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当前共找到 10619 篇文献，本页显示第 701 - 720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 701 | 2026-01-30 |
Single-cell analysis of Barrett's esophagus and carcinoma reveals cell types conferring risk via genetic predisposition
2025-Oct-08, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100980
PMID:40925382
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析Barrett食管和食管腺癌，结合全基因组关联数据，揭示细胞类型特异性遗传风险及参与疾病发展的细胞过程 | 首次整合单细胞转录组数据与全基因组关联分析，识别Barrett食管和食管腺癌发展中的关键细胞类型及细胞过程，特别是肠化生细胞和柱状细胞分化过程 | 未明确提及样本量限制或技术验证细节，可能需进一步实验验证细胞类型特异性机制 | 确定Barrett食管和食管腺癌发展中涉及的细胞类型及其遗传风险，探索疾病预测的生物标志物 | Barrett食管、食管腺癌及配对正常组织样本 | 数字病理学 | 食管腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 702 | 2026-01-30 |
Sensitive dissection of a genomic regulatory landscape using bulk and targeted single-cell activation
2025-Oct-08, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100984
PMID:40930101
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研究论文 | 本研究开发了TESLA-seq技术，结合CRISPRa筛选与靶向单细胞RNA测序，用于高灵敏度解析PHOX2B基因座附近的增强子及其靶基因调控网络 | 开发了TESLA-seq新技术，首次将CRISPRa筛选与靶向单细胞RNA测序结合，实现了对数百个增强子与所有基因位点关系的并行检测 | 研究主要聚焦于PHOX2B基因座，可能未涵盖更广泛的基因组区域；实验系统可能无法完全模拟体内环境 | 识别和功能扰动内源性增强子，解析基因调控网络 | PHOX2B基因座附近的增强子（CaREs）及其靶基因 | 基因组学 | 神经母细胞瘤 | CRISPR激活筛选，靶向单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 703 | 2026-01-30 |
Integrated Spatial and Single-Cell Transcriptomics Reveals Poor Prognostic Ligand-Receptor Pairs in Glioblastoma
2025-Oct-01, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14191540
PMID:41090768
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单细胞转录组学，揭示了胶质母细胞瘤中与不良预后相关的配体-受体对及其在肿瘤组织内的空间定位 | 首次结合单细胞和空间转录组学数据，全面评估胶质母细胞瘤中的细胞间相互作用，并识别出与细胞外基质相关、影响预后的特定配体-受体对 | 这些配体-受体对的临床重要性仍需进一步研究 | 识别胶质母细胞瘤中的预后相关配体-受体对及其在肿瘤内的空间定位 | 胶质母细胞瘤细胞及其与微环境细胞的相互作用 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 40,958个细胞来自单细胞RNA测序数据集，以及三个独立的胶质母细胞瘤队列用于空间转录组分析 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 704 | 2026-01-30 |
Intestinal Bacteroides drives glioma progression by regulating CD8+ T cell tumor infiltration
2025-Jul-30, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf024
PMID:39868555
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研究论文 | 本研究揭示了肠道微生物Bacteroides通过调节CD8+ T细胞肿瘤浸润驱动神经纤维瘤病1型相关低级别胶质瘤进展的机制 | 首次建立了肠道微生物Bacteroides与NF1-LGG病理生物学之间的机制性联系，并揭示了TGFβ介导的免疫调节通路 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性尚需进一步验证 | 探究肠道微生物对神经纤维瘤病1型相关视路胶质瘤进展的影响机制 | Nf1突变小鼠模型（Nf1OPG小鼠）的视路胶质瘤 | 肿瘤免疫学 | 神经胶质瘤 | 16S基因分型，单细胞RNA测序 | NA | 基因测序数据 | 使用Nf1OPG小鼠模型进行研究 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 705 | 2026-01-30 |
Pioneer factor ETV2 safeguards endothelial cell specification by recruiting the repressor REST to restrict alternative lineage commitment
2025-Jun, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-025-00660-y
PMID:40495012
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研究论文 | 本研究探讨了先锋因子ETV2通过招募抑制因子REST来限制替代谱系承诺，从而保护内皮细胞规格化的机制 | 揭示了ETV2作为先锋因子招募抑制因子REST来抑制非内皮谱系基因的创新机制，提供了单细胞分辨率下的内皮细胞规格化分子分析 | 未明确提及具体样本数量或实验重复次数，可能限制结果的普适性 | 研究ETV2过表达在人类诱导多能干细胞来源的中胚层祖细胞中高效指定内皮细胞的机制 | 人类诱导多能干细胞来源的中胚层祖细胞和内皮细胞分化过程 | 发育生物学与再生医学 | NA | CUT&RUN, scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 单细胞RNA测序数据、单细胞ATAC测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 706 | 2026-01-30 |
TGF-β-driven T-cell exclusion in ovarian cancer: single-cell and spatial transcriptomic views of immune low-response states
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1698088
PMID:41181126
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综述 | 本文综述了单细胞RNA和ATAC测序以及空间转录组学在揭示卵巢癌中TGF-β驱动的T细胞排斥和免疫低反应状态方面的进展，并评估了相关的转化机会 | 整合单细胞和空间转录组学数据，解析TGF-β信号相关的成纤维细胞、肿瘤和免疫程序，提出基于TGF-β信息的精准免疫治疗策略 | 存在部位特异性异质性、检测标准化有限以及预测指标稀缺等挑战，限制了临床实施 | 评估TGF-β驱动的免疫低反应状态在卵巢癌中的作用，并探索精准免疫治疗策略 | 上皮性卵巢癌（EOC）中的TGF-β信号、成纤维细胞、肿瘤细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 表观遗传数据, 空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 707 | 2026-01-30 |
Multi-omics exploration of chaperone-mediated immune-proteostasis crosstalk in vascular dementia and identification of diagnostic biomarkers
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1615540
PMID:40808948
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和机器学习算法，探索了分子伴侣系统在血管性痴呆中的调控网络和诊断潜力 | 首次将HSP90AA1-HSPA1B-DNAJB1网络识别为通过蛋白质稳态和免疫重编程双重机制驱动血管性痴呆发病的关键因素，其诊断性能显著优于传统生物标志物 | 需要更大规模的队列研究来验证其临床转化潜力 | 阐明血管性痴呆的分子机制并识别诊断性生物标志物 | 血管性痴呆患者的额叶、颞叶皮质和白质样本，以及双侧颈总动脉狭窄小鼠模型 | 机器学习 | 血管性痴呆 | 转录组学，单细胞转录组学，免疫微环境分析 | LASSO, SVM-RFE, Random Forest | 转录组数据，单细胞转录组数据 | 人类样本：额叶和颞叶皮质（n=15），白质（n=8）；小鼠模型：双侧颈总动脉狭窄模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 708 | 2026-01-29 |
Construction and Evaluation of a Chimeric Japanese Encephalitis Virus Vaccine Candidate Strain with Chaoyang Virus as the Backbone
2025-Dec-26, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines14010030
PMID:41600946
|
研究论文 | 本研究构建并评估了一种以朝阳病毒为骨架的嵌合日本脑炎病毒疫苗候选株 | 首次利用昆虫特异性黄病毒朝阳病毒作为骨架，通过CPER技术构建嵌合JEV疫苗候选株，并系统评估其安全性和免疫保护效果 | 研究主要在IFNAR-/-小鼠模型中进行，尚未在更广泛的动物模型或人体中验证 | 开发一种安全有效的日本脑炎病毒疫苗候选株，并评估朝阳病毒作为通用黄病毒疫苗骨架的潜力 | 日本脑炎病毒基因型I的prME蛋白、朝阳病毒骨架、IFNAR-/-小鼠 | NA | 日本脑炎 | CPER技术、单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 709 | 2026-01-29 |
Myeloid CD36 deficiency alleviates hepatic fibrosis by promoting adaptive immunity of macrophages
2025-Dec-16, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001646
PMID:41400628
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研究论文 | 本研究揭示了CD36介导的巨噬细胞脂质代谢如何通过调节免疫功能和铁死亡影响肝纤维化的发展 | 首次阐明CD36通过促进巨噬细胞铁死亡和损害抗原呈递能力来削弱CD8+T细胞功能，而CD36缺失则通过激活cGAS-STING通路恢复免疫应答 | 研究主要基于小鼠模型和患者组织分析，尚未进行大规模临床试验验证靶向CD36的治疗效果 | 探究巨噬细胞CD36介导的脂质代谢在肝纤维化免疫调节中的作用机制 | 肝巨噬细胞、肝星状细胞、CD8+T细胞及肝硬化患者样本 | NA | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序、组织学分析、血清学分析 | NA | 基因表达数据、组织图像、血清指标 | 小鼠模型及肝硬化患者样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 710 | 2026-01-29 |
Prediction of Clinical Outcomes and Immunotherapy Response in Breast Cancer Based on T Cell-Mediated Tumor Killing-Related Traits
2025-Dec-04, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
|
研究论文 | 本研究基于T细胞介导的肿瘤杀伤相关特征，构建了一个风险模型来预测乳腺癌患者的临床预后和免疫治疗反应 | 首次结合T细胞介导的肿瘤杀伤相关基因，通过WGCNA和差异表达分析识别关键基因，并构建包含HOXC13、KDELR2、POP1、PGK1和ZIC2的预后风险模型，同时整合单细胞RNA测序分析和功能实验验证 | 研究依赖于公共转录组数据集（TCGA和GSE20685），可能受样本异质性和数据质量限制，且风险模型需在更大规模的前瞻性队列中进一步验证 | 识别能预测乳腺癌患者生存结局和免疫治疗反应的生物标志物，以优化免疫检查点抑制剂治疗的患者选择 | 乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 转录组分析、加权基因共表达网络分析、差异表达分析、单细胞RNA测序 | LASSO回归模型 | 转录组数据 | TCGA和GSE20685队列的乳腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 711 | 2026-01-29 |
Cancer cachexia-related monocytic myeloid-derived suppressor cells impair T-cell negative selection and predict immune-related adverse events
2025-Dec, Liver research (Beijing, China)
DOI:10.1016/j.livres.2025.10.001
PMID:41602130
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研究论文 | 本研究探讨了癌症恶病质与免疫相关不良事件（irAEs）之间的关联及其潜在机制，发现恶病质相关的单核髓系来源抑制细胞（M-MDSCs）通过诱导胸腺上皮细胞凋亡损害T细胞阴性选择，从而促进自身免疫反应 | 首次揭示了癌症恶病质通过M-MDSCs损害胸腺T细胞阴性选择、导致自身免疫性T细胞浸润并增加irAEs风险的机制，并提出了M-MDSCs作为irAEs预测生物标志物的新观点 | 研究样本量相对较小（64例患者），且主要聚焦于肝细胞癌小鼠模型，结论在其他癌种中的普适性有待进一步验证 | 探索癌症恶病质与免疫检查点抑制剂治疗中免疫相关不良事件（irAEs）的相关性及其分子机制 | 恶病质肝细胞癌（HCC）小鼠模型、接受抗PD-1/L1抗体治疗的晚期癌症患者 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、免疫荧光、苏木精-伊红（H&E）染色 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞数据、组织病理图像、临床数据 | 64例接受抗PD-1/L1治疗的晚期癌症患者及恶病质HCC小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 712 | 2026-01-29 |
Multi-Omics Dissection of TIMP1 in Monocytes/Macrophages Reveals Pathogenic Mechanisms and Therapeutic Opportunities in Ankylosing Spondylitis
2025-Oct-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202502830R
PMID:41082174
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研究论文 | 本研究通过整合蛋白质组学、miRNA分析和单细胞测序数据，揭示了TIMP1在单核/巨噬细胞中下调通过RHOA途径促进强直性脊柱炎发病的机制，并筛选出多种潜在治疗化合物 | 首次通过多组学整合分析系统阐明TIMP1在AS单核/巨噬细胞中的表达调控网络及下游RHOA信号通路机制，并筛选出包括传统中药成分在内的多种靶向TIMP1的潜在治疗化合物 | 研究主要基于生物信息学分析和体外模型验证，缺乏在体动物模型或临床样本中的功能验证实验 | 阐明强直性脊柱炎的发病机制并探索潜在治疗靶点 | 强直性脊柱炎患者样本（推测）及慢性炎症模型中的椎旁韧带肌肉组织 | 生物信息学 | 强直性脊柱炎 | 蛋白质组学, miRNA分析, 单细胞测序, qPCR | NA | 蛋白质组数据, miRNA表达数据, 单细胞转录组数据, qPCR数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 713 | 2026-01-29 |
Comprehensive Analysis of Epigenetic Signatures in Non-Small Cell Lung Cancer: Development and Validation of an Epigenetics-Based Prognostic Model for Drug Sensitivity Prediction
2025-Oct-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202502391R
PMID:41085960
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据，开发并验证了一个基于表观遗传特征的NSCLC预后模型，用于预测药物敏感性 | 首次系统整合单细胞RNA测序与批量转录组数据，构建基于表观遗传特征的预后模型，并实验验证了关键基因LYPD3的致癌功能 | 样本量相对有限，单细胞数据仅来自42个NSCLC和11个正常样本，模型在其他癌症类型中的泛化能力需进一步验证 | 开发一个基于表观遗传特征的预后模型，用于预测NSCLC的药物敏感性和临床结局 | 非小细胞肺癌（NSCLC）患者样本，包括肿瘤组织和邻近正常组织 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序，qRT-PCR，免疫组化 | 随机生存森林（RSF） | 基因表达数据，表观遗传数据 | 单细胞数据：42个NSCLC样本和11个正常样本；批量转录组数据：TCGA-NSCLC队列993例，GSE13213队列110例，GSE42127队列176例 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 714 | 2026-01-29 |
Interplay of PRMTs and Identification of Biomarkers Through Machine Learning Algorithms in Pan-Cancer, Highlighting PRMT3 as a Biomarker in Pancreatic Cancer
2025-Oct-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202500729R
PMID:41099588
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研究论文 | 本研究通过机器学习算法探索PRMTs在泛癌中的作用，并识别PRMT3作为胰腺癌的潜在预后生物标志物 | 首次结合三种机器学习算法系统分析PRMTs在泛癌中的预后价值，并通过单细胞RNA测序数据验证PRMT3在胰腺癌中的功能 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅限于胰腺癌模型，需进一步体内外实验确认 | 探究PRMTs在癌症中的调控机制并识别相关预后生物标志物 | 泛癌数据集及胰腺癌细胞 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，分子对接，Transwell实验，伤口愈合实验 | 机器学习算法 | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | 泛癌数据集及胰腺癌单细胞RNA测序样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 715 | 2026-01-29 |
COL6A1, LAPTM5, and ZFAND2A as Crucial Biomolecules Driving Immunoregulation in Human Nucleus Pulposus Degeneration
2025-Oct-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202500320R
PMID:41124083
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、转录组学和孟德尔随机化分析，揭示了椎间盘退变中关键的免疫调控生物分子及其作用机制 | 首次将单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析相结合，系统性地识别了与椎间盘退变风险显著相关的关键基因（COL6A1、LAPTM5、ZFAND2A），并阐明了它们在免疫微环境中的调控作用 | 样本量较小（仅4名患者），且研究结果主要在蛋白水平进行了验证，缺乏更深入的体内功能实验验证 | 探究椎间盘退变的免疫调控机制，并识别驱动该过程的关键生物分子 | 人类髓核组织 | 生物信息学 | 椎间盘退行性疾病 | 单细胞RNA测序，转录组学，孟德尔随机化分析，eQTL分析 | NA | 单细胞RNA测序数据，转录组数据，基因组关联数据 | 4名椎间盘退变患者的髓核样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 716 | 2026-01-29 |
A Lactylation-Based Diagnostic Model Reveals Molecular Subtypes and Therapeutic Targets in Dilated Cardiomyopathy
2025-Oct-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202502739R
PMID:41137708
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研究论文 | 本研究通过整合转录组数据和乳酸化相关基因，构建了一个基于乳酸化的诊断模型，用于扩张型心肌病的分子分型和治疗靶点识别 | 首次将蛋白质乳酸化与扩张型心肌病诊断模型结合，利用集成机器学习算法识别核心乳酸化相关基因，并揭示了两种分子亚型及免疫代谢重塑机制 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据，缺乏大规模前瞻性临床队列验证，且治疗化合物的预测需进一步实验证实 | 开发基于乳酸化相关基因的扩张型心肌病诊断模型，探索分子亚型及潜在治疗靶点 | 扩张型心肌病患者及小鼠心肌组织的转录组和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 转录组测序, 单细胞RNA测序 | 集成机器学习算法 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的多个外部队列数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 717 | 2026-01-29 |
Polyamine acetylation mediates crosstalk between cancer cells and myeloid cells to promote mesenchymal/plurimetabolic states in glioblastoma
2025-Oct-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf128
PMID:40424600
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研究论文 | 本研究探讨了多胺乙酰化在胶质母细胞瘤中如何通过调节肿瘤细胞内在代谢及与肿瘤相关巨噬细胞/髓系细胞的代谢串扰，促进间充质/多代谢状态及治疗抵抗 | 揭示了SAT1及其产物N1-乙酰亚精胺在连接肿瘤细胞与肿瘤相关巨噬细胞代谢活动中的新作用，共同促进胶质母细胞瘤的间充质/多代谢状态和治疗抵抗 | NA | 研究多胺代谢重编程如何影响胶质母细胞瘤的恶性细胞内在及微环境依赖的生物学过程，以阐明其亚型分类的基础 | 人类和小鼠的胶质母细胞瘤肿瘤及细胞系 | NA | 胶质母细胞瘤 | 液相色谱/串联质谱法、单细胞RNA测序、代谢谱分析 | NA | 代谢物定量数据、单细胞RNA测序数据、代谢谱数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 718 | 2026-01-29 |
β-cell heterogeneity and molecular plasticity in type 2 diabetes: multi-omics perspectives and the role of gut microbiota
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1698296
PMID:41584842
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综述 | 本文综述了利用多组学技术揭示2型糖尿病中β细胞的异质性与分子可塑性，并探讨了肠道微生物群在其中的作用及潜在治疗策略 | 整合单细胞转录组学、表观基因组学、空间转录组学等多组学视角与肠道微生物组研究，提出了理解β细胞功能失调与微生物群介导代谢调控的综合框架 | 作为一篇综述文章，主要整合现有证据而非提出新的原始数据，且微生物群与β细胞功能间的因果机制仍需更多实验验证 | 阐明2型糖尿病中β细胞的异质性、分子可塑性及其与肠道微生物群的相互作用，以寻找潜在治疗靶点 | 胰腺β细胞、胰岛其他内分泌细胞、免疫细胞、基质细胞、胰腺外分泌部分以及肠道微生物群 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞转录组学、表观基因组学、空间转录组学、多组学整合分析 | NA | 转录组数据、表观基因组数据、空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 719 | 2026-01-29 |
Single-cell analysis of microglial activation after traumatic brain injury reveals immune signaling pathways linked to mitochondrial dysfunction and brain aging
2025, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2025.1657523
PMID:41583003
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学绘制了创伤性脑损伤后小胶质细胞动态响应的图谱，并验证了与线粒体功能障碍和脑衰老相关的关键免疫信号通路 | 首次整合多个组织和时间点，提供了创伤性脑损伤后小胶质细胞-髓系细胞相互作用的单细胞转录组图谱，并将小胶质细胞信号与线粒体功能障碍和神经炎症联系起来 | 研究主要基于公开数据集和体外模型验证，缺乏体内功能验证，且样本量有限 | 绘制创伤性脑损伤后小胶质细胞的动态响应图谱，并验证关键信号通路 | 小鼠的皮质、海马体和血液样本中的髓系细胞（包括单核细胞、巨噬细胞和小胶质细胞） | 数字病理学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞转录组学，qPCR | NA | 转录组数据 | 35只小鼠（11个血液样本，12个皮质样本，12个海马体样本） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 720 | 2026-01-29 |
ULMnet: inferring physical cell-cell communication networks from scRNAseq data using univariate linear models
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1722504
PMID:41583424
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研究论文 | 本研究开发了一种名为ULMnet的计算方法，利用单变量线性模型从单细胞RNA测序数据中推断物理细胞间通信网络 | 通过识别scRNAseq中的多重体（尤其是双联体）来推断物理细胞间相互作用，克服了传统方法因组织解离而无法捕获直接接触的局限性 | 方法在预测已知成分的双联体时灵敏度约为56%，虽然精度高（~99%），但灵敏度相对较低，可能漏检部分多重体 | 开发一种计算工具，从scRNAseq数据中推断物理细胞间通信网络，以揭示组织中的直接细胞相互作用 | 单细胞RNA测序数据，包括细胞对、部分解离组织以及健康和癌症组织的常规scRNAseq数据集 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | 单变量线性模型 | 单细胞RNA测序数据 | 多个数据集，包括细胞对、部分解离组织以及健康和癌症组织的scRNAseq数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |