单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 10755 篇文献，本页显示第 7081 - 7100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7081 | 2025-10-06 |
Exploring the anti-gastric cancer mechanisms of Diosgenin through integrated network analysis, bioinformatics, single-cell sequencing, and cell experiments
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1600960
PMID:40487391
|
研究论文 | 本研究通过整合网络分析、生物信息学、单细胞测序和细胞实验，系统探索薯蓣皂苷元抗胃癌的作用机制 | 首次采用多方法策略（网络分析、生物信息学、单细胞RNA测序、孟德尔随机化和细胞实验）系统研究薯蓣皂苷元的抗胃癌机制 | NA | 全面研究薯蓣皂苷元抗胃癌的作用机制 | 胃癌细胞 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 孟德尔随机化, 蛋白质印迹分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7082 | 2025-10-06 |
Single-cell and transcriptomic analyses reveal the role of PCDH17 in the non-inflammatory tumor microenvironment of pancreatic cancer
2025, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2025.1559909
PMID:40487760
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和转录组分析揭示了PCDH17在胰腺癌非炎症性肿瘤微环境中的作用机制 | 首次系统阐明PCDH17在胰腺癌内皮细胞中的表达特征及其与炎症基因和免疫细胞浸润的关联 | PCDH17调控肿瘤微环境的具体分子机制仍需进一步验证 | 探究PCDH17在胰腺癌肿瘤微环境调控中的作用机制 | 胰腺癌组织样本和单细胞测序数据 | 单细胞分析 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,免疫荧光 | NA | 单细胞测序数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7083 | 2025-10-06 |
Utilizing Multi-omics analysis to elucidate the role of mitochondrial gene defects in Gastric cancer progression
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0325520
PMID:40489463
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示线粒体自噬相关基因在胃癌进展中的作用 | 首次结合bulk RNA-seq和单细胞RNA测序数据，识别出8个线粒体自噬相关预后基因并构建风险评分模型 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 阐明线粒体自噬相关基因在胃癌进展中的作用机制 | 胃癌组织和细胞 | 生物信息学 | 胃癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | LASSO-Cox回归, 风险评分模型 | 基因表达数据 | TCGA和GEO数据库中的胃癌样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7084 | 2025-10-06 |
Integration of Bulk and Single-Cell Transcriptomics Reveals BCL2L14 as a Novel IGKC+ T Cell-Associated Therapeutic Target in Breast Cancer
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S523147
PMID:40491783
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk转录组数据，发现BCL2L14是乳腺癌中新型IGKC+ T细胞亚群的关键调控因子和潜在治疗靶点 | 首次识别出IGKC+ T细胞亚群，并确定BCL2L14作为该亚群中驱动乳腺癌进展的关键基因 | 研究主要基于转录组数据分析，需要更多实验验证BCL2L14的临床转化价值 | 识别乳腺癌肿瘤微环境中的新型T细胞亚群及相关生物标志物，为靶向治疗提供新策略 | 乳腺癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，机器学习算法，体外功能验证 | 预后风险模型，列线图 | 转录组数据 | 多个乳腺癌队列样本 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | NA |
| 7085 | 2025-10-06 |
GSDMD is a novel predictive biomarker for immunotherapy response: in the pan-cancer and single cell landscapes
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1570901
PMID:40491921
|
研究论文 | 本研究通过泛癌分析和单细胞测序揭示了GSDMD作为免疫治疗反应预测生物标志物的潜力 | 首次在泛癌水平和单细胞景观中系统评估GSDMD作为免疫治疗预测生物标志物的价值，并发现PARPi通过增强GSDMD介导的焦亡发挥抗肿瘤作用 | 研究主要基于生物信息学分析，需要更多实验验证GSDMD的临床预测价值 | 探索GSDMD作为免疫治疗反应预测生物标志物的潜力 | 多种肿瘤类型和免疫细胞 | 生物信息学 | 泛癌 | 单细胞RNA测序, 类器官功能实验 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | TCGA数据集中的多种肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7086 | 2025-10-06 |
A telomere-associated molecular landscape reveals immunological, microbial, and therapeutic heterogeneity in colorectal cancer
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1615533
PMID:40492114
|
研究论文 | 本研究开发了一种名为TELscore的端粒评分系统，用于揭示结直肠癌中免疫、微生物和治疗异质性 | 首次整合转录组和瘤内微生物组数据构建端粒评分系统，全面表征了结直肠癌中端粒生物学与免疫微环境、微生物生态和治疗反应的关联 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要前瞻性研究验证临床实用性 | 开发端粒相关分子标志物用于结直肠癌患者分层和精准治疗 | 结直肠癌患者队列 | 数字病理 | 结直肠癌 | 转录组测序, 16S rRNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫组化, 全切片图像分析 | NA | 转录组数据, 微生物组数据, 病理图像, 单细胞数据 | 多个独立结直肠癌队列 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 微生物组测序 | NA | NA |
| 7087 | 2025-10-06 |
Unveiling fatty acid subtypes: immunometabolic interplay and therapeutic opportunities in gastric cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1570873
PMID:40492126
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于脂肪酸代谢基因的预测模型，用于评估胃癌患者的预后和治疗指导 | 首次通过整合脂肪酸代谢相关基因构建胃癌预后预测模型，并结合单细胞RNA测序和代谢组学验证基因表达特征 | 模型在不同验证数据集中的AUC值存在差异(0.508-0.86)，需要进一步临床验证 | 开发基于脂肪酸代谢基因的预测特征来评估胃癌患者预后 | 胃癌患者 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序，代谢组学，转录组学，随机森林模型，Cox回归分析 | 随机森林，Cox比例风险模型 | 基因表达数据，代谢物数据 | 多个胃癌数据集的患者样本 | NA | 单细胞RNA测序，代谢组学，转录组学 | NA | NA |
| 7088 | 2025-10-06 |
Fibroblast Heterogeneity in Hepatocellular Carcinoma and Identification of Prognostic Markers Based on Single-cell Transcriptome Analysis
2025, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示肝细胞癌中成纤维细胞的异质性及其预后标志物 | 首次在单细胞水平系统揭示HCC成纤维细胞的转录调控机制，发现染色体6p拷贝数缺失与CEBPD、FOSB转录因子的预后价值 | 样本来源单一数据库，功能验证实验有限 | 探索肝细胞癌中成纤维细胞的复杂作用及转录调控机制 | 肝细胞癌组织中的成纤维细胞及其他肿瘤微环境细胞 | 单细胞转录组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，qRT-PCR，Transwell实验 | Seurat，inferCNV，CellChat，Monocle 2，SCENIC | 单细胞转录组数据 | GSE149614数据库中的非肿瘤肝组织和原发肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7089 | 2025-10-06 |
Progress in single-cell sequencing of retinal vein occlusion or ischemic hypoxic retinopathy
2025-Aug, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110436
PMID:40414336
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在视网膜静脉阻塞和缺血性缺氧性视网膜病变研究中的最新进展 | 整合了单核RNA测序、空间转录组学和多组学方法，增强对视网膜反应的空间和时间图谱绘制 | 样本保存、视网膜细胞类型注释和跨物种翻译等挑战尚未完全解决 | 探讨单细胞测序技术在视网膜血管疾病研究中的应用进展 | 视网膜静脉阻塞和缺血性缺氧性视网膜病变 | 数字病理学 | 视网膜血管疾病 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学, 多组学分析 | NA | 转录组数据, 空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 7090 | 2025-10-06 |
Targeting SPP1+ macrophages via the SPP1-CD44 axis reveals a key mechanism of immune suppression and tumor progression in ovarian cancer
2025-Jul-28, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114906
PMID:40446696
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析发现SPP1+巨噬细胞通过SPP1-CD44轴驱动卵巢癌免疫抑制和T细胞耗竭 | 首次识别SPP1+TAM亚群在卵巢癌中的关键作用，揭示SPP1-CD44轴是免疫抑制的主要介质，并发现尼洛替尼作为潜在SPP1抑制剂 | 研究主要基于单细胞测序数据分析，需要更多临床验证 | 探究卵巢癌肿瘤微环境中肿瘤相关巨噬细胞介导免疫抑制的分子机制 | 高级别浆液性卵巢癌患者样本和Jurkat细胞 | 肿瘤免疫学 | 卵巢癌 | 单细胞测序，分子对接，分子动力学模拟，功能验证实验 | NA | 单细胞测序数据，实验数据 | 六个HGSOC单细胞测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7091 | 2025-10-06 |
Mefunidone treats pulmonary fibrosis by targeting SDH to regulate fibro-promoting macrophages
2025-Jul-28, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114971
PMID:40449267
|
研究论文 | 本研究揭示美氟尼酮通过靶向琥珀酸脱氢酶调控促纤维化巨噬细胞表型治疗肺纤维化的新机制 | 首次发现美氟尼酮通过结合并抑制SDH活性减少琥珀酸生成，进而抑制MMP12+CCL2+促纤维化巨噬细胞转化 | 研究主要基于博来霉素诱导的小鼠肺纤维化模型，临床转化价值需进一步验证 | 阐明美氟尼酮治疗肺纤维化的分子靶点及作用机制 | 博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型及巨噬细胞 | 单细胞测序 | 肺纤维化 | 单细胞测序，组织病理学检查，体外验证 | 动物疾病模型 | 单细胞测序数据，组织病理图像 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7092 | 2025-10-06 |
Multi-omics identifies OSM-OSMR as a key receptor-ligand in the tumor environment of endometrial adenocarcinoma
2025-Jul-28, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114933
PMID:40450916
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析发现OSM-OSMR是子宫内膜腺癌肿瘤微环境中的关键受体-配体对，并构建了七基因预后模型 | 首次系统识别OSM-OSMR在子宫内膜腺癌中的关键作用，并建立基于随机生存森林的七基因预后特征模型 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 探索肿瘤细胞与其他细胞间的配体-受体关系并构建预后模型 | 子宫内膜腺癌组织和细胞系 | 生物信息学 | 子宫内膜腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组测序,批量RNA测序 | 随机生存森林 | 基因表达数据,临床数据 | 来自GEO和TCGA数据库的多个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,批量RNA-seq | NA | NA |
| 7093 | 2025-10-06 |
Phillyrin for sepsis-related acute lung injury: A potential strategy suppressing GSK-3β
2025-Jul, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2025.04.017
PMID:40359720
|
研究论文 | 本研究探讨连翘酯苷通过抑制GSK-3β信号通路缓解脓毒症相关急性肺损伤的机制 | 首次通过多组学分析发现连翘酯苷与GSK-3β的稳定结合，并系统阐明其通过调控巨噬细胞极化改善急性肺损伤的作用机制 | 机制研究主要聚焦于GSK-3β信号通路，可能存在其他未被发现的调控途径 | 阐明连翘酯苷治疗脓毒症相关急性肺损伤/急性呼吸窘迫综合征的分子机制 | 巨噬细胞、斑马鱼、小鼠模型 | 分子药理学 | 急性肺损伤/急性呼吸窘迫综合征 | 分子对接、分子动力学模拟、孟德尔随机化分析、单细胞测序、体内外实验验证 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据、分子模拟数据 | 从公共数据库筛选8331个ALI/ARDS相关靶基因 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7094 | 2025-10-06 |
The glia-immune network: Astrocytes and oligodendrocytes as microglial co-ordinators in health and disease
2025-Jun-10, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP287015
PMID:40492604
|
综述 | 探讨星形胶质细胞和少突胶质细胞作为小胶质细胞协调者在中枢神经系统免疫网络中的作用 | 提出胶质细胞特异性免疫样网络概念，强调大胶质细胞在中枢神经系统免疫信号传导中的主动协调作用 | NA | 阐明大胶质细胞来源的免疫信号传导及其在健康和疾病中的相关性 | 中枢神经系统胶质细胞（小胶质细胞、星形胶质细胞、少突胶质细胞） | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7095 | 2025-10-06 |
Tumor microenvironment heterogeneity and progression mechanisms in intrahepatic cholangiocarcinoma: A study based on single-cell and spatial transcriptomic sequencing
2025-Jun-09, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001423
PMID:40489753
|
研究论文 | 基于单细胞和空间转录组测序研究肝内胆管癌肿瘤微环境异质性及进展机制 | 首次通过单细胞和空间转录组技术系统解析ICC肿瘤微环境异质性，发现ASPH作为侵袭亚型标志物及MHC-II介导的免疫逃逸新机制 | 样本量有限（单细胞测序12例，空间转录组4例），需更大队列验证 | 探究肝内胆管癌肿瘤微环境异质性及肿瘤进展机制 | 肝内胆管癌患者肿瘤组织、类器官和小鼠模型 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序, RNA-seq, 多重免疫荧光 | 类器官模型, 小鼠模型 | 单细胞测序数据, 空间转录组数据, RNA-seq数据, 图像数据 | 训练队列：12例初治ICC样本（单细胞测序）+4例ICC样本（空间转录组）；验证队列：87例ICC肿瘤样本（RNA-seq） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7096 | 2025-10-06 |
KRT5high TP63-expressing urothelial basal cells act as a driver to bladder urothelium regeneration in rabbit
2025-Jun-07, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04417-z
PMID:40483513
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定KRT5high TP63表达基底细胞作为膀胱尿路上皮再生的驱动细胞，并开发了基于胶囊血管床的膀胱组织工程策略 | 首次在兔模型中证实KRT5high TP63表达基底细胞具有干细胞特性，能够分化为中间层和表层伞状细胞，并建立了基于胶囊血管床的尿路上皮组织工程新方法 | 研究仅在兔模型中进行，尚未在更高等动物或人体验证；样本量未明确说明 | 探索膀胱尿路上皮再生的细胞机制并开发组织工程修复策略 | 兔膀胱尿路上皮基底细胞 | 组织工程 | 膀胱疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7097 | 2025-10-06 |
Heterogeneous characteristics of γδ T cells in peripheral blood of diffuse large B-cell lymphoma
2025-Jun-07, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-025-00795-x
PMID:40483533
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了弥漫性大B细胞淋巴瘤患者外周血中γδ T细胞的异质性特征及其与预后的关联 | 首次在DLBCL患者外周血中系统鉴定出6个功能各异的γδ T细胞亚群，并发现TIGIT+ γδ T细胞亚群与不良预后显著相关 | 样本量较小（6例患者和3例健康个体），需要在更大队列中验证研究结果 | 阐明DLBCL患者外周血中γδ T细胞的异质性及其临床相关性 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者和健康个体的外周血样本 | 单细胞基因组学 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | 共识聚类, 伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 9个血液样本（6例DLBCL患者和3例健康个体） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7098 | 2025-10-06 |
Cholangiocytes contribute to hepatocyte regeneration after partial liver injury during growth spurt in zebrafish
2025-Jun-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60334-y
PMID:40480975
|
研究论文 | 本研究通过建立斑马鱼部分肝损伤模型，揭示了在快速生长期胆管细胞通过转分化为肝细胞参与肝脏再生的机制 | 首次在快速生长期动物模型中证明胆管细胞是新生肝细胞的主要来源，并发现mTORC1信号通路调控胆管细胞可塑性 | 研究仅限于斑马鱼模型，尚未在哺乳动物中验证 | 探究快速生长期肝脏再生的细胞来源和分子机制 | 斑马鱼肝脏 | 发育生物学 | 肝损伤 | 单细胞转录组测序,谱系追踪,基因组编辑 | NA | 基因表达数据,谱系追踪数据 | 斑马鱼部分肝损伤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7099 | 2025-10-06 |
RAN potentiates nuclear export of phosphorylated AMPK, reshaping lipid metabolism and impairing immune efficacy in lung adenocarcinoma
2025-Jun-06, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00977-8
PMID:40481101
|
研究论文 | 本研究探讨RAN通过调节磷酸化AMPK核输出影响脂质代谢，从而削弱肺腺癌免疫治疗效果的机制 | 首次揭示RAN通过调控p-AMPK核输出重塑脂质代谢并影响免疫治疗效果的分子机制 | 样本量较小（n=15），需要更大规模研究验证 | 探索肺腺癌免疫治疗反应差异的代谢机制 | 肺腺癌患者和细胞系 | 单细胞转录组学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 15例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7100 | 2025-10-06 |
Identification of immune-associated genes and single-cell sequencing analysis in diagnosing Behçet's disease
2025-Jun-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-05086-x
PMID:40481130
|
研究论文 | 通过批量测序和单细胞测序分析白塞病的免疫景观并鉴定新的诊断生物标志物 | 首次在单细胞分辨率下探索单核细胞在白塞病发生发展中的作用，并通过机器学习筛选出5个新的潜在诊断标志物 | 研究主要依赖公共数据库数据，实验验证仅限于小鼠模型 | 识别白塞病的免疫相关基因并开发诊断方法 | 白塞病患者和小鼠模型 | 生物信息学 | 白塞病 | 批量测序,单细胞测序,qRT-PCR | LASSO | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的白塞病数据和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |