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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 701 | 2026-09-02 |
Hair follicle epithelial stem cells contribute to interfollicular epidermis during homeostasis
2025-08-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.193496
PMID:40627455
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研究论文 | 本研究通过谱系追踪和空间转录组学揭示KROX20标记的毛囊上皮干细胞在稳态期间迁移至毛囊间表皮,对表皮更新有贡献 | 首次证明KROX20转录因子标记上、中段毛囊中的异质性干细胞群体,并展示其向毛囊间表皮的迁移贡献 | 摘要未提及明显局限,可能包括对KROX20细胞异质性和迁移机制的深入理解有限 | 探究毛囊上皮干细胞在稳态下对毛囊间表皮的贡献及其在表皮稳态维持中的作用 | 小鼠毛囊和毛囊间表皮干细胞 | 数字病理学 | 不适用 | 谱系追踪、空间转录组学 | 不适用 | 基因表达数据、空间转录组数据 | 小鼠模型(具体数量未在摘要中提及) | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组 |
| 702 | 2026-09-02 |
An engineered glioblastoma model yields macrophage-secreted drivers of invasion
2025-08-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.181903
PMID:40857405
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研究论文 | 利用工程化3D水凝胶模型,揭示M2型巨噬细胞通过分泌TGFBI等因子促进胶质母细胞瘤干细胞侵袭性的机制 | 结合工程化3D肿瘤微环境模型与多组学分析,首次识别并验证TGFBI作为可靶向的巨噬细胞分泌促肿瘤因子 | 局限于体外模型,尚需体内验证及临床转化研究 | 阐明肿瘤相关巨噬细胞在胶质母细胞瘤侵袭中的作用及机制 | 胶质母细胞瘤干细胞及M2型巨噬细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 蛋白质组学、单细胞转录组学 | 3D水凝胶模型 | 蛋白质组数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 703 | 2026-09-02 |
The spleen tyrosine kinase inhibitor entospletinib resolves inflammation to promote repair following acute kidney injury
2025-08-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.189601
PMID:40857403
|
研究论文 | 研究选择性SYK抑制剂entospletinib在急性肾损伤向慢性肾病转变过程中的抗炎和修复作用 | 首次证明entospletinib通过靶向白细胞表达的SYK,阻断中性粒细胞/单核细胞募集,并抑制促炎巨噬细胞活化,从而促进AKI后肾脏修复 | 研究仅限于小鼠模型,未涉及人类样本;未探讨长期安全性及临床转化可行性 | 评估选择性SYK抑制剂entospletinib对AKI向CKD转变的干预效果及其机制 | 小鼠肾脏组织及免疫细胞 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序、数字空间图谱、活体显微镜、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、图像 | 小鼠模型,具体数量未提供 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 单细胞RNA测序和数字空间图谱分析 |
| 704 | 2026-09-02 |
Single-cell spatial transcriptomics unravels the cellular landscape of abdominal aortic aneurysm
2025-08-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.190534
PMID:40857411
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研究论文 | 本研究利用超高分辨率空间转录组技术Seq-Scope,解析了血管紧张素II诱导的小鼠腹主动脉瘤(AAA)的细胞空间图谱,揭示了巨噬细胞、成纤维细胞和平滑肌细胞(SMCs)的异质性及细胞间相互作用,并发现GPNMB高表达巨噬细胞通过CD44信号通路促进SMC表型转换,从而推动AAA发展 | 首次将Seq-Scope超高分辨率空间转录组技术应用于动脉瘤研究,以单细胞分辨率结合空间信息揭示了AAA组织不同层中细胞亚群的特定分布和互作,发现了GPNMB高表达巨噬细胞与平滑肌细胞共定位及功能关联,并提出其通过CD44信号通路介导SMC功能障碍的新机制 | 研究基于小鼠模型,其发现可能不直接适用于人类AAA;需进一步通过体内实验验证GPNMB、CD44等靶点的功能及临床相关性;未详细探讨其他细胞类型间可能的相互作用 | 应用空间转录组技术解析AAA的细胞空间景观,探索细胞间互作及新致病机制,为疾病治疗提供潜在靶点 | 血管紧张素II诱导的Apoe-/-小鼠腹主动脉瘤组织中的细胞(包括巨噬细胞、成纤维细胞和平滑肌细胞) | 空间转录组学 | 腹主动脉瘤 | Seq-Scope空间转录组、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫荧光染色 | NA | 空间转录组数据、单细胞转录组数据、组织图像 | 小鼠动脉瘤组织样本(具体数量未提及) | NA | 空间转录组学 | Seq-Scope | Seq-Scope超高分辨率空间转录组技术 |
| 705 | 2026-09-02 |
Spatial transcriptomics reveals distinct cell type dynamics following opioid dependence in mice with the common human variant in the μ-opioid receptor, Oprm1 A118G
2025-Aug-18, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7199524/v1
PMID:40894067
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研究论文 | 利用空间转录组学技术,研究了携带常见人类μ-阿片受体Oprm1 A118G变异的阿片依赖小鼠中细胞类型动态变化,揭示了遗传风险对阿片依赖的细胞类型特异性影响 | 首次将空间转录组学应用于探究阿片依赖中Oprm1 A118G变异的影响,并发现胶质细胞适应而非神经元功能障碍在遗传风险中起更重要作用 | 研究基于小鼠模型,人类中的具体机制仍需进一步验证;样本量和具体实验细节未在摘要中提供 | 阐明Oprm1 A118G变异如何影响阿片依赖的细胞动态和分子机制,为治疗提供新途径 | 携带Oprm1 A118G变异的小鼠阿片依赖模型 | 空间转录组学 | 阿片使用障碍 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 706 | 2026-09-02 |
CAR-engineered cytolytic Tregs reverse pulmonary fibrosis and remodel the fibrotic niche with limited CRS
2025-08-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.182050
PMID:40627450
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研究论文 | 开发靶向FAP1+肺泡成纤维细胞的CAR工程化溶细胞性调节性T细胞(CAR-cTregs),在博来霉素诱导的肺纤维化模型中逆转纤维化并重塑纤维化微环境,且细胞因子释放综合征(CRS)有限 | 将CAR-T免疫疗法的靶向杀伤优势与Treg的免疫抑制功能相结合,构建CAR-cTregs治疗特发性肺纤维化,同时诱导细胞毒性及免疫抑制,展现出对慢性炎症性疾病的治疗潜力 | 未提及具体局限性,但可能需要进一步验证安全性、长期效果及临床转化可行性 | 开发针对特发性肺纤维化的新型治疗策略,利用CAR-cTregs靶向并消除致病性FAP1+肺泡成纤维细胞,逆转纤维化并减少炎症 | FAP1+肺泡成纤维细胞、CAR工程化溶细胞性调节性T细胞(CAR-cTregs)、博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型 | 数字病理学、免疫治疗 | 特发性肺纤维化 | 单细胞转录组学、CAR-T细胞工程 | CAR-T细胞模型 | 单细胞转录组数据、体外实验数据、动物模型数据 | 未明确样本数量,涉及细胞系及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 707 | 2026-09-02 |
Human myelocyte and metamyelocyte-stage neutrophils suppress tumor immunity and promote cancer progression
2025-08, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-025-01145-0
PMID:40664963
|
研究论文 | 本研究分离人类和小鼠中性粒细胞的三个发育阶段,发现人骨髓中髓细胞和晚幼粒细胞阶段的中性粒细胞具有免疫抑制和促肿瘤作用,并通过创建人免疫系统小鼠模型验证其功能,提出靶向治疗策略 | 首次将人类中性粒细胞分为三个发育阶段,并鉴定出髓细胞和晚幼粒细胞阶段在肿瘤免疫抑制中的主导作用;创建了NCG-Gfi1人免疫系统小鼠模型以支持人肿瘤浸润中性粒细胞的重建;提出使用Fms样酪氨酸激酶3配体诱导这些细胞转分化为单核细胞从而控制肿瘤的新策略 | 未明确说明研究的局限性 | 阐明人类髓细胞和晚幼粒细胞阶段中性粒细胞在肿瘤免疫抑制和癌症进展中的作用,并探索其作为生物标志物和免疫治疗靶点的潜力 | 人类和小鼠中性粒细胞的不同发育阶段(包括早幼粒细胞、髓细胞和晚幼粒细胞、杆状和分叶核中性粒细胞)以及17种癌症类型的肿瘤浸润中性粒细胞 | 免疫学 | 多种癌症(涉及17种癌症类型) | 单细胞RNA测序、流式细胞术、小鼠模型 | NCG-Gfi1人免疫系统小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据 | 涉及17种癌症类型的患者样本,以及小鼠模型(具体数量未提供) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 708 | 2026-09-02 |
Spatiotemporal transcriptomic analysis during cold ischemic injury to the murine kidney reveals compartment-specific changes
2025-May-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.25.654911
PMID:40501673
|
研究论文 | 利用空间转录组学技术对小鼠肾脏冷缺血损伤(0-48小时)进行时空转录组分析,揭示了区域特异性变化和代谢重编程。 | 开发了计算流程,实现区域特异性的时空转录组变化识别;发现肾内髓质在缺血环境中具有强烈的氧化磷酸化特征;揭示了冷缺血与热缺血再灌注损伤的共性,包括全肾组织抗病毒样免疫反应诱导。 | 未提及具体局限性 | 全面解析冷缺血损伤的分子机制,并探索空间分析对肾组织深层病理发展的新见解。 | 小鼠肾脏组织,冷缺血损伤模型(0-48小时)。 | 空间转录组学 | 肾脏冷缺血损伤 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 小鼠肾脏样本(具体数量未提及) | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 709 | 2026-09-02 |
MALADAPTIVE IMMUNE-FIBROTIC AXIS DRIVES IMPAIRED LONG BONE REGENERATION UNDER MECHANICAL INSTABILITY
2025-May-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.26.564177
PMID:37961650
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研究论文 | 本研究通过可调髓内钉构建小鼠延迟愈合模型,模拟高应变下的骨折不愈合,揭示了机械不稳定性驱动的免疫-纤维化轴在长骨再生受损中的作用 | 首次利用可调髓内钉精确控制骨折间隙应变,模拟人类肥厚性骨不连,并结合空间转录组学和全身免疫谱分析,将机械不稳定性与病理免疫-基质串扰联系起来,提出机械免疫学的新概念 | 研究基于小鼠模型,可能无法完全复制人类骨折愈合的复杂性,且未涉及长期随访或临床验证 | 阐明机械不稳定性如何驱动免疫-纤维化轴导致骨再生受损,为肥厚性骨不连提供新的诊断和治疗策略 | 小鼠股骨骨折模型,特别是高应变(15-30%)和低应变(<5%)条件下的愈合过程 | 数字病理学 | 骨不连 | 空间转录组学、全身免疫谱分析 | NA | 空间基因表达数据、免疫细胞数据、生物力学数据 | 涉及小鼠骨折模型,具体样本数量未在摘要中明确 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 710 | 2026-09-02 |
A Bifunctional Antibody Targeting PD-1 and TGF-β Signaling Has Antitumor Activity in Combination with Radiotherapy and Attenuates Radiation-Induced Lung Injury
2025-05-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0903
PMID:39878763
|
研究论文 | 本研究探讨了双功能抗体JS-201(靶向PD-1和TGF-β信号)与放疗联合的抗肿瘤效果及其对放射性肺损伤的缓解作用 | 首次证明JS-201与放疗联合不仅能增强抗肿瘤效应,还能通过抑制TGF-β/Smad通路和ROS介导的中性粒细胞胞外陷阱释放,减轻放射性肺损伤 | 摘要未提及具体局限性 | 评估JS-201与放疗联合的抗肿瘤效果及对放射性肺损伤的影响 | Lewis肺癌荧光素酶阳性小鼠模型及放射性肺损伤模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 转录组测序、单细胞测序 | NA | 测序数据、图像 | 多种肿瘤模型和RILI模型(具体数量未在摘要中说明) | NA | NA | NA | NA |
| 711 | 2026-09-02 |
Denosumab Enhances Antitumor Immunity by Suppressing SPP1 and Boosting Cytotoxic T Cells
2025-05-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-1094
PMID:40009710
|
研究论文 | 探讨地舒单抗通过抑制SPP1表达和增强细胞毒性T细胞活性来提升抗肿瘤免疫的作用 | 首次在人类巨细胞瘤样本中通过单细胞RNA测序揭示地舒单抗的免疫调节新作用,并进行了泛癌分析验证SPP1与CD8A的负相关及预后关联 | 未提及具体局限性 | 探索地舒单抗在增强抗肿瘤免疫中的额外作用及其机制 | 人类巨细胞瘤(GCTB)样本和多种癌症类型的患者 | 数字病理学 | 巨细胞瘤、多种癌症 | 单细胞RNA测序、泛癌分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 9个人类巨细胞瘤样本(6例未治疗,3例仅用地舒单抗)和9例配对样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 712 | 2026-09-02 |
Endogenous CD4+ T Cells That Recognize ALK and the NPM1::ALK Fusion Protein Can Be Expanded from Human Peripheral Blood
2025-04-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0445
PMID:39774774
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研究论文 | 本研究首次在人类外周血中检测到针对ALK融合蛋白的CD4+ T细胞,并鉴定出其表位及T细胞受体 | 首次发现并扩展了人类外周血中针对ALK和NPM1::ALK融合蛋白的CD4+ T细胞,并鉴定出特定表位和HLA-DR13限制性T细胞受体 | 样本量较小(10名患者和6名健康供者),且未进行体内功能验证 | 探索ALK特异性CD4+ T细胞在外周血中的存在及其在ALK阳性恶性肿瘤免疫治疗中的潜在应用 | ALK阳性间变性大细胞淋巴瘤缓解期患者和健康供者的外周血CD4+ T细胞 | 免疫学 | 间变性大细胞淋巴瘤 | TCRαβ单细胞测序 | TCR报告细胞系(58α-β-) | 外周血细胞、肽段刺激数据 | 10名患者和6名健康供者 | NA | 单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 713 | 2026-09-02 |
PKCδ Germline Variants and Genetic Deletion in Mice Augment Antitumor Immunity through Regulation of Myeloid Cells
2025-04-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0999
PMID:39808445
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研究论文 | 本研究通过结合种系变异分析和单细胞RNA测序,发现蛋白激酶Cδ(PKCδ)在调节髓系细胞状态和抗肿瘤免疫中发挥关键作用,可作为癌症免疫治疗的潜在靶点。 | 首次通过种系变异与肿瘤免疫基因特征关联分析,将PKCδ鉴定为癌症免疫治疗的新靶点,并利用单细胞RNA测序揭示其在髓系细胞中调控巨噬细胞M1/M2极化状态。 | 摘要中未提及局限性。 | 寻找与肿瘤T细胞浸润相关的种系变异,以鉴定癌症免疫治疗的新靶点。 | 小鼠模型和临床样本,包括基因敲除小鼠、抗PD-L1治疗模型及临床肿瘤样本。 | 免疫学、癌症研究 | 癌症 | 单细胞RNA测序、基因敲除 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 小鼠模型及临床样本(具体数量未在摘要中提供) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 714 | 2026-09-02 |
SPARROW reveals microenvironment-zone-specific cell states in healthy and diseased tissues
2025-03-19, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101235
PMID:40112778
|
研究论文 | SPARROW是一种计算框架,通过联合学习潜在嵌入和软聚类,在健康及病变组织中揭示微环境区域特异性细胞状态 | SPARROW创新地联合学习细胞类型和细胞组织的潜在嵌入及软聚类,避免了传统方法中分离和硬聚类的问题,实现跨尺度和样本的可比性,并能发现竞争方法遗漏的区域特异性细胞状态 | 摘要中未提及局限性的具体信息 | 开发一种计算框架,以全面表征组织特征,跨越尺度、样本和条件,揭示微环境区域特异性细胞状态 | 人类和小鼠组织,包括人类扁桃体,以及空间分辨转录组学和scRNA-seq数据 | 机器学习 | NA | 空间分辨转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 人类和小鼠组织样本,具体数量未在摘要中说明 | NA | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 715 | 2026-09-02 |
Single-cell multiome and spatial profiling reveals pancreas cell type-specific gene regulatory programs driving type 1 diabetes progression
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.13.637721
PMID:40027657
|
研究论文 | 通过单核多组学和空间转录组学分析,揭示了驱动1型糖尿病进展的胰腺细胞类型特异性基因调控程序 | 首次整合单核多组学与空间转录组学,在多达32个供体中绘制胰腺12种细胞类型的基因调控图谱,并结合遗传关联识别出因果通路 | 未明确说明,可能包括样本量限制或技术分辨率的局限 | 阐明驱动1型糖尿病进展的胰腺细胞类型特异性基因调控程序 | 来自非糖尿病、自身抗体阳性和1型糖尿病供体的胰腺组织 | 单细胞多组学 | 1型糖尿病 | 单核多组学、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、表观基因组数据、空间转录组数据 | 32例胰腺供体(包括ND、AAB+和T1D),共853,005个细胞 | 10x Genomics | 单核多组学、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | 单核多组学(如10x Multiome ATAC+GEX)、空间转录组学(如10x Visium) |
| 716 | 2026-09-02 |
Profiling Multiple CD8+ T-cell Functional Dimensions Enhances Breast Cancer Immune Assessment
2025-03-04, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0235
PMID:39715293
|
研究论文 | 本研究开发了基于bulk RNA测序的FuncDimen模型,从五个功能维度评估CD8+ T细胞抗肿瘤免疫,以增强乳腺癌的预后预测和免疫治疗反应评估。 | 通过整合单细胞RNA测序和匹配的bulk RNA测序数据,创新性地构建了评估CD8+ T细胞五个功能维度的模型,并计算FuncAggre评分以综合反映抗肿瘤免疫,优于现有免疫生物标志物。 | 基于bulk RNA测序的模型可能无法捕捉单细胞水平的异质性,且研究样本和外部验证的局限性可能影响模型的泛化性(未在摘要中明确提及)。 | 开发一种临床适用且能精细评估CD8+ T细胞功能的工具,以改善乳腺癌预后预测和免疫治疗反应评估。 | 乳腺癌患者,包括本队列和外部数据库的样本。 | 机器学习 | 乳腺癌 | bulk RNA测序、单细胞RNA测序、免疫荧光、成像质谱流式 | NA | 基因表达数据、蛋白表达数据(免疫荧光和成像质谱流式) | 乳腺癌队列和外部数据库样本(具体数量未在摘要中提供) | NA | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、成像质谱流式 | NA | NA |
| 717 | 2026-09-02 |
Spatial Organization of Macrophages in CTL-Rich Hepatocellular Carcinoma Influences CTL Antitumor Activity
2025-03-04, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0589
PMID:39745778
|
研究论文 | 本研究通过多路复用原位染色和单细胞/空间转录组学,揭示了CTL丰富的肝细胞癌中巨噬细胞空间聚集与免疫抑制微环境及不良预后相关,并影响抗PD-1免疫治疗反应 | 首次系统刻画了CTL丰富肝细胞癌中巨噬细胞空间组织模式,并证明其聚集增强促肿瘤重编程,且与免疫治疗反应相关 | 未明确说明,但可能受限于样本量及体外模型的简化条件 | 探究CTL丰富肝细胞癌中空间免疫变异如何影响临床异质性及治疗反应 | 20例预后不同的CTL丰富肝细胞癌样本及386例验证队列患者 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 多重原位染色、单细胞转录组学、空间转录组学 | 随机森林、Cox回归 | 图像、转录组数据 | 20例CTL丰富肝细胞癌及386例患者队列 | NA | 空间转录组学、单细胞转录组学 | NA | NA |
| 718 | 2026-09-02 |
O-GlcNAcylation attenuates ischemia-reperfusion-induced pulmonary epithelial cell ferroptosis via the Nrf2/G6PDH pathway
2025-02-04, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02126-w
PMID:39901237
|
研究论文 | 本研究探讨了O-GlcNAc修饰通过Nrf2/G6PDH通路减轻缺血再灌注引起的肺上皮细胞铁死亡的作用机制 | 首次揭示O-GlcNAc修饰通过O-GlcNAc转移酶1调控Nrf2/G6PDH通路,增强肺上皮细胞对铁死亡的抵抗,为肺缺血再灌注损伤的治疗提供新靶点 | 研究主要基于细胞和小鼠模型,临床样本数据有限,且未深入探讨其他潜在机制 | 探究O-GlcNAc修饰对肺缺血再灌注损伤中铁死亡的影响及其分子机制 | 肺上皮细胞和小鼠肺组织 | 分子生物学 | 肺缺血再灌注损伤 | 单细胞测序、蛋白质组学、染色质免疫沉淀、双荧光素酶报告基因实验 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞测序数据、蛋白质组学数据 | 未提供具体样本量 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 719 | 2026-09-02 |
Consensus representation of multiple cell-cell graphs from gene signaling pathways for cell type annotation
2025-01-23, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02128-8
PMID:39849579
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研究论文 | 提出scMCGraph,一个整合基因表达与通路活性进行细胞类型注释的计算框架 | 利用多个通路特异性视图构建共识图,并以此重建多个视图,从而引入通路信息改善细胞间图学习,提升跨数据集的预测性能 | 未在摘要中明确提及局限性 | 提升单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的准确性和鲁棒性 | 多样化的单细胞RNA测序数据集,包括跨平台、跨时间、跨样本和临床数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图神经网络(基于共识图) | 基因表达数据和通路活性数据 | 未在摘要中指明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 720 | 2026-09-02 |
Unveiling cell-type-specific microRNA networks through alternative polyadenylation in glioblastoma
2025-01-21, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-024-02104-8
PMID:39838429
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据,分析了胶质母细胞瘤中不同细胞类型(尤其是肿瘤细胞和少突胶质前体细胞)的替代性多聚腺苷酸化(APA)事件,揭示了APA如何调控microRNA结合位点并影响细胞状态转换和基因调控网络 | 首次揭示了APA事件与基因表达变化之间的独立性,并构建了microRNA-转录因子-靶基因网络,提供了针对GBM复杂分子互作的新视角 | 基于单细胞RNA测序数据,可能受到数据噪声和覆盖度限制,且未对发现的机制进行实验验证 | 探索替代性多聚腺苷酸化在胶质母细胞瘤中调节microRNA结合及转录后调控的作用,以理解细胞状态转变和疾病进展 | 胶质母细胞瘤样本中的肿瘤细胞和少突胶质前体细胞 | 生物信息学, 单细胞转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,APA分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 未在摘要中提供具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |