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当前共找到 10619 篇文献,本页显示第 741 - 760 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
741 2026-01-29
From multi-omics to functional validation: the PTMRS stratifies TME and positions PDGFRB in CRC biology
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究构建了一个基于翻译后修饰相关基因的风险特征模型(PTMRS),用于结直肠癌的预后分层,并通过实验验证了PDGFRβ在肿瘤微环境中的关键作用 首次整合多种翻译后修饰信号构建结直肠癌风险模型,并通过单细胞RNA测序和细胞通讯分析揭示了PTMRS与肿瘤微环境的关联,实验验证了PDGFRβ在成纤维细胞中的促癌功能 需要在体内模型和前瞻性临床队列中进一步验证 开发结直肠癌的精准预后分层工具并探索其生物学机制 结直肠癌患者样本、人类结肠成纤维细胞和结直肠癌细胞 生物信息学 结直肠癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、细胞通讯分析(CellChat)、体外功能实验 Cox偏最小二乘框架 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 TCGA和GTEx数据集中的结直肠癌样本,多个独立队列和免疫治疗数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
742 2026-01-29
Single-cell transcriptome-wide Mendelian randomization identifies mitochondrial targets in immune cells for Major Depressive Disorder
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组孟德尔随机化方法,识别了免疫细胞中与重度抑郁症风险相关的线粒体靶基因 整合多组学数据与机器学习,结合细胞类型特异性孟德尔随机化分析,首次在免疫细胞中鉴定出线粒体相关能量代谢基因对重度抑郁症风险的因果影响 研究主要基于遗传关联数据,需进一步实验验证基因功能机制;样本来源和模型验证可能限制结果的普适性 识别与重度抑郁症风险相关的免疫细胞中线粒体基因,为生物标志物和治疗靶点开发提供依据 免疫细胞中的线粒体相关能量代谢基因(MEMRGs)及重度抑郁症患者 生物信息学 重度抑郁症 单细胞转录组测序,孟德尔随机化,机器学习,ssGSEA,CIBERSORT 机器学习模型(未指定具体类型),孟德尔随机化模型 多组学数据(包括转录组数据),遗传数据 未明确指定人类样本数量,但包括独立队列验证和CUMS大鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
743 2026-01-29
Single-cell transcriptional profiling revealed the protective effects of Buddleoside in sepsis-associated acute liver injury
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序揭示了天然化合物Buddleoside对脓毒症相关急性肝损伤的保护作用及其免疫调节机制 首次在单细胞分辨率下系统阐明Buddleoside通过调节内皮细胞、中性粒细胞和巨噬细胞亚群来缓解脓毒症相关急性肝损伤的分子机制 研究仅基于小鼠模型,尚未在人体中进行验证;机制研究主要依赖转录组数据,缺乏蛋白质功能验证 评估Buddleoside对脓毒症相关急性肝损伤的保护作用并探索其免疫调节机制 小鼠脓毒症相关急性肝损伤模型中的肝脏细胞 单细胞组学 脓毒症相关急性肝损伤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠模型(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
744 2026-01-29
Integrated single-cell and bulk transcriptomic analysis reveals shared pathogenesis and prognostic biomarkers in breast and thyroid cancers
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞和批量转录组分析,揭示了乳腺癌和甲状腺癌的共享发病机制及预后生物标志物 首次结合单细胞和批量转录组数据,系统探索乳腺癌与甲状腺癌的共病分子机制,并利用机器学习构建预后模型,验证了SMR3B作为共享预后基因 研究主要基于生物信息学分析,实验验证部分有限,且样本来源和数量可能影响结果的普适性 阐明乳腺癌和甲状腺癌的共享发病机制,并识别共同的预后生物标志物和治疗靶点 乳腺癌和甲状腺癌的转录组数据,包括单细胞和批量RNA测序数据 生物信息学 乳腺癌, 甲状腺癌 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 差异表达基因分析, 功能富集分析, 拷贝数变异分析, 非负矩阵分解, 加权基因共表达网络分析, 机器学习算法 非负矩阵分解, 加权基因共表达网络分析, 机器学习模型 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
745 2026-01-29
P2RY13+ dendritic cells correlate with enhanced antigen presentation and lymphocyte activation in lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in medicine IF:3.1Q1
研究论文 本研究通过整合多组学数据,揭示了P2RY13在肺腺癌肿瘤微环境中的特异性表达于树突状细胞,并阐明了其通过增强抗原呈递和T细胞激活来促进抗肿瘤免疫的作用机制 首次在单细胞分辨率下确定了P2RY13在肺腺癌肿瘤微环境中的特异性细胞表达谱(树突状细胞),并系统性地将其表达与免疫浸润、细胞间通讯及预后关联起来 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏实验验证来证实P2RY13在树突状细胞中的功能机制 探究P2RY13在肺腺癌肿瘤微环境中的细胞特异性表达、功能及其与免疫调节和预后的关系 肺腺癌患者肿瘤组织及正常组织的转录组和临床数据 生物信息学 肺腺癌 单细胞RNA测序,转录组分析,生物信息学算法 Seurat, CIBERSORT, MCP-counter, quanTIseq, TIMER, ESTIMATE, CellChat, AUCell, UCell, AddModuleScore, GSVA, JASMINE, singscore, ssGSEA, viper 转录组数据,单细胞RNA测序数据,临床数据 来自TCGA、GEO(GSE68465和GSE31210)和单细胞数据集(GSE131907)的样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
746 2026-01-29
Cellular senescence in age-related cardiovascular disease: past and future
2025, Frontiers in aging IF:3.3Q2
综述 本文综述了细胞衰老在年龄相关心血管疾病中的作用,并提出了一个以衰老相关分泌表型为核心、解释少数衰老细胞如何系统性影响心血管微环境的统一框架 超越对通路的简单罗列,提出了一个以少数衰老细胞如何重编程心血管微环境为核心、整合关键调控网络的统一框架,并前瞻性地讨论了靶向衰老的治疗策略 机制复杂性高,动物模型和体外系统存在局限性 阐明细胞衰老在年龄相关心血管疾病发生发展中的作用机制,并探讨靶向衰老作为延缓心血管衰老和治疗相关疾病的新策略 衰老细胞及其分泌表型对主要心血管细胞类型(心肌细胞、内皮细胞、成纤维细胞、平滑肌细胞)的影响 NA 心血管疾病 单细胞测序 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
747 2026-01-29
JAK-centric explainable few-shot gene-expression diagnosis framework for alopecia via MultiPLIER priors and relation-style set-to-set comparison
2025, Frontiers in molecular biosciences IF:3.9Q2
研究论文 本文开发了一个基于JAK-STAT信号通路的可解释少样本基因表达诊断框架,用于区分斑秃和雄激素性脱发 提出了一种结合生物学先验知识(MultiPLIER潜在变量)和关系式集合比较的少样本深度学习分类器,增强了小样本条件下的诊断鲁棒性和机制可解释性 研究样本量有限,且框架在更广泛疾病类型中的应用仍需验证 开发可解释的AI框架,用于小样本转录组诊断,以区分斑秃和雄激素性脱发 斑秃和雄激素性脱发患者的头皮样本 机器学习 脱发疾病 RNA-seq 少样本深度学习分类器(Relation-style set-to-set comparator) 基因表达数据 未明确指定具体样本数量,但涉及独立AA/AGA/健康头皮样本 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
748 2026-01-29
Spatiotemporal dynamics of spermatogenesis: insights from high-resolution spatial transcriptomics and pseudotime trajectories in mouse testes
2025, Frontiers in reproductive health IF:2.3Q3
研究论文 本研究利用高分辨率空间转录组学技术揭示了小鼠睾丸中精子发生的时空动态过程 采用Salus-STS高分辨率空间转录组学(约1微米分辨率)结合Salus Cellbins算法,首次在单细胞水平上解析了睾丸的空间转录组特征,克服了传统空间转录组学分辨率不足的问题 研究仅基于小鼠模型,未直接验证人类样本;高分辨率技术可能受限于样本处理和成本 探究精子发生的分子基础和时空动态,以增进对男性生殖生物学的理解 小鼠睾丸组织 空间转录组学 男性不育 空间转录组学,单细胞RNA测序 NA 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 NA NA 空间转录组学,单细胞RNA-seq Salus-STS Salus-STS高分辨率空间转录组学(约1微米分辨率)
749 2026-01-28
An Integrated Single-Cell Atlas of the Mouse Ileum Links Nutrient Metabolism with Epithelial and Immune Crosstalk
2025-Dec, The Journal of nutrition IF:3.7Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序构建了小鼠回肠的首个整合单细胞图谱,揭示了上皮细胞和免疫细胞的异质性、营养代谢程序以及上皮-免疫相互作用 首次提供了小鼠回肠的整合单细胞图谱,系统描绘了上皮细胞分化、营养代谢程序以及上皮-免疫细胞间的相互作用,特别是在肠上皮细胞亚群中发现了与维生素A、类胡萝卜素和维生素B12吸收相关的特异性功能 研究仅基于8周龄雄性C57BL/6J小鼠,样本来源单一,未涵盖不同年龄、性别或疾病状态,且未进行功能验证实验 绘制回肠细胞异质性图谱,定义上皮细胞分化、营养代谢程序以及上皮-免疫相互作用,以揭示其在健康和疾病中的作用 8周龄雄性C57BL/6J小鼠的回肠细胞 数字病理学 克罗恩病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) Seurat 单细胞基因表达数据 32,076个回肠细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
750 2026-01-28
TREM2 Impedes Recovery After Spinal Cord Injury by Regulating Microglial Lysosomal Membrane Permeabilization-Mediated Autophagy
2025-Oct, Cell proliferation IF:5.9Q2
研究论文 本研究探讨了TREM2在脊髓损伤后通过调节小胶质细胞溶酶体膜通透性介导的自噬来影响恢复的机制 首次揭示了TREM2通过调节小胶质细胞溶酶体膜通透性介导的自噬在脊髓损伤恢复中的具体作用机制 研究主要基于小鼠模型,临床转化需进一步验证 探究TREM2在脊髓损伤中的潜在机制及其对小胶质细胞功能的影响 野生型和Trem2敲除小鼠的小胶质细胞,以及脊髓损伤模型 神经科学 脊髓损伤 单细胞测序,免疫荧光,3D步态分析,运动诱发电位实验,H&E染色,Masson染色 NA 测序数据,图像数据,行为数据 野生型和Trem2敲除小鼠在脊髓损伤前后的样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
751 2026-01-28
Identification of type 2 diabetes- and obesity-associated human β-cells using deep transfer learning
2025-Sep-22, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究利用深度迁移学习工具DEGAS,通过单细胞RNA-seq数据识别与2型糖尿病和肥胖相关的人类β细胞亚群 应用深度迁移学习工具DEGAS将疾病关联映射到单细胞RNA-seq数据,首次识别出与2型糖尿病和肥胖相关的独特β细胞亚群,并验证了CDKN1C和DLK1基因的表达差异 研究仅基于现有单细胞RNA-seq数据,未来需要扩展到更多人类胰岛组学数据集以揭示复杂的多细胞相互作用 优先识别与疾病相关的β细胞亚群,以更好地理解2型糖尿病发病机制并确定靶向治疗的相关基因 人类胰腺胰岛β细胞 机器学习 2型糖尿病 单细胞RNA-seq 深度迁移学习 单细胞RNA-seq数据 来自健康和非糖尿病捐赠者的人类胰腺切片 NA 单细胞RNA-seq NA NA
752 2026-01-28
Optimizing Single-Cell Long-Read Sequencing for Enhanced Isoform Detection in Pancreatic Islets
2025-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究优化了单细胞长读长测序协议,以提升胰腺胰岛中异构体的检测能力 通过优化5'文库制备协议和靶向耗竭胰岛素转录本,提高了单细胞长读长测序的读长和转录本检测效率 单细胞长读长测序存在技术挑战,如读长不足和错误率较高 优化单细胞长读长测序协议,以增强胰腺胰岛中异构体的检测 胰腺胰岛细胞 数字病理学 糖尿病 单细胞长读长RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
753 2026-01-28
Investigating Gene Expression Noise Reduction by MicroRNAs and MiRISC Reinforcement by Self-Feedback Regulation of mRNA Degradation
2025-Sep-14, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过数学建模和单细胞RNA-seq数据分析,探讨了microRNA通过负自反馈调控mRNA降解来降低基因表达噪声的机制 首次同时分析mRNA降解动力学和表达噪声,并证明通过mRNA降解的自反馈调控可以降低噪声 NA 研究microRNA介导的基因表达噪声减少机制 microRNA诱导的沉默复合体(miRISC)及其靶向的mRNAs 计算生物学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 数学建模 单细胞RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
754 2026-01-28
Co-regulator activity of Mediator of DNA Damage Checkpoint 1 (MDC1) is associated with DNA repair dysfunction and PARP inhibitor sensitivity in lobular carcinoma of the breast
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究揭示了乳腺浸润性小叶癌(ILC)中MDC1蛋白作为雌激素受体共调节因子的新功能,并发现该功能与同源重组修复功能障碍及PARP抑制剂敏感性相关 首次发现MDC1在ILC细胞中作为雌激素受体的共调节因子,并揭示这种新功能导致独特的同源重组修复功能障碍(不同于经典BRCAness状态),且与PARP抑制剂敏感性相关 研究主要基于细胞系和异种移植模型,临床样本验证有限;MDC1共调节功能的具体分子机制尚未完全阐明 探究乳腺浸润性小叶癌中MDC1蛋白的双重功能(DNA修复与雌激素受体共调节)及其治疗意义 乳腺浸润性小叶癌细胞系、异种移植模型及肿瘤数据 癌症生物学 乳腺癌 单细胞转录组分析、DNA修复活性分析、蛋白质相互作用组分析、异种移植模型 NA 转录组数据、蛋白质相互作用数据、功能实验数据 多个ILC细胞系及异种移植模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
755 2026-01-28
Uncovering the Signatures of Cellular Senescence in the Human Dorsolateral Prefrontal Cortex
2025-Feb-20, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过空间转录组学和单核RNA测序技术,构建了人类背外侧前额叶皮层衰老和细胞衰老的转录组图谱 结合Visium空间转录组学和单核RNA测序,首次在非病理人类组织中系统揭示了背外侧前额叶皮层细胞衰老的异质性和细胞类型特异性特征 研究基于非病理组织,可能未完全反映疾病状态下的衰老特征;细胞衰老的罕见性和异质性仍带来识别挑战 探索人类背外侧前额叶皮层在衰老过程中的细胞衰老特征和转录组变化 人类背外侧前额叶皮层的非病理组织样本 数字病理学 老年疾病 空间转录组学,单核RNA测序 NA 空间转录组数据,单核RNA测序数据 NA 10x Genomics 空间转录组学,单细胞RNA测序 10x Visium,10x Chromium Visium空间转录组学用于空间基因表达分析,单核RNA测序用于细胞类型特异性转录组分析
756 2026-01-27
Cross-organ single-cell integration identifies liver-specific fibroblast programs and HGF-MET/AGT-AGTR1B axes that link fibrosis to hepatocarcinogenesis
2025-Dec-29, Neuro endocrinology letters
PMID:41565578
研究论文 本研究通过跨器官单细胞整合分析,识别了肝脏特异性成纤维细胞程序及HGF-MET/AGT-AGTR1B轴,揭示了肝纤维化与肝细胞癌发生之间的潜在联系 采用跨器官单细胞RNA-seq数据整合方法,通过减去共享的全纤维化特征来提名肝脏特异性成纤维细胞基因和通路,并识别了肝脏选择性基质环路及肝细胞-成纤维细胞轴 研究依赖于公共数据集,可能存在批次效应或数据异质性;结论为假设性,需进一步实验验证 探究肝脏选择性基质机制,以及肝纤维化如何连接到肝细胞癌的发生 纤维化心脏、肾脏、肝脏和肺脏的单细胞RNA-seq数据,以及肝细胞癌数据集 单细胞组学 肝细胞癌 单细胞RNA-seq Seurat整合工作流、Slingshot伪时间分析、CellChat配体-受体推断 单细胞RNA-seq数据 多个公共数据集,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
757 2026-01-27
Intraperitoneal programming of tailored CAR macrophages via mRNA lipid nanoparticle to boost cancer immunotherapy
2025-Dec-24, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究开发了一种靶向巨噬细胞的mRNA脂质纳米颗粒系统,用于原位编程CAR-M,以增强对实体瘤腹膜转移的免疫治疗效果 通过mRNA-LNP系统评估了36种CAR格式,并发现CD3ζ TLR4 ICDs的CAR-M能有效激活适应性免疫,与PD-1/L1疗法协同作用,重塑肿瘤微环境 CAR设计中潜在细胞内域及其抗肿瘤机制仍需系统探索,研究可能未全面评估所有CAR格式的长期效果或副作用 开发针对实体瘤腹膜转移的免疫治疗策略,通过编程CAR-M来增强抗肿瘤免疫反应 巨噬细胞、CAR-M、肿瘤微环境、CD8 T细胞 免疫治疗 实体瘤 mRNA脂质纳米颗粒系统、单细胞RNA测序 CAR-M模型 RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
758 2026-01-27
Comprehensive analysis of malignant subtypes of lung adenocarcinoma based on multi-omics landscape and functional validation of prognostic biomarker BAIAP2L2
2025-Dec-23, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究基于多组学数据,对肺腺癌恶性亚型进行了综合分析,并通过功能实验验证了预后生物标志物BAIAP2L2的作用 整合单细胞RNA测序和RNA测序数据,结合CNV评估、细胞轨迹分析、恶性细胞识别和细胞通讯分析等多种方法,深入解析肺腺癌上皮细胞的异质性,并首次通过CoxBoost模型挖掘并实验验证了BAIAP2L2作为肺腺癌预后风险基因的功能 研究主要基于公共数据库数据,实验验证仅限于体外细胞实验,缺乏体内动物模型或临床样本的进一步验证 深入探究肺腺癌的恶性亚型特征,并寻找有效的预后生物标志物 肺腺癌上皮细胞 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序, RNA测序 CoxBoost模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
759 2026-01-27
PLAUR, C3, and EMP3 coordinate tumor progression and immune evasion in clear cell renal cell carcinoma
2025-Dec-19, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过生物信息学分析和实验验证,揭示了PLAUR、C3和EMP3三个基因在透明细胞肾细胞癌(ccRCC)的肿瘤进展和免疫逃逸中的协同作用,并指出PLAUR是主要驱动因子 首次系统性地将PLAUR、C3和EMP3三个基因联系起来,阐明它们在ccRCC肿瘤微环境和免疫逃逸中的协同作用机制,并通过单细胞RNA-seq数据明确了这些基因在不同细胞类型中的表达模式 研究主要基于公共数据集和体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证和临床样本的直接功能验证 识别驱动透明细胞肾细胞癌(ccRCC)进展和免疫逃逸的关键分子,为ccRCC的诊断和治疗提供新靶点 透明细胞肾细胞癌(ccRCC) 生物信息学 肾癌 单细胞RNA-seq, RT-qPCR, Western blotting, CCK-8, 伤口愈合实验, Transwell实验, ELISA NA 基因表达数据, 单细胞RNA-seq数据 基于GSE6344和GSE781数据集,以及正常肾细胞和ccRCC细胞系 NA 单细胞RNA-seq NA NA
760 2026-01-27
Identification of NK cell marker genes based on single-cell sequencing to establish a prognostic signature in breast cancer
2025-Dec-19, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究基于单细胞测序数据识别NK细胞标志基因,构建了一个用于乳腺癌预后预测的模型 首次结合单细胞测序数据识别NK细胞标志基因,并利用机器学习构建乳腺癌预后模型,揭示了NK细胞在乳腺癌免疫浸润中的关键作用 研究依赖于公共数据库(TCGA和GEO)的回顾性数据,缺乏前瞻性临床队列验证 阐明NK细胞在乳腺癌预后和免疫浸润中的作用,并构建预测模型 乳腺癌患者 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 机器学习模型 基因表达数据 TCGA和GEO数据库中的乳腺癌样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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