单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 10537 篇文献，本页显示第 7201 - 7220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7201 | 2025-10-06 |
The Society for Immunotherapy of Cancer Perspective on Tissue-Based Technologies for Immuno-Oncology Biomarker Discovery and Application
2025-Feb-03, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-2469
PMID:39625818
|
综述 | 癌症免疫治疗学会对组织基技术在免疫肿瘤生物标志物发现与应用中的观点总结 | 整合多重免疫组化、单细胞转录组与空间蛋白质组学等前沿技术，提出生物标志物技术评估框架 | 未涉及具体临床验证数据，主要基于技术原理和现有研究进行展望 | 指导免疫肿瘤生物标志物技术发展方向和临床转化 | 组织基生物标志物检测技术 | 数字病理 | 多种癌症 | 多重免疫组化、免疫荧光、单细胞转录组学、质谱蛋白质组学 | NA | 多组学数据、空间蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学、蛋白质组学成像 | NA | NA |
| 7202 | 2025-10-06 |
Identification of molecular characteristics in polycystic ovary syndrome using single-cell and transcriptome analysis
2025-01-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-81110-w
PMID:39848950
|
研究论文 | 通过单细胞和转录组分析揭示多囊卵巢综合征的分子特征 | 整合多个数据集进行综合分析，发现PCOS中新的共表达模块和信号通路，并通过伪时间轨迹分析揭示疾病发展轨迹 | NA | 揭示多囊卵巢综合征的分子机制 | 多囊卵巢综合征患者基因表达数据 | 生物信息学 | 多囊卵巢综合征 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, RT-qPCR | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 来自三个数据集(GSE138518, GSE155489, PRJNA600740) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7203 | 2025-10-06 |
Identification of prognostic biomarkers of sepsis and construction of ceRNA regulatory networks
2025-01-22, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-78502-3
PMID:39843498
|
研究论文 | 本研究通过RNA测序和单细胞RNA测序识别脓毒症预后生物标志物并构建ceRNA调控网络 | 首次结合RNA测序、单细胞RNA测序和meta分析筛选脓毒症预后相关核心基因，并构建了包含4个circRNA、26个miRNA和2个mRNA的ceRNA调控网络 | 样本量较小（幸存组26例，非幸存组6例），需要在更大样本中验证 | 识别脓毒症预后生物标志物并构建ceRNA调控网络以深入理解脓毒症发病机制 | 脓毒症患者血液样本 | 生物信息学 | 脓毒症 | RNA测序，单细胞RNA测序，差异表达分析，GO分析，meta分析 | ceRNA调控网络 | RNA测序数据，单细胞RNA测序数据 | 32例脓毒症患者（幸存组26例，非幸存组6例） | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10×Single-cell RNA sequencing |
| 7204 | 2025-10-06 |
DiabetesOmic: A comprehensive multi-omics diabetes database
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.05.008
PMID:40502930
|
研究论文 | 介绍了一个名为DiabetesOmic的综合多组学糖尿病数据库，整合了五种高通量测序数据 | 首个专门针对糖尿病的综合多组学数据库，整合了五种测序模态数据并提供了临床并发症注释 | 目前仅包含487个样本，样本规模相对有限 | 为糖尿病研究提供分子资源，促进对糖尿病病理机制的深入理解 | 1型和2型糖尿病患者的多种组织样本 | 生物信息学 | 糖尿病 | ChIP-seq, RNA-seq, ATAC-seq, scATAC-seq, scRNA-seq | NA | 多组学测序数据 | 487个样本，涵盖1型和2型糖尿病的多种组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq, 批量ATAC-seq | NA | NA |
| 7205 | 2025-10-06 |
Exosomal BMPR2 Macromolecule Facilitates Alveolar Epithelial Cell Repair Through Functional Complex Formation with BMPR1B in Acute Lung Injury
2025, International journal of nanomedicine
IF:6.6Q1
DOI:10.2147/IJN.S519393
PMID:40502982
|
研究论文 | 本研究揭示了巨噬细胞来源的外泌体通过BMPR2-BMPR1B复合物形成促进急性肺损伤中肺泡上皮细胞修复的分子机制 | 首次发现外泌体BMPR2通过与上皮细胞BMPR1B形成功能复合物激活SMAD1信号通路，促进AT2向AT1细胞转分化 | 研究主要聚焦于分子机制，临床转化潜力需进一步验证 | 探索急性肺损伤中肺泡修复的分子机制和治疗策略 | 巨噬细胞来源的外泌体和肺泡上皮细胞 | 分子生物学 | 急性肺损伤 | 动态光散射,透射电镜,免疫印迹,蛋白质组学,分子对接,单细胞RNA测序,生化分析,共聚焦共定位,近红外成像,多重免疫荧光,伪时间轨迹分析 | NA | 蛋白质组数据,单细胞RNA测序数据,成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7206 | 2025-10-06 |
Exploring the role of neutrophils in inflammatory pain hypersensitivity via single-cell transcriptome profiling
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1552993
PMID:40503232
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析探索中性粒细胞在炎症性疼痛超敏反应中的作用 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析术后和CFA诱导炎症中CD11b+细胞的组成，并发现CXCR2抑制剂NAMO通过抑制中性粒细胞分化成熟缓解疼痛 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探索中性粒细胞在炎症性疼痛中的作用机制 | 小鼠术后和CFA诱导炎症模型中的CD11b+细胞 | 单细胞转录组学 | 炎症性疼痛 | 单细胞RNA测序，蛋白质组学分析，生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据，蛋白质表达数据 | 小鼠炎症模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7207 | 2025-10-06 |
Identification of mitophagy-related biomarkers in severe acute pancreatitis: integration of WGCNA, machine learning algorithms and scRNA-seq
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1594085
PMID:40503237
|
研究论文 | 本研究通过整合多种生物信息学方法和实验验证，识别出MAPK14作为重症急性胰腺炎中关键的线粒体自噬相关生物标志物 | 首次将WGCNA、机器学习算法和单细胞RNA测序技术相结合，系统性地识别重症急性胰腺炎中的线粒体自噬相关基因，并发现MAPK14在胰腺巨噬细胞中的重要作用 | 研究主要基于生物信息学分析和动物模型验证，需要在人类临床样本中进一步验证 | 识别重症急性胰腺炎中关键的线粒体自噬相关基因，为深入研究其发病机制提供理论基础 | 重症急性胰腺炎患者基因表达数据、SAP小鼠模型 | 生物信息学 | 重症急性胰腺炎 | WGCNA, 机器学习算法, 单细胞RNA测序, ssGSEA | 机器学习算法 | 基因表达数据 | GSE194331和GSE279876数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 基因表达分析 | NA | NA |
| 7208 | 2025-10-06 |
Loss of Plxdc2 exacerbates microglia-mediated neuroinflammation and ischemic brain injury
2025-Sep, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2025.115302
PMID:40345569
|
研究论文 | 本研究揭示了Plxdc2蛋白在调节小胶质细胞稳态和减轻缺血性脑损伤中的关键作用 | 首次发现Plxdc2在小胶质细胞中高表达并在脑卒中后显著下调，阐明了其通过PPARγ通路调控NF-κB信号和脂质代谢的新机制 | 研究主要聚焦于小胶质细胞，Plxdc2在其他神经细胞中的作用尚未完全阐明 | 探究Plxdc2在缺血性脑卒中中小胶质细胞功能调节中的作用机制 | 小胶质细胞和缺血性脑损伤模型 | 神经科学 | 缺血性脑卒中 | scRNA-seq, 转录组分析, 腺相关病毒(AAV)过表达, 慢病毒干扰 | NA | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7209 | 2025-10-06 |
Microglial colonization routes and their impacts on cellular diversity
2025-Jul, Neuroscience research
IF:2.4Q3
DOI:10.1016/j.neures.2025.04.004
PMID:40288616
|
综述 | 探讨小胶质细胞通过不同定植路线进入大脑并影响其细胞多样性的机制 | 重点关注小胶质细胞通过多种定植路线形成细胞多样性的假说，整合单细胞转录组学最新发现 | 作为综述文章，未提供原始实验数据验证假说 | 阐明小胶质细胞多样性形成机制 | 小胶质细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7210 | 2025-10-06 |
Insights into Keratinocyte and Immunologic Landscape in Cutaneous Graft-Versus-Host Disease through Single-Cell Transcriptomics
2025-Jul, JID innovations : skin science from molecules to population health
DOI:10.1016/j.xjidi.2025.100373
PMID:40492027
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学分析皮肤慢性移植物抗宿主病中角质形成细胞和免疫细胞的分子特征 | 首次在单细胞水平揭示慢性GVHD皮肤中角质形成细胞的非免疫学变化和免疫细胞的组成改变 | 样本量有限，需要更大规模研究验证发现 | 探究皮肤慢性移植物抗宿主病的发病机制 | 慢性GVHD患者和健康对照的皮肤样本 | 单细胞组学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 慢性GVHD和健康对照皮肤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7211 | 2025-10-06 |
Machine learning-driven construction and validation of an intra-tumoral heterogeneity-associated prognostic model for bladder urothelial carcinoma
2025-Jun-11, Computer methods in biomechanics and biomedical engineering
IF:1.7Q3
DOI:10.1080/10255842.2025.2516767
PMID:40500142
|
研究论文 | 本研究构建并验证了一个基于肿瘤内异质性相关基因的膀胱尿路上皮癌预后模型 | 首次结合LASSO和随机生存森林算法开发14基因预后特征，并通过单细胞RNA测序分析验证模型基因的表达模式 | 研究依赖于公共数据库数据，缺乏前瞻性验证 | 构建膀胱尿路上皮癌的预后预测模型 | 膀胱尿路上皮癌患者 | 机器学习 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析 | LASSO,随机生存森林 | 转录组数据,临床数据 | 多个公共队列数据 | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
| 7212 | 2025-10-06 |
Differentiation of lung tissue-resident c-Kit+ cells into microvascular endothelial cells alleviates pulmonary vascular remodeling
2025-Jun-09, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.01.010
PMID:39909047
|
研究论文 | 本研究揭示了肺组织驻留c-Kit+细胞通过分化为微血管内皮细胞缓解肺血管重构的机制 | 首次阐明肺组织驻留c-Kit+细胞在肺血管重构中的保护作用及其通过NR2F2调控的分化机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证仍需进一步研究 | 探究肺c-Kit细胞分化在肺血管重构中的作用机制 | 肺组织驻留c-Kit+细胞及其分化的内皮细胞 | 病理生理学 | 肺动脉高压 | 遗传谱系追踪,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,单细胞测序数据 | SU5416/低氧诱导的肺血管重构小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7213 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics reveals tryptophan metabolism restricting maturation of intratumoral tertiary lymphoid structures
2025-Jun-09, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.03.011
PMID:40185093
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学揭示色氨酸代谢抑制肝细胞癌内三级淋巴结构成熟的机制 | 首次发现恶性细胞塑造的色氨酸富集代谢微环境导致三级淋巴结构成熟偏离，并证明抑制色氨酸代谢可促进三级淋巴结构成熟并增强免疫治疗效果 | 研究主要聚焦于肝细胞癌，在其他癌种中的普适性需要进一步验证 | 探究三级淋巴结构成熟机制及其对免疫治疗的影响 | 肝细胞癌中的三级淋巴结构及其微环境 | 空间转录组学 | 肝细胞癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 近单细胞空间转录组图谱 |
| 7214 | 2025-10-06 |
eIF5A maintains intestinal epithelial homeostasis by sustaining intestinal stem cells
2025-Jun-09, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-025-00243-z
PMID:40488929
|
研究论文 | 本研究揭示了eIF5A通过调控线粒体翻译维持肠道干细胞功能和肠道上皮稳态的关键作用 | 首次发现eIF5A通过调控线粒体翻译来维持肠道干细胞功能和肠道上皮稳态的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和肠道类器官，尚未在人类样本中验证 | 探究eIF5A在肠道上皮稳态维持中的功能及其分子机制 | 小鼠肠道上皮细胞、肠道干细胞、肠道类器官 | 细胞生物学 | 肠道疾病 | 条件性基因敲除、质谱分析、单细胞RNA测序、线粒体功能检测 | NA | 蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据、功能实验数据 | 成年小鼠肠道上皮细胞和肠道类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7215 | 2025-10-06 |
Prognostic and immune modulatory effects of ammonia-induced cell death in head and neck squamous cell carcinoma
2025-Jun-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02508-0
PMID:40490575
|
研究论文 | 本研究探讨了氨诱导细胞死亡在头颈部鳞状细胞癌中的预后价值和免疫调节作用 | 首次建立氨死亡特征作为HNSC的新型预后生物标志物，揭示了氨代谢与肿瘤进展和免疫抑制的关联 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证 | 评估氨诱导细胞死亡在头颈部鳞状细胞癌中的预后意义和免疫调节机制 | 头颈部鳞状细胞癌患者和单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 随机生存森林，单细胞RNA测序，ssGSEA，TIP分析 | RSF，Cox回归 | 转录组数据，单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7216 | 2025-10-06 |
Single-cell chromatin accessibility profiling reveals regulatory mechanisms and evolution in pig brains
2025-Jun-09, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02263-2
PMID:40490756
|
研究论文 | 通过单细胞染色质可及性测序揭示猪大脑的调控机制和进化特征 | 首次在家猪和野猪大脑中进行大规模单细胞染色质可及性分析，揭示了少突胶质细胞祖细胞可能具有更快的进化速率，并发现猪在阿尔茨海默病研究中的模型优势 | 研究仅聚焦于大脑皮层和小脑区域，未涵盖全脑所有区域；样本数量相对有限 | 探究猪大脑的调控机制及其在进化过程中的变化 | 家猪和野猪的大脑皮层和小脑细胞 | 单细胞基因组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞染色质可及性测序，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞测序数据 | 71,798个细胞 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7217 | 2025-10-06 |
Comprehensive analysis of immunoglobulin expression in the mouse brain from embryonic to adult stages
2025-Jun-09, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03457-9
PMID:40490799
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫球蛋白谱分析，系统揭示了小鼠大脑从胚胎到成年阶段免疫球蛋白的表达谱 | 首次全面阐明大脑中免疫球蛋白从胚胎到成年的表达动态，发现小胶质细胞和神经元表达特定Ig亚型，并揭示其与B细胞不同的表达调控机制 | 研究仅限于小鼠模型，人类大脑中的表达情况尚不清楚；功能验证实验相对有限 | 探究免疫球蛋白在小鼠大脑发育过程中的表达特征和潜在功能 | 小鼠大脑组织（从胚胎到成年阶段） | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序，免疫球蛋白谱分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠大脑多个发育阶段样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7218 | 2025-10-06 |
Exploring the causal links between inflammation-related genes and atherosclerosis through Mendelian randomization analysis
2025-Jun-06, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000042584
PMID:40489880
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化分析探索炎症相关基因与动脉粥样硬化之间的因果关系 | 整合多组学数据和单细胞RNA测序技术，系统分析颈动脉粥样硬化中关键基因在不同细胞类型中的表达特征 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，缺乏实验验证 | 阐明动脉粥样硬化的分子机制和潜在治疗靶点 | 动脉粥样硬化斑块中的基因表达谱和细胞类型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析 | DESeq2, clusterProfiler, Cytoscape, TwoSampleMR | 基因表达数据 | 多个公共数据集(GSE198600, GSE120521, GSE253903, GSE224273) | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7219 | 2025-10-06 |
Spatial Heterogeneity of Macrophages in the Human Lung
2025-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.30.657106
PMID:40501812
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究人肺不同解剖结构中巨噬细胞亚群的空间分布特征 | 首次报告人肺巨噬细胞亚群按肺解剖结构的分数积累，并引入新的三级层次命名法 | 样本量较小（仅8名供体），仅关注吸烟因素而未涉及其他肺部疾病 | 确定转录定义的人巨噬细胞在主要肺解剖结构中的分布，以及吸烟引起的分布和编程变化 | 人肺组织中的间质巨噬细胞和肺泡巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序，显微解剖，免疫荧光显微镜 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 8名无肺部疾病的人类供体（4名吸烟者和4名非吸烟者） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7220 | 2025-10-06 |
Microglia activation orchestrates CXCL10-mediated CD8+ T cell recruitment to promote aging-related white matter degeneration
2025-Jun, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-01955-w
PMID:40404995
|
研究论文 | 本研究揭示小胶质细胞激活通过CXCL10介导的CD8+ T细胞招募促进衰老相关白质退化的机制 | 首次阐明小胶质细胞功能障碍通过CXCL10-CXCR3轴招募CD8+ T细胞导致衰老白质退化的完整机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性需进一步验证 | 探究衰老过程中小胶质细胞功能与白质退化的关系 | 小鼠白质组织中的小胶质细胞和CD8+ T细胞 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组测序,空间转录组学,药理学方法,遗传学方法 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |