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当前共找到 10572 篇文献，本页显示第 7161 - 7180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7161 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis of peripheral blood and pleural effusion reveals functional diversity of γδ T cells in tuberculosis infection
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1605827
PMID:40607390
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研究论文 | 通过单细胞测序分析结核病患者外周血和胸腔积液中γδ T细胞的功能多样性 | 首次在结核病患者中系统鉴定出7个γδ T细胞亚群，并发现效应性γδ2细胞在PBMC中占比最高(36.1%)，组织驻留γδ2细胞在PFMC中占比最高(70.5%) | NA | 探索γδ T细胞在结核病免疫应答中的具体作用和亚群分化机制 | 结核病患者的外周血单个核细胞(PBMC)和结核性胸腔积液(TPE) | 免疫学 | 结核病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7162 | 2025-10-06 |
Decoding neuroinflammation in Alzheimer's disease: a multi-omics and AI-driven perspective for precision medicine
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1616899
PMID:40607399
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综述 | 本文探讨了利用多组学和人工智能方法解析阿尔茨海默病神经炎症机制的前景 | 整合单细胞RNA测序与AI分析及多组学平台，突破传统组织分析信号平均化的限制 | NA | 解码阿尔茨海默病复杂的免疫炎症网络，实现疾病亚型精准分类和早期诊断 | 阿尔茨海默病患者脑组织细胞 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 多组学分析 | AI驱动分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7163 | 2025-10-06 |
Landscape analysis of matrix metalloproteinases reveals key prognostic markers for prostate cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1582992
PMID:40607407
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研究论文 | 本研究通过综合分析基质金属蛋白酶在前列腺癌中的作用，发现MMP11是关键预后标志物并通过重塑肿瘤微环境促进癌症进展 | 首次系统评估24种MMP在前列腺癌中的表达特征和预后价值，并证实MMP11通过调控肿瘤微环境促进前列腺癌进展的新机制 | 研究主要基于公共数据库分析，需要更多实验验证MMP11的具体作用机制 | 探索基质金属蛋白酶在前列腺癌中的全面作用及其临床意义 | 前列腺癌组织和细胞 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组测序,空间转录组测序,细胞功能实验 | COX回归分析 | 基因表达数据,单细胞数据,空间转录组数据 | 来自UCSC和GEO数据库的前列腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 7164 | 2025-10-06 |
The functional and clinical significance of nucleoporin NUP153 across human cancers: a systematic study based on multi-omics analysis and bench work validation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1613688
PMID:40607419
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研究论文 | 通过多组学分析和实验验证系统研究核孔蛋白NUP153在人类癌症中的功能和临床意义 | 首次系统研究NUP153在多种癌症中的表达模式、突变特征、诊断价值及其与肿瘤免疫微环境的关系 | 需要进一步研究阐明NUP153在癌症中的具体分子机制并探索其临床适用性 | 探索核孔蛋白NUP153在人类癌症中的功能和临床意义 | 人类多种癌症类型，重点关注胃癌 | 生物信息学 | 多种癌症（胆管癌、结直肠癌、头颈鳞状细胞癌、胃癌等） | 多组学分析、免疫组织化学、RT-qPCR、单细胞分析、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、药物敏感性数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 来自TCGA、GTEx等公共数据库的多种癌症样本，以及胃癌组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7165 | 2025-10-06 |
Identification and validation of a KRAS-macrophage-associated gene signature as prognostic biomarkers and potential therapeutic targets in melanoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1566432
PMID:40607411
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研究论文 | 本研究通过多平台数据分析识别并验证了KRAS-巨噬细胞相关基因特征作为黑色素瘤预后生物标志物和潜在治疗靶点 | 首次构建了KRAS-巨噬细胞预后相关基因(KMPAG)特征，整合了单细胞RNA测序和临床数据分析，重新分类巨噬细胞亚群 | 研究主要基于公共数据库数据，需要更多实验验证和临床队列验证 | 探索KRAS信号通路在黑色素瘤肿瘤微环境中对巨噬细胞浸润的影响及其预后价值 | 皮肤 cutaneous 黑色素瘤(SKCM)患者和黑色素瘤细胞系 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 基因集富集分析, LASSO回归, 免疫组织化学, 功能实验 | LASSO回归模型, Monocle2算法, CellChat工具 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据, 临床数据 | 来自GEO和TCGA数据库的黑色素瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7166 | 2025-10-06 |
Enhancing genetic transformation efficiency in cucurbit crops through AtGRF5 overexpression: Mechanistic insights and applications
2025-Jul, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13912
PMID:40213927
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研究论文 | 通过过表达AtGRF5基因显著提高葫芦科作物的遗传转化效率，并阐明其分子机制 | 发现AtGRF5通过促进愈伤组织增殖和增加致密细胞来增强遗传转化效率，开发了ABA诱导型AtGRF5表达系统以减轻多效性影响 | NA | 提高葫芦科作物的遗传转化和基因编辑效率 | 葫芦科作物（黄瓜等） | 植物生物技术 | NA | 单细胞RNA测序, DAP-seq, 时间序列转录组学 | NA | 基因表达数据, 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7167 | 2025-10-06 |
Distinct transcriptional changes in hematopoietic progenitor subsets on LPS-induced emergency granulopoiesis
2025-Jul, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2025.104792
PMID:40316244
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了LPS诱导的应急粒细胞生成过程中不同造血祖细胞亚群的转录变化 | 首次在单细胞水平揭示非谱系定型多能祖细胞在炎症刺激下向髓系和红系祖细胞重编程的动态过程 | 研究仅使用小鼠模型，未在人类样本中验证 | 探究不同多能祖细胞亚群在LPS诱导的应急粒细胞生成中的作用 | 野生型小鼠的多能祖细胞(MPPs) | 单细胞生物学 | 感染性疾病 | 单细胞RNA测序, 移植实验, 假时序分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 对照组和LPS处理组小鼠的MPPs | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7168 | 2025-10-06 |
Differentiable graph clustering with structural grouping for single-cell RNA-seq data
2025-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf347
PMID:40511990
|
研究论文 | 提出一种用于单细胞RNA测序数据的可微分图聚类方法，通过结构分组整合图聚类信息 | 设计了可微分聚类机制将离散的K路归一化割转化为可微分学习目标，通过谱松弛实现图聚类信息的整合 | 未在抽象中明确说明研究局限性 | 改进单细胞RNA测序数据的细胞聚类分析 | 单细胞RNA测序数据中的细胞亚群 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图神经网络, 自编码器, 图注意力自编码器 | 单细胞RNA测序数据 | 14个单细胞RNA测序基准数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7169 | 2025-10-06 |
Innovative Single-Cell Sequencing Techniques for B-Cell Analysis and Their Implications for Rational HIV-1 Vaccine Design
2025-Jul-01, Current HIV research
IF:0.8Q4
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在B细胞分析中的最新进展及其对HIV-1疫苗设计的启示 | 通过单细胞技术实现B细胞免疫库、基因表达和表型的多维度分析，为疫苗设计提供新视角 | NA | 探讨单细胞测序技术在传染病和疫苗接种背景下B细胞反应分析的应用 | B细胞及其在免疫反应中的动态变化 | 单细胞分析 | HIV-1感染 | 单细胞测序 | NA | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7170 | 2025-10-06 |
Diversity of mast cell subpopulations in the tumor microenvironment of colorectal cancer and their prognostic implications
2025-Jun-30, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04119-8
PMID:40586903
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析结直肠癌肿瘤微环境中肥大细胞亚群的异质性及其预后意义 | 首次在结直肠癌中鉴定出三个功能各异的肥大细胞亚群，并发现它们分别具有促肿瘤和抗肿瘤的不同功能特征 | 样本量相对有限，需要更大规模的研究验证 | 探索结直肠癌肿瘤微环境中肥大细胞亚群的异质性及其与预后的关系 | 结直肠癌肿瘤微环境中的肥大细胞 | 单细胞生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，生物信息学分析 | 非负矩阵分解 | 基因表达数据 | 40例结直肠癌肿瘤样本的单细胞数据，整合HMU、GEO和TCGA队列的bulk RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 7171 | 2025-10-06 |
The progress and trends of the mechanism of cardiopulmonary bypass-associated acute lung injury: A narrative review
2025-Jun-27, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000043019
PMID:40587734
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综述 | 本文综述了体外循环相关急性肺损伤机制的研究进展与趋势 | 提出未来应聚焦炎症关键靶点并探索基因编辑和单细胞测序等先进技术 | 多年未取得突破性进展，导致管理策略和临床措施停滞 | 揭示体外循环相关急性肺损伤的潜在机制并寻找有效防治策略 | 心脏直视手术患者 | 医学研究 | 心血管疾病 | 基因编辑, 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 7172 | 2025-10-06 |
Transcriptional landscape of pleural mesothelioma patients in relation to NF2 gene mutational status
2025-Jun-09, Journal of the Egyptian National Cancer Institute
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s43046-025-00284-0
PMID:40484892
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研究论文 | 本研究通过分析胸膜间皮瘤患者的转录组数据，探讨NF2基因突变状态对肿瘤生物学特征和免疫微环境的影响 | 首次系统揭示NF2突变在胸膜间皮瘤中通过改变免疫细胞浸润、细胞因子信号传导和化疗敏感性影响肿瘤微环境的机制 | 样本量相对有限（82例），且为回顾性分析，需要进一步实验验证 | 阐明NF2基因突变对胸膜间皮瘤肿瘤生物学行为和治疗反应的影响 | 82例胸膜间皮瘤患者肿瘤样本 | 癌症基因组学 | 胸膜间皮瘤 | RNA测序，单细胞RNA测序，生物信息学分析 | 逻辑回归模型，差异表达分析，功能富集分析 | 转录组数据，临床数据 | 82例胸膜间皮瘤病例 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | NA |
| 7173 | 2025-10-06 |
Elevated Fcy receptor expression augments pro-inflammatory macrophage phagocytosis in systemic sclerosis and associated rheumatic diseases
2025-Jun-01, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keae688
PMID:39672802
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和体外实验揭示了系统性硬化症及相关风湿性疾病中巨噬细胞通过高表达Fcγ受体增强吞噬活性和促炎反应的机制 | 首次在系统性硬化症中鉴定出FCGR3Ahi皮肤巨噬细胞和FCN1hi肺巨噬细胞的促吞噬表型，并证实FcγRI和FcγRII是驱动吞噬活性和IL-6炎症的关键因素 | 研究样本来源有限，主要依赖公共数据库和体外培养模型，缺乏在体功能验证 | 探究系统性硬化症及相关风湿性疾病中巨噬细胞的促吞噬表型及其分子机制 | 健康对照和系统性硬化症、类风湿关节炎、银屑病关节炎、中轴型脊柱关节炎患者的皮肤、肺组织巨噬细胞及单核源性巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 系统性硬化症及相关风湿性疾病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, Western blot, RT-qPCR | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据, 蛋白质印迹数据, 基因表达数据 | 使用公共数据集GSE138669/GSE212109，包含健康对照和SSc患者的皮肤和肺巨噬细胞；体外培养来自多种风湿病患者CD14+单核细胞分化的巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7174 | 2025-10-06 |
Cardiac Fibroblasts regulate myocardium and coronary vasculature development via the collagen signaling pathway
2025-May-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.11.612512
PMID:39314489
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和基因标记技术揭示了心脏成纤维细胞通过胶原信号通路调控心肌和冠状血管发育的机制 | 首次系统阐明了心脏成纤维细胞在发育过程中通过胶原信号通路调控心肌细胞和血管内皮细胞发育的分子机制 | 研究主要聚焦于发育阶段，对成年心脏中成纤维细胞功能的验证相对有限 | 探究心脏成纤维细胞在心脏发育过程中对心肌和血管系统的调控作用 | 小鼠心脏成纤维细胞、心肌细胞和血管内皮细胞 | 发育生物学 | 心脏发育缺陷 | 单细胞mRNA测序(scRNA-seq), RNA染色, Pdgfra-CreER控制的DTA消融系统 | NA | 单细胞转录组数据, 组织染色图像 | 不同发育阶段的小鼠心脏组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7175 | 2025-10-06 |
Pathological α-synuclein dysregulates epitranscriptomic writer METTL3 to drive neuroinflammation in microglia
2025-May-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115618
PMID:40279247
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研究论文 | 本研究揭示了病理α-突触核蛋白通过失调m6A甲基转移酶METTL3驱动小胶质细胞神经炎症的机制 | 首次发现METTL3在α-突触核蛋白和锰诱导的神经炎症中表达上调并发挥关键调控作用 | 未明确METTL3调控神经炎症的具体下游分子机制 | 探究m6A RNA修饰在神经退行性疾病中的作用机制 | 人源小胶质细胞、星形胶质细胞、阿尔茨海默病、帕金森病和路易体痴呆患者尸检组织 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序, 亚细胞定位研究, 功能分析 | NA | RNA测序数据, 蛋白质定位数据 | 人源细胞模型和神经退行性疾病患者尸检组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7176 | 2025-10-06 |
scTsI: an effective two-stage imputation method for single-cell RNA-seq data
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf298
PMID:40579791
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研究论文 | 提出一种用于单细胞RNA-seq数据的两阶段插补方法scTsI，有效处理丢失事件并提升下游分析性能 | 开发两阶段插补算法，第一阶段利用邻近细胞和基因信息插补零值，第二阶段通过脊回归和批量RNA-seq数据约束调整插补值，保持高表达值不变且避免引入新噪声 | 未明确说明方法在极稀疏数据或特定细胞类型中的性能限制 | 解决单细胞RNA-seq数据中丢失事件对下游分析的影响 | 单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 脊回归 | 基因表达矩阵 | 多种模拟和真实数据集 | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7177 | 2025-10-06 |
DeepExDC interprets genomic compartmentalization changes in single-cell Hi-C data
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf301
PMID:40581982
|
研究论文 | 提出DeepExDC方法用于单细胞Hi-C数据中A/B区室差异分析 | 开发首个可解释的一维卷积神经网络，用于单细胞水平全基因组范围的染色质区室变化分析，无需分布假设和差异模式限制 | 单细胞水平区室化变化计算分析领域尚处于起步阶段 | 分析不同条件下单细胞基因组区室化变化 | 单细胞Hi-C数据中的A/B染色质区室 | 计算生物学 | NA | 单细胞Hi-C，scRNA-seq，scATAC-seq | 1D CNN | Hi-C接触矩阵 | NA | NA | 单细胞Hi-C，单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 7178 | 2025-10-06 |
Computational modeling of single-cell dynamics data
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf305
PMID:40586321
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综述 | 本文综述了单细胞动态数据的计算建模方法，重点讨论了数据分析挑战和算法进展 | 系统梳理了单细胞动态数据分析的四大关键任务，并展望了生物技术与人工智能算法融合的前景 | 作为综述文章，未涉及具体实验验证和原始数据分析 | 探讨单细胞动态数据的计算分析方法及其在生命机制研究中的应用 | 单细胞动态测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞动态测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7179 | 2025-10-06 |
An order-preserving batch-effect correction method based on a monotonic deep learning framework
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf247
PMID:40586320
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研究论文 | 提出了一种基于单调深度学习框架的保序批次效应校正方法 | 在批次效应校正方法中首次引入保序特性，通过单调深度学习网络保持基因表达数据的原始顺序关系 | 未提及方法的具体计算复杂度或在大规模数据集上的性能表现 | 开发具有保序特性的单细胞RNA测序数据批次效应校正方法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 单调深度学习网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7180 | 2025-10-06 |
Sp140L Is a Novel Herpesvirus Restriction Factor
2025-Apr-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.13.628399
PMID:39713285
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现Sp140L是一种新型疱疹病毒限制因子 | 首次鉴定Sp140L为疱疹病毒限制因子，揭示了其连接病毒DNA感知与转录抑制的新机制 | 研究主要聚焦于EB病毒，对其他DNA病毒的验证仍需进一步扩展 | 探索疱疹病毒如何逃避宿主防御机制并鉴定新的病毒限制因子 | EB病毒感染的B细胞和疱疹病毒松鼠猴ORF3蛋白 | 分子生物学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | EBNA-LP敲除感染的B细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |