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当前共找到 10796 篇文献,本页显示第 701 - 720 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
701 2026-01-09
Stem Cell Niche: iPSC-Based Assembloids for Modeling Human Hematopoiesis
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 本文介绍了一种基于诱导多能干细胞生成模拟骨髓微环境的3D组装体协议,用于研究人类造血调控和疾病建模 开发了患者特异性3D骨髓模拟组装体,可精确控制细胞组成和遗传背景,成功模拟了骨髓增殖性肿瘤的关键特征 NA 研究人类造血调控机制和骨髓微环境重塑 诱导多能干细胞、人类原代间充质基质细胞、骨髓模拟3D组装体 数字病理学 骨髓增殖性肿瘤 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
702 2026-01-09
Pan-Cancer Analysis of Enhancer-Induced PAN3-AS1 and Experimental Validation as a WFDC13-Promoting Factor in Colon Cancer
2025, Oncology research IF:2.0Q3
研究论文 本研究通过泛癌分析揭示了长链非编码RNA PAN3-AS1的致癌特性,并在结肠癌中实验验证了其通过竞争性结合miR-423-5p促进WFDC13表达的机制 首次在泛癌水平系统分析PAN3-AS1的诊断、预后价值及其与免疫微环境的关系,并揭示了增强子活性调控PAN3-AS1表达的新机制 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内实验验证;药物筛选部分仅为虚拟预测,未进行实验验证 探究PAN3-AS1在泛癌中的致癌特性及其在结肠癌中的具体调控机制 PAN3-AS1长链非编码RNA及其在多种癌症(特别是结肠癌)中的表达与功能 生物信息学 结肠癌 单细胞转录组学、染色质免疫沉淀、荧光素酶活性测定、RNA免疫沉淀、虚拟筛选、分子对接 NA 转录组数据、单细胞RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
703 2026-01-09
AGPAT3 Regulates Immune Microenvironment in Osteosarcoma via Lysophosphatidic Acid Metabolism
2025, Oncology research IF:2.0Q3
研究论文 本研究探讨了AGPAT3通过溶血磷脂酸代谢调控骨肉瘤免疫微环境的作用 首次将AGPAT3与骨肉瘤预后及免疫微环境调控联系起来,并发现其通过LPA-TAM-LPAR6轴抑制细胞毒性T细胞功能 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内实验验证 探索甘油脂代谢在骨肉瘤中的作用及其对免疫微环境的调控机制 骨肉瘤细胞、肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)及免疫细胞 生物信息学 骨肉瘤 单细胞RNA测序、LASSO回归、虚拟筛选 NA RNA测序数据、单细胞数据 来自TARGET数据库的骨肉瘤样本及单细胞RNA测序数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
704 2026-01-09
ETV4-Mediated PD-L1 Upregulation Promotes Immune Evasion and Predicts Poor Immunotherapy Response in Melanoma
2025, Oncology research IF:2.0Q3
研究论文 本研究揭示了转录因子ETV4通过上调PD-L1促进黑色素瘤免疫逃逸,并预测免疫治疗反应不良 首次发现ETV4作为关键转录因子调控PD-L1表达,介导黑色素瘤免疫逃逸,并可作为免疫治疗反应的预测生物标志物 研究主要聚焦于黑色素瘤和肝细胞癌,其他癌症类型中的ETV4功能尚未验证 阐明ETV4在肿瘤免疫逃逸中的作用及其作为免疫治疗预测生物标志物的潜力 黑色素瘤和肝细胞癌患者样本、肿瘤细胞、免疫细胞及小鼠模型 肿瘤免疫学 黑色素瘤 单细胞RNA测序、功能研究、小鼠模型 NA 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 未明确指定样本数量,但包括黑色素瘤和肝细胞癌患者样本及小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
705 2026-01-09
STC2+ Malignant Cell State Associated with EMT, Tumor Microenvironment Remodeling, and Poor Prognosis Revealed by Single-Cell and Spatial Transcriptomics in Colorectal Cancer
2025, Oncology research IF:2.0Q3
研究论文 本研究通过单细胞和空间转录组学,在结直肠癌中鉴定出一种与上皮-间质转化、肿瘤微环境重塑及不良预后相关的STC2+恶性细胞亚群 整合多组学方法识别了空间富集于肿瘤区域且代谢重编程的STC2+恶性细胞亚群,揭示了其作为信号枢纽及潜在治疗靶点的新作用 NA 旨在识别结直肠癌中利用缺氧和果糖代谢等替代代谢途径改变肿瘤微环境的恶性亚群,并解析其细胞间信号网络和空间组织 结直肠癌组织样本,包括肝转移样本 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序,空间转录组学,多组学整合分析 NA RNA测序数据,空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
706 2026-01-09
ELK4 Promotes Vasculogenic Mimicry in Oral Squamous Cell Carcinoma via Driving DHFR Transcriptional Activation
2025, Oncology research IF:2.0Q3
研究论文 本研究揭示了ELK4通过驱动DHFR转录激活促进口腔鳞状细胞癌中血管生成拟态形成的机制 首次发现ELK4/DHFR轴在口腔鳞状细胞癌血管生成拟态中的关键调控作用,并阐明其表观遗传机制 研究主要基于体外实验和生物信息学分析,缺乏体内动物模型验证 阐明口腔鳞状细胞癌中血管生成拟态的调控机制 口腔鳞状细胞癌细胞 数字病理学 口腔鳞状细胞癌 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, H3K27ac ChIP-seq, ChIP-qPCR NA 基因表达数据, 表观遗传数据 来自TCGA和GEO数据库的样本 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 染色质免疫沉淀测序 NA NA
707 2026-01-08
Single-cell and spatial transcriptome profiling identifies the immunosuppressive spatial niche in KRAS-mutant colorectal cancer
2025-Dec-31, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了KRAS突变结直肠癌中肿瘤上皮细胞通过MDK_SDC4信号轴招募单核细胞,并与成纤维细胞分泌的胶原相互作用,共同形成免疫抑制空间微环境 首次结合单细胞和空间转录组学技术,系统解析了KRAS突变结直肠癌中免疫抑制空间微环境的形成机制,并识别了关键的细胞间通讯通路 研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平验证;样本量相对有限,可能影响结果的普适性;未进行体内功能实验验证靶点 探究KRAS突变结直肠癌的肿瘤微环境异质性,识别免疫抑制空间微环境的形成机制 KRAS突变结直肠癌患者的肿瘤组织 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学 Scanpy, Cell2location, CellChat, MISTy, stLearn 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 未明确说明样本数量 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
708 2026-01-08
Bridging the dimensional gap from planar spatial transcriptomics to 3D cell atlases
2025-Dec-31, Nature methods IF:36.1Q1
研究论文 本文介绍了一种名为SpatialZ的计算框架,用于从平面空间转录组学数据生成虚拟切片,以构建密集的3D细胞图谱 SpatialZ框架能够独立于特定空间技术的基因覆盖限制,在单细胞分辨率下生成虚拟切片,填补了实验测量切片之间的间隙,从而构建出密集的3D细胞图谱 未明确提及具体的技术限制或成本问题,但暗示了当前方法在构建3D图谱时存在技术限制和高成本挑战 旨在克服空间转录组学在构建3D细胞图谱时的技术限制,通过计算框架提升对组织架构的连续理解 空间转录组学数据和成像质谱数据,具体应用于大脑和人类乳腺癌组织 数字病理学 乳腺癌 空间转录组学,成像质谱 NA 空间转录组学数据,成像质谱数据 超过3800万个细胞(基于BRAIN Initiative Cell Census Network数据) NA 空间转录组学,成像质谱 NA NA
709 2026-01-08
Optic Atrophy 1-Mediated Mitochondrial Hyperfusion Orchestrates Yes-Associated Protein 1 Nuclear Translocation to Sustain Ameloblastoma Stemness
2025-Dec-30, The American journal of pathology
研究论文 本研究揭示了视神经萎缩蛋白1(OPA1)介导的线粒体过度融合通过调控YAP1核转位来维持成釉细胞瘤的干细胞特性 首次发现OPA1介导的线粒体过度融合是驱动成釉细胞瘤干细胞特性和进展的关键机制,并鉴定出OPA1抑制剂MYLS22的治疗潜力 研究主要基于体外细胞模型和患者来源类器官,需要进一步的体内实验验证 探究成釉细胞瘤干细胞特性的分子机制并寻找潜在治疗靶点 成釉细胞瘤组织、hTERT-AM细胞系、患者来源类器官 单细胞转录组学 成釉细胞瘤 单细胞转录组测序 NA 转录组数据 原发成釉细胞瘤标本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
710 2026-01-08
Endothelial-to-mesenchymal transition primes vascular endothelial cells toward an osteochondrogenic fate
2025-Dec-29, Vascular pharmacology IF:3.5Q2
研究论文 本文研究了内皮-间质转化(EndMT)如何使血管内皮细胞向成骨和软骨生成命运转变,从而在动脉粥样硬化中促进血管功能障碍和钙化 首次在体外和体内定义了EndMT衍生细胞向成骨和软骨生成命运转变的启动状态,揭示了EndMT通过生成成骨和软骨样细胞在动脉粥样硬化中的作用 研究主要基于HUVECs和鼠模型,可能不完全反映人体内复杂环境,且EndMT诱导条件为特定因子组合,存在局限性 探究EndMT在血管功能障碍中的作用,特别是EndMT衍生细胞的分化潜能和功能特性 人脐静脉内皮细胞(HUVECs)和动脉粥样硬化模型小鼠中的内皮谱系追踪细胞 细胞生物学 动脉粥样硬化 流式细胞术、单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
711 2026-01-08
Chronic alcohol consumption drives inflammaging and transposon derepression in hematopoietic stem and progenitor cells
2025-Dec-26, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA-seq和ATAC-seq技术,探讨了慢性酒精摄入如何驱动造血干细胞和祖细胞(HSPCs)的炎症衰老和转座子去抑制 揭示了慢性酒精暴露在人类和小鼠HSPCs中诱导年龄依赖性的炎症反应、DNA损伤和转座子表观遗传再激活,并识别出两个表观基因组不同的LT-HSC亚群 研究主要基于动物模型和异种移植实验,人类样本的直接验证有限,且未探讨酒精戒断后功能恢复的具体分子机制 探究慢性酒精摄入对造血干细胞和祖细胞(HSPCs)的影响,特别是炎症反应和表观遗传调控 人类和小鼠的造血干细胞和祖细胞(HSPCs),包括长期造血干细胞(LT-HSCs) 单细胞组学 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据 人类和小鼠HSPCs样本,具体数量未明确 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
712 2026-01-08
Integration analysis of single-cell and spatial transcriptomics identifies prognostic genes associated with neddylation in colorectal cancer
2025-Dec-24, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞和空间转录组学数据,识别与结直肠癌中neddylation相关的预后基因,并构建了一个三基因预后模型 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,系统分析neddylation相关基因在结直肠癌中的预后价值,并构建了包含PSMD12、PSMB2和FBXL5的新型三基因预后模型 研究依赖于公共数据集,缺乏独立的前瞻性队列验证;空间转录组样本量有限,可能影响结果的普适性 识别结直肠癌中与neddylation相关的预后基因,以改进治疗策略 结直肠癌患者样本,包括单细胞RNA测序、空间转录组和批量RNA测序数据 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序,空间转录组测序,批量RNA测序 回归分析,风险模型,列线图模型 转录组数据,单细胞数据,空间转录组数据 TCGA-CRC数据集(训练/内部验证,7:3分割),GSE28722(外部验证),GSE132257(scRNA-seq),GSE226997(ST) NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学,批量RNA-seq NA NA
713 2026-01-08
Identification and experimental validation of biomarkers for acute myeloid leukemia based on single-cell RNA sequencing data
2025-Dec-23, Molecular and cellular probes IF:2.3Q4
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、孟德尔随机化和基因调控网络分析,识别并实验验证了急性髓系白血病的生物标志物 结合单细胞RNA测序与孟德尔随机化方法识别AML生物标志物,并通过体外实验验证其功能 研究主要基于体外实验,缺乏体内或临床验证数据 识别和验证急性髓系白血病的可靠生物标志物 急性髓系白血病相关细胞和基因 数字病理学 白血病 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 基因调控网络分析, GSEA富集分析, 细胞转染, 细胞增殖实验, 流式细胞术 NA 单细胞RNA测序数据 22,742个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
714 2026-01-08
PTEN deficiency linked to chromosome 10q loss leads to aggressive NF2 mutant meningioma biology
2025-Dec-22, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过分析人类脑膜瘤的RNA测序数据,并结合小鼠模型,揭示了PTEN缺失与YAP1激活共同驱动侵袭性NF2突变脑膜瘤的生物学机制 首次在免疫活性小鼠模型中证实PTEN缺失会显著加速YAP1驱动的肿瘤发生,并通过跨物种整合验证了该模型能准确复现侵袭性NF2突变脑膜瘤的转录程序 NA 表征侵袭性NF2突变脑膜瘤的生物学特征并探究其驱动机制 人类脑膜瘤组织样本及基因工程小鼠模型 数字病理学 脑膜瘤 RNA测序 基因工程小鼠模型 RNA测序数据 NA NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
715 2026-01-08
A Multi-omic Atlas of Human Choroid Plexus in Alzheimer's Disease
2025-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过整合单核RNA测序、空间转录组学、单核ATAC测序和蛋白质组学数据,构建了阿尔茨海默病患者脉络丛的多组学图谱,揭示了其在疾病中的细胞状态转变和功能障碍 首次构建了阿尔茨海默病脉络丛的多组学综合图谱,识别了17种细胞状态和三大表型轴,并发现了疾病相关的多细胞信号枢纽 样本来源仅限于ROSMAP队列,且未明确探讨这些发现与临床症状进展的直接因果关系 阐明脉络丛在阿尔茨海默病病理生理学中的作用和功能障碍机制 来自69名ROSMAP参与者的脉络丛组织样本,涵盖正常认知、轻度认知障碍和阿尔茨海默病痴呆 数字病理学 阿尔茨海默病 单核RNA测序, 空间转录组学, 单核ATAC测序, 蛋白质组学 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 表观基因组数据, 蛋白质组数据 69名ROSMAP参与者的脉络丛样本 NA 单核RNA-seq, 空间转录组学, 单核ATAC-seq, 蛋白质组学 NA NA
716 2026-01-08
Exosomal heterogeneity and functional zonation in cancer drug resistance
2025-Dec-17, Drug discovery today IF:6.5Q1
综述 本文综述了肿瘤微环境中外泌体异质性及其在功能分区中的作用,特别是在癌症耐药性中的机制 探讨了肿瘤功能分区(如缺氧、血管周围区域)中外泌体亚型的特异性分子货物及其在耐药性中的空间通信网络,并介绍了新兴技术如单细胞测序和空间生物学平台的应用 NA 阐明外泌体异质性在肿瘤功能分区中的角色及其对癌症耐药性的影响 肿瘤微环境中的外泌体及其分子货物(核酸、蛋白质、脂质、代谢物) 空间生物学 癌症 单细胞测序、微芯片3D肿瘤培养、先进光谱方法、空间生物学平台 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学 NA NA
717 2026-01-08
Formononetin suppresses osteosarcoma by targeting MYO1B and remodeling the tumor immune microenvironment
2025-Dec, APL bioengineering IF:6.6Q1
研究论文 本研究通过患者来源异种移植模型和单细胞多组学测序,揭示了芒柄花素通过靶向MYO1B和重塑肿瘤免疫微环境来抑制骨肉瘤的分子机制 首次在单细胞水平上全面解析了芒柄花素抗骨肉瘤的作用机制,并鉴定出MYO1B为其关键作用靶点 研究主要基于PDX模型和体外实验,缺乏大规模临床样本验证 探索低毒性抗骨肉瘤新疗法的作用机制 骨肉瘤细胞及肿瘤微环境中的免疫细胞 单细胞多组学 骨肉瘤 单细胞多组学测序 PDX模型 单细胞转录组数据 未明确说明 NA 单细胞多组学测序 NA NA
718 2026-01-08
Single-cell transcriptome analysis elucidates the microenvironmental interactions between colorectal cancer and sarcopenia
2025-Nov-28, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组数据,揭示了结直肠癌与肌肉减少症之间共享细胞类型的跨组织功能异质性及其微环境相互作用机制 首次结合CRC肿瘤组织和SP肌肉组织的单细胞转录组数据,系统解析跨组织微环境异质性,识别共享核心细胞类型及其功能分化,并发现潜在的全域调控因子 样本量相对有限(16个CRC组织和17个SP组织),且主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平验证 阐明结直肠癌与肌肉减少症之间的微环境相互作用机制及其对预后的影响 结直肠癌肿瘤组织和肌肉减少症肌肉组织 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单核RNA测序(snRNA-seq) Harmony(批次效应校正)、CellChat(细胞通讯建模) 单细胞转录组数据 16个CRC肿瘤组织和17个SP肌肉组织 NA 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq NA NA
719 2026-01-08
Identification of ferroptosis-related therapeutic targets and causal risk factors in aortic dissection via multi-omics integration
2025-Nov-28, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 本研究通过多组学整合分析,识别了主动脉夹层中与铁死亡相关的关键基因、调控网络及潜在的因果风险因素 首次结合单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析,系统探索了铁死亡相关基因在主动脉夹层中的细胞特异性表达模式,并揭示了肠道微生物和血清代谢物与疾病的潜在因果关系 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏实验验证;孟德尔随机化分析结果可能受混杂因素影响 阐明铁死亡在主动脉夹层发病机制中的作用,并寻找潜在的治疗靶点 主动脉夹层患者与对照组的基因表达数据、单细胞转录组数据、肠道微生物组和血清代谢组数据 生物信息学与多组学整合分析 心血管疾病 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究, 孟德尔随机化 LASSO回归, 受试者工作特征分析 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 基因组关联数据, 微生物组数据, 代谢组数据 基于公共数据库(GEO)的样本,具体数量未明确说明;涉及211种肠道微生物分类群和1400种血清代谢物的GWAS汇总数据 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
720 2026-01-08
The Dynamic UPR Rheostat Orchestrates Single-Cell Plasticity in Glioblastoma
2025-Nov-27, Journal of molecular neuroscience : MN IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过重新分析公开的单细胞RNA测序数据,揭示了胶质母细胞瘤中未折叠蛋白反应三臂(IRE1/XBP1、ATF6、PERK)作为一个分级调控系统在单细胞分辨率上的动态协调机制 引入了臂特异性指标(如Rheostat Index和平衡度)来量化UPR各臂的活动及其协调性,并首次在单细胞水平上描绘了UPR三臂沿谱系轨迹的动态优势切换模式 转录组分析仅能推断臂特异性协调,功能验证需要扰动研究和蛋白质水平读数 探究胶质母细胞瘤中未折叠蛋白反应三臂是否作为单细胞分辨率的分级控制系统运作 胶质母细胞瘤细胞 单细胞组学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 发现队列871个细胞,验证队列11,877个细胞 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium, SMART-seq 10x Chromium单细胞基因表达解决方案,SMART-seq全长单细胞RNA测序技术
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