单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 10618 篇文献，本页显示第 7141 - 7160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 7141 | 2025-10-06 |
Nintedanib improves bleomycin-induced pulmonary fibrosis by inhibiting the Clec7a/SPP1 pathway in interstitial macrophages
2025-Apr, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.111635
PMID:39892726
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和RNA-seq数据分析，揭示了尼达尼布通过抑制间质巨噬细胞中Clec7a/SPP1通路改善肺纤维化的新机制 | 首次发现尼达尼布通过抑制间质巨噬细胞中Clec7a来阻断NFκB/SPP1促纤维化通路的新作用机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证该机制 | 探索尼达尼布治疗特发性肺纤维化的精确作用机制 | 博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型 | 单细胞生物学 | 肺纤维化 | 单细胞测序,RNA-seq | Monocle2,Cellchat,Scenic | 基因表达数据 | 纤维化和尼达尼布治疗的纤维化小鼠肺组织 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7142 | 2025-10-06 |
Functional analysis of yak alveolar type II epithelial cells at high and low altitudes based on single-cell sequencing
2025-02, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2024.119889
PMID:39681250
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研究论文 | 基于单细胞测序技术研究高海拔和低海拔牦牛肺泡II型上皮细胞的功能差异 | 首次构建牦牛肺组织单细胞图谱，揭示AEC II在高海拔环境下的免疫调节、粘附和代谢活性增强机制 | 样本量有限，仅比较了两个海拔高度（4000米和2600米）的牦牛 | 探究牦牛肺泡II型上皮细胞对高海拔低氧环境的适应机制 | 高海拔（4000米）和低海拔（2600米）牦牛的肺泡II型上皮细胞 | 单细胞生物学 | 高原适应 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 两个海拔高度的牦牛肺组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x单细胞RNA测序技术 |
| 7143 | 2025-10-06 |
Coupling of response biomarkers between tumor and peripheral blood in patients undergoing chemoimmunotherapy
2025-Jan-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101882
PMID:39731918
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研究论文 | 本研究通过分析接受化疗免疫治疗的间皮瘤患者肿瘤组织和外周血样本，揭示了治疗反应相关的生物标志物 | 首次将外周血单细胞RNA测序与肿瘤转录组数据相结合，发现CD8 T效应记忆细胞在应答者外周血中更丰富且治疗后扩增 | 单臂二期临床试验，样本量有限（N=54），需要更大规模研究验证 | 探索化疗免疫治疗在间皮瘤中的免疫学机制并寻找预测性生物标志物 | 间皮瘤患者 | 生物信息学 | 间皮瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, TCR-seq | NA | 转录组数据, 单细胞测序数据 | 54例患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 7144 | 2025-10-06 |
Innate immune cell barrier-related genes inform precision prognosis in pancreatic cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1559373
PMID:40486509
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研究论文 | 本研究通过整合先天免疫细胞屏障相关基因和机器学习算法，开发了胰腺癌预后预测模型并发现新的治疗靶点 | 首次系统研究先天免疫细胞屏障相关基因在胰腺癌预后中的作用，开发了基于随机生存森林的CDRG-RSF预后模型，并鉴定出UBASH3B作为新的免疫抑制和耐药标志物 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，需要前瞻性临床研究进一步验证模型的临床应用价值 | 识别胰腺癌预后生物标志物，开发预测模型，发现个性化治疗新靶点 | 胰腺癌患者及其相关基因表达数据 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，差异表达分析，功能富集分析，免疫浸润分析 | 随机生存森林(RSF)，14种机器学习算法 | 基因表达数据，临床生存数据 | TCGA和GTEx数据库中的胰腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7145 | 2025-10-06 |
TSLP pretreatment inhibits M1 macrophage polarization and attenuates LPS-induced iNKT cell-dependent acute lung injury
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1583235
PMID:40486522
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研究论文 | 本研究探讨TSLP预处理通过抑制M1巨噬细胞极化和iNKT细胞依赖途径减轻LPS诱导的急性肺损伤 | 首次揭示TSLP在脓毒症相关ARDS中的保护作用机制，发现其通过调控iNKT细胞和巨噬细胞极化发挥作用 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化价值需进一步验证；机制研究尚未完全阐明所有信号通路 | 探究TSLP在脓毒症相关急性呼吸窘迫综合征中的作用机制 | 野生型小鼠、Jα18-/-基因敲除小鼠、骨髓源性巨噬细胞 | 免疫学 | 急性肺损伤/ARDS | 转录组测序、单细胞转录组测序、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | 小鼠模型和体外细胞实验 | NA | 单细胞转录组测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7146 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomic Profiling Reveals KRAS/TP53-Driven Neutrophil Reprogramming in Luad: A Multi-Gene Prognostic Model and Therapeutic Targeting of RHOV
2025, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2025.062584
PMID:40486872
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了KRAS/TP53突变驱动的中性粒细胞重编程在肺腺癌中的作用，并开发了五基因预后模型 | 首次系统揭示KRAS/TP53突变通过OSM/CALCR/IL-1信号通路驱动中性粒细胞异质性重编程，建立首个中性粒细胞中心的五基因预后特征 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅限于细胞系模型，缺乏体内动物实验验证 | 阐明KRAS/TP53突变对肿瘤微环境异质性的影响，开发肺腺癌预后预测模型 | 肺腺癌患者样本、A549/H1299肺癌细胞系 | 生物信息学、癌症生物学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序、转录组分析、siRNA敲低、CCK8检测、伤口愈合实验、transwell实验 | hdWGCNA、Cox回归、LASSO回归、预后列线图 | 单细胞RNA测序数据、转录组数据、临床数据 | TCGA-LUAD队列、IMvigor210免疫治疗队列、GSE78220数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7147 | 2025-10-06 |
Topology entropy: Enhancing graph partitioning for TAD identification and single-cell clustering
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.04.037
PMID:40487196
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研究论文 | 本文提出拓扑熵概念用于量化生物图复杂度，并开发了TEC-O和TEC-U两种图分区方法 | 首次将拓扑熵应用于生物图复杂度量化，证明最小化熵等价于最优图分区，开发了针对有序和无序生物图的专用方法 | NA | 开发能够捕捉生物图复杂结构的有效度量方法 | Hi-C接触图谱中的拓扑关联域和单细胞测序数据中的细胞聚类 | 生物信息学 | NA | 图分区算法 | TEC-O, TEC-U | Hi-C接触图谱，单细胞测序数据 | 5个细胞系的Hi-C数据和10个单细胞测序数据集 | NA | Hi-C，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7148 | 2025-10-06 |
Exploring the anti-gastric cancer mechanisms of Diosgenin through integrated network analysis, bioinformatics, single-cell sequencing, and cell experiments
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1600960
PMID:40487391
|
研究论文 | 本研究通过整合网络分析、生物信息学、单细胞测序和细胞实验，系统探索薯蓣皂苷元抗胃癌的作用机制 | 首次采用多方法策略（网络分析、生物信息学、单细胞RNA测序、孟德尔随机化和细胞实验）系统研究薯蓣皂苷元的抗胃癌机制 | NA | 全面研究薯蓣皂苷元抗胃癌的作用机制 | 胃癌细胞 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 孟德尔随机化, 蛋白质印迹分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7149 | 2025-10-06 |
Single-cell and transcriptomic analyses reveal the role of PCDH17 in the non-inflammatory tumor microenvironment of pancreatic cancer
2025, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2025.1559909
PMID:40487760
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研究论文 | 本研究通过单细胞和转录组分析揭示了PCDH17在胰腺癌非炎症性肿瘤微环境中的作用机制 | 首次系统阐明PCDH17在胰腺癌内皮细胞中的表达特征及其与炎症基因和免疫细胞浸润的关联 | PCDH17调控肿瘤微环境的具体分子机制仍需进一步验证 | 探究PCDH17在胰腺癌肿瘤微环境调控中的作用机制 | 胰腺癌组织样本和单细胞测序数据 | 单细胞分析 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,免疫荧光 | NA | 单细胞测序数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7150 | 2025-10-06 |
Utilizing Multi-omics analysis to elucidate the role of mitochondrial gene defects in Gastric cancer progression
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0325520
PMID:40489463
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研究论文 | 通过多组学分析揭示线粒体自噬相关基因在胃癌进展中的作用 | 首次结合bulk RNA-seq和单细胞RNA测序数据，识别出8个线粒体自噬相关预后基因并构建风险评分模型 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 阐明线粒体自噬相关基因在胃癌进展中的作用机制 | 胃癌组织和细胞 | 生物信息学 | 胃癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | LASSO-Cox回归, 风险评分模型 | 基因表达数据 | TCGA和GEO数据库中的胃癌样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7151 | 2025-10-06 |
Integration of Bulk and Single-Cell Transcriptomics Reveals BCL2L14 as a Novel IGKC+ T Cell-Associated Therapeutic Target in Breast Cancer
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S523147
PMID:40491783
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk转录组数据，发现BCL2L14是乳腺癌中新型IGKC+ T细胞亚群的关键调控因子和潜在治疗靶点 | 首次识别出IGKC+ T细胞亚群，并确定BCL2L14作为该亚群中驱动乳腺癌进展的关键基因 | 研究主要基于转录组数据分析，需要更多实验验证BCL2L14的临床转化价值 | 识别乳腺癌肿瘤微环境中的新型T细胞亚群及相关生物标志物，为靶向治疗提供新策略 | 乳腺癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，机器学习算法，体外功能验证 | 预后风险模型，列线图 | 转录组数据 | 多个乳腺癌队列样本 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | NA |
| 7152 | 2025-10-06 |
GSDMD is a novel predictive biomarker for immunotherapy response: in the pan-cancer and single cell landscapes
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1570901
PMID:40491921
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研究论文 | 本研究通过泛癌分析和单细胞测序揭示了GSDMD作为免疫治疗反应预测生物标志物的潜力 | 首次在泛癌水平和单细胞景观中系统评估GSDMD作为免疫治疗预测生物标志物的价值，并发现PARPi通过增强GSDMD介导的焦亡发挥抗肿瘤作用 | 研究主要基于生物信息学分析，需要更多实验验证GSDMD的临床预测价值 | 探索GSDMD作为免疫治疗反应预测生物标志物的潜力 | 多种肿瘤类型和免疫细胞 | 生物信息学 | 泛癌 | 单细胞RNA测序, 类器官功能实验 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | TCGA数据集中的多种肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7153 | 2025-10-06 |
A telomere-associated molecular landscape reveals immunological, microbial, and therapeutic heterogeneity in colorectal cancer
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1615533
PMID:40492114
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研究论文 | 本研究开发了一种名为TELscore的端粒评分系统，用于揭示结直肠癌中免疫、微生物和治疗异质性 | 首次整合转录组和瘤内微生物组数据构建端粒评分系统，全面表征了结直肠癌中端粒生物学与免疫微环境、微生物生态和治疗反应的关联 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要前瞻性研究验证临床实用性 | 开发端粒相关分子标志物用于结直肠癌患者分层和精准治疗 | 结直肠癌患者队列 | 数字病理 | 结直肠癌 | 转录组测序, 16S rRNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫组化, 全切片图像分析 | NA | 转录组数据, 微生物组数据, 病理图像, 单细胞数据 | 多个独立结直肠癌队列 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 微生物组测序 | NA | NA |
| 7154 | 2025-10-06 |
Unveiling fatty acid subtypes: immunometabolic interplay and therapeutic opportunities in gastric cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1570873
PMID:40492126
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研究论文 | 本研究开发了一种基于脂肪酸代谢基因的预测模型，用于评估胃癌患者的预后和治疗指导 | 首次通过整合脂肪酸代谢相关基因构建胃癌预后预测模型，并结合单细胞RNA测序和代谢组学验证基因表达特征 | 模型在不同验证数据集中的AUC值存在差异(0.508-0.86)，需要进一步临床验证 | 开发基于脂肪酸代谢基因的预测特征来评估胃癌患者预后 | 胃癌患者 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序，代谢组学，转录组学，随机森林模型，Cox回归分析 | 随机森林，Cox比例风险模型 | 基因表达数据，代谢物数据 | 多个胃癌数据集的患者样本 | NA | 单细胞RNA测序，代谢组学，转录组学 | NA | NA |
| 7155 | 2025-10-06 |
Fibroblast Heterogeneity in Hepatocellular Carcinoma and Identification of Prognostic Markers Based on Single-cell Transcriptome Analysis
2025, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示肝细胞癌中成纤维细胞的异质性及其预后标志物 | 首次在单细胞水平系统揭示HCC成纤维细胞的转录调控机制，发现染色体6p拷贝数缺失与CEBPD、FOSB转录因子的预后价值 | 样本来源单一数据库，功能验证实验有限 | 探索肝细胞癌中成纤维细胞的复杂作用及转录调控机制 | 肝细胞癌组织中的成纤维细胞及其他肿瘤微环境细胞 | 单细胞转录组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，qRT-PCR，Transwell实验 | Seurat，inferCNV，CellChat，Monocle 2，SCENIC | 单细胞转录组数据 | GSE149614数据库中的非肿瘤肝组织和原发肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7156 | 2025-10-06 |
Progress in single-cell sequencing of retinal vein occlusion or ischemic hypoxic retinopathy
2025-Aug, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110436
PMID:40414336
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在视网膜静脉阻塞和缺血性缺氧性视网膜病变研究中的最新进展 | 整合了单核RNA测序、空间转录组学和多组学方法，增强对视网膜反应的空间和时间图谱绘制 | 样本保存、视网膜细胞类型注释和跨物种翻译等挑战尚未完全解决 | 探讨单细胞测序技术在视网膜血管疾病研究中的应用进展 | 视网膜静脉阻塞和缺血性缺氧性视网膜病变 | 数字病理学 | 视网膜血管疾病 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学, 多组学分析 | NA | 转录组数据, 空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 7157 | 2025-10-06 |
Targeting SPP1+ macrophages via the SPP1-CD44 axis reveals a key mechanism of immune suppression and tumor progression in ovarian cancer
2025-Jul-28, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114906
PMID:40446696
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析发现SPP1+巨噬细胞通过SPP1-CD44轴驱动卵巢癌免疫抑制和T细胞耗竭 | 首次识别SPP1+TAM亚群在卵巢癌中的关键作用，揭示SPP1-CD44轴是免疫抑制的主要介质，并发现尼洛替尼作为潜在SPP1抑制剂 | 研究主要基于单细胞测序数据分析，需要更多临床验证 | 探究卵巢癌肿瘤微环境中肿瘤相关巨噬细胞介导免疫抑制的分子机制 | 高级别浆液性卵巢癌患者样本和Jurkat细胞 | 肿瘤免疫学 | 卵巢癌 | 单细胞测序，分子对接，分子动力学模拟，功能验证实验 | NA | 单细胞测序数据，实验数据 | 六个HGSOC单细胞测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7158 | 2025-10-06 |
Mefunidone treats pulmonary fibrosis by targeting SDH to regulate fibro-promoting macrophages
2025-Jul-28, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114971
PMID:40449267
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研究论文 | 本研究揭示美氟尼酮通过靶向琥珀酸脱氢酶调控促纤维化巨噬细胞表型治疗肺纤维化的新机制 | 首次发现美氟尼酮通过结合并抑制SDH活性减少琥珀酸生成，进而抑制MMP12+CCL2+促纤维化巨噬细胞转化 | 研究主要基于博来霉素诱导的小鼠肺纤维化模型，临床转化价值需进一步验证 | 阐明美氟尼酮治疗肺纤维化的分子靶点及作用机制 | 博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型及巨噬细胞 | 单细胞测序 | 肺纤维化 | 单细胞测序，组织病理学检查，体外验证 | 动物疾病模型 | 单细胞测序数据，组织病理图像 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7159 | 2025-10-06 |
Multi-omics identifies OSM-OSMR as a key receptor-ligand in the tumor environment of endometrial adenocarcinoma
2025-Jul-28, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114933
PMID:40450916
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研究论文 | 本研究通过多组学分析发现OSM-OSMR是子宫内膜腺癌肿瘤微环境中的关键受体-配体对，并构建了七基因预后模型 | 首次系统识别OSM-OSMR在子宫内膜腺癌中的关键作用，并建立基于随机生存森林的七基因预后特征模型 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 探索肿瘤细胞与其他细胞间的配体-受体关系并构建预后模型 | 子宫内膜腺癌组织和细胞系 | 生物信息学 | 子宫内膜腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组测序,批量RNA测序 | 随机生存森林 | 基因表达数据,临床数据 | 来自GEO和TCGA数据库的多个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,批量RNA-seq | NA | NA |
| 7160 | 2025-10-06 |
Phillyrin for sepsis-related acute lung injury: A potential strategy suppressing GSK-3β
2025-Jul, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2025.04.017
PMID:40359720
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研究论文 | 本研究探讨连翘酯苷通过抑制GSK-3β信号通路缓解脓毒症相关急性肺损伤的机制 | 首次通过多组学分析发现连翘酯苷与GSK-3β的稳定结合，并系统阐明其通过调控巨噬细胞极化改善急性肺损伤的作用机制 | 机制研究主要聚焦于GSK-3β信号通路，可能存在其他未被发现的调控途径 | 阐明连翘酯苷治疗脓毒症相关急性肺损伤/急性呼吸窘迫综合征的分子机制 | 巨噬细胞、斑马鱼、小鼠模型 | 分子药理学 | 急性肺损伤/急性呼吸窘迫综合征 | 分子对接、分子动力学模拟、孟德尔随机化分析、单细胞测序、体内外实验验证 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据、分子模拟数据 | 从公共数据库筛选8331个ALI/ARDS相关靶基因 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |