单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 10572 篇文献,本页显示第 7221 - 7240 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
7221 2025-10-06
T-B cell cooperation in ectopic lymphoid follicles propagates CNS autoimmunity
2025-04-25, Science immunology IF:17.6Q1
研究论文 本研究揭示了脑膜异位淋巴滤泡中T细胞与B细胞的广泛合作如何促进中枢神经系统自身免疫 首次通过活体成像直接观察T17-B细胞在脑膜异位淋巴滤泡中的持久抗原特异性接触,并发现中枢神经系统T细胞依赖B细胞维持促炎细胞因子谱 研究采用实验性自身免疫性脑脊髓炎模型,可能不完全反映人类多发性硬化症的复杂病理过程 探究脑膜异位淋巴滤泡在中枢神经系统自身免疫中的作用机制 T细胞、B细胞及其在中枢神经系统的相互作用 免疫学 多发性硬化症 单细胞RNA测序,活体成像 T辅助17细胞过继转移实验性自身免疫性脑脊髓炎模型 基因表达数据,影像数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
7222 2025-10-06
Identification of Recurrence-associated Gene Signatures and Machine Learning-based Prediction in IDH-Wildtype Histological Glioblastoma
2025-Apr-14, Journal of molecular neuroscience : MN IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过基因共表达网络分析和机器学习方法,识别IDH野生型胶质母细胞瘤复发相关基因并建立预测模型 首次在IDH野生型组织学胶质母细胞瘤中鉴定8个复发相关基因,并开发了基于随机森林的高精度预测模型 研究样本量相对有限,需要更多独立队列验证模型的泛化能力 探索胶质母细胞瘤复发的分子机制并建立复发预测模型 IDH野生型组织学胶质母细胞瘤患者 机器学习 胶质母细胞瘤 加权基因共表达网络分析(WGCNA), RT-qPCR, 单细胞RNA测序, 机器学习 随机森林(RF) 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 CGGA-693队列190例, CGGA-325队列111例, 另有两个单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA测序, 转录组测序 NA NA
7223 2025-10-06
Psychological stress increases skin infection through the action of TGFβ to suppress immune-acting fibroblasts
2025-04-11, Science immunology IF:17.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学和脂质组学分析揭示了心理压力通过TGFβ抑制真皮成纤维细胞免疫功能从而增加皮肤感染的机制 首次发现心理压力通过脑-皮肤轴介导的TGFβ信号通路抑制成纤维细胞产生抗菌肽cathelicidin的免疫防御功能 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类中得到验证 探究心理压力增加皮肤感染易感性的分子机制 小鼠模型中的真皮成纤维细胞 免疫学 皮肤感染 单细胞转录组学, 脂质组学分析 NA 基因表达数据, 脂质组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
7224 2025-10-06
IL-4 induces CD22 expression to restrain the effector program of virtual memory T cells
2025-02-07, Science immunology IF:17.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序发现CD22作为IL-4诱导的虚拟记忆CD8 T细胞表面标志物,并揭示其抑制T细胞效应程序的作用机制 首次发现CD22可作为IL-4诱导的虚拟记忆CD8 T细胞选择性表面标志物,并揭示CD22对T细胞效应程序的固有调控功能 寄生虫感染模型中IL-4依赖性T细胞激活和扩张的具体调控机制仍需进一步阐明 探究IL-4依赖性虚拟记忆CD8 T细胞激活和扩张的调控机制 虚拟记忆CD8 T细胞 免疫学 寄生虫感染 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
7225 2025-10-06
Gonadal sex and temperature independently influence germ cell differentiation and meiotic progression in Trachemys scripta
2025-Jan-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究探讨温度和性腺性别对红耳龟生殖细胞分化和减数分裂进程的独立影响 首次在温度依赖性性别决定物种中证明温度对生殖细胞性分化的直接影响独立于性腺体细胞 研究仅针对单一TSD物种(红耳龟),结果可能不适用于其他物种 探究温度是否直接影响生殖细胞分化和性别认同的其他方面 红耳龟(Trachemys scripta)胚胎和生殖细胞 发育生物学 NA 减数分裂铺片分析,单细胞转录组分析 NA 基因表达数据,细胞形态数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
7226 2025-10-06
Inonotus obliquus (chaga) ameliorates folic acid-induced renal fibrosis in mice: the crosstalk analysis among PT cells, macrophages and T cells based on single-cell sequencing
2025, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序技术探讨了桦褐孔菌(Chaga)改善叶酸诱导的小鼠肾纤维化的细胞和分子机制 首次应用单细胞RNA测序技术研究桦褐孔菌治疗肾纤维化的作用,揭示了近端肾小管细胞、巨噬细胞和T细胞之间的相互作用网络 需要进一步的实验验证以确定其临床应用价值 探究桦褐孔菌治疗肾纤维化的潜在机制 叶酸诱导的肾纤维化小鼠模型 单细胞测序 肾纤维化 单细胞RNA测序, 空间转录组学, UPLC-MS, 组织学染色 NA 单细胞基因表达数据, 空间转录组数据, 组织学图像 82,496个肾脏细胞 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
7227 2025-10-06
Corrigendum: Inonotus obliquus (chaga) ameliorates folic acid-induced renal fibrosis in mice: the crosstalk analysis among PT cells, macrophages and T cells based on single-cell sequencing
2025, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
correction 本文是对先前发表文章的更正说明 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
7228 2025-10-06
Candida albicans: a historical overview of investigations into an important human pathogen
2025-Jan-01, Canadian journal of microbiology IF:1.8Q4
综述 回顾白色念珠菌研究的历史发展,从早期临床观察到现代高通量基因组技术 整合多组学方法推进精准真菌学时代,追踪真菌种群基因组学的进化适应 NA 理解白色念珠菌的分子生物学、致病性和耐药机制 机会性致病真菌白色念珠菌 NA 侵袭性念珠菌病 全基因组测序,功能基因组学,单细胞转录组学,CRISPR-Cas9基因组编辑,多组学方法 NA 基因组数据,转录组数据 NA NA 单细胞转录组学 NA NA
7229 2025-10-06
PIK3R1 and G0S2 are human placenta-specific imprinted genes associated with germline-inherited maternal DNA methylation
2025-Dec, Epigenetics IF:2.9Q2
研究论文 本研究通过全基因组筛选发现并表征了两个人类胎盘特异性印记基因PIK3R1和G0S2 首次识别出胎盘特异性印记基因,这些基因与仅在胚胎植入前和胚外谱系中存在的瞬时种系DMRs相关 未发现这些基因在宫内生长受限或先兆子痫的胎盘样本中存在甲基化和表达差异 扩展胎盘特异性印记基因列表并研究其特性 人类胎盘组织、配子、囊胚和各种体细胞组织 表观遗传学 妊娠并发症 全基因组甲基化测序、单细胞RNA测序 NA 甲基化数据、RNA-seq数据 多种组织类型样本(包括配子、囊胚、胎盘等) NA 单细胞RNA-seq、全基因组甲基化分析 NA NA
7230 2025-10-06
Development and Validation of a Flow-Dependent Endothelialized 3D Model of Intracranial Atherosclerotic Disease
2025-Aug, Translational stroke research IF:3.8Q2
研究论文 开发并验证了一种基于患者特异性成像的流动依赖性内皮化3D颅内动脉粥样硬化疾病模型 首次创建了基于患者特异性神经影像的可内皮化并承受流动力的可重复ICAD模型,结合单细胞RNA测序分析流动依赖性内皮基因表达 依赖于神经影像数据的质量,模型复杂度可能限制高通量应用 开发用于研究颅内动脉粥样硬化疾病机制和治疗方法的实验模型 大脑中动脉的3D模型和人类内皮细胞 数字病理 心血管疾病 单细胞RNA测序,计算流体动力学,共聚焦显微镜 3D生物模型 图像,基因表达数据 使用SAMMPRIS临床试验的影像数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
7231 2025-10-06
Role of stem-like cells in chemotherapy resistance and relapse in pediatric T-cell acute lymphoblastic leukemia
2025-Jun-27, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序研究儿童T细胞急性淋巴细胞白血病中干细胞样细胞在化疗耐药和复发中的作用 首次在T-ALL中通过纵向单细胞研究鉴定出具有干细胞特征的耐药细胞亚群 样本量相对有限(13对匹配样本+5例非复发患者) 探究T-ALL复发和化疗耐药的机制 儿童T细胞急性淋巴细胞白血病患者样本 单细胞测序分析 急性淋巴细胞白血病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 18例样本(13对匹配诊断-复发样本+5例非复发诊断样本) NA 单细胞RNA-seq NA NA
7232 2025-10-06
Single-cell and spatial analyses of the GDF family in tumors, with a focus on the prognostic and biological role of GDF15 in hepatocellular carcinoma
2025-Jun-27, Cell & bioscience
研究论文 通过单细胞和空间转录组分析GDF家族在肿瘤中的作用,重点关注GDF15在肝细胞癌中的预后和生物学功能 首次基于单细胞和空间转录组对GDF亚家族进行系统性泛癌分析,揭示了GDF15在肝细胞癌肿瘤微环境中的新作用机制 研究主要基于生物信息学分析,实验验证部分仅限于肝细胞癌细胞系 系统分析GDF亚家族在多种癌症中的表达特征及其临床意义 33种癌症类型,重点关注肝细胞癌 生物信息学 肝细胞癌 单细胞RNA测序, 空间转录组, 功能获得和缺失实验 NA 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 细胞系实验数据 33种癌症类型的数据 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组 NA NA
7233 2025-10-06
ETMR stem-like state and chemo-resistance are supported by perivascular cells at single-cell resolution
2025-Jun-25, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示胚胎性多层菊形团肿瘤的异质性及肿瘤微环境中周细胞对肿瘤干细胞状态和化疗耐药性的支持作用 首次在单细胞水平系统揭示ETMR肿瘤微环境中PDGFRβ周细胞通过细胞外基质相互作用支持肿瘤干细胞信号传导和化疗耐药性 研究主要基于模型系统,需要在更多临床样本中验证 探究ETMR肿瘤异质性及肿瘤微环境中的细胞通讯机制 人类和小鼠原代ETMR肿瘤细胞、体外培养细胞、3D前脑类器官ETMR模型 单细胞生物学 脑肿瘤 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 空间转录组学 3D类器官模型 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 约250,000个细胞 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
7234 2025-10-06
Reduction of NFX1-123 and HPV 16 E6 and E7 Decreased Telomerase and CENP-F in Cervical Cancer Cell Lines
2025-Jun-19, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过敲除NFX1-123和HPV 16 E6/E7,探讨了它们在宫颈癌细胞系中对端粒酶和CENP-F的调控作用 首次在HPV相关癌症中研究NFX1-123对端粒酶活性的调控作用,并发现其与HPV 16致癌基因在调控hTERT、端粒酶和CENP-F中的共同作用 研究仅限于宫颈癌细胞系,需要进一步在更多细胞模型和体内实验中验证 研究NFX1-123在HPV相关癌症中对端粒酶活性的调控机制 宫颈癌细胞系(CaSki和SiHa细胞)以及TCGA数据库中的宫颈癌和HPV阳性头颈癌原发肿瘤数据 癌症生物学 宫颈癌 基因敲除、单细胞RNA测序、基因敲低 NA 单细胞RNA测序数据、基因表达数据、临床数据库数据 宫颈癌细胞系和TCGA数据库中的原发肿瘤样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
7235 2025-10-06
Spatial Transcriptomics Reveals Regional and Temporal Dynamics of Gene Expression in the Mouse Brain Across Development and Aging
2025-Jun-18, Biology
研究论文 本研究利用空间转录组学技术分析小鼠大脑在发育和衰老过程中的区域特异性基因表达动态 首次通过空间转录组学直接比较大脑发育与衰老的分子机制,建立了新颖的空间转录组参考数据集 研究仅针对三个特定时间点,可能无法完全捕捉连续的变化过程;研究局限于小鼠模型 探究大脑在发育和衰老过程中区域特异性基因表达的动态变化 小鼠大脑在不同发育阶段(P21、3月龄、28月龄)的基因表达 空间转录组学 神经退行性疾病 空间转录组学 NA 空间基因表达数据 三个关键时间点的小鼠大脑样本(P21、3月龄、28月龄) NA 空间转录组学 NA NA
7236 2025-10-06
Multi-omics analyses of the heterogenous immune microenvironment in triple-negative breast cancer implicate UQCRFS1 potentiates tumor progression
2025-Jun-16, Experimental hematology & oncology IF:9.4Q1
研究论文 通过多组学分析揭示三阴性乳腺癌异质性免疫微环境,发现UQCRFS1促进肿瘤进展 首次通过单细胞RNA测序系统分析TNBC免疫微环境异质性,建立恶性细胞指数模型并验证UQCRFS1的促癌功能 样本量较小(仅9例初治TNBC患者),需更大队列验证 解析三阴性乳腺癌免疫微环境异质性及其与肿瘤进展的关系 三阴性乳腺癌患者肿瘤组织 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序, 空间转录组, 蛋白质组, qRT-PCR, 蛋白质印迹 LASSO-Cox回归, CellChat算法, 伪时序分析 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 蛋白质组数据 9例初治三阴性乳腺癌患者 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 蛋白质组学 NA NA
7237 2025-10-06
Next generation genetic screens in kinetoplastids
2025-Jun-06, Nucleic acids research IF:16.6Q1
综述 本文综述了动质体寄生虫中遗传筛选技术的发展与应用 探讨了将基于图像的筛选和单细胞测序技术与遗传筛选相结合的新方法 NA 系统理解基因组功能元件及其扰动对细胞功能的影响 动质体寄生虫的编码和非编码基因组区域 基因组学 寄生虫病 遗传筛选, CRISPR-Cas技术, 单细胞测序, 图像分析 NA 基因组数据, 图像数据, 单细胞测序数据 NA NA 单细胞测序 NA NA
7238 2025-10-06
Macrophage polarization, inflammatory monocytes, and impaired MDSCs are associated with murine and human immune aplastic anemia
2025-Jun-04, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2
研究论文 本研究通过小鼠模型和人类样本探讨骨髓源性细胞在免疫性再生障碍性贫血发病机制中的作用 首次揭示CSF-1R抑制会加剧骨髓衰竭并促进M1巨噬细胞极化,同时发现JAK抑制剂可缓解疾病进程 研究样本量有限,人类样本仅针对严重AA患者 探索骨髓衰竭疾病中髓系细胞的免疫病理机制 小鼠骨髓衰竭模型和人类再生障碍性贫血患者样本 免疫学 再生障碍性贫血 流式细胞术, 细胞因子分析, 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据, 细胞群体数据 CByB6F1小鼠和严重AA患者样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
7239 2025-10-06
ScInfeR: an efficient method for annotating cell types and sub-types in single-cell RNA-seq, ATAC-seq, and spatial omics
2025-May-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 提出一种基于图结构的细胞类型注释方法ScInfeR,能够高效注释单细胞RNA测序、ATAC测序和空间组学数据中的细胞类型和亚型 结合scRNA-seq参考数据和标记基因集,采用分层框架和图神经网络消息传递机制,支持加权正负标记基因,并开发了包含329种细胞类型参考数据的交互式数据库 NA 开发高效的细胞类型注释方法,解决单细胞和空间组学数据分析中的细胞类型识别难题 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和空间转录组学数据集中的细胞类型 生物信息学 NA 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序,空间转录组学 图神经网络 基因表达数据,染色质可及性数据,空间坐标信息 在100多个细胞类型预测任务中评估,包含28种组织类型的人类和植物数据 NA 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq,空间转录组学 NA NA
7240 2025-10-06
Fucosylated haptoglobin promotes inflammation via Mincle in sepsis: an observational study
2025-Feb-04, Nature communications IF:14.7Q1
观察性研究 本研究揭示了败血症患者血浆中岩藻糖基化结合珠蛋白通过Mincle受体促进炎症反应的作用机制 首次发现败血症患者血浆中Hp在Asn207和Asn211位点的末端岩藻糖基化水平升高,并阐明其通过Mincle受体激活炎症反应的分子机制 观察性研究设计,无法确定因果关系;样本量未明确说明;动物模型结果需要进一步验证 探究岩藻糖基化结合珠蛋白在败血症炎症反应中的作用机制 败血症患者血浆样本、小鼠模型、巨噬样细胞群体 分子生物学 败血症 单细胞RNA测序,蛋白质纯化,细胞因子检测 NA 基因表达数据,蛋白质数据,临床数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
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