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当前共找到 10572 篇文献，本页显示第 7141 - 7160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7141 | 2025-10-06 |
Integrated bulk and single-cell RNA sequencing reveals a cuproptosis-related LncRNA prognostic signature in neuroblastoma
2025-Jul-01, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-14463-8
PMID:40596995
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序数据，构建了一个与铜死亡相关的长链非编码RNA预后特征，用于神经母细胞瘤的风险分层 | 首次在神经母细胞瘤中整合bulk和单细胞RNA测序数据，构建铜死亡相关lncRNA预后特征，并通过功能验证确认其致癌作用 | 样本量有限，需要更大规模的前瞻性研究验证 | 开发神经母细胞瘤的精准预后评估模型 | 神经母细胞瘤患者 | 生物信息学 | 神经母细胞瘤 | RNA测序, 单细胞RNA测序, siRNA敲低 | Lasso-Cox回归模型, 风险评分模型 | RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据 | 神经母细胞瘤患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7142 | 2025-10-06 |
stGRL: spatial domain identification, denoising, and imputation algorithm for spatial transcriptome data based on multi-task graph contrastive representation learning
2025-Jul-01, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02290-z
PMID:40597202
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研究论文 | 提出一种基于多任务图对比表示学习的空间转录组数据分析算法stGRL，用于空间域识别、去噪和插补 | 开发了首个结合编码器-解码器架构与零膨胀负二项分布的多任务图神经网络模型，集成图对比表示学习增强节点嵌入一致性 | 未明确说明算法计算复杂度及对大规模数据集的处理效率 | 解决空间转录组数据高丢失率和噪声问题，提升下游分析性能 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌,卵巢癌 | 空间转录组测序 | 图神经网络,编码器-解码器,对比学习 | 空间转录组数据 | 多个空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 7143 | 2025-10-06 |
A rare IDH-Mutant glioma case: insights from single-cell transcriptomic analysis of tumor recurrences
2025-Jul-01, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-025-03913-z
PMID:40597255
|
病例报告 | 通过单细胞转录组分析研究一例罕见IDH突变胶质瘤多灶性复发的细胞异质性和谱系关系 | 首次对IDH突变胶质瘤多灶性复发进行单细胞测序分析，揭示不同病灶间的细胞组成差异和隐藏谱系关系 | 单一样本病例研究，结果可能不具有普遍代表性 | 探究IDH突变胶质瘤多灶性复发的分子机制 | 36岁男性IDH突变少突胶质细胞瘤患者的多灶性复发肿瘤组织 | 数字病理学 | 脑胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例患者的2个复发肿瘤病灶 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7144 | 2025-10-06 |
Gremlin1 repression-mediated mitochondrial network hyperfunction contributes to TCE-induced zebrafish cardiac defects
2025-Jul-01, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02314-9
PMID:40597303
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研究论文 | 本研究揭示三氯乙烯通过抑制Gremlin1基因导致线粒体网络功能亢进，从而引起斑马鱼心脏发育缺陷的机制 | 首次发现Gremlin1基因在心脏发育中的关键作用，并阐明环境污染物通过调控该基因导致心脏缺陷的新机制 | 研究主要基于斑马鱼模型，在人类中的直接相关性需要进一步验证 | 探究三氯乙烯诱导先天性心脏病的分子机制 | 斑马鱼胚胎和人类多能干细胞来源的心肌细胞 | 发育生物学 | 先天性心脏病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, CRISPR/dCas9基因编辑 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 斑马鱼胚胎和hPSC-CMs细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7145 | 2025-10-06 |
Multiple cell types guided by neurocytes orchestrate horn bud initiation in dairy goats
2025-Jul-01, Genetics, selection, evolution : GSE
DOI:10.1186/s12711-025-00981-3
PMID:40597626
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术解析了奶山羊早期角芽发育过程中细胞异质性和命运轨迹 | 首次揭示了神经细胞引导下多种细胞类型协同调控山羊角芽起始的发育机制 | 研究仅聚焦于胚胎期角芽发育，未涉及出生后角形成过程 | 阐明奶山羊角芽起始的细胞和分子机制 | 奶山羊胚胎期角芽组织 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, HE染色, 免疫组织化学 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据, 组织图像 | 奶山羊胚胎期角芽组织（E50, E60, E70阶段） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7146 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome of mouse hippocampus identifies neural precursor-like cells, and reveals IL15Rα knock out-mediated neuron remodeling
2025-Jul-01, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-11785-6
PMID:40597645
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了IL15Rα敲除对小鼠海马体细胞功能的影响，并鉴定出一种具有前体样属性的新型神经细胞 | 发现前体样神经元这一新型细胞类型，提出'极化评分'方法评估细胞聚集程度，揭示IL15Rα敲除通过影响神经元可塑性调节兴奋-抑制平衡 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证；单细胞测序技术本身存在技术偏差 | 研究IL15Rα敲除对成年小鼠海马体细胞功能的影响 | 野生型和IL15Rα敲除小鼠的海马体组织 | 单细胞转录组学 | 精神疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 64,399个单细胞转录组（来自WT和KO小鼠） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7147 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing reveals the role of SALL4 in cervical cancer development
2025-Jul-01, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-14469-2
PMID:40597906
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术探讨SALL4在宫颈癌发展中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 首次结合单细胞测序技术和体内外实验系统揭示SALL4在宫颈癌进展中的关键调控作用 | 研究主要基于HeLa细胞系，临床样本验证不足 | 探究SALL4在宫颈癌发展中的作用及其治疗靶点潜力 | 宫颈癌细胞系HeLa | 单细胞测序 | 宫颈癌 | 单细胞测序，转录组分析，免疫荧光，体内外实验 | NA | 单细胞测序数据，转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7148 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics and time-series metabolite profiling reveal the spatiotemporal regulation of flavonoid biosynthesis genes and phytohormone homeostasis by PAP1 in Arabidopsis
2025-Jul-01, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02297-6
PMID:40598113
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序和时序代谢物分析，揭示了PAP1在拟南芥中调控类黄酮生物合成基因和植物激素稳态的时空调控机制 | 首次结合单细胞转录组和时序代谢组学，在细胞类型特异性水平解析PAP1对类黄酮生物合成途径的时空调控网络 | 研究仅针对拟南芥模型植物，结果在其他物种中的普适性需要进一步验证 | 阐明PAP1转录因子在植物类黄酮生物合成和植物激素稳态中的细胞特异性调控机制 | 拟南芥野生型和pap1-D突变体叶片 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 代谢物分析 | NA | 单细胞转录组数据, 代谢组数据 | 拟南芥野生型和pap1-D突变体叶片样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 代谢组学 | NA | NA |
| 7149 | 2025-10-06 |
Mechanical force-induced oncostatin M secretion by Jun-positive neutrophils promotes craniofacial bone regeneration for midface hypoplasia treatment
2025-Jul-01, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04458-4
PMID:40598376
|
研究论文 | 本研究揭示了机械力通过Jun阳性中性粒细胞分泌制瘤素M促进颅面骨再生的新机制 | 首次发现Jun阳性中性粒细胞亚群在机械力诱导的骨再生中的关键作用，并阐明其通过分泌制瘤素M促进缝线来源干细胞成骨分化的机制 | 研究基于小鼠模型，临床转化需要进一步验证；未探讨其他细胞类型在骨再生中的潜在作用 | 探究经缝牵引成骨技术促进颅面骨再生的分子机制 | C57BL/6小鼠颧颌缝区域的中性粒细胞和缝线来源干细胞 | 骨再生生物学 | 颅面畸形 | 单细胞RNA测序，细胞通讯分析，体外拉伸实验 | 小鼠TSDO模型，HL-60细胞分化模型 | 基因表达数据，细胞信号通路数据 | 4周龄C57BL/6小鼠和中性粒细胞缺失小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7150 | 2025-10-06 |
A single-cell transcriptomic atlas of human lens epithelium: identification and functional insights into lens stem/progenitor cells
2025-Jul-01, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04436-w
PMID:40598599
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序构建了人类晶状体上皮细胞的转录组图谱，识别了晶状体干细胞/祖细胞并提供了功能见解 | 首次在人类晶状体上皮中识别出瞬时扩增细胞(TACs)和晶状体祖细胞样细胞(LPLCs)，确定了TOP2A作为TAC的生物标志物，揭示了PTN信号在晶状体稳态中的关键作用 | 样本量相对较小(8对样本)，仅包含人类供体样本，需要进一步的功能验证实验 | 识别和表征人类晶状体上皮中的干细胞/祖细胞亚群，理解晶状体细胞分化轨迹和衰老相关变化 | 人类供体晶状体上皮样本、人类晶状体、晶状体类器官、兔再生晶状体、小鼠晶状体和细胞系 | 单细胞生物学 | 白内障 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、轨迹推断、细胞间通讯分析、转录组测序、免疫荧光 | UMAP、CytoTRACE | 单细胞转录组数据、基因表达数据 | 8对人类供体晶状体上皮样本(4个非老年<65岁，4个老年>65岁) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7151 | 2025-10-06 |
Identification of Crucial Genes Associated With MYCN-Driven Neuroblastoma Based on Single-Cell Analysis and Machine Learning
2025-Jul, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71008
PMID:40600620
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析和机器学习方法识别与MYCN驱动神经母细胞瘤相关的关键基因 | 结合单细胞转录组分析和随机生存森林机器学习方法识别预后相关基因，并揭示其在免疫微环境调控中的作用 | 样本量有限，需要更大规模验证；机制研究仍需深入 | 阐明MYCN扩增神经母细胞瘤的分子机制并识别关键预后基因 | 神经母细胞瘤患者样本和细胞系 | 机器学习 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，RT-qPCR | 随机生存森林(RSF)，列线图分析 | 单细胞转录组数据，基因表达数据 | GSE218450数据集中的神经母细胞瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7152 | 2025-10-06 |
Chromatin accessibility module identified by single-cell sequencing underlies the diagnosis and prognosis of hepatocellular carcinoma
2025-Jun-27, World journal of hepatology
IF:2.5Q2
DOI:10.4254/wjh.v17.i6.107329
PMID:40606924
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研究论文 | 通过单细胞测序识别染色质可及性模块，揭示其在肝细胞癌诊断和预后中的作用机制 | 首次整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据解析HCC中多层染色质调控网络，发现DGAT1作为染色质可及性核心调控基因 | 样本来源有限，功能验证主要基于体外实验，需要更多临床样本验证 | 解析多层染色质调控如何维持致癌转录和肿瘤-基质相互作用 | 肝细胞癌样本 | 单细胞多组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 批量RNA测序 | ArchR, 共可及性网络分析 | 单细胞测序数据, 批量测序数据 | 多个队列（TCGA、肝癌研究所、GSE25907） | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 7153 | 2025-10-06 |
Elevated Stanniocalcin-1 Expression in Uveal Melanoma Predicts Poor Patient Prognosis
2025-Jun-26, Cancer genomics & proteomics
IF:2.6Q3
DOI:10.21873/cgp.20526
PMID:40571316
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研究论文 | 本研究探讨了STC-1在葡萄膜黑色素瘤中的表达及其与患者预后的关系 | 首次揭示了STC-1在葡萄膜黑色素瘤中的预后价值及其在肿瘤微环境中的细胞来源 | 样本量较小（阶段IV仅4例），需要进一步实验验证机制 | 评估STC-1在葡萄膜黑色素瘤中的预后意义和生物学作用 | 葡萄膜黑色素瘤患者和肿瘤组织 | 生物信息学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 转录组分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 阶段III 36例，阶段IV 4例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7154 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis reveals abnormal angiogenesis and placentation by loss of imprinted glutaminyl-peptide cyclotransferase
2025-Jun-15, Journal of Zhejiang University. Science. B
DOI:10.1631/jzus.B2400099
PMID:40571662
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示印迹基因谷氨酰肽环转移酶缺失导致胎盘血管生成异常 | 首次发现谷氨酰肽环转移酶作为新型抗血管生成因子调控小鼠胎盘发育 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类样本中验证 | 探究印迹基因在胎盘血管生成和胚胎发育中的调控机制 | 谷氨酰肽环转移酶基因敲除小鼠的胎盘和胚胎组织 | 单细胞组学 | 胎盘发育异常 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,免疫组织化学 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 32,309个细胞（来自Qpct+/-和Qpct+/+小鼠胎盘） | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | NA |
| 7155 | 2025-10-06 |
Safety and feasibility of 4-1BB co-stimulated CD19-specific CAR-NK cell therapy in refractory/relapsed large B cell lymphoma: a phase 1 trial
2025-May, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-025-00940-3
PMID:40251398
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研究论文 | 本研究评估了4-1BB共刺激的CD19特异性CAR-NK细胞疗法在难治/复发性大B细胞淋巴瘤患者中的安全性和可行性 | 首次使用狒狒包膜假型慢病毒载体转导脐带血来源的NK细胞生成CD19-BBz CAR-NK细胞，并进行临床阶段试验 | 样本量较小（仅8名患者），为早期阶段临床试验 | 评估CAR-NK细胞疗法在B细胞淋巴瘤患者中的安全性和治疗效果 | 难治/复发性大B细胞淋巴瘤患者 | 癌症免疫治疗 | 大B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序，慢病毒转导 | 临床实验 | 临床数据，基因表达数据 | 8名患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7156 | 2025-10-06 |
Tumor-associated macrophage-based predictive and prognostic model for hepatocellular carcinoma
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0325120
PMID:40601653
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量测序数据，构建了基于肿瘤相关巨噬细胞的肝细胞癌预测和预后模型 | 首次整合单细胞RNA测序和批量测序数据，系统研究肿瘤相关巨噬细胞特征在肝细胞癌中的预后价值 | 需要在大规模前瞻性研究中进一步验证，并探索肿瘤相关巨噬细胞在肝细胞癌进展中的功能机制 | 研究肿瘤相关巨噬细胞在肝细胞癌预后中的作用，并开发有效的预后分层模型 | 肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，批量测序，生物信息学分析 | Cox回归，逻辑回归 | 基因表达数据 | 多个肝细胞癌队列 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 7157 | 2025-10-06 |
Identification of three T cell-related genes as diagnostic and prognostic biomarkers for triple-negative breast cancer and exploration of potential mechanisms
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1584334
PMID:40606662
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研究论文 | 本研究通过整合TCGA和GEO数据库数据，识别出三个T细胞相关基因作为三阴性乳腺癌的诊断和预后生物标志物 | 首次将T细胞相关基因与三阴性乳腺癌诊断预后相结合，并构建了高精度的逻辑回归诊断模型 | 研究基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 识别三阴性乳腺癌的诊断和预后生物标志物 | 三阴性乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,机器学习算法 | 逻辑回归 | 转录组数据,临床数据 | TCGA-BRCA数据集和GEO数据库样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7158 | 2025-10-06 |
Comprehensive bioinformatics analysis of the common mechanism of atherosclerosis and atrial fibrillation: emphasizing mitochondrial metabolic disorder and immune inflammation
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1595048
PMID:40607061
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研究论文 | 通过生物信息学分析揭示动脉粥样硬化和心房颤动的共同机制，重点关注线粒体代谢紊乱和免疫炎症 | 首次建立MRPS23作为连接线粒体功能障碍和免疫失调的新型生物标志物，提出'线粒体-免疫轴'心血管共病新范式 | 需要在临床前模型和临床队列中进一步验证以转化为诊断或治疗应用 | 揭示动脉粥样硬化和心房颤动的共同分子通路，识别诊断生物标志物 | 动脉粥样硬化和心房颤动患者的转录组数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 转录组分析，单细胞RNA测序，机器学习算法 | LASSO，SVM，随机森林 | 转录组数据，单细胞转录组数据 | 多个独立数据集（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序，转录组测序 | NA | NA |
| 7159 | 2025-10-06 |
Integrative multi-omics analysis of IFNγ-induced macrophages and atherosclerotic plaques reveals macrophage-dependent STAT1-driven transcription in atherosclerosis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1590953
PMID:40607379
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研究论文 | 通过整合多组学分析揭示巨噬细胞中STAT1驱动的转录调控在动脉粥样硬化中的作用机制 | 首次发现STAT1与PU.1共结合通过表观遗传修饰调控巨噬细胞特异性IFNγ激活的转录反应，并鉴定出新的巨噬细胞依赖性基因特征 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本，需要进一步临床验证 | 探究巨噬细胞STAT1介导的信号通路在动脉粥样硬化进展中的作用 | IFNγ诱导的巨噬细胞、人类和小鼠动脉粥样硬化斑块 | 生物信息学 | 心血管疾病 | ATAC-seq, ChIP-seq, RNA-seq, scRNA-seq, 多组学整合分析 | 统计分析、通路分析 | 基因组学、表观基因组学、转录组学数据 | 人类颈动脉和冠状动脉粥样硬化病变样本、LDLr-/-和ApoE-/-高脂饮食小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 染色质可及性测序, 染色质免疫沉淀测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 7160 | 2025-10-06 |
Integrative analysis of T cell-associated markers in Ewing sarcoma reveals prognostic signatures and immune dynamics
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1586544
PMID:40607387
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和生物信息学分析，揭示了尤文肉瘤中T细胞相关标志物的预后价值及免疫动态特征 | 首次系统鉴定CLEC11A、BDP1和ID3作为尤文肉瘤T细胞相关预后标志物，并构建了具有高预测准确性的预后模型 | 样本量相对有限，需要更多独立队列验证模型的普适性 | 探索尤文肉瘤肿瘤微环境中T细胞相关标志物的预后价值及免疫调控机制 | 尤文肉瘤患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 尤文肉瘤 | 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 批量RNA测序, CIBERSORT算法 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |