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当前共找到 10549 篇文献，本页显示第 721 - 740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 721 | 2026-03-18 |
Scalable nonparametric clustering with unified marker gene selection for single-cell RNA-seq data
2025-Sep-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.11.579839
PMID:38405697
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研究论文 | 本文提出了一种名为NCLUSION的非参数聚类方法，用于单细胞RNA测序数据分析，该方法能够同时进行聚类和标记基因选择 | 提出了一种基于无限混合模型的非参数聚类方法，利用贝叶斯稀疏先验在聚类过程中同步识别标记基因，避免了传统方法中事后差异表达分析带来的高假阳性率问题 | 未明确说明方法在特定细胞类型或复杂组织中的适用性限制，也未讨论对批次效应的处理能力 | 开发一种可扩展的单细胞RNA测序数据聚类方法，同时解决聚类参数依赖和标记基因识别假阳性率高的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 无限混合模型，变分推断算法 | 基因表达数据 | 可达数百万细胞的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 722 | 2026-03-18 |
Single-Cell Transcriptome and RNA Sequencing Reveal Immune-Related Markers of Preeclampsia
2025-08, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
DOI:10.1007/s43032-025-01843-5
PMID:40216654
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研究论文 | 本研究通过单细胞和RNA测序技术，比较了先兆子痫与非先兆子痫胎盘样本的免疫微环境，旨在发现调控先兆子痫的关键靶基因 | 首次在单细胞水平上对先兆子痫胎盘的免疫微环境进行系统分析，并识别出巨噬细胞中调控先兆子痫的7个关键靶基因（SLC9A9、SH2B3、SDC3、RCC2、F13A1、CCL2、CBLB） | 研究样本量未明确说明，且分析主要基于公共数据集，需要进一步实验验证这些靶基因的功能 | 探索先兆子痫胎盘免疫微环境中的关键调控基因 | 先兆子痫与非先兆子痫患者的胎盘组织 | 数字病理学 | 先兆子痫 | 单细胞RNA测序，RNA测序 | Scenic包用于转录因子分析，伪时间分析，细胞间通讯分析 | 单细胞转录组数据，RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 723 | 2026-03-18 |
The Genomics of Aging at the Single-Cell Scale
2025-08, Annual review of genomics and human genetics
IF:7.7Q1
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在研究衰老相关细胞变化中的应用，总结了衰老对哺乳动物器官中细胞类型特异性群体变化的影响 | 通过整合过去十年的单细胞研究数据，系统性地总结了衰老对哺乳动物全身细胞类型特异性群体的影响，并探讨了性别和抗衰老干预对细胞群体动态的影响 | NA | 阐明衰老对哺乳动物细胞类型特异性群体变化的影响，为衰老和年龄相关疾病提供潜在治疗靶点 | 哺乳动物器官中的细胞类型特异性群体 | 基因组学 | 老年疾病 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 724 | 2026-03-18 |
Spatiotemporal transcriptomic profiling reveals metabolic dysfunction prior to overt tauopathy in the PS19 mouse model
2025-Jul-10, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6941464/v1
PMID:40671812
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研究论文 | 本研究利用PS19小鼠模型，通过空间转录组学分析揭示了tau蛋白病前期海马和皮层区域的代谢功能障碍 | 首次在PS19小鼠模型中，通过空间转录组学技术，在可检测的tau缠结病理出现前，识别出CA3区域糖酵解通路基因的早期上调，揭示了代谢失调与区域脆弱性的关联 | 研究基于转基因小鼠模型，可能无法完全模拟人类神经退行性疾病的复杂性，且样本量有限 | 探究tau蛋白病中区域脆弱性与tau驱动转录组变化之间的关系，特别是代谢功能障碍在疾病早期的作用 | PS19转基因小鼠模型的海马和皮层区域 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学分析 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 725 | 2026-03-18 |
PINK1 link mitochondria-ER contacts controls deposition of intramuscular fat in pigs
2025-05-20, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151672
PMID:40138759
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研究论文 | 本研究探讨了PINK1蛋白通过调控线粒体-内质网相互作用来调节猪肌肉内脂肪沉积的分子机制 | 首次揭示了PINK1在猪肌肉内脂肪沉积中的关键作用，并发现其通过调控线粒体-内质网接触来影响脂肪沉积过程 | 研究主要基于猪模型，结果在人类或其他物种中的适用性尚需验证 | 探究PINK1如何调控猪肌肉内脂肪沉积的分子机制 | 猪的肌肉组织、纤维-脂肪祖细胞和脂肪细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多个猪品种的肌肉组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 726 | 2026-03-18 |
Dissecting the Single-Cell Diversity and Heterogeneity Underlying Cervical Precancerous Lesions and Cancer Tissues
2025-05, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
DOI:10.1007/s43032-024-01695-5
PMID:39354287
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研究论文 | 本文通过整合单细胞数据集，研究了从宫颈癌前病变到宫颈鳞状细胞癌的细胞多样性和异质性 | 利用单细胞组成数据分析（scCODA）揭示细胞类型组成变化，并通过ATAC-seq分析将表观遗传改变与基因表达谱关联，识别了关键转录因子（如YY1） | 研究依赖于现有数据集整合，可能受样本来源和技术差异影响，且新队列数据（HRA001742）的相似性评估仅基于逻辑回归模型 | 探究宫颈癌前病变到宫颈鳞状细胞癌的细胞多样性和异质性，为靶向治疗提供基础 | 正常组织、癌旁组织、癌前病变和宫颈肿瘤的单细胞数据 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, RT-qPCR, 免疫组化（IHC） | 逻辑回归模型 | 单细胞测序数据, 表观遗传数据, 基因表达数据 | 四个单细胞数据集，包括正常组织、癌旁组织、癌前病变和宫颈肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 727 | 2026-03-18 |
Systematic evaluation of single-cell multimodal data integration for comprehensive human reference atlas
2025-Mar-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.06.637075
PMID:40093094
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研究论文 | 本研究系统评估了单细胞多模态数据整合方法在构建人类肾脏皮质参考图谱中的应用 | 开发了可解释的机器学习工具scOMM，并首次系统评估了水平整合（scRNA与snRNA-seq）和垂直整合（snRNA-seq与snATAC-seq）策略在复杂组织中的效果 | 研究仅针对肾脏皮质组织，未验证在其他复杂组织中的普适性 | 评估多模态单细胞数据整合策略对构建全面人类参考图谱的影响 | 人类肾脏皮质组织 | 单细胞组学 | NA | scRNA-seq, snRNA-seq, snATAC-seq | 机器学习（scOMM工具） | 单细胞多模态组学数据 | 19名捐赠者的119,744个高质量细胞核/细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 728 | 2026-03-18 |
Mixed exposure to PFOA and PFOS induces oocyte apoptosis and subfertility in mice by activating the Hippo signaling pathway
2025-03, Reproductive toxicology (Elmsford, N.Y.)
DOI:10.1016/j.reprotox.2024.108829
PMID:39746460
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研究论文 | 本研究探讨了PFOA和PFOS混合物暴露通过激活Hippo信号通路诱导小鼠卵母细胞凋亡并导致生育力下降的机制 | 首次揭示了PFOA和PFOS混合物通过激活Hippo信号通路损害卵母细胞质量和生育能力的分子机制，并利用单细胞转录组分析证实了其对能量代谢和凋亡的影响 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证；混合物暴露的具体剂量和比例对结果的普适性有待进一步研究 | 探究PFOA和PFOS混合物暴露对卵母细胞质量和雌性生育能力的影响及其分子机制 | 雌性小鼠的卵母细胞 | 生殖毒理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞转录组分析 | 动物模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 729 | 2026-03-18 |
Eliminating the persistent HIV reservoir based on biomarker expression - How do we get there?
2025-02, Virology
IF:2.8Q3
DOI:10.1016/j.virol.2024.110368
PMID:39721194
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综述 | 本文讨论了基于生物标志物表达来消除持久性HIV病毒库的挑战与前景 | 系统分析了导致HIV潜伏感染细胞生物标志物异质性的因素，并提出了通过识别共表达蛋白的最小组合来定义所有病毒库亚群的新策略 | 目前缺乏能够定义所有HIV潜伏感染细胞的单一特异性分子标志物，且对组织微环境和髓系细胞中潜伏感染细胞的表征仍不充分 | 探讨如何识别和利用生物标志物来靶向消除持久性HIV病毒库，以实现HIV治愈 | HIV潜伏感染细胞及其相关的生物标志物 | NA | HIV感染 | 空间转录组学、蛋白质组学 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 730 | 2026-03-18 |
ImageDoubler: image-based doublet identification in single-cell sequencing
2025-01-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55434-0
PMID:39747095
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研究论文 | 本研究提出了一种基于图像的模型ImageDoubler，用于识别单细胞测序中的双联体 | 首次利用Fluidigm单细胞测序图像数据进行双联体识别，相比传统基于基因组模拟数据的方法，F1分数至少提升33.1% | 方法目前主要针对Fluidigm平台图像数据，在其他单细胞测序平台上的适用性有待验证 | 开发更有效的单细胞测序双联体检测方法 | 单细胞测序数据中的双联体（两个或多个细胞被一起测序） | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | 图像识别模型 | 图像 | NA | Fluidigm | 单细胞测序 | NA | Fluidigm单细胞测序图像数据 |
| 731 | 2026-03-17 |
A phenotypic brain organoid atlas and biobank for neurodevelopmental disorders
2025-Dec-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.10.006
PMID:41187745
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研究论文 | 本研究建立了一个包含352个公开可用的神经发育障碍患者来源iPSC的生物库，并通过对35名代表性患者的6000多个脑类器官进行分析，揭示了不同疾病类别的特异性细胞表型 | 创建了首个大规模、遗传多样性的神经发育障碍iPSC生物库，并系统性地将脑类器官表型与临床疾病类别相关联，构建了基因型与表型之间的桥梁 | 研究仅基于35名代表性患者的类器官进行分析，样本代表性可能有限；类器官模型仍不能完全模拟人脑发育的复杂性 | 建立神经发育障碍的生物库和脑类器官图谱，以揭示疾病机制并支持未来的疾病建模和治疗开发 | 神经发育障碍患者来源的诱导多能干细胞及其衍生的脑类器官 | 数字病理学 | 神经发育障碍 | 单细胞转录组测序，组织学分析 | 脑类器官模型 | 单细胞转录组数据，组织学图像，临床数据，脑成像数据，基因组数据 | 352个患者来源iPSC系（来自公开生物库），35名代表性患者（超过6000个脑类器官），10名神经典型对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 732 | 2026-03-17 |
Single cell and spatial transcriptomic profiling of the type 2 diabetic coronary microcirculation and myocardium
2025-12, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-025-01144-7
PMID:41203872
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了2型糖尿病小鼠冠状动脉微循环和心肌中与脂肪生成、脂肪酸代谢和氧化磷酸化相关的基因表达上调，为冠状动脉微血管疾病的机制提供了新见解 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，全面分析2型糖尿病小鼠冠状动脉微循环和心肌的转录组差异，识别出新的基因表达特征和关键调控因子 | 研究仅基于小鼠模型，未涉及人类样本，且未进行功能验证实验以确认这些基因表达变化在疾病进展中的具体作用 | 探究2型糖尿病中冠状动脉微血管疾病的转录组差异，识别潜在的治疗靶点 | 2型糖尿病小鼠的冠状动脉微循环和心肌组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA序列数据, 空间转录组数据 | 未明确指定样本数量，但涉及2型糖尿病小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 733 | 2026-03-17 |
Single-cell and bulk transcriptomic analyses reveal ITGA5-driven epithelial-mesenchymal transition and metabolic adaptation in thyroid cancer
2025-10-20, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152678
PMID:40992268
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研究论文 | 本文通过单细胞和批量转录组分析揭示了ITGA5驱动的上皮-间质转化和代谢适应在甲状腺癌中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序和批量转录组数据，系统性地研究了ITGA5在甲状腺癌中的功能，并揭示了其通过激活上皮-间质转化和肿瘤微环境重塑促进肿瘤侵袭性的新机制 | 研究主要基于体外细胞实验和生物信息学分析，缺乏体内动物模型验证，且临床样本来源有限，可能无法完全反映肿瘤异质性 | 探究ITGA5在甲状腺癌进展中的分子机制及其与患者预后的关联 | 甲状腺癌组织样本、BCPAP和8505C甲状腺癌细胞系 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, WGCNA, GO分析, 通路分析 | NA | 转录组数据, 单细胞数据 | TCGA数据库中的甲状腺癌样本及体外培养的细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 734 | 2026-03-17 |
Single-cell mapping of TMZ-resistant glioma reveals CXCL2/3-CXCR2-associated neutrophil communication
2025-10-20, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152706
PMID:41016335
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了替莫唑胺耐药胶质瘤中CXCL2/3-CXCR2信号轴介导的肿瘤细胞与中性粒细胞通讯机制 | 首次在单细胞水平上绘制了TMZ耐药胶质瘤的微环境图谱，并发现了一个独特的CXCL2/3-CXCR2趋化轴介导的肿瘤-中性粒细胞通讯回路 | 研究主要基于转录组数据分析，功能验证实验相对有限，且未在体内模型中充分验证CXCR2抑制的治疗效果 | 探究胶质母细胞瘤中替莫唑胺耐药的微环境机制 | 胶质瘤细胞（包括TMZ耐药和对照细胞）及肿瘤微环境中的免疫细胞（特别是中性粒细胞） | 单细胞转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 基于已发表的大规模单细胞RNA-seq数据集进行分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 735 | 2026-03-17 |
Mechanistic insights into iguratimod action in asthma-COPD overlap through multi-omics and in-silico modelling
2025-10-10, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152673
PMID:40976228
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学方法，分析哮喘-慢性阻塞性肺疾病重叠（ACO）的基因表达数据，结合分子对接和动力学模拟，探讨了艾拉莫德（IGU）在ACO中的作用机制 | 首次将多组学（批量与单细胞RNA测序）与计算机模拟（分子对接和动力学模拟）相结合，系统研究了艾拉莫德在ACO中的潜在治疗靶点和作用机制 | 研究主要基于公共数据库的基因表达数据，缺乏实验验证，且分子动力学模拟时间较短（200纳秒），可能无法完全反映长期动态行为 | 探究艾拉莫德在哮喘-慢性阻塞性肺疾病重叠（ACO）中的分子作用机制，识别关键靶点基因 | 哮喘-慢性阻塞性肺疾病重叠（ACO）相关的基因表达数据，以及艾拉莫德（IGU）小分子药物 | 生物信息学 | 哮喘-慢性阻塞性肺疾病重叠（ACO） | 批量RNA测序，单细胞RNA测序，分子对接，分子动力学模拟 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 批量RNA-seq，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 736 | 2026-03-17 |
Tryptophan metabolic dysregulation drives immune activation and cartilage degradation in osteoarthritis: Functional validation integrated with transcriptomic and single-cell RNA sequencing
2025-09-30, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152497
PMID:40907267
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研究论文 | 本研究系统探索了色氨酸代谢异常在骨关节炎发病机制中的潜在作用，整合转录组学和单细胞RNA测序数据 | 首次系统揭示色氨酸代谢失调驱动骨关节炎免疫激活和软骨降解的代谢机制，提出犬尿氨酸通路作为潜在治疗靶点 | 研究主要基于体外细胞模型和测序数据，缺乏体内实验验证和临床样本的直接证据 | 阐明色氨酸代谢在骨关节炎发病中的作用机制 | 骨关节炎软骨组织、IL-1β刺激的软骨细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 737 | 2026-03-17 |
Single-cell transcriptomic analysis of interactions of peritoneal mesenchymal stem cells with macrophages in prevention of peritoneal membrane injury
2025-09-25, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152491
PMID:40829206
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析探讨了腹膜间充质干细胞与巨噬细胞的相互作用在预防腹膜透析诱导的腹膜损伤中的作用 | 首次在腹膜损伤模型中应用单细胞RNA测序技术解析pMSCs通过调控巨噬细胞亚群发挥保护作用的分子机制 | 研究基于大鼠模型，结果向人类临床转化的有效性仍需验证；单细胞测序样本量有限 | 探究腹膜间充质干细胞（pMSCs）与巨噬细胞相互作用在预防腹膜透析诱导的腹膜膜损伤中的机制 | Sprague-Dawley大鼠的腹膜组织、腹膜间充质干细胞、巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 腹膜损伤 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞数据 | 大鼠模型（具体数量未明确说明） | Illumina | 单细胞RNA-seq | HiSeq X Ten | HiSeq X Ten平台进行单细胞RNA测序，使用Cell Ranger软件和Mouse_ref_Immgen数据集进行分析 |
| 738 | 2026-03-17 |
Rutaecarpine alleviates liver fibrosis by modulating the TRPV1/Connexin 43 axis: A study based on transcriptome data, single-cell sequencing data, and cell experiments
2025-09-25, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152506
PMID:40848544
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研究论文 | 本研究基于转录组数据、单细胞测序数据和细胞实验，探讨了吴茱萸碱通过调节TRPV1/Connexin 43轴缓解肝纤维化的潜在机制 | 结合转录组、单细胞测序和细胞实验，首次揭示了吴茱萸碱通过调控TRPV1/Cx43轴缓解肝纤维化的新机制 | 研究主要基于体外细胞模型和公开数据集，缺乏体内动物模型的验证 | 探索吴茱萸碱缓解肝纤维化的潜在分子机制 | 肝纤维化相关的分子通路（TRPV1/Cx43轴）及吴茱萸碱的药理作用 | 生物信息学与分子生物学 | 肝纤维化 | 转录组分析、单细胞测序、分子对接、细胞模型实验 | 逻辑回归模型、ROC曲线分析、分子对接模型 | 基因表达数据、单细胞测序数据、体外细胞实验数据 | 基于公开数据集GSE84044，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 739 | 2026-03-17 |
Role of Defense/Immunity Proteins in Non-Obstructive Azoospermia: Insights from Gene Expression and Single-Cell RNA Sequencing Analyses
2025-07, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
DOI:10.1007/s43032-025-01916-5
PMID:40537735
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研究论文 | 本研究通过基因表达和单细胞RNA测序分析，探讨了防御/免疫蛋白在非梗阻性无精子症中的作用 | 首次结合多数据集基因表达分析和单细胞RNA测序技术，系统揭示了免疫相关基因在非梗阻性无精子症不同睾丸细胞群体中的差异表达模式 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证来确认这些免疫相关基因在NOA发病机制中的具体功能 | 探究免疫失调在非梗阻性无精子症发病机制中的作用，并识别关键的免疫相关基因 | 非梗阻性无精子症患者的睾丸组织和相关基因表达数据 | 单细胞组学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序, 基因表达分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 多个数据集（具体样本数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 740 | 2026-03-17 |
Single-cell profiling demonstrates the combined effect of wheeze phenotype and infant viral infection on airway epithelial development
2025-May-23, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adr9995
PMID:40408478
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了2至3岁儿童鼻气道上皮细胞的发育表型，探讨了喘息表型和婴儿期呼吸道合胞病毒感染对气道上皮发育的联合影响 | 首次在预先设计的嵌套出生队列中，结合喘息表型和RSV感染状态，使用单细胞RNA测序技术系统表征了儿童气道上皮的发育异常和免疫反应变化 | 研究样本局限于特定年龄段的儿童，且为观察性研究，难以确定因果关系 | 阐明哮喘儿童气道上皮的发育机制，特别是喘息表型和早期RSV感染对其的影响 | 2至3岁儿童的鼻气道上皮细胞 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 来自四个互斥组的儿童（喘息/非喘息与RSV感染/未感染组合） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |