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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7461 | 2025-10-06 |
Impact of lymph node metastasis on immune microenvironment and prognosis in colorectal cancer liver metastasis: insights from multiomics profiling
2025-Apr, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02921-2
PMID:39753715
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研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨淋巴结转移对结直肠癌肝转移患者预后的影响及其免疫机制 | 首次整合SEER数据库和中国多中心队列,结合bulk RNA测序、单细胞RNA测序和蛋白质组学数据系统分析淋巴结转移对免疫微环境的影响 | 回顾性研究设计,需要前瞻性验证 | 研究淋巴结转移对结直肠癌肝转移患者预后的影响及免疫机制 | 结直肠癌肝转移患者 | 数字病理 | 结直肠癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 免疫组织化学 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据, 病理图像 | 来自SEER队列和中国多中心队列的结直肠癌肝转移患者 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 7462 | 2025-10-06 |
Exploration of common molecular mechanisms of psoriatic arthritis and aging based on integrated bioinformatics and single-cell RNA-seq analysis
2025-04, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2025.167730
PMID:39965531
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研究论文 | 通过整合生物信息学和单细胞RNA测序分析探索银屑病关节炎与衰老的共同分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序数据整合分析发现银屑病关节炎与衰老共享的CD8-CM细胞亚群和关键基因 | 样本来源有限,仅分析了滑膜液和外周血数据 | 研究银屑病关节炎与衰老之间的共同分子机制 | 银屑病关节炎患者的滑膜液、衰老患者的外周血样本以及正常人群 | 生物信息学 | 银屑病关节炎 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 共定位分析, KEGG通路富集分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, GWAS数据, eQTL数据 | 银屑病关节炎患者滑膜液、衰老患者外周血和正常人群样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7463 | 2025-10-06 |
20 years of stemness: From stem cells to hypertranscription and back
2025-03-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102406
PMID:39919752
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综述 | 回顾干细胞转录组学20年发展历程,探讨干细胞超转录状态的发现与意义 | 发现2002年干细胞特征基因签名实际上是干细胞超转录状态的标志,这一发现早于超转录概念的确立 | NA | 回顾干细胞转录组学研究进展,探讨干细胞超转录状态的特征与意义 | 胚胎干细胞和成体干细胞 | 转录组学 | NA | 微阵列,单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7464 | 2025-10-06 |
Profiling immune cell tissue niches in the spatial -omics era
2025-Mar, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.11.001
PMID:39522655
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综述 | 本文综述了空间组学技术在免疫细胞组织生态位研究中的最新进展,并提出了定义免疫生态位的三步框架 | 提出了定义和表征免疫生态位的三步框架,整合了空间多参数分析的最新方法学进展 | 免疫生态位的定义标准在文献中存在不一致性,且空间分析方法仍在发展中 | 探讨空间组学技术如何促进对组织免疫景观的深入理解 | 免疫细胞及其组织环境 | 空间组学 | 免疫相关疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间多组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 7465 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing and machine learning provide candidate drugs against drug-tolerant persister cells in colorectal cancer
2025-03, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2025.167693
PMID:39870146
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和机器学习方法,在结直肠癌患者来源类器官中识别药物耐受持久性细胞并筛选候选药物 | 首次在家族性腺瘤性息肉病相关类器官中应用单细胞RNA测序和机器学习识别DTP细胞,并发现YM-155和THZ2与曲美替尼的协同作用 | 研究仅基于三个患者来源类器官样本,样本量有限 | 开发针对结直肠癌中药物耐受持久性细胞的靶向治疗策略 | 家族性腺瘤性息肉病患者来源的类器官(良性肿瘤、恶性肿瘤和正常类器官) | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | 3个患者来源类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7466 | 2025-10-06 |
Integrated analyses uncover new features of atypical memory B cells and novel targets for intervention
2025-03, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2025.152877
PMID:39938454
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研究论文 | 本研究通过整合分析揭示了非典型记忆B细胞的新特征及其在系统性风湿性疾病中的致病作用 | 首次系统鉴定非典型记忆B细胞的转录组特征、免疫表型和信号通路,并证实其在系统性风湿性疾病中的扩增现象 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步实验验证功能机制 | 表征非典型记忆B细胞的免疫特征及其在系统性风湿性疾病中的致病机制 | B细胞亚群,特别是非典型记忆B细胞 | 免疫学 | 系统性风湿性疾病 | 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术,生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7467 | 2025-10-06 |
Omics based technology application in poultry meat research
2025-Jan, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2024.104643
PMID:39662255
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综述 | 本文综述了组学技术在禽肉研究中的应用,包括基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学和脂质组学等方法 | 系统整合多种组学技术研究禽肉品质问题,特别关注空间转录组学和代谢组学在木质胸病研究中的应用 | NA | 探讨组学技术如何增进对禽肉品质问题和复杂性状的理解 | 家禽肉类品质,特别是鸡肉品质和肌肉病变 | 生物信息学 | 禽类肌肉疾病 | 基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、脂质组学、空间转录组学、空间代谢组学、多组学分析 | NA | 组学数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间代谢组学, 多组学分析 | NA | NA |
| 7468 | 2025-10-06 |
A novel Tc17 population recruited by tumor cells promotes tumor progression in gastric cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1592328
PMID:40452847
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和空间转录组学技术揭示了胃癌微环境中Tc17细胞的免疫抑制功能及其促进肿瘤进展的机制 | 首次系统性地揭示了Tc17细胞在胃癌微环境中的免疫抑制功能,发现肿瘤细胞通过CXCL16-CXCR6轴招募Tc17细胞,而Tc17细胞通过分泌IL-17A和IL-26促进肿瘤进展 | 研究主要基于体外实验验证,缺乏体内动物模型验证;样本量相对有限 | 探究Tc17细胞在胃癌肿瘤微环境中的功能和作用机制 | 胃癌患者组织样本和细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多色免疫组化染色, SCENIC分析, 伪时间分析, 细胞-细胞相互作用分析 | NA | 单细胞测序数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 65例胃癌样本的单细胞测序数据(296,879个细胞), 10例胃癌样本的空间转录组数据 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7469 | 2025-10-06 |
Metabolic reprogramming signature predicts prognosis and immune landscape in small cell lung cancer: MOCS2 validation and implications for personalized therapy
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1592888
PMID:40452920
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析建立了小细胞肺癌的代谢重编程预后模型,并验证了关键基因MOCS2的功能 | 首次系统识别小细胞肺癌代谢重编程特征并构建基于梯度提升机的预后模型,通过实验验证MOCS2基因功能 | 使用公共数据集,样本来源有限;功能验证仅限于体外实验 | 开发小细胞肺癌预后预测模型并探索代谢重编程的临床意义 | 小细胞肺癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, siRNA敲低, WGCNA分析 | 梯度提升机(GBM) | 基因表达数据 | 来自GSE60052和cBioportal队列的公共数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 7470 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis Reveals Aspirin Restores Intervertebral Disc Integrity via Ferroptosis Regulation
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S519218
PMID:40453974
|
研究论文 | 通过单细胞分析发现阿司匹林通过调控铁死亡恢复椎间盘完整性 | 首次在椎间盘退变中鉴定出CDKN1A⁺aNPC亚型作为早期预警标志,并揭示阿司匹林通过靶向GPX4抑制铁死亡的新机制 | 研究样本量有限,机制验证仍需进一步深入 | 探究椎间盘退变的细胞异质性及阿司匹林的治疗机制 | 椎间盘髓核细胞亚群 | 单细胞分析 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序,分子对接,体外实验,体内实验 | Harmony算法 | 单细胞RNA测序数据 | 四个独立单细胞测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7471 | 2025-10-06 |
To Explore the Key Subgroup and Their Immune Microenvironment During the Formation of Coronary Plaque With scRNA-seq
2025, Cardiology research and practice
IF:1.8Q3
DOI:10.1155/crp/3221767
PMID:40454289
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术探索冠状动脉斑块形成过程中的关键NK细胞亚群及其免疫微环境 | 首次发现C1 RACK1+ NK细胞亚群在冠状动脉斑块形成中的关键作用,并系统分析其在伪时间轨迹、细胞相互作用和转录因子调控中的表达特征 | 样本量较小(15例),需要更大规模研究验证发现 | 探索冠状动脉斑块形成过程中的关键细胞亚群及其免疫微环境机制 | 冠状动脉斑块组织中的NK细胞亚群 | 单细胞组学 | 冠状动脉疾病 | 单细胞RNA测序, CytoTRACE, monocle, slingshot, CellChat, SCENIC | NA | 单细胞转录组数据 | 15例个体标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7472 | 2025-10-06 |
Paricalcitol plus hydroxychloroquine enhances gemcitabine activity and induces mesenchymal to epithelial transition in pancreatic ductal adenocarcinoma: A single cell RNA-seq analysis
2025-Aug-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217809
PMID:40409452
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了帕立骨化醇联合羟氯喹增强吉西他滨活性并诱导胰腺导管腺癌间质-上皮转化的分子机制 | 首次在单细胞分辨率水平系统解析GPH联合治疗方案通过下调纤维连接蛋白和胶原信号通路抑制EMT过程的分子机制 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 | 探究联合药物治疗对胰腺导管腺癌EMT过程的影响机制 | KPC-Luc原位小鼠胰腺导管腺癌模型 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 高维加权基因共表达网络分析, 细胞间通讯分析 | NA | 单细胞转录组数据 | KPC-Luc小鼠肿瘤模型 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 7473 | 2025-10-06 |
Decoding the corneal immune microenvironment in healthy and diabetic mice during corneal wound healing
2025-Jul, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2025.02.010
PMID:40023495
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术解析了健康与糖尿病小鼠角膜伤口愈合过程中免疫微环境的转录组变化 | 首次建立健康与糖尿病小鼠角膜伤口愈合过程中免疫细胞的全面单细胞转录组图谱 | 研究仅限于小鼠模型,机制研究仍需进一步深入验证 | 探究糖尿病角膜病变中免疫微环境的变化机制 | 糖尿病和健康对照小鼠的角膜免疫细胞 | 单细胞组学 | 糖尿病角膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 糖尿病和健康对照小鼠角膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7474 | 2025-10-06 |
Investigating the molecular mechanisms and clinical potential of APO+ endothelial cells associated with PANoptosis in the tumor microenvironment of hepatocellular carcinoma using single-cell sequencing data
2025-Jul, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102402
PMID:40318262
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据探索肝细胞癌肿瘤微环境中与PANoptosis相关的APO+内皮细胞的分子机制和临床潜力 | 首次系统性地在肝细胞癌肿瘤微环境中识别并表征了具有高PANoptosis评分的APO+内皮细胞亚群,并揭示了其通过调控HLA分子表达影响T细胞功能的潜在机制 | 样本量相对较小(16例患者),且研究主要基于生物信息学分析,需要更多实验验证 | 探究PANoptosis在肝细胞癌肿瘤微环境中的具体功能和分子机制 | 肝细胞癌患者的肿瘤微环境细胞,特别是APO+内皮细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,免疫荧光染色,CCK8检测 | AUCell算法,CytoTRACE,scMetabolism | 单细胞RNA测序数据 | 16例肝细胞癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7475 | 2025-10-06 |
SARS-CoV-2 Infection of Human Lung Air-Liquid Interface Cultures Reveals Basal Cells as Relevant Targets
2025-Jun-02, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiaf125
PMID:40065723
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研究论文 | 通过人类肺气液界面培养模型研究SARS-CoV-2感染机制,发现基底细胞是重要感染靶点 | 首次揭示除纤毛细胞和分泌细胞外,基底细胞也是SARS-CoV-2(包括Alpha变种)的重要感染靶点,并证实其在上呼吸道免疫反应中的关键作用 | 研究基于体外培养模型,可能与体内实际情况存在差异;存在供体特异性差异 | 探究SARS-CoV-2感染上呼吸道时涉及的上皮细胞类型及其免疫反应机制 | 人类原代鼻和支气管上皮细胞的气液界面培养物 | 传染病学 | COVID-19 | 病毒复制分析,单细胞RNA测序,光谱显微镜 | NA | 单细胞转录组数据,显微镜图像数据 | 人类原代上皮细胞培养物(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7476 | 2025-10-06 |
Cxcr3 promotes protection from colorectal cancer liver metastasis by driving NK cell infiltration and plasticity
2025-Jun-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI184036
PMID:40168086
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研究论文 | 本研究揭示了CXCR3通过驱动NK细胞浸润和可塑性在结直肠癌肝转移中发挥保护作用的机制 | 首次阐明CXCR3/配体轴通过促进巨噬细胞依赖的NK细胞积累和功能维持来抑制结直肠癌肝转移 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究NK细胞在结直肠癌肝转移中浸润和获得抗肿瘤特性的分子机制 | 结直肠癌肝转移微环境中的NK细胞和巨噬细胞 | 癌症免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,条件性基因敲除,抗体介导的细胞清除 | MC38小鼠模型,SL4诱导的CRC转移模型 | 基因表达数据,细胞表型数据 | 未治疗结直肠癌患者队列的已发表单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7477 | 2025-10-06 |
Perivascular Niche-Resident Alveolar Macrophages Promote Interstitial Pneumonitis Related to Trastuzumab Deruxtecan Treatment
2025-Jun-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-2021
PMID:40300097
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研究论文 | 本研究揭示了曲妥珠单抗德鲁替康(T-DXd)通过肺泡巨噬细胞的Fc-FcγR相互作用引发间质性肺炎的机制 | 首次发现T-DXd诱导的ILD是脱靶不良反应而非靶向脱瘤不良反应,并阐明了肺泡巨噬细胞通过Fc-FcγR摄取T-DXd导致SPP1通路介导的炎症机制 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化需要进一步验证 | 探究T-DXd诱导间质性肺病的分子机制 | 免疫活性小鼠模型和肺泡巨噬细胞 | 免疫学 | 间质性肺病 | 单细胞RNA测序,活体显微镜检查 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据,影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7478 | 2025-10-06 |
Lung endothelial cell heterogeneity in health and pulmonary vascular disease
2025-Jun-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00296.2024
PMID:39772753
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综述 | 本文通过单细胞RNA测序技术探讨肺内皮细胞异质性在健康和肺血管疾病中的作用 | 利用单细胞RNA测序技术识别了新型功能特异性肺内皮细胞亚群(如aerocytes和通用毛细血管内皮细胞)及其在肺动脉高压发病机制中的作用 | 作为小型综述,主要总结现有研究进展,未提供新的实验数据 | 探讨肺内皮细胞异质性在肺血管疾病发生发展中的作用机制 | 肺内皮细胞及其亚群 | 单细胞生物学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 7479 | 2025-10-06 |
Characterization of the recombination activity in the pituitary and ovary of Prop1-iCre knockin mice
2025-Jun-01, American journal of physiology. Endocrinology and metabolism
DOI:10.1152/ajpendo.00049.2025
PMID:40327412
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研究论文 | 本研究通过CRISPR/Cas9系统构建了Prop1-iCre基因敲入小鼠,并验证了其在垂体内分泌细胞和卵巢颗粒细胞中的特异性重组活性 | 首次利用CRISPR/Cas9技术构建Prop1-iCre基因敲入小鼠模型,证实其在垂体内分泌细胞中具有特异性重组活性,同时发现其在卵巢颗粒细胞中的意外重组活性 | 发现Prop1-iCre在卵巢颗粒细胞中存在非预期的重组活性,可能影响实验数据解读 | 开发用于垂体生物学研究的特异性基因操作工具 | Prop1-iCre基因敲入小鼠 | 分子生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑技术,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,组织特异性重组活性数据 | Prop1-iCre小鼠及其与Rosa-tdTomato报告基因小鼠的杂交后代 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7480 | 2025-10-06 |
Oncostatin-M: a novel leukocyte-derived factor facilitating the ovulatory process in the human ovary
2025-Jun-01, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deaf076
PMID:40327872
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研究论文 | 本研究揭示了白细胞来源的制瘤素M在人类排卵过程中的调控作用 | 首次证实白细胞来源的OSM通过激活STAT3、ERK1/2等信号通路调控人类排卵过程 | 使用体外培养的颗粒黄体细胞,可能无法完全模拟体内排卵动态;结果仅适用于人类样本 | 探究白细胞来源的制瘤素M是否调控人类优势卵泡的排卵过程 | 自然周期女性的优势卵泡和IVF患者的卵泡抽吸物 | 生殖生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序,定量PCR,免疫组化,Western blotting,RNA测序 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,激素测定数据 | 自然周期女性19例,IVF患者12例 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |