本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7281 | 2025-10-06 |
CX3CR1+ Monocytes/Macrophages Promote Regional Immune Injury in Mesangial Proliferative Glomerulonephritis through Crosstalk with Activated Mesangial Cells
2025, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0716
PMID:40458609
|
研究论文 | 本研究揭示了CX3CR1+单核细胞/巨噬细胞通过与活化系膜细胞相互作用促进MsPGN区域免疫损伤的机制 | 首次发现CX3CL1-CX3CR1轴在MsPGN区域免疫损伤中的关键作用,并验证CX3CL1单克隆抗体quetmolimab的治疗潜力 | 部分分子机制细节仍需进一步阐明,动物模型与人类疾病的差异需谨慎评估 | 探究系膜增生性肾小球肾炎区域免疫损伤的分子机制 | IgA肾病临床标本和MsPGN动物模型 | 单细胞生物学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, Luminex多重免疫分析, 分子分析 | 动物模型 | 单细胞转录组数据, 蛋白质数据 | 临床标本和动物模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7282 | 2025-10-06 |
CD151 Promotes Cancer Progression in Triple-Negative Breast Cancer by Inducing EMT through the MAPK Signaling Pathway
2025, Breast cancer (Dove Medical Press)
DOI:10.2147/BCTT.S518760
PMID:40458675
|
研究论文 | 本研究探讨CD151通过MAPK信号通路诱导上皮间质转化促进三阴性乳腺癌进展的机制 | 首次揭示CD151与整合素α3β1形成复合物通过MAPK信号通路诱导EMT促进三阴性乳腺癌进展的新机制 | 研究主要基于体外实验,缺乏体内动物模型验证;临床样本量有限 | 研究CD151在三阴性乳腺癌中的促肿瘤作用及其分子机制 | 三阴性乳腺癌临床样本和细胞系 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 免疫组织化学, Western blotting, RNA干扰, 单细胞RNA测序, 免疫共沉淀 | NA | 蛋白质表达数据, 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 三阴性乳腺癌临床样本和细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7283 | 2025-10-06 |
Cellular Heterogeneity and IL-17 Pathway Dynamics Reveal Insights into the Transition from Ulcerative Colitis to Colorectal Cancer Through scRNA-Seq Analysis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S505313
PMID:40458692
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示溃疡性结肠炎向结直肠癌转变过程中的细胞异质性和IL-17通路动态 | 首次在共存UC和CACRC病变的患者组织样本中通过scRNA-seq揭示疾病进展过程中的细胞异质性和IL-17信号通路动态 | 仅分析单个患者样本,样本量有限,需要更大规模研究验证 | 研究溃疡性结肠炎向结直肠癌转变的分子和细胞机制 | UC和CACRC共存患者的正常结肠组织、UC病变组织和CACRC组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | scRNA-seq, 细胞聚类分析, 差异基因表达分析, KEGG通路富集分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 1例患者(包含正常结肠、UC病变和CACRC三种组织类型) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7284 | 2025-10-06 |
[Donor T cell exhaustion and immune tolerance after allogeneic hematopoietic cell transplantation]
2025, [Rinsho ketsueki] The Japanese journal of clinical hematology
DOI:10.11406/rinketsu.66.339
PMID:40467463
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示钙调磷酸酶抑制剂在异基因造血细胞移植后对供体T细胞耗竭状态的影响机制 | 首次发现钙调磷酸酶抑制剂通过抑制供体T细胞耗竭同时诱导效应样耗竭T细胞,从而影响慢性移植物抗宿主病的发生 | 目前主要基于小鼠模型,人类患者样本验证仍在进行中 | 探究异基因造血细胞移植后慢性移植物抗宿主病的发生机制 | 供体T细胞 | 单细胞测序分析 | 血液系统恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠移植模型,正在积累患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7285 | 2025-10-06 |
Cross-disease integration of single-cell RNA sequencing data from lung myeloid cells reveals TAM signature in in vitro model
2025-Dec, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2025.2502278
PMID:40448976
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据验证了3D人类细胞培养模型作为研究肿瘤相关巨噬细胞的临床前模型 | 首次将体外3D模型中的巨噬细胞单细胞数据与患者来源数据集整合,发现其与SPP1 TAM群体的表型特征相似 | 研究基于体外模型,与真实人体环境存在差异 | 验证3D人类细胞培养模型在研究肿瘤相关巨噬细胞方面的适用性 | 肺髓系细胞、肿瘤相关巨噬细胞(TAMs) | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 3D细胞培养模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7286 | 2025-10-06 |
RETRACTED: Deciphering the prognostic landscape of osteosarcoma: Integrating the roles of hippo pathway genes, programmed cell death, and the tumor immune microenvironment
2025-Jul, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24280
PMID:38622820
|
研究论文 | 本研究通过整合Hippo通路基因、程序性细胞死亡和肿瘤免疫微环境,揭示骨肉瘤的预后特征 | 首次系统整合Hippo通路基因与肿瘤免疫微环境在骨肉瘤预后中的作用,并通过单细胞测序揭示细胞异质性 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要实验验证 | 探索骨肉瘤的分子基础并识别预后生物标志物 | 骨肉瘤患者样本 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 转录组分析, 单细胞测序 | Cox回归分析, 层次聚类, Kaplan-Meier分析 | 转录组数据 | TARGET-OS数据集和GTEx对照样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 7287 | 2025-10-06 |
RETRACTED: Single-cell transcriptome sequencing analysis reveals intra-tumor heterogeneity in esophageal squamous cell carcinoma
2025-Jul, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24243
PMID:38572681
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序分析揭示食管鳞状细胞癌的肿瘤内异质性 | 首次在食管鳞癌中应用单细胞转录组测序技术系统解析肿瘤微环境细胞组成和空间特征,并鉴定出关键基因UPF3A | 样本量相对有限(60个肿瘤样本和4个癌旁样本),研究结果需要更大样本验证 | 深入探究食管鳞癌的发病机制和关键分子事件 | 食管鳞状细胞癌患者组织样本 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | COX回归模型, LASSO分析 | 单细胞转录组数据 | 60个肿瘤样本和4个癌旁样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7288 | 2025-10-06 |
RETRACTED: Prediction of potential targets and toxicological insights of Astragalus in liver cancer based on network pharmacology: Integrating systems biology, drug interaction networks, and toxicological perspectives
2025-Jul, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24189
PMID:38476113
|
研究论文 | 本研究通过网络药理学方法探讨黄芪在原发性肝癌治疗中的潜在靶点及其分子机制 | 整合系统生物学、单细胞分析和分子对接技术,首次在单细胞分辨率揭示黄芪对MT1E基因的调控作用及其细胞亚群特异性 | 研究主要基于计算预测和体外实验,缺乏临床验证数据 | 探索黄芪治疗原发性肝癌的分子靶点和作用机制 | 黄芪活性成分及其在肝癌细胞中的分子靶点 | 网络药理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, 基因本体分析, KEGG通路分析, 基因集变异分析, 蛋白质相互作用网络, 分子对接, qPCR | UMAP, tSNE, SingleR | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7289 | 2025-10-06 |
Understanding psoriatic disease at single-cell resolution: an update
2025-Jul-01, Current opinion in rheumatology
IF:5.2Q1
DOI:10.1097/BOR.0000000000001085
PMID:40160177
|
综述 | 本文综述了单细胞技术在银屑病研究中的最新进展,重点探讨了免疫细胞、角质形成细胞和成纤维细胞在疾病中的作用机制 | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术揭示银屑病细胞多样性,发现IL-17/IL-36和PRSS3-F2R通路在成纤维细胞-角质形成细胞相互作用中的关键作用,以及代谢失调在慢性炎症中的新机制 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据,主要基于已有研究进行总结分析 | 探讨单细胞技术在银屑病研究中的应用及其对疾病机制理解的贡献 | 银屑病患者皮肤组织中的免疫细胞、角质形成细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7290 | 2025-10-06 |
RETRACTION: Single-Cell Transcriptome Sequencing Analysis Reveals Intra-Tumor Heterogeneity in Esophageal Squamous Cell Carcinoma
2025-Jul, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24542
PMID:40358431
|
撤稿声明 | 本文宣布撤回一篇关于食管鳞状细胞癌肿瘤内异质性的单细胞转录组测序研究论文 | NA | 论文基于受损的投稿和同行评审流程被接受,且作者未能验证肿瘤样本和细胞系的来源 | NA | 食管鳞状细胞癌 | NA | 食管癌 | 单细胞转录组测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7291 | 2025-10-06 |
Malvidin Alleviates Lipopolysaccharide-Induced Acute Lung Injury by Modulating JAK2/STAT3 Signaling to Inhibit Macrophage M1 Polarization and Oxidative Stress
2025-Jun-04, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c00077
PMID:40397040
|
研究论文 | 本研究探讨锦葵色素通过调节JAK2/STAT3信号通路抑制巨噬细胞M1极化和氧化应激,缓解脂多糖诱导的急性肺损伤 | 首次揭示锦葵色素通过靶向JAK2/STAT3信号通路调控巨噬细胞极化状态,并证实其结合JAK2的分子机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验,尚未进行临床验证 | 评估锦葵色素对急性肺损伤的治疗效果并阐明其作用机制 | 小鼠急性肺损伤模型和巨噬细胞 | 分子生物学 | 急性肺损伤 | 单细胞转录组测序,RNA测序,分子对接,分子动力学模拟,Western blot,DPPH/ABTS自由基清除实验 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,分子相互作用数据 | 小鼠模型和细胞实验样本 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
| 7292 | 2025-10-06 |
Analyzing the potential targets and mechanism of per- and polyfluoroalkyl substances (PFAS) on breast cancer by integrating network toxicology, single-cell sequencing, spatial transcriptomics, and molecular simulation
2025-Jun-04, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01616-y
PMID:40465018
|
研究论文 | 通过整合网络毒理学、单细胞测序、空间转录组学和分子模拟,研究PFAS对乳腺癌的潜在靶点和作用机制 | 首次整合网络毒理学、单细胞测序、空间转录组学和分子模拟方法系统研究PFAS与乳腺癌的关联机制 | PFAS导致乳腺癌发展的具体分子机制仍需进一步研究 | 研究PFAS环境污染物对乳腺癌发展的分子机制 | 乳腺癌相关基因和蛋白质 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 网络毒理学,单细胞测序,空间转录组学,分子模拟 | 蛋白质-蛋白质相互作用网络,分子对接模拟 | 基因表达数据,空间转录组数据,分子结构数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 7293 | 2025-10-06 |
Deciphering the temporal transcriptional landscape of human fetal leptomeninges
2025-Jun-03, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awae397
PMID:39657259
|
研究论文 | 通过单核RNA测序揭示人类胎儿软脑膜发育过程中的转录组动态和细胞异质性 | 首次系统描绘人类胎儿软脑膜发育的时间转录组图谱,发现人类特异性层标记物和衰老特异性蛛网膜细胞簇 | 样本数量有限(8个人类胚胎),仅通过免疫染色验证部分发现 | 解析人类胚胎发育过程中软脑膜的细胞发育和分子机制 | 人类胎儿软脑膜组织 | 单细胞基因组学 | NA | 单核RNA测序,生物信息学分析,免疫染色 | NA | 单细胞转录组数据 | 8个人类胚胎(从早期胎儿到中晚期胎儿阶段) | NA | 单核RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7294 | 2025-10-06 |
The Application of Omics Technologies in Type II Diabetes Mellitus Research
2025-Jun-03, Current diabetes reviews
IF:2.4Q3
|
综述 | 本文探讨组学技术在2型糖尿病研究中的应用与进展 | 系统总结单细胞测序和LC-MS技术如何推动糖尿病精准医疗和生物标志物发现 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于文献综述 | 探索组学技术在2型糖尿病研究中的应用价值 | 2型糖尿病的分子机制和生物标志物 | 生物医学 | 2型糖尿病 | 基因组学,蛋白质组学,代谢组学,单细胞测序,液相色谱-质谱联用 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,蛋白质组学,代谢组学 | NA | NA |
| 7295 | 2025-10-06 |
A Genetic Perspective to Reveal the Impact of Mitochondrial Dysfunction-related Genes on Diabetic Kidney Disease: A Multi-omics Study
2025-Jun-03, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法探讨线粒体功能障碍相关基因在糖尿病肾病中的作用,并确定ACTN1作为潜在治疗靶点 | 首次整合大规模数据库和单细胞RNA测序数据,识别出7个具有显著遗传因果效应的线粒体功能障碍相关基因,并预测了二氢麦角汀作为ACTN1的靶向化合物 | 研究主要基于生物信息学分析,需要更多实验验证;样本来源和数量未明确说明 | 探究线粒体功能障碍在糖尿病肾病进展中的分子机制,识别关键致病基因 | 糖尿病肾病相关的线粒体功能障碍基因 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序, SMR分析, MR分析, 共定位分析, PheWAS分析, 分子动力学分析, 免疫荧光 | 预测模型 | 基因组数据, 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7296 | 2025-10-06 |
Targeting INF2 with DiosMetin 7-O-β-D-Glucuronide: a new stratagem for colorectal cancer therapy
2025-Jun-01, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-14357-9
PMID:40452021
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别INF2作为结直肠癌特异性生物标志物,并发现天然化合物DiosMetin 7-O-β-D-葡萄糖醛酸苷可作为INF2抑制剂用于靶向治疗 | 首次将INF2鉴定为结直肠癌特异性预后标志物,并发现天然化合物DiosMetin 7-O-β-D-葡萄糖醛酸苷作为选择性INF2抑制剂 | NA | 识别结直肠癌特异性生物标志物并开发靶向治疗方法 | 结直肠癌组织和细胞 | 生物医学研究 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 机器学习, 免疫组织化学, 细胞生物学实验, 计算对接 | 机器学习模型 | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7297 | 2025-10-06 |
Novel roles for CREG1 in hematopoiesis revealed by single-cell RNA sequencing
2025-Jun-01, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01407-9
PMID:40452027
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示CREG1在斑马鱼造血过程中的新功能 | 首次在成年斑马鱼中利用单细胞RNA测序技术系统研究CREG1在造血过程中的作用,发现其对B细胞、T/NK细胞和红细胞谱系发育的关键调控功能 | 研究仅在斑马鱼模型中进行,尚未在哺乳动物系统中验证;具体的分子调控机制仍需进一步研究 | 探究CREG1在成年造血过程中的功能和机制 | 成年斑马鱼的肾脏骨髓造血组织 | 单细胞生物学 | 造血系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | creg1缺陷型斑马鱼肾脏骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7298 | 2025-10-06 |
Precision targeting of β-catenin induces tumor reprogramming and immunity in hepatocellular cancers
2025-May-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60457-2
PMID:40442146
|
研究论文 | 本研究开发了一种靶向β-catenin的新型siRNA纳米颗粒疗法,可重塑肝细胞癌的肿瘤微环境并增强免疫治疗反应 | 首次证明靶向CTNNB1的siRNA纳米颗粒可重编程Wnt活性肝细胞癌的肿瘤微环境,激活干扰素信号通路并增强免疫检查点抑制剂疗效 | 研究主要基于临床前模型,临床疗效仍需进一步验证 | 开发针对β-catenin突变肝细胞癌的新型治疗策略并阐明其作用机制 | β-catenin突变的肝细胞癌模型 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序, 空间转录组学, siRNA技术 | NA | 基因表达数据, 转录组数据 | 多个免疫活性肝细胞癌模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7299 | 2025-10-06 |
Bronchopulmonary dysplasia with pulmonary hypertension associates with semaphorin signaling loss and functionally decreased FOXF1 expression
2025-May-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60371-7
PMID:40442177
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析早产儿肺组织,发现BPD合并PH与信号素信号通路缺失及FOXF1表达降低相关 | 首次在人类早产儿肺组织中鉴定出BPD+PH特有的ANKRD1表达异常毛细血管细胞状态,并揭示信号素引导通路缺陷与FOXF1表达降低的关联 | 样本量有限,主要基于观察性数据,需要进一步功能验证 | 探索支气管肺发育不良合并肺动脉高压的细胞和分子驱动机制 | 早产儿肺组织(包括BPD和BPD+PH患者)及足月婴儿肺组织 | 单细胞基因组学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 早产儿和足月婴儿肺组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7300 | 2025-10-06 |
[Progress in investigating astrocyte heterogeneity after spinal cord injury based on single-cell sequencing technology]
2025-May-25, Zhongguo gu shang = China journal of orthopaedics and traumatology
|
综述 | 基于单细胞测序技术研究脊髓损伤后星形胶质细胞异质性的进展综述 | 利用单细胞测序技术揭示脊髓损伤后星形胶质细胞的异质性及其与神经再生修复的关联 | 目前所有发现仍需更多基础研究和足够临床试验验证 | 探讨单细胞测序技术在脊髓损伤后星形胶质细胞研究中的应用进展 | 脊髓损伤后的星形胶质细胞 | 生物信息学 | 脊髓损伤 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |