMID:40433053
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研究论文 | 本研究通过生物信息学、机器学习算法和细胞实验，鉴定出角质形成细胞来源的外泌体lncRNA PRKCQ-AS1可通过激活STAT3信号通路促进Th17细胞分化和IL-17分泌，从而参与银屑病发病机制 | 首次鉴定PRKCQ-AS1作为角质形成细胞来源的外泌体lncRNA在银屑病中的作用机制，并通过多种机器学习算法和实验验证其功能 | 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞实验，需要进一步的体内实验验证 | 探索调控银屑病Th17/IL-17轴的关键外泌体ncRNA及其作用机制 | 银屑病相关的ncRNA、Th17细胞、角质形成细胞、CD4+T细胞 | 生物信息学 | 银屑病 | RNA测序、单细胞RNA测序、全基因组关联研究、机器学习算法、免疫荧光、qRT-PCR、Western blot | 加权基因共表达网络分析、五种机器学习算法 | 基因表达数据、单细胞数据、GWAS数据 | 来自GEO数据库的批量RNA测序数据集、大规模单细胞RNA测序数据 | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7686 | 2025-10-06 |
Reversing VTN deficiency inhibits the progression of pancreatic cancer and enhances sensitivity to anti-PD1 immunotherapy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1578870
PMID:40433359
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研究论文 | 本研究揭示细胞外基质蛋白玻连蛋白(VTN)在胰腺癌中的双重功能：抑制肿瘤进展并增强抗PD1免疫疗法敏感性 | 首次系统阐明VTN在胰腺癌中的双重调控作用，发现其既能抑制肿瘤恶性表型又能调节免疫治疗反应 | 研究主要基于临床前模型，需要进一步临床验证 | 探索VTN作为胰腺癌预后生物标志物和免疫治疗增敏靶点的潜力 | 胰腺癌细胞系、小鼠皮下肿瘤模型、公共数据库临床样本 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、功能实验、机制研究 | 同基因小鼠皮下肿瘤模型 | 基因表达数据、细胞功能数据、动物实验数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7687 | 2025-10-06 |
Glypican-3 regulated epithelial mesenchymal transformation-related genes in osteosarcoma: based on comprehensive tumor microenvironment profiling
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1566061
PMID:40433364
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研究论文 | 本研究通过综合分析骨肉瘤肿瘤微环境，揭示了Glypican-3调控上皮间质转化相关基因的作用机制 | 首次基于EMT相关基因构建骨肉瘤预后模型，并结合单细胞RNA测序技术验证模型基因在细胞亚群中的表达特征 | 研究样本量有限，功能验证仅在MG-63细胞系中进行，需要更多临床样本验证 | 探索EMT在骨肉瘤发生发展和免疫治疗反应中的作用机制 | 骨肉瘤患者样本和MG-63细胞系 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序，加权基因共表达网络分析，LASSO算法，基因敲除 | 预后预测模型 | 转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 多个骨肉瘤转录组数据集和验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7688 | 2025-10-06 |
Investigating the molecular mechanisms associated with ulcerative colitis through the application of single-cell combined spatial transcriptome sequencing
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1534768
PMID:40433374
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研究论文 | 通过单细胞联合空间转录组测序研究溃疡性结肠炎的分子机制 | 首次结合单细胞测序与空间转录组技术系统分析UC相关单核细胞亚型，并鉴定出GNG5和TIMP1两个关键调控基因 | 研究样本量有限，动物模型与人类疾病存在差异，需要进一步的功能验证实验 | 阐明溃疡性结肠炎的发病分子机制 | 溃疡性结肠炎患者样本和DSS诱导的结肠炎小鼠模型 | 生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序, 免疫组织化学, 免疫荧光, Western blotting | LASSO, SVM | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 蛋白质表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7689 | 2025-10-06 |
CD4+T and CD8+T cells profile in lung inflammation and fibrosis: targets and potential therapeutic drugs
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1562892
PMID:40433386
|
综述 | 本文总结了CD4+T细胞和CD8+T细胞在肺纤维化中的作用及其潜在治疗靶点 | 通过调节T淋巴细胞不同亚群比例及相关信号通路为延缓肺纤维化进程提供新的治疗视角 | 主要基于现有研究总结，缺乏原始实验数据验证 | 探讨T淋巴细胞亚群在肺纤维化中的作用机制和潜在治疗策略 | 肺纤维化患者和矽肺病小鼠模型中的T淋巴细胞 | 免疫学 | 肺纤维化 | 单细胞测序 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7690 | 2025-10-06 |
CDT1 is a Potential Therapeutic Target for the Progression of NAFLD to HCC and the Exacerbation of Cancer
2025, Current genomics
IF:1.8Q3
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析识别了NAFLD向HCC进展过程中的关键基因CDT1，并验证其作为潜在治疗靶点 | 首次通过机器学习模型结合单细胞测序分析确定CDT1是NAFLD向HCC进展中最关键的基因 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证 | 识别NAFLD向HCC进展的潜在治疗靶点 | 非酒精性脂肪肝病(NAFLD)和肝细胞癌(HCC)患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 二代测序, 单细胞测序, 机器学习 | Cox比例风险模型, Lasso回归模型 | 基因表达数据 | 来自GEO和TCGA数据库的大样本数据 | NA | 单细胞RNA测序, 伪时序分析 | NA | NA |
| 7691 | 2025-10-06 |
The covariance environment defines cellular niches for spatial inference
2025-Feb, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-024-02193-4
PMID:38565973
|
研究论文 | 提出了一种利用基因-基因协变结构表示细胞邻域特征的空间分析方法 | 引入了协变环境(COVET)表示法和基于最优传输的距离度量，开发了环境变分推断(ENVI)模型 | NA | 解决高分辨率空间分析技术中细胞邻域特征表示的关键挑战 | 细胞邻域或生态位 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序,单细胞RNA测序 | 条件变分自编码器 | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 数百万细胞 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7692 | 2025-10-06 |
Landscape of spatial disruption of homeostasis in the middle temporal gyrus of epileptic patients
2025-Aug-01, Brain research
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.brainres.2025.149688
PMID:40350141
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析癫痫患者颞中回的细胞和空间稳态破坏 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学揭示癫痫患者颞中回的细胞空间重组和稳态破坏机制 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证发现 | 阐明癫痫相关的细胞和空间稳态破坏机制 | 癫痫患者和对照组的颞中回脑组织 | 空间转录组学 | 癫痫 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 空间转换张量算法 | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7693 | 2025-10-06 |
Immune checkpoint inhibitor-associated pneumonitis: focus on diagnosis and underlying mechanisms
2025-Jul-01, Current opinion in pulmonary medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.1097/MCP.0000000000001175
PMID:40265506
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综述 | 本文综述免疫检查点抑制剂相关肺炎的诊断、风险因素、治疗策略及其病理生理机制 | 重点关注支气管肺泡灌洗液单细胞RNA测序等新技术在揭示疾病机制中的应用 | NA | 更新对免疫检查点抑制剂相关肺炎的认识，特别关注其病理生理机制 | 免疫检查点抑制剂相关肺炎 | NA | 肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 7694 | 2025-10-06 |
Elevating single-particle encapsulation in droplet microfluidics by utilizing surface acoustic wave and flow control
2025-May-28, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d4lc00787e
PMID:40302630
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研究论文 | 提出了一种集成表面声波和鞘流控制的液滴微流控系统，显著提高了单颗粒封装效率 | 结合表面声波和鞘流控制实现颗粒线性排列，突破传统方法的泊松分布限制 | 未明确说明系统在更复杂生物样本中的应用限制 | 提高液滴微流控中单颗粒封装效率 | 聚苯乙烯微球、磁珠和H22细胞 | 微流控技术 | NA | 表面声波(SAW)、鞘流控制、液滴微流控 | NA | 实验数据 | 多种浓度溶液的聚苯乙烯微球、磁珠和H22细胞 | NA | 液滴微流控、单细胞分析 | NA | 集成表面声波和鞘流控制的液滴微流控系统 |
| 7695 | 2025-10-06 |
Image guided construction of a common coordinate framework for spatial transcriptome data
2025-May-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-01862-x
PMID:40413226
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研究论文 | 提出深度学习算法STaCker，通过图像配准统一空间转录组切片的坐标框架 | 开发了首个通过整合组织图像和基因表达构建复合图像表示的空间转录组坐标统一算法，仅使用合成数据进行训练 | 未提及算法在极端组织变形情况下的性能表现 | 解决空间转录组切片间缺乏统一坐标框架的问题，实现数据比较和整合 | 空间转录组数据切片 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术 | 深度学习 | 图像、基因表达数据 | 多个基准测试数据集和真实空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 7696 | 2025-10-06 |
Construction of a deep learning model and identification of the pivotal characteristics of FGF7- and MGST1- positive fibroblasts in heart failure post-myocardial infarction
2025-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.143171
PMID:40258553
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析构建深度学习模型，揭示了FGF7+和MGST1+成纤维细胞在心肌梗死后心力衰竭中的关键特征 | 首次发现FGF7MGST1成纤维细胞在心肌梗死后心力衰竭中下调，并通过多组学分析揭示其细胞通讯特征和因果关联 | 研究主要基于小鼠模型和单细胞测序数据，需要在人类样本中进一步验证 | 探究成纤维细胞异质性在心肌梗死后心力衰竭中的作用机制 | 心脏组织中的成纤维细胞，特别是FGF7+和MGST1+成纤维细胞亚群 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，qRT-PCR，孟德尔随机化分析 | 深度学习模型，机器学习算法 | 单细胞转录组数据，基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量，包含小鼠心脏组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7697 | 2025-10-06 |
Neurotrophin-3/chitosan inhibits cuproptosis-related genes to enable functional recovery after spinal cord injury
2025-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.143403
PMID:40268016
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研究论文 | 本研究探讨了铜死亡相关基因在脊髓损伤中的调控机制，并评估了神经营养因子-3/壳聚糖在促进功能恢复方面的治疗潜力 | 首次整合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq分析脊髓损伤后铜死亡相关基因的调控网络，发现神经营养因子-3/壳聚糖可抑制铜死亡相关基因表达 | 需要在更大样本队列中验证研究结果，并进一步探索NT3-壳聚糖调控铜死亡相关基因的详细机制 | 研究脊髓损伤中铜死亡相关基因的调控机制及潜在治疗方法 | 小鼠脊髓组织 | 生物信息学 | 脊髓损伤 | RNA-seq, scRNA-seq, 分子对接分析 | 机器学习 | 基因表达数据 | 小鼠脊髓组织在不同时间点的样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 7698 | 2025-10-06 |
Role of Galactosylceramide Metabolism in Satellite Glial Cell Dysfunction and Neuron-Glia Interactions in Painful Diabetic Peripheral Neuropathy
2025-03-07, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14060393
PMID:40136642
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研究论文 | 本研究探讨了半乳糖神经酰胺代谢在痛性糖尿病周围神经病变中卫星胶质细胞功能障碍和神经元-胶质细胞相互作用中的作用 | 首次揭示半乳糖神经酰胺耗竭是痛性糖尿病周围神经病变中卫星胶质细胞功能障碍的核心介质，并识别出易受影响的卫星胶质细胞亚群 | 研究仅使用大鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 研究半乳糖神经酰胺在糖尿病周围神经病变进展过程中对卫星胶质细胞功能和神经元-胶质细胞相互作用的影响 | 痛性糖尿病周围神经病变大鼠模型的背根神经节卫星胶质细胞和神经元 | 神经科学 | 糖尿病周围神经病变 | 单细胞RNA测序、靶向质谱分析、免疫荧光分析 | NA | 基因表达数据、质谱数据、图像数据 | 痛性糖尿病周围神经病变大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7699 | 2025-10-06 |
Multihormone-producing capabilities of normal pancreatic islet cells-spatial transcriptomics analysis using Xenium
2025, Biomedical research (Tokyo, Japan)
DOI:10.2220/biomedres.46.129
PMID:40436764
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研究论文 | 通过Xenium空间转录组学分析研究成人胰岛细胞的多激素产生能力 | 首次使用Xenium空间转录组技术揭示成人胰岛细胞具有同时产生多种胰腺激素的基因表达潜力 | 样本量较小（仅3例患者），仅基于基因转录水平推测激素产生能力，未验证蛋白质表达 | 阐明成人胰岛细胞是否严格维持单一激素产生能力或保留多激素产生可塑性 | 人胰腺胰岛细胞 | 空间转录组学 | 胰腺肿瘤 | 空间转录组学分析 | NA | 空间基因表达数据 | 3例胰腺肿瘤患者的11个胰岛，共773个胰岛细胞 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium空间基因表达平台，使用477个探针 |
| 7700 | 2025-10-06 |
GRACE: Unveiling Gene Regulatory Networks With Causal Mechanistic Graph Neural Networks in Single-Cell RNA-Sequencing Data
2025-05, IEEE transactions on neural networks and learning systems
IF:10.2Q1
DOI:10.1109/TNNLS.2024.3412753
PMID:38896510
|
研究论文 | 提出一种基于图神经网络和结构因果模型的GRACE框架，用于从单细胞RNA测序数据中推断基因调控网络并进行因果推理 | 将结构因果模型与图神经网络结合，首次在单细胞RNA测序数据中实现基因因果关系的显式建模和推理 | 未明确说明模型的计算复杂度或对大规模数据集的扩展性 | 从单细胞RNA测序数据中准确推断基因调控网络并揭示基因间的因果关系 | 基因调控网络和基因因果关系 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图神经网络, 自编码器, 结构因果模型 | 基因表达数据 | 7个基准数据集和人类外周血单核细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |