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当前共找到 10537 篇文献，本页显示第 7101 - 7120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7101 | 2025-10-06 |
Transcriptional profiling reveals H.pylori-associated genes induced inflammatory cell infiltration and chemoresistance in gastric cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1592558
PMID:40519938
|
研究论文 | 本研究通过转录组分析鉴定幽门螺杆菌相关基因并构建预后指数，揭示其与胃癌肿瘤微环境和化疗耐药性的关联 | 首次建立基于ACSM5和HSPB2基因的幽门螺杆菌相关预后指数(HPI)，并发现其与肿瘤微环境细胞浸润和化疗耐药性的直接关联 | 研究主要基于生物信息学分析，需要更多实验验证；样本来源有限 | 探索幽门螺杆菌感染对胃癌肿瘤微环境和化疗耐药性的影响机制 | 胃癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 胃癌 | 转录组分析，单细胞RNA测序，药物敏感性检测 | 预后指数模型 | 基因表达数据，临床数据 | TCGA和GSE62254数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7102 | 2025-10-06 |
Omics-based Approach Towards Macrophages: New Perspectives of Biology and Function in the Normal and Diseased Heart
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.112061
PMID:40520014
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综述 | 系统总结巨噬细胞在心血管疾病调控中的表型多样性和功能可塑性，重点关注多组学技术带来的新见解 | 整合单细胞RNA测序、空间转录组学和代谢组学等多组学技术揭示巨噬细胞异质性、细胞间相互作用和空间组织的新视角 | NA | 探讨巨噬细胞在正常和病变心脏中的生物学特性和功能 | 巨噬细胞及其在心血管疾病中的表现 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 代谢组学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 代谢组学 | NA | NA |
| 7103 | 2025-10-06 |
Integrative Single-Cell and Spatial Transcriptomics Analysis Reveals ECM-remodeling Cancer-associated Fibroblast-Derived POSTN as a Key Mediator in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Progression
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.108618
PMID:40520021
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和空间转录组学分析，揭示了胰腺导管腺癌中ECM重塑癌症相关成纤维细胞通过POSTN-ITGAV/ITGB5轴促进肿瘤进展的新机制 | 首次系统识别了8种成纤维细胞亚群，发现ECM重塑成纤维细胞位于伪时间轨迹末端，并鉴定SOX11为其关键转录因子，揭示了POSTN-ITGAV/ITGB5轴在PDAC进展中的核心作用 | NA | 解析胰腺导管腺癌中成纤维细胞异质性及其与上皮细胞的相互作用机制 | 胰腺导管腺癌肿瘤微环境中的成纤维细胞和上皮细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7104 | 2025-10-06 |
ITLN1 exacerbates Crohn's colitis by driving ZBP1-dependent PANoptosis in intestinal epithelial cells through antagonizing TRIM8-mediated CAPN2 ubiquitination
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.105550
PMID:40520022
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研究论文 | 本研究揭示了ITLN1通过拮抗TRIM8介导的CAPN2泛素化，驱动ZBP1依赖性PANoptosis加剧克罗恩病结肠炎的分子机制 | 首次发现ITLN1-TRIM8-CAPN2轴在驱动肠道上皮细胞PANoptosis中的关键作用，并证实ITLN1靶向治疗对克罗恩病的潜在治疗价值 | 研究主要基于动物模型和体外实验，需要进一步临床验证 | 探究肠道上皮细胞PANoptosis促进克罗恩病进展的分子机制 | 克罗恩病患者结肠组织、肠道上皮细胞、IL-10基因敲除小鼠 | 单细胞生物学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序, 免疫共沉淀, 质谱分析, RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质相互作用数据 | 克罗恩病患者发炎和未发炎结肠组织, IL-10 KO小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7105 | 2025-10-06 |
Research progress of colorectal cancer in genomic and transcriptomic at multi-level
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1533817
PMID:40520235
|
综述 | 本文综述了结直肠癌在基因组和转录组多层面的研究进展 | 系统比较了从传统单基因研究到批量测序再到单细胞测序三个研究阶段的结直肠癌机制研究演变 | NA | 探讨结直肠癌发生发展和转移的机制 | 结直肠癌 | 基因组学 | 结直肠癌 | 单细胞测序, 批量测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 7106 | 2025-10-06 |
Identification of biomarkers for the diagnosis of chronic kidney disease (CKD) with dilated cardiomyopathy (DCM) by bioinformatics analysis and machine learning
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1562891
PMID:40520229
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研究论文 | 通过生物信息学分析和机器学习识别慢性肾脏病合并扩张型心肌病的生物标志物并开发诊断模型 | 首次结合多组学数据和多种机器学习方法识别MNS1和HERC6作为CKD合并DCM的新型生物标志物，并构建了诊断列线图 | 研究依赖于公共数据库数据，需要进一步实验验证生物标志物的临床适用性 | 开发慢性肾脏病合并扩张型心肌病的早期诊断方法和识别相关生物标志物 | 慢性肾脏病和扩张型心肌病患者基因表达数据 | 生物信息学 | 慢性肾脏病,扩张型心肌病 | 生物信息学分析,机器学习,单细胞RNA测序 | LASSO,SVM-RFE,RF | 基因表达数据 | 多个GEO数据集(GSE57338,GSE29819,GSE104954,GSE145154) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7107 | 2025-10-06 |
Integrative transcriptomics and single-cell transcriptomics analyses reveal potential biomarkers and mechanisms of action in papillary thyroid carcinoma
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1536198
PMID:40520228
|
研究论文 | 通过整合转录组学和单细胞转录组学分析，揭示甲状腺乳头状癌的潜在生物标志物和细胞机制 | 首次结合RNA-seq和scRNA-seq技术系统识别PTC的转录组生物标志物，并在单细胞水平解析关键细胞类型及其相互作用机制 | 研究基于公共数据库的回顾性分析，缺乏实验验证和前瞻性临床队列验证 | 识别PTC的可靠诊断生物标志物并阐明其发病机制 | 甲状腺乳头状癌转录组数据 | 生物信息学 | 甲状腺癌 | RNA-seq, scRNA-seq, 差异表达分析, GO/KEGG富集分析, WGCNA, 机器学习, ROC分析, 细胞通讯分析, 伪时序分析 | 机器学习, 加权基因共表达网络 | 基因表达数据 | 5个RNA-seq数据集和1个scRNA-seq数据集 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7108 | 2025-10-06 |
Integrative single-cell and cell-free plasma RNA transcriptomics identifies biomarkers for early non-invasive AD screening
2025, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2025.1571783
PMID:40520536
|
研究论文 | 整合单细胞和血浆游离RNA转录组学识别用于早期非侵入性阿尔茨海默病筛查的生物标志物 | 首次整合血浆cfRNA-seq和脑组织scRNA-seq数据，识别出34个在两种数据集中一致失调的基因，并开发了基于机器学习的高精度AD早期诊断模型 | cfRNA稳定性问题对临床转化带来挑战 | 开发非侵入性阿尔茨海默病早期筛查工具 | 阿尔茨海默病患者和年龄匹配的对照人群 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | RNA测序，单细胞RNA测序，机器学习 | 支持向量机，随机森林，逻辑回归 | RNA测序数据，单细胞RNA测序数据 | 血浆cfRNA-seq数据337个样本（172例AD患者和165例对照），脑组织scRNA-seq数据88个样本（46例AD患者和42例对照） | NA | 单细胞RNA-seq，游离RNA测序 | NA | NA |
| 7109 | 2025-10-06 |
scFocus: Detecting branching probabilities in single-cell data with SAC
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.04.036
PMID:40520594
|
研究论文 | 提出一种基于强化学习的单细胞数据分析算法scFocus，用于检测细胞分化轨迹中的分支概率 | 结合强化学习和无监督分支分析，在单细胞低维潜在空间中划分细胞亚群，能更有效地捕捉分化过程 | NA | 开发单细胞数据分析算法以精确检测细胞分化轨迹中的分支概率 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 强化学习 | 单细胞基因表达数据 | 十个单细胞数据集，包括小规模、常规规模和多批次数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7110 | 2025-10-06 |
The complex interplay of TROP2 and PD-L1 in immune regulation and drug resistance in lung cancer
2025, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
DOI:10.62347/NHFJ1535
PMID:40520853
|
研究论文 | 本研究探讨了TROP2和PD-L1在肺腺癌中的相互作用及其对免疫调节和耐药性的影响 | 首次通过单细胞RNA测序揭示TROP2和PD-L1在肺腺癌中的复杂相互作用机制，并发现其与CD8 T细胞浸润和癌症相关成纤维细胞的关联 | 研究主要聚焦于PC9细胞系及其耐药变体，样本类型相对有限 | 阐明TROP2和PD-L1在肺腺癌免疫调节和耐药性中的分子机制 | 肺癌细胞系、肿瘤组织和免疫细胞，特别是PC9亲本和耐药变体 | 数字病理学 | 肺癌 | 转录组分析、免疫组织化学、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、组织图像、单细胞测序数据 | 肺癌细胞系、肿瘤组织和免疫细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7111 | 2025-10-06 |
Notable influences of estrogen and sex-specific microenvironment in colorectal cancer revealed by single-cell transcriptome analysis
2025, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.106133
PMID:40520886
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示雌激素和性别特异性微环境在结直肠癌中的显著影响 | 首次在单细胞水平系统揭示结直肠癌中性别特异性的细胞组成、功能和细胞间相互作用差异，并验证雌激素信号通路与凋亡活性的关联 | 样本量相对有限(32例)，需要在更大队列中验证发现 | 探究结直肠癌中性别特异性预后差异的生物学机制 | 结直肠癌患者组织样本和细胞系 | 单细胞转录组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,多重免疫组化,Western blot,TUNEL检测 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质印迹数据,免疫组化图像 | 32例结直肠癌样本,共167,437个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7112 | 2025-10-06 |
PDGF-BB/EGR1 Axis Drives Fibroblast Activation Protein Expression to Promote Abdominal Aortic Aneurysm
2025, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.114429
PMID:40520892
|
研究论文 | 本研究探讨了成纤维细胞活化蛋白在腹主动脉瘤发展过程中对血管平滑肌细胞的作用机制 | 首次揭示了PDGF-BB通过转录因子EGR1调控FAP表达的新机制，并证实靶向FAP可抑制动脉瘤形成 | 研究主要基于小鼠模型，临床样本验证有限 | 阐明FAP在腹主动脉瘤发病机制中的分子作用 | 血管平滑肌细胞、小鼠AAA模型、临床AAA患者 | 分子生物学 | 腹主动脉瘤 | RNA测序、PET/CT成像 | NA | 基因表达数据、影像数据 | 动物模型及有限临床病例 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 7113 | 2025-10-06 |
FOS as a biomarker for myocardial infarction treatment with Deng's Yangxin Decoction: a systems biology-based analysis
2025, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2025.1488684
PMID:40520937
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研究论文 | 本研究通过系统生物学方法探索邓氏养心汤治疗心肌梗死的潜在生物标志物FOS及其作用机制 | 首次将FOS鉴定为邓氏养心汤治疗心肌梗死的核心生物标志物，并通过分子对接和单细胞RNA测序验证其与免疫细胞浸润的关联 | 机制研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证 | 探索邓氏养心汤治疗心肌梗死的生物标志物和作用机制 | 心肌梗死患者和对照组的基因表达数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 系统药理学分析、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、分子对接、免疫浸润分析、单细胞RNA测序 | 蛋白-蛋白相互作用网络、分子对接模型 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 基于公开数据集的心肌梗死患者和对照组基因表达数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7114 | 2025-10-06 |
Extrachromosomal circular DNA drives dynamic genome plasticity: emerging roles in disease progression and clinical potential
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.111765
PMID:40521196
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综述 | 本文系统综述了染色体外环状DNA(eccDNA)在基因组动态可塑性中的关键作用及其在疾病进展和临床应用中的潜力 | 提出了应激选择理论，将eccDNA视为增强细胞适应环境压力的适应性储备库 | 在理解组织特异性作用、实现临床转化和方法学标准化方面仍面临挑战 | 系统总结eccDNA的分类、生物发生、检测方法、生物学功能和临床意义 | 染色体外环状DNA(eccDNA)及其亚型如microDNA、双微体和ecDNA | 基因组学 | 癌症、心血管疾病、神经系统疾病、自身免疫疾病、代谢疾病 | 长读长测序、单细胞测序、CRISPR合成、计算工具 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 单细胞测序、空间生物学、多组学 | NA | NA |
| 7115 | 2025-06-17 |
Data-informed insights into sex differences in peripheral blood mononuclear cells from single-cell transcriptomics
2025-Sep, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101525
PMID:40520998
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7116 | 2025-06-17 |
Integrating spatial transcriptomics and single-cell RNA-sequencing reveals epithelial cell alterations in benign prostatic hyperplasia following finasteride treatment
2025-Sep, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101526
PMID:40520997
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7117 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing and machine learning reveal the role of dioxin-interacting genes in HCC prognosis and immune microenvironment
2025-Jul-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118484
PMID:40483782
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研究论文 | 通过单细胞测序和机器学习揭示二噁英相互作用基因在肝细胞癌预后和免疫微环境中的作用 | 首次结合单细胞和批量转录组分析识别二噁英相互作用差异表达基因，并建立预后模型 | 未提及样本量限制或验证队列的详细信息 | 探究二噁英在肝细胞癌发展中的分子机制及预后评估 | 肝细胞癌患者样本和体外细胞实验 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞测序, 批量转录组分析, 机器学习, 分子对接, 体外实验 | 预后风险模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 7118 | 2025-10-06 |
Plaque erosion risk and JAK2 V617F variant
2025-Jun-16, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehaf114
PMID:40053703
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研究论文 | 本研究探讨JAK2 V617F突变与斑块侵蚀风险之间的关联及其潜在机制 | 首次明确JAK2 V617F突变与心肌梗死特定机制——斑块侵蚀的强相关性，并通过单细胞RNA测序揭示中性粒细胞活化在其中的作用机制 | 病例对照研究设计无法确定因果关系，样本来源单一 | 探究JAK2 V617F突变与心肌梗死不同机制（斑块侵蚀vs斑块破裂）的关联性 | 728例斑块侵蚀患者、919例斑块破裂患者和804例对照个体 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 数字滴液PCR, 单细胞RNA测序 | 逻辑回归分析 | 基因测序数据, 临床数据 | 2451例（728侵蚀+919破裂+804对照） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7119 | 2025-10-06 |
Role and Validation of Lactylation-Related Gene Markers in Postmenopausal Osteoporosis
2025-Jun, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05216-1
PMID:40131629
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多组学数据分析，探讨了乳酸化相关基因在绝经后骨质疏松症中的作用并构建诊断模型 | 首次将乳酸化修饰与PMOP发病机制联系起来，结合单细胞测序、孟德尔随机化分析和多种机器学习算法构建诊断模型 | 研究样本量有限，需要更大规模的数据验证模型的泛化能力 | 探索乳酸化相关基因在绝经后骨质疏松症发病机制中的作用并开发诊断标志物 | 绝经后骨质疏松症患者的单细胞RNA测序数据和转录组数据 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 孟德尔随机化分析 | 多种机器学习算法组合 | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7120 | 2025-10-06 |
Longitudinal single-cell analysis reveals RUNX1T1 as an early driver in treatment-induced neuroendocrine transdifferentiation
2025-May-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.14.653660
PMID:40463134
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研究论文 | 通过纵向单细胞转录组测序揭示RUNX1T1是治疗诱导神经内分泌转分化的早期驱动因子 | 首次发现t-NEPC发展过程中的早期中间过渡细胞状态，并鉴定RUNX1T1作为NEPC转分化的关键转录调节因子 | 研究基于单一PDX模型（LTL331/331R），需要更多模型验证 | 探究治疗诱导神经内分泌前列腺癌的时序动态和分子驱动机制 | 前列腺癌患者来源异种移植模型（PDX） | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 7个时间点的纵向样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |