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当前共找到 10542 篇文献,本页显示第 701 - 720 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
701 2026-05-09
A multimodal atlas of COVID-19 severity identifies hallmarks of dysregulated immunity
2025-Sep-21, medRxiv : the preprint server for health sciences
research paper 利用多模式单细胞图谱研究COVID-19严重程度的免疫失调特征 首次在单细胞分辨率下整合多数据类型(单细胞RNA-seq、CITE-seq、TCR和BCR测序、病毒载量、中和试验、75种自身抗体、HLA基因型和1463种血清蛋白组学)并纳入托珠单抗治疗和康复期样本,提供对COVID-19严重程度免疫特征的最全面视图 未明确说明局限性(文中未提及) 研究COVID-19严重程度相关的免疫失调标志物,包括托珠单抗治疗和康复期的影响 428名患者的2.5百万循环免疫细胞(840份PBMC样本),涵盖急性感染(5个WHO严重度等级)、托珠单抗治疗和康复期(感染后3个月) machine learning COVID-19 单细胞RNA-seq, CITE-seq, TCR测序, BCR测序, 血清蛋白质组学 线性建模 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据, 病毒载量数据, 自身抗体数据, HLA基因型数据 428名患者,840份PBMC样本(2.5百万细胞) NA 单细胞RNA-seq, CITE-seq NA NA
702 2026-05-09
Selective Depletion of CCR8+Treg Cells Enhances the Antitumor Immunity of Cytotoxic T Cells in Lung Cancer by Dendritic Cells
2025-08, Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer IF:21.0Q1
研究论文 该研究探讨了在非小细胞肺癌中通过选择性清除CCR8+调节性T细胞增强细胞毒性T细胞的抗肿瘤免疫作用 首次揭示抗CCR8疗法与PD1抑制剂联用通过破坏CCR8+Treg-CCL5+树突状细胞相互作用重塑肿瘤微环境,并明确JAK-STAT通路激活诱导IL-12分泌增强CD8+ T细胞杀伤活性的分子机制 研究主要基于小鼠模型,临床样本量有限且仅观察了晚期非小细胞肺癌患者联合治疗潜力,尚未开展大规模随机临床试验验证安全性与有效性 评估抗CCR8单药及联合PD1抑制剂在非小细胞肺癌中的治疗效果及分子机制 非小细胞肺癌小鼠模型及晚期患者 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序、单细胞T细胞受体测序、流式细胞术、多色免疫荧光、Luminex检测 NA 基因表达数据、免疫表型数据 四种非小细胞肺癌小鼠模型及部分晚期非小细胞肺癌患者 NA 单细胞RNA测序、单细胞T细胞受体测序 NA NA
703 2025-10-06
Single-cell RNA sequencing indicates AP-1 as a potential therapeutic target for autoimmune uveitis
2025-07, Biochemical pharmacology IF:5.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析自身免疫性葡萄膜炎小鼠模型,发现AP-1是疾病关键分子并验证其作为治疗靶点的潜力 首次通过单细胞RNA测序揭示AP-1在自身免疫性葡萄膜炎发病机制中的关键作用,并发现其通过GM-CSF/IL-23反馈环路支持Th17细胞致病性 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类患者中验证 探索自身免疫性葡萄膜炎的发病机制并寻找新的治疗靶点 实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠的脾脏和颈引流淋巴结细胞 单细胞组学 自身免疫性葡萄膜炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 正常和EAU小鼠的脾脏及颈引流淋巴结 NA 单细胞RNA测序 NA NA
704 2026-05-09
Female-biased vascular smooth muscle cell gene regulatory networks predict MYH9 as a key regulator of fibrous plaque phenotype
2025-Apr-02, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 利用性别特异性基因调控网络揭示了MYH9作为女性斑块中调节纤维斑块表型的关键因子 首次通过性别特异性基因调控网络分析,发现MYH9在女性血管平滑肌细胞中调控纤维斑块形成 研究样本量有限(119名男性和32名女性),可能影响结果的普遍性 探究动脉粥样硬化中纤维斑块的性别差异分子机制 来自心脏移植供体的血管平滑肌细胞和颈动脉斑块 机器学 心血管疾病 RNA-seq, 单细胞RNA测序 贝叶斯网络 基因表达数据, 单细胞转录组数据 151名心脏移植供体(119名男性和32名女性)的血管平滑肌细胞样本 Illumina bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq Illumina NovaSeq NA
705 2025-10-07
A Unique Signature for Cancer-Associated Fibroblasts in Melanoma Metastases
2025-03, Pigment cell & melanoma research IF:3.9Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析黑色素瘤原发灶和肺转移灶中的癌症相关成纤维细胞,揭示了转移灶特异性CAF的独特特征 首次系统比较黑色素瘤原发灶和转移灶中CAF的转录特征,发现转移灶特异性CAF亚群及其与中性粒细胞的肿瘤依赖性串扰机制 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 探索黑色素瘤转移过程中癌症相关成纤维细胞的异质性和功能特征 小鼠黑色素瘤原发灶和肺转移灶中的癌症相关成纤维细胞,以及人类黑色素瘤转移样本 单细胞生物学 黑色素瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 约8400个CAF和正常成纤维细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
706 2026-05-08
Non-parasite genome encoded virus-like RNAs reprogram the pathogenicity of human blood flukes
2025-Dec-26, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 发现非寄生虫基因组编码的病毒样RNA调控日本血吸虫的致病性 首次发现非寄生虫基因组编码的病毒样RNA(ngRNAs)在血吸虫中存在并通过编码RNA依赖的RNA聚合酶影响胚胎活力和卵子生成,揭示了ngRNAs在寄生虫生物学中的调控机制 未详细说明ngRNAs在其他物种中的保守性及长期感染条件下的动态变化 探究非寄生虫基因组编码的病毒样RNA在血吸虫致病性中的作用及其潜在治疗靶点 日本血吸虫(Schistosoma japonicum)和涡虫(Dugesia japonica) 数字病理学 血吸虫病 宏转录组学(metatranscriptomics),单细胞RNA测序(scRNA-seq),RNA干扰 NA 转录组数据 未明确说明样本数量 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
707 2026-05-08
Oral immunotherapy directs systemic transcriptomic changes in children with hen's egg allergy
2025-Dec, Asian Pacific journal of allergy and immunology IF:2.3Q3
研究论文 一项关于口服免疫疗法如何影响鸡蛋过敏儿童全身转录组变化的研究 首次通过单细胞RNA测序揭示鸡蛋口服免疫疗法诱导的系统性免疫细胞转录组改变,发现CD8+ T细胞耗竭状态和IKZF2高表达的调节性T细胞增加 样本量较小(仅8名完成治疗的患者),且未涉及长期随访或机制验证实验 探究鸡蛋过敏儿童口服免疫疗法相关的全身免疫表型和转录组变化 3至12岁确诊鸡蛋过敏的儿童(中位年龄4.5岁) 分子免疫学 食物过敏(鸡蛋过敏) 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据(转录组) 16名鸡蛋过敏儿童,其中8名完成治疗阶段(血液样本) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台,用于外周血单个核细胞的转录组分析
708 2026-05-08
Integrative multiomics elucidate crotonylation-associated GCDH in Parkinson's disease pathogenesis via metabolome remodeling
2025-12, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society IF:2.7Q2
研究论文 通过整合多组学分析,揭示了巴豆酰化相关基因GCDH通过代谢组重塑在帕金森病发病机制中的作用 利用孟德尔随机化结合中介分析首次建立巴豆酰化相关基因与帕金森病之间的因果关系,并系统解析代谢物介导的机制,同时整合单细胞转录组数据揭示GCDH在星形胶质细胞中的特异性表达和调控模式 未明确说明,但可能包括孟德尔随机化分析的固有局限性(如工具变量假设)以及单细胞数据来自公共数据库的样本异质性 阐明巴豆酰化及其代谢调控网络在帕金森病病理生理中的重要性 巴豆酰化相关基因(如SIRT1、GCDH、HDAC7)及其代谢物和帕金森病风险 机器学习 帕金森病 孟德尔随机化、单细胞转录组测序 NA 基因表达数据、代谢组数据、单细胞转录组数据 涉及eQTLGen数据集和GEO单细胞转录组数据,具体样本量未明确 NA 单细胞RNA测序 NA NA
709 2026-05-08
Impaired immune metabolism in COPD driven by dysfunction of CXCL16 + alveolar macrophages: multivariate causal evidence
2025-12, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society IF:2.7Q2
研究论文 本研究通过多组学方法揭示CXCL16+肺泡巨噬细胞功能障碍驱动慢性阻塞性肺疾病(COPD)的免疫代谢紊乱,并提供多变量因果证据 首次通过整合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析,鉴定CXCL16作为COPD的新因果机制,并揭示其通过影响免疫-代谢稳态驱动疾病进展 未提供具体局限性信息 识别COPD中由肺泡巨噬细胞功能障碍驱动的关键分子机制及其因果关系 COPD患者和对照组的肺泡巨噬细胞及其特异性基因CXCL16 单细胞组学、免疫学 慢性阻塞性肺疾病 单细胞RNA测序、孟德尔随机化分析、批量RNA测序 NA 基因表达数据(单细胞和批量RNA-seq) 人类肺组织样本及1283个肺泡巨噬细胞特异性基因的遗传变异数据 NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
710 2026-05-08
Multi-omics dissection of RAD21-PON1 axis reveals metabolic-immune crosstalk and prognostic significance in hepatocellular carcinoma
2025-12, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society IF:2.7Q2
研究论文 通过多组学整合分析揭示RAD21-PON1轴在肝细胞癌中的代谢-免疫串扰及预后意义 首次阐明RAD21作为黏连蛋白亚基通过调控PON1基因表达影响代谢重塑与免疫微环境,构建了RAD21-PON1风险特征用于预后分层 基于公开数据集的分析,缺乏独立临床队列验证;RAD21-PON1轴的直接调控机制需进一步实验验证 探究RAD21-PON1轴在肝细胞癌中整合代谢与免疫信号的机制及其预后价值 肝细胞癌患者的转录组、ChIP-seq和单细胞RNA-seq数据集 机器学习 肝癌 RNA-seq, ChIP-seq, 单细胞RNA-seq LASSO 转录组数据, 染色质免疫沉淀测序数据, 单细胞转录组数据 基于公开数据库的多组学数据集,具体样本量未在摘要中说明 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
711 2026-05-08
CRATER tumor niches facilitate CD8+ T cell engagement and correspond with immunotherapy success
2025-Nov-26, Cell IF:45.5Q1
研究论文 利用斑马鱼内源性黑色素瘤和人类黑色素瘤样本,通过长期体内成像和高分辨率空间转录组学鉴定出肿瘤微环境中促进免疫治疗响应的CRATER肿瘤生态位 首次发现并定义CRATER(抗原呈递和T细胞结合滞留区)作为肿瘤基质与黑色素细胞边界处的口袋结构,该区域富含抗原识别分子并具有最高密度CD8 T细胞,在免疫检查点阻断治疗后扩张并与临床响应相关 未明确说明研究限制 鉴定在免疫治疗期间促进免疫应答的肿瘤微环境域 斑马鱼内源性黑色素瘤和人类黑色素瘤样本 数字病理学 黑色素瘤 空间转录组学、体内成像 NA 图像、转录组数据 斑马鱼肿瘤样本和人类黑色素瘤活检样本(具体数量未在摘要中说明) NA 空间转录组学 NA NA
712 2026-05-08
HMGA2 links morphological evolution and microenvironment dynamics to systemic therapy response in clear cell renal cell carcinoma
2025-Nov-24, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究探讨了HMGA2在透明细胞肾细胞癌中连接形态演变与肿瘤微环境动态,并影响系统治疗反应的作用 首次揭示HMGA2在ccRCC中通过促进形态演化和调节免疫微环境(特别是Tpex与cDC1的ICAM-1依赖性互作)来影响免疫检查点抑制剂联合疗法的反应 结论需要额外的实验研究来验证这些机制 研究HMGA2在ccRCC形态演变、肿瘤微环境动态及系统治疗反应中的作用及其临床影响 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者的肿瘤样本,包括原发性和转移性队列 数字病理学 肾癌 空间转录组学, 免疫组化, 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 多重免疫组化 NA 图像, 文本, 转录组数据 原发性ccRCC样本(ST样本)、转移性ccRCC队列(IHC及RNA-seq数据)以及scRNA-seq和mIHC数据集 10x Genomics, Illumina 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 10x Visium, NovaSeq 10x Visium空间转录组学平台、Illumina NovaSeq平台用于批量RNA测序和单细胞RNA测序
713 2026-05-08
Semi-parametric Empirical Bayes Method for Multiplet Detection in snATAC-seq with Probabilistic Multi-omic Integration
2025-Oct-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出一种半参数经验贝叶斯方法SEBULA,用于snATAC-seq数据中的多细胞检测,并支持概率性多组学整合 首次将半参数经验贝叶斯模型应用于snATAC-seq多细胞检测,实现良好校准的后验概率并支持多模态证据整合 未提及具体局限性,但可能受限于snATAC-seq数据的稀疏性和过度离散性 开发一种高效的多细胞检测方法以控制错误发现率 snATAC-seq和trimodal DOGMA-seq数据集 机器学习 NA snATAC-seq, scRNA-seq 半参数经验贝叶斯模型 染色质可及性数据、单细胞多组学数据 七个标注的三模态DOGMA-seq数据集及模拟数据 NA 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
714 2026-05-08
Cardiomyocyte-specific plakophilin-2 loss is sufficient to induce aging and senescence of nonmyocytes. Relevance to arrhythmogenic cardiomyopathy
2025-Oct-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 心肌细胞特异性PKP2缺失足以诱导非心肌细胞的衰老和早衰,与致心律失常性心肌病相关 首次证明心肌细胞特异性PKP2缺失足以诱导非心肌细胞中的促炎性衰老和整体心脏早衰,揭示了细胞衰老与桥粒致心律失常性心肌病的关联 研究基于小鼠模型,结果需在人类中验证;未在心肌细胞中发现典型衰老标志物,但观察到早衰相关结构特征 探讨心肌细胞特异性PKP2缺失是否足以诱导心脏非心肌细胞(驻留细胞)的过早衰老和促炎性衰老 心肌细胞特异性、他莫昔芬激活的PKP2缺失小鼠(PKP2cKO模型) 数字病理学 致心律失常性右心室心肌病 空间转录组学、多重成像、细胞因子阵列、表观遗传时钟、扩展显微镜、结构照明显微镜 NA 图像、转录组、蛋白质组 PKP2cKO小鼠模型,具体数量未在摘要中说明 NA 空间转录组学 NA NA
715 2026-05-08
Limited nasal IFN production contributes to delayed respiratory virus clearance and suboptimal vaccine responses
2025-Oct-22, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 利用小鼠模型和单细胞RNA测序,发现鼻腔干扰素产生不足导致呼吸道病毒清除延迟和疫苗反应不佳 首次揭示人偏肺病毒感染中鼻腔局部干扰素反应的抑制机制,并通过鼻腔施用干扰素改善疫苗反应 主要基于小鼠模型,人类数据仅来自COVID-19患者,其他呼吸道病毒验证不足 探究鼻腔干扰素反应在呼吸道病毒感染和疫苗免疫中的作用 人偏肺病毒感染的小鼠模型和COVID-19患者 机器学习 呼吸道感染 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 人偏肺病毒感染小鼠和COVID-19患者样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
716 2026-05-08
Deciphering context-specific gene programs from single-cell and spatial transcriptomics data with DeCEP
2025-10-01, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 提出名为DeCEP的计算框架,利用单细胞RNA测序和空间转录组学数据解码特定上下文基因程序 DeCEP通过整合功能基因列表和有向图,构建特定细胞或空间上下文下的功能网络,并基于网络拓扑识别依赖上下文的枢纽基因,实现对基因程序的细粒度表征,尤其擅长处理转录异质性显著的数据 文中未明确指出局限性,但可能依赖于功能基因列表的完整性和准确性,以及对有向图构建的要求 开发一种能够利用单细胞和空间转录组学数据表征上下文特异性基因程序的计算方法 模拟生物数据集以及真实生物数据集,包括正常肝组织、阿尔茨海默病和癌症样本 计算生物学 阿尔茨海默病,癌症 单细胞RNA测序,空间转录组学 基于网络拓扑的计算框架 单细胞转录组数据,空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
717 2026-05-08
Multicondition and multimodal temporal profile inference during mouse embryonic development
2025-10-01, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 提出Sunbear框架,整合小鼠胚胎发育过程中多条件、多模态单细胞时间序列数据 首次提出能同时处理多条件(如性别、批次、疾病)和多模态(scRNA-seq、scATAC-seq)单细胞时间序列数据的联合建模框架Sunbear 未明确提及局限性,但可能受限于单细胞数据本身的破坏性测量和跨时间点匹配的困难 开发整合多条件多模态单细胞时间序列数据的联合建模框架 小鼠胚胎发育过程中的单细胞 机器学习 NA scRNA-seq, scATAC-seq Sunbear联合建模框架 单细胞时间序列数据 小鼠胚胎发育过程中的单细胞样本 NA 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 NA NA
718 2026-05-08
Clonal dynamics shaped by diverse drug-tolerant persister states in melanoma resistance
2025-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 开发了高分辨率谱系追踪平台MeRLin,揭示黑色素瘤治疗耐药过程中多种药物耐受持久性细胞的克隆动态和转录异质性 整合细胞条形码、单细胞转录组、RNA荧光原位杂交和计算分析的多模态平台,首次在患者来源黑色素瘤模型中追踪持久性细胞的克隆动态和空间组织,发现四种保守的持久性细胞状态 主要基于患者来源模型,需在临床样本中进一步验证;长期治疗过程中耐药机制的完整图景可能仍有限 解析黑色素瘤靶向治疗耐药过程中药物耐受持久性细胞的克隆动态和分子机制 患者来源的黑色素瘤模型中的耐药持久性细胞 数字病理学 黑色素瘤 单细胞转录组测序、RNA荧光原位杂交 NA 转录组数据、图像 患者来源黑色素瘤模型(具体数量未在摘要中明确) 10x Genomics 单细胞RNA测序、空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'测序、10x Visium空间转录组学、条形码RNA-FISH
719 2026-05-08
High-resolution spatial transcriptomics in fixed tissue using a cost-effective PCL-seq workflow
2025-09-02, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 提出一种利用光控DNA标记策略的空间转录组学方法PCL-seq,用于固定组织中的高分辨率空间转录组分析 首次开发基于光裂解和连接测序的空间索引方法,通过光控DNA标记实现特定区域的转录谱构建,具备亚细胞分辨率且兼容FFPE组织 NA 开发一种经济高效的空间转录组学工作流程,适用于固定组织且具有高分辨率 冷冻小鼠胚胎和FFPE小鼠胚胎组织切片 数字病理学 NA 空间转录组学 NA 基因表达数据 小鼠胚胎组织切片(冷冻和FFPE) NA 空间转录组学 PCL-seq 光裂解和连接测序工作流程,使用光可裂解寡核苷酸和连接适配体,通过显微控制光照指定感兴趣区域
720 2026-05-08
Comprehensive identification of crucial biomarkers and therapeutic targets in cholestasis via integrated single-cell RNA and transcriptome sequencing analysis
2025-09, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society IF:2.7Q2
研究论文 通过整合单细胞RNA测序和转录组测序分析,全面鉴定胆汁淤积症的关键生物标志物和治疗靶点 首次利用单细胞RNA测序结合转录组分析,全面鉴定出IL32、CRIP2、ANXA2和VWF作为胆汁淤积症的关键生物标志物和治疗靶点,并揭示了其在肝窦内皮细胞和门静脉周围区域的显著上调 未明确提及局限性 探究胆汁淤积症的细胞通讯网络和分子机制,识别关键的生物标志物和治疗靶点 胆汁淤积症患者和健康对照者的肝脏组织样本 机器学习 肝脏疾病 单细胞RNA测序、转录组测序 Lasso回归 测序数据 13名胆汁淤积性肝病患者和10名对照者的肝脏组织 NA 单细胞RNA测序、转录组测序 NA NA
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