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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7161 | 2025-10-06 |
Tumor microenvironment heterogeneity and progression mechanisms in intrahepatic cholangiocarcinoma: A study based on single-cell and spatial transcriptomic sequencing
2025-Jun-09, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001423
PMID:40489753
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研究论文 | 基于单细胞和空间转录组测序研究肝内胆管癌肿瘤微环境异质性及进展机制 | 首次通过单细胞和空间转录组技术系统解析ICC肿瘤微环境异质性,发现ASPH作为侵袭亚型标志物及MHC-II介导的免疫逃逸新机制 | 样本量有限(单细胞测序12例,空间转录组4例),需更大队列验证 | 探究肝内胆管癌肿瘤微环境异质性及肿瘤进展机制 | 肝内胆管癌患者肿瘤组织、类器官和小鼠模型 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序, RNA-seq, 多重免疫荧光 | 类器官模型, 小鼠模型 | 单细胞测序数据, 空间转录组数据, RNA-seq数据, 图像数据 | 训练队列:12例初治ICC样本(单细胞测序)+4例ICC样本(空间转录组);验证队列:87例ICC肿瘤样本(RNA-seq) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7162 | 2025-10-06 |
KRT5high TP63-expressing urothelial basal cells act as a driver to bladder urothelium regeneration in rabbit
2025-Jun-07, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04417-z
PMID:40483513
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定KRT5high TP63表达基底细胞作为膀胱尿路上皮再生的驱动细胞,并开发了基于胶囊血管床的膀胱组织工程策略 | 首次在兔模型中证实KRT5high TP63表达基底细胞具有干细胞特性,能够分化为中间层和表层伞状细胞,并建立了基于胶囊血管床的尿路上皮组织工程新方法 | 研究仅在兔模型中进行,尚未在更高等动物或人体验证;样本量未明确说明 | 探索膀胱尿路上皮再生的细胞机制并开发组织工程修复策略 | 兔膀胱尿路上皮基底细胞 | 组织工程 | 膀胱疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7163 | 2025-10-06 |
Heterogeneous characteristics of γδ T cells in peripheral blood of diffuse large B-cell lymphoma
2025-Jun-07, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-025-00795-x
PMID:40483533
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了弥漫性大B细胞淋巴瘤患者外周血中γδ T细胞的异质性特征及其与预后的关联 | 首次在DLBCL患者外周血中系统鉴定出6个功能各异的γδ T细胞亚群,并发现TIGIT+ γδ T细胞亚群与不良预后显著相关 | 样本量较小(6例患者和3例健康个体),需要在更大队列中验证研究结果 | 阐明DLBCL患者外周血中γδ T细胞的异质性及其临床相关性 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者和健康个体的外周血样本 | 单细胞基因组学 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | 共识聚类, 伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 9个血液样本(6例DLBCL患者和3例健康个体) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7164 | 2025-10-06 |
Cholangiocytes contribute to hepatocyte regeneration after partial liver injury during growth spurt in zebrafish
2025-Jun-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60334-y
PMID:40480975
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研究论文 | 本研究通过建立斑马鱼部分肝损伤模型,揭示了在快速生长期胆管细胞通过转分化为肝细胞参与肝脏再生的机制 | 首次在快速生长期动物模型中证明胆管细胞是新生肝细胞的主要来源,并发现mTORC1信号通路调控胆管细胞可塑性 | 研究仅限于斑马鱼模型,尚未在哺乳动物中验证 | 探究快速生长期肝脏再生的细胞来源和分子机制 | 斑马鱼肝脏 | 发育生物学 | 肝损伤 | 单细胞转录组测序,谱系追踪,基因组编辑 | NA | 基因表达数据,谱系追踪数据 | 斑马鱼部分肝损伤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7165 | 2025-10-06 |
RAN potentiates nuclear export of phosphorylated AMPK, reshaping lipid metabolism and impairing immune efficacy in lung adenocarcinoma
2025-Jun-06, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00977-8
PMID:40481101
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研究论文 | 本研究探讨RAN通过调节磷酸化AMPK核输出影响脂质代谢,从而削弱肺腺癌免疫治疗效果的机制 | 首次揭示RAN通过调控p-AMPK核输出重塑脂质代谢并影响免疫治疗效果的分子机制 | 样本量较小(n=15),需要更大规模研究验证 | 探索肺腺癌免疫治疗反应差异的代谢机制 | 肺腺癌患者和细胞系 | 单细胞转录组学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 15例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7166 | 2025-10-06 |
Identification of immune-associated genes and single-cell sequencing analysis in diagnosing Behçet's disease
2025-Jun-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-05086-x
PMID:40481130
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研究论文 | 通过批量测序和单细胞测序分析白塞病的免疫景观并鉴定新的诊断生物标志物 | 首次在单细胞分辨率下探索单核细胞在白塞病发生发展中的作用,并通过机器学习筛选出5个新的潜在诊断标志物 | 研究主要依赖公共数据库数据,实验验证仅限于小鼠模型 | 识别白塞病的免疫相关基因并开发诊断方法 | 白塞病患者和小鼠模型 | 生物信息学 | 白塞病 | 批量测序,单细胞测序,qRT-PCR | LASSO | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的白塞病数据和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 7167 | 2025-10-06 |
BNT162b2 COVID-19 vaccination elicits the expansion of CD16+CD8+ T cells endowed with natural killer cell features
2025-Jun, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.01.024
PMID:39894227
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研究论文 | 本研究揭示了BNT162b2 mRNA疫苗接种可诱导具有自然杀伤细胞特征的CD16+CD8+ T细胞扩增 | 首次发现mRNA疫苗能诱导产生兼具适应性免疫和天然免疫特征的CD16+CD8+ T细胞亚群 | 样本量较小(30名健康个体),未评估长期免疫持久性 | 表征BNT162b2 mRNA疫苗接种后出现的非常规T细胞亚群 | 接受两剂BNT162b2 mRNA疫苗的健康人类个体 | 免疫学 | COVID-19 | 多参数流式细胞术,单细胞转录组分析 | NA | 流式细胞数据,单细胞转录组数据 | 30名健康个体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7168 | 2025-10-06 |
Kinesin family member 4 a drives Cancer stem cell characteristics in breast Cancer: Insights from scRNA-Seq and experimental validation
2025-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144308
PMID:40383330
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据识别乳腺癌癌症干细胞标志基因,并验证KIF4A在癌症干细胞特性中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序结合实验验证揭示KIF4A是乳腺癌癌症干细胞特性的关键调控因子 | 研究主要基于公共数据集和有限实验验证,需要进一步临床样本验证 | 识别乳腺癌癌症干细胞标志基因并验证其功能 | 乳腺癌细胞系和裸鼠模型 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,加权基因共表达网络分析 | NA | 基因表达数据 | GSE180286单细胞数据集和TCGA乳腺癌数据集 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 7169 | 2025-10-06 |
Integrative genome-wide association studies, proteome-wide Mendelian randomization, and single-cell RNA sequencing identify interleukin-6 receptor protein as a therapeutic target in aortic aneurysm
2025-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144380
PMID:40409638
|
研究论文 | 本研究通过整合基因组关联研究、蛋白质组孟德尔随机化和单细胞RNA测序,识别白细胞介素-6受体蛋白作为主动脉瘤的潜在治疗靶点 | 首次将GWAS、PW-MR和单细胞RNA测序整合应用于主动脉瘤研究,发现IL6R在疾病机制中的关键作用 | 靶向IL6R的药物可能存在副作用需要进一步评估 | 识别主动脉瘤的新生物标志物和治疗靶点 | 主动脉瘤患者和健康对照人群 | 生物信息学 | 心血管疾病 | GWAS, PW-MR, 单细胞RNA测序 | 孟德尔随机化模型, 多性状共定位分析 | 基因组数据, 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | 8125例AA患者和381,977例对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7170 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveals an anti-tumor neutrophil subgroup in microwave thermochemotherapy-treated lip cancer
2025-05-13, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-025-00366-8
PMID:40360503
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学揭示微波热化疗治疗唇癌中抗肿瘤中性粒细胞亚群的作用机制 | 首次发现微波热化疗通过增强血液灌注诱导抗肿瘤中性粒细胞(N1-TANs)浸润,并鉴定MX2作为N1-TANs标志物,开发了基于H&E图像的深度学习预测模型 | 研究样本量有限,机制验证主要基于转录组数据,需要进一步实验验证 | 探究微波热化疗治疗唇鳞状细胞癌的免疫调节机制 | 唇鳞状细胞癌患者肿瘤组织中的免疫细胞和肿瘤微环境 | 数字病理 | 唇癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 深度学习 | 深度学习模型 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, H&E染色图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7171 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing systematically analyzed the mechanism of Emdogain on the restoration of delayed replantation periodontal membrane
2025-04-17, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-024-00345-5
PMID:40246878
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序系统分析Emdogain在延迟再植牙周膜修复中的作用机制 | 首次在单细胞分辨率下系统揭示EMD通过调控Vtn+成纤维细胞、促进骨生成和血管生成通路的作用机制 | 研究仅基于大鼠模型,尚未在人类临床样本中验证 | 探究Emdogain促进延迟再植牙周膜修复的细胞和分子机制 | 大鼠延迟牙齿再植模型 | 单细胞测序 | 牙周病 | 单细胞RNA测序,micro-CT,HE染色,TRAP染色,免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据,影像数据,组织学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7172 | 2025-10-06 |
Genetically supported causality between gut microbiota, prefrontal cortex and depression: insights from multiple Mendelian randomization, multi-omics analysis, and network pharmacology
2025-Oct-01, Journal of affective disorders
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.jad.2025.119458
PMID:40419156
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研究论文 | 通过多组学分析和网络药理学方法研究肠道菌群与前额叶皮层在抑郁症中的因果关系 | 首次整合孟德尔随机化、多组学分析和网络药理学方法,系统阐明肠道菌群通过前额叶皮层影响抑郁症的因果机制 | 研究主要基于欧洲人群的GWAS数据,结果可能受人群异质性限制 | 探究肠道菌群与前额叶皮层在抑郁症发生发展中的因果关系和生物学机制 | 人类基因组数据、脑影像表型、抑郁症患者前额叶组织样本、CUMS诱导的小鼠模型 | 生物信息学 | 抑郁症 | 全基因组关联分析(GWAS)、孟德尔随机化(MR)、单细胞RNA测序、RT-qPCR、免疫荧光分析、分子对接 | NA | 基因组数据、脑影像数据、基因表达数据 | GM数据(n=5959)、抑郁症数据(43,280病例,329,192对照)、脑影像表型数据(n=33,224) | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7173 | 2025-10-06 |
Endothelial Nrf2 deficiency promotes atherosclerotic lesion formation by shaping a proinflammatory niche
2025-Aug-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2025.123725
PMID:40404122
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型证明内皮细胞Nrf2缺失通过诱导炎症特性和改变血管细胞通讯促进动脉粥样硬化形成 | 首次在单细胞水平揭示内皮Nrf2缺失通过改变内皮细胞转录组和细胞间通讯促进动脉粥样硬化的机制 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究内皮细胞特异性Nrf2缺失在动脉粥样硬化形成中的作用机制 | Nrf2Cdh5tKO基因敲除小鼠和对照Nrf2flox/flox小鼠 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 组织学分析 | NA | 基因表达数据, 组织图像 | 基因工程小鼠模型 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 7174 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics and metabolomics reveal the potential role of ASRGL1 in metabolic reprogramming and invasion of nasopharyngeal carcinoma cells
2025-08, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2025.106788
PMID:40320045
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和代谢组学分析揭示了ASRGL1在鼻咽癌细胞代谢重编程和侵袭中的潜在作用 | 首次在鼻咽癌中系统研究ASRGL1的表达特征和功能,发现其通过影响氨基酸代谢促进肿瘤侵袭 | 研究主要基于公共数据集和细胞系实验,缺乏体内实验验证 | 探究ASRGL1在鼻咽癌进展中的具体作用和机制 | 鼻咽癌细胞系C666-1和公共单细胞测序数据集 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序, 代谢组学, GC-MS, siRNA干扰, 细胞功能实验 | NA | 单细胞转录组数据, 代谢组数据, 细胞实验数据 | 公共数据集GSE150430和C666-1细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 代谢组学 | NA | NA |
| 7175 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptional profiling reveals cellular senescence and inflammatory persistence as key features of type 1 diabetes partial remission
2025-Jul, Diabetes, obesity & metabolism
DOI:10.1111/dom.16384
PMID:40183401
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析1型糖尿病部分缓解期的免疫机制 | 首次在单细胞水平揭示1型糖尿病部分缓解期存在细胞衰老和持续性炎症反应的特征 | 样本量相对有限,主要关注单核细胞亚群 | 探究1型糖尿病部分缓解期的免疫机制 | 健康对照、新诊断1型糖尿病患者和部分缓解期患者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | 轨迹推断、转录网络重建 | 单细胞转录组数据 | 健康对照、新诊断T1D患者和PR期患者的外周血单个核细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7176 | 2025-10-06 |
CD44 Deficiency Induces Combinatory NRF2 Inhibition and Endoplasmic Reticulum Stress-Associated Dyserythropoiesis
2025-Jun-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202500228R
PMID:40488748
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研究论文 | 本研究揭示了CD44缺失通过抑制NRF2通路和诱导内质网应激导致红细胞生成异常的作用机制 | 首次阐明CD44在终末红细胞生成中通过调控PI3K/AKT/NRF2和p62/NRF2通路维持氧化还原稳态和蛋白质稳态的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类红细胞生成中的验证尚不充分 | 探究CD44在红细胞生成中的具体功能和分子机制 | CD44基因敲除小鼠、红细胞前体细胞、小鼠胎肝细胞 | 分子生物学 | 溶血性贫血 | 单细胞测序、基因敲除、体外红细胞分化实验 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | CD44KO小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7177 | 2025-10-06 |
Loss of ARNTL Enhances ER Stress and Apoptosis in CKD Through Disruption of NRF2 Signaling
2025-Jun-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202403398RRR
PMID:40489010
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研究论文 | 本研究揭示了ARNTL通过调控NRF2信号通路在慢性肾病中抑制内质网应激和细胞凋亡的保护机制 | 首次发现ARNTL直接结合NRF2启动子区域并通过蛋白互作调控NRF2激活,在慢性肾病中形成关键保护轴 | 研究主要基于细胞模型和动物模型,临床转化价值需要进一步验证 | 探索慢性肾病中内质网应激导致肾小管细胞凋亡的分子机制 | 慢性肾病患者的肾脏组织、CKD模型小鼠、HK2人肾小管上皮细胞 | 分子生物学 | 慢性肾病 | 单细胞测序, 蛋白互作分析, 启动子结合实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白水平数据, 单细胞测序数据 | CKD患者和模型小鼠的肾脏组织样本,HK2细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7178 | 2025-10-06 |
A spatially organized Cd24a+/Pax9+ stem cell core governs postnatal tooth establishment
2025-Jun-06, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adu5653
PMID:40479070
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研究论文 | 本研究揭示了Cd24a+/Pax9+干细胞核心在出生后牙齿建立过程中的空间组织与功能 | 首次发现并表征了空间组织的Cd24a+/Pax9+干细胞核心在哺乳动物牙齿发育中的关键作用 | NA | 探究出生后牙齿建立过程中干细胞的空间组织与发育机制 | 小鼠和人类牙齿组织 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,CUT&Tag,空间图谱 | NA | 基因表达数据,表观遗传数据,空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7179 | 2025-10-06 |
Cathepsin C correlates with M2 macrophage infiltration and regulates the tumor growth and metastasis in non-small cell lung cancer
2025-Jun-05, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-14341-3
PMID:40474091
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研究论文 | 本研究探讨组织蛋白酶C在非小细胞肺癌中的作用机制及其与M2巨噬细胞浸润的关系 | 首次通过单细胞测序揭示CTSC在非小细胞肺癌免疫微环境中的表达特征,并证实其与M2巨噬细胞浸润的正相关性 | 未明确CTSC调控M2巨噬细胞浸润的具体分子机制 | 阐明CTSC在非小细胞肺癌进展和转移中的调控作用 | 非小细胞肺癌细胞系、临床患者组织样本 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 基因集富集分析, 细胞功能实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 临床数据 | 临床非小细胞肺癌队列组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7180 | 2025-10-06 |
Targeting CD39 boosts PD-1 blockade antitumor therapeutic efficacy via strengthening CD8 + TILs function and recruiting B cells in cervical cancer
2025-Jun-03, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03500-0
PMID:40462160
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研究论文 | 本研究通过靶向CD39增强PD-1阻断在宫颈癌中的抗肿瘤疗效 | 发现CD39高表达与CD8+T细胞耗竭相关,并开发了含POM-1的脂质体增强治疗效果 | 样本量较小(仅10例患者),需更大规模研究验证 | 寻找增强免疫检查点抑制剂治疗宫颈癌疗效的新策略 | 宫颈癌患者样本和皮下肿瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 10例宫颈癌患者(本中心队列)+TCGA数据库队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |